The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4MAC A; 1FD6 A; 1YMH E; 1IBX B; 2JSV X; 2N9L A; 2ON8 A; 2J53 A; 2KQ4 X; 5BMI A; 5HI1 A; 2QSD A; 1HEZ E; 1YNT E; 1K50 A; 1P7F A; 1IGC A; 5HFY A; 2LHE A; 4OZA A; 3UI3 A; 2JXT A; 4GLS C; 5BMH A; 2ONQ A; 3V3X A; 1PGB A; 2RMM A; 1IBX A; 1MHH E; 2QMT A; 4IKG A; 1XCT L; 1EM7 A; 2I38 A; 2ZW1 A; 2LHD A; 1MHX A; 3GB1 A; 4KGS A; 1ZXH A; 1Q10 A; 4KGT A; 1JML A; 4IOI E; 4WH4 A; 3MP9 A; 4HJG E; 1GB4 A; 1UWX A; 1PGX A; 2KWD A; 2IGG A; 2KDM A; 1XCQ L; 2J52 A; 1QKZ A; 1HZ6 A; 2PTL A; 2KAC A; 2GI9 A; 2IGD A; 1P7E A; 2NMQ A; 2RPV A; 4OZB A; 5HHD G; 2OED A; 1F2R I; 2IGH A; 1K53 A; 2JZP A; 2N7J A; 1PGA A; 2EEL A; 2PLP A; 1IGD A; 1GB1 A; 1HZ5 A; 2I2Y A; 2N9K A; 1MVK A; 1D4B A; 4OZC A; 2K0P A; 5HG2 A; 1K51 A; 2JU6 X; 2LUM A; 1MPE A; 4D2K A; 4HKZ E; 1FCL A; 5JXV A; 1F2R C; 2KN4 A; 1C9F A; 2JWU A; 1MI0 A; 2LGI A; 3FIL A; 1FCC C; 5BMG A; 1K52 A; 2ZW0 A; 2GB1 A; 3FIL B; 4KGR A; 1KH0 A; 2PW9 A; 1XF5 L; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RPQ A; 4FA6 A; 2BPS A; 5LLI A; 4ANX A; 3PRE A; 3ZRC A; 4F8C B; 2FE8 A; 2KQ4 X; 3P1M A; 3QAQ A; 2WYQ A; 3PRZ A; 4ZYS A; 3ZKJ C; 1XLO A; 3RNC C; 4BAX A; 5FR3 A; 3Q3N C; 4GIV A; 2ACZ B; 1K50 A; 1P1A A; 1N5W A; 5IKC M; 1LXD A; 2ZZP B; 3N9Y C; 1WM2 A; 3MFG A; 1I4H A; 2KVR A; 1T0Q C; 2PJH A; 4M01 A; 1WE7 A; 1XT9 B; 4NY0 A; 4WJP A; 4IDI A; 4GGQ A; 1LO5 D; 3BVG A; 1UBQ A; 3GB1 A; 1ZXH A; 2VZK D; 1AN8 A; 1JML A; 4HJG E; 3RT3 B; 1PGX A; 1AWD A; 4G3X B; 3DCG A; 2J42 A; 3ZO5 B; 4A6Q A; 2HD5 B; 4MEM A; 1VZ8 A; 2QCZ A; 3QIJ A; 2GBN A; 3HM3 A; 1CJE A; 1P7E A; 2KX0 A; 1HQR D; 2BTE A; 2M8S A; 2KWC A; 1L6V A; 1VDV A; 1QF6 A; 4XX5 A; 3GZN I; 5TR5 A; 1WX7 A; 4PK1 A; 3CWI A; 4AUQ C; 3J9C A; 2RDG A; 5KHQ A; 3PRP B; 1PGA A; 3A4R A; 3NS8 A; 2MSE D; 1L4D B; 3R7Q A; 1MVK A; 1VJK A; 3QAR A; 4N59 A; 3E56 A; 4B0E A; 4DHJ D; 2WXG A; 2KAJ A; 4W9E A; 4B6W A; 3PTF C; 2NTT A; 4HKZ E; 4LNF A; 4W9L A; 1OEY A; 1WRD B; 2HJ1 A; 1XQQ A; 1C9F A; 4LJP B; 2N1W A; 4NJ7 A; 1DYQ A; 5D2M B; 1T0R C; 4AWJ A; 3BII D; 1T6B X; 5FK9 C; 1MJD A; 2EMT A; 2LXC A; 1GG3 A; 3BVZ A; 2CHZ A; 1PDX A; 2G4D B; 4YSX B; 1P7F A; 2CHX A; 3A9J B; 4FJV B; 2JPH A; 3C19 A; 4KZ0 A; 4RM9 A; 3QWZ B; 2LI5 A; 5C23 A; 3HUI A; 1ET6 A; 2AEH A; 3QHT A; 3PS6 A; 4C7Y A; 2K22 A; 1L5P A; 4KGS A; 1V97 A; 2KFK B; 4WIP A; 4US8 A; 2I1J A; 3P2B A; 3UQA A; 2NS5 A; 2M19 A; 4B0M A; 3LYY A; 4RGN A; 2ZEQ A; 5JH5 C; 3H8H A; 2KN5 A; 2G1E A; 3MC8 A; 1JQ4 A; 3DBL B; 1L0V B; 1QOG A; 3OJ4 B; 4US9 A; 2WWZ A; 3L54 A; 3DVN V; 4A90 A; 1WGD A; 2KMM A; 2ZPN A; 3W5U B; 1HZ5 A; 2LAS A; 1IPG A; 2QC8 A; 3L0W B; 2CU1 A; 3NS1 A; 5D7G A; 4WWN A; 1SXT A; 3EA6 A; 1S1Q B; 2CS4 A; 1GPX A; 4TQ1 A; 2WXR A; 1SE4 A; 1I4X A; 2WXK A; 3NOB A; 2OOB B; 4MM3 A; 1JWS D; 2JWU A; 2LEK A; 3V05 A; 3QC8 B; 4WJN A; 3WAM A; 2V3P A; 2D5G A; 3DQV A; 4MAC A; 2IJ0 A; 1FD6 A; 1E9M A; 2N7E A; 2FAZ A; 1JCK B; 2KMC A; 1F9J A; 4NAM A; 1V2Y A; 4KDI C; 3RNF C; 2JWZ A; 1NI2 A; 4WWM A; 3H7P B; 2KQS A; 1ZOY B; 2KDE B; 3M63 B; 3B2G A; 3U8Z A; 3AU5 A; 3TEZ A; 1BXT A; 3DOW A; 3VH4 B; 4EZJ A; 3QJZ A; 3HIZ A; 3RYT A; 4EE2 A; 2LRU A; 2K25 A; 3EHV A; 1KOT A; 2XBB C; 3L10 B; 2J7Q B; 3GP7 A; 4BKS A; 4KVG B; 1ZKH A; 4HLE A; 4PYU A; 3TEX A; 4YTN B; 2ICI A; 4R3D A; 3K9O B; 1F1H A; 2V4I B; 2WQY B; 4GOC A; 1I42 A; 2SAK A; 4HRS A; 1HZ6 A; 4RGT A; 3BY4 B; 3RZF A; 3NHE B; 4W9I A; 3MHS D; 2MJE A; 2H88 B; 3PRM B; 3AI5 A; 1XD3 B; 3KUZ A; 2KVZ A; 3N1X C; 5BYS A; 4BOZ B; 1PUT A; 3P63 A; 3KLS X; 2KLC A; 1D4B A; 1MG4 A; 3P4Q B; 4YSY B; 1E7U A; 1TKE A; 3VRA B; 4OVV A; 4DK5 A; 2FCQ A; 3UIN B; 2PVO D; 2LVP A; 2Y5P A; 5C2T B; 2W54 A; 2AX5 A; 3M62 B; 3KYC D; 1C3T A; 3BVM A; 3VR8 B; 5FR6 A; 4FBJ B; 2C9W B; 4ZRI A; 1I4G A; 4JPS A; 4KGR A; 2GB1 A; 1C77 A; 1A5R A; 2PE6 B; 1FO4 A; 4WUR A; 1WYW B; 2DYB A; 4WAA A; 1PYW D; 4WJQ A; 1HTO A; 4LNN A; 4HKQ A; 3IAM 1; 1QOA A; 2Q5W D; 4ITK A; 4I6N B; 2K1F A; 4RGM A; 1OEY J; 1XO3 A; 4JWU C; 1V80 A; 2NTS A; 2QMT A; 3NJT A; 1N5X A; 1I35 A; 3AE2 B; 3V62 A; 3PZ8 A; 3W1S C; 1WGK A; 2KDI A; 1SJH D; 1YQ3 B; 2N4F A; 1WMH A; 4IOI E; 3AH7 A; 1SB3 C; 1TY0 A; 3DPD A; 2KHW B; 3Q69 A; 2HJ8 A; 1JRP A; 4JQW C; 5FKA C; 2UU7 A; 4J3O D; 4KIK B; 2L1A A; 2WXO A; 2LXA A; 4ZRK A; 1YQB A; 2KLG A; 4OZB A; 4RFB A; 2O2V A; 4P1B C; 1WFY A; 4C7Z A; 2W82 A; 3TEY A; 1ZP0 B; 3PHX B; 2EEL A; 2FCN A; 2PLP A; 4MDK E; 5E6N A; 2MRP A; 1JRU A; 2BWE S; 3EGR A; 3PPA A; 4MT5 A; 1WRI A; 1T3Q A; 1WXQ A; 4H2A A; 3AE3 B; 4GMV A; 1V49 A; 2MBQ A; 1JWM D; 3ZJU A; 4D2K A; 1SF0 A; 1TYG B; 3ZW3 A; 2Z59 B; 1UUP A; 2JF5 A; 3UGB B; 1JAL A; 1FRD A; 1FCC C; 4A3O A; 3QK0 A; 4AP4 C; 2B3A A; 3VAW A; 4ZDV A; 4CYE A; 2O6V D; 1IBX B; 2M1M A; 2C7M B; 4WQM A; 2IY1 B; 1TJE A; 2KTF A; 1OQQ A; 2N9E B; 3QQ8 B; 1YNT E; 3EFC A; 3AE4 B; 4MH0 E; 1STE A; 2FCM A; 3KUC B; 1ZDX A; 3JSV A; 1HE8 A; 3APF A; 2K3U A; 1PGB A; 5JHA A; 4P7I A; 1GAQ B; 3Q14 C; 4BFR A; 1SGH A; 1WWT A; 2IPK D; 5AZH A; 3MHZ A; 1E8W A; 2ZW1 A; 3DWG C; 5CX3 A; 1N6Z A; 1YJJ A; 2NCN A; 3BIN A; 5AZF A; 4WH4 A; 3T8M A; 1WMH B; 5T8I A; 2L52 A; 1WJU A; 2BT6 A; 1I4Q A; 1E0Z A; 2BF8 B; 1C1Y B; 4MGK E; 5IN7 A; 2RPV A; 3N20 C; 1DOI A; 4RNA A; 5AZG A; 3UIP B; 2MP2 B; 1FFV A; 1WGG A; 1EU4 A; 2XK5 B; 3N32 A; 2O2V B; 3AB5 A; 2KK8 A; 2IGH A; 3AM9 A; 3NZU A; 4GN1 A; 4MSM B; 1TZ1 A; 1ZUD 2; 3VXW A; 1KFY B; 2KOX A; 4OZC A; 2K0P A; 5HG2 A; 2MBB B; 3Q8C A; 1M94 A; 1M4V A; 3U30 A; 2JZ3 B; 3DVG X; 3VH3 B; 3UQB A; 2VZK B; 1V5T A; 2INC C; 4CQN A; 4HVB A; 5E6O A; 2RD0 A; 4GDL B; 3A33 B; 1V9J A; 3DBL I; 2V3S A; 4ICV A; 1SJE D; 2REX A; 4IUM B; 3M3J A; 2VH1 A; 1XF5 L; 4WQO B; 4JL9 A; 3VFK A; 4JWS C; 2WNM A; 4XWW A; 2MW5 A; 4A55 A; 1KJT A; 2V3N A; 4NJ6 A; 5AUI A; 5DCN A; 1TY2 A; 5L83 A; 3IT4 B; 1IGC A; 1I4R A; 1DOX A; 3FKY A; 4XE0 A; 4YTM B; 2WXP A; 2XN9 C; 4BKT A; 3BK2 A; 2PEA A; 3L17 A; 1KLU D; 3N1Y C; 2WXJ A; 2WDQ B; 3ZTD A; 4S0R A; 3KH0 A; 3VTW A; 1HTQ A; 2D2Q A; 3DHG C; 4WWO A; 3W5V B; 1NVI D; 2JRI B; 3A9J A; 5MPO A; 1UWX A; 4BZA A; 2IGG A; 2W55 A; 4N6E B; 1DOY A; 3TSS A; 2KMA A; 2PTL A; 4HEA 1; 2KAC A; 3DBR B; 4N58 A; 2NMQ A; 1SE2 A; 5C1Z A; 4W9J A; 1TS3 A; 1RWS A; 4PYZ A; 3ETR A; 5EE3 A; 2AQ2 B; 2NVU I; 3ZXV A; 2KFK A; 4KSL C; 4RMA A; 4HXD A; 1K53 A; 2WXQ A; 3JW0 X; 3AEA B; 4C4V A; 2WXM A; 2I2Y A; 3PHW B; 2KDB A; 3B08 A; 5LXH A; 2IND C; 2IO2 B; 1MPE A; 3WAO A; 2K8H A; 5G5G A; 2I1K A; 1FRR A; 5EDS A; 3LDZ E; 1Q5W B; 5BMG A; 5IP4 D; 4PS8 A; 4DHZ B; 2MX2 A; 1KH0 A; 1TBE A; 3RUI B; 2ZVN A; 2DZI A; 2K6D B; 4IM0 A; 3P4P B; 1WX9 A; 3N1Z C; 2LVQ A; 3ZUN A; 2L00 B; 4OVZ A; 4MSQ B; 3RN9 C; 2LGX A; 5HI1 A; 5JHB A; 2WDR B; 5HFY A; 4LNK A; 2IBI B; 3HVZ A; 1L2N A; 4LNI A; 3L08 A; 1CMX B; 3A1Q B; 1WJ6 A; 3SFD B; 4EEW A; 1XLP A; 2DBY A; 2WX0 A; 5G55 A; 4KDL B; 2J0K A; 2JX5 A; 4XC2 A; 5DPR A; 4EZK A; 4FJZ A; 1C4C A; 4B95 A; 5EE0 A; 3ZQ4 A; 5IA7 A; 3H7P A; 5J18 A; 1J7C A; 2CKH B; 2KTR A; 1IP9 A; 1GB4 A; 1GJZ A; 3V6E B; 4DBG A; 4EZL A; 1E10 A; 3TL5 A; 1IYF A; 4OW0 A; 1K8R B; 4ZRJ A; 3ZIM A; 2UWQ A; 4E71 A; 3U7Z A; 2EMS A; 4CO7 A; 4DQO C; 5CHW A; 1TIF A; 4RM8 A; 1EU3 A; 3RNB C; 4LK0 M; 1OFF A; 3VRB B; 4WJO A; 1V1P B; 1JRO A; 1AW7 A; 3CF6 E; 1YIW A; 4NQL B; 3NZ3 A; 1IUE A; 4G11 A; 4TV3 A; 4C4V B; 1EO6 A; 4NPN A; 2ZJD A; 1C4A A; 4K7W A; 4AS1 A; 2BYT A; 1ZW7 A; 1YN5 A; 1FNU A; 4NNJ B; 2R61 A; 4HPP A; 2LUE A; 3RNA C; 2KC2 A; 1EUV B; 2D3A A; 3ENE A; 1FFU A; 3ZDT A; 3N3K B; 4IG7 B; 2LGI A; 3FIL A; 3GS2 A; 1JWA D; 4HWI B; 2BYF A; 1CQV A; 2M17 A; 1TS2 A; 4TKN A; 1WI0 A; 1ZGU B; 2M4N A; 1UGM A; 2K8C A; 1AYF A; 2H89 B; 4DXG A; 2QSD A; 3ZXR A; 3AUL A; 1VD2 A; 1QQR A; 4E74 A; 4M0W A; 3MJW A; 3RNE C; 2UYZ B; 4OZA A; 4XWT A; 1WF9 A; 2KO3 A; 4GLS C; 2M0A A; 1WM3 A; 2KFJ A; 3MC0 B; 2OHF A; 3URY A; 2MJ3 A; 2I38 A; 3KWV A; 3NVZ A; 2D3B A; 2LHD A; 4K3B A; 3IHP C; 2MBO A; 1QLB B; 2LGS A; 3DBS A; 4I6P A; 2K5P A; 2G4S A; 4AJW A; 2G3Q B; 3SD5 A; 1Z2M A; 1J19 A; 2KWD A; 3PLV A; 2KTR B; 3OG5 A; 3TIX A; 2BS2 B; 4K1R B; 4ASW C; 1DGJ A; 1J7B A; 2O6V A; 1WXM A; 4HCN B; 2GI9 A; 4RF0 A; 1ZE3 D; 2Z0E B; 1BML C; 2DHZ A; 1FNW A; 2BBC A; 2JY6 A; 2YVC A; 1ZDV A; 2XEW A; 5EE9 A; 3W9C B; 5IO9 A; 1NI3 A; 1FM0 D; 2KT7 A; 3JVZ X; 1QOB A; 3V60 A; 4KIK A; 1FIQ A; 2AQ3 B; 4HJK A; 1E8Y A; 2WXN A; 1UEL A; 4XZ4 A; 1P3Q U; 2PMV A; 3T3O A; 2E6X A; 4HK2 A; 2L83 A; 2C60 A; 3FIL B; 4JE3 B; 1C78 A; 2PW9 A; 3VQI A; 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3L13 A; 3OJ3 A; 1NDD A; 4XDD A; 2LJI A; 4BOS C; 3AEB B; 3PLU A; 3DBH B; 2MJD A; 1MHH E; 1F52 A; 4EKU A; 4FJY A; 4P6V F; 1C76 A; 3H7S A; 2NR2 A; 3IFW B; 2KYW A; 4MJS B; 1T0S C; 1V1O A; 3ECI A; 3ZGZ A; 1RFK A; 3EC8 A; 1WH3 A; 3WA0 A; 2K6Q A; 3WAN A; 3TCA A; 1V6E A; 3PO0 A; 2KJ6 A; 1SEB D; 4M02 A; 4FN2 A; 4N9F 4; 4RCO A; 1J0G A; 4ANV A; 5BYR A; 4XGA B; 1YX6 B; 4F7Z A; 3B1L X; 1GC6 A; 1L0Y B; 2OJR A; 1F2R I; 1TKY A; 2N7J A; 1V8C A; 4EOY A; 1WX8 A; 2M56 B; 4W9F A; 2Z0D B; 2GOW A; 2MHJ A; 4KV2 A; 5J17 A; 2FNJ B; 1VR9 A; 1BT0 A; 3PV1 A; 1TGZ B; 3SEB A; 2QIL A; 4DXA B; 2INN E; 2PPH A; 3B0A A; 3VUY A; 2KN4 A; 1T0Y A; 1WJN A; 3TJP A; 2L3Z A; 3T3N A; 4FUL A; 3SU8 X; 1P98 A; 3R3M A; 3WCQ A; 2WXL A; 4RF1 A; 1N63 A; 2D3G A; 1VCB A; 4ZYN A; 3DVN U; 4GU2 A; 2QIE B; 3APD A; 2KXJ A; 3A9K B; 2KD0 A; 1J7A A; 1EWC A; 2R2O A; 1E90 A; 2ZVO A; 3ZRF A; 1FPY A; 2N1V A; 4TMA B; 2JXT A; 3Q3M C; 2LZ6 A; 5BMH A; 2L7R A; 3AE7 B; 4P16 A; 3AE5 B; 2KWV B; 1SE3 A; 4KSK C; 2K9X A; 5C3J B; 3LXF A; 2L05 A; 2CR5 A; 3IAS 1; 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