The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
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sequence length |
122
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structure length |
122
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Chain Sequence |
ADVFDPPTQYGYDGKPLDASFCRTAGSREKDCRKDVQACDKKYDDQGRETACAKGIREKYKPAVVYGYDGKPLDLGFCTLAGIREVDCRKDAQTCDKKYESDKCLNAIKEKYKPVVDPNPPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure, dynamics and domain organization of the repeat protein Cin1 from the apple scab fungus.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Cell adhesion
|
| source organism |
Venturia inaequalis
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| molecule keywords |
Cellophane-induced protein 1
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| total genus |
26
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| structure length |
122
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| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LHT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EW9 A; 4EEK A; 3LVV A; 4RPZ A; 4PL2 A; 1L8L A; 3ZDA A; 4B9N A; 4BDP A; 4I27 A; 3SR6 A; 3M1Y A; 3K75 D; 2PFN A; 2AQ4 A; 4QZC A; 5DB6 A; 4ACO A; 5CB1 A; 4OJ5 A; 3DDH A; 4J9S A; 7ICL A; 4JB3 A; 3GV7 B; 5KAF U; 1SKW A; 4O5E A; 3PMN A; 2UVR A; 2KVS A; 1S5L U; 1COK A; 3C2L A; 2PI5 A; 3MGV A; 1U49 A; 4MEY A; 2JZB A; 4C8N A; 2ZUC A; 5ALG A; 5AIC A; 3PML A; 3PW7 A; 5ALJ A; 1P7D A; 1NJZ A; 1N62 A; 2E5S A; 1JRO A; 4DWI A; 2KZZ A; 5DDY A; 3D2S A; 8ICY A; 2KD1 A; 2NRZ A; 3LWL A; 5JUM A; 1ZD2 P; 3RBE A; 3PX4 A; 5GTI U; 3D2N A; 4BX9 C; 2XC9 A; 4BWM A; 9ICB A; 5EE9 A; 3JPR A; 1TV9 A; 1KL9 A; 4I2C A; 5KFA A; 1BPZ A; 1KDH A; 1FFU A; 3OJU A; 3OTQ A; 4NY8 A; 4M9G A; 1ZQZ A; 4PGX A; 2LYA A; 2Y0S C; 3N4M B; 4C8M A; 9ICX A; 2BKE A; 3E58 A; 2EDU A; 1JMS A; 3VC8 A; 2BCS A; 1PK1 A; 4I2H A; 5AKE A; 2E8P A; 7ICM A; 2EAM A; 4Q8F A; 2AH5 A; 3RJG A; 2FLP A; 3QZ8 A; 1C7Y A; 1OXJ A; 1ZQS A; 4A8E A; 5AK5 A; 1SXE A; 4NL9 A; 4R66 A; 3IDW A; 4UBB A; 1Z00 A; 1S0V A; 3RB4 A; 8ICZ A; 8ICU A; 1CI4 A; 1FIQ A; 2FJ6 A; 4DFM A; 4IRD A; 4DL6 A; 2ZJ8 A; 4Z6C A; 1B43 A; 5AKK A; 1S10 A; 2D8C A; 2E3T A; 2ISO A; 1ZOL A; 1MN8 A; 1IM4 A; 1SV0 A; 1ZRN A; 2MU2 A; 1UA1 A; 3V6H A; 2G09 A; 4YMM A; 2VA8 A; 3JPT A; 9ICI A; 2IOF K; 3OPX A; 2FLN A; 2YB1 A; 3C1Z A; 5DQG A; 1XU4 A; 2HBK A; 3T5J A; 3KHL A; 3QUQ A; 5ALU A; 4KMO B; 3BJY A; 2JEJ A; 1DK2 A; 5HNK A; 2DL0 A; 2XCP A; 4QIW C; 4RQN A; 2KFZ A; 2Q4T A; 4RT3 A; 4GIB A; 2ODG A; 3C23 A; 3NVY A; 3HRD D; 5ALY A; 4XQ8 A; 5JU5 A; 1X6I A; 4XUS A; 4ELV A; 3GIL A; 4AYB F; 1TE2 A; 5F9N A; 2VA2 A; 4ECS A; 1K1Q A; 1BPY A; 3HWT A; 1NJX A; 5KT5 A; 1BVS A; 9ICN A; 2G5H B; 4FE3 A; 1B0X A; 2F3N A; 4MF2 A; 2MA1 A; 5KL1 B; 5KG6 A; 3UXO A; 2ZTD A; 2W43 A; 1S0O A; 5AK3 A; 8ICE A; 1RQL A; 4RPX A; 1YT3 A; 3PZP A; 1N5W A; 2HHV A; 2CN1 A; 9ICV A; 5KFI A; 2KG5 A; 3SV4 A; 3OHA A; 2PFO A; 1ZQB A; 1FEZ A; 4M04 A; 3AL0 B; 3NTU A; 4LZD A; 2HW3 A; 3QEB Z; 3Q8L A; 7ICE A; 1ZQL A; 2VKQ A; 4DOB A; 5L1M A; 4RNN A; 4RQ7 A; 3EPG A; 2HOQ A; 5CRX A; 3N7P D; 3EPI A; 2DFL A; 2UVV A; 4RQ3 A; 4IL6 U; 2B6G A; 5AKG A; 2HCF A; 2IHM A; 5HML A; 1T8E A; 1NKE A; 4O3O A; 3PSP A; 4Q44 A; 2KEY A; 1MA7 A; 4J9O A; 1HIW A; 5KTQ A; 1ZQX A; 3H8W A; 1SZH A; 3V72 A; 5KFN A; 1SB3 C; 3CP8 A; 4IRC A; 1ZQH A; 2C22 A; 4NLB A; 4EYI B; 1F0M A; 1RYU A; 8ICM A; 5DBB A; 2LHT A; 2O6K A; 3RAQ A; 2GO7 A; 1WWU A; 5J0Q A; 1TK0 A; 2WHE A; 5ALQ A; 1EXN A; 2F1H A; 2W7O A; 2J6T A; 4K4H A; 4F91 B; 4ZOH C; 2XO7 A; 4TQS A; 3UQ0 A; 8ICO A; 4C7Y A; 5DG9 A; 2YN4 A; 4O9M A; 4ECU A; 4EX6 A; 7ICQ A; 2N1R A; 5CWR A; 2FE9 A; 2ES6 A; 1NK6 A; 1IV8 A; 4NJ8 A; 8ICA A; 1KEJ A; 1RXV A; 1T94 A; 1D8L A; 5KFS A; 1ARO P; 1ZQJ A; 2A1J B; 2B0C A; 3V6J A; 4M9J A; 3RJE A; 4FBU A; 3ALR A; 3QXG A; 1ZQE A; 3E2E A; 5J2B A; 4QWA A; 5ALW A; 4F5R A; 2YTU A; 5ALI A; 2W55 A; 4JV2 A; 4J9Q A; 5AM4 A; 5AIA A; 2HBL A; 2WF9 A; 4QZI A; 3RJI A; 4QZH A; 1JX4 A; 3ZDC A; 4I28 A; 1ZQR A; 3GIJ A; 1ZQQ A; 5J2C A; 9ICH A; 2XCA A; 2W54 A; 3F53 A; 4ED7 A; 2HSZ A; 5KG4 A; 1L7M A; 1RDF A; 2RQ5 A; 3UM9 A; 2DQN B; 1XO1 A; 4QZG A; 4R65 A; 1N2X A; 2UVW A; 5HR7 A; 4O3M A; 2K4H A; 5IIL A; 5AM1 A; 3MR5 A; 4PGQ A; 2JZB B; 2KFN A; 2XIC A; 2PFP A; 1N56 A; 4DFP A; 3RFA A; 4TUS A; 4QZ9 A; 4F4K A; 1J97 A; 4F4Z A; 1X66 A; 4B9U A; 2ZTC A; 2M0N A; 1ZQG A; 2LMR A; 4Y2R A; 4DLG A; 2KMD A; 2W3S A; 2K8B B; 2GWS A; 3KHG A; 4IC9 A; 5KNI A; 4DF4 A; 4EEL A; 1ZD4 A; 4HYK A; 3BQ1 A; 3TFR A; 9ICC A; 3GQC A; 1UPH A; 5L1I A; 4I2A A; 5E79 U; 1JXL A; 2ZIW A; 1VJ5 A; 4P2H A; 1ECW A; 1LKY A; 2F77 X; 1L5U A; 1S77 D; 1KKX A; 3THV A; 1ZQF A; 3QZ7 A; 8ICV A; 2W3R A; 5KFR A; 2BPG A; 4GFJ A; 2BCU A; 1X40 A; 4ECV A; 5ALX A; 4BGD A; 5ALM A; 1KQQ A; 3EWA A; 2AGO A; 4FFD A; 3N97 B; 4FS1 A; 1KBU A; 2FDR A; 4PHE A; 4ED0 A; 2WFA A; 2Z7J A; 1PVP A; 3HKZ F; 1Z00 B; 1L7P A; 3OJS A; 3CW2 C; 5ALT A; 4F3O A; 1SGG A; 3MC1 A; 4Q43 A; 4ED2 A; 1SWV A; 1NZB A; 3QYP A; 2ALZ A; 3PST A; 2H3F A; 5DDM A; 3BS7 A; 4ECR A; 4P0P A; 2DF4 B; 2KJ9 A; 2BHN A; 4YMN A; 4FS2 A; 2RDJ A; 1COO A; 4I2I A; 3NS1 A; 1ZJN A; 2C2D A; 4X5V A; 1WUD A; 2QAR A; 1ED1 A; 3WK8 A; 1V38 A; 1A77 A; 1BNP A; 4O3P A; 1ZQT A; 1BPX A; 4Z6E A; 5EWE A; 4QW8 A; 2K4I A; 4DSI A; 2LYH A; 1RXW A; 4DS5 A; 1NK0 A; 3DEE A; 2JHD A; 3IV6 A; 5AI0 A; 1UA0 A; 4MFF A; 4JMU A; 5L1L A; 3J81 j; 1T3Q A; 4Z6F A; 5AM2 A; 4UBC A; 3C5G A; 3TAQ A; 1HUZ A; 3SEN A; 4DL2 A; 5G5G A; 4M9H A; 2GOL A; 4QZB A; 4PHP A; 8ICQ A; 2WAQ F; 3H0L B; 1ZET A; 4I2G A; 7ICR A; 2IHN A; 3Q8M A; 5CEH A; 1JXE A; 9ICJ A; 2WF6 A; 7ICU A; 1KTQ A; 1NNL A; 2MRL A; 2HVH A; 2F1I A; 4UB1 A; 4RQ4 A; 1HEK A; 2KKP A; 4IQV A; 4UAS A; 3JPS A; 2ZJA A; 3BQ7 A; 3K1R B; 4E0D A; 1ZQA A; 1H38 A; 5KT3 A; 3IHQ B; 5J0Y A; 3SQI A; 9ICQ A; 2OM6 A; 1QTM A; 5EE3 A; 3MAB A; 2VJ4 A; 3E0F A; 1XS9 D; 2F76 X; 3PX0 A; 2IOF A; 1YZ7 A; 4OJP A; 3MDA A; 2V4Q A; 4QZ8 A; 1IIP A; 3PVX A; 1Q3U A; 4NLN A; 4RNO A; 4G3I A; 3QU7 A; 5J0T A; 4QWB A; 4UB6 U; 4BUG A; 4Q8E A; 5KG1 A; 4KLO A; 4DOA A; 1L6N A; 5ALL A; 1IG6 A; 4J9K A; 5AI4 A; 3F5A A; 3K1Z A; 9ICW A; 4RQ0 A; 4J9P A; 7ICP A; 4ZH4 A; 5AI8 A; 2JGA A; 5AKI A; 2RRD A; 5HMM A; 5EE1 A; 4R8U A; 1T4G A; 3L3F X; 5KFB A; 1X2I A; 2E8M A; 2KZ3 A; 4OCZ A; 5AM5 A; 5GTH U; 2QB0 A; 4C4T A; 4KN4 A; 2K8C B; 3FM9 A; 2NYV A; 4DSL A; 4KX3 A; 9ICF A; 3IP4 B; 2F8K A; 2PXI A; 2G5I B; 3MGH A; 5IIK A; 2V9W A; 2XY5 A; 5AHX A; 1XWL A; 4QNL A; 1JIH A; 2FPL A; 3SZ2 A; 1ZQI A; 8ICF A; 1A6S A; 2LM1 A; 5DQI A; 2W11 A; 5ALO A; 5IIO A; 4UAU A; 9ICE A; 3M8S A; 2Y9T A; 1D9D A; 3C21 A; 2BQ3 A; 5DLG A; 3RR7 A; 9ICG A; 4F4Y A; 1ZRM A; 1SIJ A; 4RT2 A; 3SV3 A; 3M9M B; 1QCK A; 3TI0 A; 2HVI A; 1BGX T; 1T7P A; 4ED1 A; 1NJW A; 8ICC A; 1XC9 A; 9ICO A; 3N28 A; 1UHU A; 2W8K A; 2LBO A; 4KN7 A; 3H0R B; 1BPD A; 4DL5 A; 1PUZ A; 3H40 A; 4QJF B; 4C8K A; 2KOB A; 1SXD A; 2G0A A; 3DV9 A; 4UB4 A; 3PV8 A; 3WKC A; 1U4B A; 1NKC A; 3B9J A; 1WWV A; 2HI0 A; 4PHA A; 7ICK A; 3K4G A; 5DBC A; 5KL8 B; 1L7N A; 3TAD C; 1TVA A; 3M6K A; 5KFH A; 2BGW A; 2W9A A; 4F2S A; 1TAQ A; 1U48 A; 2YML A; 3Q8S B; 4ECW A; 9ICT A; 4EEY A; 1IXR A; 4UB8 U; 1MQ3 A; 3C5F A; 1BNO A; 5T14 A; 4RZR A; 3D6J A; 5K4L A; 3HT3 A; 1L3T A; 3LYS A; 3ZDD A; 4EBE A; 4GXI A; 1AQ6 A; 2WB1 F; 4B9S A; 2W9M A; 1ZQV A; 3B0Y A; 4TUQ A; 3NGD A; 1TAU A; 1UT5 A; 4NLG A; 2MUT A; 2BR0 A; 2H3I A; 3NVV A; 4B9M A; 5HHI A; 2E1F A; 3NVW A; 3UQ2 A; 3N7R C; 1LVH A; 4YCX A; 3MFH A; 1CEZ A; 5KFY A; 4F50 A; 5ALN A; 4YFK A; 1CUK A; 9ICS A; 5CP2 A; 1KFD A; 2ZJ5 A; 4I29 A; 2LM4 A; 2NO4 A; 2YMP A; 2R8K A; 4I2F A; 4DF8 A; 5DGB A; 2ZIW B; 3UMC A; 3GV5 B; 4YR0 A; 2DGZ A; 4PJ0 U; 4OJL A; 3H0M B; 1N60 A; 5KFG A; 2JH1 A; 3H4B A; 1X9W A; 1ZQC A; 5ALZ A; 4ECZ A; 3T5L A; 2NRW A; 4Y2X A; 2BPC A; 3O0F A; 4KLT A; 4M9L A; 1NI3 A; 3A0B U; 4ED3 A; 4QZE A; 5J2K A; 3B0X A; 3GZF A; 4QZF A; 3SAF A; 4UB3 A; 5KFF A; 2DPJ A; 3WK7 A; 4CRX A; 2I5H A; 1XSN A; 2ZXH A; 5J29 A; 2HHQ A; 4OJ6 A; 3KFU F; 2FPK A; 2BCR A; 1ZQY A; 2VAN A; 2EQY A; 3V6K A; 2BPF A; 4JWM A; 1S76 D; 2LI6 A; 2A3V A; 2LYB A; 4NXZ A; 3U26 A; 5KFP A; 4P0P B; 1U9L A; 2AHO B; 3H8J A; 3LWM A; 4QWD A; 4C8L A; 4KX5 A; 4DSE A; 2WF7 A; 3LK9 A; 4MHV A; 5BOM A; 2ASJ A; 3HKZ C; 2H3Q A; 3MR2 A; 3RB0 A; 4Z6D A; 1OUQ A; 4ECY A; 5J8Y C; 4CDG A; 4DCC A; 1JRP A; 2E8N A; 3UXN A; 3EYZ A; 5ALK A; 3ISC A; 1SL2 A; 3H8S A; 1U45 A; 4EBD A; 2BCV A; 1RM6 C; 5KFQ A; 5IIJ A; 4ED8 A; 2HBM A; 3BS5 B; 2HOI A; 4PH5 A; 1S0M A; 3TAD A; 1ZQU A; 4O3R A; 1MQ2 A; 5KT2 A; 2DPI A; 4KLH A; 3SYZ A; 5KT4 A; 1NK9 A; 1Z3E B; 3Q8K A; 4MF8 A; 4F5P A; 3GIK A; 3SI8 A; 4ICA A; 4YVZ A; 2EZZ A; 5CA7 A; 1Z1V A; 1X9X A; 3MR3 A; 4PZO A; 4O5C A; 1NZP A; 5AI5 A; 3HP6 A; 2C2R A; 1S9F A; 1L7O A; 3HIL A; 1ZYQ A; 4J9M A; 4USA A; 8ICB A; 1NOM A; 3C29 A; 5J2A A; 3F2D A; 2KZM A; 3JPN A; 4GXK A; 2WAQ C; 3N7S C; 2ESE A; 1Z4N A; 1ZQK A; 1L8O A; 1LV5 A; 7ICS A; 4ECT A; 1X9M A; 3EZ5 A; 1ZQ1 C; 4DQR A; 4AP9 A; 3JPP A; 3PW2 A; 1ZQW A; 5ALH A; 2W03 A; 3NAS A; 2PFQ A; 2GLE A; 4DOC A; 1KSP A; 1MC8 A; 4KLI A; 1FFV A; 1QQ6 A; 3ZD9 A; 1V85 A; 2KTQ A; 1DOQ A; 5L1K A; 4F93 B; 2EAN A; 5AKX A; 4F5O A; 4B9V A; 1ZXI A; 3QU4 A; 2DKZ A; 4RUC A; 2BQR A; 2ISP A; 2JEG A; 2IA6 A; 3TAN A; 1YZ6 A; 5H2F U; 4RQ5 A; 4YR3 A; 2E1E A; 3AM9 A; 1X6J A; 3RJF A; 4J9N A; 5KFU A; 1ZJM A; 4NM2 A; 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1UT8 A; 5F3X B; 2PI4 A; 3RJH A; 4B6J A; 3G6V A; 2R8I A; 1HJP A; 4CNQ A; 2OWO A; 7ICN A; 2HOF A; 4CF4 A; 4HAI A; 1T3N A; 1N63 A; 2QLT A; 4O3Q A; 4K4I A; 2AQ0 A; 4DQS A; 3KZI U; 2FMS A; 2Y1J A; 3TFS A; 5ALR A; 1PVQ A; 3WKD A; 4DQQ A; 1ZQD A; 5KFK A; 4KLF A; 4KLL A; 5C0Y A; 1L3S A; 2WB1 C; 1Q8K A; 4EBC A; 4GC7 A; 3ICX A; 3IRU A; 3LDA A; 1WCN A; 2PMZ F; 3RBD A; 5DBA A; 4I2E A; 5DG8 A; 4YP3 A; 2ZUD A; 3Q8R B; 3GV8 B; 5J2H A; 3QUB A; 1TKD A; 1A76 A; 4AYB C; 1SL1 A; 3PR4 A; 4KLU A; 7ICO A; 3UPQ A; 3BQT A; 4I2B A; 3AQE A; 5JRT A; 8ICN A; 5KFC A; 4F72 A; 2ASD A; 3EUB 2; 2KK0 A; 4O0I A; 2FPM A; 1JAL A; 1RG6 A; 4MFA A; 2BQU A; 4NV0 A; 2BDP A; 3HJE A; 2HBJ A; 4Y2Q A; 4FZN A; 2G07 A; 4Q45 A; 2P66 A; 1Y88 A; 4I2D A; 3M6Z A; 3CNH A; 5ALS A; 2ZXI A; 4TUR A; 4K4G A; 2H3Z A; 2GH1 A; 5KFT A; 4RQ1 A; 5DLF A; 2FLL A; 3PW0 A; 5KT6 A; 5DKW A; 4DQP A; 3A0H U; 1SKS A; 2KIV A; 3PSF A; 2AJQ A; 2B21 A; 2ZTE A; 4F92 B; 4YG2 A; 1BPB A; 1ZQO A; 4YD1 A; 2ZIV A; 3I1Y A; 4CF3 A; 5B66 U; 2ATL A; 3QUT A; 2IBK A; 3RTV A; 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