The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GMVKETTYYDVLGVKPNATQEELKKAYRKLALKYHPDKNPNEGEKFKQISQAYEVLSDAKKRELYDKGGEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
NMR structure of the protein BC008182, DNAJ homolog from Homo sapiens
rcsb |
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily A member 1
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| total genus |
22
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J7Z A; 2CTQ A; 2CTR A; 4RWU A; 2CTW A; 2QWN B; 1FPO A; 1XBL A; 2Y4T A; 3APO A; 2LO1 A; 4J80 A; 1N4C A; 2M6Y A; 2QSA A; 2QWR B; 2DMX A; 2YUA A; 2DN9 A; 1GH6 A; 2GUZ A; 2QWO B; 1FAF A; 3AG7 A; 3BVO A; 2PF4 E; 2LGW A; 3UCS C; 4IT5 A; 2CTP A; 3UO3 A; 2N05 A; 2Y4U A; 2GUZ B; 1NZ6 A; 1WJZ A; 2EJ7 A; 1IUR A; 1BQZ A; 1BQ0 A; 2N04 A; 2L6L A; 2QWP B; 2CUG A; 2YS8 A; 3UO2 A; 2QWQ B; 2OCH A; 2KQX A; 1HDJ A; 3APQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DUY B; 3K5M A; 4R6Z A; 4HNA B; 4FK5 C; 1IBM O; 1NU1 H; 3D36 C; 3ABU A; 4JI3 B; 3EHB B; 2YDE A; 4X62 B; 4QJF B; 4WF9 V; 4B3T B; 1OCZ C; 4QPJ A; 1CEZ A; 2DYR C; 1VP7 A; 4UCO A; 5KA6 A; 4DUY O; 4BIO A; 3W7T A; 2F95 B; 2YID A; 4K8Z A; 1NR1 A; 1AR5 A; 3G67 A; 1FJG B; 3VQY A; 1M93 A; 1A32 A; 4JI3 O; 4JI4 B; 3CCR V; 1VQM V; 2UUA O; 4NKG B; 2QTO A; 3OUS A; 2BOB C; 2P5O A; 3T1C A; 4YXW G; 3AG3 B; 2Y69 C; 3IJ4 A; 5IYC O; 2NLJ C; 2ZD9 A; 3H9V A; 4LFC B; 1GKF A; 1K5S A; 1AJN A; 3CRM A; 3QO8 A; 4TUY A; 2XAQ A; 4FFB A; 1XUQ A; 1K92 A; 5L3F A; 5ITZ B; 1K4D C; 4GT1 A; 4FLX A; 4DR4 B; 2Q73 A; 2X6B A; 5H6R A; 5LP6 B; 1LNQ A; 4LFC O; 1H2N A; 1QVF U; 1FXV A; 1YHQ V; 3JD0 A; 1H2K A; 1Z5V A; 2Y4U A; 3AK2 A; 4X9Q A; 3GB7 C; 1M57 B; 1URF A; 2Q7E A; 4NXM B; 4DR4 O; 2LJ2 A; 4IGG A; 3HKD A; 3TET A; 4O4H A; 5EIB D; 4QIW F; 1NJI W; 1V54 C; 4O2A B; 2HHH B; 3C3S A; 3EVK A; 2Q0O C; 4DR3 O; 2CAZ C; 4AQY B; 3BAB A; 1NTK H; 1P4R A; 4PDM A; 4EFE A; 4CS3 A; 1IBK O; 1ENV A; 3SPJ A; 2NR5 A; 3G71 V; 5EZY A; 2HHH O; 4UCT A; 4AQY O; 2FKX A; 3OMN B; 3M7M X; 2QM7 A; 1XBL A; 2GDS A; 2OIE A; 4LH7 A; 4FLZ A; 2D3O W; 1SQP H; 2VQE B; 1D5N A; 4LF7 B; 1P7B A; 5BXZ A; 2IJI A; 3OEE G; 5IE9 A; 1NZ6 A; 5CA3 A; 1WB7 A; 4W4K A; 3JAR A; 3JSL A; 1Y67 A; 2IBZ H; 1Q82 W; 1F51 A; 2AHZ A; 5K1P A; 1SQV H; 3APO A; 4LF7 O; 4DR6 B; 4TQF A; 4MSW C; 4EKW A; 2QSA A; 2JRI A; 1HNW B; 1NH2 D; 2Y0P A; 1Q86 W; 4JAU A; 2A06 H; 4I4T B; 2R9R B; 1VQ8 V; 4OX9 B; 3CEI A; 5DN6 G; 2ZCE A; 3A0R A; 3ZMS A; 3RW0 A; 4F6R A; 3QG5 A; 3QO5 A; 3K0G A; 3AG1 C; 3H1K H; 2R9I A; 3S3X A; 1HNW O; 3L71 H; 4LCU C; 4MT8 A; 3E8B A; 4L87 A; 5E1A C; 3UT5 A; 4TUY B; 2ZXW B; 4FFB B; 3SPC A; 4OX9 O; 5KUM A; 4JI6 O; 4I7Z B; 5CN0 A; 4FM2 A; 2ZIO A; 4X8A A; 4I55 A; 1WAZ A; 1GM9 A; 3NXS A; 3HKC B; 2X6A A; 5JQG A; 5KAF Z; 5IYZ A; 1JVM A; 3K03 A; 2QR4 A; 1BE3 H; 2X6C A; 1S72 V; 1OCR C; 3SJB C; 3HKD B; 4FJC C; 4O4H B; 3TJT A; 2FL4 A; 5KHK A; 3JAL A; 1AI7 A; 3BAA A; 2IH3 C; 3H1L H; 1NH2 B; 2PGG A; 2DWD C; 4FM0 A; 2IJJ A; 1ZSP A; 1Q81 W; 3SYC A; 1XHZ A; 3KZI Z; 3LNM B; 3UO2 A; 2YI8 A; 1Q90 D; 3CS5 A; 3E8G A; 3X2Q C; 2OIG A; 4J9Z B; 4MW8 A; 3ZIA G; 4RQF A; 3FB7 C; 2XAH A; 3KG2 A; 1NTM H; 1N34 B; 3LNN A; 1HWY A; 2IH1 C; 4WCE V; 3HKB A; 3RBZ A; 2JGD A; 4NTW A; 3HKE A; 4XDJ A; 3L74 H; 3CCE V; 1QR9 A; 3SJC C; 4HAM A; 5L3C A; 2OYQ A; 4FLT A; 4X20 A; 5LA6 A; 1XNQ B; 1PL4 A; 1Y74 A; 5JWP A; 1N34 O; 2DE0 X; 2IJH A; 5F2V O; 1N4C A; 2PI4 A; 4P2Z A; 1JQ0 A; 4UV8 A; 4JI1 B; 4GX2 A; 1GAX A; 3F7V C; 1XNQ O; 1FKA O; 4H0L B; 5CA1 A; 4LC1 A; 4CH4 A; 2F93 B; 3ZMZ A; 4JI1 O; 4F6R B; 1KEC A; 4I5S A; 4JTC B; 3SGI A; 4DV6 B; 1M4U A; 2AGA A; 5IWA O; 4DV7 B; 4JAS A; 2UUC O; 4GLX A; 5CBG A; 4DXW A; 1L0L H; 1QVG U; 1FXK C; 4PDV A; 2EX3 A; 2FB5 A; 2VWJ A; 4W4L A; 4BW9 A; 4H44 B; 2XAS A; 1VF7 A; 3EFF K; 2IU0 A; 1AJQ A; 3SYO A; 2BSK B; 4I55 B; 4U3F H; 4DV6 O; 3ZX6 A; 4DV7 O; 1DF5 A; 5GW7 A; 1S3J A; 2Q8V A; 4RWU A; 5JQG B; 4UVC A; 1J5E B; 2P4K A; 3ABK C; 5IYZ B; 5LYJ B; 4B08 A; 4J9Y B; 5GON A; 5KHG A; 4OXS A; 5B1A B; 3JAL B; 2WWW A; 5L3G A; 4DV4 B; 2PYL A; 2QEX V; 1AJP A; 4R50 A; 4DK1 A; 3WFV A; 2QJ1 A; 1FS0 G; 1YDX A; 3B40 A; 3F7Y C; 4FLU A; 4DK0 A; 2BTQ A; 4JI8 O; 3STZ C; 3K59 A; 3E86 A; 1QCE A; 3R65 A; 1CP9 A; 2GBO A; 2ODM A; 2QM4 A; 3L75 H; 3EXA A; 2W0X A; 4XBF A; 3R66 A; 1K5Q A; 2RQ6 A; 5KLV H; 1U97 A; 4WFG A; 3GWO A; 2ZNI A; 5JCO C; 2JGD B; 3HKE B; 1MSW D; 3CWB H; 1MZE A; 1AI4 A; 2XTA A; 3ML0 A; 3KKY A; 3OR6 C; 4X20 B; 4X88 A; 5LA6 B; 4JYA O; 2LFS A; 1U96 A; 4GCZ A; 5B5E Z; 2R72 A; 1CXZ B; 2PYJ A; 4IYI A; 1KD1 W; 1DK1 A; 3SPI A; 2F43 G; 2IU3 A; 4CH3 A; 1MMM A; 3W7U A; 1H8H G; 3J81 N; 1S76 D; 2HVK C; 2JEU A; 2QA4 V; 1PD3 A; 1R3J C; 2E5L B; 2V7Q G; 1AP5 A; 3CX5 F; 1FFX A; 2EIM C; 4I0X B; 4F4L A; 3VOU A; 3E22 A; 2F4V B; 2AXT Z; 2A7W A; 2EIJ B; 2PTM A; 5LHG A; 1AVM A; 3OR7 C; 3ZRV A; 1S77 D; 1K9M W; 1NKD A; 4ZOL B; 3TXQ A; 1OCO B; 2F4V O; 2HP8 A; 4C7U A; 4BIZ A; 3FKS G; 2LP7 A; 4R8C A; 1US6 A; 4JTD B; 4D7S A; 4CZZ A; 1YZB A; 1GTO A; 1SA0 A; 4OPH A; 3PJS K; 1YI2 V; 3OW2 U; 3N2K A; 4UV9 A; 4UCR A; 3JAM N; 1PM9 A; 1VF5 B; 1ZUQ A; 4WFH A; 3WB2 A; 5KHI A; 4DV5 O; 2JGU A; 3BFR A; 3MHH C; 3SPH A; 4NR1 A; 4UUJ C; 5LL6 Y; 1KQS U; 5IJ9 B; 1UPG A; 2BTQ B; 1XNR B; 3A0B Z; 2PF4 E; 4B7E A; 1TGO A; 1R73 A; 1LUV A; 4I50 A; 5BR8 B; 2F23 A; 4CH6 A; 2B9Z A; 3OMA B; 1N36 B; 1VQP V; 3G4S V; 1XNR O; 4CS4 A; 1N8R W; 3SPG A; 1OZ0 A; 3CRR A; 2LO1 A; 3Q4H B; 5BR8 O; 2FML A; 3JD2 A; 3HPL C; 3CME V; 4ZHQ B; 2EBO A; 1WLE A; 4DRX A; 1VF6 C; 1WJZ A; 2V4D A; 1SQG A; 3CP1 A; 2XAJ A; 5E79 Z; 4BR6 A; 1VQ9 V; 3JYC A; 1W0J G; 3CPW U; 1JJO A; 5BY1 A; 3U10 A; 1JA8 A; 2VQF B; 4QGP A; 3JD3 A; 3LDE A; 1HR0 B; 1IBL O; 1V55 C; 3E22 B; 5B3S C; 1BQ0 A; 2RMK B; 4LP8 A; 4I9W A; 2VQF O; 1SQF A; 4TT3 G; 2YXY A; 1COW G; 1XL4 A; 1FYJ A; 2XUM A; 3CD6 V; 1DLB A; 2WA4 A; 1YVW A; 3QF7 A; 3BHP A; 5BMV A; 2PZS A; 1I5X A; 3D36 A; 1PL0 A; 4LF9 O; 1SZT A; 3B8M A; 4GYC B; 1VQ5 V; 1NTZ H; 1EFR G; 3SJQ C; 4N21 A; 3N2K B; 5BZB A; 3SDL A; 2M6Y A; 1PPJ H; 2Q4P A; 1JJ2 U; 1UFI A; 3UCS C; 4IT5 A; 1RP3 B; 4UVA A; 3RYH B; 2F66 C; 2P6J A; 2GUZ B; 4RQE A; 1SER A; 4I50 B; 2P7T C; 2RDC A; 4UB6 Z; 2PI5 A; 3HR0 A; 2HLD G; 3JAK A; 4PDL A; 4WFF A; 2RJZ A; 2GTS A; 1ZAU A; 4FVM A; 5A9G A; 4PA4 A; 2UUA B; 1AB3 A; 2WLN A; 4KHP O; 1MAB G; 3ZN1 A; 1MG1 A; 3UO3 A; 3W7W A; 2JS3 A; 4J41 A; 4DRX B; 1VQ6 V; 4MW3 A; 4NTY A; 5JJN B; 3RYC B; 3I56 V; 5B1B B; 4MVU A; 3ZHV A; 1NR7 A; 4WFE A; 5EYP A; 4X65 B; 1K7D A; 1R3K C; 3RVZ A; 2N74 A; 5LGN A; 1H2L A; 4DO2 A; 2E76 B; 2P06 A; 1YIT V; 3WB0 A; 3QNE A; 4Q20 A; 1XMO B; 2YSU B; 3SR2 C; 1OCC C; 4LFB O; 4N23 A; 1RSO A; 1PNL A; 4X65 O; 2KB1 A; 4QE9 A; 1K3E A; 3FYI B; 2WLM A; 3ZBH A; 4GX0 A; 2BTO A; 1O9G A; 4DR3 B; 1QR8 A; 3ZHT A; 1T5E A; 3G6B A; 4K3A A; 1XMO O; 1WPB A; 4K35 A; 1IBK B; 1NT2 B; 1OCZ B; 1OJH A; 2DYR B; 1BT8 A; 2HG5 C; 3AG4 C; 2QWR B; 2Y0I A; 4O4J A; 1IXB A; 4DV2 B; 2X7R B; 2QTS A; 2N04 A; 5HFM A; 3CC2 V; 4X1I A; 3W7S A; 1ZTE A; 2Y69 B; 4DV2 O; 2QWN B; 3AK3 A; 1SQQ H; 1GN4 A; 5J2T B; 3TK1 A; 1N32 O; 1N0N A; 2ARH A; 4A5U B; 4Q6G A; 1HNX O; 4D6T H; 1MNG A; 3CCL V; 5IT9 N; 4BW5 A; 1KC8 W; 3B2E E; 2WAM A; 3OTO B; 4CC6 A; 2NNU A; 4QPK A; 3ZMV A; 4IHJ A; 1JMK C; 4MTG A; 1WP7 A; 3T2M A; 1KYO F; 4NVP A; 4EFB A; 5EC2 C; 5LMN B; 5LBQ A; 4FM1 A; 4MVM A; 4FLY A; 3K5N A; 3CB2 A; 3CRQ A; 4J7J A; 3OTO O; 1BHB A; 2ADQ B; 4WFA V; 5FNV A; 1Q3E A; 1CPY A; 4QE7 A; 2YXH A; 1ROP A; 4IIJ A; 1V54 B; 4JI6 B; 2CH7 A; 2ATK C; 2IM9 A; 1XDC A; 5LMN O; 5LGT A; 2YS8 A; 1K73 W; 2WA3 A; 1B6Q A; 1F4N A; 1F23 A; 4KFM A; 1I08 A; 4KXR A; 4KL1 A; 1YJW V; 4OPA A; 1TVK A; 1MOF A; 1RSO B; 5FPO A; 4FIP C; 3K9S A; 2F1M A; 1Q6H A; 2HR3 A; 4YHH B; 1QLE C; 1E1R G; 4LWS A; 1AR1 B; 2NN4 A; 3LDC A; 1NBM G; 3K3W A; 5JJJ B; 4UXN A; 4PJ0 Z; 3ASO C; 3CCM V; 3AG2 C; 4YHH O; 1XL6 A; 2EIL B; 1VAR A; 2MW2 B; 2AHY A; 5GTI Z; 1FD9 A; 4O4J B; 3CRC A; 3U0Z A; 4JYY A; 1AI5 A; 4X1K A; 4D7T A; 4RUF A; 3JD1 A; 4JAV A; 1Z5W A; 5FL7 G; 3E83 A; 3KCY A; 3ZRW A; 5EZY B; 4X1I B; 2UXB O; 4JV5 O; 5KAI Z; 1I94 B; 1IX9 A; 3OE7 G; 4YJ2 A; 4EEQ A; 1YJ9 V; 3AG1 B; 5IY5 C; 4DR1 B; 1R1B A; 3JCU Z; 2OCC C; 4IL6 Z; 2VWK A; 4P30 A; 1FXK A; 2R70 A; 3DSQ A; 4DV3 B; 3JSN A; 4FZ1 A; 3G80 A; 1I94 O; 4TQD A; 1B06 A; 3JAR B; 2LFR A; 4OGQ B; 4PI0 A; 4DR1 O; 2ILM A; 2HEP A; 2C2A A; 1Q7Y W; 4ZKI A; 1M5I A; 2GHY A; 1FAF A; 2HKO A; 1BCC H; 1P49 A; 3BA8 A; 4DV3 O; 1M56 C; 1BSM A; 5IWA B; 4X66 B; 2UUC B; 1IUR A; 1BQZ A; 3OD4 A; 4EB6 A; 5FNV B; 3ABM C; 4MTX A; 2CUG A; 3ASN C; 2CH7 B; 4LF6 B; 5D5P A; 1H2S B; 1NQT A; 4X66 O; 2UXN A; 4ZIB A; 5IJ0 A; 3RYI A; 2HFE C; 2WLL A; 1TVK B; 3UT5 B; 3T1Y O; 5EK0 A; 3X2Q B; 4LF6 O; 2OT5 A; 3VQX A; 2PY5 A; 1IVS A; 1OV9 A; 1MZF A; 2A79 B; 4LWS B; 2GSM B; 2YC0 A; 5JCO A; 3J7A U; 1M9N A; 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2EUL A; 3MD0 A; 3E8H A; 4NB5 A; 3AG7 A; 3ZHR A; 4JI2 O; 4DV5 B; 4PA9 A; 5LMU B; 3WG7 C; 2ZDI C; 3ETQ A; 4P9P A; 1AIL A; 3CCS V; 5GON B; 3ETE A; 1VF6 A; 1D2D A; 1VQL V; 4FPP A; 5LOV A; 3DGE A; 5DED A; 5LMU O; 2OWO A; 4UCU A; 3STL C; 1H2M A; 2EIN C; 1YSC A; 2JJ2 G; 4CC5 A; 2QKC A; 3H01 A; 3OMI B; 4YY3 B; 1QHT A; 2ZQM A; 4LF5 O; 2UUB B; 1EN5 A; 3VQV A; 3CCV V; 4H33 A; 1GN2 A; 1GMG A; 1FFT B; 5J2U B; 5CA0 A; 3L73 H; 3ZMU A; 4YY3 O; 3FB8 C; 4PA6 A; 1WPX A; 4JGS A; 3VQW A; 2UUB O; 4YJ3 A; 2CGN A; 1XEQ A; 3M99 B; 3OM3 B; 2Y48 A; 3ZMT A; 1IBL B; 3ABL C; 4AHC A; 3E89 A; 2ZE6 A; 4RUE A; 1BL8 A; 4TV9 B; 4DV1 B; 2OTL V; 4MVO A; 1JFF B; 1KUQ A; 1FFX B; 2K1E A; 4FFK A; 1IZ3 A; 4DV1 O; 3RYF B; 1SES A; 5JVD B; 4LF9 B; 2CTW A; 2YI9 A; 1QLN A; 5K1X A; 3T1H B; 3VBB A; 2YUA A; 5LHH A; 1YIJ V; 4O2B B; 4JZG A; 3JCZ A; 3BPZ A; 4UFZ A; 3AEI A; 3T1H O; 1SA0 B; 1KP2 A; 2OCH A; 1V9P A; 3ZN0 A; 3ZRS A; 2DYS B; 2JJ1 G; 1DGS A; 4MVS A; 4DR5 O; 2EZO A; 3OGC C; 5LOV B; 3E8F A; 4Z1M G; 2QE7 G; 5B1B C; 1XOU A; 1M90 W; 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