2LKUA

Solution structure of reduced poplar apo grxs14
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
MALTPALKTTLDKVVTSHKVVLFMKGTKDFPQCGFSQTVVQILKSLNAPFESVNILENELLRQGLKEYSSWPTFPQLYIDGEFFGGCDITVEAYKSGELQEQVEKAMCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Populus trichocarpa
publication title Solution structure of reduced poplar apo GrxS14
rcsb
molecule keywords GrxS14
total genus 32
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lkuA01
3QFBC 3Q74A 4IVFA 2OBKA 2EIRA 2GT5A 4ZXGA 2HZFA 2HYXA 5LD0A 4TR3A 3VPQA 4Q5FA 1DBYA 1GTIA 1B4PA 4ZIJA 1RW1A 1BX9A 4GSTA 3PH9A 5ECIB 3LYPA 3UAPA 2FWFA 1TRUA 4RQRA 3O3TA 4F2IA 1ST9A 4L8EA 4IKHA 5LNKe 2H30A 3QCPA 3TJGA 1B9XC 4TN8A 1J08A 2P5RA 5KEJA 3MWHA 2KHPA 1XXUA 2GVPA 4CW9A 1TK5B 2AV4A 2C80A 1XW9A 2X99A 1Z5YE 3CXGA 3IE3A 2H66A 2FA4A 5CRWA 1XIYA 2CX3A 2H73A 3D21A 3RPPA 4DSSA 2LNSA 1PKWA 2M46A 2HSHA 4MLYA 3HZ8A 4G9HA 5ECPB 1T4YA 3HJMA 4TXVA 4I5QA 4J56E 3C71A 2XPDA 3D6IA 2O89A 3KM6A 2FWGA 3C8EA 1T8EB 1R5AA 3H4KA 2VCWA 2B1LA 2L4QA 1VF1A 3P8WA 2JSZA 2K8VA 5ECHB 3GMFA 2LJKA 1YJ6A 3IRAA 4EL1A 4KE3A 5GSTA 1X5CA 3P90A 1N2AA 1PGTA 3CSIA 1CQHA 3R2QA 1EOGA 4I2TA 4X0XA 1TOFA 2I4AA 3I9V2 4JR4A 2WS2A 2L6CA 4MCUA 4V2MA 4NAXA 3H93A 3IHQA 2CZ2A 3FR3A 5ELAA 1XW5A 3F3RA 3IBHA 1F3BA 4L5LA 4EE0A 2GSTA 4WF4A 5G5EA 1A2MA 1Q4JA 3FR6A 4RI6A 4D73A 3TKPA 1JZWA 3M1GA 1OC9A 2FWEA 3W6GA 1GLPA 5A5KA 4KSOA 3F63A 3FR9A 1ML6A 5DAKB 1QUWA 4FYUA 3F4SA 4XCSA 4O5RA 3FZ4A 2XBIA 3G9BA 1TRSA 2VCQA 1AW9A 1DE1A 2QGVA 2R3XA 3TCOA 1B8XA 3GL5A 3ZITA 1K3YA 1XVWA 5IM9A 1WRYA 2GT6A 1G6WA 3A3TA 4QL7A 5G1KA 1EV9A 2HZEB 4MF5A 2B5EA 1USBA 2KLXA 4I6XA 1VF3A 4F0BA 2R5GA 4QQ7A 4NV5A 3TJJA 1A8YA 5JCUA 1TKDB 3ZTLA 2CZ3A 2H19A 2ALBA 2YP6A 3ED3A 4AJ7A 2G2QA 2EC4A 1O6JA 1B9YC 1SKWB 4BA7A 3ZL5A 3LG6A 4YAPA 1B48A 2PBJA 3QMXA 2I1UA 1SK0A 2BTOT 1XWKA 3BCIA 2JZRA 4PURA 5ECLB 2VCZA 3GKMA 3WGEA 3PR8A 4MJEA 3FYGA 3BJ5A 3IAM2 3D4TA 4GLTA 4EUYA 1YF0A 1SL0B 1HNCA 2F8FA 1J0FA 3ERGA 4KW6A 1AQVA 3VWXA 1NHYA 4FIWA 4OCFA 3GURA 4BVYA 2FY6A 2IFQA 2C3TA 1KNGA 2HSYA 5AIXA 3F6FA 1X0RA 2K9FA 3HYPA 1M99A 4Q5NA 4I97A 2MMZA 4EF0A 3KTLA 3ZMLA 1FO5A 4MA9A 3ZREA 3GV1A 1WP0A 1GUMA 1JLWA 4HEA2 2FCHA 2GLRA 2FNOA 4CHSA 1URMA 1YEPA 1FVKA 2FA8A 1ZYQB 5J9BA 3GX8A 2ZCTA 2MBSA 4KSMA 1J9BA 2QSIA 2NDOA 3TUEA 1MDIA 4LL1B 5JWQB 3FHKA 5ID2A 1T7PB 3GHAA 4L0WA 3FKFA 5J9CA 2YV9A 2YZHA 4ZL7A 4MJAA 1GWCA 1VGLA 5CYYA 2F9SA 3GYKA 1BAYA 4GRFA 5DALB 4ZILA 3UBKA 4Q5RA 2GZPA 2M80A 1QMVA 4IQAA 4TR4A 4WEYA 1ZZYA 3BBYA 1WIKA 1GUKA 5ECMB 3TGZA 3CRTA 1SYXA 4ISDA 1JZDA 2IMKA 1V40A 2VD0A 5HFGA 5ECOB 1EP8A 3HZ4A 3Q19A 2GQMA 5COHA 2FHEA 2B3SA 4IS0A 3D4MA 4KCAA 4MPGA 2H71A 1N8JA 3HHVA 2JACA 3CBUA 20GSA 2PMTA 4L0UA 1LU4A 4PUFC 1V58A 2VL3A 4PUAA 2D2ZA 4KX4A 1WPIA 2ON7A 3GN3A 4TRXA 5B6NA 4AJ8A 1Z3EA 1T1VA 1GH2A 4IP1A 2E0QA 5C04A 2DBCA 3FZ9A 2OA7A 1FW1A 1GNEA 1ERUA 5G30A 3UJ1A 1TI1A 4XS4B 1A24A 1GRXA 1IYHA 3NIVA 3L9VA 4TKYA 4HU9A 2IMEA 2C3QA 3M8NA 1TP9A 1HYUA 3ZIVA 2BMXA 4WR5A 6GSYA 1EZKA 1PD21 4K0GA 3RAZA 3WYWA 2YWOA 1Z6MA 3MSZA 3GNJA 1W4VA 5JCGA 5J3RA 4NPBA 3CYNA 4GSSA 2KUCA 2DC5A 2GTUA 5D9WA 2PU9C 1H75A 2PN8A 2L4CA 4PQHA 3UL3A 3US3A 2OE0A 4TOPA 5G2ZA 5GAPD 2LRNA 4HS1A 4XHMA 1QGVA 2E2MA 1KEBA 4PXOA 5F06A 2X8GA 1A2LA 2G0FA 2GS3A 1TK8B 2FWHA 2XHFA 6GSSA 4WBRD 2JADA 2ZNMA 1V9WA 4YQUA 4FYCA 2RUFA 3A2VA 4MF7A 1ABAA 4BVXA 1VF2A 4KDYA 5D73A 3KZQA 2PWJA 2H0HA 2PPTA 3VWVA 4ECIA 2JZSA 17GSA 2A2SA 1OAZA 3IA1A 2VIMA 1XW6A 1YKCA 3DD3A 1GP1A 3DVXA 1DE2A 1OE8A 2HE3A 5JCWA 1ILOA 3GSTA 3LJRA 1X5EA 3PGTA 2YV7A 1GSEA 1AAZA 3ZYWA 1F3AA 3EE2A 1CQGA 4ULXA 3EVIA 3TKSE 3GTUB 5C00A 2VD1A 2F51A 4AGSA 2R6KA 1O73A 3DXBA 3GX0A 1WMJA 5A4VA 3F9UA 2OBIA 2GZZA 5DJLA 3HD5A 3IXRA 5HFIA 1TW9A 3L0HA 1EGOA 3DGQA 2PUKC 4FYBA 5D9XA 4BL7A 1GTUA 3E0UA 3VWWA 4EVMA 2WDUA 5DJMA 3RHCA 1SK2A 1SYRA 1KBNA 2P31A 4OD7A 5JWRB 1GSDA 2EIQA 5CRHA 4YH2A 2C4JA 2IPAA 4G10A 3RPNA 1WE0A 3IK9A 4BWQA 3EU4A 3GSSA 1LBKA 4KDXA 6GSXA 3IAS2 4EDYA 3F4TA 2GSQA 2HXKA 3N5OA 2AJQB 3M0FA 4PNGA 11GSA 1K0MA 4JU5A 1BEDA 3H8QA 3ZFLA 4FO5A 2YJHA 1G0TA 2E2GA 4KCEA 4JRRA 2GSRA 1PL1A 1R7HA 2C1YA 3DMLA 5D93A 4I2UA 4EKZA 3ZFBA 1MD4A 2IMDA 1YF1A 2VCVA 2OJLA 4N30A 1THOA 1O8XA 1K3OA 3L9UA 1GSUA 1XWCA 2H6YA 2H75A 1PX6A 1Q98A 2B6MA 4F9ZA 2NBSA 3DIEA 3QD9A 2L57A 1AIUA 4V2LA 1PQNA 2K6VA 1U87A 2C0EA 4LA1A 3KMNA 2CVDA 4KA0A 2DLXA 3IC4A 2RUEA 2XPEA 3W8JA 4BPYA 4ZB6A 2H1GA 2RIIA 3DVWA 4AF2A 4G19A 1DUGA 2MZCA 4KNDA 1SKSB 2F3MA 3I69A 3UOMA 2HRFA 1FB0A 3C73A 1YKAA 3IR4A 3TDGA 1K0OA 1PRXA 4YQMA 2ES7A 4LMWA 4XS1A 4MZBA 5DAKA 1HD2A 2AUVA 4IP6A 4TXOB 3GA4A 2IWTA 3QPMA 2QC7A 2K18A 1TJDA 1C72A 4N11A 1X9WB 2B7JA 2C8UA 4HQZA 1V57A 2I9HA 4JE1A 1BJXA 1I9DA 5IOXA 4IW9A 1M9BA 4XRDA 2NVLA 2HT9A 2HZEA 2J23A 5ECQB 4POLA 5A4WA 5ENUA 4J2FA 3DRNA 4POBA 4GQCA 1XBSA 2KP1A 3PINA 3VPTA 3HCZA 5AGYA 2JL4A 3HJPA 1F37A 1W89A 1OKTA 1QXHA 1UA5A 3TKSA 4X1UA 4XRAA 5DVBA 3KJYA 3D0ZA 1FG4A 3FW2A 3HVSA 3LSZA 5B8AA 3LXTA 2B5XA 2PVQA 2FLSA 1E2YA 4EDZA 2V2GA 1NSWA 5ELGA 2OE1A 5DBQA 5IQYA 1XZOA 4GCIA 2C3NA 3CRUA 1TU8A 1F9MA 4BWSA 4OMVA 3M9KA 1OE7A 2LEGA 3J7Yk 2REMA 3E9JB 1MTCA 4HI7A 5F05A 3TKSC 5IPGA 3U5RE 1A0FA 3V1WA 1XWAA 4HZ2A 2AB6A 3CTFA 2IL3A 14GSA 2O8VB 5J41A 3EMPA 4GWRA 2BJXA 3RDWA 4AJ6A 5H5RA 4HZ4A 4ML6A 4MABA 3VURA 4WF5A 1O81A 2IMIA 2QKEA 4MH2A 2O87A 2KP2A 1TRVA 2LTKA 4EC0A 3D5JA 3A5WA 3P7XA 1ZMAA 5D9TA 9GSSA 1MD3A 3G7YA 1OYJA 3DYRA 5IMDA 1K0BA 4TR1B 1XPVA 3UIWA 2TIRA 2DMLA 2CQ9A 2H8LA 5DALA 1DSBA 4JZQA 3APQA 4E8HA 1X9MB 1G6YA 3KCMA 4MJBA 5KN2A 2H6ZA 5HR0A 1ERTA 5KN3A 3KP9A 2E7PA 1IYIA 2VL2A 3NOFA 1GUHA 3D22A 5A4UA 3GIXA 3KH7A 2V32A 4HDEA 5ABRA 2MMNA 1K0DA 12GSA 2HLSA 4OWYA 3UVHA 2DJ2A 4RQXA 1T00A 4RUVA 2L5OA 4K0NA 8GSSA 1QK8A 2H72A 4ZBBA 2V1MA 5INYA 3APOA 3A2XA 1A2JA 5AIVA 1XOBA 1NM3A 2VL2C 3TRXA 2DJ3A 3GH9A 1T4ZA 4GSNA 3HKRA 1XVQA 3KIJA 5CREA 3ZIJA 2IMFA 1SL2B 5F8BA 5F07A 3ME8A 1SU9A 2H1BA 4ECJA 1K0CA 1QFNA 5ECKB 1ERVA 3WD6A 3TB2A 4MJCA 1ZYEA 4XS4A 6GSTA 2VM2A 2J9HA 2V6KA 3EURA 4ILFA 5FT3A 4IHUA 4KDUA 1O8WA 1R5PA 2O7KA 1A0RP 2IJYA 3TKQA 2DJJA 2VO4A 3GUSA 3O76A 5GSSA 4MMMA 4MF6A 2CVBA 4PQIA 5B8BA 1O85A 1G7EA 5JWOB 3FK8A 4TR0A 2YWIA 2H76A 5E59A 4H86A 1JLVA 4XTSA 2YZUA 4IQ1A 5HR3A 1YQ1A 4V1Ag 2LKUA 2JSYA 2Z9SA 2CA8A 1WJKA 22GSA 1VF4A 4NMUA 4IJIA 2NPBA 4NWYA 1MDKA 2X64A 3C1RA 1LJRA 5IMFA 1Z7PA 3HA9A 1MEKA 3KH9A 4V2NA 3F6DA 3WGXA 1SJIA 2I3YA 2X8HA 4HOJA 5CO3A 2V41A 4IN0A 4JR6A 6GSWA 4N0ZA 1I5GA 5KN1A 1Y25A 4O32A 1SD8A 4OCEA 4EO3A 3EYTA 2DJ0A 3L4NA 3QR6A 3QFAC 3LORA 3HVVA 4PGTA 3FZAA 2YN1A 2VL9A 2MMOA 5DCGA 4GQFA 1SENA 7GSSA 1EEJA 4WETA 2DIYA 2WCIA 1G7OA 4Q5QA 3EC3A 2DJKA 16GSA 1V98A 4EXJA 3EMXA 4IELA 4K2DA 4K9ZA 3GFKA 3M3MA 2PERA 4X43A 3LGCA 1XWBA 2GSSA 1F2EA 3ZZXA 4PQ1A 4FH8A 4DSQA 4MP4A 3C7MA 5J4UA 2VLVA 3VI5A 3GTUA 1GULA 3KEBA 4ID0A 3ERFA 1BG5A 3P2AA 4N0VA 5IMZA 1HNBA 1FVJA 1U3IA 1S3DA 1PMTA 2YPMA 5DCHA 2GDRA 2GQLA 2HNLA 2DIZA 1GL8A 4MZCA 3H79A 5DDLA 4NHZA 2VCTA 2GQKA 1K0AA 3TRPA 3RBTA 5CP1A 2R2JA 1Y6EA 5ECNB 1HNAA 3FEUA 4KUNA 1OVNA 3Q18A 2OE3A 1R26A 1GTBA 4K7IA 3MAKA 1A8LA 2H74A 5KN0A 1Z9HA 4TVEA 3CSJA 4KGIA 3ZRDA 1Z6NA 4ACSA 2PGTA 5EVOA 2ON5A 2HFDA 3KTBA 2H01A 1HQOA 4K7NA 2WJUA 1KTEA 4OFMA 3VWUA 2M72A 3WT1A 4NHWA 6GSVA 2LQQA 3SBCA 5IIZA 2TRXA 1GTAA 3GH6A 4DSSB 3EU3A 1R4WA 2AYTA 1QQ2A 4IGJA 3ISOA 4QL9A 4DEJA 13GSA 1E6BA 2JZTA 3GKKA 3ERWA 2FGXA 4HJMA 1EWXA 3APSA 5EY6A 2VCXA 2WGRA 1EOHA 2B5YA 3IK7A 1TI3A 3F3QA 1F6MC 5CNWA 5GZZB 1TRWA 1EV4A 4HJ2A 1M0UA 2VM1A 1BQ7A 2WRTA 2GZYA 1TK0B 1X5DA 5G31A 3KGKA 1OC8A 5AISA 2MBTA 1PL2A 2MYGA 4XIHA 1GSQA 1YDKA 3A2WA 5IMVA 5G1LA 3TOTA 5CRDA 3LXZA 5IO0A 1GNWA 2VLUA 2VAFA 3TJBA 1UC7A 5IPHA 3ME7A 3UEMA 5IMAA 1RQMA 4D73B 1OC9B 2YCDA 3HXSA 4IJ3A 3U6VA 5HR2A 4ECBA 2NTOA 2VOCA 1GLQA 4P3YB 1XOAA 4KH7A 4ZBAA 2LS5A 4TXOA 2C0DA 4L5OA 4O7HA 1S3CA 4I8BA 2OADA 1AUCA 5J5NA 4OFTA 1U6TA 1V2AA 4G2EA 3EWLA 3IOSA 5FWGA 1S3AA 2YANA 2CAIA 4K1FA 3TJKA 3KP8A 5IMCA 2LUSA 1SD9A 1NHOA 4YAVA 5LCZA 4ZL8A 4K8MA 2LJAA 2MMAA 1THXA 4JBBA 4Z7XA 2IN3A 3TOUA 1PKZA 10GSA 5IOWA 4V1Ap 4N10A 3GL3A 4ZB9A 1AQXA 3N9JA 3HJOA 1ON4A 2WZ9A 4CDOA 2H0IA 3G7JA 2HRNA 4HQSA 5CRGA 3HDCA 3F4RA 4O92A 4GF0A 5D96A 3CTGA 3K8NA 4F82A 2F8AA 1NW2A 2DJ1A 2TRCP 3J7Yb 3I6AA 1B4QA 4KB3A 1M2AA 5D9VA 2VUPA 2VLTA 3UBLA 2P5QA 1M2DA 3QAVA 2AHEA 3IDVA 4K6XA 1K0NA 1RK4A 3KXOA 4PX1A 3L78A 1UN2A 3H1NA 2IFQB 5CAXA 5DQSA 1JHBA 1YEXA 1FHEA 2L59A 2AAWA 2H0GA 2ZUPA 3LYKA 3UMAA 3LEFA 1M2BA 2CT6A 2LV3A 3QAWA 2K8SA 1ACVA 5AN1A 2CAQA 2CX4A 2N5FA 3CMIA 2R37A 1YZXA 5GAND 4DVCA 5ID2B 4TW5A 3GKNA 5L71A 4F03A 2B7KA 4XS6A 1PSQA 4MH3A 2RM6A 4TR1A 2YOIA 3S9FA 2LRTA 1YY7A 3E3EA 4WKWA 3MDKA 4IBPA 4NXIA 1GSYA 1Z7RA 4ZBDA 3ZVJA 1EEMA 2WB9A 1AXDA 2V6OA 3LWAA 2LJRA 1O7UA 19GSA 1WWJA 4GTUA 3OR5A 3SWLA 1XCCA 1M7TA 3HVXA 2GGTA 4YQVA 4F0CA 3MNGA 2N5AA 1OKDA 3DKSA 1SK1A 3UVTA 3KMOA 1SL1B 3AY8A 3L9SA 2RM5A 3QDNA 5IO2A 2O85A 3ZMKA 2H1DA 5EL8A 1WOUA 2OKAA 4LLRA 3QOUA 1FB6A 2XC2A 4ZL9A 1JFUA 3VI7A 1ZOFA 2OACA 4RI7A 4GXZA 3W8SA 2WULA 4POKA 1A23A 2JU5A 3TRQA 3F0IA 3ZVJD 2IIYA 4MK3A 3BD2A 3EINA 5EPFA 3WT2A 3G7IA 1H4OA 1UVZA 3I43A 4ZB8A 3TJFA 3DWVA 5B6MA 3O6TA 2C0GA 2XBQA 1JZRA 1TU7A 3IPZA 1BYEA 2CVKA 3UARA 18GSA 1K3LA 5E4WA 2EIOA 1PX7A 1ERWA 2R4VA 2DMMA 2H70A 5D8IA 1TDIA 5HQPA 3GRXA 4WBJA 4MDCA 2CV4A 2H6XA 2YWNA 5DQYA 3WGDA 4MPFA 1JZOA 3VLNA 1X9SB 1T3BA 2N5BA 1EGRA 1MDJA 2A4VA 5B7CA 3FZ5A 1EP7A 4JEDA 3HY2A 4E8EA 1SJ6A 2L6DA 3BOAA 1GSFA 4LL4B 3LFLA 2L5LA 5ECRB 2X8CA 3NZNA 1XWGA 1TXXA 2A2RA 4OFNA 4PNFA 4ECCA 4J57E 1TTZA 4LMVA 4OO5A 5H5SA 3M9JA 2LNTA 4WXTA 1PA3A 3ZLPA 1SKRB 1OC3A 4NV2A 3GKXA 3VFIA 2I81A 2DSAA 2WFCA 2FUG2 1AQWA 4OO4A 3CSHA 1SJZA 4MZWA 4POMA 3F8UA 3Q6OA 3C1SA 1FOVA 4DSRA 2HI7A 1XFLA 1AC1A 2LQOA 1ZCPA 1GSSA 1U3AA 1ZL9A 4HU7A 2LSTA 3VK9A 6GSUA 1PN9A 5F0GA 3BCKA 2YJ7A 3FY7A 2LRCA 1ZGNA 3IV4A 4ML1A 2P0GA 1U88A 1FAAA 3TKRA 2PVOC 2H1AA 5HR1A 2FD3A 3RHBA 2YNXA 1VRSD 3DEXA 2KOKA 4HUAA 2YWMA 2C0FA 3KD0A 3QAGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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