2LKUA

Solution structure of reduced poplar apo grxs14
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
b'MALTPALKTTLDKVVTSHKVVLFMKGTKDFPQCGFSQTVVQILKSLNAPFESVNILENELLRQGLKEYSSWPTFPQLYIDGEFFGGCDITVEAYKSGELQEQVEKAMCS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of reduced poplar apo GrxS14
rcsb
molecule keywords GrxS14
source organism Populus trichocarpa
molecule tags Electron transport
total genus 32
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lkuA01
4MF6A 1GSDA 1EP7A 1EV9A 2BTOT 3TJBA 1WE0A 1PX6A 4EKZA 3A3TA 3VWUA 5DAKB 2TRXA 5JCGA 5F8BA 2MMAA 1B48A 3IAM2 4MJEA 1GP1A 3L4NA 2K6VA 1XOBA 5GAND 1YKAA 1K0MA 4EUYA 2H75A 2FUG2 5AGYA 3VURA 1CQHA 2LRCA 2I1UA 1PN9A 4MJAA 4OFNA 5J4UA 5A4VA 2YWOA 3MWHA 2YV9A 22GSA 1F3AA 5JWQB 3D0ZA 1BG5A 6GSVA 3D22A 4MZBA 2VLUA 4LLRA 2HNLA 2H1GA 1TXXA 5ECOB 3HDCA 3HHVA 3UIWA 2DSAA 2K8VA 3GSTA 3RDWA 2CZ3A 1Y25A 3I43A 5CRHA 3EMPA 3ME8A 2IWTA 1B9YC 3ED3A 2GDRA 4NV5A 1UC7A 3QMXA 3ZFBA 2R5GA 4OCFA 4K7OA 5CREA 5HR3A 3RPPA 2OE0A 1HNCA 4TR3A 3M8NA 4AJ7A 3TGZA 6GSWA 1KTEA 2PU9C 4TN8A 2F8FA 2H6ZA 4ZB6A 4RI6A 1M2DA 1TKDB 4BWQA 1XWBA 5D9VA 4MJCA 4GXZA 2VO4A 2PWJA 2HYXA 2VCQA 4H86A 4FH8A 4WXTA 4RI7A 3VI5A 4JR4A 2NTOA 5J9BA 2YPMA 1AIUA 4V2NA 4I97A 4EXJA 2TIRA 2QSIA 4F9ZA 3BBYA 1X9WB 2K8SA 2HLSA 4F82A 4CHSA 4ACSA 3ZTLA 5HR0A 1FAAA 2WGRA 1WPIA 1RK4A 2G0FA 4KB3A 1A8YA 2IMDA 4DSQA 1UVZA 4KE3A 5G1LA 1VF4A 1TRWA 3HVVA 4BVXA 4KDUA 1SKWB 3A2XA 1URMA 3APQA 2GZYA 3SWLA 3G7IA 3WD6A 4TW5A 2IMKA 4K2DA 2PN8A 4PXOA 2REMA 1IYIA 5JCWA 1GSUA 4ID0A 2ZUPA 5AIVA 3KMOA 3TUEA 4ECIA 2YV7A 1OC3A 3UOMA 1SD8A 1B8XA 4NXIA 1YF0A 1U6TA 4O5RA 3VWVA 2R3XA 4PX1A 5A4WA 2FNOA 2GLRA 5D9WA 1FOVA 1MDIA 3NIVA 3ZL5A 4HS1A 1SL2B 5FT3A 2YCDA 4HDEA 3H4KA 5CP1A 4TKYA 2N5FA 3GKNA 3Q19A 2DJKA 3QFBC 1U3AA 3KP8A 2VL2A 1OVNA 3S9FA 2AB6A 4OFTA 2BJXA 1SL0B 1X5DA 1HD2A 1GLPA 4AJ8A 3F6FA 3CTFA 4NWYA 1OC8A 1PMTA 2RUFA 3QDNA 3GHAA 3C73A 3IDVA 4MP4A 3GN3A 1A8LA 2H1AA 3F6DA 3M9JA 3O6TA 6GSSA 5A5KA 3ME7A 3D4TA 4D73B 1PA3A 3GL3A 2J23A 3ZREA 9GSSA 1B4QA 2GGTA 18GSA 1OC9A 3P90A 3C71A 2LS5A 4K0NA 3WGXA 4N30A 3DD3A 1PL2A 3IAS2 1ST9A 5ECRB 2KUCA 2PMTA 2F51A 2X64A 5LD0A 19GSA 3TKSE 2H0GA 3DEXA 2O89A 1JHBA 3VLNA 3HYPA 4YH2A 5IMVA 1PD21 2LQOA 3HD5A 1EV4A 3DXBA 2CVDA 3APSA 4J57E 3HZ4A 1DE2A 1F2EA 1G6WA 1T4ZA 2H0IA 3PGTA 2DC5A 5AIXA 3J7Yb 5F0GA 2LNTA 3LSZA 2B5XA 5IMCA 1N2AA 5B6NA 1T7PB 1DE1A 14GSA 2B7JA 4PQHA 3DRNA 4TVEA 4ILFA 3GX0A 2OA7A 3GNJA 4XS4B 4GLTA 3DGQA 4XHMA 1WIKA 5EVOA 5LNKe 5F06A 5G31A 4Q5FA 4LL4B 3QD9A 3J7Yk 1YEPA 1AW9A 2EIQA 4XS1A 1PSQA 3UL3A 2PVQA 2CV4A 4TOPA 3TKRA 2GT6A 3A2VA 5DQYA 4HEA2 4PQ1A 1XW5A 1U3IA 5EL8A 2GQMA 3HJOA 1O8XA 2C0FA 3CYNA 4GTUA 1E2YA 2JU5A 2CQ9A 1AQXA 3WT1A 4WR5A 3C7MA 4ZILA 2R2JA 4YAPA 1XCCA 1SJIA 4KDYA 1EEMA 2H6XA 1R7HA 2DJJA 2GVPA 2D2ZA 5ECQB 2YZUA 1BQ7A 2OACA 4ECBA 2ZCTA 4KX4A 2V2GA 1GTBA 2CZ2A 1TRSA 2ZNMA 3GSSA 4EL1A 5B8AA 3CTGA 1GRXA 5CRWA 1Z7RA 1ERWA 1O85A 3ERWA 1B9XC 3K8NA 2MMNA 3KD0A 4CW9A 3U6VA 2C1YA 3KEBA 2KP2A 3W8SA 1HQOA 1EEJA 3TOUA 3FHKA 3F4TA 1TU8A 4YQVA 3US3A 1FVJA 1G0TA 3GX8A 1OKTA 2I4AA 3L9SA 2VUPA 1Z7PA 4YQMA 1EZKA 4KAEA 5JCUA 3UJ1A 5F05A 3F8UA 1SYXA 5D73A 3UBLA 13GSA 3TCOA 4GSSA 1A24A 4ML1A 1ZOFA 2MBTA 2VCZA 4WETA 2P0GA 3DIEA 2WFCA 4ZL7A 1XOAA 3CSIA 4GSTA 2ALBA 3LJRA 2LTKA 1GUKA 2KOKA 3P7XA 4OMVA 4V2MA 2I81A 1K0AA 2FLSA 3FR9A 2IMFA 2H66A 2YNXA 4LMWA 1M0UA 4ISDA 1Q4JA 5IO2A 1ERVA 5E4WA 4K0GA 3GA4A 4J2FA 2H0HA 2GSQA 2FA8A 1MD3A 1X0RA 2FWEA 2C80A 4WBJA 3TOTA 2J9HA 3RHCA 1GNEA 1SK0A 3AY8A 2HT9A 4QL9A 3IPZA 4L0WA 1A23A 5IMFA 1KEBA 5D9TA 5JWOB 2V1MA 3IXRA 5H5RA 1O81A 4E8EA 4XS6A 2B1LA 4O32A 3TDGA 5G5FA 3GH6A 2LKUA 2JZTA 4PNGA 4PURA 5GSTA 4N0VA 2C3NA 1B4PA 1QK8A 3H8QA 3CRTA 4PUAA 4EE0A 5ABRA 3QCPA 1USBA 1ERUA 3NOFA 2GS3A 3ZMLA 1G7OA 4PNFA 2MYGA 4POLA 2QC7A 1QUWA 4DSSA 4I6XA 3TKSC 1F3BA 2L6DA 11GSA 4I2UA 2N5BA 4MDCA 3EE2A 4KUNA 4HJMA 3OR5A 5G2ZA 2IPAA 3M3MA 2MMOA 1O8WA 5CRDA 4RQXA 1XWCA 2H8LA 2M46A 6GSTA 3L9UA 1JZDA 2A2RA 2XBIA 1I5GA 3VI7A 3LXTA 4KDXA 3P2AA 4K6XA 1ABAA 3NZNA 3IC4A 4MH2A 5G30A 5DCGA 1PKWA 2FY6A 3GRXA 4MMMA 4J56E 2V41A 1K0CA 1ML6A 2HE3A 1QMVA 4KW6A 2DJ1A 4OWYA 4N10A 3ZVJA 2L4QA 3IE3A 4KGIA 2V32A 3FKFA 4GSNA 5DDLA 2JZRA 1OAZA 1WRYA 2LQQA 4BA7A 1NW2A 4MCUA 4K7NA 2OE1A 2IMIA 2NVLA 1ZGNA 2HSHA 3PINA 5HFIA 2DIZA 4OO5A 1FO5A 1ILOA 3EWLA 5D93A 4BWSA 4JRRA 1T00A 1XW6A 3ZLPA 1Q98A 1EOGA 1GSQA 1SKSB 3G9BA 5H5SA 4IQ1A 3KMNA 5F07A 3ZIVA 4WKWA 3D5JA 2HI7A 3GFKA 3H79A 4I8BA 1DSBA 3FYGA 1HNAA 3ERGA 4Q5NA 1PX7A 1CQGA 2RM5A 3TRXA 4QL7A 3G7JA 2PGTA 1ERTA 2K18A 3F0IA 4JE1A 5ELGA 4E8HA 2E7PA 4O92A 1XBSA 1O6JA 3P8WA 4KSMA 1H75A 1SU9A 2VL3A 3F9UA 1GWCA 3Q6OA 5IOWA 2OBKA 4MPFA 2C0EA 5DQSA 3VWXA 5CAXA 3FRCA 4GRFA 2OE3A 4LMVA 4L5OA 5J41A 3FZ5A 2O87A 4NPBA 2E0QA 7GSSA 2ON7A 5J3RA 2EC4A 2XC2A 2AYTA 1XIYA 3JCML 2O85A 4XRDA 1H4OA 2H19A 3D4MA 4JR6A 4GQCA 1MD4A 5B8BA 2X8HA 2FWGA 3RHBA 2P5QA 3HVSA 1EP8A 1ZYEA 3KJYA 2NDOA 1K0NA 2AV4A 3LYKA 3C1SA 5IQYA 2C8UA 4IS0A 3BOAA 2RLIA 3F3RA 1BYEA 3M9KA 5DCHA 4JEDA 5ID2A 3W6GA 3ERFA 2I3YA 1AUCA 3R2QA 2VCXA 3E9JB 3BJ5A 4MH3A 1ZCPA 2DBCA 2OBIA 3GKMA 1DBYA 4TXVA 3VPQA 2HSYA 4IW9A 3LEFA 4XTSA 2VLVA 2YJHA 3E3EA 4IKHA 4BVYA 3FW2A 2CVBA 2H70A 3CMIA 4TR0A 1OC9B 1WOUA 3KH9A 1F37A 2HFDA 1V57A 4MZCA 4F03A 5KN1A 5FHIA 1K3OA 2GSTA 2LV3A 3GYKA 3WT2A 16GSA 4JZQA 2F8AA 1V40A 4KNDA 1VRSD 3F3QA 4K1FA 4O7HA 2IMEA 2AUVA 4EVMA 1GULA 2X99A 2H1BA 1IYHA 3HJPA 1ZMAA 3VFIA 3UVTA 1TW9A 4G2EA 1Z6MA 3FEUA 1WJKA 3GTUA 5DALA 1O73A 2VL2C 4WBRD 3VPTA 3N9JA 4MK3A 2FGXA 1K3LA 1U88A 1EWXA 4ECJA 2LUSA 1V2AA 3W8JA 3L9VA 4HOJA 3FZAA 4MJBA 2YJ7A 5HR2A 1M2AA 6GSYA 3ZRDA 3DVWA 3FR6A 2C4JA 3FY7A 2WDUA 3QOUA 1TRVA 4HQSA 2FWHA 2O7KA 3EINA 1TK8B 4WF5A 1M9BA 3I69A 2VD1A 1Z9HA 3V1WA 5G5EA 3A5WA 3RPNA 2FHEA 1XVWA 3GMFA 1DUGA 3QFAC 4PUFC 4V1Ap 2GSSA 1EGRA 3BD2A 3LWAA 4JBBA 2VCVA 5GAPD 2WCIA 3GKKA 5J5NA 2L57A 2GT5A 4YQUA 2IJYA 3L0HA 3VK9A 2L5LA 1W89A 4OFMA 1R4WA 3GURA 4HI7A 1LJRA 1SK1A 3U5RE 4EO3A 1NSWA 4I5QA 4IQAA 1PRXA 2BMXA 3MDKA 4G19A 1TI3A 3LYPA 3LG6A 1SKRB 4MLYA 2QGVA 1XXUA 5AISA 1SYRA 3GUSA 2K9FA 4V2LA 3E0UA 2E2MA 4ZBDA 1A2JA 3IK9A 2HXKA 4KA0A 4TR4A 5DVBA 2VCWA 2OADA 5G1KA 2VIMA 1MEKA 2RIIA 4EF0A 4L5LA 2X8CA 3KCMA 5FWGA 1GH2A 5ECMB 1F9MA 5D9XA 5IPGA 5EY6A 4ZL8A 4DSRA 2FWFA 1GLQA 1X9SB 4ZBAA 5IM9A 3I6AA 1JLWA 1A0FA 2LNSA 1J08A 4F0CA 4ZIJA 3EURA 3QPMA 4HZ2A 4ZB9A 4GCIA 1TJDA 3BCIA 1XWAA 5C04A 4TXOB 3C8EA 5IMDA 2VD0A 2H76A 2EIRA 1OE8A 1TK0B 2DMLA 2IFQB 2YWIA 1UN2A 1Z5YE 1YF1A 5JWRB 2H73A 2VL9A 2FD3A 3D6IA 1VF1A 2KLXA 2LJAA 2RM6A 2M72A 3O3TA 1ACVA 4FO5A 4TXOA 1VF3A 1GSYA 4POKA 4PQIA 4OD7A 2IFQA 4RUVA 4F2IA 5D8IA 3WGDA 2CT6A 4OCEA 4P3YB 3PH9A 5IMAA 1U87A 2VM1A 5HQPA 1GNWA 3TJFA 4ZXGA 5B7CA 2PERA 1GUMA 3IOSA 1EOHA 4DSSB 3HZ8A 1FG4A 1X5CA 3GH9A 1R5AA 2C0DA 1JZOA 1A0RP 1M99A 3H1NA 1JZRA 5KN2A 1TTZA 1ON4A 5J9CA 2AAWA 4EDZA 3M0FA 1AC1A 4KCEA 1X5EA 2GQLA 2R37A 2B1KA 1LBKA 3MAKA 4IP1A 1C72A 2YP6A 5AN1A 4POMA 3F4SA 1YY7A 4X1UA 1HNBA 3KXOA 1QXHA 3CXGA 2NBSA 1J9BA 3UMAA 3KZQA 2A4VA 1SK2A 3GL5A 1RQMA 4TR1B 1GUHA 3M1GA 3APOA 1YKCA 4IELA 5KN3A 4Z7XA 3HVXA 2PBJA 5ECLB 2LRNA 2WS2A 5C00A 1NHYA 2A2SA 4WEYA 4CDOA 2CAQA 3D21A 2CX4A 5DAKA 3VWWA 2C0GA 5B6MA 5IOXA 4MF7A 4TR1A 1T3BA 1FB0A 1FW1A 1K3YA 2B7KA 3HKRA 1VGLA 2QKEA 1VF2A 4MA9A 2CVKA 3IK7A 3BCKA 1OYJA 2EIOA 5GZZB 5IMZA 4EC0A 4N11A 5KN0A 1BJXA 1NM3A 2XPDA 2YN1A 1X9MB 3TJKA 2WB9A 1YZXA 2JSYA 4I2TA 1A2LA 2IIYA 5HFGA 1JFUA 1Y6EA 4DVCA 1R26A 3ZITA 2I9HA 2DMMA 2KHPA 3ZMKA 2P5RA 2L5OA 5D96A 1GTAA 2HZFA 1GL8A 1YEXA 4NV2A 2JSZA 5DJMA 6GSUA 4ZB8A 4NMUA 5INYA 2HRFA 4BPYA 4L0UA 5IIZA 2R4VA 2ES7A 2B5YA 3DVXA 4GWRA 3ZFLA 1JLVA 2MBSA 1AQWA 2HRNA 3FR3A 2VCTA 5E59A 2DIYA 4JU5A 5DJLA 1FVKA 2VLTA 2V6KA 3EC3A 3MSZA 5ELAA 3TJGA 1NHOA 3TRQA 4ZL9A 4G10A 2F9SA 4IVFA 2N5AA 2TRCP 4FIWA 4AF2A 1XZOA 1V9WA 1ZZYA 4F0BA 4HU9A 1AQVA 4MZWA 1V58A 5ECNB 5EPFA 1S3DA 4ZBBA 2C3TA 4MABA 1F6MC 3HJMA 3LQ7A 3ISOA 1M7TA 4FYUA 2WULA 3TKPA 1KBNA 1XPVA 1TOFA 2LJRA 3IV4A 5ID2B 4L8EA 2B6MA 3HY2A 1GTUA 3FK8A 1XWKA 4RQRA 3QAVA 3KP9A 3ZVJD 2B3SA 4NAXA 5A4UA 1XWGA 1M2BA 3DYRA 3HXSA 2VAFA 3RBTA 1W4VA 5HR1A 3RAZA 3UBKA 10GSA 2G2QA 2M80A 1BEDA 1MDKA 2JZSA 4YAVA 4FYCA 1GSEA 3Q18A 1G7EA 3FZ9A 2L6CA 3EMXA 3CRUA 3TKQA 4LA1A 3KGKA 2GTUA 2OKAA 3UVHA 1WMJA 4X43A 2H74A 4OO4A 1FB6A 2C3QA 3KH7A 2H30A 4HUAA 4XIHA 5ECKB 3Q74A 3GTUB 5DALB 1PKZA 1KNGA 2LEGA 1M9AA 4G9HA 2V6OA 4AGSA 5CO3A 2H71A 5ECIB 1EGOA 1MTCA 1R5PA 3HCZA 3WYWA 3H93A 2MZCA 3I9V2 2AHEA 3HA9A 2XHFA 4ML6A 3LORA 2H72A 2WZ9A 2RUEA 1PL1A 3KTBA 1K0BA 1SENA 4GQFA 1TU7A 2O8VB 1XVQA 3TB2A 1A2MA 3LFLA 2YOIA 3KTLA 1WP0A 1UA5A 3LXZA 1YJ6A 1TK5B 2JACA 2L4CA 3QR6A 1K0DA 1YDKA 5DBQA 3EU3A 5CYYA 1BX9A 4D73A 4FYBA 5HFKA 4XRAA 4IGJA 5COHA 8GSSA 2JL4A 4AJ6A 1BAYA 5ECSA 3IA1A 3UEMA 1V98A 2XPEA 1MDJA 1OKDA 1AXDA 4IP6A 3IRAA 2KP1A 2YWNA 3N5OA 1QQ2A 2HZEB 4HZ4A 2H6YA 1TRUA 5KEJA 1RW1A 5LCZA 2PPTA 2NPBA 1GTIA 3F63A 4TRXA 5CRGA 2PVOC 3DMLA 4K9ZA 1AAZA 1N8JA 4V1Ag 4WR4A 3CSJA 1PGTA 3CSHA 4LL1B 2B5EA 3TRPA 2ON5A 3ZIJA 3UARA 3KIJA 1XFLA 3IBHA 3MNGA 1J0FA 3LGCA 4HQZA 2R6KA 2YWMA 3C1RA 3IR4A 2JADA 3L78A 1G6YA 4HU7A 2HZEA 1SD9A 3QAWA 1YQ1A 2YANA 4Q5RA 2GZPA 3TJJA 5L71A 1Z3EA 2GQKA 3F4RA 2DJ2A 2FA4A 1Z6NA 2H01A 1ZYQB 4NHZA 3CBUA 4NHWA 1FHEA 3FZ4A 4WF4A 5ECHB 4XS4A 2FCHA 4MPGA 1WWJA 2PUKC 4KH7A 4POBA 2IL3A 1S3AA 12GSA 1LU4A 2GSRA 2XBQA 4IJIA 3GKXA 5IO0A 17GSA 1GSFA 1XW9A 2CA8A 2P31A 4QQ7A 2CAIA 3QAGA 2H1DA 4MF5A 4N0ZA 1SJZA 4K7IA 3ZYWA 2CX3A 5ENUA 4K8MA 1JZWA 3EU4A 1T1VA 4IBPA 1O7UA 1S3CA 2LJKA 1SL1B 4ULXA 4XCSA 20GSA 5H5QA 4EDYA 1QGVA 2DJ3A 5GSSA 2VM2A 2X8GA 3IHQA 5ECPB 2LSTA 2GZZA 3G7YA 4Q5QA 3WGEA 4KSOA 5CNWA 1HYUA 4DEJA 2AJQB 1PQNA 2OJLA 3ZZXA 4IJ3A 2Z9SA 2VOCA 1T4YA 4ECCA 3DKSA 1QFNA 5IPHA 2YZHA 3EYTA 3DWVA 4HJ2A 3UAPA 2DJ0A 1K0OA 1GSSA 2L59A 3PR8A 3O76A 1TP9A 4IHUA 2WJUA 3TKSA 3GV1A 2LRTA 4KCAA 1THOA 1TDIA 2WRTA 3KM6A 1SJ6A 4IN0A 1OE7A 3GIXA 1T8EB 2F3MA 4BL7A 6GSXA 4X0XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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