2LEGA

Membrane protein complex dsbb-dsba structure by joint calculations with solid-state nmr and x-ray experimental data
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution membrane protein structure by joint calculations with solid-state NMR and X-ray experimental data.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein, oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
total genus 44
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2legA00
3LG6A 1A2MA 2FY6A 3CXGA 1M2BA 2WRTA 1K0AA 1SENA 1HNBA 1SU9A 2BJXA 2HZFA 4L5LA 4ML1A 4PX1A 4N11A 1O8WA 3H1NA 1CQHA 5ID2B 3VWUA 5J41A 4KCEA 3ZIVA 1QXHA 3P90A 5J9BA 4AJ8A 4XS6A 4G9HA 1T4ZA 5IMFA 3F6DA 2VUPA 2OE1A 1PN9A 3UIWA 1GUMA 3IHQA 5J4UA 2R6KA 1W4VA 4K7OA 2OKAA 1TK8B 2DIZA 2H0IA 1SD9A 2C3NA 9GSSA 1A0RP 1GUHA 1M7TA 1M9BA 1BEDA 1PMTA 2QKEA 4HQZA 2HRNA 2LJAA 1PA3A 3IC4A 3FW2A 4K0NA 2P31A 1GTIA 1XW5A 3ZREA 4PURA 2YV9A 4ACSA 2I1UA 3D5JA 3RDWA 1X9MB 4HQSA 3NZNA 5ECSA 1XIYA 4I8BA 2H1GA 3VK9A 4GSSA 3ZIJA 2B6MA 2GSQA 4J57E 3D4TA 2DC5A 3LYKA 5ECLB 3LXTA 1VF4A 3GYKA 3QMXA 4ZB9A 5IMAA 4RQRA 3TJGA 3HKRA 3F6FA 2F8AA 2OADA 1J08A 1KTEA 5ELAA 5G30A 5HR3A 3CTFA 3A3TA 2X64A 2CA8A 1Z3EA 5D73A 2P5QA 4JR6A 2CVDA 1Z5YE 4O32A 3GIXA 3US3A 2L5OA 1XXUA 2JZRA 3ME8A 3GFKA 1XCCA 3PINA 2GQLA 4X43A 2MZCA 1R7HA 5INYA 2YJHA 3M1GA 1B4PA 3TJJA 4BL7A 4ZBAA 4NAXA 1PQNA 1OC3A 5ECKB 3GRXA 4XS4B 2C80A 4IGJA 5LNKe 1SKRB 2WB9A 3LFLA 2L6CA 3D0ZA 2DJ0A 2GZPA 1O7UA 3GMFA 1EV4A 2FGXA 2V6KA 2VO4A 2LRTA 4ZL7A 4GSNA 5D9WA 5ECMB 2LEGA 5IMCA 4DEJA 2YOIA 3GA4A 1J9BA 2YCDA 1VGLA 4K1FA 4OFMA 4QL9A 3PGTA 2H1DA 2ES7A 3P7XA 2X8HA 4MF5A 5F0GA 4AJ6A 2PPTA 4LL4B 4MF7A 4WR4A 3TJKA 3IRAA 4GCIA 2VD1A 2V1MA 1RW1A 3IR4A 1ZOFA 1WMJA 1R26A 1EGOA 2F51A 2REMA 3TRPA 3CRUA 4ECCA 4P3YB 1X5EA 5ECPB 2FWFA 2YJ7A 3IK7A 1TI1A 1GH2A 3GSSA 3UBKA 3CMIA 4TR4A 2HSYA 12GSA 3EINA 3HVVA 2HFDA 2A2RA 1TRVA 1EWXA 1TKDB 2PVOC 1NSWA 3IE3A 2XC2A 4KCAA 1GLQA 1GSFA 4OFTA 2MMNA 2I3YA 1A2JA 3HCZA 2M46A 3GL3A 2VCTA 5A4VA 4MJEA 3VURA 5DAKB 1WE0A 4NMUA 2CX4A 3QFBC 1U6TA 3DEXA 2K18A 2C0FA 3EVIA 1V2AA 1SK2A 2K6VA 4KX4A 3ERFA 1HQOA 3ERGA 4CDOA 2ALBA 5G2ZA 2CV4A 3GUSA 3TOTA 5HQPA 3M8NA 3QFAC 4QQ7A 4ZBBA 4MZBA 2MMAA 4ECBA 3DGQA 1R4WA 1SYXA 2YNXA 1Q4JA 1JZOA 2CVBA 3F0IA 4QL7A 5HR2A 4E8EA 3ZRDA 5JWRB 1XVWA 2C3QA 1ZZYA 2KUCA 3HHVA 3APSA 2LJKA 4MP4A 4F0BA 4OMVA 2CVKA 4OFNA 3UL3A 5CRDA 1QQ2A 3QDNA 2IL3A 2H1BA 1GNWA 4YQMA 3KM6A 4KSMA 5AN1A 5HR1A 3LQ7A 2K8SA 4IJIA 2PUKC 3SWLA 4PUAA 3KGKA 3IBHA 3N5OA 5AGYA 3L9UA 4HJ2A 2PN8A 1UA5A 4POLA 1S3CA 4K0GA 4KW6A 4DSRA 1UN2A 1BAYA 2CZ3A 4IJ3A 5AIVA 2V32A 13GSA 2GSRA 2LKUA 3M9JA 3TKSE 5LCZA 5IM9A 1GUKA 1WRYA 2OJLA 2AHEA 3HZ8A 5F06A 1LBKA 4DSSA 2RLIA 1GP1A 4KDUA 1B4QA 1C72A 2WGRA 3CBUA 4FYUA 3P2AA 4AJ7A 5H5QA 4G2EA 5J3RA 3A5WA 3Q74A 4WEYA 3A2VA 3BCIA 2H75A 2H74A 5FHIA 2YN1A 1JZDA 4XS1A 4JE1A 2ON5A 3C8EA 5ECNB 4K7IA 2GQKA 4I2TA 6GSYA 2H76A 2VL3A 2N5AA 1K0CA 1JZRA 4OCEA 2FCHA 2L5LA 2E0QA 1SL1B 1SJIA 1ZYEA 4MF6A 4ZIJA 3FHKA 1HNCA 2HSHA 3FR3A 4DSSB 1B9XC 3H79A 3L9SA 3GTUA 2R5GA 1AIUA 2B3SA 3FR9A 3HJMA 4KSOA 3WGEA 2OACA 4GSTA 1XOBA 3WGXA 1OAZA 2DJ3A 3IAM2 2EC4A 3UVTA 3HVXA 3EURA 1GRXA 2YWNA 3QAVA 1JLVA 3MAKA 5FWGA 4KH7A 1MDJA 2JZSA 4FYBA 1KNGA 3F63A 3LORA 1SJ6A 4I97A 4F2IA 1GSYA 2IWTA 1OYJA 1VRSD 3WGDA 1OC9A 5ECRB 3TKRA 3KTLA 3GSTA 2OBKA 1G7EA 2EIRA 2MMZA 22GSA 3KEBA 5KEJA 4YQUA 4PUFC 2VLUA 3KIJA 1V98A 5G1LA 1YEPA 1DE2A 5ECHB 3TRXA 2H0GA 2HYXA 3H4KA 3S9FA 3QAGA 2LQQA 2RIIA 4WKWA 3GTUB 2B5EA 3BD2A 2XPDA 3KD0A 1ILOA 4IN0A 1YKCA 3HVSA 2LRCA 2A4VA 4EKZA 1Y25A 5HFKA 6GSTA 4LA1A 4IS0A 4Q5QA 1AXDA 2PERA 2LNTA 4PQ1A 1V9WA 2H01A 1FB6A 1PX7A 2CZ2A 1DBYA 3ZMKA 3IAS2 4ISDA 3ME7A 2DMMA 1GSQA 1TU8A 4JU5A 1TP9A 3RPNA 3TGZA 3P8WA 3ZFBA 4BA7A 2RM6A 4KDXA 2JSYA 3I69A 1OC9B 5L71A 4GXZA 3VFIA 3WT2A 4TXVA 5JWQB 4F9ZA 3KP9A 2K8VA 3GX8A 4MA9A 1G7OA 1X9SB 5JCGA 4TOPA 1EOGA 3LWAA 2FWHA 2GT6A 2NPBA 17GSA 1OVNA 2PBJA 3KMOA 3FKFA 1RQMA 4PGTA 1J0FA 2YV7A 1YDKA 1T4YA 3DKSA 4OO5A 3Q6OA 4WETA 2CAQA 3EMPA 1NW2A 5CO3A 2VCQA 4N10A 3MSZA 2I4AA 1WPIA 3GURA 3O6TA 4JRRA 4EO3A 1SKWB 1F3BA 3GNJA 2G2QA 3QAWA 4BVXA 5CAXA 2R3XA 2N5BA 4HOJA 3RHBA 5B8BA 1T7PB 1EEMA 3GV1A 3O76A 4XS4A 2BMXA 2C8UA 1FAAA 2G0FA 1FG4A 2I81A 3UEMA 1YZXA 1K0BA 4OWYA 4MH3A 2DSAA 3IOSA 1GSSA 2TRXA 3D6IA 1W89A 3FR6A 5DJLA 4GF0A 1Z6NA 1EGRA 1SK0A 1A2LA 5CRGA 2B7KA 1WJKA 2VL2A 3U5RE 1Y6EA 3BBYA 3LGCA 2YZUA 5AIXA 4ZL9A 1VF2A 1USBA 2O7KA 3W6GA 1UVZA 4L5OA 5CNWA 3F4SA 4Q5FA 1K0NA 3D21A 2LQOA 1GULA 2GZYA 3APOA 3W8SA 1TRSA 2HLSA 4MABA 4JBBA 7GSSA 4MZWA 4K7NA 4PQHA 2LTKA 4F0CA 2VAFA 3G7YA 1E6BA 4EL1A 4HU7A 2E2MA 1ZCPA 3RHCA 16GSA 1ABAA 1PKZA 1IYIA 3ZZXA 3VLNA 1IYHA 4YAPA 1S3DA 1PX6A 4XCSA 4FYCA 4YH2A 4GLTA 1SL2B 2OE0A 1U88A 1ERWA 2PGTA 4WBJA 3HD5A 3DWVA 1YKAA 3DD3A 5DAKA 1DE1A 2H19A 1TDIA 3HA9A 2XPEA 4JR4A 1A0FA 1B9YC 2OE3A 3M3MA 4F82A 5G5FA 4O7HA 5KN2A 1T8EB 1OE8A 2GGTA 2L4QA 4PXOA 1LU4A 2DLXA 2GVPA 3FY7A 1BQ7A 5CYYA 1T3BA 2WULA 1QFNA 2E2GA 2YPMA 5G5EA 4IHUA 2P0GA 4K9ZA 3F4RA 6GSWA 3GKXA 2KOKA 1Z9HA 5IO0A 1TJDA 2IMFA 2WS2A 3C7MA 2GQMA 1ML6A 2WCIA 5DBQA 3TJBA 3DIEA 1R5PA 4TXOA 1XZOA 1ZMAA 1YF1A 1ST9A 3HJPA 3ZTLA 2ON7A 5D9VA 2O87A 4MJBA 2RUFA 4IW9A 5EL8A 2VCVA 4J2FA 4POKA 3OR5A 3C1RA 3LYPA 3G7JA 2X8GA 2YWOA 1TK5B 2H30A 2V2GA 1A8LA 1FVJA 2PVQA 3ZVJD 3K8NA 1SL0B 5H5SA 2MBSA 2FA4A 3ZFLA 1DUGA 3EWLA 5F05A 3TB2A 1K0OA 4OCFA 3UAPA 1A24A 3RAZA 1O73A 4TXOB 3V1WA 4ZL8A 4N30A 3VWXA 4MPFA 3DRNA 1M9AA 1G0TA 1O6JA 3GHAA 1GTAA 3D22A 1K0DA 6GSUA 3TKQA 4EDYA 1F3AA 1F6MC 4EVMA 5DQSA 4KB3A 4XRDA 2H72A 4MLYA 5A5KA 5J5NA 1MDKA 1OE7A 2CAIA 3VI5A 4ZB6A 2XHFA 5IQYA 3J7Yk 4JEDA 5GAND 1Z7PA 1PRXA 3M0FA 2VCWA 5IMDA 1K0MA 5IIZA 1EV9A 4DSQA 2V41A 4IP1A 2AV4A 1BYEA 5ENUA 1T00A 4KNDA 2VL2C 1G6WA 1GTUA 11GSA 3I6AA 3L78A 2DJJA 4ZXGA 1RK4A 5GAPD 4N0VA 1M99A 6GSSA 2I9HA 4ML6A 2H6XA 3L0HA 5G31A 4J56E 3GL5A 1SD8A 5HR0A 1GSDA 2E7PA 4EDZA 3GH6A 3WD6A 2P5RA 2ZNMA 2DJKA 1M2DA 1OC8A 2C0GA 3C73A 1PL2A 2FLSA 5IMZA 4MJCA 1FOVA 4BWSA 3FRCA 3H8QA 2V6OA 2H70A 4TR0A 2R37A 4Q5RA 4O5RA 1PSQA 2H6YA 2NDOA 4KGIA 1YQ1A 5JCWA 1GL8A 3L4NA 3E9JB 3QD9A 2OBIA 4ECJA 1MDIA 2FUG2 3UARA 1O85A 2N5FA 2GS3A 3GKKA 6GSVA 1V57A 3IV4A 4NHZA 1AQVA 1DSBA 3GKMA 3UJ1A 3DVWA 1B8XA 4PNFA 3MDKA 3VPTA 1FB0A 3ERWA 1MTCA 4K6XA 4I6XA 5ELGA 4CW9A 6GSXA 1QMVA 1JLWA 2YZHA 1BX9A 1GWCA 2HI7A 2H73A 2KP2A 1B48A 2GSTA 1BJXA 2R4VA 2WJUA 4FH8A 4V2LA 2AJQB 4GRFA 2H0HA 2KP1A 1YF0A 5E59A 3CTGA 4H86A 1SK1A 10GSA 2GSSA 2JZTA 3KH9A 3IK9A 2IMDA 2M80A 2CQ9A 4LMVA 2AB6A 2MBTA 1GNEA 4WXTA 3TJFA 2QSIA 1O8XA 1X9WB 1OKTA 2IJYA 1FO5A 2OA7A 5EPFA 4G19A 4NXIA 3CSHA 3ZITA 2VM2A 3CSJA 1R5AA 3FYGA 4LMWA 1UC7A 2GDRA 4POBA 5DQYA 2LUSA 4N0ZA 2RUEA 1F2EA 4XRAA 1A8YA 2C1YA 2AUVA 3ZVJA 2GZZA 2FWEA 4POMA 3PR8A 2B1KA 4KA0A 2A2SA 3EYTA 3F8UA 4NPBA 4RUVA 3FZAA 5DJMA 1YY7A 2RM5A 4NHWA 4EF0A 2VD0A 3RPPA 5FT3A 3ISOA 3KXOA 2HT9A 1U3AA 1AW9A 3UBLA 2IMIA 5IPGA 2DJ2A 1WWJA 3G7IA 2HE3A 1THXA 4GQCA 4DVCA 2DMLA 1WP0A 1MD4A 4NV2A 3R2QA 3KCMA 2L6DA 3NOFA 5F07A 4BWQA 2CX3A 2MMOA 4AF2A 4V2NA 1JZWA 1XWAA 5DALA 1MEKA 3N9JA 1XFLA 5GZZB 1F37A 2LJRA 4HS1A 4HZ4A 3JCML 5HFIA 1XWBA 1ZGNA 4RQXA 2KLXA 5D9XA 5GSSA 4JZQA 2KHPA 3TUEA 4TR3A 3U6VA 1SKSB 1FW1A 1KBNA 1NM3A 3ZLPA 2WDUA 3DMLA 1AUCA 3M9KA 2PU9C 5ECOB 2L4CA 4MDCA 2IN3A 1TRUA 4Q5NA 4TVEA 4WF4A 3TCOA 2ZUPA 1T1VA 5B6NA 2GLRA 5HFGA 4XHMA 4TRXA 1PGTA 5DDLA 4KAEA 4XTSA 4D73A 2K9FA 1PKWA 2X8CA 4V2MA 5DALB 3HJOA 1EOHA 3QR6A 4GWRA 5B6MA 3H93A 2AAWA 5ECIB 1XWGA 3DVXA 1EEJA 1XW6A 4EC0A 5B8AA 4MJAA 3MWHA 2YANA 3G9BA 4G10A 3TDGA 1TRWA 2H71A 4TN8A 3NIVA 2VCZA 5IOXA 1M2AA 2YP6A 4MMMA 3DXBA 2H1AA 2WFCA 1TW9A 5ECQB 2B7JA 1N2AA 3FZ4A 4L0WA 2ZCTA 4OD7A 8GSSA 5F8BA 5A4WA 1EZKA 1TOFA 4AGSA 1ERVA 2QC7A 1XWCA 3FK8A 5EY6A 4WF5A 4ULXA 5CRHA 2XBQA 4ZILA 1PL1A 4TW5A 4D73B 5J9CA 5KN1A 3A2XA 4IKHA 1TTZA 1Z6MA 1HD2A 4BPYA 4MH2A 3J7Yb 2CT6A 2O8VB 4IQ1A 3FEUA 3KZQA 4RI6A 3ZMLA 3TKSA 3F3RA 4HJMA 2EIOA 2H66A 4IVFA 1GSUA 3I9V2 4IQAA 1AC1A 2JSZA 3LXZA 3VPQA 2LNSA 1QGVA 2R2JA 3Q18A 1VF3A 1X5CA 3KMNA 3CYNA 4MZCA 3BCKA 2C0DA 5D93A 5C00A 4CHSA 18GSA 1H4OA 2PWJA 4V1Ap 3F4TA 3WT1A 1PD21 3KP8A 3IXRA 2TIRA 4HZ2A 1FHEA 2HRFA 5CRWA 2FNOA 3VI7A 3KH7A 3UMAA 1HYUA 4L0UA 2HXKA 1O81A 20GSA 2O89A 4MCUA 3UVHA 1ON4A 3HY2A 5E4WA 3C1SA 5D96A 3DYRA 2NTOA 4WBRD 3O3TA 3IPZA 1BG5A 4YAVA 4ECIA 2Z9SA 5EVOA 2LV3A 4TKYA 4V1Ag 1TK0B 3GN3A 4FO5A 1GTBA 5G1KA 3CRTA 3FZ5A 1FVKA 2LSTA 1M0UA 1ZL9A 2NBSA 2YWIA 2C3TA 4MPGA 4O92A 3VWWA 3LSZA 2FHEA 1A23A 1XW9A 3VWVA 4GTUA 4LLRA 1EP7A 5D9TA 1WIKA 3D4MA 1THOA 4HU9A 2JL4A 4K2DA 1AAZA 1I9DA 1Z7RA 3QPMA 5H5RA 1SJZA 2FWGA 3GKNA 1X0RA 2IPAA 3TRQA 3W8JA 3UOMA 2F3MA 3E3EA 5GSTA 2VM1A 2D2ZA 5IO2A 1I5GA 3MNGA 4TR1A 2LRNA 5ABRA 4HDEA 2H8LA 4I5QA 3HDCA 5IPHA 4FIWA 3EMXA 5CREA 1YEXA 4IELA 5D8IA 2IIYA 4IP6A 2IFQA 2X99A 2B5YA 1JFUA 2B1LA 1V40A 2DIYA 2PMTA 1GLPA 1S3AA 1GSEA 4PNGA 5KN0A 2YWMA 5A4UA 3EC3A 5C04A 2BTOT 4EXJA 4KDYA 5IOWA 5CP1A 1K3LA 5IMVA 3GH9A 1EP8A 4NWYA 2LS5A 3SBCA 4ILFA 1TI3A 1XVQA 2L57A 3EU3A 5DCHA 2O85A 1XBSA 4I2UA 4TR1B 4L8EA 3TKPA 1E2YA 3ZL5A 3F3QA 4YQVA 1KEBA 2FA8A 3EE2A 4GQFA 2L59A 4K8MA 2VLVA 3Q19A 3GX0A 1K3OA 3BJ5A 3FZ9A 1TU7A 2IFQB 2AYTA 1V58A 2VL9A 2J9HA 1QK8A 4E8HA 3TKSC 4WR5A 2J23A 3EU4A 4LL1B 2QGVA 1NHYA 1WOUA 1CQGA 4KUNA 4XIHA 4F03A 2IMKA 4MK3A 4Z7XA 3ED3A 3BOAA 3HYPA 4X0XA 2MYGA 2B5XA 3L9VA 14GSA 2H6ZA 2F9SA 1XWKA 3A2WA 2VOCA 1F9MA 5JWOB 1Q98A 1XPVA 3HXSA 3PH9A 4EE0A 2JU5A 1AQXA 2NVLA 4KE3A 4ZBDA 3KJYA 2GTUA 3TOUA 2VCXA 1ZYQB 2DBCA 3KTBA 2FD3A 2XBIA 3RBTA 1ACVA 3WYWA 4EUYA 2HZEA 3QCPA 4PQIA 2F8FA 1U87A 2JACA 1XOAA 2IMEA 3I43A 1H75A 1NHOA 3AY8A 2TRCP 5KN3A 3APQA 4OO4A 3IA1A 4RI7A 1QUWA 4HUAA 5DCGA 2GT5A 5JCUA 4ID0A 3IDVA 5ID2A 5COHA 1G6YA 4NV5A 2M72A 1OKDA 3HZ4A 1U3IA 3CSIA 4X1UA 2C0EA 4HEA2 2HNLA 1HNAA 2DJ1A 1SYRA 4ZB8A 3ZYWA 4BVYA 1N8JA 1ERUA 5B7CA 1K3YA 3LEFA 5LD0A 1YJ6A 2WZ9A 1JHBA 4HI7A 19GSA 2VIMA 3F9UA 1LJRA 5AISA 2VLTA 1X5DA 1VF1A 3LJRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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