2MBSA

Nmr solution structure of oxidized kpdsba
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
190
structure length
190
Chain Sequence
SNAQITDGKQYITLDKPIAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVRQKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKDLTQAWAVAIALGVEDKITAPMFEAVQKTQTVQSVADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMYVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVAQYADTVKQLVEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative Sequence, Structure and Redox Analyses of Klebsiella pneumoniae DsbA Show That Anti-Virulence Target DsbA Enzymes Fall into Distinct Classes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
source organism Klebsiella pneumoniae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 48
structure length 190
sequence length 190
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2mbsA00
3TRXA 5ENUA 3CBUA 5EVOA 2FGXA 2HNLA 3M1GA 2HSYA 4RQRA 1K0CA 3I9V2 1SK2A 1MTCA 1T7PB 5G1KA 4YQVA 2GZZA 2I1UA 3F63A 4JE1A 1M2BA 4I2UA 4RI6A 3KH7A 2IPAA 1SJZA 4GLTA 3IPZA 1AUCA 5IPHA 5CRGA 2PPTA 1CQGA 1ZMAA 2YWNA 1QUWA 4Q5NA 4HU9A 1ZYEA 4Q5RA 3UAPA 4G10A 2MBTA 1U88A 1R26A 3APOA 2XPDA 5CRWA 2N5AA 4HS1A 1FO5A 3DVXA 3M0FA 5HR1A 3WYWA 1WOUA 9GSSA 1S3DA 3GMFA 5IO2A 1EWXA 3Q6OA 3ISOA 3HY2A 1F9MA 2ZUPA 3VWXA 4OFNA 4V1Ag 4ECIA 1URMA 5ELGA 4KDXA 5D93A 1I9DA 1QQ2A 4JRRA 6GSSA 3KIJA 4WF4A 1Y25A 3KMOA 4WBJA 4RQXA 5IM9A 4TN8A 2F51A 2H0HA 3GTUB 2PU9C 2DJKA 4EXJA 3KMNA 3LYKA 3L78A 5GSSA 1GSSA 2N5FA 3KP9A 1XWAA 3D4TA 5IQYA 1SK1A 2O8VB 1F6MC 3F0IA 2JZRA 4IP6A 3DD3A 3SWLA 4J57E 2DJ3A 2IMDA 3VWVA 1A23A 1TXXA 1SD9A 4ZL8A 3C8EA 5IIZA 3BJ5A 3I43A 4KW6A 2L57A 1VF3A 4HUAA 1OKTA 4EUYA 1PX6A 1ERTA 4PURA 4DVCA 2KUCA 2O85A 3FY7A 3GX8A 4GRFA 4BVXA 3FZAA 2JACA 3MNGA 5LD0A 5ECQB 2HI7A 4DEJA 1DUGA 1GH2A 4JR4A 2JZTA 4ZIJA 3F3RA 1J08A 4K6XA 1WPIA 1KTEA 5ECNB 1FOVA 2H8LA 2MMOA 5H5SA 2VM2A 4TR1A 5DQYA 3GNJA 5B6NA 2RLIA 3IDVA 1Z6MA 2H1AA 5DVBA 3H93A 1XW5A 1GUMA 3GL3A 5C00A 3ZZXA 1QFNA 1O85A 1TRVA 4BVYA 1XW6A 4PX1A 3CRTA 4TVEA 1X9MB 1MDJA 5ELAA 3GA4A 3TRQA 2PUKC 3H4KA 3P7XA 3TCOA 2H01A 1CQHA 3A2VA 2L6CA 3EINA 5CREA 3GKKA 5C04A 2L4CA 3H8QA 3VWUA 3J7Yb 3W8JA 3LG6A 3O6TA 1YY7A 2G0FA 4IVFA 2C8UA 1FVKA 1ZGNA 3UL3A 3P2AA 2V6OA 4ILFA 1ST9A 4Q5FA 3QMXA 3LXTA 4O7HA 3MDKA 2PN8A 3LWAA 3IE3A 3ZFBA 3DRNA 5G5FA 4OO4A 2KHPA 2ZNMA 4PQ1A 3GKXA 2EIOA 2NVLA 3CRUA 3LGCA 1YQ1A 2WRTA 4BL7A 3PGTA 1LJRA 3QOUA 1T4YA 5HR2A 3UBKA 2K8VA 5KN3A 2A2SA 2A4VA 3TKRA 4PQHA 3FZ4A 1THXA 1XVWA 1H4OA 2WULA 5H5QA 3LXZA 1BYEA 4KNDA 4L8EA 2YWIA 2B6MA 4KGIA 4POMA 4NHZA 2I4AA 4JBBA 4HOJA 4FYUA 1O8XA 3S9FA 2H1DA 2VCTA 3GTUA 1J9BA 5DDLA 1VF4A 4G19A 2YZHA 4LA1A 2K8SA 2TRCP 2PVOC 4HZ2A 2DJ1A 2DLXA 2HRNA 3O3TA 1FB6A 2YV9A 4ID0A 1HNBA 2PGTA 4J56E 1GL8A 3FR9A 4RI7A 2WB9A 1HYUA 2E2GA 4F9ZA 1PL1A 1R4WA 4MZCA 2B7KA 4ZB8A 4ZL9A 1SJIA 2DSAA 4MF6A 2VCQA 2GSSA 4WF5A 4IP1A 2CX4A 4K7OA 3CSIA 1B9XC 5KN2A 4AJ6A 2MMZA 1ZZYA 2HE3A 4TRXA 5ECRB 1BX9A 1GRXA 3EVIA 2YN1A 1ERVA 5HFGA 1PKZA 4TW5A 1A2JA 4KE3A 3FR3A 2FD3A 5D96A 1G7EA 1GSYA 6GSXA 1MD3A 2YZUA 6GSVA 2VL2A 1O6JA 1S3AA 2GGTA 2CT6A 1U3IA 5LCZA 2H1BA 5COHA 3ZVJA 2LRNA 2WGRA 2OKAA 4V2LA 5HR0A 2GS3A 3HJOA 2GZPA 1O81A 1QXHA 4JR6A 4N11A 3UMAA 4NWYA 3NIVA 5FHIA 2LNTA 2RM5A 1NHOA 2WJUA 3H1NA 3GH9A 1A8YA 2IL3A 3L9UA 4J2FA 2VCXA 3QAVA 3BD2A 1Q98A 4V1Ap 1YF1A 3TUEA 3P8WA 2IN3A 1YKAA 4X0XA 1VGLA 3EMXA 4FO5A 5H5RA 1NSWA 2PERA 1TK8B 1M0UA 1TW9A 2EC4A 1GTUA 4HZ4A 2B1KA 1TRUA 5B7CA 2CAQA 5CRDA 2LQQA 4MPFA 3RPPA 2ALBA 4PUFC 5GZZB 3TRPA 2C3NA 4LL4B 1QGVA 4Z7XA 4OCFA 3ZIVA 3TB2A 1TRSA 3NZNA 4MK3A 1Z3EA 3D5JA 3CYNA 5JCUA 2XBIA 3QPMA 2RUFA 4JZQA 1V40A 2O87A 2GQLA 4LLRA 2QC7A 2LJKA 3US3A 1YKCA 4ZBAA 5AGYA 5CAXA 5KEJA 4XIHA 2L59A 4ML1A 4LMVA 1F2EA 1JZDA 3KM6A 3M9JA 3ZLPA 1NW2A 1FVJA 4I5QA 5IMAA 3C1SA 2FLSA 5DAKB 2IWTA 1T8EB 3ZFLA 4OCEA 5GAPD 4HDEA 1K0AA 3LEFA 3VWWA 1VF1A 1N8JA 3UJ1A 4I8BA 1SL1B 1QMVA 4IW9A 5E59A 2TRXA 7GSSA 3VLNA 1M2AA 1M2DA 1T4ZA 4YAPA 2YJHA 1J0FA 3NOFA 2YANA 4WBRD 1YEXA 4IELA 5HFIA 4KB3A 4MJAA 4TR1B 4CHSA 3BCIA 5D9TA 2QGVA 2MMNA 4K8MA 2MZCA 1RQMA 4OFTA 1SU9A 4CDOA 1MD4A 5KN0A 3IA1A 1AW9A 2R37A 4ZB6A 1K0MA 4K7NA 4EDYA 5DALB 3GIXA 4E8EA 1JLVA 1EEMA 2E0QA 4EE0A 4NAXA 3EMPA 3QR6A 1Z7PA 3SBCA 11GSA 3QCPA 5ECIB 3TKSA 1K3LA 2YPMA 1GLPA 3KP8A 3IAM2 4YAVA 2X64A 4O92A 1VF2A 1X5EA 3HA9A 3EURA 1X5CA 3E9JB 3UBLA 4ZL7A 2VD0A 3RAZA 3Q19A 3ZMLA 1ERUA 2QSIA 1Z5YE 2B7JA 1GSQA 3ERFA 2YJ7A 1WJKA 3FHKA 3U5RE 2DJJA 1Z7RA 4KH7A 5ECOB 1FHEA 2C4JA 3TOTA 3DYRA 5HFKA 2AB6A 1A24A 3HJMA 4I6XA 1PRXA 3L9VA 6GSWA 2M46A 3O76A 2IIYA 1XWKA 3GURA 4ECJA 3FR6A 3RDWA 1EP7A 1XZOA 3HVXA 4ZILA 3UEMA 3TJGA 3TDGA 3LQ7A 2KP2A 4MPGA 2H1GA 4IQ1A 3TOUA 1WMJA 2BJXA 3FEUA 5G2ZA 2DC5A 2DJ0A 2DJ2A 1GUKA 3D6IA 1T1VA 4NMUA 1PMTA 3WT2A 1XPVA 2H75A 1WP0A 3A2XA 3TJJA 3L9SA 5FT3A 4H86A 2IJYA 3F9UA 1V58A 4X1UA 1NM3A 4PQIA 1V9WA 4KA0A 2GLRA 1YF0A 4MZBA 1YZXA 2H66A 2GQMA 5HR3A 3FW2A 5E4WA 3KGKA 2K18A 2B5XA 5AIXA 5DAKA 1EGRA 1TTZA 2J23A 1K3OA 1GTIA 5G31A 5CNWA 1V57A 1F3BA 2Z9SA 2DMLA 2LUSA 3QAWA 2HZFA 2ZCTA 12GSA 3P90A 4MH3A 2C3TA 1ACVA 1ZL9A 3DMLA 1V98A 3MSZA 1MDKA 1HNCA 2JSZA 4N0VA 4EO3A 3WD6A 5G30A 3ME7A 1OKDA 3M8NA 2RUEA 2FWGA 8GSSA 2JSYA 3V1WA 1ON4A 1USBA 1O7UA 4AJ8A 3EC3A 1UA5A 4K1FA 3TJFA 5INYA 2WZ9A 1VRSD 4TR3A 3MAKA 5DALA 2HXKA 20GSA 4KSOA 3RHBA 5ECLB 2GQKA 2C0DA 3KCMA 4PGTA 3DGQA 3QFBC 1TU8A 2VO4A 3N5OA 1K0NA 3K8NA 1IYIA 3DVWA 3GHAA 1EP8A 2DIZA 2JL4A 1WRYA 2GSQA 3L0HA 2VD1A 4PUAA 3EWLA 1OC8A 2YCDA 1QK8A 3CSHA 3AY8A 1TJDA 2IMFA 5JCGA 2ON7A 4XHMA 3LSZA 3WGDA 1BAYA 4TXVA 3ZVJD 3KD0A 4WETA 2VUPA 2YV7A 4HQSA 4QQ7A 2LS5A 2CVDA 5D73A 5B8BA 2GT6A 4EC0A 4POKA 4XCSA 2GSRA 1W4VA 1GSDA 1JZOA 4IS0A 3GH6A 5CO3A 1AXDA 1Y6EA 1JLWA 1A8LA 1M9AA 2CVKA 2NBSA 4QL7A 3WGXA 1K0BA 1AIUA 5EY6A 1XWBA 4JEDA 2C0FA 1E6BA 2CX3A 5HQPA 1ILOA 1AAZA 1XWCA 3DXBA 2H73A 3QFAC 2HFDA 1G0TA 1U3AA 2C0GA 4TR4A 5DJMA 2C3QA 4IBPA 4KAEA 1F3AA 2R2JA 5D8IA 3Q18A 3G7JA 4XRAA 4YQMA 1PN9A 2HZEA 2ON5A 5J9BA 2FY6A 1R5PA 1GSFA 1RW1A 2NDOA 2EIQA 2FUG2 3HHVA 4G2EA 3GSTA 1V2AA 1LBKA 1PA3A 4OFMA 4IJIA 3WT1A 4MA9A 2HRFA 5JCWA 3LJRA 1OYJA 1FG4A 1XVQA 1G7OA 1GNWA 3QD9A 2AUVA 3LFLA 1X5DA 4L0WA 1XIYA 2YP6A 3DKSA 4EDZA 2WFCA 3IAS2 2FA8A 1H75A 2IMKA 1R7HA 2H72A 4WXTA 4MJEA 1GULA 4MMMA 4EVMA 2AHEA 2LRTA 3ZREA 2RIIA 4XS6A 4ML6A 2P0GA 3GUSA 4NV5A 4ZXGA 4N0ZA 1BQ7A 22GSA 3ERGA 2FHEA 4X43A 1HD2A 5B6MA 2LJRA 5A5KA 3KEBA 1A2LA 2JADA 3HKRA 3HXSA 2WS2A 2J9HA 5IPGA 1AQWA 2O89A 3ED3A 2GT5A 2YNXA 3A5WA 2C80A 10GSA 1GWCA 5IOWA 3IV4A 5DCGA 4OO5A 3UVTA 4XS1A 3E0UA 1TU7A 4KDYA 2LRCA 2GVPA 1JHBA 3FYGA 1OC9A 3G7IA 2PBJA 4K2DA 1XXUA 3FK8A 3PR8A 3HVSA 4K7IA 2VLVA 5DJLA 4OMVA 2LKUA 3TKPA 2FWEA 1SENA 1OAZA 1EEJA 4XRDA 4I97A 2QKEA 2FWFA 4OD7A 4IN0A 1T00A 2VM1A 3HD5A 17GSA 5DCHA 2XPEA 2VL2C 2H6ZA 6GSUA 1EGOA 2HT9A 1YJ6A 2FWHA 5IOXA 4XS4A 2H19A 5IMCA 4HI7A 2F9SA 3FKFA 3L4NA 1OE8A 2PVQA 2CZ2A 3IK7A 3GN3A 2YOIA 1EOHA 1N2AA 1X9SB 1TI3A 2F8AA 3IXRA 2TIRA 4YQUA 3CSJA 19GSA 2GTUA 2L5OA 2VL3A 4MLYA 5D9VA 5F07A 4GQFA 3H79A 4GF0A 1EOGA 4F0CA 2IMIA 4HJ2A 2CQ9A 3M9KA 5AIVA 1LU4A 1UC7A 1EV9A 2OE1A 2GDRA 2LNSA 4FYCA 1X9WB 2P5QA 4ULXA 4POLA 4P3YB 2VAFA 4WEYA 2MYGA 4MDCA 2C1YA 2X99A 2E7PA 2G2QA 2AAWA 2V2GA 3GX0A 2K9FA 1AQVA 4PNFA 4KX4A 4NPBA 4QL9A 3GV1A 1SYRA 3FZ9A 1C72A 1W89A 3VFIA 2BTOT 1SYXA 3HCZA 1G6WA 2OJLA 3HYPA 3VK9A 5AN1A 4ZB9A 1DBYA 3RHCA 1OC3A 1T3BA 4BPYA 2K6VA 3F6DA 1O8WA 5ID2B 2H6YA 2VOCA 2HYXA 1XOAA 1ERWA 1MDIA 4ACSA 2X8CA 3Q74A 4MF5A 3QDNA 1UN2A 2JU5A 2D2ZA 1ZOFA 14GSA 1B9YC 3ME8A 4EL1A 5JWOB 3EU4A 2B3SA 2CA8A 4IGJA 4YH2A 1DE2A 4TXOB 4KUNA 2XHFA 1GTBA 4K0NA 1U6TA 5A4WA 3UIWA 4E8HA 4HU7A 2HLSA 4MJBA 2NPBA 2DMMA 1K0OA 1PGTA 2OBKA 1FB0A 5CRHA 3CXGA 3D22A 2E2MA 5FWGA 3KXOA 5G5EA 3I69A 4GWRA 1XCCA 4KDUA 1YEPA 3N9JA 1G6YA 3BBYA 3QAGA 2H70A 4L5OA 3TKSC 3F8UA 1SKWB 2OADA 3A2WA 4AJ7A 3F3QA 1GSEA 5AISA 1SL2B 2BMXA 2OBIA 1PD21 4GSNA 2HSHA 1GNEA 5D9XA 3VPTA 3E3EA 2HZEB 5IO0A 1SKSB 2FCHA 3KTBA 4Q5QA 2ES7A 2AJQB 2LEGA 3ZYWA 2H0GA 4DSSA 4PXOA 3HZ8A 1ML6A 1PL2A 2AV4A 4MF7A 1OVNA 1I5GA 1PQNA 1KNGA 2R6KA 3M3MA 5IMDA 3JCML 5J41A 5J3RA 3U6VA 4EF0A 1K0DA 1SK0A 4G9HA 1B4PA 5IMFA 2VL9A 2XC2A 3DEXA 2OACA 3ERWA 3FZ5A 2CZ3A 4MJCA 4CW9A 4N30A 1TOFA 1TKDB 5DBQA 1EZKA 2F3MA 3TJKA 2P5RA 4HQZA 2CVBA 2VLUA 5EL8A 4V2MA 3UARA 3J7Yk 3BOAA 2M80A 2VCWA 4N10A 1TK5B 3PH9A 1DE1A 4GTUA 4MZWA 2VCZA 2H74A 2CAIA 5ABRA 3W8SA 3IRAA 4KCAA 2PWJA 4GCIA 3C73A 3I6AA 4GXZA 3IBHA 5EPFA 4PNGA 1NHYA 2IMEA 2KP1A 1R5AA 1OC9B 2IFQA 3G7YA 4DSQA 4HEA2 5ECMB 4BA7A 4BWSA 1WWJA 1BEDA 2L5LA 4NXIA 4TOPA 4ZBBA 3KH9A 5J9CA 4V2NA 1AC1A 5ID2A 2FNOA 2OA7A 13GSA 1JZRA 5F0GA 4L5LA 2EIRA 5KN1A 1X0RA 4NV2A 3C7MA 3VI7A 2H71A 2JZSA 2PMTA 3UVHA 5L71A 1WIKA 2RM6A 2V1MA 2GZYA 4TXOA 4O32A 4XS4B 4EKZA 2KOKA 1FW1A 1PSQA 4XTSA 3IHQA 3KJYA 4GSTA 2I9HA 5CYYA 3FRCA 3APSA 3RBTA 3DWVA 3GRXA 1AQXA 4GQCA 5G1LA 3DIEA 1XWGA 1SKRB 4IHUA 1KEBA 2H30A 4D73B 5F05A 1B4QA 2R5GA 2DBCA 4NHWA 3LYPA 4HJMA 2V32A 4MABA 4WKWA 4MH2A 2MMAA 4I2TA 18GSA 3APQA 3ZTLA 1UVZA 1TP9A 3EE2A 2V41A 4MCUA 3HJPA 1XOBA 5D9WA 3RPNA 1BG5A 5DQSA 3BCKA 1SJ6A 1U87A 5JWRB 1BJXA 2P31A 1M9BA 3TKSE 1PX7A 3IC4A 1XW9A 4FIWA 5LNKe 2VLTA 2V6KA 4DSRA 5ECPB 4WR4A 3ZMKA 3UOMA 1TRWA 1JZWA 3WGEA 2YWOA 2FA4A 3GL5A 3CMIA 2LJAA 3TJBA 3F6FA 3ZRDA 3F4RA 1MEKA 3OR5A 1M99A 4ISDA 3F4TA 1S3CA 1B48A 1WE0A 5ECHB 1EV4A 1OE7A 2L6DA 3HDCA 1M7TA 2R4VA 5ECSA 1K3YA 2M72A 3TGZA 1ZYQB 1Q4JA 3VI5A 16GSA 3W6GA 4AF2A 4KCEA 2OE3A 3KTLA 3HZ4A 4LL1B 1XBSA 2F8FA 4ECBA 2MBSA 4GSSA 3GFKA 1JFUA 5GAND 3MWHA 5F8BA 2LSTA 1ZCPA 6GSTA 1PKWA 4ECCA 5B8AA 4ZBDA 3TKQA 2YWMA 2B5EA 2L4QA 4F82A 5GSTA 1O73A 2CV4A 4POBA 3GSSA 2A2RA 1Z6NA 4F2IA 2VIMA 2LV3A 2DIYA 3C1RA 3KZQA 2NTOA 2XBQA 3EYTA 1GTAA 5A4VA 5IMVA 1SL0B 4F0BA 3ZIJA 6GSYA 2B5YA 2C0EA 5A4UA 1GSUA 2VCVA 5CP1A 1DSBA 1FAAA 1GLQA 3IOSA 3D4MA 3LORA 2REMA 5J5NA 1B8XA 1TDIA 3G9BA 3D0ZA 4DSSB 5F06A 3A3TA 4IJ3A 4O5RA 3F4SA 4TR0A 3D21A 1SD8A 4F03A 1TI1A 3HVVA 2WDUA 4IKHA 4BWQA 5JWQB 3PINA 1GUHA 1ABAA 3VPQA 1XFLA 4FH8A 4RUVA 1HQOA 4KSMA 4IQAA 3ZL5A 2X8GA 4D73A 1RK4A 3GYKA 1A0RP 3R2QA 2LQOA 2OE0A 1GP1A 1THOA 1A2MA 1Z9HA 1KBNA 1E2YA 3C71A 3EU3A 3CTGA 4MP4A 1A0FA 4AGSA 2R3XA 3ZITA 1YDKA 2X8HA 5ECKB 2N5BA 3GKMA 4JU5A 4TKYA 4WR5A 2H6XA 4K0GA 1IYHA 2H76A 2I81A 1HNAA 1F37A 3IK9A 4LMWA 2B1LA 2KLXA 2IFQB 2GSTA 4OWYA 1TK0B 5IMZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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