The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
b'MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| publication title |
Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GB1 A; 1QKZ A; 2I38 A; 5BMI A; 1GB4 A; 3FIL A; 4KGS A; 2PW9 A; 1XCQ L; 2LGI A; 1HZ5 A; 2KWD A; 5HHD G; 4KGR A; 1F2R C; 1PGX A; 5HI1 A; 1IGD A; 3V3X A; 1MPE A; 1Q10 A; 1D4B A; 2IGG A; 1IBX B; 1XCT L; 1C9F A; 2RPV A; 2JWU A; 2N7J A; 2JSV X; 5BMG A; 4D2K A; 2I2Y A; 2RMM A; 4GLS C; 1K50 A; 1ZXH A; 4OZC A; 2JXT A; 1XF5 L; 1YMH E; 3UI3 A; 1GB1 A; 1FCL A; 2IGD A; 2J52 A; 2JZP A; 1EM7 A; 4OZB A; 4IOI E; 1HEZ E; 2PTL A; 1MHX A; 2ONQ A; 5HG2 A; 4OZA A; 2QSD A; 2N9K A; 2QMT A; 2JU6 X; 2ON8 A; 4IKG A; 3FIL B; 2N9L A; 2J53 A; 1IGC A; 1IBX A; 2LHE A; 2OED A; 1K51 A; 2IGH A; 1FCC C; 1KH0 A; 1YNT E; 3MP9 A; 2PLP A; 1UWX A; 2KDM A; 2LHD A; 4HJG E; 1K52 A; 4HKZ E; 1F2R I; 1K53 A; 1P7E A; 1PGA A; 1FD6 A; 2LUM A; 1P7F A; 2EEL A; 2ZW0 A; 1MHH E; 4MAC A; 2ZW1 A; 2KAC A; 2K0P A; 4KGT A; 2KQ4 X; 1MVK A; 1HZ6 A; 4WH4 A; 1MI0 A; 5JXV A; 3GB1 A; 2KN4 A; 2GI9 A; 5HFY A; 1PGB A; 1JML A; 5BMH A; 2NMQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M8N A; 1RFA A; 1Y56 A; 4DHJ D; 4PT5 A; 1WJU A; 2HJ8 A; 2V1Y A; 2HE7 A; 2JZZ A; 4TSS A; 3T3O A; 2RDH A; 3GE3 C; 5KHQ A; 3DQV A; 3CWI A; 2KWD A; 1T6B X; 1WRD B; 2WDT B; 2BWF A; 1OQQ A; 1UNS A; 4IWP A; 4C4V A; 3QC8 B; 3AE6 B; 1ET6 A; 1NEK B; 2ZCC A; 4BZA A; 2MA9 B; 2JXT A; 2M4N A; 1HXY D; 2WDR B; 4EZK A; 1C76 A; 2J52 A; 3CF6 E; 1XLQ A; 3OG5 A; 1YJJ A; 1WFY A; 4OZA A; 4YTN B; 2AL3 A; 3MC9 A; 1TS5 A; 1E6E B; 3BVZ A; 5AZF A; 4RGN A; 1WGY A; 4W9K A; 4K7S A; 5L83 A; 3HUI A; 1TT5 B; 3A1Q B; 1V49 A; 2RSU A; 3RN9 C; 1HTO A; 1FMA D; 1KH0 A; 2K5P A; 5E6N A; 5G2N A; 1EF1 A; 1ZP0 B; 2PE6 B; 4IWQ A; 5D3D A; 1PGA A; 3JVZ X; 3RPF C; 5DPW A; 2JY6 A; 4II2 B; 2G4S A; 2M8S A; 1YD8 U; 5HFY A; 2L7R A; 2QHO A; 2JZ3 B; 1PGB A; 1FNU A; 3AEA B; 3ZRC A; 3VR8 B; 3Q6B A; 2N9P C; 3L13 A; 1QOB A; 4WIP A; 4YTP B; 2JT4 B; 1OGW A; 1BUI C; 4W9J A; 4IDI A; 3V05 A; 4WUR A; 3TEX A; 1F0Z A; 1HA5 A; 4FLH A; 3JSV A; 2XK5 A; 3KQ4 A; 3PHX B; 3UQA A; 2LGI A; 4KSK C; 3ZJU A; 2GLS A; 2HJ1 A; 4A6Q A; 2WDV B; 2WXK A; 3C8Y A; 1Q0W B; 3J9C A; 3M3J A; 2VRR B; 1YN4 A; 2MQJ A; 3IXS A; 1F77 A; 3NG0 A; 1L2N A; 2QC8 A; 3DVG X; 4PS7 A; 1L7Y A; 4DWF A; 1VLB A; 1YJ1 A; 4HCN B; 2R2O A; 3TEY A; 2LRW A; 4IOI E; 1K8R B; 2QJL A; 3V61 A; 4ANU A; 4E71 A; 1ZDV A; 1L6V A; 4M01 A; 1V80 A; 4A3P A; 4RF0 A; 3WAM A; 1K51 A; 4N6E B; 4DHZ E; 3VHT C; 5C2T B; 3ZTD A; 3BVM A; 4BFR A; 2PLP A; 3BY4 B; 2L0F A; 1TKG A; 1DGJ A; 2LHD A; 1YQ4 B; 4AJY B; 2M19 A; 2PKO A; 2D5G A; 3DCG A; 1JWA D; 1E10 A; 4HPP A; 2BW2 A; 2D11 A; 3ZYY X; 4GB9 A; 2EKE C; 4ZYN A; 3QAR A; 2PMV A; 1STE A; 2R61 A; 1N63 A; 3W2D A; 2C7H A; 2Y3A A; 1NYR A; 1FRR A; 4HWI B; 2LGY A; 3T3N A; 2WXJ A; 2WXN A; 3ML9 A; 5AUI A; 4ICV A; 3KUC B; 3B2G A; 2BT6 A; 3ML8 A; 1J7B A; 4WWN A; 1IYF A; 3RNA C; 4GN1 A; 1FM0 D; 1L0X B; 2K8B A; 4WJN A; 3RFZ B; 3EGR A; 1Q10 A; 2IGG A; 3ZO5 B; 3UF8 A; 4LTU A; 2MJE A; 1TGZ B; 3IAS 1; 3KYD D; 4KKI A; 2KDF B; 2WGS A; 2LVP A; 3ZDM C; 2RDG A; 2N1V A; 4LDT D; 1YMH E; 4P16 A; 3UI3 A; 1OQR A; 1WX7 A; 3ZNG C; 5D94 A; 2KWV B; 4FBJ B; 2BB5 A; 2KC2 A; 3ZNZ B; 4ZRQ A; 3MC0 B; 4YWG G; 3SFE B; 2PTL A; 3IVF A; 4WJQ A; 5AUK A; 2OJR A; 2KDI A; 4E3C A; 5G55 A; 4MEL A; 3ZGZ A; 4YTM B; 1TTN A; 2K1F A; 4EKU A; 1SIJ A; 4HDQ A; 5AZH A; 2BS4 B; 2IO2 B; 3Q3M C; 2KMA A; 1WGD A; 1TZO A; 3R8B A; 3ZVV A; 1JRP A; 4XWW A; 1QF6 A; 2L05 A; 1LQB A; 2OOB B; 3W1S A; 3NVY A; 4KGT A; 2GBR A; 3EC8 A; 4WQM A; 4OVZ A; 3VTV A; 3KWL A; 1LM8 B; 4Q2J A; 4J6I A; 3V62 A; 1JML A; 4N58 A; 2KJ6 A; 3TJP A; 2YEP B; 3UGB B; 3MHZ A; 2WXG A; 4N9F 4; 1XLP A; 4HJK A; 2DBY A; 2V3P A; 4XX5 A; 1CQV A; 2ZZP B; 1LXD A; 2N7E A; 2HTM E; 4P7I A; 3B1L X; 4MH0 E; 3ENE A; 2RGF A; 4BOZ B; 1XCQ L; 2Z8L A; 2QEJ C; 2ZPN A; 3NY5 A; 4A55 A; 2NBV B; 5CHV C; 2BS3 B; 2ZCB A; 1XT9 B; 1WZ0 A; 4LJO B; 2KN5 A; 4C7Y A; 1CZP A; 3BYY B; 4A3O A; 2KDB A; 4PK1 A; 3KUZ A; 1GPX A; 2GBM A; 1GB1 A; 4FHJ A; 3N20 C; 3RI7 C; 3AE4 B; 3HHM A; 1G6J A; 3AE3 B; 1EF5 A; 4UDU C; 1M4V A; 1DYQ A; 1Q1O A; 1C4C A; 3VQI A; 4NJC A; 1HTQ A; 2JUO A; 2NBW B; 2N0S B; 1KTK A; 3X0W A; 2WX0 A; 2MHJ A; 2K22 A; 2NBU A; 4I6N B; 3RCZ A; 5DCN A; 1BT0 A; 1WYW B; 4XYC A; 1WR1 A; 2KFK A; 1ZOY B; 2WU5 B; 2NPT A; 1RYJ A; 1UD7 A; 3P4S B; 4W9F A; 4GSW A; 2M1M A; 1L4Z B; 2JXX A; 4HVB A; 3VVW B; 4HPL B; 3O65 B; 3B0A A; 4K1R B; 1RAX A; 3WAL A; 1E0Z A; 3BIN A; 4CHK A; 2IDY A; 2M17 A; 4HKQ A; 1YX5 B; 3HM6 X; 2MBE A; 4WH4 A; 1E9M A; 2JF5 A; 3TBL D; 2VH2 A; 3IFW B; 2K6D B; 2Y5P A; 1VRA B; 3W1Y A; 3AI5 A; 2NMQ A; 1V5O A; 2BVC A; 4HK2 A; 3NZS A; 2BKF A; 3UIO B; 2V4L A; 2BBC A; 2K6Q A; 1YIW A; 1ROE A; 3I5J C; 2WYQ A; 3Q14 C; 1WF9 A; 2NCN A; 3ZXR A; 1J7A A; 1ACC A; 5HHD G; 2FUH B; 2EKI A; 1MPE A; 1SE3 A; 3AE8 B; 2UU7 A; 3CIR B; 2IJ0 A; 3EFU A; 4BAX A; 1PUT A; 1JWB D; 3RNG C; 1WX9 A; 1WGH A; 2DEN B; 3VR9 B; 2JRI B; 3LDZ E; 2MCN B; 2D07 B; 1VR9 A; 2JWZ A; 2IO0 B; 2K8C A; 3DHH C; 4WAF A; 2ASQ A; 2TSS A; 2J0M A; 3U7D A; 1VZ7 A; 1A5R A; 5CHF A; 3TEW A; 3SHQ A; 1HEZ E; 2FBW B; 3U8Z A; 2GBN A; 3UIN B; 1S3S G; 1NVI D; 3H7S A; 4B0M A; 3ONS A; 2L83 A; 2L8J A; 1KRH A; 2YEP F; 4DDG D; 3HM3 A; 3FC4 A; 3EFC A; 2JYE A; 4YT0 B; 2K3U A; 4M0W B; 2O6V A; 4NQL B; 1CJE A; 2RR9 A; 3PSE B; 2I1J A; 4WJO A; 1FXT B; 2JQR B; 2LWP A; 2LI5 A; 2CHZ A; 5IOI A; 3RZW C; 1WX8 A; 1KJT A; 4KKJ A; 3L54 A; 4MH8 A; 3C0R B; 4B0E A; 1MHH E; 2BYV E; 3TEZ A; 2IY1 B; 2KNB A; 2BTE A; 2FCN A; 4PYU A; 2IPK D; 3AEF B; 4HRO A; 1GUA B; 3JW0 X; 1MI0 A; 2V4I B; 4R3D A; 4LNO A; 3ZW3 A; 2LUE A; 3K9P B; 2MWS B; 2O2V B; 2I38 A; 1EUV B; 3OWE B; 2KXJ A; 3AEB B; 4JQW C; 3MFG A; 3PVL A; 4LDT B; 1C4A A; 4MGK E; 1UUP A; 1PGX A; 2ZVO A; 3R66 C; 1I4X A; 2INP E; 3SU8 X; 3DBR I; 1T0Y A; 3N1Y C; 2REX A; 1P3Q U; 3RT3 B; 1A70 A; 1I4Q A; 1WIA A; 2RMM A; 2N7D A; 3PT2 B; 1JRO A; 4FJV B; 3LJ3 A; 3N3K B; 3MJ5 A; 2GRI A; 5J17 A; 4F1S A; 3NUH B; 2N4F A; 4K3C A; 5IAA C; 3ZKJ C; 1WM3 A; 3ZJT A; 1B9R A; 3RUI B; 4TV3 A; 4ZRP A; 2WHI A; 5IN7 A; 5EE0 A; 2C9W B; 1TJE A; 1I7H A; 2WP9 B; 4HEA 1; 2V9H A; 3TCA A; 3P63 A; 1KF6 B; 1YNT E; 4GDK B; 1XD3 B; 3DOW A; 1C79 A; 3A33 B; 2W54 A; 2NTS A; 2LMC A; 1L6U A; 2BB6 A; 3D32 A; 2LVO A; 2ZW0 A; 2CJN A; 2ZVN A; 3P4P B; 1S1Q B; 5TR5 A; 3A9J B; 5JXV A; 1PQS A; 3GB1 A; 2D3C A; 4ZHP A; 4NJ7 A; 1QOG A; 1VDV A; 1J8C A; 3Q8B A; 2XNA C; 3KVF B; 2BYF A; 4PYZ A; 4W9D A; 3GZN B; 3HRD D; 1I4R A; 3PHW B; 2C60 A; 3HVZ A; 2C5L C; 4JPS A; 4K7U A; 3QAQ A; 4TQ0 A; 3PZ8 A; 4KGS A; 3V6E B; 5FR6 A; 2WNM A; 1KOT A; 2AWT A; 2INC C; 5C1Z A; 3AE1 B; 2KO3 A; 3NRZ A; 4TQ1 A; 2RPV A; 4LNN A; 3DBS A; 1OTR B; 4JWS C; 4JE3 B; 3NVZ A; 2I2Y A; 1YOV B; 3RNC C; 2L32 A; 2DLB A; 3I3T B; 2KAN A; 1UF0 A; 4LK0 M; 3DBH B; 4B95 A; 3PS6 A; 1ZGU B; 5D3I B; 1I42 A; 2AQ3 B; 2EMS A; 3MTN B; 3ECI A; 3WAO A; 3VAW A; 2G45 B; 3MC8 A; 1FO4 A; 3AEE B; 4GDL B; 2QIE B; 3RNE C; 4FAD A; 5G5H A; 5I4D A; 1YQ3 B; 2JU6 X; 4REZ A; 4FJY A; 3QK0 A; 2DYO A; 3AE2 B; 5BYR A; 1WH3 A; 1XLO A; 5FR3 A; 1ET9 A; 2J42 A; 2WDQ B; 1XXG A; 4IC7 B; 1P0R A; 2BS2 B; 3H8H A; 4W9H A; 2BF8 B; 1BML C; 1Z5S B; 4IM3 A; 2KDM A; 3ABV B; 5DPT A; 1E7U A; 3OJ4 B; 3SR6 A; 2MSE D; 2DAJ A; 1WI0 A; 2G9H D; 1TYG B; 1UH6 A; 4KZ0 A; 4L1B A; 2WXF A; 4L2Y A; 2KQ4 X; 2A4Z A; 4XC2 A; 1SE9 A; 1WMH A; 3HIZ A; 4MM3 A; 4ICU A; 2DZM A; 3ZLZ A; 3Q8F A; 3M63 B; 1V1O A; 1TKY A; 1EU3 A; 1R7S A; 1BXT A; 1D5Z C; 1WE7 A; 3Q3F A; 2ZJD A; 5D7G A; 1KFY B; 3ALB A; 5TSS A; 1QKZ A; 1IP9 A; 2XEW A; 4K81 A; 1WXA A; 4IM2 A; 2MBH A; 1EWY C; 1VCB A; 2PW9 A; 3LB8 C; 1GC7 A; 2KWC A; 4EUT A; 5L95 C; 3AU4 A; 3BK1 A; 3U7Z A; 4CQN A; 1FPY A; 2LGS A; 1SF0 A; 1P1A A; 3EHV A; 2KDE B; 1WWT A; 2KKC A; 2WXO A; 1ESF A; 3P4Q B; 1U4A A; 4K3B A; 3VTW A; 1GOZ A; 4DK5 A; 2BWE S; 4OZB A; 3L10 B; 1MHX A; 2GBJ A; 1JW9 D; 3V60 A; 1Q5W B; 2IYD B; 4ZDV A; 4DHJ B; 5HG2 A; 3IG3 A; 3Q3N C; 3W1S C; 4W9G A; 1WYG A; 3VUX A; 1T3Q A; 3LYY A; 3FIL B; 3IBE A; 3DWM A; 1WXM A; 1AW7 A; 2H89 B; 5J18 A; 1TS4 A; 3Q8C A; 4KSL C; 1V2Y A; 2QIL A; 1V8C A; 2K25 A; 4W9L A; 4XZ4 A; 1RM6 C; 2DYB A; 4MM3 B; 4O1N A; 5DPR A; 4TKN A; 2RDB C; 1V81 A; 5LLI A; 4NPN A; 1P7E A; 3UQB A; 1RWS A; 2LUM A; 2X8X X; 2K39 A; 2JX5 A; 4WWM A; 4G50 A; 3AE5 B; 2KK8 A; 3W5U B; 3RNB C; 2LZ6 A; 1VJK A; 4EZJ A; 2L3Z A; 4GXB A; 4KIK A; 3A9K B; 1QQR A; 4MEM A; 1YN5 A; 3M62 B; 1TY2 A; 2E3T A; 3L08 A; 4S17 A; 5JH5 C; 3QJZ A; 2WXI A; 1N61 A; 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1SBB B; 2HTH A; 4MJS B; 4BKT A; 3TIX A; 1L5P A; 1WR6 E; 1LO5 D; 2K8H A; 4EEW A; 4DQO C; 4AJW A; 1QIL A; 1JWM D; 2G4D B; 2MP2 B; 4HXD A; 1ZUD 2; 4EE2 A; 2K9X A; 5JHB A; 4US9 A; 2WXM A; 3N9Y C; 2LXA A; 2QMT A; 5BO4 B; 1TIF A; 2ON8 A; 3QA8 A; 1WM2 A; 2EMT A; 1NBF C; 1SE4 A; 3WA0 A; 3VDZ A; 2Z0D B; 2W3S A; 2J0K A; 4MSQ B; 4FN2 A; 2FUG 1; 1FIQ A; 3GZN I; 3L4P A; 3PRP B; 1CK1 A; 2KMM A; 1VD2 A; 4E74 A; 1SSN A; 2Q5W D; 4ZRK A; 4FJZ A; 2KAC A; 1N60 A; 1TZ1 A; 3APD A; 3C19 A; 3URY A; 4RMA A; 4ACF A; 3BII D; 4CO7 A; 2GI9 A; 2FCQ A; 1ISN A; 3PLV A; 1L0V B; 1X1M A; 5KHO A; 5BMH A; 1D5X C; 2MX2 A; 2Y5C A; 1H8C A; 3JYU A; 2AYO B; 1YJI A; 4IW0 A; 1RFK A; 2NR2 A; 1UGJ A; 4AOF A; 4KVG B; 1KM7 A; 3ZQ4 A; 4M0W A; 2LEK A; 1NEN B; 1E5W A; 1FFV A; 3AE9 B; 3AMZ A; 1WSP A; 2D3A A; 5E6J A; 3RNF C; 3WAN A; 5BMG A; 2JPH A; 3KH0 A; 4OZC A; 2O6V D; 2Z0E B; 1V97 A; 3E56 A; 4B6W A; 3AEG B; 4WWP A; 3P4R B; 1UZX B; 3BK2 A; 4NZL B; 1C4P A; 3AM9 A; 1E8W A; 3DVN U; 2KVZ A; 2N9L A; 2JRH A; 2J53 A; 2ZNV B; 1MFW A; 1IBX A; 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