2LS5A

Solution structure of a putative protein disulfide isomerase from bacteroides thetaiotaomicron
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MSLGYIVRIGEMAPDFTITLTDGKQVTLSSLRGKVVMLQFTASWCGVCRKEMPFIEKDIWLKHKDNADFALIGIDRDEPLEKVLAFAKSTGVTYPLGLDPGADIFAKYALRDAGITRNVLIDREGKIVKLTRLYNEEEFASLVQQINEMLKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of a putative protein disulfide isomerase from Bacteroides thetaiotaomicron
rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 58
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ls5A00
4IJ3A 3D4MA 2GQLA 3KIJA 1PSQA 2L57A 3CBUA 1OKDA 2O85A 3DIEA 3VWUA 5ABRA 3IE3A 4WKWA 3GIXA 3DXBA 2MMZA 2JZSA 3GRXA 4MJEA 3DKSA 1TRUA 3KMNA 4IBPA 2DJ0A 3RHBA 1WP0A 1SK2A 1F3BA 1K0BA 4OO4A 2L5OA 3VI5A 1SJZA 2V41A 4IVFA 4ISDA 1IYHA 1G0TA 4IS0A 3UBKA 1ZOFA 1SL1B 1YEXA 5H5RA 2NDOA 2EIRA 4GF0A 5L71A 5CRWA 1PRXA 3DGQA 4DEJA 5LCZA 3DWVA 1F9MA 2XHFA 2LRNA 1WWJA 5H5SA 2OADA 1S3CA 2MMNA 1DSBA 5ECMB 1TTZA 3FZAA 3D6IA 3V1WA 3ERFA 3UAPA 2C0FA 3LWAA 4HOJA 1QQ2A 4DVCA 2YCDA 4TW5A 5DJMA 5HQPA 1LJRA 4IN0A 4MF6A 3ZREA 5D93A 4MF7A 1F37A 3HVXA 4MPGA 4YAPA 3TDGA 2N5AA 1PMTA 2HT9A 2JL4A 2IPAA 2M80A 1VF2A 5DCHA 3ZVJD 1PL1A 2AB6A 4XRAA 3ZRDA 3L9SA 4DSSB 3FW2A 2R3XA 4PXOA 2K18A 3TRQA 3I69A 2C0DA 3VLNA 3RBTA 4O92A 3US3A 1EGOA 3EU3A 1XIYA 3GKXA 5B8AA 1JZOA 5ECIB 3BCKA 1ERUA 3TOTA 2L6CA 5GZZB 1RQMA 5D9TA 3L9UA 4O5RA 4ECJA 4LA1A 2D2ZA 4HDEA 1TJDA 2CV4A 1H75A 5IPGA 2VCVA 4LLRA 3TJGA 2C80A 3F4TA 1FVKA 5C04A 1FG4A 1RW1A 4YH2A 3F4SA 5A4VA 1FOVA 3WGEA 5KN1A 4ZBAA 3A3TA 1GH2A 4TR4A 2MYGA 3LYKA 1GUMA 1A2JA 1ERVA 2WULA 2KLXA 1X0RA 3WGDA 4L8EA 2G0FA 5G1KA 1ON4A 3K8NA 5KN3A 3LGCA 1GSDA 5DALB 1Z6NA 2V2GA 1LU4A 3UOMA 4V2LA 4N0VA 2HYXA 5CAXA 6GSVA 1EP8A 3ME7A 2CAIA 5EPFA 1TOFA 1TRSA 4BL7A 5F07A 1SK1A 1ST9A 2O89A 4MF5A 2H0GA 1HNBA 2KOKA 1WOUA 16GSA 3EC3A 4MP4A 2P31A 5DAKB 2F9SA 2K6VA 1K0MA 3FYGA 5ECSA 3UEMA 1V98A 1M9BA 1TU8A 2IJYA 4XS6A 2H6XA 1QFNA 2FCHA 2ON5A 2IN3A 3BD2A 1SJ6A 4EXJA 4X1UA 4MCUA 4FYBA 2FNOA 1ML6A 4FYUA 4I8BA 3CSIA 1KEBA 4KSMA 2YZUA 3CMIA 2M46A 4DSSA 4IGJA 3M0FA 3HCZA 3ERWA 3IDVA 1G6YA 4POKA 2GGTA 3C1RA 4J2FA 4ACSA 1GUHA 2DLXA 4J57E 3W6GA 2B5YA 2VM2A 2GTUA 1PQNA 3UL3A 4ZL9A 1SKWB 3QCPA 5J4UA 1GULA 4OFMA 3IK9A 4K2DA 3I43A 1S3DA 2GSTA 1A23A 2VAFA 1V9WA 2O7KA 4RQXA 2FWHA 3FRCA 2XC2A 1YJ6A 4OFNA 4GSTA 2FWEA 3W8SA 3GKKA 2VL3A 3RPPA 2I81A 3EURA 1QK8A 1Q4JA 1ZZYA 4WF5A 3FKFA 2YWNA 1MDIA 1NSWA 4TXOB 3S9FA 5CRGA 5HFKA 1TKDB 4BPYA 1XOAA 2H1BA 4CDOA 2GSRA 1TK5B 2B7KA 4CW9A 1SKSB 2GT5A 2JADA 4RQRA 4JZQA 3HKRA 4ZB8A 2H72A 4HEA2 5ECQB 4KCAA 3A2WA 3G7IA 1Z7PA 1A0FA 4WBJA 1GSUA 5IOWA 2REMA 3F8UA 2F51A 4KE3A 1TXXA 2WCIA 1XWGA 4ZB9A 1BAYA 1HYUA 3APQA 5DAKA 1YY7A 5JCUA 1T1VA 3HXSA 2GZZA 2JZTA 2J23A 2C8UA 2FWGA 4GCIA 5ELGA 1AXDA 3SBCA 2H6YA 3KD0A 2WZ9A 5IMDA 1SL0B 3A2VA 1GTIA 2TRCP 4EC0A 5EY6A 2FA4A 3VWXA 3H8QA 1U3IA 4NHZA 5DQYA 5IO2A 1BYEA 5CNWA 2VL2C 5JCGA 3IAS2 4K9ZA 3NZNA 4V2NA 2GSSA 6GSSA 2JZRA 3GYKA 3IAM2 3M9KA 2CX4A 3WYWA 3ZYWA 3ZIVA 3FZ5A 5IMVA 4IQ1A 5AISA 3TKRA 1F2EA 1SENA 2C0GA 3TKSA 2GQMA 1XOBA 4Z7XA 3KGKA 1I5GA 1OKTA 5HR3A 3Q19A 5IMFA 5D9XA 1V57A 3ZTLA 3EE2A 4PNGA 17GSA 4FO5A 5J9CA 2OE3A 2IIYA 5G31A 3WGXA 4EL1A 2AJQB 2WS2A 4LL1B 1KBNA 5HFGA 4WXTA 1O8WA 1EOHA 3TUEA 1B4QA 4GLTA 3N5OA 3H1NA 2VLVA 4TXOA 3IXRA 1ERTA 2LRTA 1ZGNA 2QC7A 3O6TA 3ZMLA 1HD2A 2YP6A 3ZVJA 4Q5FA 2H30A 1KNGA 4KNDA 2DMMA 1PGTA 1HQOA 2B5XA 1OC9B 2LNSA 5D96A 4BWSA 2X64A 3WD6A 1T4ZA 2R5GA 1K3LA 1XXUA 4GTUA 4KH7A 4MLYA 3TOUA 2C1YA 1W4VA 4XS1A 4MJBA 1PN9A 2CAQA 2B6MA 2H73A 3E0UA 2IWTA 1W89A 5HFIA 5FHIA 4K6XA 1RK4A 4ECIA 2WDUA 2LSTA 6GSYA 5CRDA 2BMXA 2PVOC 4WF4A 3KZQA 1BQ7A 4F0CA 2H76A 1FB0A 2VCQA 3NOFA 5INYA 1CQHA 4NV2A 4KGIA 6GSXA 3QFBC 3KTLA 4GRFA 3E3EA 4NXIA 1C72A 3TKPA 2V32A 4L0WA 3HVSA 4EDZA 4POMA 1Y6EA 3CTGA 3H4KA 3CXGA 2PBJA 1X5EA 4KDXA 4WR5A 2CT6A 3TJFA 3GV1A 4TXVA 2LS5A 3PINA 4QL7A 1THXA 2YANA 4X0XA 1X9SB 3BOAA 3HZ4A 1X9WB 1BJXA 2GSQA 1AC1A 1EOGA 4V1Ap 2RLIA 5IMZA 1T8EB 2MZCA 1A8YA 1Z7RA 3EMXA 4MH2A 5HR0A 2VL9A 2LTKA 2KHPA 1VF3A 7GSSA 2G2QA 4BA7A 2OBIA 2YNXA 4K7NA 1EV4A 3MWHA 3KCMA 5GAPD 3IRAA 4JEDA 1BG5A 3GX8A 3ERGA 2ES7A 2A2SA 4WEYA 2DC5A 5B6MA 2C3QA 2NBSA 4KSOA 5EL8A 3CYNA 3HDCA 3BJ5A 1OC9A 4HJMA 3DYRA 2VD1A 1OC8A 3I9V2 2VLTA 5HR2A 3LORA 2RM6A 5B7CA 1PX7A 3TRPA 4Q5NA 2P0GA 1QUWA 4Q5QA 4EO3A 3LFLA 3H93A 1WRYA 2DJKA 5B8BA 1YKAA 1YQ1A 3ZFBA 3M1GA 1KTEA 1G6WA 3KM6A 1GNEA 3VPTA 5JWRB 3AY8A 2DSAA 2HSYA 3TJJA 4RI6A 2PMTA 2I4AA 3GMFA 5ENUA 3WT2A 3CSHA 4O7HA 1X9MB 1DBYA 1FHEA 1TP9A 4L0UA 1ZYQB 3P2AA 2QKEA 5A4UA 1N8JA 2DJ3A 2HNLA 1AAZA 3GH9A 1JLWA 3HJMA 3VWVA 4MDCA 1SKRB 3DEXA 4HZ2A 1S3AA 4KDUA 3NIVA 1WIKA 4E8HA 1SYXA 1XWBA 1XWCA 1ZMAA 3EWLA 2PN8A 2VCWA 5DDLA 3UJ1A 1OE7A 2LRCA 3HJPA 3GA4A 2ZNMA 2K8SA 4LL4B 5KN2A 1IYIA 1SU9A 11GSA 4GQCA 2JSZA 4BWQA 4V2MA 4AJ6A 3LXTA 2IFQB 2VLUA 4MMMA 3ZFLA 5IQYA 3A5WA 3FR3A 5E4WA 3GNJA 5LNKe 1FAAA 2OJLA 5KN0A 3IA1A 2L4CA 3UBLA 3VURA 1FVJA 1SYRA 3KP8A 3L9VA 3DMLA 1I9DA 1NHYA 4FYCA 3WT1A 3DRNA 1THOA 3Q74A 2PERA 1NW2A 4POLA 1M2DA 5AIVA 2IMIA 3LJRA 4OWYA 2XPDA 1UVZA 5ECLB 5IO0A 4K0NA 2JU5A 2PUKC 3P90A 1SD9A 1YEPA 4IJIA 4MK3A 4NWYA 3OR5A 4K7OA 1ZCPA 2MMOA 1XW5A 4PUFC 3C71A 2VIMA 1OYJA 4GSSA 4ECBA 18GSA 4XS4B 3UARA 2DIZA 2PVQA 3F63A 4JR6A 4GXZA 2HFDA 3QAVA 1VF1A 3FY7A 2OA7A 2FY6A 1Y25A 1GLQA 4HU9A 1XW6A 5J3RA 3HY2A 6GSUA 1T00A 3KH9A 2H70A 3HHVA 2C3TA 3F6FA 1G7OA 1A0RP 10GSA 2VCTA 1U88A 5KEJA 2NTOA 3GHAA 3RAZA 2YZHA 2EIOA 2YWMA 2J9HA 3VFIA 4ML1A 5G1LA 1JZDA 3QDNA 3ZMKA 1TK8B 5LD0A 4G10A 4HJ2A 5J41A 1ABAA 2N5FA 3TKQA 3QR6A 3TKSC 4TN8A 1B4PA 6GSWA 4G2EA 2VCXA 2L5LA 1R5AA 1X5CA 4MZBA 4FIWA 3FZ4A 5IMAA 2P5RA 5F06A 5IOXA 1FB6A 4XRDA 2FHEA 2DIYA 2PPTA 5DALA 4N30A 4TRXA 1MDKA 5FWGA 2IFQA 1TRWA 2B3SA 2O87A 3F6DA 1N2AA 1OC3A 5F05A 4ULXA 1TRVA 1DUGA 5IPHA 1SL2B 5CO3A 2HI7A 1ACVA 1E2YA 2V1MA 3O76A 3O3TA 2HXKA 1MD3A 1LBKA 2OE1A 4EKZA 3ZL5A 2FD3A 2WGRA 1U3AA 4D73B 3ZITA 2H75A 5HR1A 1BEDA 2X8HA 3PGTA 2CVBA 1XW9A 2C3NA 1M2AA 3GN3A 1QMVA 1WE0A 4XIHA 5ECHB 4AJ8A 1WMJA 4POBA 5G2ZA 1AQWA 2LJAA 1H4OA 2RIIA 3APSA 4XS4A 2H6ZA 2WJUA 4TVEA 1B8XA 3LEFA 3C7MA 1XWAA 3TKSE 2VUPA 3EINA 4MPFA 1GP1A 1CQGA 1PA3A 3EYTA 2ZCTA 2CQ9A 2C4JA 2XPEA 2XBQA 5FT3A 1QGVA 3MNGA 4OO5A 1TW9A 2WFCA 3IHQA 4ML6A 5ECKB 1AUCA 2LJKA 1BX9A 1GUKA 3D21A 3P8WA 2CZ2A 5AIXA 4F0BA 3QFAC 3QAGA 1USBA 2H74A 3DVXA 2VM1A 1GSQA 2MMAA 4JU5A 2IMKA 3EU4A 3SWLA 2R6KA 1ERWA 9GSSA 2FA8A 4IP1A 1G7EA 2AYTA 3MSZA 2GVPA 2CX3A 1WJKA 1Z6MA 4ID0A 5DQSA 3VPQA 3D0ZA 3ME8A 22GSA 3ISOA 2FLSA 3F4RA 2R37A 4N0ZA 1B9YC 3IBHA 2CVDA 3HD5A 1QXHA 2HE3A 3FK8A 3GFKA 2YPMA 4F03A 2IMDA 2KP2A 1O85A 8GSSA 4XTSA 3F3RA 1O81A 5ECRB 4AF2A 5AGYA 2WB9A 3F0IA 5B6NA 2X8GA 3VK9A 20GSA 1V40A 1PKWA 2M72A 1XVQA 2QSIA 3QD9A 4I97A 2H1DA 1GTBA 1SD8A 3RDWA 1O8XA 4JR4A 4I2UA 2F8FA 3IV4A 1ILOA 2Z9SA 3VI7A 4D73A 2QGVA 3L0HA 3CRUA 3C1SA 5IMCA 2K9FA 5CYYA 2B7JA 1F6MC 2DJ2A 4XHMA 2E2MA 2ALBA 2IL3A 3BBYA 4IP6A 6GSTA 2H1AA 4MJCA 4MZWA 1Z3EA 3DVWA 3FR9A 3W8JA 1JHBA 2H0IA 4GSNA 5ECNB 1DE1A 2GDRA 3UIWA 4JE1A 4G19A 5GSTA 2JACA 1A2LA 1MDJA 1T3BA 4J56E 4ZB6A 1M99A 2X99A 5DBQA 3MAKA 3IOSA 1VF4A 5JCWA 2YOIA 3ZLPA 4WR4A 2OACA 4OCFA 4KW6A 2VOCA 4L5LA 2CVKA 4WETA 1NHOA 1ZYEA 2VCZA 4HI7A 1EGRA 1JZWA 5CRHA 1R7HA 2IMFA 1K0NA 1YF1A 1M2BA 4IW9A 4EVMA 1EEJA 1MEKA 4I2TA 4MABA 1FO5A 1GTAA 1J0FA 3F3QA 1GWCA 5CREA 1TI1A 1V58A 2EC4A 1TDIA 2YJHA 2AAWA 3G7YA 1SK0A 3Q18A 2ZUPA 3TRXA 1EP7A 2F3MA 5D73A 4AJ7A 1VGLA 5CP1A 1GSFA 4EUYA 3PR8A 2HRNA 1MTCA 1XPVA 1GSEA 4PGTA 2HLSA 3UVHA 3FZ9A 4XCSA 4HQSA 5D8IA 2I9HA 1O7UA 4PQ1A 1E6BA 1WPIA 4TR1B 2GLRA 3EMPA 4DSQA 2V6KA 3E9JB 1B9XC 1M9AA 5J5NA 4NHWA 3TJBA 4HUAA 2DBCA 4PURA 5H5QA 4DSRA 3BCIA 1GNWA 1XWKA 2C0EA 2H1GA 2ON7A 2YN1A 4JBBA 4RUVA 1A24A 2KP1A 1K3OA 4MH3A 4RI7A 3HZ8A 1T4YA 4KB3A 2X8CA 3QOUA 1YZXA 1GTUA 4MZCA 3QMXA 1Z9HA 1R4WA 1M0UA 3LXZA 1JFUA 3ED3A 1J9BA 2KUCA 1T7PB 4QQ7A 2E7PA 5EVOA 3EVIA 4TR3A 4FH8A 3TJKA 1PD21 5ELAA 2VD0A 3KP9A 1OAZA 4ZL7A 4GWRA 1EEMA 4F82A 4GQFA 1JLVA 4HZ4A 3UMAA 3TB2A 2LQQA 4AGSA 2N5BA 2I3YA 1UC7A 2A2RA 1Q98A 2GT6A 2HZFA 2FWFA 1M7TA 2B1KA 5F8BA 2GZPA 5COHA 14GSA 3KJYA 2YV9A 4LMWA 3GUSA 4X43A 3LQ7A 4KUNA 4MJAA 2K8VA 2FUG2 1OVNA 3FR6A 3IR4A 2YWIA 4ZXGA 1PL2A 2OBKA 1UA5A 1YF0A 1MD4A 1UN2A 5ECOB 2IMEA 3L78A 4K7IA 3APOA 1A8LA 2L6DA 3CRTA 4G9HA 1URMA 3ZZXA 2H71A 2WRTA 3IC4A 2B5EA 2HZEB 1PX6A 2R2JA 1OE8A 2B1LA 2CZ3A 4N11A 2P5QA 1X5DA 3KMOA 1K0OA 3KXOA 4TKYA 2PU9C 3M3MA 5E59A 1U6TA 3C73A 1K0DA 1Z5YE 2YJ7A 4HS1A 4TR1A 2LKUA 3IK7A 2LJRA 4KX4A 4E8EA 1GL8A 2GS3A 5G5EA 3G7JA 4YQMA 3CSJA 3J7Yk 1O73A 5D9WA 1GSYA 3Q6OA 3I6AA 5C00A 2H0HA 2H01A 1O6JA 2AUVA 3U6VA 1HNAA 4MA9A 4ZILA 1GLPA 1TI3A 5A4WA 5A5KA 4NPBA 4ZBBA 1DE2A 4BVXA 4Q5RA 4ZBDA 3LSZA 4OCEA 3G9BA 3F9UA 13GSA 4KCEA 3HJOA 4PQHA 2AHEA 2CA8A 4PUAA 3N9JA 1K3YA 2V6OA 1K0AA 4JRRA 4KDYA 2DJJA 2RUEA 3TGZA 3GH6A 2RM5A 2LQOA 2LUSA 2LNTA 4TR0A 1FW1A 4P3YB 2FGXA 4OMVA 3VWWA 2BJXA 4ZIJA 3TCOA 3C8EA 2A4VA 5AN1A 4KAEA 1YDKA 3GTUB 4NMUA 1ZL9A 1XCCA 2GZYA 3GL3A 4EDYA 5ID2B 4EF0A 3M8NA 4PNFA 19GSA 4H86A 5IIZA 4I5QA 3J7Yb 4NV5A 1XBSA 4TOPA 2I1UA 2LV3A 5DVBA 2H19A 1HNCA 2TRXA 2XBIA 4ZL8A 3D22A 4PX1A 2L59A 3GL5A 4HU7A 3MDKA 1AIUA 4NAXA 2OKAA 1NM3A 3GSTA 2HZEA 2LEGA 1TU7A 4IHUA 3R2QA 2HSHA 4I6XA 3ZIJA 4ECCA 3GX0A 1R26A 2H66A 5IM9A 4F9ZA 2VO4A 4LMVA 3KH7A 3QAWA 3KEBA 1YKCA 5J9BA 2DJ1A 2JSYA 1EWXA 4YQUA 3L4NA 3KTBA 2PGTA 4EE0A 1AQVA 3CTFA 3M9JA 3LYPA 4N10A 4HQZA 2BTOT 12GSA 1VRSD 1XFLA 3HA9A 3IPZA 3HVVA 1TK0B 4F2IA 2OE0A 2YV7A 1AQXA 2L4QA 2NPBA 2DMLA 2TIRA 1V2AA 5DJLA 4BVYA 3GKMA 3A2XA 1SJIA 4YAVA 1F3AA 5G5FA 2GQKA 1JZRA 3GURA 3HYPA 2H8LA 4K1FA 1AW9A 1A2MA 3FHKA 2AV4A 5G30A 5GAND 4V1Ag 4IELA 2MBSA 1K0CA 5F0GA 2HRFA 1GSSA 4WBRD 2F8AA 1EV9A 2E0QA 3UVTA 1B48A 2MBTA 3H79A 1EZKA 3FEUA 3GSSA 3RPNA 4IKHA 2EIQA 1XVWA 1J08A 4K0GA 3PH9A 4IQAA 4L5OA 4KA0A 5DCGA 4K8MA 2RUFA 2VL2A 3U5RE 5D9VA 2NVLA 3DD3A 5JWQB 1GRXA 3GTUA 2YWOA 4O32A 4YQVA 5ID2A 3LG6A 4CHSA 2R4VA 2O8VB 3GKNA 4OFTA 3RHCA 3P7XA 4OD7A 1U87A 3QPMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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