2LS5A

Solution structure of a putative protein disulfide isomerase from bacteroides thetaiotaomicron
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MSLGYIVRIGEMAPDFTITLTDGKQVTLSSLRGKVVMLQFTASWCGVCRKEMPFIEKDIWLKHKDNADFALIGIDRDEPLEKVLAFAKSTGVTYPLGLDPGADIFAKYALRDAGITRNVLIDREGKIVKLTRLYNEEEFASLVQQINEMLKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
publication title Solution structure of a putative protein disulfide isomerase from Bacteroides thetaiotaomicron
rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein
total genus 58
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ls5A00
1K3YA 1SD9A 1PA3A 1EEJA 1K0DA 2ES7A 2HZFA 5IOWA 3VURA 3IAM2 3UEMA 4ID0A 2HI7A 4E8EA 2QKEA 3TKSA 1O8XA 3APQA 4BWSA 3TDGA 5EVOA 3C73A 1G0TA 3K8NA 4TOPA 2H74A 4FYUA 5ECLB 3EWLA 3A3TA 3L4NA 2RUFA 2XBQA 1AQVA 1X0RA 4ZBBA 5F0GA 1BQ7A 5CRHA 3C71A 4G10A 4BVXA 2HYXA 5IOXA 2V41A 4POLA 2AYTA 2FY6A 2LRNA 3GX0A 3I6AA 4YH2A 2GSRA 2RUEA 1E6BA 5A4UA 3N9JA 1MDIA 4OO4A 4ECIA 2LTKA 3TKSE 1V2AA 2DBCA 1YQ1A 2V6KA 4ZL7A 5GZZB 1S3CA 4MP4A 3M3MA 4O92A 5IPHA 5G31A 4AGSA 5B8BA 3QPMA 2P31A 2WS2A 2RM5A 4HQZA 2DIZA 3GA4A 4HUAA 4K7OA 2J9HA 2I1UA 4MDCA 1THXA 4KH7A 5HFGA 4XCSA 4ZL9A 1WWJA 3TJKA 1X9WB 3E9JB 3US3A 2YJ7A 2H6ZA 3I69A 4TW5A 3ZL5A 3LXZA 3MSZA 4JR6A 3EMPA 5DVBA 2GTUA 1PGTA 3KXOA 3GUSA 3J7Yk 3UARA 1F3AA 2WFCA 1NSWA 2L59A 12GSA 1WP0A 2WRTA 2HE3A 1V98A 2CX4A 4PUFC 1ZGNA 3IRAA 2H0GA 1Q98A 4F0CA 4EVMA 4XS4A 2QGVA 1VF4A 3CBUA 1R4WA 1YF1A 3GH6A 2F8AA 4BWQA 1A2LA 2CVBA 1AC1A 3QFBC 5IM9A 3DYRA 1G6WA 3Q74A 4PXOA 3H79A 1ST9A 2DC5A 4OCFA 4MH2A 2LSTA 2L4CA 2DJJA 1ERUA 3LEFA 2L5OA 1HNBA 1ERVA 3H8QA 2X64A 5JWRB 2VCZA 4DVCA 1M0UA 3CTFA 2BMXA 4ML1A 2LEGA 4KB3A 3GYKA 3M0FA 2TIRA 2LJKA 4ML6A 4TKYA 1HYUA 4IBPA 3QFAC 4IVFA 3L9SA 4WF5A 3D5JA 3APSA 3W8SA 2ALBA 4EXJA 3KH7A 4O5RA 1OAZA 4ZIJA 20GSA 2LQOA 3FZ5A 3IK9A 1B8XA 2LNTA 2C8UA 3PGTA 2NVLA 2CAIA 2PBJA 2WZ9A 4POBA 2X8GA 4RQRA 4EO3A 2LUSA 4WETA 2H1AA 5J9BA 3EU4A 5JCGA 2H6YA 3TUEA 2XBIA 3HZ4A 1DSBA 1EOHA 1N8JA 2PERA 2IWTA 1Y25A 1JZDA 3IDVA 1VF1A 2K18A 5JWQB 2C0GA 1TW9A 4CHSA 1EGOA 2O7KA 2F51A 4DSSB 2HNLA 3F4SA 4WKWA 5ECRB 2OJLA 3KJYA 1MDKA 3MNGA 2KUCA 1PL2A 1R26A 3HA9A 2OE3A 2KP1A 1S3DA 2PMTA 1THOA 1E2YA 2BTOT 4L8EA 4XRDA 2FLSA 1T7PB 1M9AA 1PKWA 1U6TA 2VCTA 2N5FA 2WGRA 4PX1A 1OC9A 3LSZA 3QMXA 1A23A 1GLPA 1A2MA 4RUVA 3CSHA 3EE2A 1MD4A 3VWXA 1YEPA 1EP7A 2V1MA 3C1RA 2EIQA 3ZITA 3LQ7A 1XXUA 4KW6A 4PQ1A 2PPTA 4XIHA 3GTUB 2XC2A 4BVYA 1SJ6A 3IV4A 1PKZA 3TOTA 4JU5A 2DIYA 1XWGA 1X5CA 2MMAA 2PVQA 2X8HA 3TGZA 4CDOA 1GSQA 5COHA 2FCHA 3A2XA 4RQXA 1B9XC 1JZWA 3TKPA 2GQKA 2JACA 2HT9A 3MWHA 3KCMA 1BAYA 7GSSA 4OMVA 1SK1A 2DJ3A 4MH3A 4G9HA 3SWLA 1M2BA 3CRTA 1NM3A 5J5NA 4HJ2A 2C1YA 3V1WA 4EDYA 1Z7PA 1SKSB 4Q5FA 1PRXA 2PU9C 4DEJA 3WYWA 1R5PA 2IMIA 1V40A 4J57E 2E2MA 1QGVA 4KSMA 2L57A 4F9ZA 3A5WA 4L5OA 4I2TA 2CZ2A 3BCIA 2DJ1A 2LRCA 3KP8A 5CO3A 4ECBA 9GSSA 2H1GA 2KP2A 6GSVA 1ABAA 1EGRA 2VLVA 1ACVA 4IJIA 3ZMLA 4MMMA 2BJXA 3DGQA 4JBBA 1NHYA 5G5EA 3H1NA 4IELA 3BJ5A 1GSSA 1J0FA 3FKFA 2ON5A 2YWIA 1JHBA 1K0AA 3KP9A 1X9MB 10GSA 3Q6OA 4MJCA 1GL8A 4JEDA 4ZB9A 2AHEA 2YCDA 4YQVA 3ME7A 4KSOA 5IQYA 5A4WA 5ECKB 3FZAA 3FW2A 5F05A 3ERGA 3HD5A 5A4VA 3KGKA 3D21A 4XHMA 3QAGA 2H75A 3TRQA 1C72A 3KM6A 3DEXA 4HS1A 1TK8B 5AIXA 2IL3A 1ZYQB 3VWVA 1XCCA 3L78A 3F9UA 3FEUA 2IIYA 18GSA 1MEKA 1LBKA 3TKRA 2GSQA 2C4JA 4NV5A 5D9TA 4ACSA 5JCWA 3CTGA 2LJRA 1TI1A 1GTUA 3WD6A 3LJRA 2YOIA 4ZBDA 3DIEA 4O32A 4I8BA 1TU7A 2QC7A 5GAND 3QD9A 1K0CA 3HYPA 3GFKA 1FVKA 4OFTA 4TN8A 3KTLA 6GSSA 1GNEA 3RAZA 3KMOA 2L6DA 4MJAA 2VLUA 3F6FA 1SL2B 3RPNA 2OA7A 3UIWA 2P5QA 3GKMA 2IMFA 6GSYA 4IHUA 4K8MA 4XS4B 1CQGA 2AAWA 1KTEA 3M1GA 1JLWA 3VWUA 3QCPA 5AIVA 2K9FA 2HXKA 3EMXA 2WULA 5D73A 1UC7A 2O87A 4GRFA 1K0BA 13GSA 2GT5A 2VL3A 4WBJA 1SK2A 2F9SA 4N11A 1FHEA 2NTOA 3APOA 1BJXA 2M46A 4KE3A 4KAEA 2VIMA 2MBTA 4OWYA 3ZVJD 3GKXA 4IKHA 2VM2A 1G7EA 1SJIA 2L6CA 1DUGA 4ZBAA 5KN1A 5F07A 1O7UA 1TK5B 1I9DA 2PGTA 2MYGA 3ZFBA 1K0MA 1ILOA 1GWCA 1TRUA 3GNJA 4WR4A 2K8VA 2WDUA 5HR1A 2FA8A 3D22A 4ECJA 4TR4A 3M8NA 1OKTA 4H86A 2YZUA 1RW1A 4POMA 5HFKA 4QQ7A 2YP6A 2B5EA 1Z6NA 3ED3A 2Z9SA 3KH9A 3VFIA 4TR1A 2HLSA 1K3OA 5G30A 3IXRA 4PQHA 1T4YA 4Q5RA 1ERTA 1TKDB 4JRRA 2YV7A 4GWRA 4NWYA 3TJFA 3DMLA 4MJBA 1ERWA 2I4AA 4V2NA 5CRGA 1OE7A 2PWJA 4AF2A 4Z7XA 4HEA2 5A5KA 2C0FA 1Z6MA 3UMAA 1FW1A 3KD0A 1OC9B 3IPZA 4MZWA 4K7IA 2O8VB 2L4QA 2ON7A 4D73A 2RIIA 3M9KA 1LU4A 2MMNA 2JZRA 3VLNA 2AUVA 3FY7A 2GT6A 2JSYA 1XW5A 5DDLA 1U87A 2YV9A 4HDEA 1VF2A 3HVSA 3TCOA 1WOUA 1V58A 2NPBA 4HU7A 4YAVA 1XFLA 1WPIA 5ECIB 5AGYA 4AJ6A 3TKSC 4XTSA 5AN1A 3F4TA 4AJ8A 1AQXA 1OE8A 4J56E 5G5FA 2B1KA 3VPTA 3HDCA 1EEMA 2C0EA 2FD3A 3IR4A 5CREA 6GSWA 4FYCA 3TJJA 1RQMA 5ELAA 2CA8A 2C80A 2R5GA 1SKRB 1F9MA 5D9XA 5G2ZA 1QXHA 4GSNA 5GAPD 4OFMA 2DJ2A 4RI7A 3E3EA 4KGIA 3GN3A 3C7MA 2C3TA 2K8SA 2YJHA 3O3TA 2LS5A 3LORA 3IA1A 1R5AA 3KZQA 1PX6A 2IMDA 3HVVA 3PR8A 5FT3A 3HXSA 3GV1A 5E59A 4YQMA 2EIRA 2IN3A 1JZRA 1F37A 1Q4JA 4IQAA 3TOUA 2JU5A 4EDZA 2B7KA 2D2ZA 3VK9A 3OR5A 1ML6A 4YQUA 4NMUA 3L0HA 4FIWA 2VL2A 1MTCA 3A2VA 3QAWA 2PVOC 3R2QA 3RBTA 5FWGA 4G2EA 4MPFA 3C8EA 3W6GA 3IOSA 2FUG2 1T3BA 1F6MC 5H5RA 4PGTA 1YKAA 3UJ1A 4POKA 1O8WA 3C1SA 2GZYA 3SBCA 4TR0A 1S3AA 2M80A 4KCAA 1NW2A 1X9SB 2K6VA 1U3IA 5HR0A 4EF0A 3BOAA 3ZIVA 2HRNA 3WGXA 2R3XA 2B5XA 4J2FA 4GQCA 4WF4A 4K1FA 4GXZA 4PNGA 3KTBA 4V1Ap 1HQOA 3EINA 1QQ2A 2OBIA 1ZZYA 5ECQB 1NHOA 2LRTA 2H71A 5J4UA 2WCIA 3CMIA 4EUYA 2JSZA 2FNOA 2H30A 4G19A 1FO5A 2O89A 2LNSA 5B6NA 1GUKA 3AY8A 4I6XA 1V9WA 4ZL8A 1XIYA 2VO4A 1M2DA 3DVWA 5DQSA 2R4VA 2RLIA 4RI6A 2OE0A 4JZQA 1SYRA 17GSA 4HU9A 2L5LA 1K3LA 4HOJA 1TDIA 1GSDA 2C3QA 1I5GA 2G2QA 1XWAA 2PUKC 5JWOB 2VM1A 3DRNA 1OC3A 3WGDA 5H5SA 1R7HA 3D0ZA 4FH8A 3ZFLA 1ZCPA 1DBYA 4N10A 4Q5NA 5CRDA 1UA5A 2CZ3A 1EZKA 1TTZA 2TRCP 5ECOB 3F4RA 3L9VA 1A0RP 2YNXA 2KOKA 1TK0B 1EWXA 3VPQA 2FA4A 5EL8A 1SJZA 1SU9A 2R6KA 2X99A 2ZCTA 4BA7A 5IMFA 4OFNA 1OVNA 2R37A 3GSTA 2IMEA 3F0IA 3TJBA 3ZYWA 1T1VA 1UN2A 3BD2A 5KN2A 4V2MA 1FVJA 1GSEA 3GL3A 3U6VA 1QK8A 4TXOA 1FAAA 2REMA 5DJLA 2V6OA 3DD3A 3KIJA 2OKAA 4WXTA 4GCIA 3TB2A 4AJ7A 1V57A 2MMZA 4N30A 3FYGA 4X1UA 5KN3A 1IYIA 8GSSA 1KEBA 3ZREA 1GRXA 4XRAA 1CQHA 4HI7A 3F8UA 5IMVA 3A2WA 2AJQB 4ECCA 4F2IA 2A2SA 2CT6A 3FR6A 3GKNA 4QL7A 2GVPA 5HR2A 1WE0A 3H93A 2VD1A 2XHFA 4TR3A 1WJKA 3ERFA 1AAZA 2VCVA 1XBSA 3PH9A 5KN0A 2M72A 3BBYA 1M99A 5IO0A 3UBLA 2GLRA 2R2JA 1Z5YE 1XWCA 1B4PA 2IFQA 1WRYA 2XPDA 2C3NA 2JADA 2AB6A 4ZXGA 2KHPA 1OC8A 2OACA 1B9YC 1TRVA 2P5RA 2GZPA 1M2AA 1TOFA 3ISOA 4MABA 3UOMA 1SL0B 5ECNB 4X0XA 3JCML 2I3YA 4KDUA 3G7IA 2YN1A 4ZB6A 3DWVA 4ZILA 1FG4A 2VL9A 1EV4A 4PURA 1YZXA 1DE2A 1PX7A 1M9BA 1ZOFA 2GQMA 4ISDA 1PD21 3CSIA 1K0OA 3E0UA 4K2DA 4MPGA 5ECMB 4F0BA 4NHWA 5J3RA 3EU3A 1J08A 2B3SA 2TRXA 4QL9A 2VUPA 2H73A 2H1BA 4OO5A 1YF0A 2QSIA 2P0GA 1SKWB 2OADA 1N2AA 1Z3EA 2FWHA 2JL4A 5DBQA 3EVIA 3LFLA 5C04A 1SK0A 1ZL9A 3QR6A 2FGXA 1T4ZA 1YJ6A 1FB6A 1X5EA 4I97A 1J9BA 3GURA 3NOFA 5AISA 4MLYA 2YWNA 3ZVJA 1SENA 5H5QA 3EC3A 1GSYA 1QUWA 3LWAA 3S9FA 5LCZA 2HZEA 5F06A 3WT1A 1MD3A 1SD8A 4KDYA 4L0UA 1JFUA 11GSA 4IP6A 1TP9A 3TRPA 4K6XA 1K0NA 2GSTA 4PNFA 5D8IA 1BEDA 2YANA 4I5QA 4HZ4A 3I43A 3FR3A 1H4OA 2JZSA 1W4VA 3LGCA 3GX8A 5D9WA 2DMLA 1Z7RA 4KCEA 5GSTA 1WIKA 2H01A 5DAKA 3IC4A 3VI5A 2IPAA 3ZMKA 4ILFA 3ERWA 1KBNA 3GIXA 2EIOA 3UBKA 4K9ZA 2VCWA 1LJRA 3CRUA 4K0NA 4GTUA 1M7TA 19GSA 2LQQA 2DJKA 4MF6A 4LMWA 4L5LA 4EL1A 3ME8A 4N0ZA 4F03A 1Z9HA 5IIZA 14GSA 3WT2A 3Q19A 3FHKA 4IW9A 3D4TA 3FZ9A 1OYJA 4EE0A 3KEBA 4E8HA 1W89A 3LXTA 5ID2A 2VCQA 2CVDA 5DALA 5IPGA 5C00A 3HCZA 4NV2A 2KLXA 2NDOA 3GKKA 1XWKA 2AV4A 5DQYA 2H6XA 1GTBA 2H0HA 2VOCA 3Q18A 3CSJA 1AUCA 3F3QA 2N5AA 1FOVA 2GSSA 5J41A 4KDXA 3KMNA 4IGJA 2LV3A 5D9VA 1GSUA 5D93A 4ZB8A 2H70A 1SYXA 3DKSA 16GSA 1UVZA 1U88A 3HY2A 4PQIA 1XVQA 3FK8A 3IHQA 2I9HA 1TI3A 1T00A 4Q5QA 4YAPA 4CW9A 6GSTA 1XPVA 3FR9A 2CQ9A 3TKQA 1ZYEA 2JZTA 3G7JA 3ZRDA 2LJAA 1PL1A 3EURA 5E4WA 3GH9A 2X8CA 1BYEA 3IAS2 1AQWA 3P8WA 1T8EB 3UAPA 1USBA 1YDKA 1WMJA 3RDWA 4ULXA 4MZBA 1O81A 6GSUA 5CAXA 4P3YB 1TU8A 1O73A 3G7YA 2WJUA 4MCUA 1A0FA 3HHVA 3D6IA 1BG5A 3QOUA 2VD0A 5FHIA 4NPBA 4BL7A 1VGLA 4WBRD 4MA9A 2I81A 3MDKA 5B6MA 1H75A 2OBKA 5F8BA 2CX3A 4IS0A 1PN9A 1BX9A 2HSHA 3RHBA 4MJEA 4I2UA 2H1DA 4FYBA 4IN0A 4NHZA 1ZMAA 3QAVA 4LL1B 4TXOB 3GSSA 2IJYA 3L9UA 3IE3A 3GMFA 4DSQA 4GF0A 5JCUA 5DJMA 4KX4A 6GSXA 2GZZA 2GDRA 3UL3A 4EC0A 1QMVA 4V2LA 4MZCA 5G1LA 5IO2A 2EC4A 3I9V2 5ECSA 5CNWA 5HR3A 2H8LA 1TXXA 5CRWA 3RHCA 4KNDA 5ECHB 2XPEA 4K7NA 2WB9A 3HJPA 2ZUPA 3U5RE 5ELGA 2A2RA 1G7OA 2MBSA 4LLRA 5HFIA 5IMCA 1GULA 3D4MA 1XZOA 1B48A 1XOAA 1HD2A 3VI7A 5EY6A 2V2GA 2F3MA 4OCEA 1JLVA 2B1LA 3PINA 2B5YA 1AXDA 2F8FA 2A4VA 1GTAA 5G1KA 2J23A 1KNGA 2VLTA 3CXGA 5IMZA 5ABRA 3NIVA 1AW9A 2IFQB 3W8JA 1EV9A 1SL1B 1U3AA 5CYYA 1QFNA 2HFDA 2H72A 1EP8A 1XW6A 4JE1A 1GH2A 4GQFA 5B8AA 5ENUA 5CP1A 2C0DA 4XS1A 2IMKA 2LKUA 4HJMA 4LA1A 1A8YA 2DLXA 3P7XA 2CV4A 1GSFA 2RM6A 3LYKA 22GSA 5INYA 1TRWA 2FWFA 3P2AA 4FO5A 3IK7A 1YEXA 5IMAA 3DVXA 2YWMA 2NBSA 2B6MA 3TJGA 4L0WA 3HKRA 2H76A 3HZ8A 2CAQA 2VL2C 5DCHA 1A24A 3ZTLA 2GGTA 4V1Ag 4GLTA 3ZLPA 4NAXA 4LL4B 4JR4A 4OD7A 4MF5A 5D96A 1XVWA 2G0FA 3UVHA 1AIUA 2H19A 2E0QA 1HNAA 1GLQA 3CYNA 1VF3A 3VWWA 1XW9A 3UVTA 3IBHA 4GSTA 2ZNMA 3LYPA 2HZEB 3DXBA 2FWGA 1Y6EA 2FWEA 3G9BA 4IP1A 2DMMA 2HRFA 3F63A 4EKZA 3LG6A 4DSSA 5LNKe 5L71A 3M9JA 3NZNA 4NXIA 5EPFA 1A8LA 1PSQA 1GNWA 5GSSA 2O85A 1O6JA 4MF7A 4HZ2A 5KEJA 3WGEA 2E2GA 4LMVA 1F2EA 4HQSA 3HVXA 2DJ0A 4BPYA 1PMTA 3N5OA 2VCXA 5B7CA 1EOGA 1PQNA 4GSSA 3ZZXA 5DAKB 5IMDA 4DSRA 2YZHA 1XWBA 4O7HA 2CVKA 4PUAA 1RK4A 2GS3A 4TR1B 5LD0A 1GTIA 3F3RA 2N5BA 3O76A 3TRXA 1IYHA 1ON4A 3MAKA 2H66A 4F82A 4MK3A 3GRXA 5DCGA 3J7Yb 3GTUA 1GUMA 1X5DA 3RPPA 1XOBA 2MZCA 4TRXA 2YWOA 5HQPA 4KA0A 1DE1A 2VAFA 4IQ1A 4X43A 1O85A 3GHAA 4IJ3A 2YPMA 1TJDA 4KUNA 2V32A 5ID2B 3FRCA 5ECPB 4D73B 1TRSA 2B7JA 5DALB 3BCKA 4XS6A 3HJOA 2E7PA 5J9CA 3F6DA 4TVEA 1F3BA 3P90A 3O6TA 1JZOA 1B4QA 1GP1A 1A2JA 2GQLA 2PN8A 1YKCA 2FHEA 3EYTA 1VRSD 2HSYA 3H4KA 1FB0A 4WEYA 4N0VA 1G6YA 4WR5A 3FZ4A 2MMOA 4TXVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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