The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
b'QTSQDLFSYQALYSYIPQNDDELELRDGDIVDVMEKCDDGWFVGTSRRTKQFGTFPGNYVKPLYL'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure Basis for the Recognition of Ataxin-7 PRR with R85FL SH3 Domain
rcsb |
| molecule keywords |
Sorbin and SH3 domain-containing protein 1
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
11
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AZE A; 1MUZ A; 2A28 A; 1MV0 B; 5EC7 A; 2GQI A; 2L3S A; 1JO8 A; 2RNA A; 2X3W D; 5FWC A; 2HEQ A; 5I11 A; 1UG1 A; 2HSP A; 1T3L A; 2B86 A; 1FMK A; 3H0F A; 1QKX A; 2DRM A; 3ULR B; 4OMP A; 1AWX A; 4LE9 A; 2JMA A; 2L2P A; 1IO6 A; 1AEY A; 4LNP A; 2J06 A; 4CC3 A; 3EG0 A; 2VKN A; 2EYW A; 1NYF A; 2ROT A; 1NLP C; 2D1X A; 2KRO A; 4F17 A; 1WFW A; 1PRM C; 4IIO A; 4CC7 A; 1TUC A; 4DEY A; 1K4U S; 1SEM A; 2EGE A; 1UJY A; 4GBQ A; 2RQV A; 2FEI A; 1YN8 A; 2M0Y A; 2RN8 A; 2A37 A; 4KRT A; 1JQQ A; 2MIO A; 1M3C A; 4AFS C; 2YSQ A; 3EGU A; 3ZL7 C; 4AG2 C; 1WDX A; 2RF0 A; 1GRI A; 1HD3 A; 3CQT A; 4RTY A; 2BZY A; 3SHW A; 4LUD A; 2EKH A; 2SEM A; 1UHF A; 1ZUK A; 4AFU C; 2DF6 A; 4J9I A; 3REA B; 1RUW A; 1PKS A; 2OAW A; 2NWM A; 2JS2 A; 1E6G A; 2O9S A; 2L3P A; 4LN2 A; 2RQW A; 1M8M A; 3RNJ A; 1ARK A; 4M4Z A; 2GBQ A; 4RUG A; 2FO0 A; 4OMM A; 2AKK A; 1CSK A; 5FW9 A; 5IH2 A; 2P4R A; 1J3T A; 1RLP C; 1WX6 A; 4HCK A; 1UTI A; 5IHI A; 1E7O A; 1A0N B; 1LCK A; 3UAT A; 1GL5 A; 1UJ0 A; 1QLY A; 2YDL A; 1WXU A; 2DE0 X; 3I9Q A; 1I1J A; 2LQW A; 1Z9Z A; 2W10 A; 2L3Q A; 1WIE A; 2CT3 A; 1ZUY A; 3VRY A; 2K7A A; 2FPF A; 2LJ0 A; 1X69 A; 1T0J A; 2DYB A; 2NUZ A; 4J9F A; 2LQN A; 3M0P A; 4ZNX A; 3PVQ A; 1CKA A; 2KNB B; 1U3O A; 2KXD A; 1H3H A; 2CDT A; 2A08 A; 1UE9 A; 3TVT A; 1X2Q A; 2J7I A; 2EVR A; 4OMO A; 1T0H A; 1ZSG A; 1G2B A; 1U06 A; 1VYU A; 1TG0 A; 2DIL A; 4D8D A; 1NEG A; 2LP5 A; 1G83 A; 3A98 A; 1I0C A; 2JXB A; 1M27 C; 2D8J A; 2EBP A; 4HVU A; 2CH4 A; 1M30 A; 1MV3 A; 1VYT A; 4Y92 A; 3NPF A; 4X1V A; 1ZX6 A; 1H92 A; 2BTT A; 1ZUU A; 2EQI A; 2AK5 A; 2GNC A; 1K0S A; 1V1C A; 1NYG A; 2A36 A; 4F16 A; 3IQL A; 2LZ6 B; 1QKW A; 2W0Z A; 1KFZ A; 1UDL A; 1X6B A; 3M0T A; 4JJB A; 3TSZ A; 2KR3 A; 4JJD A; 2FRW A; 3EG3 A; 1GFC A; 4Z89 A; 1X27 A; 1WYX A; 4AFZ C; 1AVZ C; 4J9D A; 3VS0 A; 1UGV A; 1Z9Q A; 4HVV A; 1GFD A; 3THK A; 2GGR A; 2FRY A; 3I35 A; 4WCI A; 2CT4 A; 2OI3 A; 2KE9 A; 3PVL A; 2JS0 A; 2ED0 A; 2DJQ A; 3EHR A; 1GBR A; 2LNH B; 2DL5 A; 4IIM A; 2JTE A; 2AZV A; 1QCF A; 1SPK A; 1UFF A; 3TSW A; 1KJW A; 2C0O A; 2E5K A; 1K76 A; 2EYX A; 2X3X D; 2ROL A; 2JM9 A; 1NM7 A; 2LMJ A; 2KYM A; 1T3S A; 1JXO A; 2D8H A; 4J9H A; 1SSH A; 2HBW A; 3U23 A; 2C0I A; 2RQT A; 3REB B; 1S1N A; 3PE0 A; 1Y57 A; 1NG2 A; 2G6F X; 2C0T A; 4GLM A; 4RTV A; 5GJV B; 1SHF A; 5ECA A; 2GTO A; 2YUQ A; 1OPL A; 4OML A; 2IIM A; 1XOV A; 2GTJ A; 2PNI A; 5IHK A; 2KT8 A; 3VS5 A; 2K79 A; 2FPE A; 2AKL A; 2K2M A; 5IHN A; 2MCN A; 2FG0 A; 2DNU A; 4RTT A; 1NEB A; 2RMO A; 4J9B A; 4Z88 A; 2EYZ A; 4JZ3 A; 4R0K A; 1AZG B; 3O5Z A; 3QWX X; 2CUB A; 2OJ2 A; 2EYY A; 2O2O A; 2YUP A; 1GCP A; 1B3Q A; 2HDA A; 2DVJ A; 2ENM A; 5I22 A; 1BU1 A; 2DRK A; 2KGT A; 1RI9 A; 1AOJ A; 2DX1 A; 4HXJ A; 4OMN A; 1AWO A; 1CKB A; 3M0R A; 4JPB W; 1W6X A; 1JXM A; 4DEX A; 3H0H A; 5IXF A; 1SRL A; 1UEC A; 1GBQ A; 4ESR A; 1GCQ A; 1UHC A; 2JMC A; 2RPN A; 1NLO C; 4AG1 C; 2K9G A; 3C0C A; 1OOT A; 3VS2 A; 1SHG A; 2K3B A; 2MOX A; 2JM8 A; 1H8K A; 1PNJ A; 2EPD A; 2KT1 A; 1YCS B; 4F14 A; 4J9E A; 2KRM A; 2BZX A; 3VS6 A; 2K6D A; 3EHQ A; 1W1F A; 4AFQ C; 3H41 A; 3LH5 A; 1HSQ A; 1PKT A; 2CSQ A; 2KRS A; 1WLP B; 2HCK A; 5L23 A; 2V1R A; 4RTU A; 2RQR A; 2J6F A; 3EG2 A; 2EGC A; 1HJD A; 1E6H A; 1M3B A; 1QWF A; 1ZBJ A; 2DA9 A; 2PZ1 A; 3NMZ C; 3VS1 A; 4A63 B; 2EGA A; 1ABO A; 2O88 A; 2J6K A; 1YWP A; 2ED1 A; 1JU5 C; 4CC4 B; 1K9A A; 1OV3 A; 2YT6 A; 2YUO A; 3UA7 A; 3VRZ A; 1YNZ A; 1JEG A; 4EIK A; 2DL8 A; 2DBK A; 3QWY A; 5FWB A; 2JT4 A; 3VS4 A; 1VA7 A; 1BB9 A; 2ESW A; 1YWO A; 3H0I A; 2KRN A; 1YP5 A; 2FPD A; 4QT7 A; 1RLQ C; 2YUN A; 2J05 A; 2SRC A; 4Z8A A; 1K0X A; 1PHT A; 1WA7 A; 2DLP A; 1WXB A; 2M51 A; 2J6O A; 1OEB A; 2XMF A; 1X2K A; 2LX7 A; 4K11 A; 1Y0M A; 1PWT A; 2QDL A; 4RTZ A; 3I5S A; 3I5R A; 1M3A A; 4OMQ A; 3NGP A; 3VS3 A; 1OPK A; 2F2W A; 3JV3 A; 1N5Z A; 4J9G A; 1U5S A; 5IXB A; 2DMO A; 2KEA A; 1QWE A; 4HVW A; 4D8K A; 1KSW A; 2DL4 A; 1EFN A; 4JJC A; 2I0N A; 2LJ3 A; 2O31 A; 2D0N A; 3NHN A; 2LCS A; 2AZS A; 1GCQ C; 1FYN A; 1X6G A; 4FSS A; 4E6R A; 2DL3 A; 2LJ1 A; 2KYB A; 2KXC A; 2O9V A; 1BBZ A; 1TUD A; 1ZLM A; 1BK2 A; 1I07 A; 2V1Q A; 2KBT A; 4JZ4 A; 4CC2 A; 2CSI A; 1B07 A; 2H8H A; 1X43 A; 1AWJ A; 2F2X A; 5HCK A; 4RTX A; 3EG1 A; 1WI7 A; 3M0Q A; 2VVK A; 1K1Z A; 2PTK A; 2F2V A; 2EW3 A; 3UA6 A; 4RTW A; 3SEM A; 1UUE A; 3RBB B; 2BZ8 A; 1KIK A; 2ECZ A; 2ABL A; 1PRL C; 2CUD A; 3VS7 A; 1VYV A; 4LUE A; 3KFV A; 3M0S A; 3M0U A; 2CH4 W; 3FJ5 A; 2DL7 A; 1AWW A; 1WXT A; 1SRM A; 1AD5 A; 2RQU A; 1ABQ A; 4ORZ A; 3GBQ A; 4J9C A; 2VWF A; 3UF4 A; 2DBM A; 5GJW B; 2JW4 A; 3R6N A; 2DM1 A; 2L0A A; 1W70 A; 2CRE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M0O A; 4OF1 A; 2JZ2 A; 4XAX B; 3R6O A; 3WVE B; 4PJO F; 3CC4 Q; 3GPL A; 5CR2 A; 4O6J A; 2CP7 A; 2GQI A; 4C8Q E; 5LJ3 d; 3MEA A; 4ME7 A; 2RNA A; 1OI1 A; 1W2B A; 2JOY A; 4JDS A; 3QBY A; 3FRN A; 1KQ1 A; 3HRU A; 1NJI R; 2BE7 D; 4VUB A; 1T3L A; 2B86 A; 1FMK A; 4JRK A; 4C92 E; 3ULR B; 1Q95 G; 1AWX A; 2J06 A; 2QK0 A; 4F7U G; 3EG0 A; 3G6E Q; 4F7U E; 2KMT A; 3M58 A; 3G4S A; 2BUD A; 4MML A; 3V7S A; 1VQ6 Q; 1SSF A; 1PRM C; 3QHS A; 4HCB A; 1TUC A; 3V8L A; 1K4U S; 1ACM B; 1UJY A; 5DM7 R; 2XIC A; 5GAM f; 4AFS C; 2YSQ A; 1YIT A; 1PCX A; 3ZL7 C; 4AG2 C; 3OQ5 A; 3PFS A; 4FYW B; 2OTL Q; 1WNL A; 4LUD A; 3OSV A; 3QXE B; 2X51 A; 4BE2 A; 3FDR A; 3REA B; 1QVP A; 1E6G A; 1D3B B; 1G3T A; 1M8M A; 1B34 B; 1QW1 A; 3JCM W; 5D6X A; 1ARK A; 3CCU T; 4M4Z A; 4FT4 A; 2E65 A; 3EGX B; 4RUG A; 3CCQ A; 1U1T A; 5A0L A; 2A3L A; 4M78 B; 2D9T A; 2LRQ A; 1J3T A; 1WGS A; 3CCV Q; 3CBO A; 1X01 A; 2D6F A; 1IZ6 A; 2COY A; 1BIA A; 5IHI A; 5GAN 2; 1E7O A; 1LCK A; 2YHT A; 1UJ0 A; 1S72 Q; 1WXU A; 5KYW B; 3GP8 A; 3JB9 D; 3G71 A; 3JCM J; 5GAN 8; 2MYS A; 2Y4Y A; 2GFA A; 2QEX T; 3EGX A; 3FJP A; 1VQ8 Q; 2FPF A; 2X4Y A; 2V8K A; 1T0J A; 4BAC A; 2DYB A; 4B9W A; 3J7A F; 4J9F A; 1G5V A; 3M0P A; 4M78 A; 4ZNX A; 1IGU A; 3TQ7 P; 3RMS A; 2CDT A; 1X2Q A; 2EVR A; 1VQ4 Q; 1T0H A; 3OYE A; 2RJC A; 1JJ2 P; 1G83 A; 1I0C A; 2D8J A; 3JB9 G; 5KYW A; 5LJ5 f; 1M1G A; 4HVU A; 5KYX B; 3BE3 A; 4EMG A; 3TU4 K; 3VYG A; 1M30 A; 4QVZ A; 5DLQ E; 1R77 A; 1ZA1 B; 2G3R A; 2ZZD A; 3MHX A; 3S3O A; 1ZUU A; 1PSF A; 2AK5 A; 1M4Z A; 2E3I A; 2A36 A; 4F16 A; 2ZPF B; 2NYS A; 3E19 A; 1X6B A; 2KR3 A; 4JJD A; 4FCY A; 1AVZ C; 2JNG A; 4OGE A; 3CCM T; 4HVV A; 1GFD A; 4QKU A; 2VB6 A; 2DKG A; 3S3M A; 1FMW A; 4E47 A; 3I35 A; 4WCI A; 3L2R A; 3G4S Q; 2CKK A; 2RI5 A; 3EHR A; 3I56 A; 2JTE A; 2AZV A; 3JB9 I; 2DXB A; 2MAM A; 3TSW A; 4D6W A; 1G3Y A; 2C0O A; 2YXY A; 2EYX A; 1YIT Q; 1IGQ A; 1NM7 A; 3AT1 B; 1T3S A; 1I81 A; 4IUR A; 1PC0 A; 4PLL A; 1S1N A; 4C8Q F; 3PE0 A; 4M78 C; 1NG2 A; 1W2B S; 1KK7 A; 3OW2 S; 3L2W A; 1M90 U; 1OPL A; 4LD6 A; 4Y91 A; 1BI2 A; 2RHZ A; 3CCQ Q; 2ZCF B; 1TH7 A; 2HKN A; 4XQ3 A; 4C92 F; 1XOV A; 5D6W A; 2DET A; 2CYZ B; 3A5Z B; 2JVV A; 2GTJ A; 3JCM Q; 2PNI A; 1OU9 A; 3CPW P; 2VXE A; 5LJ3 j; 2AKL A; 2K2M A; 3A8M B; 5IHN A; 2MCN A; 1BI3 A; 2RJF A; 1NEB A; 2RMO A; 4DBH A; 3MP6 A; 2NUP B; 2EQM A; 1VQ7 T; 2K5L A; 3G71 Q; 2M02 A; 2EJ9 A; 3QWX X; 4KUD K; 4BI8 B; 1TUG B; 2O2O A; 3HTR A; 3FB9 A; 2GFU A; 4C5E A; 2QA4 A; 3D7S B; 2ENM A; 2P0P A; 4J6W A; 1BI1 A; 3OYK A; 2DRK A; 2DER A; 4HCZ A; 1RI9 A; 2GQV A; 4HXJ A; 5EG2 A; 3MP1 A; 5CO7 A; 5GAN 7; 2FZK B; 1W6X A; 1GBQ A; 1GCQ A; 3CPW A; 3C0C A; 1QVG P; 1OOT A; 3QSU A; 4N4G A; 4ANJ A; 2EQK A; 2K3B A; 2EQU A; 1H8K A; 1P92 A; 4M75 G; 5AT1 B; 5HK3 A; 2DTO A; 4M7A B; 2DJZ A; 2WSC E; 4ELY C; 3SFM A; 4M77 G; 2F69 A; 5CKD A; 4HT9 A; 1PKT A; 3EH1 A; 2KVQ G; 3UPU A; 3NFC A; 3DLM A; 4RTU A; 4XTX A; 2K2V A; 1HJD A; 4OB1 B; 1M3B A; 2PZ1 A; 3NMZ C; 2YLB A; 1ABO A; 4HT8 A; 3I55 A; 2O4X B; 1F1B B; 1YWP A; 4XK8 E; 1JU5 C; 3I56 Q; 3DLL A; 1K9A A; 2LQK A; 2PQW A; 3UA7 A; 5A0D A; 4A4G A; 4WTO B; 5M9O A; 4M7A A; 2DFU A; 4GLK A; 3V7C A; 2DBK A; 3QKJ A; 3VS4 A; 3OYG A; 5GAN 3; 2FPD A; 4M75 A; 1LVK A; 1PHT A; 2XKO C; 2JJ9 A; 2M51 A; 2J6O A; 4OB2 B; 2HZY A; 4M77 A; 1N8R C; 5FRM A; 1X2K A; 3M53 A; 1Q82 R; 1Y0M A; 2FL7 A; 1RAH B; 1G8X A; 3MPU B; 2O4X A; 4JRP A; 3NTK A; 4ZTF A; 3CCU A; 3ZBD A; 5IXB A; 2KEA A; 3H8Z A; 3VV0 A; 3OYL A; 1K73 C; 4RG2 A; 1FMV A; 1VQM T; 5GMK l; 3NHN A; 5GMK i; 2R57 A; 3CCE T; 4DOW A; 5GAO m; 1GCQ C; 1X6G A; 2DL3 A; 5LJ5 h; 1YI2 A; 3QJ6 A; 1BBZ A; 4FSX A; 2V1Q A; 5GAM g; 1YHQ T; 3KBG A; 1M2O A; 2B8A A; 2H8H A; 2CS7 A; 3E2U A; 4RTX A; 2QEX A; 3QYH B; 1IHV A; 5D7U A; 1K1Z A; 3PIO A; 4RTW A; 3SEM A; 3RBB B; 3JB9 H; 2QA4 Q; 3L2V A; 3H6Z A; 1OUL A; 2DL7 A; 5I2S A; 4J6Y A; 2P0Q A; 2K5F A; 3R6N A; 3HKS A; 2DM1 A; 2L0A A; 1QMC A; 1MNE A; 2CP2 A; 4M7A C; 2YWW A; 3PT9 A; 2CZ6 B; 3MJX A; 1BI0 A; 4EMK B; 1JBM A; 4XU1 A; 1JO8 A; 3P8H A; 4M75 C; 1XQH A; 2HEQ A; 2MF2 A; 1UG1 A; 3CC2 A; 3VU3 C; 4M77 C; 3JCM e; 4E7S A; 1QKX A; 2DRM A; 4A53 A; 3OMC A; 4OMP A; 3ER0 A; 2L2P A; 1XNI A; 1TXQ A; 3P8B B; 2LVM A; 4IKF A; 4Y28 E; 3CCM A; 4J83 A; 1K9M C; 1NLP C; 3PTA A; 1VQ9 T; 3UT1 A; 3I55 Q; 3CCL T; 5GAM d; 2FEI A; 3MEW A; 4C5I A; 5LJ5 g; 3QPH A; 1HD3 A; 2BZY A; 3SHW A; 2SEM A; 2DAQ A; 3DB3 A; 3EG9 B; 2DF6 A; 1OZ3 A; 1RUW A; 3MCA B; 2NWM A; 2JS2 A; 2O9S A; 5GAN e; 2L3P A; 3HFN A; 4IUQ A; 5IN1 A; 2RQW A; 2DK3 A; 1LPL A; 3LH0 A; 3RNJ A; 3JAM E; 5J3B A; 4FYY B; 3L2Z A; 2EIF A; 3CCU Q; 1V76 A; 2E64 A; 2FO0 A; 2KQW A; 4OMM A; 2AKK A; 5GMK e; 4PLI A; 2L89 A; 1M5Q 1; 3GLX A; 3CMA T; 2OAU A; 3EG9 A; 1Q82 U; 8ATC B; 1Q7Y C; 1WX6 A; 2HSE B; 4HCK A; 1UTI A; 1KC8 C; 2NLU A; 1A0N B; 3OW2 P; 1VQN A; 2LTO A; 2YDL A; 1YI2 Q; 3OYA A; 2VC8 A; 1R0B G; 1VIF A; 1ZUY A; 2JTF A; 2QEX Q; 1X69 A; 5J26 A; 9ATC B; 1QQJ A; 4XTU A; 1ZA2 B; 2KXD A; 4J8O A; 1H3H A; 2A08 A; 3TVT A; 3MO8 A; 2Y90 A; 1UB4 A; 3HFO A; 4FW2 A; 1ZSG A; 1U06 A; 1VYU A; 2DIL A; 2RHI A; 5LJ5 d; 5A0G A; 2EBP A; 2CP3 A; 2KSS A; 4QVD A; 2CH4 A; 1N9S A; 1SG5 A; 3QDF A; 1YJ9 T; 4OB3 B; 3H9N A; 2BTT A; 2HAX A; 2PVO B; 5FU7 B; 5DLO A; 1Q86 C; 3CBP A; 3E9F A; 3OW2 A; 1ZQ1 A; 4C5G A; 2GNC A; 3G7Z A; 1K0S A; 1V1C A; 4KH0 B; 2LZ6 B; 3OYN A; 3BFM A; 1X6O A; 2W0Z A; 3DB4 A; 3JCM h; 1YCY A; 1UDL A; 3M0T A; 3CC2 Q; 4ZN1 A; 1I8F A; 2FRW A; 4BE1 A; 1YJN A; 1X27 A; 5CK9 A; 1Q81 U; 4C8Q B; 3JCM P; 4M78 D; 3CCM Q; 2OI3 A; 1WHH A; 2DZC A; 4KGX B; 2ED0 A; 2DJQ A; 4FW1 A; 1U1S A; 2K3X A; 2RK2 A; 2ZGW A; 4IIM A; 4BI4 A; 4KH1 B; 1PG5 B; 1QCF A; 1UFF A; 4TVR A; 4C92 B; 1M90 R; 2DIG A; 2X9H A; 2ROL A; 2JM9 A; 3OS5 A; 2DVE A; 2HBP A; 2KYM A; 4JS5 A; 2CP5 A; 3E9G A; 1JXO A; 3RKY A; 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