2LSTA

Solution structure of a thioredoxin from thermus thermophilus
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
MSLRWYPYPEALALAQAHGRMVMVYFHSEHCPYCQQMNTFVLSDPGVSRLLEARFVVASVSVDTPEGQELARRYRVPGTPTFVFLVPKAGAWEEVGRLFGSRPRAEFLKELRQVCVKGGACGEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of a thioredoxin from Thermus thermophilus
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Thioredoxin
total genus 38
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lstA00
1MD3A 5GSTA 1WE0A 1GTUA 2R3XA 2L4CA 4GSSA 3FZ4A 2AHEA 5A4UA 1EZKA 3DIEA 1IYIA 4PNFA 1M2AA 1SU9A 2F3MA 1K0MA 1K3OA 2FA4A 3L0HA 3APOA 1MD4A 3D4TA 1QK8A 1X0RA 2MBTA 5G2ZA 1XW9A 3N5OA 4H86A 4HJMA 3P7XA 4KUNA 5JWOB 3Q74A 4DVCA 2JZRA 1SL2B 3EE2A 2DJKA 3DYRA 3GX0A 4K7NA 3HVSA 5J41A 4I8BA 4JE1A 3ED3A 4MMMA 4X43A 1GTIA 1MDIA 4JBBA 2R37A 1AIUA 1ZL9A 2X8GA 4MZCA 2M80A 3O6TA 1MDKA 3M9JA 3UJ1A 1XWCA 1S3AA 1BX9A 3QFBC 3BCKA 2VLTA 1BJXA 4PQHA 3CTFA 3JCML 1TU8A 1N2AA 4KDYA 5ID2B 2ZCTA 2IPAA 4NV5A 2PU9C 3ERGA 2JACA 4HEA2 4KNDA 4HZ2A 4Q5QA 3OR5A 1SJIA 2LEGA 2I1UA 1PSQA 2AJQB 2EIOA 1Z6NA 3VI7A 1OC9A 4X0XA 20GSA 1AQWA 2LTKA 4ML6A 3BJ5A 4MABA 2J23A 2IMFA 3EVIA 1PX6A 3QAVA 1USBA 4ZL7A 4DSRA 3I6AA 2H71A 1OE7A 2GDRA 5DCHA 1F6MC 3TOTA 4HQSA 3UOMA 1WP0A 3I43A 1J0FA 1U6TA 1J08A 3DKSA 1TK8B 2H73A 3CSIA 3QAWA 1DBYA 3LGCA 1RQMA 4BWSA 4O7HA 1TDIA 4IJIA 3DRNA 1GWCA 3L9VA 2NVLA 1H4OA 2VLVA 4ML1A 4FO5A 4IBPA 8GSSA 4FYUA 4NMUA 4E8EA 5IMFA 5GSSA 2J9HA 5ABRA 1TU7A 3IK9A 4BL7A 2JSYA 2GSSA 2K8VA 1AUCA 3GURA 4XHMA 3HD5A 4V2NA 1TXXA 5DVBA 4GLTA 4NHZA 5IPHA 1TRSA 5G5FA 4LLRA 1YKCA 4ISDA 3KGKA 2AB6A 1SENA 3FK8A 5ID2A 1GUHA 3M1GA 1ZYQB 2P31A 2LQOA 4RUVA 1I5GA 2H66A 2PERA 1S3DA 3MNGA 3PINA 1TRWA 1JZDA 3IAS2 5H5RA 5G5EA 4TR1B 3GA4A 3APQA 5L71A 1B48A 3L78A 2C0FA 2R4VA 2WCIA 3EYTA 5HFGA 1SL0B 3ZFLA 2VIMA 2OE1A 2DIYA 3UVHA 17GSA 3KXOA 3IDVA 4CDOA 5LCZA 3DVWA 4F0CA 5IMVA 2LRCA 2DBCA 3WT1A 4WXTA 1M9BA 1ERTA 2L59A 1E2YA 1ST9A 3KH9A 3BOAA 1VRSD 2QKEA 1GSSA 2KOKA 4QL9A 1SKSB 1BYEA 1ZZYA 4ZILA 2KLXA 3KIJA 5E59A 3VK9A 4LL4B 1Z3EA 4N0VA 5IMDA 4MDCA 2HRFA 4Q5RA 9GSSA 2Z9SA 3KEBA 3UAPA 1A23A 4GTUA 2JU5A 2KP1A 5ECOB 3CXGA 2I3YA 1ERUA 5J5NA 4AF2A 2LJKA 3SWLA 3RAZA 1A8LA 2P5QA 4MJAA 4LMWA 1PQNA 2HT9A 2K18A 3GH6A 1XWKA 3LG6A 4NPBA 2B5XA 3TDGA 4HS1A 1CQGA 5CO3A 3E9JB 1SYRA 4JR4A 1GNEA 4J57E 4EXJA 3CRTA 4EKZA 2GQLA 3HCZA 1VF2A 3ZITA 3Q19A 4TR1A 4KA0A 4EC0A 2H6YA 3ZREA 1YQ1A 1XWAA 3TKSE 4XS4B 1X9SB 1GULA 4FYCA 2I9HA 2NTOA 2B1LA 4ECBA 4KW6A 1T8EB 5CREA 2LJRA 5LD0A 3WYWA 4IHUA 1RW1A 2OBIA 4GWRA 1K0NA 1XOAA 3WD6A 1EP7A 1VF3A 3CRUA 2GSRA 2WS2A 3IR4A 3LSZA 4N30A 4RQRA 2CVDA 1UA5A 2GT6A 1F3AA 2V2GA 3LFLA 3NOFA 3TJBA 2DMLA 3H93A 4EE0A 2HZEA 3GKMA 5KEJA 2FD3A 4CW9A 3ZMKA 4WETA 2DJ3A 4KH7A 2B7JA 3IXRA 4KE3A 3HA9A 1EV9A 5D73A 1EWXA 2A4VA 4DEJA 1ERWA 3C1RA 4HI7A 2BMXA 2L5LA 5H5SA 3GKKA 2WGRA 4I6XA 4POLA 1WRYA 1K0DA 1G0TA 3C7MA 2EIQA 1TRUA 1R5PA 1DE2A 4OMVA 4IN0A 1X5DA 4Z7XA 3TRQA 1TTZA 4AGSA 5FHIA 4GSTA 4TRXA 3NIVA 2ALBA 4PNGA 1T3BA 3IC4A 3US3A 1DUGA 2ON7A 3VWVA 5CRHA 2FNOA 4ZBDA 2NPBA 1U3IA 2ES7A 1PKWA 2IJYA 1XW5A 1O6JA 4V2MA 1NHYA 1T00A 2ZNMA 2DJ1A 3A3TA 3IPZA 3DEXA 4K6XA 4XTSA 1THXA 3KZQA 4MZBA 1TI1A 2FHEA 1V98A 2F51A 2V6OA 2OKAA 3EU3A 3ZFBA 4KB3A 5IO2A 3TKQA 3M8NA 3LWAA 3ZYWA 4EDZA 4TOPA 5G1KA 5LNKe 1CQHA 2YNXA 1ERVA 2HSHA 1GTAA 2O85A 2PWJA 2YANA 2XC2A 3HHVA 1YEPA 1IYHA 3MAKA 1UVZA 3UBLA 2E7PA 1EGOA 5G30A 1SD9A 1XVWA 1A2MA 1Q98A 3TKSC 5DAKB 6GSSA 2OA7A 4L0UA 4NWYA 4Q5FA 5D9XA 1VF4A 2H1AA 2VD0A 4K2DA 4XIHA 1OC3A 3O3TA 5ECLB 2GT5A 3IOSA 3LXTA 1UN2A 4POMA 1YY7A 3HXSA 1FOVA 2MBSA 3GN3A 1V58A 4IS0A 2H0GA 5A4VA 3FYGA 3W8SA 1ZMAA 3VPQA 1ON4A 1XBSA 3VWUA 5EVOA 4FYBA 2C3TA 1FVKA 2N5AA 2FCHA 4LL1B 2A2RA 2VCTA 2FLSA 3KH7A 1AAZA 4V1Ap 4HOJA 5ECRB 4ULXA 2FWFA 1SJ6A 1XPVA 2RUEA 2CX3A 2RIIA 3E0UA 1YF1A 2NDOA 4POBA 2WZ9A 2XPEA 2HLSA 3TRXA 2LQQA 3GUSA 2XBQA 5A5KA 1PL1A 2MYGA 1O7UA 4V2LA 2P5RA 5G31A 1LU4A 4G19A 2JZTA 1MDJA 1SD8A 4TXOB 3TGZA 5J3RA 1FO5A 3J7Yk 3RPPA 4F03A 4I2UA 2LRTA 4ECCA 2TRCP 1R5AA 5KN1A 4IELA 4NHWA 2C80A 1TP9A 4DSSB 4DSQA 3CSJA 3TJGA 4BPYA 3ME8A 4AJ7A 2XHFA 2GZPA 4KSMA 2H6ZA 1AQXA 1Y6EA 2FWEA 1FB6A 4JEDA 1QUWA 4EO3A 2X99A 1FG4A 1XIYA 2H0IA 5DAKA 3FRCA 1O85A 2QSIA 3QCPA 2VM2A 4MH2A 2X8HA 1FAAA 1U88A 5GZZB 2CZ3A 2H70A 2L57A 2LNTA 4K7OA 5DJMA 2MZCA 4WR5A 1OC8A 2QC7A 1T4ZA 3IV4A 4MCUA 3GFKA 3MSZA 5B6NA 5IMCA 3VI5A 1N8JA 5F07A 2DJJA 4PQIA 5DCGA 3GHAA 2BJXA 4RI6A 4P3YB 3GNJA 3MWHA 2I4AA 3C73A 2VUPA 3GKNA 2OJLA 3HZ8A 2YWNA 2TIRA 2M72A 2HSYA 3GL3A 1W4VA 3PH9A 3GRXA 2C3QA 5KN0A 5GAPD 4GCIA 1B8XA 5D93A 2VCWA 3KD0A 3CYNA 2JZSA 2N5FA 2C3NA 2AUVA 1T1VA 1EP8A 3D22A 3GMFA 2C8UA 1GLQA 2H0HA 4WR4A 3FY7A 5ELAA 4N10A 2PVQA 3A2VA 16GSA 2OACA 2WFCA 3WT2A 1EOGA 3KTLA 3S9FA 2EC4A 3GYKA 1B9XC 2LUSA 2H30A 4YQUA 1H75A 3TJKA 1GSDA 2CV4A 1GUKA 2LJAA 2VAFA 4QQ7A 1SKRB 3CMIA 4JR6A 5AGYA 1U3AA 1WOUA 3VLNA 4RQXA 5JCGA 3QR6A 3W8JA 4EDYA 1I9DA 1M7TA 1ILOA 2MMZA 1ACVA 3GSTA 1T4YA 4TR4A 2WRTA 3N9JA 4PUAA 4EF0A 3FR3A 2VL9A 4WF5A 1AXDA 3FEUA 4K1FA 4WBRD 3F63A 1FHEA 2O89A 1V57A 1SK0A 3IE3A 1GL8A 3DGQA 1PD21 1X5CA 3TKRA 5G1LA 3G7IA 1WWJA 1HNCA 3UL3A 1T7PB 2YPMA 3VWXA 4OCFA 4BA7A 5ECHB 1EEJA 4Q5NA 3LQ7A 2C0GA 2PVOC 4OCEA 1OKDA 4F2IA 2VL3A 2B3SA 3HYPA 1MEKA 4D73B 2RM5A 2LNSA 4PGTA 2FWGA 4HU7A 1TI3A 5ENUA 5J9BA 6GSTA 3A2XA 1EV4A 3TKSA 4BVXA 3TJJA 5AISA 2GS3A 2L5OA 3V1WA 3KTBA 5A4WA 1Q4JA 2VCZA 2X64A 2WB9A 3CBUA 3HVVA 2KHPA 3FZAA 3M3MA 3AY8A 5C00A 3HJMA 2AAWA 1AQVA 5CP1A 3M9KA 5EY6A 3K8NA 2HYXA 5IOXA 4XCSA 4K7IA 1TW9A 5ECPB 2E2GA 3TRPA 3H4KA 4F82A 4L0WA 4YQVA 5J4UA 3EURA 2KP2A 1NM3A 2H72A 2B5YA 4OO4A 2LRNA 1M99A 4YH2A 3TCOA 1K3YA 5DALB 1M0UA 3VPTA 1PGTA 2BTOT 1R26A 2F9SA 5IMAA 3H1NA 3EMXA 4XRDA 3G7YA 2R2JA 1BAYA 2CZ2A 1F2EA 4IW9A 5IQYA 2H76A 1Z9HA 1HD2A 3NZNA 1PKZA 3HZ4A 1WPIA 4WBJA 1TKDB 5ECKB 4G10A 4XS6A 4JZQA 2WULA 1YDKA 1HYUA 2IIYA 1SK1A 2DC5A 4PQ1A 5ECNB 4EUYA 1THOA 3FZ5A 1KBNA 2FGXA 1LBKA 3LORA 4HU9A 1A2LA 4MPGA 2JL4A 2YJHA 2VCVA 1BQ7A 4KDXA 2DMMA 1TOFA 2H6XA 6GSXA 4OFTA 1G7OA 3APSA 3RDWA 2MMNA 4MPFA 4HQZA 3F0IA 1PX7A 1FW1A 3HVXA 1M2BA 2IFQB 3F4TA 2VOCA 2ZUPA 1SK2A 1XW6A 1F9MA 1XCCA 3FW2A 2EIRA 4XS4A 3D5JA 3F9UA 4ZL9A 1HNAA 4NV2A 3ZLPA 3FHKA 3F3RA 3WGEA 1U87A 4YAPA 3FZ9A 1HQOA 3ZIVA 5AIXA 3I9V2 3EWLA 4ECIA 6GSVA 2CAQA 1V2AA 5ECIB 2MMAA 4GF0A 1FVJA 2IN3A 5DALA 1A8YA 5AIVA 2PMTA 1R4WA 3KP9A 3HDCA 1JZRA 2B6MA 3CSHA 3KP8A 4QL7A 2FUG2 4OFMA 5JWRB 5EPFA 4ECJA 4BWQA 2AV4A 1YZXA 3QDNA 1XWGA 1JZWA 2H19A 2HXKA 2HNLA 1GSFA 2DLXA 1ZCPA 2JSZA 1O8XA 3MDKA 4IGJA 4IQ1A 2H01A 4I5QA 2GZZA 3EINA 3TB2A 12GSA 3G7JA 1JLVA 5KN2A 4ILFA 4OD7A 2R6KA 5H5QA 3PR8A 2A2SA 1PRXA 3ZL5A 5D96A 4MZWA 4XS1A 4YAVA 5E4WA 3DVXA 4KGIA 1Z7RA 3IK7A 2LSTA 2XPDA 4RI7A 2DJ2A 1QFNA 1OC9B 4N11A 1V40A 3HJOA 2M46A 3C1SA 5ECMB 2OE0A 3QD9A 3GV1A 4ID0A 4JU5A 2X8CA 2V32A 5ECQB 2IMEA 2OE3A 4MF5A 11GSA 5GAND 1A0FA 1GSYA 2PUKC 1SL1B 1M9AA 3UEMA 2CT6A 4IQAA 3GH9A 5AN1A 2VLUA 3P8WA 2LV3A 3P90A 2LKUA 3LYPA 1XZOA 2OADA 4L8EA 2YWMA 3QMXA 4GRFA 2H8LA 1J9BA 3A5WA 4KDUA 4ZBBA 3GKXA 4KCEA 4FH8A 5D9VA 2VM1A 2RUFA 1PMTA 2V1MA 2C0DA 3DD3A 1HNBA 2WJUA 3L9UA 2H74A 3D4MA 4IP6A 2F8FA 2IMKA 1TJDA 4MJBA 4KX4A 3W6GA 1EOHA 3F6FA 1A2JA 4OWYA 2FY6A 2K6VA 3U6VA 3UVTA 1GSQA 4YQMA 2L6DA 2REMA 3D21A 1EGRA 3IBHA 5J9CA 1YJ6A 2FA8A 3UARA 3ZTLA 2PN8A 1K3LA 1GSEA 1G6WA 1O73A 3IAM2 1QMVA 2TRXA 4TVEA 3O76A 2PGTA 4O32A 4XRAA 5IMZA 4EL1A 5HR1A 2E2MA 3Q18A 1PN9A 5ELGA 1E6BA 1URMA 4TN8A 3A2WA 1GTBA 4G2EA 3RHCA 1GUMA 4F0BA 2GZYA 19GSA 2CVKA 1K0AA 4GQFA 3TJFA 1F37A 1DSBA 1AC1A 1SJZA 4LA1A 1A0RP 2H75A 4BVYA 4WKWA 1QXHA 1YKAA 4MA9A 1F3BA 1O8WA 1OKTA 4HUAA 5CAXA 3J7Yb 4MJCA 3FKFA 3HKRA 2VL2C 3ZVJA 4MF7A 3RHBA 2FWHA 3ERFA 4TXOA 2GVPA 4TR0A 3IHQA 2G0FA 2H1BA 3TUEA 5B8AA 5IIZA 4N0ZA 3L9SA 3I69A 5DQSA 1OYJA 5COHA 2CVBA 1NW2A 2HFDA 4DSSA 2YP6A 6GSWA 2L4QA 4TXVA 2NBSA 3ZIJA 3WGXA 3KMNA 1PA3A 5JCUA 2YOIA 2PBJA 3ZRDA 1GSUA 2F8AA 3KM6A 4O5RA 4I97A 4ZXGA 1G7EA 1V9WA 1O81A 5JWQB 4O92A 5F0GA 1OE8A 4MJEA 3CTGA 2O7KA 5D9WA 1Z6MA 3RBTA 2B5EA 1S3CA 3BCIA 3UIWA 3GL5A 3LEFA 4TR3A 5IOWA 3IRAA 13GSA 2B1KA 2GSQA 1DE1A 4J2FA 5JCWA 3FR9A 4G9HA 2G2QA 2OBKA 3BD2A 1JZOA 18GSA 2IL3A 2R5GA 1RK4A 4GQCA 1ZGNA 1XOBA 5B6MA 5CRGA 1YF0A 3H79A 3Q6OA 3VFIA 4X1UA 3UMAA 3EMPA 2LS5A 4E8HA 3QFAC 4I2TA 2HI7A 1UC7A 1WJKA 3GSSA 1XVQA 2N5BA 1XXUA 2HZEB 2RLIA 2MMOA 1Z5YE 3LJRA 4NXIA 4POKA 2YWOA 2K9FA 5IO0A 2C0EA 1NHOA 2VD1A 2O87A 4IP1A 4PX1A 4ZIJA 2H1DA 1GNWA 2RM6A 2CQ9A 3EC3A 2GQKA 5HR3A 1KNGA 5CRDA 1XFLA 3UBKA 5IPGA 1ZYEA 2IWTA 3G9BA 4AJ8A 3F4RA 3ZVJD 4MP4A 4ZL8A 3TOUA 3VURA 4IJ3A 2KUCA 1QQ2A 2P0GA 4K0NA 5CYYA 1YEXA 2K8SA 4GXZA 2XBIA 3GTUB 4MH3A 2YV9A 5INYA 3HY2A 3QAGA 2ON5A 5CNWA 1K0BA 4PXOA 3QPMA 4WF4A 1GH2A 1A24A 4KCAA 4HJ2A 2GTUA 2B7KA 1ABAA 1C72A 1JHBA 3PGTA 4TKYA 1X5EA 1VF1A 4TW5A 3R2QA 2CX4A 22GSA 4MF6A 1TK0B 2IMIA 3ERWA 4GSNA 4IKHA 2VCXA 2YN1A 7GSSA 4LMVA 1GLPA 1ZOFA 2V41A 5C04A 4F9ZA 2HZFA 1WIKA 1R7HA 4L5LA 3BBYA 3HJPA 3WGDA 2GLRA 4NAXA 3F6DA 1K0OA 2JADA 5FT3A 5FWGA 1TK5B 5EL8A 3TKPA 5KN3A 1KTEA 2QGVA 4ACSA 4KSOA 2L6CA 5HFKA 4D73A 2VCQA 2HE3A 2I81A 2YJ7A 5B8BA 2AYTA 3ME7A 3ZZXA 5DBQA 2GQMA 1TRVA 5HR2A 1PL2A 1XWBA 3DMLA 6GSUA 3H8QA 4EVMA 5F8BA 4HZ4A 4ZBAA 4ZB6A 4ZB9A 6GSYA 3KCMA 2DJ0A 3GIXA 3C8EA 4CHSA 2DSAA 3P2AA 4KAEA 5IM9A 2YZHA 2IMDA 2GSTA 1NSWA 2CAIA 1BEDA 3LYKA 3M0FA 3E3EA 3U5RE 1KEBA 5ECSA 1JFUA 5F06A 1GRXA 3F8UA 2H1GA 3GTUA 4K9ZA 4JRRA 3EU4A 4ZB8A 2DIZA 2O8VB 2YWIA 3ZMLA 2GGTA 3VWWA 2YV7A 2HRNA 5D9TA 1B9YC 1EEMA 5F05A 4WEYA 3F3QA 4PURA 3KMOA 3C71A 1JLWA 3RPNA 1GP1A 10GSA 5DDLA 3SBCA 3DWVA 3L4NA 1Y25A 4PUFC 5DQYA 4V1Ag 4OO5A 2C1YA 2VL2A 1MTCA 1B4PA 1LJRA 1QGVA 4K0GA 4K8MA 1SKWB 3D6IA 3DXBA 1FB0A 4L5OA 1OVNA 1M2DA 3QOUA 2E0QA 5HR0A 4HDEA 5CRWA 1K0CA 1W89A 5DJLA 3KJYA 4AJ6A 4OFNA 1AW9A 3D0ZA 2V6KA 2WDUA 2YZUA 14GSA 2YCDA 4FIWA 5HQPA 1Z7PA 2VO4A 1WMJA 2PPTA 1SYXA 3LXZA 4IVFA 2CA8A 1OAZA 1VGLA 4MLYA 1X9MB 4MK3A 5HFIA 2C4JA 1X9WB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite