The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
MNVTVEVVGEETSEVAVDDDGTYADLVRAVDLSPHEVTVLVDGRPVPEDQSVEVDRVKVLRLIKGG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of a protein from Haloferax volcanii
rcsb |
| molecule keywords |
Small archaeal modifier protein 2
|
| source organism |
Haloferax volcanii
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
5
|
| structure length |
66
|
| sequence length |
66
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJI A; 2L32 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1I7H A; 4OZB A; 4OVZ A; 4ARC A; 4DQO C; 3URY A; 1LFD A; 2CHX A; 1UGJ A; 4LTU A; 2KHW B; 2WWZ A; 3OG5 A; 4EEW A; 1G6J A; 3RD2 A; 4HWI B; 4TKN A; 4HEA 1; 4KKJ A; 1Z2M A; 1ZE3 D; 4XDD A; 3PRZ A; 3GZN I; 2MP2 A; 4K3C A; 2RGF A; 4W9H A; 1D5X C; 1P3Q U; 4MDK E; 4ANX A; 4NQK E; 3U8Z A; 4ITK A; 4OVV A; 5CTR C; 4I6L B; 2C7N B; 4G50 A; 4WAA A; 5C3J B; 2WHI A; 3QK0 A; 1OQR A; 2OOB B; 1SXT A; 3WCQ A; 2B3A A; 3AXC A; 3Q8C A; 4KIK B; 3ZRC A; 2IYD B; 2N1V A; 2ZNV C; 1C77 A; 3ZGZ A; 5J2R A; 2DAF A; 1KLV A; 3GE3 C; 5KHQ A; 4FHJ A; 3P4Q B; 4IM2 A; 1TKG A; 3VTV A; 4JE3 B; 4HVB A; 3TL5 A; 2WDV B; 5EE3 A; 5C2T B; 4FXC A; 3BWU D; 1WR6 E; 2LWP A; 4MGZ E; 3HIZ A; 2L3Z A; 2D3A A; 3V05 A; 1Y56 A; 3HM3 A; 4UDU C; 1V1O A; 2L05 A; 1E6E B; 1CK1 A; 3Q6B A; 1I4R A; 1C1Y B; 1N62 A; 1TYG B; 3AEC B; 3UIN B; 2V3N A; 2KDB A; 3PZ7 A; 1ISN A; 3JW0 X; 3WAL A; 3GB1 A; 4HDQ A; 2D5G A; 3RNE C; 2IZV B; 4GDL A; 5G2N A; 3P4S B; 4ICV A; 2BYE A; 3HRD D; 2KWU B; 1FXA A; 1ZKH A; 2MSE D; 3NZ3 A; 1GB4 A; 1D3Z A; 2IO0 B; 2RD0 A; 2NTT A; 1F2R C; 4XX5 A; 3Q2A C; 3DDC B; 2LRU A; 3KYD D; 3DBL I; 4ASW C; 1N60 A; 4BBN C; 2OJR A; 2PE9 A; 2WDT B; 4J3O D; 4HCP B; 3R2T A; 1WR1 A; 4G11 A; 1JWU D; 1KLU D; 4HRS A; 1K51 A; 2KDI A; 1R4M I; 1LO5 D; 3I9V 1; 4DDG D; 5IP4 D; 4M8M A; 2YEP B; 1GG3 A; 3ZW3 A; 1MVK A; 2WNM A; 1GUA B; 1WM3 A; 1IP9 A; 4EZJ A; 3L54 A; 2LGS A; 4L2Y A; 1JML A; 4YL8 A; 2BYT A; 4NAM A; 3ZNZ B; 2D3C A; 2GLS A; 3Q3N C; 3ZO5 B; 4XZ4 A; 2LMC A; 1QT9 A; 3NS1 A; 4S17 A; 3CMM B; 2H89 B; 2BS2 B; 2K3U A; 4B0E A; 2N9X A; 2KWD A; 4ANU A; 3K9P B; 3ZYY X; 4MSM B; 1XCT L; 4IWQ A; 1UBQ A; 3HM6 X; 3NHE B; 2MA9 B; 2PMV A; 2C9W B; 3DHG C; 2IGD A; 1OEY J; 2C5L C; 3PV1 A; 2VZK D; 2WXI A; 3PS6 A; 3TEY A; 1XQQ A; 3JSV A; 3TEZ A; 4RCO A; 4ZRP A; 2GBR A; 2N7J A; 3CIR B; 4GN1 A; 3ZUN A; 4K7W A; 4EFO A; 2PIA A; 2L76 A; 3UQB A; 1P9D U; 4AUQ C; 4BVU C; 1P0R A; 2IY0 B; 1UGM A; 3IFW B; 5LXH A; 1P7E A; 4RF1 A; 1L0Y B; 4DHZ B; 3T3O A; 2OJW A; 3N32 A; 4WQM A; 4ZRJ A; 2WXP A; 4G3X B; 3PRM B; 3T8M A; 3E9S A; 4MH8 A; 3AE1 B; 1CMX B; 3OWE B; 3U52 E; 2MBQ A; 4ARI A; 1C79 A; 2KXJ A; 1V1P A; 3AEB B; 3RPF C; 4K7S A; 2NBV B; 4HKZ E; 1E9M A; 1ZGU B; 4ZRK A; 2KZR A; 3KWL A; 3GZN B; 5CHW A; 2JZP A; 1C9F A; 4NQL B; 4M0W B; 3QHT A; 3U7Z A; 2ZVN A; 4AQ7 A; 2G9H D; 4MGI E; 3I5J C; 1TS2 A; 3VUW A; 1C3T A; 3ETR A; 3PPA A; 4B95 A; 2C7H A; 5BYQ A; 3VRB B; 2WXJ A; 3Q3O C; 2XN9 C; 1WE6 A; 3UGB B; 3BYT B; 1CJE A; 2JZZ A; 4LJP B; 1RAX A; 3M62 B; 1KJT A; 3ZTC A; 4DXF A; 1FEH A; 1T0R C; 2GMI C; 1WX9 A; 2LZ6 A; 1V8C A; 4WWN A; 2ZCC A; 1QOG A; 2KT7 A; 2GBK A; 3AH7 A; 1KLG D; 2JU6 X; 2LHD A; 1EM7 A; 2E3T A; 2NBU A; 2PPH A; 4YTM B; 2AX5 A; 4I6N B; 4AP4 C; 1ZXI A; 4FUL A; 2JRH A; 1T0S C; 1D5Z C; 2FBW B; 2JQR B; 2IO2 B; 1I35 A; 1P7F A; 1Q5W B; 2L0T A; 1PGX A; 4BKT A; 3P63 A; 1SIF A; 4US8 A; 2EMT A; 1MHX A; 4ZYS A; 3V61 A; 1J7C A; 3A9K A; 5DPW A; 3PRE A; 4MM3 B; 3DBH B; 1NI2 A; 3VDZ A; 2G4D B; 3DBL B; 1ENF A; 4GB9 A; 3SEB A; 1TTN A; 1JWM D; 2Y5P A; 1KTK A; 4A8X C; 2LUE A; 3Q8A A; 5HHD G; 3L16 A; 3AM9 A; 4NY0 A; 4AS1 A; 2MBO A; 2REX A; 2KTR A; 1YMH E; 2AEH A; 1WGG A; 2G1E A; 2EEL A; 5LNK 1; 2L52 A; 1E7P B; 2L83 A; 1K52 A; 4N58 A; 1YQ3 B; 3WAM A; 3MHS D; 1MJD A; 4XWT A; 1MG8 A; 1VCB A; 3SDL C; 2GBN A; 4OZA A; 1WRI A; 1JWS D; 4KSK C; 4HKQ A; 1KH0 A; 2IGH A; 3H1U A; 3LB8 C; 2BB6 A; 1UZX B; 3H6N A; 3ZDT A; 2FCN A; 2FE8 A; 4G0N B; 2JYT A; 3BVG A; 1QLB B; 3SFE B; 3ZXR A; 4MGK E; 5D6J B; 4RM8 A; 4IG7 B; 1DOX A; 2PJH A; 1NI3 A; 3M63 B; 3Q14 C; 4KSL C; 2RSU A; 1UEL A; 2MBE A; 1JCK B; 3DVN V; 1PQS A; 2FNJ B; 3NS8 A; 4HLE A; 2DYO A; 5G5G A; 2L32 A; 3HVD A; 1L0X B; 1JRO A; 2R2Q A; 1XCQ L; 4A3P A; 2KVZ A; 2MJE A; 4WQO B; 1YN5 A; 2H88 B; 3EEC A; 1HTQ A; 1VZ6 A; 1SE3 A; 2BF8 B; 4N6E B; 4TMA B; 2OHF A; 4C7Z A; 3D32 A; 2K25 A; 1KFY B; 4MAC A; 1V81 A; 4NZL B; 1V6E A; 2JUO A; 1WX7 A; 1OFF A; 1UF0 A; 3SD5 A; 1TY2 A; 2MRP A; 1ZP0 B; 3ML8 A; 2BKR B; 1NBF C; 4P1C C; 5BYR A; 1VJK A; 1N5W A; 1CQV A; 4WJO A; 3ZNG C; 1FNV A; 1L4D B; 3WAP A; 4XWW A; 2PVO D; 1GJZ A; 2IBI B; 5H92 C; 2LJ5 A; 4K1R B; 2XNA C; 2CU1 A; 2W3R A; 2KTF A; 4F8C B; 2K8C A; 2LAS A; 4I6P A; 4REZ A; 2L1A A; 1NEK B; 2MEK A; 2WX0 A; 1FO4 A; 5LXI B; 3M95 A; 3OJ4 B; 2ICI A; 3MC9 A; 1F9J A; 3V3X A; 4WJP A; 1ESF A; 5D2M B; 4HPL B; 3RYT A; 4OHJ A; 2M8S A; 4EOY A; 1VD2 A; 4E71 A; 1WSP A; 3JYU A; 4FBJ B; 1FFV A; 1HZ5 A; 2IY1 B; 1FNW A; 2KFK B; 3DCG A; 3IXS A; 4WH4 A; 4BOS C; 1QKZ A; 3PO0 A; 4M02 A; 5JZE B; 4W9G A; 2M19 A; 4WAF A; 4MGY E; 2Z0D B; 1IUE A; 3VTU A; 1NYR A; 4WWO A; 1I4G A; 3AEG B; 4P6V F; 2B76 B; 2BGF A; 2ZEQ A; 1F52 A; 5EDS A; 5E6P A; 1PGA A; 3APD A; 2LHE A; 1C78 A; 4EKU A; 2CS4 A; 1HQR D; 3AED B; 4AJY B; 3QA8 A; 4XYC A; 2DNF A; 3AE9 B; 2O6V A; 3ECI A; 1AW7 A; 3W5V B; 3OLM D; 3DBR I; 3DHI C; 3B08 A; 1PDX A; 2NR2 A; 3APC A; 3EC8 A; 2JX5 A; 1ZOY B; 3Q8B A; 1TZO A; 1I4H A; 3RZF A; 3BY4 B; 2JYE A; 3S2A A; 4DDI D; 3SFD B; 3VAW A; 2DYM A; 3V6C B; 2QHO A; 1XF5 L; 1QQR A; 2PW9 A; 1E5W A; 3N1X C; 4HXD A; 4LDT B; 2OED A; 1S1Q B; 2MLB A; 1VLB A; 3NVW A; 4YT0 B; 3R66 C; 2O6V D; 4NJ6 A; 1UUP A; 1WF9 A; 4AJW A; 3B9J A; 1QOF A; 2BWE S; 1YQB A; 3CF6 E; 1JW9 D; 4FLH A; 3AEF B; 3OAW A; 2Z8L A; 3NVZ A; 1T0Y A; 2WXK A; 1XT9 B; 3IBE A; 2L00 B; 2BYV E; 3KVF B; 2ON8 A; 2Y3A A; 3BZD B; 5IN7 A; 1L6V A; 2V9H A; 3Q8F A; 1K8R B; 5EE0 A; 5J17 A; 1A70 A; 3Q3J A; 4MEL A; 3HVZ A; 1N63 A; 1V2Y A; 2K9X A; 3M3J A; 3AE8 B; 2I1J A; 2ACZ B; 3QIJ A; 3QC8 B; 1Q0W B; 4FN2 A; 1F77 A; 4QAY A; 2G3Q B; 4XDC A; 1FD6 A; 1WRD B; 5T8I A; 1A5R A; 1J7B A; 4NAW B; 2KJH B; 3L13 A; 4W9J A; 5GXG B; 2NPT B; 1SJH D; 2IDY A; 4WUR A; 2O2V A; 3DBH I; 4PS7 A; 2I38 A; 2ZVO A; 3QWZ B; 5FR6 A; 1EU4 A; 3IHP C; 3MFG A; 2LFI A; 3W2D A; 2KKC A; 3APF A; 2V4L A; 1L6U A; 2JRI B; 2I2Y A; 3A1Q B; 3PZD A; 1Z5S B; 3N9Y C; 4IUM B; 1WJU A; 4IDI A; 3TSS A; 2J0J A; 5AEK B; 4W9F A; 3VR9 B; 2CHZ A; 4HJG E; 2HJ1 A; 4FJV B; 1S3S G; 3H7P B; 3IAS 1; 1ZW7 A; 3GP7 A; 5DPT A; 5HKH A; 2BB5 A; 1L2N A; 2BW2 A; 4RFB A; 1WFY A; 4P7I A; 3H7S A; 4GDK A; 3AUL A; 3P2B A; 4KZ0 A; 5IKC M; 3U2S C; 2V3P A; 1K50 A; 4NJ7 A; 3RNB C; 4ZHO A; 1EF1 A; 3B1L X; 3IG3 A; 3TJP A; 2MP2 B; 3DOW A; 1YN4 A; 4IWP A; 4KZC A; 1VZ8 A; 1YD8 U; 4TUU A; 3LDZ E; 1JQ4 A; 2D10 A; 3DVG Y; 2G45 B; 1M4V A; 3WAN A; 3WAO A; 1DYQ A; 1EWC A; 5FR3 A; 1WI0 A; 2QIL A; 2GB1 A; 4WWP A; 4II2 B; 2J53 A; 4GIV A; 2BYF A; 3SU8 X; 3KYC D; 4CQN A; 1B1Z A; 1LXD A; 2WDQ B; 1DGJ A; 2BVC A; 1KRH A; 1IBX A; 1RRB A; 5AZF A; 2DEN B; 3LXF A; 4KDI C; 4DHZ E; 4WJN A; 4BBN F; 2ONQ A; 2WQY B; 2LGD A; 3GOE A; 3I57 A; 1GB1 A; 1ROE A; 1WM2 A; 2QC8 A; 3I3T B; 1L4Z B; 3RFZ B; 3LJ3 A; 1UWX A; 2L8J A; 3TMP B; 3PRP B; 3V62 A; 1IGD A; 3AE5 B; 2D2Q A; 1NYQ A; 3NZU A; 3RMK C; 1TBE A; 2XK5 A; 4DHJ D; 1TKY A; 2QSD A; 3BYY B; 4F7Z A; 2HJ8 A; 3BII D; 3KUZ A; 1BUI C; 1F1H A; 2IO3 B; 2LGI A; 3DBR B; 3PLU A; 2KNB A; 2Z0E B; 1E7U A; 4GGQ A; 3DPD A; 3VRA B; 2BTE A; 2K8H A; 3FIL A; 4GDL B; 2Y5B B; 4K7U A; 4LNN A; 2W55 A; 1WX8 A; 4LLG M; 3PGE A; 1XLO A; 3B2F A; 4MJS A; 2DYB A; 3Q8E A; 3ZDM C; 5AZH A; 1SE9 A; 2O2V B; 1J7A A; 3HHM A; 4ANV A; 2Y5C A; 3CWI A; 1E90 A; 4LJO B; 2MQJ A; 4C4V A; 3RNF C; 3VFK A; 4O1N A; 2KC2 A; 4LNF A; 4E74 A; 3T3N A; 2Q5W D; 4A55 A; 1XLN A; 5AUI A; 2AL6 A; 4YSX B; 3N30 A; 4KV2 A; 2KFJ A; 5I4D A; 4X57 B; 3EFU A; 2GOW A; 2VZK B; 5BYS A; 1WXQ A; 2BS4 B; 1XD3 B; 2ZZP B; 4A20 A; 2W82 A; 1H8C A; 2AYO B; 1E10 A; 1C4P A; 1BT0 A; 1QOB A; 3TUO A; 1MFW A; 2WXR A; 2A4Z A; 4KVG B; 4LNI A; 4P1B C; 4S0R A; 2CJN A; 2N9L A; 2GRI A; 4JIO U; 3ALB A; 5IO9 A; 1QZE A; 1N5X A; 5CHF A; 1FFU A; 4RF0 A; 3CSF A; 3RUI B; 5BMI A; 1H4R A; 3UF8 A; 5L95 C; 2M1M A; 2WXQ A; 1KOT A; 2WU2 B; 4US9 A; 3QX1 A; 1C4A A; 1WY8 A; 2SEB D; 2LD9 A; 3NZS A; 4CO7 A; 2JVC A; 2HTM E; 1HE8 A; 2XEW A; 2JWU A; 3L0W B; 3W1Y A; 2XBB C; 1IGC A; 2V4I B; 1M94 A; 2PLP A; 2RDG A; 3HUI A; 3ZJU A; 1FRD A; 3PLV A; 3AU4 A; 1FMA D; 2AQ2 B; 5EE1 A; 2PVG C; 2E6X A; 1UBI A; 2PKO A; 1WJ4 A; 3JSV B; 3BK2 A; 3MC0 B; 2J52 A; 3ZIM A; 3WA0 A; 1MHH E; 1QOA A; 2DZJ A; 2IGG A; 2KLG A; 3AE4 B; 3GE8 C; 2LVQ A; 4TQ1 A; 3ZNI D; 5G5H A; 3AE3 B; 4LNO A; 1UWM A; 4BFR A; 5D3I B; 3EGR A; 4HJK A; 3R7R A; 2KO3 A; 5J18 A; 4IKG A; 4J6I A; 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5G55 A; 5HFY A; 3BIN A; 3C0R B; 2INN E; 1WYG A; 2KYW A; 4FAD A; 4M01 A; 2EKI A; 1U4A A; 3AEA B; 3AEE B; 2BKF A; 1L7Y A; 2MBH A; 2AL3 A; 2KTR B; 2JSV X; 2N1W A; 3UQA A; 5JH5 C; 4DK5 A; 1V80 A; 2SAK A; 2LVO A; 1FNU A; 2KQ4 X; 1VZ7 A; 3C8Y A; 2LXA A; 2X8X X; 3N3K B; 1EU3 A; 2WU5 B; 3MJW A; 1RFK A; 2FCS A; 3KQ4 A; 1V49 A; 1FM0 D; 2KDF B; 3VH3 B; 3FKY A; 2AQ3 B; 4GMV A; 1WE7 A; 3DWM A; 4A90 A; 1IPG A; 3C19 A; 1WGY A; 2YLM A; 3TEX A; 2MX2 A; 2CU3 A; 1C4C A; 4N9F 4; 1T3Q A; 1N61 A; 4OW0 A; 1Q1O A; 1F0Z A; 3W1S C; 2K0P A; 1YJJ A; 3N20 C; 3QAR A; 4W9L A; 1WJ6 A; 2HE7 A; 1JWA D; 1D4B A; 1QIL A; 4FA6 A; 2MHJ A; 2J0K A; 2KMC A; 1ZUD 2; 2INC C; 4R3D A; 4B6W A; 4F1S A; 2ZW0 A; 2IND C; 2BS3 B; 3ZVV A; 3GS2 A; 2WS3 B; 5FK9 C; 3ABV B; 2JY6 A; 1K53 A; 4FJZ A; 3W9C B; 2K22 A; 4PYU A; 1SEB D; 1WGR A; 1FIQ A; 4RGM A; 3VR8 B; 2KDM A; 1P1A A; 1TKE A; 2TSS A; 2DX5 B; 3DVN U; 3PTF C; 3T9L A; 1TZ1 A; 4HPM B; 4ZRI A; 3VVW B; 4GU2 A; 2JF5 A; 2KAJ A; 3AE2 B; 2W54 A; 5IOI A; 4A3O A; 1JWB D; 1T5X D; 1XXG A; 2WLB A; 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