The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
QTSQDLFSYQALYSYIPQNDDELELRDGDIVDVMEKCDDGWFVGTSRRTKQFGTFPGNYVKPLYL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure Basis for the Recognition of Ataxin-7 PRR with R85FL SH3 Domain
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Sorbin and SH3 domain-containing protein 1
|
| total genus |
11
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RNA A; 2DVJ A; 1OPL A; 3VS0 A; 1MV0 B; 4CC4 B; 3SEM A; 1KIK A; 4JJB A; 1FMK A; 3M0T A; 4KRT A; 1ZX6 A; 2L3Q A; 5ECA A; 1X69 A; 3PE0 A; 4JZ3 A; 2KXC A; 3EG3 A; 1GBQ A; 2CUB A; 4OMQ A; 4CC7 A; 3UA7 A; 5IHI A; 2E5K A; 2EGC A; 1U3O A; 2KRS A; 2L3S A; 1UHC A; 1E6G A; 2LQN A; 1UG1 A; 4J9E A; 1M30 A; 2AK5 A; 3VS2 A; 2M0Y A; 1GFD A; 2DL3 A; 4OMO A; 4ZNX A; 3VS1 A; 2SEM A; 3M0R A; 1TUC A; 3R6N A; 2JT4 A; 1CKA A; 3VS7 A; 2DL7 A; 1X6B A; 3H41 A; 4J9H A; 1UE9 A; 2KYB A; 1M8M A; 2OAW A; 5FWB A; 1SSH A; 1U06 A; 4Z8A A; 3EG2 A; 1RLQ C; 1PKT A; 1GL5 A; 2MCN A; 2I0N A; 2KXD A; 4FSS A; 4A63 B; 2O88 A; 1N5Z A; 1UDL A; 2LMJ A; 2PTK A; 5HCK A; 1ZUU A; 1VA7 A; 1NLO C; 2DYB A; 4DEY A; 3EGU A; 2C0T A; 1UUE A; 2MIO A; 4AFU C; 1QWF A; 5IHN A; 1QWE A; 1NYG A; 2LJ0 A; 5FWC A; 1K0X A; 1AWW A; 4GBQ A; 2NWM A; 1A0N B; 4RTY A; 2GTJ A; 2EYW A; 1AZG B; 2IIM A; 2KRO A; 2KR3 A; 2VWF A; 4E6R A; 2ED1 A; 2EBP A; 4AG2 C; 2FPE A; 1UJY A; 2AKK A; 2DMO A; 2FRW A; 2HSP A; 4OML A; 1AWX A; 2QDL A; 2DBM A; 4RTT A; 4OMP A; 1K1Z A; 1B07 A; 3IQL A; 4QT7 A; 3KFV A; 2LCS A; 2RQW A; 1M3A A; 1U5S A; 1YNZ A; 2EVR A; 1NEB A; 1WXU A; 1SRM A; 2EYZ A; 2F2V A; 2FRY A; 2KRN A; 1I0C A; 3UAT A; 2BTT A; 1G2B A; 4J9C A; 1MUZ A; 1I1J A; 1WDX A; 1X2K A; 2EPD A; 1AEY A; 1Z9Z A; 1QCF A; 3EHR A; 2B86 A; 4RTW A; 2D1X A; 2FO0 A; 2CDT A; 5EC7 A; 3VS6 A; 2RQV A; 2CSI A; 1GCQ C; 1X43 A; 4J9G A; 1VYT A; 2DM1 A; 1GCP A; 3NMZ C; 3VS3 A; 2LJ1 A; 2D8H A; 2JTE A; 4LUE A; 2LP5 A; 4EIK A; 2KEA A; 2DX1 A; 2K2M A; 3RBB B; 2VKN A; 2XMF A; 4CC3 A; 4AFZ C; 1H8K A; 2J05 A; 2H8H A; 2DA9 A; 1WLP B; 1PRM C; 2BZY A; 3REB B; 4GLM A; 5FW9 A; 1SRL A; 2GNC A; 2JS0 A; 4F16 A; 1JXM A; 3FJ5 A; 4DEX A; 1WX6 A; 2DL4 A; 4LN2 A; 2LNH B; 2X3W D; 1PKS A; 4RTX A; 3SHW A; 2HEQ A; 2ED0 A; 1UHF A; 4F14 A; 2DL5 A; 2AZV A; 2W0Z A; 1ZBJ A; 1MV3 A; 2CT4 A; 4J9F A; 1UGV A; 1NG2 A; 1T0J A; 2RPN A; 2J6O A; 1WFW A; 2EGE A; 1JXO A; 4HCK A; 1UEC A; 1AD5 A; 1JEG A; 1QKW A; 1ZUY A; 2C0O A; 2JMA A; 3CQT A; 4D8D A; 1JU5 C; 2CUD A; 1OOT A; 1TG0 A; 3H0H A; 2DRK A; 4IIM A; 2RF0 A; 4AG1 C; 2RMO A; 2RQR A; 4HXJ A; 1GBR A; 3H0I A; 2ENM A; 2KBT A; 2O2O A; 2AZS A; 1M3B A; 3TSZ A; 1HSQ A; 2OI3 A; 1QKX A; 2V1Q A; 1PRL C; 3NHN A; 2D0N A; 1X6G A; 1V1C A; 4JZ4 A; 2ABL A; 3VRZ A; 2ESW A; 2KGT A; 2YSQ A; 1PNJ A; 2FPD A; 2GTO A; 1ZUK A; 1BBZ A; 3I5S A; 1T3L A; 2FPF A; 2DF6 A; 1GCQ A; 1H92 A; 3NGP A; 1K9A A; 2LZ6 B; 1OPK A; 1BB9 A; 2A36 A; 2VVK A; 5GJV B; 1QLY A; 2GBQ A; 3TSW A; 3C0C A; 1X27 A; 2K6D A; 2JW4 A; 4AFS C; 2A37 A; 1BU1 A; 2YDL A; 1YWO A; 2J7I A; 3LH5 A; 2F2W A; 2HDA A; 2ROL A; 2KE9 A; 1UJ0 A; 3REA B; 3H0F A; 4ORZ A; 4JJD A; 1AWO A; 4LE9 A; 2JXB A; 2AKL A; 3UA6 A; 1UTI A; 1VYV A; 1AOJ A; 1JO8 A; 2LJ3 A; 5L23 A; 2X3X D; 2YUQ A; 1WI7 A; 4R0K A; 2OJ2 A; 2CT3 A; 1M3C A; 1W1F A; 3EG1 A; 2DE0 X; 2JS2 A; 3EHQ A; 1RLP C; 3RNJ A; 3THK A; 3NPF A; 3A98 A; 5IH2 A; 4J9D A; 4OMM A; 1T3S A; 1WYX A; 2JMC A; 4CC2 A; 1T0H A; 2V1R A; 2BZX A; 2EYX A; 2PZ1 A; 3TVT A; 1OV3 A; 1AWJ A; 2G6F X; 2K9G A; 4Z88 A; 1FYN A; 2BZ8 A; 2LX7 A; 4HVW A; 1WA7 A; 4AFQ C; 2JM9 A; 2J06 A; 1BK2 A; 1J3T A; 2DJQ A; 1ZSG A; 3JV3 A; 1RUW A; 2HCK A; 2O31 A; 1NLP C; 4K11 A; 2K7A A; 2K79 A; 3VS4 A; 1SEM A; 1W70 A; 1YP5 A; 2HBW A; 4HVU A; 2O9V A; 1ARK A; 4F17 A; 1PHT A; 3I35 A; 2YUN A; 1UFF A; 5I11 A; 2DIL A; 2GGR A; 1OEB A; 2JM8 A; 2FEI A; 5GJW B; 2J6K A; 2L3P A; 4OMN A; 2CH4 A; 2CRE A; 2KYM A; 1NYF A; 1KJW A; 3ZL7 C; 5I22 A; 4Y92 A; 3I5R A; 1K76 A; 1CKB A; 4RUG A; 2FG0 A; 1LCK A; 2DNU A; 1ZLM A; 1AVZ C; 2F2X A; 4LNP A; 3UF4 A; 1VYU A; 2W10 A; 1GFC A; 4WCI A; 2A08 A; 2ROT A; 4RTV A; 3QWX X; 1H3H A; 4X1V A; 2EQI A; 2CSQ A; 2KNB B; 1K0S A; 4RTU A; 1NEG A; 4JJC A; 2KRM A; 2EGA A; 3M0U A; 4LUD A; 2EKH A; 1B3Q A; 2YUO A; 4JPB W; 2P4R A; 1KFZ A; 1HD3 A; 1SHF A; 2DBK A; 2CH4 W; 1EFN A; 5IHK A; 2EW3 A; 2C0I A; 1AZE A; 3O5Z A; 4M4Z A; 2L0A A; 1WIE A; 1G83 A; 2KT1 A; 1KSW A; 4J9I A; 2RN8 A; 2LQW A; 1NM7 A; 2GQI A; 3EG0 A; 3PVQ A; 1X2Q A; 2RQU A; 4J9B A; 1SHG A; 4ESR A; 1WXT A; 2ECZ A; 1W6X A; 3M0S A; 2YUP A; 1Y57 A; 4HVV A; 1WXB A; 2D8J A; 1Z9Q A; 1SPK A; 2RQT A; 2A28 A; 3GBQ A; 1JQQ A; 5IXB A; 5IXF A; 2NUZ A; 2M51 A; 4IIO A; 2YT6 A; 1RI9 A; 1CSK A; 1S1N A; 1E6H A; 1GRI A; 3QWY A; 2K3B A; 3VS5 A; 1M27 C; 4D8K A; 1I07 A; 2SRC A; 3M0Q A; 2DL8 A; 1XOV A; 1E7O A; 1ABQ A; 4Z89 A; 3I9Q A; 1YWP A; 1TUD A; 2MOX A; 1PWT A; 1ABO A; 2J6F A; 4RTZ A; 1YCS B; 1K4U S; 1IO6 A; 1Y0M A; 2DLP A; 2DRM A; 2L2P A; 3PVL A; 3VRY A; 1YN8 A; 3U23 A; 2PNI A; 3M0P A; 3ULR B; 2O9S A; 1HJD A; 2EYY A; 2KT8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OGC A; 2QQB A; 2G3R A; 2MPX C; 1YIT T; 3VS0 A; 1MV0 B; 2QGG A; 4JJB A; 1FMK A; 3CCE T; 4KRT A; 2L3Q A; 1X69 A; 3VUZ A; 2KXC A; 2EJF A; 2MMP A; 3M54 A; 5GAO q; 3OYB A; 3CD6 T; 1O75 A; 1EIF A; 3M58 A; 1UG1 A; 2P4T A; 1M30 A; 3VS2 A; 2QQR A; 5GAO n; 4M7D E; 2AT1 B; 3MP8 A; 1TUG B; 4D6W A; 4M78 D; 1G3Y A; 2JT4 A; 4J9H A; 1MMA A; 5FWB A; 1Y96 B; 1U06 A; 2MWO A; 1QVG S; 1M2V B; 1RLQ C; 1S72 T; 3FJP A; 3HHT B; 2O88 A; 4A63 B; 1N5Z A; 1UDL A; 3CC2 T; 2DET A; 3TEE A; 1NLO C; 2DYB A; 2E70 A; 2HZY A; 3EGU A; 2C0T A; 1O9S A; 4AFU C; 5CO7 A; 2WSC E; 6AT1 B; 2VYT A; 1NYG A; 2V8K A; 3OSV A; 3OS5 A; 4M7D A; 1K0X A; 1N27 A; 2X4X A; 3P8D A; 3QPH A; 5GAM e; 2EWN A; 4GBQ A; 3TCJ A; 2XDP A; 1A0N B; 4E6R A; 2DEU A; 4PJJ A; 2EYQ A; 1Q7Y U; 2HSP A; 2R57 A; 1VQ9 T; 1X75 C; 3M9Q A; 5GAN j; 1K1Z A; 1B07 A; 2LCS A; 5CKB A; 2QEX Q; 2RM4 A; 1LOJ A; 1U5S A; 3RES A; 5KYW B; 5DM7 R; 1M5Q 1; 1SRM A; 1RAH B; 5GAN f; 5CCA A; 1D1C A; 3CXC S; 1U1T A; 4WTO B; 1Q86 R; 1WJR A; 2BTT A; 2CP5 A; 4II1 A; 5GAM h; 2FZG B; 1G3T A; 1VQN A; 5M9O A; 4AT1 B; 2B86 A; 2D1X A; 5EC7 A; 5IN1 A; 3URG A; 4C8Q D; 2KQW A; 4PJO F; 2DM1 A; 2VGN A; 2D8H A; 2JTE A; 4ZTF A; 4EIK A; 2X35 A; 1ZBX A; 3CCM T; 2DTI A; 3MEW A; 3A8O B; 1QP2 A; 1K8A R; 3JCM V; 1PRM C; 2BZY A; 3KXT A; 2DIQ A; 2XDB A; 2F5T X; 1JXM A; 4DEX A; 1WX6 A; 4OVA A; 1WHG A; 2LNH B; 1RAB B; 1Q81 R; 1KQS S; 2PUK B; 5HY6 A; 2W0Z A; 3J81 E; 4IKF A; 2BUD A; 1D0Z A; 2Y90 A; 2OTJ T; 4DQ2 A; 2CT4 A; 1UGV A; 2DXU A; 4XTU A; 3CCJ T; 2JTM A; 5CQX A; 4LXC A; 2EGE A; 3CCS T; 4HCK A; 3S3O A; 1OZ3 A; 1GXI E; 2E6N A; 1AD5 A; 2CP0 A; 1EZZ B; 1FXX A; 1QKW A; 1R77 A; 1WHL A; 2VUB A; 4E7K A; 3CQT A; 1PM3 A; 2R5M A; 2LRQ A; 1TG0 A; 3H0H A; 2DRK A; 2RK2 A; 4QVD A; 1K73 C; 1RAD B; 4GLK A; 4AG1 C; 2DZC A; 1I81 A; 1UGQ B; 3H0I A; 1VQ5 T; 2ENM A; 2CS7 A; 4VUB A; 1M3B A; 2DK3 A; 1C1A A; 2M0O A; 2PVO B; 4NS5 A; 1M9S A; 1VQL A; 1ZSZ B; 4NL2 A; 4JRQ A; 1PRL C; 4A4F A; 4ZGD B; 1SKU B; 1VQL Q; 1KG1 A; 3L2U A; 1MHN A; 1N8R C; 1X01 A; 3I5S A; 1VOM A; 2FPF A; 1YIT A; 2LZ6 B; 1BB9 A; 1BKB A; 1YIT Q; 3CCE A; 2CZ1 B; 2OX7 A; 3CD6 A; 3CCE Q; 5CR2 A; 2V26 A; 2IPO B; 3CD6 Q; 2HBP A; 5LJ5 j; 1BIB A; 2VC8 A; 2ZPI B; 3UA6 A; 1VYV A; 5LJ5 f; 1AOJ A; 1JO8 A; 1WI7 A; 3TRE A; 2K5L A; 4M78 F; 3EG1 A; 1KC8 C; 2X4W A; 1RLP C; 2WSE E; 2KDS A; 3RR6 A; 2E41 A; 1S72 A; 2RJC A; 1M2O A; 3J80 E; 3WVE B; 5GAN e; 1S72 Q; 3CC2 A; 1YCY A; 2EYX A; 4XU2 A; 1RI0 A; 5GAN 5; 3QG1 A; 1WHK A; 2O4X B; 1AWJ A; 2NYS A; 3EG9 A; 1RAE B; 1WA7 A; 2E3H A; 2J06 A; 2QAZ A; 1BK2 A; 3OYD A; 1VQ8 T; 5CK9 A; 4BI4 A; 4C0D B; 2I2L A; 5GAO r; 2HCK A; 2K7A A; 4C5G A; 1I5O B; 1SEM A; 4TVR A; 3D7S B; 3JCM d; 3OS0 A; 3CCV T; 1ARK A; 3M55 A; 1VQ9 A; 3EGD B; 1UFF A; 3OS2 A; 4F7U G; 1QW1 A; 1VQ9 Q; 3NTI A; 4B9W A; 5IAY A; 1M1K R; 7AT1 B; 1TH7 A; 3JCM W; 4FSX A; 4F04 B; 4R55 A; 3INZ A; 4FYY B; 3DB3 A; 1QCO A; 4JUV A; 3ZFJ A; 4KGV B; 1VQK Q; 3CC4 A; 2QQ9 A; 3BDU A; 2X4J A; 2A08 A; 4M75 C; 2COY A; 1H3H A; 2EQI A; 2CSQ A; 4J7F A; 4QW2 A; 4BE2 A; 4RTU A; 4JJC A; 1W2B P; 2EKH A; 1B3Q A; 2YUO A; 4J6W A; 4C8Q F; 3VV0 A; 2H3J A; 2LVM A; 2FHD A; 2YRD A; 3PIO A; 4FCY A; 1KFZ A; 2M02 A; 3CCM A; 4BDY A; 1SHF A; 3JB9 G; 2DBK A; 2QA4 T; 2HQH A; 3DLL A; 2CH4 W; 3OYM A; 3OW2 P; 2C0I A; 3CCM Q; 2DTO A; 4FU6 A; 4J9I A; 2DO3 A; 2RN8 A; 2E12 A; 2LQW A; 2GQI A; 4KH0 B; 3PVQ A; 1X2Q A; 2ZPH B; 3JSC A; 2M9U A; 4RCB A; 5DLO A; 1SHG A; 2DIG A; 5A0G A; 3RUX A; 2OTJ A; 1IHW A; 3M0S A; 2YUP A; 2D8J A; 1Z9Q A; 2OTJ Q; 4RG2 A; 4M75 E; 1VQM T; 4EMK A; 2RQT A; 4KH1 B; 3GBQ A; 3CCJ A; 4E7L A; 2M51 A; 3L1A A; 3CCS A; 5A0L A; 4J7I A; 3CCJ Q; 1JJ2 P; 4M77 C; 2YT6 A; 5GMK l; 3CCS Q; 3R6O A; 1S1N A; 1E6H A; 3QWY A; 3DKM A; 2LDM A; 3KUF A; 1I07 A; 1WPY A; 3M0Q A; 2DL8 A; 2E5Q A; 1KQ2 A; 1TUD A; 2E10 A; 1IRE B; 5LJ5 e; 1VQ5 A; 1F1B B; 3UWN A; 1DJ7 B; 2DLP A; 4C92 G; 1K73 U; 1VQ5 Q; 4MDX A; 4MML A; 3LGF A; 3M56 A; 4CRI A; 1YN8 A; 4A4E A; 3G71 T; 2FZK B; 2ZAE A; 2KVQ G; 3PMT A; 1G2B A; 2KT8 A; 4M75 A; 3G7Z A; 3CCQ T; 3GIB A; 3HRU A; 1M2V A; 4C8Q G; 2QXF A; 1KIK A; 4A4H A; 2IG0 A; 1N8R U; 2H3E B; 3M0T A; 1ZX6 A; 3QZ9 B; 3PE0 A; 4M77 E; 1RAC B; 1GBQ A; 3QYG B; 1Q7Y R; 1QP3 A; 3EGX B; 4CC7 A; 2CZ6 B; 5IHI A; 2E5K A; 3OMC A; 3FC3 A; 1U3O A; 3M53 A; 4RCC A; 3I55 T; 2D0Q B; 1YBY A; 4XTV A; 2X4Y A; 3OYC A; 5I21 A; 1QVF A; 1TUC A; 2XIC A; 5GAM j; 3R6N A; 1VQ4 Q; 3H41 A; 1UE9 A; 5CAI A; 4OMF B; 2X51 A; 3OBY A; 1SSH A; 4Z8A A; 1D1A A; 3OYK A; 4OP0 A; 2DXT A; 1KC8 U; 3P8H A; 4FSS A; 4M77 A; 4C92 E; 2LMJ A; 2NUT A; 2M16 A; 2HQE A; 2ZPF B; 4J6Y A; 1VIF A; 3JB9 H; 2RHY A; 3OB9 A; 3H8Z A; 1ZSZ C; 5KH6 A; 4C0Z A; 4EDU A; 3A8H B; 3MPU B; 2BKD N; 1VQ8 A; 1YHQ Q; 1BIA A; 1VQ8 Q; 4RTY A; 2GTJ A; 2KRO A; 2M1H A; 2VWF A; 2JOY A; 2ED1 A; 5KYX B; 4AG2 C; 2AKK A; 3H6Z A; 3CCV A; 2MK5 A; 1WGS A; 1JJ2 S; 3CCV Q; 3IQL A; 4QT7 A; 5FU7 C; 3VYG A; 2D9T A; 4Y91 A; 4M7D G; 2EVR A; 2RH2 A; 4C92 A; 2FRY A; 1MUZ A; 5GAN 7; 4JLG A; 1OX9 A; 1AEY A; 2A0F B; 4RTW A; 4LDV A; 5GAO l; 1QQJ A; 5GAN 4; 4J9G A; 1GCP A; 2RD1 A; 3NMZ C; 4A53 A; 1IHV A; 2E3I A; 2KEA A; 3RKX A; 4B6M A; 5KYU B; 2B8A A; 2DX1 A; 3JCM f; 2LT1 A; 2K2M A; 3RBB B; 2VKN A; 4PJN A; 1VQ6 T; 2QA4 A; 2CP2 A; 2H8H A; 2DA9 A; 1NPP A; 1WLP B; 2QA4 Q; 1MGQ A; 3SB2 A; 2E4H A; 3QII A; 4GLM A; 5FW9 A; 1SRL A; 4F16 A; 2ZPE B; 1YJN T; 2RB6 A; 4LN2 A; 4JRI A; 4C0D C; 2X3W D; 1PKS A; 4RTX A; 3SHW A; 4QQ6 A; 2R5A A; 2HEQ A; 4F14 A; 3BDL A; 1KQS P; 1ZSZ A; 5I2S A; 4IUQ A; 1LVK A; 2QQA A; 5D6Y A; 1VQM A; 1KHC A; 3FIF A; 2KMT A; 3QZ5 B; 3G4S T; 3JB9 D; 1I8F A; 5J26 A; 1WZO A; 1JEG A; 2DVE A; 2K5I A; 1ZUY A; 1R0B G; 3M4G A; 1JU5 C; 5FU6 B; 4MZM A; 1OOT A; 3VYH B; 2HQX A; 3O8V A; 3SDZ A; 5EG2 A; 1AHJ B; 3CME T; 4F7U B; 2YHT A; 2PQW A; 2RQR A; 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