2LTKA

Solution structure of a monomeric truncated mutant of trypanosoma brucei 1-c-grx1
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
GAMVKKDIDDTIKSEDVVTFIKGLPEAPMCAYSKRMIDVLEALGLEYTSFDVLAHPVVRSYVKEVSEWPTIPQLFIKAEFVGGLDIVTKMLESGDLKKMLRDKGITCRDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma brucei
publication title Iron-Sulfur Cluster Binding by Mitochondrial Monothiol Glutaredoxin-1 of Trypanosoma brucei: Molecular Basis of Iron-Sulfur Cluster Coordination and Relevance for Parasite Infectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mono-cysteine glutaredoxin
total genus 29
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ltkA01
3TOUA 2HZFA 5DALA 2IMIA 1WMJA 3ZZXA 2YWNA 2QC7A 1OC3A 5ECIB 3GKMA 2JSYA 4XIHA 1SKSB 5HQPA 3BBYA 4NMUA 2H1AA 3VWWA 1HNBA 2TRXA 2FWFA 2LRNA 2HRFA 1A8LA 4D73A 2V1MA 3ZIVA 2FUG2 1DE2A 1PD21 1O7UA 5IMVA 2F51A 1B9YC 4XRAA 1XOBA 3ZIJA 4AGSA 1TRVA 1T00A 4P3YB 4MZCA 3HJMA 2EC4A 3CSIA 18GSA 1TU7A 1B9XC 4HDEA 2B7JA 3DGQA 3GKKA 5IMZA 3ZYWA 5B6MA 3UJ1A 3HVXA 5J41A 3QAVA 2AYTA 2JSZA 4L8EA 4BVXA 1QGVA 3QD9A 1RK4A 2AV4A 4GQFA 4XS4A 1YKAA 3M0FA 1N8JA 2DJ1A 3UEMA 2KP2A 4EF0A 4MA9A 2H73A 5FHIA 4XCSA 4GSSA 4XS1A 1ABAA 2WCIA 3DD3A 1WPIA 4TR3A 3TCOA 4DSRA 4ML6A 1V2AA 5ECQB 3F3RA 5B8AA 5CREA 2VM1A 5H5RA 1NHOA 6GSWA 1GWCA 2VCTA 4F0CA 5IOWA 2VD1A 1H75A 4IKHA 2H66A 2WGRA 1MD4A 4WEYA 1R5AA 1YZXA 1ZMAA 1GTAA 4GRFA 4NWYA 5DJMA 3KH7A 2QGVA 1EOGA 3EE2A 4KDUA 5ECSA 3N5OA 3QFAC 2DIZA 5LCZA 1S3AA 4OO4A 1SL1B 5IO2A 1U6TA 3D4TA 3UVTA 4RQXA 1YKCA 3KMNA 3BJ5A 3KMOA 1JFUA 3GX0A 9GSSA 3K8NA 1T1VA 1AIUA 2K8SA 3QPMA 2GQLA 3D21A 2CQ9A 2H6XA 3D22A 2NTOA 3IA1A 3M9KA 1V57A 4Q5NA 2LKUA 2DJ3A 3KP9A 2V6KA 2YV9A 1K0MA 1EEJA 2LRCA 2CZ3A 5J5NA 3TRPA 3VLNA 2O8VB 1M9AA 3ZFLA 1WWJA 3CMIA 3N9JA 3VPTA 2IFQB 4V1Ag 3DEXA 3GMFA 1BG5A 4K6XA 4OWYA 5AIXA 2VCQA 4MCUA 4V2LA 5JCUA 4GSTA 3VWUA 5COHA 4MABA 3GSSA 3HJPA 3P8WA 4ZL7A 2I1UA 3DYRA 2KLXA 1AXDA 4OFMA 4ECIA 2OADA 1OC8A 1TRSA 4JRRA 1OVNA 4KGIA 1DUGA 5C04A 1QMVA 1YEXA 1WP0A 4POKA 3GL3A 4KA0A 2YNXA 1A2JA 1MDIA 1XPVA 1YF0A 2L5LA 3WD6A 2CVBA 4ZBDA 1XW9A 2PUKC 1OC9A 1GTBA 1NHYA 2PPTA 2HXKA 4BPYA 1SJIA 3ME7A 1E2YA 5F8BA 3ZREA 2OBIA 3L4NA 2LS5A 3VPQA 4MDCA 5L71A 5G31A 5ECRB 2VCXA 4OCEA 2H76A 5ECPB 2JU5A 1FAAA 3G7IA 4E8HA 2FCHA 3LGCA 4XHMA 1GSYA 1YDKA 1F3BA 2X64A 1Q98A 2IN3A 3AY8A 3GUSA 5IOXA 2VCZA 2HFDA 3KIJA 3F0IA 3ZTLA 4MH3A 5DAKB 1TK0B 2HSYA 2GT6A 1K0DA 3I69A 1U87A 4I97A 2J23A 2PU9C 3F9UA 2YCDA 3G9BA 5KN2A 1UVZA 3F4TA 4GWRA 4JBBA 2L4QA 3PGTA 1W89A 1LU4A 3IK9A 2OE1A 2KHPA 4K8MA 1SU9A 4N0VA 1GRXA 2RM6A 2NVLA 2CV4A 3GX8A 3W8SA 4BL7A 1PA3A 2R3XA 5D96A 1EV9A 4NAXA 1O81A 4JU5A 4K1FA 1ZYQB 3WT1A 1R4WA 2OACA 5AN1A 2C0GA 5ELGA 3NIVA 3MWHA 4LMVA 5ID2B 4I8BA 4KDXA 1EGRA 3ED3A 1VF2A 1B4PA 1IYIA 2FA4A 2FD3A 5HFKA 2YJ7A 4FO5A 1SKRB 3L78A 5ECHB 3BCIA 4TXVA 1OE8A 5EY6A 3P7XA 4KCEA 3F6FA 1R7HA 3FR6A 1BJXA 1NM3A 4QL9A 3GHAA 3TJKA 3UVHA 3GFKA 3FKFA 3D5JA 4K7NA 2R4VA 1SYXA 5ENUA 3TDGA 4POLA 4TKYA 3IK7A 1XWGA 1QFNA 4I2TA 1FB0A 5GAND 1YJ6A 5KN3A 1BAYA 3PINA 4ISDA 1F2EA 2FHEA 3WGEA 1EOHA 1KNGA 4IN0A 1SK2A 5G5EA 3ZVJD 2C3NA 2F9SA 4ZXGA 3QFBC 3G7JA 3I9V2 3ERGA 5H5SA 1V58A 4ULXA 1QQ2A 3HHVA 4BVYA 2XHFA 4HJMA 3DVWA 1OYJA 1SD8A 5J3RA 1K0NA 3TUEA 3KM6A 4CDOA 2EIQA 2B6MA 5CP1A 4IW9A 1R5PA 1Z7RA 1JHBA 3QCPA 5EL8A 3LXZA 3QDNA 3TKQA 1X9MB 4YQMA 4ZL8A 1LJRA 2GSRA 2OJLA 2VL9A 2HE3A 3IDVA 2WULA 4KB3A 1V40A 4HQZA 1HNAA 1ZGNA 3U6VA 3GSTA 5HR3A 1SJZA 2CZ2A 3MNGA 3EU3A 1O85A 5CRGA 1K0CA 2H6ZA 4TOPA 4EXJA 2AUVA 5G30A 4AJ6A 4TXOA 1PGTA 4V2MA 2GQKA 3TKSC 3BOAA 4LL4B 1M9BA 2CAQA 3IV4A 3IE3A 2QKEA 4PGTA 1Y6EA 1GSQA 5AGYA 3UBKA 5C00A 3NOFA 2K18A 2LRTA 2LTKA 3TJGA 2R2JA 3FZAA 2BJXA 4I2UA 3E9JB 4NPBA 1VGLA 4FYCA 2IWTA 1JLVA 1HD2A 4PQHA 2MBSA 4X0XA 4IVFA 3VURA 1RW1A 3KEBA 1XIYA 4TR0A 4MPFA 2VD0A 1AQVA 1XWKA 1T4YA 4KH7A 2GZPA 3E0UA 1ERVA 2CVDA 2TRCP 3HY2A 4NHZA 5DQYA 4CHSA 4OO5A 1FW1A 5GAPD 2H74A 3ZITA 1TRWA 5D9VA 2K6VA 2YV7A 1AAZA 1FVKA 2LV3A 4K7OA 17GSA 1DBYA 2GLRA 4O32A 3P2AA 1EEMA 4OFNA 1WJKA 1VF3A 1PKWA 3ZLPA 3HVSA 1SL2B 3IAS2 1Z5YE 3LSZA 2O7KA 3A3TA 1XW5A 3IAM2 1TDIA 5JCGA 3ERWA 2FA8A 1V98A 2C8UA 4KW6A 1G7EA 4YAVA 1MTCA 3OR5A 4Z7XA 2M72A 2P5RA 2HNLA 5ELAA 4F0BA 3GIXA 2H30A 4G9HA 1GNEA 1ZCPA 3DMLA 4XTSA 4O7HA 4N11A 2RUEA 4ZBBA 5G5FA 5D73A 2PMTA 5GSTA 2OE0A 3IOSA 2J9HA 2VLVA 2K9FA 3TJBA 4XRDA 1E6BA 3DXBA 2H8LA 2VLUA 2VUPA 3GV1A 1T8EB 2VCWA 4MZBA 5E4WA 3FW2A 2GSTA 1U3AA 2GQMA 5HFGA 3FY7A 3FK8A 2FWGA 2N5AA 2H19A 3QOUA 4IHUA 1ZYEA 2VL2A 4EVMA 4GTUA 3ZRDA 4ECBA 1ERWA 1TXXA 4L0UA 3QMXA 1M99A 5B7CA 3EWLA 2E2MA 1SKWB 3ZFBA 2F3MA 4ILFA 4MH2A 1GSFA 5JCWA 4L5OA 1HQOA 4HU9A 3APOA 1S3CA 3GTUA 3CBUA 1JZDA 1YY7A 4YQVA 2H0IA 2JACA 3DWVA 4EKZA 5F06A 4QL7A 4K0NA 3UIWA 1FOVA 2IMKA 1TOFA 3EU4A 2DLXA 5DALB 2C0EA 2LUSA 2YANA 5DDLA 2B5EA 1EWXA 19GSA 3KD0A 5DBQA 2FLSA 1TI3A 1XBSA 2G2QA 4I6XA 3KP8A 4MJEA 2XC2A 2A4VA 4ZB9A 3HA9A 4D73B 2HT9A 3LYPA 2I3YA 1X9WB 1GTUA 4WF5A 1CQGA 1ML6A 5A4UA 4FH8A 1GSSA 4EC0A 2BMXA 3UL3A 4F9ZA 2HRNA 1GUMA 3NZNA 1TI1A 3VK9A 3LJRA 2CT6A 2OA7A 1XVWA 2YN1A 3BCKA 2HZEA 3IR4A 2JL4A 1F3AA 2ON7A 5GSSA 3CTGA 4ZB6A 4IP1A 4XS4B 2RM5A 4EDZA 2AJQB 4DVCA 3A2VA 4MJCA 2LJAA 2A2RA 1G0TA 3GH6A 3M3MA 2WDUA 2H01A 3LG6A 2RLIA 4NV5A 2C3QA 4KDYA 6GSVA 3QR6A 3LORA 5IPGA 4GQCA 3Q18A 3MSZA 3VI7A 1PRXA 6GSXA 2P31A 2B5XA 1JZRA 4N0ZA 4HZ4A 2WZ9A 5DCHA 3SBCA 2V41A 4KNDA 2DJJA 4EE0A 4G10A 2N5FA 4HI7A 4PNGA 2JADA 2LEGA 2H72A 1THXA 1NW2A 1C72A 3ME8A 2GZZA 5IIZA 4K9ZA 1PSQA 1F37A 2MMZA 3IBHA 4TR1A 3G7YA 4J2FA 2H0GA 1ERTA 5ECMB 1R26A 2QSIA 1THOA 5HR2A 3TRQA 1K0AA 1XWCA 2KOKA 4GXZA 1XW6A 4WF4A 2ES7A 5CO3A 4YAPA 3FEUA 1TW9A 3CRTA 2VM2A 1XFLA 4V2NA 2YOIA 4HJ2A 4FYBA 1J0FA 1H4OA 2L5OA 3RHBA 1ST9A 3HJOA 13GSA 2GZYA 1XVQA 3I6AA 1M0UA 2PGTA 2O89A 2PN8A 3CXGA 2GT5A 2H1DA 4F82A 1A8YA 3GURA 2VO4A 3C73A 1FHEA 1QUWA 4MMMA 4JEDA 3D4MA 3KXOA 3TJJA 4G19A 4F03A 2IPAA 2H71A 5DQSA 3WYWA 1FB6A 1EGOA 4J56E 1X0RA 3I43A 1XXUA 5F07A 5GZZB 2OKAA 4HOJA 4DSSA 5CRDA 5A4VA 4GSNA 5E59A 3MDKA 5IMDA 1A2LA 2H0HA 5D9XA 1SK0A 1WE0A 1XWBA 3GL5A 4H86A 2GS3A 1PL2A 1OC9B 1WOUA 2FNOA 2CX3A 4O92A 1B4QA 1XCCA 2GDRA 2YZUA 3FZ4A 4WXTA 4ZL9A 2IJYA 1BEDA 2GSSA 2HYXA 4X43A 2IMEA 6GSUA 2WS2A 5IMFA 1O8XA 2DMLA 2X8CA 1K3LA 2PERA 1X9SB 2L4CA 4DSQA 1QK8A 4EDYA 1AQWA 2LQQA 1K3OA 3H1NA 1TP9A 2WJUA 2P5QA 3GH9A 1AC1A 1HYUA 4WETA 1AW9A 1NSWA 4FYUA 4JZQA 2YP6A 1KBNA 3EC3A 1J08A 3W6GA 4KCAA 1V9WA 2C80A 1O73A 3F63A 5F0GA 4L5LA 4K0GA 1WRYA 2FWHA 4HS1A 4IS0A 3WT2A 3EVIA 3GA4A 2X8GA 5G1KA 2GSQA 4ZIJA 4KUNA 4Q5RA 1Q4JA 3APSA 2WFCA 3EMXA 1TRUA 3C7MA 2YWMA 1F9MA 4TVEA 2REMA 2XPEA 5IM9A 4IQAA 2PWJA 2LSTA 3M9JA 2FGXA 2R37A 3LQ7A 1A0RP 2JZRA 5CAXA 3M8NA 4ACSA 1GULA 3F4SA 3D6IA 4PUFC 1F6MC 4WBJA 4IELA 3HYPA 4HZ2A 2JZTA 5DCGA 2O85A 3LXTA 4ZILA 4MZWA 1QXHA 2M80A 3TOTA 3VWXA 3RAZA 2RIIA 2K8VA 3CTFA 3KGKA 1K0BA 2E7PA 2VOCA 2DC5A 2G0FA 3TJFA 3VWVA 3UARA 2B1KA 7GSSA 3DIEA 1ZZYA 2DIYA 4OCFA 4IJIA 1KTEA 4BWSA 6GSSA 3APQA 6GSYA 2BTOT 2B3SA 1N2AA 3QAGA 3FRCA 4L0WA 3FHKA 3PH9A 4I5QA 4LMWA 3HVVA 2IIYA 1G7OA 2FY6A 5INYA 2H6YA 1YF1A 3A2WA 4AJ8A 2AB6A 2HLSA 1O8WA 3WGXA 2YWOA 3TKSE 2N5BA 3W8JA 3H8QA 2DMMA 3KCMA 3M1GA 4OMVA 4O5RA 4Q5FA 2IMDA 1OKDA 4KSMA 3C8EA 5D93A 3KZQA 1OE7A 2F8FA 3CRUA 2VLTA 2DJ0A 3CSJA 3ZVJA 2YPMA 3A2XA 1GTIA 5IMAA 3RDWA 3CSHA 4PQ1A 1TU8A 4PQIA 1PKZA 2PVOC 2EIOA 4BWQA 1U88A 5JWRB 5J9BA 2L6CA 1ON4A 2LNSA 2V32A 3RPNA 1A23A 4TXOB 1SENA 3RPPA 1GUKA 4MF6A 4PNFA 2IFQA 5F05A 1T4ZA 2MMNA 1MDJA 2YJHA 2AAWA 4ID0A 4PXOA 4EUYA 2X99A 1SL0B 3H79A 5B6NA 10GSA 4IQ1A 6GSTA 4ECJA 1ILOA 2V6OA 5JWOB 2MYGA 2GVPA 4E8EA 4RI6A 5LD0A 3QAWA 1GLPA 4PURA 4F2IA 4PX1A 2XBQA 4X1UA 1I9DA 1TK8B 2WB9A 4JE1A 2A2SA 2O87A 2H1GA 3BD2A 2NDOA 1UN2A 4EO3A 3SWLA 2KUCA 3C1RA 3ISOA 2CAIA 1B8XA 1G6WA 4MPGA 1URMA 1JZOA 5JWQB 2R5GA 2TIRA 1YQ1A 2E2GA 1T7PB 2Z9SA 8GSSA 1GUHA 2FWEA 4HQSA 1EZKA 5H5QA 5CRWA 3D0ZA 5D9WA 1X5CA 2HSHA 3P90A 3HZ4A 2ZNMA 4TRXA 5G1LA 3UAPA 4N10A 1M2BA 2E0QA 4Q5QA 1GH2A 3IC4A 1PQNA 5A5KA 2C1YA 3GN3A 1EP8A 1Z9HA 3LEFA 5DAKA 3WGDA 3FZ5A 3LYKA 1O6JA 4G2EA 3U5RE 4JR6A 1M2DA 2LQOA 3HZ8A 1TK5B 11GSA 1GSDA 4IJ3A 5CNWA 1YEPA 3FR3A 3EMPA 1GSUA 2VAFA 4KX4A 1KEBA 1K3YA 5IO0A 1SYRA 5FWGA 2LNTA 4HEA2 4AF2A 2ON5A 2PVQA 4LLRA 4WR4A 1Z7PA 1A24A 3GKNA 3HD5A 1MDKA 1BQ7A 3A5WA 2H1BA 3ZL5A 4ML1A 1PX7A 2MBTA 3TKPA 3DKSA 4AJ7A 4MF5A 3Q6OA 4XS6A 5ID2A 2WRTA 5D9TA 4J57E 2ALBA 2H75A 2C3TA 3GTUB 3F4RA 2I9HA 4EL1A 1X5EA 2C0DA 2HI7A 4GLTA 1MD3A 1S3DA 1T3BA 3C1SA 5AIVA 3MAKA 1A0FA 1FVJA 2B1LA 3L0HA 1Z6MA 2L6DA 1AUCA 1M2AA 5G2ZA 3TKSA 4WR5A 1AQXA 1G6YA 2V2GA 4GCIA 1ZL9A 1XOAA 1GP1A 4MJAA 4MK3A 3C71A 14GSA 1JZWA 2D2ZA 1PN9A 5KN0A 5HR1A 4HUAA 3J7Yb 3L9VA 3UOMA 1LBKA 3ZMLA 1ERUA 3Q19A 1K0OA 2CVKA 4RUVA 5IPHA 3HDCA 5J4UA 3RBTA 2DJKA 1Z6NA 2ZUPA 4POBA 2B5YA 1UC7A 3E3EA 1GSEA 4JR4A 4LA1A 2KP1A 3O3TA 1HNCA 1USBA 2OE3A 4N30A 5LNKe 2GTUA 2HZEB 3CYNA 4NHWA 4WBRD 3FR9A 3TB2A 3FZ9A 3TRXA 3LWAA 4OD7A 2VL2C 2MMOA 5B8BA 4KE3A 5EVOA 3F3QA 3H4KA 4PUAA 3IHQA 3DRNA 4K7IA 2MZCA 1U3IA 2OBKA 3GYKA 4ZBAA 4IP6A 2VL3A 1OAZA 1W4VA 2C0FA 1TTZA 2C4JA 1JLWA 2XBIA 2F8AA 2MMAA 4MJBA 2IMFA 3ERFA 4MP4A 3IPZA 1XWAA 1FO5A 2XPDA 2JZSA 1PMTA 22GSA 2CX4A 4YQUA 3EURA 3HCZA 3R2QA 2DJ2A 4HU7A 1PL1A 4TR1B 2DBCA 1XZOA 1Z3EA 1FG4A 4ECCA 2CA8A 1EV4A 2H70A 2DSAA 1ZOFA 4LL1B 1RQMA 4RI7A 12GSA 3TKRA 5DVBA 4OFTA 1A2MA 5FT3A 4NXIA 4V1Ap 5AISA 4IBPA 3F8UA 3DVXA 4KSOA 4QQ7A 3EYTA 5CYYA 3O6TA 3L9SA 2X8HA 3HKRA 3IRAA 2VIMA 3RHCA 5HR0A 5J9CA 2LJKA 2NBSA 1GNWA 5CRHA 1BYEA 3GKXA 1BX9A 3JCML 3H93A 2L59A 1SK1A 3F6DA 1SJ6A 1DSBA 2EIRA 2PBJA 2M46A 1OKTA 2GGTA 5HFIA 3KH9A 1DE1A 4WKWA 3J7Yk 2NPBA 4TN8A 3L9UA 2YWIA 1J9BA 1ACVA 4DSSB 1MEKA 4MF7A 3VFIA 5KN1A 1I5GA 4RQRA 4ZB8A 4GF0A 5ECLB 5A4WA 1X5DA 1CQHA 3Q74A 4NV2A 3PR8A 4TW5A 1TKDB 1GLQA 1VF1A 3ZMKA 5DJLA 2RUFA 3S9FA 2I81A 3UMAA 2R6KA 2L57A 20GSA 4POMA 1UA5A 2IL3A 1VRSD 1M7TA 1VF4A 3LFLA 2ZCTA 2VCVA 2LJRA 3KTBA 2B7KA 3HXSA 1GL8A 5ECOB 3FYGA 4K2DA 4TR4A 16GSA 1SD9A 3EINA 3KJYA 3V1WA 5IQYA 1EP7A 2I4AA 3GRXA 3UBLA 3TGZA 4FIWA 3KTLA 5ABRA 1PX6A 2AHEA 4MLYA 4BA7A 2P0GA 3IXRA 4YH2A 5IMCA 5ECNB 4CW9A 1TJDA 3VI5A 5KEJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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