The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| total genus |
14
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1IGD A; 2OED A; 1UWX A; 4HKZ E; 2IGG A; 5BMH A; 2ONQ A; 1P7E A; 1EM7 A; 4HJG E; 2GI9 A; 2LUM A; 3FIL A; 1MI0 A; 5HG2 A; 2IGH A; 2PLP A; 5JXV A; 1JML A; 2ZW1 A; 1HZ6 A; 2NMQ A; 2KQ4 X; 1FCL A; 2I38 A; 4MAC A; 2I2Y A; 2K0P A; 3GB1 A; 4OZC A; 2LHD A; 1IBX A; 4KGR A; 2KAC A; 4OZA A; 1HEZ E; 1K51 A; 2PTL A; 4D2K A; 2J52 A; 2JSV X; 4IOI E; 1XF5 L; 4OZB A; 1MPE A; 2EEL A; 1QKZ A; 4KGT A; 1IBX B; 1K50 A; 1GB4 A; 1GB1 A; 2GB1 A; 1MVK A; 1F2R I; 4KGS A; 2JU6 X; 1PGA A; 3V3X A; 2JWU A; 1XCQ L; 3UI3 A; 5HHD G; 1K52 A; 1FCC C; 1YMH E; 2JZP A; 2N7J A; 2QSD A; 1YNT E; 5HFY A; 1C9F A; 1D4B A; 1PGB A; 1PGX A; 1FD6 A; 5BMI A; 2RMM A; 2KN4 A; 1XCT L; 2LHE A; 5BMG A; 1K53 A; 2J53 A; 2N9K A; 2KDM A; 2QMT A; 1MHH E; 1HZ5 A; 2PW9 A; 1Q10 A; 2N9L A; 1P7F A; 2RPV A; 3FIL B; 4GLS C; 1ZXH A; 1F2R C; 2ON8 A; 2KWD A; 5HI1 A; 1MHX A; 2LGI A; 2JXT A; 1KH0 A; 4WH4 A; 2IGD A; 3MP9 A; 2ZW0 A; 4IKG A; 1IGC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OED A; 1VZ6 A; 4II2 B; 3X0W A; 2BKF A; 2HD5 B; 4ZRQ A; 3PGE A; 1RFK A; 3O65 B; 2NBU A; 3FIL A; 5T8I A; 3H7P A; 5IO9 A; 3PLU A; 3BVZ A; 4W9K A; 2KLC A; 4RGM A; 2ZJD A; 2MHJ A; 2B76 B; 2DWQ A; 2LVP A; 2KQ4 X; 4HCP B; 3A4R A; 3M95 A; 2I38 A; 2I2Y A; 1EUV B; 3PRM B; 4EZL A; 4L2Y A; 2XK5 B; 1KOT A; 1WXS A; 2K39 A; 3TMP B; 4ANX A; 3ZNZ B; 3GOE A; 2WHI A; 3ZNG C; 1DGJ A; 2AL6 A; 1I4G A; 4P6V F; 3VTU A; 1GB4 A; 2WXP A; 3MHS D; 2V9H A; 2MBH A; 2GB1 A; 5BYS A; 2Z59 B; 1I4H A; 1E90 A; 1NVI D; 3OG5 A; 2OOB B; 2WXJ A; 2KO3 A; 1ZGU B; 1GC6 A; 2CHX A; 4II3 B; 2KMM A; 3K9P B; 1GNU A; 3UGB B; 1TS5 A; 3VAW A; 2J0K A; 2LEK A; 2PPH A; 2KN4 A; 2LHE A; 3HM6 X; 2MX2 A; 2R2O A; 5BMG A; 3U7D A; 1LM8 B; 4LDT B; 3SEB A; 3NVZ A; 2QIE B; 4QAY A; 3AE7 B; 2QMT A; 3APC A; 1FM0 D; 2N9L A; 1WGD A; 2IBI B; 4IWO A; 3FAH A; 2KDB A; 1WGH A; 2KMA A; 3V6E B; 2V3P A; 1TKE A; 3MP9 A; 2BWE S; 3APF A; 4IKG A; 1E7V A; 2KWV B; 2X38 A; 3BII D; 3ZDT A; 4KDI C; 3QAR A; 2IO2 B; 2D5G A; 3ZIM A; 2LGX A; 4WIP A; 2LUE A; 1C78 A; 3Q69 A; 4BBN C; 3N3K B; 2J7Q B; 1YQB A; 3R7R A; 4ZRJ A; 3NZS A; 1V5O A; 4KVG B; 4C4V B; 2V0G A; 4BFR A; 2KOX A; 5D3D A; 3EHV A; 2FCN A; 4RM8 A; 3NRZ A; 1YN5 A; 2WX0 A; 3Q3M C; 1J19 A; 4F7Z A; 3QHT A; 3I9V 1; 1L0X B; 1JRP A; 5I4D A; 3A9J A; 2L83 A; 3ZKJ C; 5DPR A; 2FUH B; 2IO3 B; 2MBO A; 3DBH I; 4NPN A; 3DHH C; 1EF1 A; 4RNA A; 3RI7 C; 3S2A A; 3V05 A; 5KHQ A; 4GGQ A; 3A9J B; 2K6Q A; 3DQV A; 2LJ5 A; 1KLV A; 3LDZ E; 1P9D U; 4KKJ A; 1YNT E; 1C9F A; 1R4M B; 3ZTC A; 5JHB A; 3NVY A; 1ZP0 B; 2KDI A; 4OVZ A; 2J0M A; 2INP E; 2MQJ A; 1GAQ B; 4JPS A; 2KNB A; 1P0R A; 3NOB A; 2BQQ A; 2L05 A; 4HEA 1; 1K53 A; 1E7U A; 4N58 A; 1WRD B; 4LNF A; 2JX5 A; 2O2V A; 2ZVO A; 4ZDV A; 1EWC A; 3FIL B; 1WF9 A; 3IAS 1; 3M62 B; 3AB5 A; 1VCB A; 4FXC A; 3T3O A; 3BYT B; 2IJ0 A; 3H1U A; 2ON8 A; 3M3J A; 2G4D B; 1N6Z A; 2KWU B; 5TR5 A; 2MWS B; 5TSS A; 4W9E A; 3WA0 A; 4HKZ E; 3PS6 A; 1DOX A; 3D32 A; 3HRD D; 4BKG A; 1CMX B; 2IZV B; 2LGY A; 2KDE B; 3CWI A; 3GE8 C; 1T0Y A; 2D10 A; 2H89 B; 1WJ4 A; 2I1K A; 2XK5 A; 2BYT A; 1WH3 A; 3WAO A; 4P1C C; 1JML A; 2KX3 A; 2UYZ B; 2KJR A; 4JIO U; 3NZU A; 2IDY A; 1HZ6 A; 2WXN A; 1C3T A; 3M63 B; 4CHK A; 3IG3 A; 1AYF A; 4MJS A; 1I35 A; 1KM7 A; 2JF5 A; 5H8Y E; 5AZH A; 3B08 A; 2BVC A; 4YTN B; 1T0R C; 4KX6 B; 1NI2 A; 2C7M B; 2ZNV B; 5J2R A; 5FKA C; 1I4Q A; 1NI3 A; 3L13 A; 4FLH A; 3V6C B; 2L3Z A; 3GP7 A; 2PEA A; 1QIL A; 2A5U A; 2BYE A; 3NVW A; 4WJN A; 3QQ8 B; 2N9P C; 1F2R I; 1PGA A; 2LAS A; 3L0W B; 2KFJ A; 2LRW A; 1XT9 B; 1UEL A; 3FKY A; 1Q1O A; 1SE9 A; 2G3Q B; 1PGX A; 4YSX B; 3KYC D; 5BYQ A; 3RNE C; 1ET9 A; 3SHQ A; 5JHA A; 1UUP A; 3DHG C; 4YTP B; 2WXH A; 3QK0 A; 1DYQ A; 4KIK A; 2BBC A; 2YVC A; 1ZOY B; 2J53 A; 2WX1 A; 5D6J B; 2JT4 B; 2UWQ A; 2RDH A; 2RPV A; 4K7U A; 5C2T B; 4MT5 A; 2LGD A; 5FR3 A; 4F8C B; 3Q8B A; 2LGI A; 3TEX A; 2VZK B; 3P1M A; 5DPT A; 2DZK A; 2Q5W D; 1FNV A; 3GZN I; 1J7C A; 3KUD B; 3DVN U; 1RLF A; 3VQI A; 3W9C B; 1SSN A; 3AED B; 1JWB D; 4MSQ B; 3N9Y C; 2LJI A; 4YSY B; 2MRP A; 3ZXR A; 4W9C A; 3WAP A; 1YN4 A; 5D3I B; 1OGW A; 3GB1 A; 3L4P A; 3TUO A; 5GMV A; 4LLG M; 4OZA A; 3B2F A; 4KV2 A; 5E6J A; 2KKC A; 3SU8 X; 3V60 A; 1WE6 A; 3AU4 A; 3CIR B; 4HKQ A; 4A6Q A; 2PMV A; 3PV1 A; 3DBH B; 4HPP A; 1B9R A; 1TZO A; 1SE2 A; 1YD8 U; 3DBR I; 2KTR A; 1JCK B; 4REZ A; 2C9W B; 4DDI D; 3U4E G; 2NS5 A; 4N9F 4; 1L4D B; 2MBE A; 1S3S G; 1TYG B; 3C0R B; 3NZ3 A; 1UBQ A; 2N9X A; 2K1F A; 2KMC A; 1YQ3 B; 1T3Q A; 3CSF A; 4XWT A; 1DOI A; 2K6D B; 1FRD A; 1P1A A; 1T5X D; 1B1Z A; 3WCQ A; 1C79 A; 3RUI B; 2E6X A; 3WAM A; 1ESF A; 4W9H A; 2KWD A; 2IGD A; 2MJ3 A; 1XLQ A; 5EE9 A; 2AYO B; 2NPT A; 4M02 A; 1SE3 A; 1UWX A; 5D2M B; 3N1X C; 4S0R A; 4B9K A; 4JE3 B; 1E6E B; 3DVG X; 4ASW C; 2QHO A; 1HE8 A; 2BB5 A; 5AEK B; 4GDK B; 4ANW A; 2K9X A; 2BGF A; 2LHD A; 3L16 A; 3VUX A; 4LNK A; 1L5P A; 1T0Q C; 3W5U B; 1UNS A; 1HEZ E; 4WJP A; 4ZYS A; 1GUA B; 1BT0 A; 3QC8 B; 3MC0 B; 3AH7 A; 4HRO A; 4IOI E; 4LK0 M; 4K1R B; 2DAF A; 4GMV A; 5LXI B; 3NVV A; 4H2A A; 2X8X X; 4W9I A; 1YQ4 B; 2BYF A; 1VDV A; 2WQY B; 4ARI A; 1UGM A; 3V3X A; 2GLS A; 1D3Z A; 2MJD A; 1PUT A; 4B6W A; 3ZYY X; 2O6V D; 4DHZ B; 3EFC A; 2M1M A; 2SAK A; 4JX1 C; 4YXD B; 3ZRC A; 5JH5 C; 1MFW A; 3ZJT A; 1Q0W B; 3JYU A; 1H8C A; 2CU3 A; 3VRB B; 1JWS D; 1ISN A; 4GDL B; 4EZJ A; 3N1Z C; 5AUI A; 3IHP C; 4B0M A; 4ACF A; 2KFK A; 2L0F A; 5LLI A; 2I1J A; 4PS7 A; 4WAA A; 4XX5 A; 2JZZ A; 1R7S A; 1QOA A; 2L76 A; 3NJT A; 1WE7 A; 4G50 A; 1FIQ A; 4KSL C; 2C5L C; 2OHF A; 2V1Y A; 2IGG A; 3DBL I; 3IFW B; 3Q3N C; 3AEE B; 4JL9 A; 4HJG E; 4AS1 A; 4GN1 A; 3Q3F A; 2IO0 B; 2INN E; 2AX5 A; 2PE6 B; 4EUT A; 2N1W A; 2WLB A; 1CK1 A; 2XN9 C; 3HK0 A; 2PIA A; 5D94 A; 2KX0 A; 3AE5 B; 5EE0 A; 2W3S A; 3DWM A; 1ZDX A; 1XLN A; 3Q8A A; 4W9L A; 3EGR A; 4J6I A; 3VDZ A; 2WXQ A; 1Z2M A; 3AU5 A; 2WDT B; 3ZXV A; 2W3R A; 3AV8 A; 2JSV X; 3PZ7 A; 1QOB A; 4FJY A; 2NR2 A; 2LVQ A; 2KAN A; 2EEL A; 3NUH B; 3UIO B; 2QDF A; 1TBE A; 2VRR B; 1L6U A; 2HJ1 A; 1BUI C; 1J8C A; 1NYQ A; 4IDI A; 4ITK A; 3MC8 A; 1QLB B; 3A1Q A; 1TIF A; 1WI0 A; 2FCM A; 2MH7 A; 3SFD B; 1UWM A; 2JZP A; 2AQ3 B; 4NAW B; 2VH2 A; 3IBE A; 1SIJ A; 2RDB C; 3PZ8 A; 3J9C A; 2W82 A; 1HQR D; 1MJD A; 2QC8 A; 5BMI A; 3NS8 A; 1WRI A; 5EE3 A; 1FFV A; 1YX6 B; 4WUR A; 3Q6B A; 4YWG G; 2TSS A; 3JVZ X; 1JWU D; 1FPY A; 5D7G A; 1VZ7 A; 2W55 A; 1V1O A; 2L52 A; 2KZR A; 3PT2 B; 4DDG D; 1G6J A; 1VJK A; 1VR9 A; 1WJ6 A; 4W9G A; 4AP4 C; 4G3X B; 1EM7 A; 2KDF B; 3ABV B; 2DZM A; 1I4P A; 5AUK A; 4B95 A; 3IT4 B; 4FHK A; 2PLP A; 4IM2 A; 5JXV A; 2L00 B; 2AQ1 B; 1FCL A; 1NEN B; 2NPT B; 4MH0 E; 1CQV A; 2BTE A; 3I5J C; 3R8B A; 2KAC A; 4ZHP A; 1E9M A; 4YSZ B; 2J52 A; 3RMK C; 4CQN A; 1XF5 L; 2M0X A; 3AE8 B; 4K7W A; 4KKI A; 1WXQ A; 3SFE B; 5AZF A; 1PDX A; 2K8B A; 1UH6 A; 2ZNV C; 3DDC B; 3HVD A; 2DX5 B; 3A9K A; 1DOY A; 3MJW A; 4ZYN A; 4RCO A; 5IKC M; 4G11 A; 4LJP B; 5CHW A; 1J7A A; 3U7Z A; 4IM3 A; 4E3C A; 4LDT D; 2ZCB A; 1PGB A; 1LO5 D; 2DYO A; 2REX A; 3RT3 B; 3PSE B; 3VRA B; 3AI5 A; 3RZW C; 4NNJ B; 4YTM B; 3A9K B; 1SJE D; 2N4F A; 2RR9 A; 3U2S C; 2MSE D; 2N9K A; 3A4S C; 4JLC A; 2PW9 A; 4NQK E; 4W9D A; 3A1Q B; 1RRB A; 4AUQ C; 1XD3 B; 2MBQ A; 1I4R A; 2JZ3 B; 1N5X A; 1V80 A; 4C4V A; 3TIX A; 1TZ1 A; 2GBR A; 4WAF A; 3R3M A; 1D5M C; 3I57 A; 2PVG C; 4HJK A; 4BKS A; 1WGR A; 3CMM B; 3RNB C; 5EDS A; 4JGH B; 2EMS A; 3VVW B; 2IGH A; 3B2G A; 1TS4 A; 3JW0 X; 4K3C A; 2O2V B; 4S17 A; 4TQ1 A; 1LQB A; 3APD A; 3AEG B; 4LNN A; 4EFO A; 4ZOH C; 3L17 A; 1OEY A; 2CR5 A; 3Q8F A; 5E6P A; 3UF8 A; 3DBR B; 2L1A A; 4P16 A; 2KJH B; 1E10 A; 3AE9 B; 2IYD B; 2KC2 A; 3QX1 A; 3E56 A; 2KVR A; 4TMA B; 4ZRI A; 2E3T A; 1MPE A; 1TY0 A; 1TS2 A; 1QKZ A; 4DHZ E; 2D11 A; 2FCS A; 4HWI B; 2MLB A; 2XEW A; 3Q8C A; 2DYB A; 1GB1 A; 3B9J A; 2MJE A; 3MFG A; 3URY A; 3HM3 A; 1FCC C; 4RGT A; 4EOY A; 4IWQ A; 3KLS X; 5E6O A; 2AQ2 B; 4C7Y A; 4F1S A; 1WGY A; 2MP2 A; 2N7D A; 2O6V A; 3KW5 B; 5G2N A; 1FD6 A; 4N6E B; 4JWU C; 1V86 A; 4A3P A; 4RF1 A; 1SIF A; 2BW2 A; 2FE8 A; 4MM3 B; 4YT0 B; 2KQS A; 2RSU A; 5MPO A; 4BOS C; 2AEH A; 1ENF A; 3EFU A; 1ACC A; 2D3A A; 1A5R A; 1TT5 B; 2WNM A; 2HTH A; 4GDK A; 1TJE A; 4MGZ E; 3ZUN A; 1RWS A; 1IGC A; 1IGD A; 4HDQ A; 3TEY A; 1P7E A; 4XDC A; 3SDL C; 4M00 A; 3RPF C; 1JW9 D; 2INC C; 3DBS A; 3TEZ A; 2WDV B; 4PYZ A; 4FJV B; 5G5G A; 4FAD A; 3RNC C; 2MBB B; 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3NHE B; 3B1L X; 3BK2 A; 4ANV A; 1P98 A; 1WZ3 A; 4FUL A; 3HVZ A; 4FHJ A; 1ZE3 D; 4NQL B; 4NY0 A; 1AN8 A; 3Q3J A; 4MJS B; 1SXT A; 3UI3 A; 4HPM B; 5HHD G; 3ZRF A; 4AOF A; 3L08 A; 1A70 A; 3W1S C; 2KLG A; 2R2Q A; 2PJH A; 4OVU A; 3W1Y A; 3HHM A; 3VTW A; 3A33 B; 1NDD A; 1V2Y A; 3U52 E; 3I3T B; 2IY1 B; 3ML9 A; 2OJR A; 4WWM A; 3MJ5 A; 2KC1 A; 4HCN B; 4MEL A; 3WAN A; 2QIL A; 3IVF A; 1IP9 A; 4Q2J A; 2NCN A; 1R4N B; 2WP9 B; 3PTF C; 1FXT B; 3RNF C; 1EO6 A; 4A90 A; 3H7P B; 3Q14 C; 4NZL B; 1ZXH A; 4GIV A; 1LGR A; 1FMA D; 4TKN A; 2IO1 B; 2JXT A; 4TQ0 A; 4BOZ B; 3L54 A; 1IUE A; 1JAL A; 2LGS A; 4O1N A; 2GBM A; 4RFB A; 4JQW C; 2K3U A; 3BZD B; 2M4N A; 3L10 B; 2DLB A; 1V8C A; 3RN9 C; 1IPG A; 4A8X C; 3BVG A; 1IYF A; 1KLU D; 2WXK A; 2KYW A; 4DXA B; 3N20 C; 2WDR B; 4I6N B; 3LXF A; 3RCZ A; 2ZVN A; 3MC9 A; 4MAC A; 4MGI E; 1HTQ A; 1L0V B; 1RYJ A; 4DXG A; 1XLO A; 3C8Y A; 4BAX A; 4WQM A; 4LNO A; 3RNA C; 4P7I A; 4FBJ B; 1OQR A; 2FAZ A; 5DPW A; 3ZLZ A; 4OHJ A; 5BO4 B; 3I63 C; 1QZE A; 4RMA A; 1R4M I; 4NJ6 A; 2LFI A; 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