The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (AQUO MET)
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| publication title |
X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian)
pubmed rcsb |
| source organism |
Lupinus luteus
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| total genus |
58
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1982-04-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HDS A; 2HBS A; 3ODQ A; 1VXA A; 1DWT A; 1QXE A; 1C7B B; 4O35 A; 1CG8 B; 2D2N A; 1QSH A; 5JDO F; 1XY0 B; 2W72 A; 1GJN A; 1MLS A; 5ILR A; 1MLF A; 1DWS A; 3EOK A; 4YU3 A; 2NRL A; 5CND A; 4MXK A; 3VAU A; 1IT3 A; 2HCO B; 2SPL A; 2R4W A; 3LB4 A; 3PI9 A; 3HF4 A; 1O1N B; 1F65 A; 2R4Z A; 2OH8 A; 1SDL B; 5CN5 A; 2MYC A; 1HGA A; 2HHB A; 1J7Y A; 4DWT A; 3PT7 A; 1YMC A; 2SPO A; 104M A; 1UIW B; 1EBT A; 1HBB A; 1QSI A; 3HRW A; 1O1J A; 1C40 B; 1MLH A; 1HBG A; 1MLQ A; 2ZSX A; 1Y8I B; 3UHI A; 4NXA A; 4FC3 B; 1SPG A; 3HHB A; 3ZJO A; 4B3W A; 1YEV B; 1BZZ B; 5CMV A; 1DXD A; 1CIK A; 1MKO A; 2MGL A; 3WI8 A; 1O1P A; 2AV0 A; 4WCH D; 4DWU A; 3WFT A; 1BZ1 A; 3GLN A; 1LFV A; 3UBV A; 3QM9 A; 1G9V A; 3M39 A; 1CQX A; 1EBC A; 4HRT A; 1YIE A; 1YEO B; 1HLB A; 3WCU A; 3MOU A; 1JZM A; 3D17 A; 1J7W A; 1NQP B; 3GYS B; 1LFZ A; 2ZLU A; 1YCB A; 1Y45 B; 2H8F A; 1URY A; 1HAB A; 3OO5 B; 1LJW B; 1U7S A; 2ZS1 D; 3A5B A; 2V1J A; 1GDI A; 3WTG B; 4SDH A; 1G08 B; 3E5I A; 5AB8 A; 1OFK A; 1XZV B; 3PI3 A; 1CP5 A; 4UZV A; 3UHD A; 3MN0 A; 3UH3 A; 1GCV B; 1Y7G B; 1YHE B; 2BW9 M; 1MYT A; 2HBC A; 1HSY A; 1YE2 B; 3U3E A; 3QJE A; 2ZSP A; 1UVX A; 5JDO E; 4M4A A; 3D4X A; 1Y83 A; 2HBD B; 4M4B B; 3GK9 A; 3S1J A; 3UHY A; 1GCW B; 1S61 A; 1FLP A; 4MQG A; 1HLM A; 3AT5 A; 3D1A B; 1YE0 B; 1AZI A; 1DXC A; 3MBA A; 1VXC A; 3DR9 A; 3VRF A; 3FH9 A; 1Y85 B; 5D1V A; 1A3O A; 3MJU A; 4X0L B; 4N7P B; 1Y4B B; 3IC2 A; 2HBE A; 1XQ5 B; 3K8B B; 3UBC A; 1J40 B; 3RJN B; 3DHT A; 1JW8 A; 3M3B A; 3ED9 A; 1DO1 A; 3OO4 A; 1MWB A; 1Y8W A; 2O5M X; 3K3U A; 1QXD A; 1Y8H B; 1S5X A; 2MGB A; 3QJC B; 3V2Z A; 3BA2 A; 2DN1 B; 1Y35 A; 2RAO B; 2GTL D; 1R1Y A; 2VYY A; 1C7D B; 3NML A; 3HEO A; 4HSW A; 3QJD A; 1DTM A; 3B75 B; 1X9F A; 1JY7 A; 1GZX A; 3DHR A; 1YEQ A; 1VXB A; 3WR1 B; 1Y0D A; 1Y4Q A; 2DN3 B; 3AQ5 A; 1RTX A; 2G0R A; 2MGM A; 2O5S X; 1HAC A; 3G4V A; 1NWI A; 2NSS A; 1Y0C B; 1X46 A; 3ZJS A; 1HHO B; 1YH9 B; 1Y4F A; 1HGB A; 1BIN A; 3UGY A; 1TU9 A; 1NZ5 A; 1MBN A; 1J52 A; 3GQP A; 1GLI B; 1K0Y B; 3G53 A; 1XZ4 B; 1A4F A; 2ZSS A; 5KER A; 5ILP A; 3VRG A; 1OR4 A; 1V07 A; 1CQ2 A; 2G11 A; 1T1N B; 3A0G A; 4G1V A; 5E6E B; 1DLY A; 1FDH A; 1V4U A; 2G12 A; 4DC7 A; 1IOP A; 3E5O A; 5CHR A; 2OIF A; 1XXT B; 1CG5 A; 4XDI A; 4IRO A; 1GVH A; 4HBI A; 1BUW B; 1LH7 A; 1ASH A; 1MTJ A; 1OUT A; 3AG0 A; 1A3N A; 4YU4 A; 2DC3 A; 1MLN A; 2OHA A; 4U8U C; 3WCT C; 1MYH A; 1THB B; 4C44 A; 3UH7 A; 2DN2 B; 1V4W B; 2QSS A; 4ZVA A; 2GRF A; 2Z6N B; 2IG3 A; 102M A; 1LFY A; 3TLD A; 1HRM A; 5EOH A; 1CH7 A; 5EUI B; 3WHM A; 2R80 A; 4MQI A; 1GCV A; 2MYD A; 3LR7 A; 2HBF A; 1OJ6 A; 2MGJ A; 5CNE A; 3S65 B; 1YE2 A; 2QFK A; 3D1K A; 2FRI X; 2ZT1 A; 1UT0 A; 1A00 A; 1KR7 A; 2EVK A; 3A59 A; 2V1H A; 1LFL B; 3EU1 B; 1YIH B; 4KJT A; 5JDO D; 1V75 B; 2PGH B; 3PIA B; 1M6M A; 2MGF A; 4PQB A; 4TWV A; 1IWH B; 2QLS B; 2ZLV B; 2W6Y A; 2EB9 A; 1YGD B; 4OF9 A; 1YFF B; 3UH5 A; 1FSX B; 3LQD A; 1RQ4 B; 4KMW A; 101M A; 2ZLX B; 1JZL A; 3RJ6 A; 3UHU A; 2AUR A; 2YRS B; 2MGI A; 5CN8 A; 4F6D A; 3PEL B; 3LB1 A; 1YOH A; 3MKB A; 1RVW A; 3ECZ A; 4FH6 A; 3G4U A; 1SDK A; 1HBA B; 4MQC B; 1VWT A; 3ONZ B; 4WJG A; 4PQC A; 2QSP A; 111M A; 2XYK A; 2D60 A; 2GRZ A; 1DXV B; 1M9P B; 1HDA A; 1MYG A; 2ZFO C; 1CMY B; 1BJE A; 1Y46 A; 3GQG B; 3FS4 B; 5IKS A; 2D2M B; 3NG6 A; 3GQR A; 1UVY A; 4F68 A; 5AZQ A; 4F6I A; 3WCV A; 2VLY A; 3ZJR A; 1Y8K A; 2DXM A; 1BBB A; 3E55 A; 1SHR B; 3BJ2 B; 1HBI A; 2ZSN A; 1XYE B; 4L7Y B; 1B0B A; 3G4Q A; 1XCH A; 4F6F A; 1FHJ A; 2XKH A; 2ZLT B; 4OOD A; 2BWH A; 1ABW A; 5C6E B; 4N8T A; 5HY8 A; 6HBW A; 2GKN A; 1HCO B; 2MGG A; 2GKM A; 1GLI A; 1PBX B; 1Y5J B; 3CY5 B; 1MWD A; 4NZI A; 1LHS A; 1G09 A; 5HBI A; 3WCP A; 1AJG A; 4U8U B; 1Q1F A; 3W4U A; 3WCT B; 1PMB A; 2XKG A; 2QU0 A; 1CO9 A; 1CLS B; 2R4Y A; 3AQ7 A; 1B86 A; 1OUU A; 2ZS0 C; 2MGD A; 2ZSY A; 1NS9 A; 1MLM A; 4MQH B; 3ZJM A; 2MGH A; 4QAU A; 5KKK A; 105M A; 2ZT3 A; 1YHU C; 2BMM A; 2ZLW A; 3MYM A; 1MDN A; 1FDH G; 3ZH0 A; 2D6C A; 3BJ1 B; 1QPW A; 1COH A; 1QI8 A; 2JHO A; 4NXC A; 1A0U A; 5SW7 B; 2BLH A; 1XZ5 A; 2HBG A; 1DWR A; 3S66 B; 1IRD A; 3UHX A; 1Y4P A; 2AUO A; 1AJ9 B; 3TM3 A; 5E83 A; 1YVQ A; 3PI8 B; 1J3Y B; 3QZX A; 3UHR A; 1YEN A; 3HEP A; 2V1G A; 1H1X A; 4ROM A; 4H2L B; 3IC0 A; 2ZSR A; 1HBS A; 1YHR A; 1UFP A; 1O1M A; 2B7H B; 3LHB A; 1MOH A; 3SDH A; 1WLA A; 3UHC A; 5HLX A; 2BLI A; 1WMU B; 4NS2 A; 1OFJ A; 1X3K A; 1YCA A; 3NMM B; 1YEU A; 5CNF A; 2GLN A; 3HYU A; 5KDQ A; 1Y0A A; 4BJA A; 2ZS1 A; 3VRE A; 2H35 A; 1LA6 A; 2QFN A; 1CH2 A; 4N7N B; 3BJ3 B; 1GBU B; 1DKE B; 1YFF A; 4TYX A; 1GBV B; 1DXT A; 1DXU B; 2ZFO B; 1Y5F A; 4MQJ B; 1O1K B; 3GKT A; 5CN4 A; 2D5Z A; 4ZVB A; 3AQ9 A; 2E2Y A; 1HV4 B; 1RPS B; 2R4X A; 1Y0W A; 2H8D B; 1MOD A; 1YGF A; 2SPN A; 3QM6 A; 2AUP A; 2VYZ A; 3AT6 A; 1Y7D A; 3BCQ A; 2HHD B; 1CBM A; 2MGA A; 2D2M A; 4IT8 A; 3V2V A; 4XS0 A; 5C6Y A; 1HDB B; 5E29 A; 3HC9 A; 3BJ2 A; 2D5X B; 4FWX A; 2R50 A; 1Y7C B; 2EB8 A; 1MZ0 A; 3PT8 B; 4N7O A; 4ESA B; 1DUK A; 1LH6 A; 2G3H A; 1MYI A; 108M A; 3OGB A; 1K1K A; 2M6Z A; 3KMF A; 3UHT A; 3ARK A; 1Y7Z A; 2ZS0 B; 1WVP A; 2ZST A; 3ZOL A; 2GTL A; 1Y4R A; 5EYJ A; 1NEJ B; 4ROL B; 1LFQ B; 3R5I A; 3GOU B; 1YHU B; 4ODC B; 1MLO A; 5JGG A; 1O1I B; 4LPI A; 4MAX A; 1JDO A; 1W92 A; 3UHK A; 3KUN A; 5F0B A; 1FAW A; 2W6X A; 3E4N A; 3VHB A; 3G46 A; 3OVU C; 1NPG A; 1SI4 B; 2ZSO A; 2O58 X; 1DO7 A; 3NFE B; 3G4W A; 4F6G A; 1Z8U B; 2AV3 A; 4MQK A; 4L2M A; 1Y09 B; 5D5R A; 4HRR A; 1ABY A; 2V1I A; 2FRK X; 1KD2 B; 5EE4 C; 4FH7 A; 1NIH A; 1HBR A; 1UMO A; 1A6M A; 1Y22 B; 1N9H A; 1YMB A; 1A6G A; 1MNK A; 2Z8A A; 4NI1 A; 3SZK A; 5HLU A; 1G0B B; 1S5Y B; 4UUR A; 3MJP A; 4F4O B; 4H07 A; 2MGK A; 1BZ0 B; 2D2M D; 3D7O A; 4GZG A; 1HBH A; 1S69 A; 3GDJ B; 1JEB B; 1YZI B; 2VHB A; 1MBC A; 3NMM A; 3WCW C; 1J7S B; 3QJB B; 5EQM A; 3AQ6 A; 1BZP A; 3NL7 A; 1C7B A; 1CG8 A; 1O1K A; 5EU2 A; 1XY0 A; 4NK1 A; 2RI4 B; 3ORD A; 3PI1 A; 1RQ3 B; 1LHT A; 1XZ2 B; 4G51 B; 4U8U D; 3WCT D; 2HCO A; 3P5Q B; 2C0K A; 6HBI A; 1YVT B; 2OLP A; 3QMA A; 1O1N A; 1SDL A; 1YG5 B; 1R1X B; 4NI0 B; 3BOM B; 4AVE A; 1N9X A; 1BZR A; 2D2N C; 3R0G A; 1UIW A; 3QM7 A; 2W72 C; 1C40 A; 1Y8I A; 4FC3 A; 1MLL A; 2LH3 A; 1YEV A; 1BZZ A; 2QMB B; 3A9M A; 2BNL A; 2HZ1 A; 3A5G A; 1GDK A; 1MBI A; 1NS6 B; 3SDN A; 1MBA A; 1XZ7 B; 1CBL A; 1A01 B; 1YEO A; 1NZ2 A; 1DTI A; 1A9W E; 1LFT B; 5JOM A; 3UHQ A; 4ROL A; 2BLJ M; 1NQP A; 3GYS A; 1IBE B; 3CIU B; 4MBA A; 1BAB B; 1RSE A; 1Y45 A; 4PQ6 A; 2ZFB B; 5CN6 A; 3ZJN A; 3OO5 A; 3WFX A; 2LHB A; 1O1L B; 1LJW A; 1JF4 A; 5CN9 A; 1JZK A; 3WTG A; 1G08 A; 3WCU C; 5AZR A; 1XZV A; 1Y4V B; 2PEG B; 2ZFO D; 1J41 B; 5MBN A; 1Y7G A; 5B84 A; 1YHE A; 1C7C B; 3ZOM A; 3M38 A; 1G0A B; 1A0Z B; 1Y31 B; 5HU6 B; 2G10 A; 1BIJ B; 4VHB A; 2G0Z A; 3WCW B; 3DUT B; 2W6V B; 2HBD A; 2ZSQ A; 1MYM A; 2DHB B; 4M4B A; 2WY4 A; 2MYE A; 2AA1 B; 5CNG A; 1NWN A; 1GCW A; 1Y4G B; 3ARL A; 2W31 A; 3D1A A; 2R1H B; 1FN3 B; 4F69 A; 1YE0 A; 3GKV B; 3MVC A; 1O1O B; 1MTI A; 1S0H B; 1Y85 A; 1J3Z B; 1JP6 A; 4X0L A; 1HGC B; 4N7P A; 1Y4B A; 4AVD A; 1XQ5 A; 2LH2 A; 3K8B A; 2MHB B; 1J40 A; 1A6N A; 3ZJJ A; 3G4Y A; 2HHE B; 1Y8H A; 1JL6 A; 1Y2Z B; 1YDZ B; 4MU5 A; 3QJC A; 2ZS0 D; 1HDS B; 1ECN A; 2DN1 A; 2HBS B; 2AUQ A; 3ODQ B; 1QXE B; 3ARJ A; 2RAO A; 2D2N B; 2OHB A; 1I3D A; 1C7D A; 1QSH B; 1J3F A; 2W72 B; 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2ZLV A; 3OZU A; 1YGD A; 3VRF B; 3FH9 B; 1FSX A; 1RQ4 A; 1A3O B; 3MJU B; 1CH5 A; 2ZLX A; 3IC2 B; 2HBE B; 1M6C A; 5ILE A; 2YRS A; 3PEL A; 3DHT B; 2XKI A; 3OO4 B; 1Y8W B; 1QXD B; 1BVC A; 1S5X B; 1GDJ A; 3TM9 A; 1HBA A; 4MQC A; 3ONZ A; 2NX0 A; 1IDR A; 1Y35 B; 2KSC A; 1DXV A; 1M9P A; 2LH1 A; 2FAL A; 1R1Y B; 3WFU A; 1CMY A; 4H0B A; 3GQG A; 3FS4 A; 110M A; 3QJD B; 4O1T A; 1CH3 A; 1ECO A; 1X9F B; 2FAM A; 1V4X B; 1JY7 B; 1GZX B; 1V5H A; 3DHR B; 5EE4 D; 1YEQ B; 2VYW A; 1SHR A; 1Y0D B; 2VLX A; 1XYE A; 5M3S A; 4L7Y A; 1Y4Q B; 2NSR A; 1VHB A; 1NGK A; 1DM1 A; 7HBI A; 1HAC B; 4G1B A; 2ZLT A; 1Y4F B; 5C6E A; 1CIO A; 1HGB B; 1HCO A; 3IA3 B; 2HZ3 A; 1PBX A; 1Y5J A; 3WCV C; 3CY5 A; 103M A; 2GDM A; 3GQP B; 2O5O X; 1A4F B; 5KER B; 1LH3 A; 3HEN A; 2O5L X; 4U8U A; 4O4T A; 3VRG B; 1O16 A; 3WCT A; 3WCW D; 3A0G B; 3ECX A; 1CLS A; 1DLW A; 1V4U B; 1EWA A; 1Y5K B; 1F5O A; 1CO8 A; 1CG5 B; 4IRO B; 1L2K A; 4MQH A; 5MBA A; 4C0N A; 1ABS A; 1OUT B; 3HXN B; 1A3N B; 4YU4 B; 2MGC A; 3BJ1 A; 2CMM A; 5SW7 A; 2GNW A; 4HHB A; 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