2LNSA

Solution structure of agr2 residues 41-175
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
140
structure length
140
Chain Sequence
IDPFTPQTLSRGWGDQLIWTQTYEEALYKSKTSNKPLMIIHHLDECPHSQALKKVFAENKEIQKLAEQFVLLNLVYETTDKHLSPDGQYVPRIMFVDPSLTVRADITGRYSNRLYAYEPADTALLLDNMKKALKLLKTEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Metastasis-promoting anterior gradient 2 protein has a dimeric thioredoxin fold structure and a role in cell adhesion.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Anterior gradient protein 2 homolog
total genus 22
structure length 140
sequence length 140
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lnsA00
4G10A 1VF1A 3FR9A 3DWVA 4JBBA 4KNDA 4EC0A 5DQSA 4J57E 3TKPA 1EP8A 1E6BA 3CSHA 2FWEA 4IHUA 3NIVA 1TRUA 5CNWA 1GSEA 4XTSA 5ECHB 2LTKA 4DSQA 5E4WA 2LSTA 3CBUA 6GSYA 5J9BA 1XVWA 1AUCA 3DYRA 4TXOA 1YF0A 3KH9A 4AJ8A 3FHKA 2WZ9A 1GTIA 2RM6A 2HT9A 4P3YB 4TN8A 5KN0A 3HHVA 4MLYA 3F4TA 2EC4A 2QSIA 1XWAA 3D0ZA 1XXUA 1TRVA 3QMXA 1IYHA 2H19A 2REMA 1QUWA 5LCZA 1PMTA 1USBA 1O85A 1NHYA 2FA4A 1GTUA 1A23A 1OC8A 4GCIA 5CRDA 2L4CA 3F3QA 1TK5B 3DRNA 3Q6OA 2HZFA 2LUSA 3FW2A 3G7IA 4N30A 5JWQB 2IMFA 1KBNA 5HFKA 2B5XA 3W6GA 1M0UA 3E3EA 1I5GA 1Y6EA 5ECSA 3FEUA 1B8XA 1M2AA 3CRTA 3G7YA 2AUVA 1XPVA 1F3BA 2LJKA 2OBIA 3TDGA 3D6IA 5D8IA 2OA7A 4K7IA 2C3QA 5EY6A 4TR0A 4OCEA 4KH7A 5AN1A 4HI7A 1GWCA 2ZCTA 1N2AA 3AY8A 1ILOA 2GQLA 4RI6A 2BJXA 18GSA 2PUKC 2XBQA 5F06A 3SWLA 2XPDA 2YWNA 5F0GA 1AQXA 3ME7A 1UC7A 3VWVA 2EIRA 2VLVA 1FG4A 3IE3A 5A4UA 2JSYA 1VF4A 1VRSD 2XBIA 1I9DA 3VWUA 2FD3A 3KEBA 5LD0A 4WXTA 2ZNMA 4PUFC 1PSQA 3WT1A 3FKFA 3VPQA 2H0GA 2K9FA 5J5NA 1ABAA 1OVNA 3KP9A 1X9MB 4BWSA 3C71A 1OKDA 3NZNA 5C04A 1XW9A 2GSTA 1BG5A 1J08A 5FHIA 1ERVA 5ENUA 1Q98A 1H75A 2FNOA 4OMVA 3KCMA 2V32A 4ZB8A 4V2MA 3BJ5A 3C8EA 2TRCP 2DIZA 5EL8A 1GLQA 4K0NA 5F07A 1SD9A 4MH3A 3RBTA 2IPAA 2R2JA 2VD0A 2FGXA 2YCDA 3O76A 2TIRA 1X5DA 3GSTA 1EOHA 1EGOA 5B6MA 2Z9SA 3EVIA 4J2FA 2IMKA 4K7OA 4BVYA 3IRAA 3BOAA 2VUPA 2FWGA 3IPZA 6GSUA 3I69A 2H1BA 3A2XA 5IMDA 4WBRD 2AV4A 3BCIA 3ZFLA 1SK0A 3GH9A 2KHPA 4FO5A 1SL1B 5AISA 1O8WA 5IMAA 2O85A 1T4YA 5D9VA 2BMXA 4KDYA 4HU7A 2H66A 2VCVA 2OE1A 1MDIA 2L57A 1YKCA 1T3BA 2WFCA 2V41A 4KB3A 2DJKA 3KD0A 1THXA 5J4UA 3CTFA 1O73A 2FWFA 1FW1A 5IMVA 4FH8A 5D9TA 3QR6A 3GURA 2E0QA 3VWWA 3M8NA 1DSBA 1F6MC 2O87A 2F51A 1AW9A 1JZOA 2VCZA 3EINA 3FZ9A 2PN8A 2LRCA 2R6KA 3SBCA 2R5GA 2MYGA 1M7TA 3IC4A 5F8BA 1U3IA 2B3SA 1WRYA 2LNSA 1VF3A 1KNGA 1VGLA 2PMTA 4YQUA 2M80A 1M9BA 3EU3A 4DSSA 1EEMA 1NHOA 2H6XA 3GFKA 4KW6A 3LXZA 1YF1A 2N5FA 3H8QA 2K18A 11GSA 5ABRA 2YN1A 2AHEA 5CRHA 3RPPA 3HKRA 5CYYA 5DQYA 1EV9A 3DMLA 3W8JA 2GQMA 2KUCA 1HNCA 4NV5A 2VOCA 3CMIA 3HDCA 1WP0A 3TUEA 1XOBA 4K2DA 1Z3EA 3DGQA 3L9SA 2F3MA 4PURA 1GUMA 2XHFA 3TJBA 3GUSA 4MZCA 1GSYA 5HR3A 5ECMB 2NBSA 4EXJA 1GUKA 4HEA2 2P31A 4QQ7A 3WGDA 1O81A 3ZL5A 4IQ1A 3J7Yb 4JRRA 1K0DA 2AYTA 5DCGA 4IN0A 2OACA 3LYPA 2VM2A 4NXIA 3BBYA 2C0DA 2GZZA 3TGZA 2C80A 4HS1A 1Q4JA 3S9FA 1HYUA 1ZMAA 3D4MA 1S3AA 2X8CA 4EKZA 2JADA 3G9BA 3D4TA 2GZYA 3GV1A 3WYWA 2H71A 5KEJA 1X5CA 5JWRB 1QK8A 1GH2A 4BPYA 3M1GA 4KCAA 4OFNA 4XRDA 1BAYA 3U5RE 1FB6A 3JCML 2WRTA 1B4QA 1TU8A 1SJIA 5DAKB 1BX9A 2B5YA 3EMPA 4K0GA 4ISDA 3KGKA 5A4VA 3FZ5A 3Q18A 2F9SA 1U3AA 2NPBA 2R37A 4XS1A 1ZGNA 4BA7A 2I4AA 1YZXA 1SJ6A 4V2LA 3K8NA 3FY7A 1GP1A 5G5FA 1A2MA 3F0IA 4YQVA 3ED3A 2KP2A 2NVLA 3UJ1A 1LBKA 2WDUA 4MJAA 3GX0A 2LJAA 3HYPA 3C1RA 2VCWA 1JLVA 1Z7PA 3ZVJD 1EOGA 4MPGA 3US3A 1MDKA 4BVXA 1VF2A 1EZKA 1XW5A 3QCPA 4ECIA 3IR4A 2H01A 2HXKA 2DSAA 4XHMA 4XS4A 3GSSA 1GL8A 5HQPA 3F63A 2HFDA 5D96A 5CRWA 2LQQA 3FRCA 1UA5A 5FWGA 1B9XC 2L6DA 2ALBA 1SKSB 1AXDA 2YANA 1O7UA 1OAZA 5H5RA 8GSSA 5IMZA 5AIXA 2P0GA 1TRWA 2MBSA 1YKAA 3DIEA 3APOA 4I97A 4H86A 2YNXA 2F8FA 1A0FA 2HI7A 4ECJA 1SL0B 4GSSA 2GVPA 1TJDA 2H8LA 6GSXA 2L4QA 4TXOB 4ZB6A 1URMA 1THOA 3ISOA 1OC3A 3PH9A 3TB2A 4O7HA 2FHEA 4LA1A 4DVCA 2IWTA 3KTBA 4HJ2A 1GTBA 1OE7A 2EIOA 1K0OA 5COHA 2IL3A 4G19A 3DXBA 1PQNA 1DE2A 2AJQB 4WR4A 2DJJA 3IA1A 3EC3A 2VO4A 5B8AA 5G1LA 2I81A 4JEDA 3HZ8A 3HVSA 1GLPA 4KUNA 3F6DA 3ZLPA 4KCEA 4MA9A 4RQRA 3UAPA 3IDVA 3APSA 4JR4A 3UEMA 4PQIA 3R2QA 4DSRA 4IKHA 1UVZA 4ZBAA 2FLSA 1GNWA 7GSSA 4XS6A 1K0NA 2LNTA 4GLTA 2P5QA 2PWJA 1BQ7A 2N5BA 3M9KA 4N10A 3KJYA 2VL2C 2R4VA 2YWMA 1Z9HA 1A8YA 12GSA 5IO2A 3EMXA 1PX7A 3P8WA 4NHZA 4I5QA 1V98A 3TKRA 1AAZA 1H4OA 4G9HA 3LSZA 2FCHA 1W4VA 2XPEA 3L4NA 4D73A 3V1WA 4AJ6A 1MD4A 3C73A 2GT6A 4MPFA 3FYGA 4K6XA 1J0FA 1OKTA 1PX6A 1XFLA 5ECQB 2GS3A 1A2LA 3IAM2 4WEYA 5GAND 1G6WA 5KN1A 2GSRA 4E8HA 4WKWA 2CV4A 1DBYA 4KDXA 5IMCA 1T8EB 4TXVA 1N8JA 2DMLA 2P5RA 1XWCA 2YZHA 2HRFA 3HJOA 3UIWA 5ECOB 1BEDA 1PA3A 3CSJA 1XIYA 3QFAC 3PR8A 2JU5A 3UMAA 5ECPB 5ECKB 5DJMA 4ZBBA 3TOUA 3O3TA 2GZPA 3LGCA 4IQAA 2L5LA 2I1UA 3CYNA 1ZYEA 1G0TA 2PU9C 1XBSA 3WD6A 2MBTA 2X8GA 2PPTA 2D2ZA 4MJEA 3TCOA 1V2AA 5AIVA 3N5OA 4ULXA 3M9JA 1ZL9A 3ZITA 4PNFA 3VURA 5DBQA 2N5AA 5DVBA 1CQHA 3H79A 4HQZA 4EE0A 1Z5YE 1F2EA 3CSIA 3ME8A 2ES7A 2PGTA 1ON4A 1ACVA 2C1YA 2HNLA 3P2AA 3QPMA 1SENA 3ZREA 3VPTA 6GSWA 3WT2A 4BWQA 4JR6A 2HYXA 3A2WA 5J41A 1RQMA 2V6KA 3EWLA 4EDYA 2I9HA 1HD2A 1A24A 4MCUA 3KH7A 1WPIA 1XWKA 4NHWA 4YQMA 1KEBA 1V9WA 4FYBA 2KP1A 1GRXA 3GNJA 5ID2A 1MD3A 4HDEA 2H74A 3ZYWA 1OC9A 1B4PA 1FVJA 2YWIA 4OO5A 1U87A 4DSSB 1W89A 4F03A 1MTCA 4HOJA 4ZXGA 4TRXA 5DALA 4X1UA 2DIYA 4IP1A 5HFIA 1R26A 5LNKe 4I6XA 4ZL9A 3CXGA 5EPFA 1WOUA 4F82A 5FT3A 3TRXA 5D93A 2B7JA 3N9JA 4XIHA 4GF0A 2VIMA 3ZMLA 1FVKA 2KOKA 1RW1A 4F0CA 4RUVA 2VL3A 1T7PB 1KTEA 2WCIA 3QOUA 2BTOT 2JZRA 3DD3A 3Q19A 1AQVA 1AC1A 3L0HA 3KMOA 4IS0A 2WGRA 4NMUA 1ML6A 5B6NA 1JZRA 1XZOA 3KMNA 3ZIJA 4TVEA 1FHEA 2GGTA 4OFMA 5D9WA 2IJYA 5IIZA 2MMZA 5GAPD 1QGVA 2DC5A 4IW9A 3GL3A 5JCUA 3HA9A 2K6VA 2H1GA 3EE2A 4MH2A 4MZBA 5ECRB 4POKA 3TOTA 6GSSA 2CA8A 4Q5RA 2LRNA 1GSSA 2CQ9A 4JZQA 1V40A 1T1VA 4X0XA 2OE3A 4MK3A 5IO0A 4IVFA 4ECCA 3F4SA 4PGTA 4NV2A 4G2EA 2WULA 3M3MA 4E8EA 1ERUA 2X8HA 2B1LA 4TR1B 4LL1B 5F05A 1EV4A 4GRFA 4PQHA 4X43A 4GTUA 1PN9A 1PL1A 2A2SA 4HJMA 4IELA 2CVBA 3ERWA 3F8UA 4PUAA 4MP4A 5HR1A 2GT5A 3DKSA 2I3YA 1C72A 2B1KA 1X5EA 1WWJA 4FYCA 5G31A 4QL7A 4MJBA 2YV7A 4MF5A 3RAZA 1PL2A 1XWBA 2C0GA 3IAS2 16GSA 1X9WB 1QQ2A 1CQGA 3ERGA 4K9ZA 3TJGA 10GSA 1BJXA 4TR1A 4KSMA 3M0FA 2J9HA 2YZUA 1FAAA 2CT6A 3D22A 1XVQA 5IOXA 2E7PA 2OJLA 1GUHA 4POLA 4CW9A 2WB9A 1MDJA 2FA8A 2OE0A 1XOAA 2VL2A 1Z7RA 5CP1A 1K3LA 1JHBA 3QFBC 1T4ZA 5J9CA 3GTUA 4XS4B 1HNAA 2DJ0A 4ZB9A 2JSZA 2C0FA 1QMVA 3GIXA 4HUAA 4OCFA 2H6YA 1V57A 3RPNA 2RLIA 5HR0A 4I8BA 3VFIA 3LYKA 1JZDA 1XW6A 3GN3A 5GSTA 1T00A 5C00A 2C0EA 2X64A 1MEKA 1J9BA 1PKWA 1YQ1A 2IMDA 3TKSE 1YY7A 4N0VA 4OO4A 3F3RA 2JZTA 2HZEA 1ZZYA 3UL3A 1SL2B 4K8MA 3FZAA 4LLRA 4NPBA 2H1DA 1SK1A 3Q74A 2YOIA 4OD7A 2VM1A 5IPHA 2PBJA 1DUGA 3GKKA 3QD9A 4FIWA 3HVVA 4IP6A 2RUEA 2VCXA 2QKEA 1WIKA 1NSWA 2PVQA 3IK9A 1TKDB 4EVMA 4PXOA 1TRSA 3HXSA 3TKSC 1TU7A 1OYJA 3VI7A 2KLXA 4Q5NA 3C1SA 4PNGA 3UBKA 2VAFA 2E2MA 3UARA 4O5RA 1M99A 4EL1A 2L5OA 1SJZA 3GKXA 2ON5A 3QAGA 5HR2A 1X0RA 4K1FA 3APQA 3LJRA 3VK9A 5INYA 2JZSA 3O6TA 1RK4A 3EURA 2WJUA 3WGEA 5B7CA 3RDWA 1TTZA 3LQ7A 4HQSA 1M9AA 5JWOB 2DJ1A 1ERTA 1JZWA 1JLWA 3KXOA 5HFGA 3TRQA 3NOFA 3TRPA 5IM9A 3CRUA 4TR4A 2H75A 4D73B 2LJRA 4LMWA 4L5OA 3HCZA 3A5WA 1FOVA 3LEFA 1U88A 4YAPA 4CHSA 2GQKA 3FZ4A 2R3XA 3GKNA 2F8AA 2HRNA 2CAIA 3HD5A 2MZCA 4ID0A 4JU5A 3UOMA 2CX4A 4F2IA 5E59A 3RHBA 5GSSA 2M72A 1R5AA 1HNBA 2YJ7A 3H93A 3FR3A 1K3OA 3FR6A 3GHAA 3HJMA 3D5JA 4ACSA 4Q5QA 4J56E 5JCWA 2V6OA 2TRXA 1QFNA 5IMFA 2FWHA 1O6JA 2CZ3A 1K0MA 3H4KA 4NAXA 1ZYQB 4IJ3A 4NWYA 1XWGA 5JCGA 2MMOA 2MMAA 2RIIA 3GA4A 2VLUA 2H6ZA 2CAQA 4WBJA 2LEGA 1LU4A 1YEXA 2GTUA 1S3DA 5J3RA 3EYTA 22GSA 2OKAA 1XCCA 1EGRA 3I9V2 3IV4A 1EEJA 4N11A 2RUFA 3GX8A 4LMVA 4F0BA 5D9XA 4IBPA 4L5LA 5G1KA 1K0AA 2IMIA 1NM3A 2ON7A 4KX4A 1GNEA 2C3NA 2O89A 5IOWA 4TKYA 5H5QA 2OADA 5A5KA 4WF5A 5G30A 4O32A 4AJ7A 3TKQA 2K8VA 4I2UA 1TOFA 2GLRA 3F4RA 5CRGA 2MMNA 4KA0A 4PQ1A 2JL4A 4ML1A 1WMJA 2YP6A 4ZILA 1AIUA 2DJ2A 1YJ6A 3ZRDA 13GSA 4EDZA 1S3CA 2O7KA 2VL9A 1V58A 3UVHA 2IN3A 2FUG2 1TW9A 4WETA 3KM6A 4HZ4A 3IOSA 3P90A 4POBA 5ID2B 3L78A 3MWHA 4IJIA 1YDKA 5G5EA 5ELGA 1X9SB 1FB0A 4KDUA 1OC9B 1BYEA 5KN3A 2C3TA 2V2GA 2B5EA 4ZL8A 2VCTA 2B7KA 3MSZA 5DALB 3DVWA 4GSTA 2HSYA 3FK8A 3G7JA 3ZIVA 1TDIA 3A2VA 1R5PA 3MAKA 5CO3A 4V2NA 1A2JA 5AGYA 4IGJA 1AQWA 2G0FA 1EP7A 3ZTLA 4PX1A 2B6MA 2G2QA 2O8VB 6GSTA 3OR5A 2LQOA 2VLTA 1HQOA 2LV3A 1JFUA 4RI7A 2CVKA 1GTAA 3P7XA 1M2DA 1ERWA 4O92A 4XRAA 2AAWA 3MDKA 1E2YA 4MZWA 3GH6A 2GDRA 3LORA 3E0UA 1FO5A 1K3YA 3F9UA 5DJLA 4JE1A 2NDOA 5GZZB 2K8SA 2LKUA 1SYXA 3LWAA 4DEJA 2H70A 4F9ZA 3L9VA 2C4JA 3CTGA 4BL7A 5ECNB 3QAVA 2M46A 3GYKA 4MDCA 19GSA 2DMMA 2H0IA 3EU4A 1ZOFA 1Y25A 4V1Ap 17GSA 4AF2A 4GSNA 5IPGA 20GSA 1GSDA 2VD1A 1R4WA 5DDLA 9GSSA 1SU9A 4KSOA 2H76A 2H73A 2PVOC 1ZCPA 3PINA 2ZUPA 4XCSA 2HSHA 1F37A 3BD2A 4MJCA 4MF6A 3TJJA 3HZ4A 3E9JB 1F3AA 3LXTA 3GKMA 3TJFA 3H1NA 5ELAA 3TKSA 4EO3A 4K7NA 2WS2A 2IFQB 1R7HA 4EUYA 4KAEA 5KN2A 1M2BA 4L0UA 1WE0A 5CREA 4QL9A 4GQCA 1A8LA 5IQYA 4ZL7A 1TP9A 2GSSA 4ZIJA 1Z6MA 2LRTA 4KE3A 2A2RA 3UVTA 3ZVJA 3VWXA 3KTLA 2E2GA 5D73A 2V1MA 1TK8B 4ML6A 5L71A 2YJHA 3LG6A 2YPMA 2IFQA 4OFTA 4CDOA 6GSVA 3ZFBA 3GTUB 1NW2A 14GSA 2H30A 4Q5FA 4GXZA 5EVOA 4AGSA 5DCHA 3A3TA 1GULA 2FY6A 1Z6NA 3BCKA 3L9UA 3U6VA 1SK2A 3KIJA 4WF4A 2CZ2A 3ZZXA 1ST9A 3RHCA 1GSQA 2C8UA 2DLXA 1TK0B 1O8XA 4V1Ag 3F6FA 2OBKA 4YAVA 5ECLB 3VLNA 4ZBDA 4POMA 2HE3A 1PRXA 2X99A 3HJPA 3WGXA 2HZEB 3HY2A 3DEXA 4EF0A 2JACA 3J7Yk 2HLSA 2DBCA 5ECIB 2EIQA 1QXHA 4L8EA 2AB6A 4Z7XA 4N0ZA 4FYUA 1SKRB 3C7MA 1G6YA 2L6CA 3I6AA 2VCQA 4GWRA 1DE1A 3I43A 1B48A 2CVDA 5B8BA 3KZQA 4I2TA 2H0HA 2J23A 4MMMA 2CX3A 4OWYA 1GSUA 1PGTA 3D21A 3TJKA 1G7OA 3IHQA 1TI1A 3IXRA 2QGVA 2RM5A 2YV9A 2A4VA 3UBLA 1SKWB 1PD21 5DAKA 4KGIA 2LS5A 3ERFA 2DJ3A 5CAXA 1TI3A 3IK7A 4TW5A 5G2ZA 4ECBA 3VI5A 1OE8A 1SYRA 4LL4B 4RQXA 3LFLA 4MF7A 3KP8A 4ILFA 4L0WA 3ZMKA 1YEPA 3QDNA 3HVXA 1TXXA 1SD8A 1WJKA 4HU9A 2YWOA 4WR5A 1A0RP 2XC2A 1K0CA 2L59A 3GRXA 4HZ2A 2H72A 3PGTA 1EWXA 5H5SA 2NTOA 1GSFA 2IIYA 1B9YC 5A4WA 2IMEA 1U6TA 3MNGA 4YH2A 4GQFA 2H1AA 4TR3A 1LJRA 2QC7A 3IBHA 4MABA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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