The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
14
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MI0 A; 2J52 A; 4HJG E; 2N7J A; 4KGS A; 2KQ4 X; 4HKZ E; 3FIL B; 1FD6 A; 1F2R I; 4GLS C; 3GB1 A; 2JSV X; 4MAC A; 3MP9 A; 1PGB A; 2QSD A; 2PW9 A; 5BMH A; 2IGH A; 3FIL A; 2J53 A; 2ZW0 A; 2ON8 A; 2JU6 X; 4KGT A; 2JWU A; 5JXV A; 1XCQ L; 2QMT A; 1PGA A; 1IBX A; 2RMM A; 4D2K A; 2RPV A; 4WH4 A; 2K0P A; 2JXT A; 1IBX B; 2KDM A; 1MHX A; 1UWX A; 2PLP A; 1MHH E; 2LHD A; 2GB1 A; 1K53 A; 5HHD G; 5BMG A; 5HFY A; 1FCC C; 3V3X A; 2N9K A; 1XCT L; 1Q10 A; 2PTL A; 4OZB A; 2LHE A; 1KH0 A; 2OED A; 3UI3 A; 5HG2 A; 2KAC A; 1MPE A; 2KWD A; 2ZW1 A; 4IOI E; 1PGX A; 1YNT E; 1P7F A; 1EM7 A; 4OZA A; 2EEL A; 5HI1 A; 2IGD A; 2IGG A; 1P7E A; 1K50 A; 4KGR A; 1D4B A; 1K51 A; 2KN4 A; 1IGD A; 2ONQ A; 1HZ5 A; 1XF5 L; 1GB1 A; 2GI9 A; 1IGC A; 1HEZ E; 2LGI A; 1YMH E; 1FCL A; 1QKZ A; 1MVK A; 4IKG A; 2I2Y A; 2JZP A; 1JML A; 1GB4 A; 1HZ6 A; 2LUM A; 2NMQ A; 2N9L A; 1F2R C; 1K52 A; 1C9F A; 2I38 A; 1ZXH A; 4OZC A; 5BMI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LXA A; 3HK0 A; 4BBN C; 2LRU A; 4K7U A; 2JX5 A; 3RUI B; 2V4L A; 2YVC A; 1S1Q B; 2JSV X; 1WXA A; 2BF8 B; 1OEY J; 3MP9 A; 4HK2 A; 2JF5 A; 3PRP B; 5E6P A; 1G6J A; 3LB8 C; 4GN1 A; 3W1S C; 2J53 A; 1I4Q A; 4CQN A; 3ZNZ B; 2MEK A; 2JU6 X; 1J7B A; 5T8I A; 4W9C A; 2BGF A; 3SEB A; 3WAM A; 4PK1 A; 3H7S A; 2JXT A; 4P16 A; 3MHZ A; 5FR6 A; 2DX5 B; 3BVM A; 3IT4 B; 2D3B A; 1P1A A; 1E7U A; 4F8C B; 3VH3 B; 1QF6 A; 2KWV B; 3KWV A; 3PS6 A; 2LGS A; 2V1Y A; 1XCT L; 4YWG G; 1VZ6 A; 1P9D U; 4ANV A; 2QJL A; 3PZ8 A; 3K9P B; 4HDQ A; 1TKE A; 3KUZ A; 4ZOH C; 1J7A A; 2LHE A; 2KZR A; 5AZG A; 3L0W B; 2LUE A; 3KUC B; 3AEG B; 2ZW1 A; 3BIN A; 2BBC A; 3VVW B; 3BVZ A; 4DQO C; 2CJO A; 3L13 A; 3RNG C; 4KX6 B; 3P4R B; 4ARC A; 4URK A; 1KM7 A; 1KTK A; 4RM8 A; 4EZL A; 5AZF A; 1E10 A; 3DHI C; 1IGD A; 4PS8 A; 2LZ6 A; 4MT5 A; 2C60 A; 1TS4 A; 2FAZ A; 3LJ3 A; 3VTW A; 1VZ8 A; 1T5X D; 2ZPY A; 2XBB C; 3C19 A; 4XE0 A; 3SDL C; 1ROE A; 3NOB A; 4IKG A; 4BOS C; 5AUK A; 2FCQ A; 3NZS A; 2KTR A; 1YQ4 B; 1DYQ A; 2UU7 A; 1T0Q C; 1FXI A; 1LQB A; 4OZC A; 1KLG D; 3TIX A; 2HD5 B; 1JRP A; 4C7Z A; 3N3K B; 2M0A A; 4WJQ A; 1WM3 A; 4DXA B; 1T0Y A; 2X8X X; 5C23 A; 1BT0 A; 2BTE A; 1WE6 A; 4GIV A; 2BW2 A; 3KWL A; 4E74 A; 5H92 C; 4HJK A; 5BMH A; 1E6E B; 2LFI A; 3JSV B; 1R7S A; 1P3Q U; 1WJ4 A; 4N58 A; 3RN9 C; 4NQK E; 2RPV A; 3KVF B; 3ZTD A; 2KFK B; 1VR9 A; 1V1P B; 1E8Y A; 1E0Z A; 1SJE D; 3NUH B; 3SU8 X; 1OTR B; 4MGI E; 5L83 A; 1SE2 A; 4YSX B; 1FIQ A; 2WX1 A; 2JXX A; 2QC8 A; 1OGW A; 5AEK B; 3TSS A; 2RDG A; 2HTH A; 1R4M I; 2GBJ A; 3U7Z A; 3QJZ A; 4KKI A; 3RNE C; 5DPS A; 1M94 A; 1QOG A; 4OVV A; 2WDV B; 4NZL B; 5DPT A; 1WI0 A; 1NI2 A; 2ZPN A; 2J42 A; 3K9O B; 1FPY A; 1ISN A; 2O6V B; 4ZHO A; 2CU3 A; 4FUL A; 3EFU A; 4YTN B; 2DAJ A; 1L4D B; 3RNF C; 1WXM A; 2X38 A; 4TQ1 A; 1XF5 L; 5FK9 C; 3V62 A; 2D10 A; 1L5P A; 1VCB A; 5CTR C; 1OQY A; 1MFW A; 2GBR A; 4I6P A; 4HVB A; 4BVU C; 5IAA C; 1D5X C; 3ZRF A; 2BKF A; 2KMA A; 2ZNV C; 1C4P A; 5HKH A; 1WX8 A; 3CIR B; 3FIL B; 4HPP A; 1X1M A; 2KDI A; 3ZIM A; 3EA6 A; 3GB1 A; 3I3T B; 1S3S G; 2V4I B; 1RRB A; 4A8X C; 4FA6 A; 4HCN B; 2M8S A; 3VUY A; 2BKR B; 1PQS A; 4MJS B; 3UIO B; 4DDI D; 2MRP A; 4A9A A; 3P4P B; 2CS4 A; 3HIZ A; 4B0M A; 2ZNV B; 3TBL D; 2KVZ A; 2UYZ B; 2KDM A; 5J2R A; 2SEB D; 4ICU A; 3BK1 A; 2ZEQ A; 1UWM A; 2KHW B; 1Q0W B; 2OJW A; 3QIJ A; 4HCP B; 2DYM A; 5DCN A; 2IO2 B; 1TKG A; 3BY4 B; 4GDL B; 3NVZ A; 3PV1 A; 1ZKH A; 3Q69 A; 2WXQ A; 4XYC A; 2KQS A; 2WHI A; 4GDK A; 1SIJ A; 3RZW C; 1F1H A; 1EM7 A; 3M95 A; 2QIL A; 4KZ0 A; 1D4B A; 1C4C A; 3VQI A; 3MC8 A; 2W9N A; 2K6Q A; 3NY5 A; 1WRI A; 1YX5 B; 4LK0 M; 3ML8 A; 3APF A; 1I4G A; 4KSK C; 2NCN A; 4B0E A; 2LRW A; 3DQV A; 1FRR A; 4XWT A; 1XLQ A; 4HLE A; 4GXB A; 4LDT B; 3HUI A; 4BKT A; 1FM0 D; 1J19 A; 2NMQ A; 1WJN A; 2N1V A; 1TS3 A; 1N5W A; 1AYF A; 2INC C; 2DZM A; 3B0A A; 4IDI A; 2HJ1 A; 4FHJ A; 1NI3 A; 2KLG A; 1TIF A; 1UF0 A; 1WR6 E; 1WXQ A; 3VHT C; 4XX5 A; 4E3C A; 2D3G A; 1V97 A; 3AE9 B; 2LI5 A; 3OWE B; 1TS5 A; 4HRS A; 2V3P A; 2G9H D; 2K5P A; 1MG4 A; 2KNB A; 4RF1 A; 4ITK A; 3RFZ B; 4W9G A; 1V49 A; 4HWI B; 4AUQ C; 1PGA A; 4C4V B; 1IBX B; 4Q2J A; 2D07 B; 2ZCC A; 2L8J A; 3TCA A; 4L23 A; 1QZE A; 2FBW B; 3SFD B; 2DBY A; 3DBL I; 3N32 A; 4HXD A; 2KK8 A; 2BS3 B; 1C4A A; 3Q3O C; 1JWB D; 4TQ0 A; 1BUI C; 4PS3 A; 4LJP B; 1GAQ B; 1UBI A; 2PTL A; 2OHF A; 3TEX A; 4EZJ A; 2MBQ A; 5IN7 A; 5IOI A; 2KAC A; 4DHZ B; 1FNU A; 1OEY A; 1YNT E; 3BYY B; 4M01 A; 4IUM B; 2Z0D B; 1QLB B; 2LXC A; 3BVG A; 3HVD A; 2VRR B; 2MBH A; 3L54 A; 4TV3 A; 1A5R A; 4EKU A; 1N61 A; 2KN4 A; 3PZD A; 1N60 A; 2KX3 A; 4W9K A; 4NAW A; 5D94 A; 1GB1 A; 1ZXI A; 2N0S B; 3TUO A; 4YL8 A; 5JH5 C; 2NPT B; 3KUD B; 3N1Z C; 4RGM A; 2I2Y A; 4C00 A; 4MSM B; 2LUM A; 1V8C A; 1V9J A; 2WGS A; 4KIK B; 4BKG A; 1B1Z A; 3NZ3 A; 3H7P A; 2J52 A; 4ARI A; 3R66 C; 2G1E A; 1F77 A; 3RI7 C; 1SB3 C; 2WXM A; 2KJ6 A; 3C0R B; 4ZRQ A; 5GXG B; 3NRZ A; 3IHP C; 4WWP A; 4LLG M; 2IZV B; 3NS1 A; 3CF6 E; 1RM6 C; 3QWZ B; 2CU1 A; 2K8B A; 3TEW A; 3NZU A; 4PYU A; 2QSD A; 3N9Y C; 1IUE A; 2PE6 B; 2KWU B; 3DDC B; 1HE8 A; 1VJK A; 2ON8 A; 3I57 A; 1BML C; 2WWZ A; 1GJZ A; 2LJ5 A; 4S0R A; 1GG3 A; 2HTM E; 3VFK A; 3HVZ A; 1E8W A; 2AL3 A; 5EE9 A; 4EOY A; 1UWX A; 2GB1 A; 1WX9 A; 3AE8 B; 3H8H A; 4RMA A; 2BYF A; 3NG0 A; 5BMG A; 5FR3 A; 4MJS A; 5HFY A; 1JWU D; 4LNI A; 4LJO B; 4G3X B; 3HRD D; 4IWP A; 3R7R A; 2KDF B; 2FCS A; 1YN3 A; 1E7P B; 2L0F A; 1KH0 A; 2KKC A; 2KXJ A; 4A55 A; 2A5U A; 2LD9 A; 3OJ4 B; 2WDR B; 1XT9 B; 5HG2 A; 3X0W A; 1MPE A; 2KWD A; 1L2N A; 3SD5 A; 2LVP A; 2DWQ A; 3H7P B; 4MH0 E; 3GZN B; 3P2B A; 2MJE A; 3ZXR A; 5C1Z A; 2AEH A; 4W9L A; 2KJH B; 3FKY A; 4DXF A; 1NYQ A; 1K50 A; 3AE7 B; 1ZOY B; 1C79 A; 1FNV A; 1T0S C; 3B9J A; 3D32 A; 3KLS X; 1JWS D; 3ABV B; 4FAD A; 2MLB A; 1YQ3 B; 3QX1 A; 3Q8B A; 5BYR A; 2JQR B; 1ZGU B; 2Z59 B; 2KYW A; 3ZJV A; 2IND C; 2INN E; 2KTF A; 1UBQ A; 2MBE A; 2RPQ A; 1JWM D; 4TSS A; 1WIA A; 5MPO A; 2KDB A; 4TKN A; 3KYD D; 4MM3 A; 2V3N A; 3JVZ X; 4DDG D; 3CSF A; 4M00 A; 1KJT A; 3IAS 1; 5E6N A; 1HA5 A; 2EMT A; 2N7E A; 5BYQ A; 1DOY A; 2G4S A; 3U4E G; 5BO4 B; 2ZW0 A; 4NAM A; 1SEB D; 3W5U B; 1YX6 B; 4WAA A; 1LGR A; 1WGH A; 2WXN A; 4WH4 A; 2WXJ A; 2J0J A; 1L7Y A; 1ET9 A; 1MHH E; 4HPM B; 3O65 B; 3AEC B; 1NYR A; 1UD7 A; 5CHV C; 3DVG Y; 5IA7 A; 4YXD B; 3LXF A; 1ACC A; 3PHX B; 2L05 A; 1PDX A; 1STE A; 4WIP A; 1E90 A; 5DPW A; 3B1L X; 2KMC A; 1QOF A; 2I1J A; 2QEJ C; 1MG8 A; 1WH3 A; 4FN2 A; 4G50 A; 2KFK A; 3TEZ A; 1PGX A; 2AWT A; 3T3O A; 3L4P A; 3AU5 A; 2JYE A; 1EU3 A; 3S2A A; 3M63 B; 4WJO A; 5IO9 A; 4FBJ B; 1TYG B; 4XGA B; 3IG3 A; 2Z8L A; 3AH7 A; 1SIF A; 3PVL A; 3DWG C; 4RM9 A; 4S17 A; 4C4V A; 3RNA C; 3W2D A; 3L17 A; 5G5H A; 4BKS D; 1RLF A; 1XLN A; 1ZPS A; 1VD2 A; 3BII D; 1FXA A; 1XXG A; 5AZH A; 1IPG A; 4HKQ A; 4MEM A; 1UZX B; 4YSY B; 4J3O D; 3AU4 A; 3RPF C; 1GPX A; 2AL6 A; 4ANU A; 2O6V A; 1PYW D; 3DVG X; 2VZK B; 1JW9 D; 3OJ3 A; 4G11 A; 1WE7 A; 2K8C A; 5LXI B; 1JWA D; 2BB6 A; 2D2Q A; 2MHJ A; 4OHJ A; 4A20 A; 5LXH A; 3QAQ A; 1EF1 A; 1V81 A; 4WWO A; 1OFF A; 1XLP A; 4L1B A; 3RD2 A; 1AW7 A; 3DPD A; 3X23 A; 3PLU A; 1XCQ L; 2QCZ A; 3H6N A; 3A4R A; 4IG7 B; 1WJ6 A; 3HM3 A; 1J7C A; 3E56 A; 4C56 C; 2WS3 B; 4ANX A; 2WXO A; 3HM6 X; 4K81 A; 4IM3 A; 5D2M B; 2Z0E B; 2QHO A; 1K53 A; 1EWC A; 5HHD G; 4XC2 A; 4A90 A; 3SR6 A; 1WGD A; 3MFG A; 2C7N B; 4EE2 A; 2KJR A; 1ZUD 2; 2M56 B; 1SGH A; 3DBR I; 2GLS A; 1RWS A; 3PRZ A; 4KKJ A; 5GMV A; 3UI3 A; 5C2T B; 3A9J A; 2DHZ A; 3KW5 B; 4LNF A; 1F52 A; 2IGG A; 3GE8 C; 3Q3M C; 4LDT D; 3GZN I; 4EEW A; 1ZDX A; 4DHJ B; 1SF0 A; 2W3R A; 4TUU A; 2WYQ A; 3VUX A; 2H89 B; 3ONS A; 1YMH E; 4ZRJ A; 4BZA A; 1QKZ A; 4KV2 A; 1HTQ A; 1ET6 A; 4DHJ D; 5D6J B; 2K6D B; 5TSS A; 1TS2 A; 1TT5 B; 3VTV A; 2N9L A; 3WAN A; 1I35 A; 4DXG A; 1C9F A; 1WX7 A; 3AE6 B; 1FMA D; 4ZRI A; 5EE1 A; 3VRA B; 2KQ4 X; 3U7D A; 4FJZ A; 4YSZ B; 2CR5 A; 1FD6 A; 3DVN U; 2ZZP B; 1C76 A; 3URY A; 3PO0 A; 1P0R A; 3AM9 A; 2MP2 A; 1XQQ A; 1T0R C; 3L08 A; 4MSQ B; 3L10 B; 3WA0 A; 2RD0 A; 3OLM D; 3U2S C; 4LNK A; 2LGX A; 1E8Z A; 3Q2A C; 2DLB A; 5IP4 D; 2JWU A; 2K9X A; 2JZ3 B; 3AE2 B; 3A1Q B; 1T3Q A; 4JGH B; 4D2K A; 2KMM A; 2BPS A; 1V6E A; 4UDU C; 4HRO A; 3UIN B; 1R4N I; 4JQW C; 4CO7 A; 2D11 A; 2KAN A; 1YJI A; 3IXS A; 1CMX B; 3VAW A; 3UIP B; 4WWM A; 3ZW3 A; 2PMV A; 1LXD A; 2KFJ A; 2L76 A; 2NPT A; 3AED B; 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3PZ7 A; 2N4F A; 5C3J B; 3VRB B; 3T8M A; 1D5Z C; 2DNF A; 2ACZ B; 1DOI A; 4RCO A; 3EEC A; 2N7J A; 2JVC A; 3A9K A; 3QK0 A; 3W9C B; 1WGG A; 4W9D A; 2IBI B; 3W1Y A; 4JE3 B; 4BBN F; 3N20 C; 1E5W A; 2MCN B; 1WMH B; 5EDS A; 5D7G A; 4GB9 A; 4G0N B; 1CJE A; 1E8X A; 3VDZ A; 1WR1 A; 1YD8 U; 4KGT A; 4NPN A; 2DYB A; 1VRA B; 4BKS A; 2N9X A; 3AEF B; 3ZUN A; 4MGY E; 4RH6 A; 1H4R A; 4AS1 A; 1MHX A; 1HTO A; 1KOT A; 1UH6 A; 1YQB A; 4WQM A; 4IC7 B; 3ECI A; 4M8N A; 3V3X A; 1OQR A; 3WAL A; 3ETR A; 3PPA A; 4YTP B; 2WXL A; 1Q5W B; 3ZLZ A; 2I1K A; 3DHG C; 4NNJ B; 2D3C A; 2ICI A; 3E9S A; 2W55 A; 3Q3N C; 2GMI C; 4EZK A; 3DBH I; 4JWS C; 4LCD E; 1I4X A; 1WF9 A; 1N63 A; 1L0X B; 4HDO A; 4OVU A; 4RNA A; 4DK5 A; 4US8 A; 1NDD A; 5E6O A; 1UNS A; 4K7W A; 2IPK D; 5LNK 1; 2LWP A; 3R3M A; 2FCN A; 3T3N A; 4C7Y A; 3OAW A; 4JL9 A; 1HZ5 A; 2RR9 A; 2VH1 A; 2MW5 A; 2PVO D; 3MJ5 A; 5JHA A; 4ZRP A; 1SBB B; 3RUL A; 2AQ1 B; 4K7S A; 1C77 A; 2B3A A; 2FCM A; 2IDY A; 2YLM A; 3CMM B; 1TZ1 A; 2DZK A; 1KFY B; 2MA9 B; 2WQY B; 3Q3J A; 4NJC A; 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