The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
164
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structure length |
164
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Chain Sequence |
MGHHHHHHSHMNFNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYRKGFIDVSKIKCVEIVKNDDGVIPCQNKYPFQVVHDANTLYIFAPSPQSRDLWVKKLKEEIKNNNNIMIKYHPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR Structure of PH Domain of Tyrosine-protein kinase Tec from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target HR3504C
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Tec
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
31
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| structure length |
164
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| sequence length |
164
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-06-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00169 | PH | PH domain |
| A | PF00779 | BTK | BTK motif |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | PH-domain like | Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P0F A; 2DTC A; 2Y8G A; 2H7D A; 2MFQ A; 2YT0 A; 1EF1 A; 1U5F A; 2RNR B; 2EJ8 A; 2R09 A; 5C5B B; 3QWM A; 5KQ4 A; 5DIF B; 4WJ7 A; 2LKO A; 2DA0 A; 2YS5 A; 1MPH A; 2M38 A; 2COF A; 2QKL A; 2KUP A; 1FGZ A; 1Y5O A; 2UVM A; 1U2B A; 2ROV A; 4D0N B; 2L2I A; 4HB4 B; 1GG3 A; 3VOQ A; 3ODX A; 1KZG A; 2CRF A; 4L6E A; 2BCJ A; 5J3Y A; 5CLL B; 2LYD A; 1GC7 A; 5JHG A; 4HB0 B; 1LW3 A; 2MKR A; 4Z2N A; 4A5K A; 2J0K A; 4YON A; 1V61 A; 1WG7 A; 4NY0 A; 3KZ1 A; 2K00 A; 2COA A; 2UZS A; 1U27 A; 1FGY A; 1OMW A; 4CHJ A; 2W2X C; 4ZRK A; 4DX8 A; 1EVH A; 5J3Q A; 1FHX A; 3BIN A; 3O96 A; 3HQC A; 2D10 A; 2Z0Q A; 3AJ4 A; 4TYZ A; 3P7Z A; 3DXE A; 2VRW B; 3FM8 C; 4WVF B; 1PFJ A; 1NTY A; 1V5M A; 1WJ1 A; 4GN1 A; 2COC A; 2I1K A; 3PZD A; 5C79 A; 4YL8 A; 2DX5 A; 2DKP A; 3A98 B; 1Y19 B; 4KAX B; 3PVL A; 4HAY B; 1UNR A; 1NTV A; 1UPR A; 4F7U P; 1BTK A; 2AEH A; 1Q67 A; 3RCP A; 2Y8F A; 1KZ7 A; 1K5G B; 1Z87 A; 4HDQ A; 1U5D A; 4K2O A; 2YS3 A; 2D9W A; 2I1J A; 2P8V A; 3KRW A; 1QQG A; 2R0D A; 2K2U A; 4WSF A; 2YRY A; 3MPX A; 2EMT A; 3D8D A; 4NSW A; 3FSS A; 2N23 A; 3PEG A; 4MK0 A; 3ZVR A; 2CY4 A; 3GYP A; 2DFK A; 4HAX B; 1MKE A; 4TKN A; 2KCJ A; 3N7C A; 3BJI A; 3AU4 A; 2I5F A; 1TJ6 A; 4HAW B; 2XQN M; 2UZR A; 5D3X A; 4KHO A; 4EJN A; 1DDM A; 3KY9 A; 3PVW A; 3TFM A; 4P7I A; 4B6H A; 1FHO A; 1UNQ A; 2D9Z A; 4C0A A; 3AU5 A; 3TCA A; 1N3H A; 4EMO A; 3U7D A; 2J0M A; 2DHK A; 1U5G A; 2AL6 A; 2KGX B; 3ZDT A; 1X11 A; 2NMB A; 3WA0 A; 4XWX A; 1KI1 B; 1BWN A; 2ZPY A; 1XKE A; 1RJ2 A; 2YSZ A; 3DXC A; 1QC6 A; 3TVV A; 3U8Z A; 3D8F A; 5JP4 A; 1ZVR A; 1FOE A; 4PQ0 A; 1MK9 B; 2ELB A; 1K5D B; 5HE0 A; 4GXB A; 5FI0 A; 3IVF A; 1MAI A; 2I5C A; 4IOY X; 1AQC A; 2OTX A; 5HE2 A; 4GMX B; 1J0W A; 3TW1 A; 4DBB A; 1E5W A; 3FEH A; 2DYN A; 2HTH B; 2LOX A; 5GOW B; 1ZC4 B; 1I2H A; 2LUL A; 2DX1 A; 4A6H A; 5KCV A; 1X05 A; 1UNP A; 1NU2 A; 1RRP B; 2M14 A; 1P3R A; 5L81 A; 4EKU A; 1ZSQ A; 2K2J A; 5D3V A; 2ELA A; 2DLW A; 3CXB B; 2LG1 A; 4F7G A; 1WI1 A; 1XX0 A; 4ZRI A; 1W1H A; 2GCJ A; 3KSY A; 4A6F A; 1BAK A; 2DHJ A; 2RLO A; 5C6R A; 2RSG A; 1M7E A; 1X1F A; 1X86 A; 4DX9 0; 5D27 A; 5D3W A; 4IFS A; 2D2Q A; 2MDX A; 2YVC A; 2DN6 A; 1AWE A; 4CHM A; 2RGN B; 2J59 M; 2D9V A; 4HAU B; 2DYQ A; 2IFS A; 3SV1 A; 4IAP A; 2HE7 A; 3VIA A; 2W2X D; 3V5W A; 3UZT A; 3PVU A; 2RUK B; 3F5R A; 1V89 A; 1WGU A; 2YT1 A; 1WJM A; 4K17 A; 2QKM A; 1PMS A; 5HE3 A; 2Z0P A; 2Z0O A; 2Q13 A; 5HE1 A; 2P0D A; 1TQZ A; 5KQ1 A; 3ODO A; 5LOP B; 2YF0 A; 2W2W A; 5J3T A; 3GYO A; 2D9X A; 3ULC A; 4A6F B; 5JHH A; 2D11 A; 1M7R A; 5JLJ B; 1I7A A; 3QBV B; 1XCG A; 2NZ8 B; 3KRX A; 5FI1 A; 1P5T A; 2JP2 A; 1XR0 B; 2COD A; 3CIK A; 1WGQ A; 3PP2 A; 4ZRJ A; 3F0W A; 3DXD A; 1U5E A; 2H7E A; 2DHI A; 5LON B; 3TO1 A; 2EC1 A; 2Y7B A; 3ODW A; 1V5P A; 3HW2 B; 2ADZ A; 1W1G A; 3SNH A; 1GC6 A; 4K81 A; 4MT7 A; 1EGX A; 2CAY A; 4CYE A; 1H4R A; 3SO6 A; 3SUZ A; 1DRO A; 1OQN A; 2YS1 A; 5D3Y A; 4HAZ B; 2D4Q A; 3ML4 A; 2LOZ A; 1PLS A; 3SYX A; 3M1I B; 3HK0 A; 2GCL A; 4HAT B; 3A8Q A; 3T06 A; 4HHV A; 3WYF B; 1IRS A; 5DH9 B; 4KVG B; 5CLQ B; 4BBK A; 1B55 A; 1ISN A; 3ULB A; 1FAO A; 2GS0 A; 1FHW A; 1OY2 A; 1MIX A; 5DHF B; 2GJY A; 3A8P A; 3NSU A; 5DHA B; 1H10 A; 3QIJ A; 2V76 A; 2FJL A; 3MDB C; 1BTN A; 1P6S A; 1V88 A; 2MWN B; 4HB2 B; 5C16 A; 4PNK A; 2VSZ A; 2VKI A; 5DI9 B; 1ZM0 A; 4K2P A; 1MIZ B; 1MK7 B; 1XOD A; 2E2X A; 4F7H A; 2RVB B; 2G35 A; 2N0Y A; 3G9W A; 1DDW A; 4GMV A; 4GPT B; 2EMS A; 2P0H A; 3P6A A; 2OQB A; 1DBH A; 3OAN A; 2X18 A; 1UPQ A; 4Z2M B; 3PG7 A; 5C5B A; 4Y94 A; 1NI2 A; 3D8E A; 3X23 A; 1W1D A; 1ZC3 B; 5EFX A; 1V5U A; 1SGH A; 2L1C A; 1XD4 A; 4A6K A; 1EAZ A; 1LB1 A; 2IYB A; 1UEF A; 1DYN A; 1WVH A; 1FB8 A; 1J19 A; 4HB3 B; 4GZU A; 4KHB B; 1X1G A; 1DDV A; 4HDO A; 2CY5 A; 1U29 A; 4HAV B; 3PSC A; 2J0J A; 2ROZ B; 2D9Y A; 4MY6 A; 2DKQ A; 1TXD A; 4KHA A; 2PZ1 A; 4DXA B; 3LJU X; 1SHC A; 4H8S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2P0F A; 2DTC A; 2Y8G A; 2H7D A; 2MFQ A; 2YT0 A; 1EF1 A; 1U5F A; 2RNR B; 2EJ8 A; 2R09 A; 2ZKM X; 5C5B B; 3QWM A; 5KQ4 A; 5DIF B; 4WJ7 A; 2LKO A; 2DA0 A; 2YS5 A; 3NWF A; 1MPH A; 2M38 A; 2COF A; 2KIG A; 2QKL A; 2KUP A; 1FGZ A; 1Y5O A; 2UVM A; 1U2B A; 2ROV A; 4D0N B; 2L2I A; 4HB4 B; 1GG3 A; 3VOQ A; 3ODX A; 1KZG A; 2CRF A; 4L6E A; 2BCJ A; 5J3Y A; 5CLL B; 2KIE A; 2LYD A; 1GC7 A; 5JHG A; 4HB0 B; 4DIX A; 1LW3 A; 2MKR A; 4OSN A; 4Z2N A; 4A5K A; 2J0K A; 4YON A; 5LG4 B; 1V61 A; 1WG7 A; 2Z14 A; 4NY0 A; 3KZ1 A; 2K00 A; 2COA A; 2UZS A; 1U27 A; 1FGY A; 1OMW A; 4CHJ A; 2W2X C; 4ZRK A; 4DX8 A; 1EVH A; 5J3Q A; 1FHX A; 3BIN A; 3O96 A; 2Z13 A; 3HQC A; 2D10 A; 2Z0Q A; 3AJ4 A; 4TYZ A; 3P7Z A; 3DXE A; 2VRW B; 3FM8 C; 4WVF B; 1PFJ A; 1NTY A; 1V5M A; 1WJ1 A; 4GN1 A; 2COC A; 2I1K A; 3PZD A; 5C79 A; 4YL8 A; 2DX5 A; 2DKP A; 3A98 B; 5M4Y B; 1Y19 B; 4KAX B; 3PVL A; 4HAY B; 1UNR A; 1NTV A; 1UPR A; 2K49 A; 1BTK A; 4F7U P; 2AEH A; 1Q67 A; 3RCP A; 2Y8F A; 1KZ7 A; 3DCX A; 1K5G B; 1Z87 A; 4HDQ A; 1U5D A; 4K2O A; 2YS3 A; 2D9W A; 2I1J A; 2P8V A; 2FJU B; 3KRW A; 1QQG A; 2R0D A; 2K2U A; 4WSF A; 2YRY A; 3MPX A; 4QJ5 B; 2EMT A; 3D8D A; 4NSW A; 3FSS A; 2N23 A; 3PEG A; 4MK0 A; 3ZVR A; 2CY4 A; 3GYP A; 2DFK A; 4HAX B; 1MKE A; 4TKN A; 2KCJ A; 3N7C A; 3BJI A; 3AU4 A; 2I5F A; 1TJ6 A; 4HAW B; 2XQN M; 2UZR A; 5D3X A; 5I2M A; 4KHO A; 4EJN A; 1DDM A; 3KY9 A; 3PVW A; 3TFM A; 4P7I A; 4B6H A; 1FHO A; 1UNQ A; 2D9Z A; 4C0A A; 3AU5 A; 3TCA A; 1N3H A; 4EMO A; 3U7D A; 2J0M A; 2DHK A; 1U5G A; 2AL6 A; 2KGX B; 3ZDT A; 1X11 A; 2NMB A; 3WA0 A; 4XWX A; 1KI1 B; 1BWN A; 2ZPY A; 1XKE A; 1RJ2 A; 2YSZ A; 3DXC A; 1QC6 A; 3HSA A; 3TVV A; 3U12 A; 3U8Z A; 3D8F A; 5JP4 A; 1ZVR A; 1FOE A; 4PQ0 A; 3NWA A; 1MK9 B; 2ELB A; 1K5D B; 5HE0 A; 4GXB A; 5FI0 A; 3IVF A; 4QJ3 B; 1MAI A; 2I5C A; 4IOY X; 1AQC A; 1MI1 A; 2OTX A; 5HE2 A; 4GMX B; 1J0W A; 3TW1 A; 4DBB A; 1E5W A; 3FEH A; 2DYN A; 2HTH B; 2LOX A; 5GOW B; 1ZC4 B; 1I2H A; 2LUL A; 2DX1 A; 4A6H A; 5KCV A; 1X05 A; 1UNP A; 1NU2 A; 1RRP B; 2M14 A; 1P3R A; 5L81 A; 4EKU A; 1ZSQ A; 2YT2 A; 2K2J A; 5D3V A; 2ELA A; 2DLW A; 3CXB B; 2LG1 A; 4F7G A; 1WI1 A; 1XX0 A; 1T77 A; 4ZRI A; 1W1H A; 2GCJ A; 3KSY A; 2Z59 A; 4A6F A; 1BAK A; 2DHJ A; 2RLO A; 2RRF A; 5C6R A; 3NW8 A; 4D6W A; 2RSG A; 2KR0 A; 1M7E A; 1X1F A; 1X86 A; 4DX9 0; 5D27 A; 4L1R A; 5D3W A; 4IFS A; 2D2Q A; 2MDX A; 2YVC A; 2DN6 A; 1AWE A; 4CSQ A; 4CHM A; 2RGN B; 2J59 M; 2D9V A; 3FVC A; 4HAU B; 2DYQ A; 2IFS A; 3SV1 A; 2R2Y A; 4IAP A; 2HE7 A; 4HSI A; 3VIA A; 2W2X D; 3V5W A; 3UZT A; 3PVU A; 2RUK B; 3F5R A; 2NBV A; 1V89 A; 1WGU A; 2YT1 A; 1WJM A; 4K17 A; 2QKM A; 1PMS A; 5HE3 A; 2Z0P A; 2Z0O A; 2Q13 A; 5HE1 A; 2P0D A; 1TQZ A; 5KQ1 A; 3ODO A; 5LOP B; 2YF0 A; 5IRS A; 2W2W A; 5J3T A; 3GYO A; 2D9X A; 3ULC A; 3OHM B; 4A6F B; 5JHH A; 2D11 A; 1M7R A; 5JLJ B; 3A58 A; 4QJ4 B; 1I7A A; 3QBV B; 1XCG A; 2NZ8 B; 3KRX A; 3NWD A; 5FI1 A; 1P5T A; 2JP2 A; 1XR0 B; 2COD A; 3CIK A; 1WGQ A; 3PP2 A; 4ZRJ A; 3F0W A; 3DXD A; 1U5E A; 2H7E A; 3HIE A; 2DHI A; 5LON B; 3TO1 A; 2EC1 A; 2Y7B A; 3ODW A; 1V5P A; 3HW2 B; 2ADZ A; 1W1G A; 3SNH A; 1GC6 A; 4K81 A; 4MT7 A; 1EGX A; 2CAY A; 4CYE A; 1H4R A; 3SO6 A; 4OT1 A; 3SUZ A; 1DRO A; 1OQN A; 2YS1 A; 3B77 A; 2K8E A; 5D3Y A; 4HAZ B; 2D4Q A; 3ML4 A; 2LOZ A; 1PLS A; 3SYX A; 3HK0 A; 3M1I B; 2GCL A; 4HAT B; 3A8Q A; 3T06 A; 4HHV A; 3WYF B; 1IRS A; 5DH9 B; 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