The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian)
pubmed rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Lupinus luteus
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| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (AQUO MET)
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| total genus |
58
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1982-04-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AJG A; 3OO5 A; 5JGG B; 3WFX A; 1Y8I A; 1HCO B; 1XQ5 B; 1OUT B; 1T1N A; 4XS0 A; 2GNV A; 4TWV A; 1MYT A; 1HBG A; 2GKN A; 3GYS A; 3CY5 B; 3OZW A; 2Z6T A; 2W6V B; 1C7B B; 4X0L B; 2GNW A; 2Z85 A; 1NIH B; 1HSY A; 1UFJ A; 1MOC A; 2QMB A; 1BZR A; 1J41 A; 3AT5 A; 1XZ2 A; 1L2K A; 1YHU D; 1RPS B; 1Y0W A; 1Y31 B; 2LH1 A; 1DXV A; 1K0Y B; 3UHR A; 2V1I A; 1GDL A; 1HDS B; 1FCS A; 2O5L X; 1YHU B; 4C0N A; 5CNE A; 3RJN B; 3GQG B; 4MQH A; 4XS0 B; 4AVE A; 1TU9 A; 5C6E A; 3UHI A; 6HBI A; 1Y7C A; 1U7R A; 1HGA A; 1Y8W A; 2ZS1 D; 3GYS B; 4YU3 A; 1S5X B; 2ZLU A; 2HBE B; 3PI8 A; 2D6C A; 1Y83 B; 1RQ4 B; 2ZSZ A; 4O4T A; 3LQD A; 1BIJ A; 2ZS1 B; 1IT2 A; 3VRE A; 4G1B A; 3M3B A; 3QZX A; 1EBC A; 5JOM A; 1DKE A; 4NK2 A; 3O7N A; 1XZ2 B; 1V75 A; 5CN6 A; 1Y0W B; 4WJG A; 2H35 A; 3WCW C; 1A9W E; 2G0X A; 4MXK A; 1Y7D B; 4HBI A; 1Y4P B; 3LB4 A; 3R5I B; 1K1K A; 3MVC A; 1S0H B; 1VXF A; 3LHB A; 1NEJ A; 1Y0T A; 1YEN A; 1Y7C B; 3PEL A; 1HGA B; 1Y5J A; 4HRT B; 1M6M A; 1Y0A B; 1J3Z B; 1BZZ A; 4YU3 B; 2Z8A A; 3PI8 B; 3NL7 A; 1MBA A; 2FRJ X; 4UUR A; 1MLG A; 1PBX A; 1ABW A; 2G0Z A; 2D2M A; 3VRG A; 1BZ1 B; 4IT8 A; 3PIA A; 1YCB A; 1CBM A; 3QJB A; 1NZ3 A; 2D60 A; 1DWS A; 1DKE B; 1Y4B B; 3OO4 B; 1J7S A; 1CMY A; 3NG6 A; 2WY4 A; 4MQI A; 2H35 B; 1UIW A; 1GLI B; 1MLK A; 5JDO F; 3IXF A; 3AQ6 A; 4HSW A; 3ZJM A; 2NSR A; 3MN0 A; 4FWY A; 3S65 B; 2GL3 A; 1MLH A; 1HBR A; 1Y0T B; 105M A; 1VXC A; 3PEL B; 1IBE B; 1HV4 B; 4L7Y A; 5M3S A; 1Y5J B; 1BBB A; 2D2M D; 3WCT C; 1BZZ B; 1TES A; 3D1A A; 1QXE B; 2DN2 B; 1A01 A; 1CG5 A; 1ECD A; 1QPW A; 4HHB B; 2Z6S A; 2D2M B; 1YOG A; 5D1V A; 3PIA B; 2FAL A; 3DHR A; 1MBI A; 1G9V B; 2HHD A; 1UX8 A; 3HF4 A; 1RTE A; 1G08 B; 4KMV A; 2D60 B; 1C40 A; 3KUN A; 1CMY B; 2ZSQ A; 2RAO A; 2ZSY A; 3KMF C; 2AUR A; 5AB8 A; 1MKO A; 3HHB B; 1J3F A; 2HBD A; 1FLP A; 2MB5 A; 1IWH B; 1Y4V A; 1HBR B; 4H2L B; 3FH9 B; 3G46 A; 1DXC A; 1GDJ A; 3LB2 A; 2D2N A; 1BBB B; 1FN3 A; 1C7D A; 4MBA A; 3ZJP A; 2MGM A; 1A01 B; 1DO3 A; 2W6X A; 2QSP B; 3HRW B; 4OF9 A; 4M4A B; 5ILM A; 1MTI A; 4ODC A; 1Y4G A; 3GOU B; 2XYK A; 3DR9 A; 2KSC A; 1Y09 A; 3LR9 A; 1VXE A; 3HF4 B; 2W6Y A; 4MQK A; 2WTG A; 1HDA A; 1GBU A; 2MGI A; 3PI9 A; 1VXH A; 1NZ5 A; 1NS9 B; 1V4X A; 5KER A; 1X46 A; 5AZQ A; 2RAO B; 1MYH A; 3UHQ A; 2MGF A; 3WFU A; 2BMM A; 4UIQ A; 1N9X A; 1GCV A; 1C7C A; 1QXD A; 5HBI A; 1Y4V B; 2G0S A; 3H57 A; 1YE0 B; 4DC7 A; 2ZSR A; 1DXT B; 1S5Y B; 2BWH A; 1YGF A; 1MDN A; 1BAB B; 4M4B B; 3NFE B; 1YH9 A; 2PEG B; 4MQJ B; 109M A; 2MYB A; 1RVW B; 2HZ1 A; 5EV5 A; 3QJC A; 4ODC B; 1HDB A; 1Y4G B; 1CLS B; 2R50 A; 1I3E A; 4B3W A; 1Y8K A; 1Y4R B; 1HDA B; 2R4W A; 5EYS A; 1XXT B; 5KER B; 1NWI A; 3MJP A; 1MNO A; 1Y7Z A; 2EKU A; 1SDK A; 2O5O X; 1MOB A; 1Y5F B; 2VYW A; 1C7C B; 3O89 A; 1YIH A; 1CP0 A; 1O1P A; 5MBA A; 2NRL A; 3ARK A; 1FDH G; 3PI1 A; 1FHJ B; 1YCA A; 1JWN A; 1GBV A; 2HBF A; 1YH9 B; 2YRS B; 3QJD A; 2G11 A; 1RQA A; 1Y45 A; 2D5Z A; 3D7O A; 2VLX A; 1X9F A; 1R1X B; 3HEO A; 1J40 A; 1YG5 B; 1SPG A; 2RI4 A; 2BNL A; 1Y8K B; 4NZI A; 2DHB A; 3G4R A; 1RTX A; 1NQP A; 2QSS A; 1XZU A; 2ZSX A; 1THB A; 2MGJ A; 1FAW B; 1WVP A; 5IKS A; 3MJP B; 1CQ2 A; 1Y7Z B; 3BA2 A; 1LFY A; 2DN1 B; 2GTL C; 3VRF B; 4FC3 A; 1MGN A; 2AA1 B; 2H8D A; 2ZSP A; 3IC2 A; 1GCW B; 4QAU A; 1YGD B; 2LH3 A; 5CNC A; 1O1O B; 4F4O A; 2FAM A; 3HYU A; 2NRM A; 7HBI A; 2GLN A; 4L2M A; 1GBV B; 5CN8 A; 2HBF B; 1GZX B; 1NS6 B; 3AT6 B; 1RQA B; 3EOK A; 2W6W A; 3ODQ B; 2M6Z B; 4N7N A; 2XKH A; 3SDN A; 1XZ5 B; 5C6Y A; 2RI4 B; 1Y0D B; 1UFP A; 1XZV B; 1YMC A; 5HY8 B; 2R4Z A; 2OLP A; 2W72 C; 3PI2 A; 1BIN A; 5JDO C; 1ABY B; 2VYY A; 1MLU A; 2D2N C; 3D1K B; 4FWZ A; 5CN7 A; 1LFY B; 107M A; 2AUQ A; 3PT7 A; 1DO1 A; 3IC2 B; 112M A; 1F65 A; 3ZJH A; 1DO4 A; 2AUO A; 2ZFO C; 1GJN A; 4G1V A; 2ZLV A; 1LFV A; 2ZT3 A; 4KJT A; 3WCW A; 1NPG A; 2VLZ A; 3EOK B; 3MYM A; 2XKG A; 1KD2 B; 1BZP A; 4N7P A; 1M9P A; 1BJE A; 3EDB A; 3GQR A; 5JDO E; 1COH A; 1JW8 A; 1DWR A; 3PT8 A; 1Y46 B; 1DXU A; 3D17 B; 1BZ0 B; 1HLM A; 3MBA A; 3PT7 B; 2R80 A; 2VLY A; 1I3D A; 5KDQ A; 1XZ7 A; 1SI4 A; 3WCW D; 4LPI A; 2DN3 B; 1V5H A; 1OR6 A; 4MQG A; 1LFV B; 1ASH A; 3WCW B; 3WHM B; 3QM6 A; 3UH6 A; 5EET A; 2V1F A; 1G0B B; 2BLI A; 1M6C A; 5EE4 C; 5E83 B; 4TWU A; 1VWT A; 1BZ6 A; 1JZL A; 3GKV B; 1YDZ A; 3WCT A; 1COH B; 3BJ1 A; 5HU6 A; 3K8B A; 3PT8 B; 3MKB A; 1UT0 A; 3BJ2 A; 3ORD A; 2R80 B; 2NX0 A; 1LFQ B; 4MXL A; 4DWU A; 3PI4 A; 3TM9 A; 3RGK A; 3GKT A; 1YEU A; 3S66 A; 1LH6 A; 1J7W A; 3WFT A; 4NI1 B; 2E2Y A; 3ECZ A; 2ZS0 D; 5F2A A; 3A59 A; 3KMF A; 1FDH A; 3DHT B; 4YU4 B; 1B86 A; 1H97 A; 2ZS0 B; 4G51 B; 2ZST A; 1VWT B; 2G12 A; 2R4Y A; 1LA6 B; 3NMM A; 4KN3 A; 4WJG 1; 3E5I A; 3OVU C; 3A9M A; 4F6J A; 1Y7G A; 1A6N A; 2BW9 M; 3AQ7 A; 1LFL B; 1RQ3 A; 1A4F B; 1MYI A; 3BJ2 B; 2HCO B; 2VYZ A; 1NPF A; 2B7H B; 1G0A A; 1V9Q A; 1O1I A; 1HBH A; 3OGB A; 3QM5 A; 4U8U C; 3OO5 B; 1Y85 A; 1IRD A; 1Y8I B; 3S66 B; 1Z8U B; 1T1N B; 4F6I A; 3UHB A; 1GDK A; 1O1N A; 3SZK A; 2ZLX A; 2EB9 A; 1YFF A; 2WTH A; 2FRF A; 3UHN A; 3UHW A; 5SW7 A; 3R0G A; 2OHA A; 2MYD A; 1B0B A; 1N9I A; 3NML A; 1G09 A; 1YOH A; 1MNK A; 1MBD A; 3G52 A; 4FH6 A; 1A0Z A; 2QMB B; 1J41 B; 3AT5 B; 2ZFB A; 3WCU A; 2HHB A; 1HLB A; 1Y0C A; 1XZ4 A; 3D4X A; 1DXV B; 2ZT4 A; 3S1I A; 1YZI A; 2ZT1 A; 3OZV A; 1URY A; 3M3A A; 4MQH B; 2R1H A; 1MZ0 A; 1LHT A; 2G3H A; 5C6E B; 1O1N B; 2QU0 A; 2AV3 A; 1YFF B; 1Y8W B; 1HJT A; 1X9F C; 2ZLU B; 3ZOM A; 4NXA A; 4ESA A; 3UHG A; 3HC9 A; 3WTG A; 3LQD B; 1BIJ B; 3VRE B; 4ROM A; 1MNH A; 1MOH A; 2MGC A; 1G09 B; 3HEP A; 3A5G A; 1CIK A; 1A0Z B; 2ZLT A; 1VRF A; 4MPM A; 1V75 B; 3ZOL A; 1HRM A; 1Y4F A; 3UHE A; 1YHR A; 1MLM A; 1YZI B; 2HBS A; 101M A; 1K1K B; 4AVD A; 1NEJ B; 1LFT A; 1YEN B; 4UZV A; 1VXB A; 2VHB A; 1NGK A; 1UMO A; 2FRI X; 2GTL A; 1VRE A; 3NL7 B; 1JF4 A; 4C44 A; 2V1K A; 1A6G A; 1JEB A; 1PBX B; 2ZSS A; 3LB1 A; 1IOP A; 1ABW B; 3VRG B; 1JY7 A; 3ZJR A; 2V1H A; 3M39 A; 2ZSO A; 3QJB B; 1DTI A; 2HZ2 A; 1J7Y A; 1J7S B; 1OJ6 A; 1CP5 A; 1CO9 A; 4NI0 A; 3RJ6 A; 3NG6 B; 1LJW A; 4MQI B; 1UIW B; 4JYQ A; 1Y01 B; 1YHR B; 1YVQ A; 1YHU C; 2V1G A; 3UGZ A; 2W72 A; 1LFT B; 3GLN A; 1ECO A; 3A5A A; 4L7Y B; 1LH7 A; 4NK1 A; 4O35 A; 1FSX A; 3G4Y A; 3D1A B; 1CG5 B; 1MLQ A; 1QPW B; 4O2G A; 3V2V A; 2ZFO A; 1QSH A; 3DHR B; 1HGC A; 2HHD B; 1JF3 A; 3IC0 A; 1OUU A; 1C40 B; 1VXD A; 2G0V A; 1R1Y A; 1Y35 A; 1LUE A; 5JDO D; 1MKO B; 2QLS A; 4F6D A; 2D2N D; 2HBD B; 4ILZ A; 3UH3 A; 1ECA A; 1WMU A; 1YOI A; 4HSX A; 1YE2 A; 2D2N B; 2OIF A; 1XCH A; 5AZR A; 1FN3 B; 1C7D B; 1HBB A; 3A2G A; 1MOD A; 2ZFO D; 5B84 A; 3M38 A; 3WCU C; 3B75 A; 3W4U A; 3ONZ A; 1Y4Q A; 1XY0 A; 1CH2 A; 3CIU A; 2ZFO B; 1QSH B; 1RSE A; 1Y09 B; 4MQC A; 2OH9 A; 3IC0 B; 4MQK B; 2VEB A; 1GBU B; 3PI9 B; 1VHB A; 1Y2Z A; 1V4X B; 1R1Y B; 1Y35 B; 5CMV A; 1UVX A; 1HAB A; 3WR1 A; 3WCV A; 1OR4 A; 3PI3 A; 1O1K A; 3UHS A; 1EWA A; 1GCV B; 5EU2 A; 1QXD B; 5EYJ A; 4N7O A; 1PMB A; 1WMU B; 1CH1 A; 2MGL A; 1YGF B; 1GVH A; 4H0B A; 1BUW A; 3W4U B; 2V1E A; 3QJC B; 3E55 A; 1HDB B; 2QRW A; 5CN9 A; 3UHV A; 1MBC A; 3VAU A; 3P5Q A; 3UI0 A; 1CG8 A; 3UHX A; 5CHQ A; 1SDK B; 3UHU A; 3QQQ A; 4O4Z A; 1SDL A; 1A6M A; 1YIH B; 1O1P B; 4IRO A; 1NZ2 A; 2H8F A; 4BJA A; 5ILR A; 1X9F D; 1DUO A; 1LH1 A; 1EMY A; 1QSI A; 3WCP A; 1YVT A; 3QJD B; 4MAX A; 1BUW B; 3GK9 A; 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2W6V A; 1C7B A; 4X0L A; 5KDQ B; 1XZ7 B; 2R4X A; 1SI4 B; 3G4W A; 2XKI A; 1NIH A; 5CNB A; 1JZK A; 2O5M X; 2MYE A; 1LH5 A; 4MQG B; 1YIE A; 1A3O A; 1RPS A; 4MU5 A; 4FH7 A; 2O5T X; 1YHU A; 1KFR A; 3WCT D; 4N8T A; 2DXM B; 1HBA A; 3GQG A; 1DXD A; 1YDZ B; 3WCT B; 3ZJO A; 1S5X A; 2HBE A; 3BJ1 B; 5HU6 B; 3K8B B; 5E29 B; 3HEN A; 1Y83 A; 3ZJL A; 3MKB B; 1RQ4 A; 1MLN A; 2ZS1 A; 1CH5 A; 2BLJ M; 1JZM A; 1O16 A; 3MYN A; 3E4N A; 2MBW A; 3UHD A; 1YEU B; 1WLA A; 4F68 A; 1J7W B; 1YIE B; 1A3O B; 3A59 B; 1Y7D A; 1Y4P A; 1B86 B; 3S48 C; 1NWN A; 1JP6 A; 3R5I A; 1S0H A; 4N8T B; 1HBA B; 1MCY A; 2ZT0 A; 3G4Q A; 103M A; 1J3Y A; 3NMM B; 4HRT A; 1Y7G B; 1CH7 A; 1Y0A A; 3EU1 A; 1J3Z A; 1RQ3 B; 3BOM A; 1JP9 A; 1BZ1 A; 1G0A B; 4TYX A; 2CMM A; 1O1I B; 1HBH B; 4JAC A; 1Y85 B; 3UHY A; 1IRD B; 3ED9 A; 1Y4B A; 3OO4 A; 1YEQ A; 1GDI A; 3SZK B; 2ZLX B; 1DTM A; 1HBI A; 1GLI A; 5ILP A; 5HLX A; 2EVK A; 1DUK A; 1J52 A; 2MGB A; 5SW7 B; 3S65 A; 3ZJJ A; 5HAV A; 3WCU D; 1V4U A; 1EW6 A; 1IBE A; 1HV4 A; 3TLD A; 1J3Y B; 3AQ8 A; 2GRH A; 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