2MEAA

Changes in conformational stability of a series of mutant human lysozymes at constant positions
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGFFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Contribution of amino acid substitutions at two different interior positions to the conformational stability of human lysozyme
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 46
structure length 130
sequence length 130
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2meaA00
2G4QA 4J0LA 1HMKA 1NMMA 1YROA 4TUNA 3WMKA 1LCNA 2CWIA 3AZ4A 3B6LA 3WU8A 1WTMA 1GF8A 1GB3A 2HEAA 1GB9A 4G9SA 4H8XA 5I4WA 1IX0A 4WG1A 4TTDA 1C10A 1FLQA 1LZ4A 4J1AA 2YBHA 4NWEA 5KJ9A 3LZTA 1DKKA 5FHWA 3WPLA 4HV2A 1AKIA 4HJYA 1YAQA 1LYYA 2AUBA 3HBEX 3A95A 4NSIA 3LN2A 207LA 2A7DA 3LYTA 4NEBA 4NGWA 3CB7A 4UWNA 1N4FA 3TMWA 4ETBA 2HEBA 3G3BB 1B7SA 3IJUA 5B05A 4XJFA 3A90A 4J1BA 4NG8A 4XN6A 1HEMA 4DYGA 5KXLA 208LA 3BKHA 1XGPC 4WM6A 1OUIA 1LJIA 2CGIA 2RSCA 1HEPA 3AZ7A 4H9AA 4NSJA 1GBYA 4RW2A 3ATOA 2Z2EA 4B4EA 1LMTA 1XGQC 1LYOA 4PRUA 5I4YA 1JJ3A 1LZSA 5LAFA 2VB1A 2BQIA 1BVKC 1IWUA 1GFEA 2YBJA 3A67Y 1VDSA 3WPKA 1LSAA 1GFJA 3A91A 5C6LA 1GF7A 1I1ZA 2HU3A 4ETEA 1IOCA 3CT5A 1JJ0A 5II3A 1CNSA 5B1FA 5DL9A 3SP3A 1DPXA 5IDDA 1LJNA 1GBOA 2LZ2A 3TXIA 2HEFA 2I25L 1D9UA 1H87A 1JTTL 3TXGA 1BB6A 4LYBA 5KXSA 4QY9A 1P2CC 1JJ1A 2DQDY 5F81A 1GB0A 2IHLA 2MEHA 1LZCA 1IR7A 1IVMA 3HBHA 4GN5C 1AT5A 5B07A 1LSCA 1IORA 3TXFA 5KKJA 3EO5A 4FJRA 3A3QA 1LPIA 1NHEA 4XJBA 4YF2A 2HTXA 3W6BA 2WARA 5I4XA 3WL2A 1JKDA 4NSGA 4TSBA 4N1EI 4H91A 4N0JA 4WL7A 1GF5A 2H9JA 3WPJA 1LZ5A 3CSRA 1HMLA 4LT1A 1W08A 2YBNA 3EBAB 4DD1A 5LA8A 1DPWA 1C45A 3CSZA 3IWRA 4DDBA 1XEIA 1REYA 1OUJA 1UIEA 5L9JA 1VFBC 1LKRA 4WMGA 1B5XA 1HEOA 3TXDA 2BQEA 4H93A 1HHLA 1QDRA 4ML7A 1IOTA 4GLAA 3A94A 5HNLA 3B72A 4XJGA 4CGEA 4G4BA 4GCCA 1LZAA 4XADA 5LINA 2MEDA 5KXOA 1LZBA 1RCMA 1CJ8A 1UA6Y 4LT2A 2N5ZA 4H8YA 1NDMC 1AM7A 2DQGY 1GFRA 1GF0A 1BWHA 1GB7A 1OQMA 2Y8PA 2HEEA 3HBDA 4WO6A 4XJIA 4PRQA 4WO9A 5D5CA 5IHGA 4OWCA 2ZQ3A 1SLYA 2Z39A 1GB5A 8LYZA 1JEFA 1NBYC 1UBZA 1RI8B 4Z3MA 1ZV5L 1WVUA 5C6JA 3W6EA 5HQ1A 1IR9A 1JTOL 3TMXA 1XEJA 2XBRA 1D6PA 3ZEKA 1CKGA 1UICA 2C8PA 5AMYA 4YENA 7LYZA 3LYMA 3AYQA 1JWRA 1QSAA 4X3BA 4NGJA 1IOSA 1BWIA 4TSCA 1JPOA 1NQIA 3T6UA 4G4HA 5B06A 3ULRA 1VAUA 2MEEA 5A3ZA 5JENB 1XGUC 4NHTA 3B0OA 4WM1A 5I53A 4C5FA 1OUCA 3WVYA 1LJGA 2BQHA 1EL1A 1LHJA 3ATNA 5ILCA 1QUSA 4OWAA 1LZRA 1IY3A 2C8OA 1C43A 1JKAA 1LZ6A 5DM9A 4IASA 2DQJY 153LA 1QDTA 4CFOA 1EQ5A 1WVVA 1LJKA 2FYCA 4KT3A 4PHIA 1B0DA 3M18B 4UWVA 3WXTA 1LSMA 1XEKA 4YEMA 135LA 2X0AA 2DKVA 3N9AA 4KXIA 1LMPA 1GEVA 4H8ZA 1NKHA 2YSSC 2EQLA 3CSQA 1LHHA 4NGIA 5LYZA 1OUFA 2CJLA 4NG1A 1FBIX 1KIRC 1CJ9A 1LSPA 1GF6A 4AXTA 1IP1A 1B7LA 2BQGA 4HTNA 1Z55A 3TMUA 1FDLY 1BWJA 1CJ6A 2EIZC 4OOOA 2XJWA 2BQDA 1LSEA 1IP2A 2IFFY 2MECA 4OWBA 4OWEA 154LA 2MEIA 1IP5A 1YIKA 1G7JC 4NSHA 1VDPA 1DQJC 1UCOA 4LT3A 1YKXX 3LYOA 4B49A 1LZEA 5KXWA 5IELA 1GB2A 1GWDA 2LZTA 5F16A 5B59A 1EQEA 2DQFC 2HUBA 3W6AA 4OOTA 1UIFA 4BAPA 4ZIXA 4GN3A 1FKQA 3TXBA 2Z18A 1REXA 1LZ1A 1PZYA 1INUA 2FBDA 1JITA 4HJVA 1LMQA 2YBMA 4H9CA 4TWSA 1GHLA 4L41A 1D0LA 1CKFA 4BAFA 1TDYA 2PC2A 4WM2A 4NGZA 3QE8A 1IO5A 1NWGA 1MELL 1UIHA 1GFHA 1GB6A 1GAYA 1ZVHL 1VEDA 3RW8A 1HEWA 1LHKA 1LZYA 2BQOA 3TXKA 1KXYA 1TCYA 3P65A 4NGYA 4W94A 1O23A 2ZIJA 4UWUA 3D3DA 4PGJB 1B7OA 1HENA 1IY4A 1YKYX 1W6ZA 1LTMA 1JUGA 4LT0A 3AW7A 2D91A 5LAGA 4DWXA 6LYZA 1GE4A 1IWWA 2H9KA 3BKVA 3WW5A 1WQRA 1KXXA 3OK0A 4NHQA 1BGIA 1LHIA 1WQMA 4NHSA 3LHMA 1KIQC 4RLNA 4GCBA 1J1PY 4M4OA 1B5WA 5LVJA 3AZ5A 1AT6A 2G4PA 3CT1A 2F4AA 3A34A 1XSFA 4H1PA 4R0FA 5E9RA 5J7CA 3WVXA 3B0IA 2BQJA 3KAMA 4LFPA 3P64A 4HPEA 2D4JA 4ETAA 4LZTA 2BAAA 3TXJA 4B4JA 4EMNA 2DQIY 5KXTA 1G7LC 1HSXA 1FLUA 1HELA 1TBYA 1T6VL 3LZ2A 4DDCA 4H9HA 4NFVA 5KXMA 1VDQA 1D6QA 2BQFA 1HFZA 1G7HC 1UC0A 4PPOA 4NGVA 5KXNA 3ZVQB 1BB3A 1BVXA 1BHZA 1BB7A 1LYZA 2ZILA 4XJHA 4ZEEA 1HFXA 2GV0A 1GF4A 1B7RA 2FYDA 4MCKA 1CKHA 4G49A 1HF4A 1LZ9A 3J6KA 2YVBA 1LJFA 3GXKA 194LA 2Z19A 2Z38A 4EOFA 1DXJA 1UIAA 1AZFA 1LJHA 4G4CA 4B1AA 3RT5X 2BLYA 1BQLY 3G3AB 5EBHA 5KXYA 2F2NA 4DD0A 3RU5A 1GXV2 1H6MA 1B5ZA 5FSTA 3WUNA 1IC7Y 1YAPA 1E8LA 1XGRC 5LYTA 4B0DA 1GE0A 3RZ4A 1IR8A 1YAMA 4XJDA 4HP0A 4N9RA 3W3EA 3P66A 1IWVA 4P2EA 3K3TA 1CKDA 5F14A 1CJ7A 3B0KA 4IATA 1LSZA 5APDA 3VWOA 1LJ3A 2YDGA 3AZ6A 3P68A 4QDNA 1JKBA 4H9FA 2ZIKA 1GDWA 4QGZA 4GN4A 3W6FA 1GEZA 2DQAA 4DD2A 4WM4A 4H9IA 1J1XY 5FEKA 5KKIA 1YILA 1LHMA 2BQMA 1A2YC 1HERA 1FKVA 1REZA 1NBZC 1B7MA 3A96A 4B4IA 4J7VA 4OWHA 1WQNA 1G7IC 3N9EA 1OUBA 4M6DA 5LVIA 1LSFA 1GXXA 2HEDA 4NGKA 1C46A 3LYZA 4H94A 3ZVQA 2BQLA 2YBIA 4RLMA 3WU9A 2D4KA 1LZTA 1XGTC 1G7MC 1LJJA 4HSFA 4Z46A 5LA5A 3W6DA 4LYOA 4DC4A 4DD3A 1OUGA 2A7FA 132LA 4LYCA 4Z98A 1LSGA 5E4PA 3QNGA 1QIOA 4KL7A 1F0WA 5D5FA 1GPQC 4H9EA 3GXRA 1A4VA 3CT0A 4W96A 4IJ4A 1SQ2L 1YQVY 4WM3A 1GFAA 1JSEA 3A6BY 5LYMA 4WLTA 1UUZC 2W1XA 4H92A 1HSWA 1LSYA 4N5RA 4O34A 1UIGA 5B1GA 1B2KA 2Z12A 3M3UA 5DN4A 1IWXA 1OUHA 1QSWA 1DI4A 1LZGA 1LZ8A 4DD9A 1GDXA 2LYZA 1I20A 4GCFA 2HECA 2ZYCA 3A93A 5KXPA 1LKSA 2ZNWY 5DN5A 1LSDA 1C08C 1B5UA 1YKZX 1NDGC 1DKJA 4GLVA 4ANRA 3CQLA 5I5QA 1C7PA 1GBWA 4NWHA 5FCPA 4DD7A 4I0CA 4LYTA 3F6ZA 4WG7A 4ET9A 5M1YA 4QEQA 1DZBX 134LA 4LFXA 2YBLA 1LZNA 1WQPA 2BQKA 4RW1A 5ILFA 4TX7A 4WM5A 1IWYA 3A3RX 2D4IA 1HEQA 1QTKA 5HMJA 1EQ4A 1LHLA 4RDSA 1IOQA 1MLCE 4R6CA 5DLAA 4NHPA 4FDYA 2G4NA 4YM8A 1REMA 2ZQ4A 1LAAA 1CKCA 2BLXA 2LYMA 1OUEA 1T3PA 1VDTA 4WLXA 1HNLA 1GF3A 1LOZA 4WOAA 4OW1A 2DQCY 4U3XB 1YL1X 4A7DA 2BQNA 2H5ZA 2LYOA 4HPIA 4HV1A 1BB5A 1GD6A 1LYSA 5KY1A 4LYMA 4Z41A 4NGOA 2BPUA 3WH1A 5KXKA 2BQCA 1IIZA 4GCEA 3RNXA 1F6RA 1NF5A 2W1YA 1BB4A 4ZFPA 5LXWA 1IC5Y 1GBZA 1LMOA 1RJCB 2DBTA 2F30A 1LSNA 2MEGA 5LVKA 4HTQA 1V7SA 4GCDA 3WUMA 1JIYA 3TMVA 1QQYA 2CDSA 4C3WA 1IEEA 1LMCA 2LHMA 3AGHA 4DDAA 4DT3A 4CFPA 2Z2FA 5APEA 2W1MA 1QTEA 1YL0X 3N9CA 5LVHA 1GFGA 1GFUA 1GF9A 3TXEA 4N1CC 4WLDA 3FE0A 3EXDA 1OUAA 4I8SA 1IP4A 3QY4A 4PJ2C 5K7OA 2DQEY 4MR1A 2Z37A 3AJNA 4E3UA 5F9XA 3AB6A 3P4ZA 4H90A 5LIOA 4NHIA 4XENA 3E3DA 1OP9B 1IWTA 5L3IA 1B7NA 1B5VA 4YOPA 5KXXA 3EMSA 4CHXA 3W6CA 1B5YA 1GBSA 1GE2A 1IWZA 3WUAA 3WYHA 4N8ZA 2BQAA 3A8ZA 1UACY 5F9UA 1D0KA 2I6ZA 4WLYA 2MEFA 1WQOA 1YANA 1QUTA 4HTKA 5APFA 6LYTA 1KIPC 1WQQA 1JKCA 1UIBA 2DQHY 4NY5A 3T36A 1J1OY 3FI7A 5HNCA 3IJVA 2Q0MX 3AW6A 5KXZA 1F10A 1GAZA 2W1LA 2XBSA 3WU7A 5A3EA 1GE3A 1DI3A 2B5ZA 4H9BA 4ETCA 1RFPA 1V7TA 1GFTA 2NWDX 1GB8A 5FELA 5C6IA 1KXWA 1I56A 3J4GA 4AGAA 3A92A 1ZMYL 3WW6A 2FBBA 4MSTA 2D6BA 1JHLA 1GBXA 2F4GA 2ZNXY 3WULA 1LMAA 1LJ4A 1IP7A 2BQBA 1HC0A 3WXUA 2ZWBA 5T3FA 1TEWA 4HJZA 5LVGA 133LA 1B7PA 1VATA 1LSBA 4CJ2A 3OJPA 1DI5A 1ALCA 2HU1A 2ZYPA 2MEAA 1IP3A 5HMVA 1B9OA 1YAOA 1HFYA 1D0MA 1FLWA 4II8A 3AGGG 1GFVA 4NGLA 1IC4Y 2EPEA 4WL6A 9LYZA 193LA 4LYZA 1LJEA 1WTNA 4D9ZA 3MGWA 1UIDA 1F6SA 1RE2A 2MEBA 1FN5A 1B7QA 1LZDA 1PS5A 3A6CY 5FDJA 1LMNA 5KXRA 5HLLA 1GE1A 1OUDA 1ZVYB 1GFKA 2XTHA 4YEOA 1JSFA 5L3HA 1TAYA 4XYYA 4ET8A 1FLYA 4ETDA 4NIJA 1IP6A 3AGIA 3HFMY 5APCA 2EKSC 3D9AC 3TXHA 4LGKA 4KPMA 1JISA 1XFPL 4BS7A 1JTPL 5I54A 2I26L 4BADA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G4QA 3AZ4A 1WTMA 1G1WA 4G9SA 5I4WA 4TTDA 1LZ4A 4DQ5A 4J1AA 2YBHA 3LZTA 4HV2A 1YAQA 2AUBA 3A95A 4NSIA 2RBRA 1L35A 4ARMB 4NG8A 2RBNA 3HT7A 5KXLA 3G3VA 1L40A 1LJIA 4H9AA 4RW2A 2Z2EA 4PRUA 211LA 4ARPA 5LAFA 4E97A 170LA 1LSAA 2B75A 3A91A 1I1ZA 1L51A 5II3A 226LA 2RH1A 1DPXA 4GRVA 5IDDA 1L34A 1GBOA 3TXIA 1H87A 5F81A 1GB0A 2IHLA 1IR7A 1T97A 3UONA 2OU8A 4GN5C 3EO5A 1DYAA 4XJBA 2HTXA 3DN3A 3WL2A 4NSGA 4H91A 1GF5A 3QAKA 1LZ5A 220LA 1HMLA 2YBNA 4DD1A 3IWRA 4DDBA 1XEIA 3CDOA 2O4WA 1REYA 260LA 1LKRA 107LA 3TXDA 2BQEA 1C62A 1QDRA 4XJGA 4XADA 2Q9DA 5LINA 1UA6Y 1D9WA 1GFRA 1GF0A 2HEEA 1OV7A 3HBDA 4PRQA 1L83A 4OWCA 152LA 2Z39A 1JEFA 1NBYC 5C6JA 1RI8B 1ZV5L 3LYMA 196LA 1QSAA 3AYQA 4TSCA 1L11A 1JPOA 5B06A 1G1VA 3ULRA 2RAYX 113LA 1XGUC 228LA 5I53A 4C5FA 1OUCA 2BQHA 141LA 1L45A 1LZRA 4CFOA 231LA 1L80A 1B0DA 1L82A 1LI6A 1LSMA 4YXAC 135LA 1GEVA 1LHHA 4DKLA 4EKRA 1IP1A 254LA 182LA 1Z55A 139LA 4OOOA 4OWEA 1L04A 4LDOA 1YIKA 1L95A 1QTZA 1L00A 1G0LA 4W55A 5IELA 5B59A 2DQFC 1UIFA 1L93A 5LZMA 1L25A 2Z18A 1REXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2G4Q A;  4J0L A;  1HMK A;  1NMM A;  1YRO A;  4TUN A;  3WMK A;  1LCN A;  2CWI A;  3AZ4 A;  3B6L A;  3WU8 A;  1WTM A;  1GF8 A;  1GB3 A;  2HEA A;  1GB9 A;  4G9S A;  4H8X A;  5I4W A;  1IX0 A;  4WG1 A;  4TTD A;  1C10 A;  1FLQ A;  1LZ4 A;  4J1A A;  2YBH A;  4NWE A;  5KJ9 A;  3LZT A;  1DKK A;  5FHW A;  3WPL A;  4HV2 A;  1AKI A;  4HJY A;  1YAQ A;  1LYY A;  2AUB A;  3HBE X;  3A95 A;  4NSI A;  3LN2 A;  207L A;  2A7D A;  3LYT A;  4NEB A;  4NGW A;  3CB7 A;  4UWN A;  1N4F A;  3TMW A;  4ETB A;  2HEB A;  3G3B B;  1B7S A;  3IJU A;  5B05 A;  4XJF A;  3A90 A;  4J1B A;  4NG8 A;  4XN6 A;  1HEM A;  4DYG A;  5KXL A;  208L A;  3BKH A;  1XGP C;  4WM6 A;  1OUI A;  1LJI A;  2CGI A;  2RSC A;  1HEP A;  3AZ7 A;  4H9A A;  4NSJ A;  1GBY A;  4RW2 A;  3ATO A;  2Z2E A;  4B4E A;  1LMT A;  1XGQ C;  1LYO A;  4PRU A;  5I4Y A;  1JJ3 A;  1LZS A;  5LAF A;  2VB1 A;  2BQI A;  1BVK C;  1IWU A;  1GFE A;  2YBJ A;  3A67 Y;  1VDS A;  3WPK A;  1LSA A;  1GFJ A;  3A91 A;  5C6L A;  1GF7 A;  1I1Z A;  2HU3 A;  4ETE A;  1IOC A;  3CT5 A;  1JJ0 A; 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 1T3P A;  1VDT A;  4WLX A;  1HNL A;  1GF3 A;  1LOZ A;  4WOA A;  4OW1 A;  2DQC Y;  4U3X B;  1YL1 X;  4A7D A;  2BQN A;  2H5Z A;  2LYO A;  4HPI A;  4HV1 A;  1BB5 A;  1GD6 A;  1LYS A;  5KY1 A;  4LYM A;  4Z41 A;  4NGO A;  2BPU A;  3WH1 A;  5KXK A;  2BQC A;  1IIZ A;  4GCE A;  3RNX A;  1F6R A;  1NF5 A;  2W1Y A;  1BB4 A;  4ZFP A;  5LXW A;  1IC5 Y;  1GBZ A;  1LMO A;  1RJC B;  2DBT A;  2F30 A;  1LSN A;  2MEG A;  5LVK A;  4HTQ A;  1V7S A;  4GCD A;  3WUM A;  1JIY A;  3TMV A;  1QQY A;  2CDS A;  4C3W A;  1IEE A;  1LMC A;  2LHM A;  3AGH A;  4DDA A;  4DT3 A;  4CFP A;  2Z2F A;  5APE A;  2W1M A;  1QTE A;  1YL0 X;  3N9C A;  5LVH A;  1GFG A;  1GFU A;  1GF9 A;  3TXE A;  4N1C C;  4WLD A;  3FE0 A;  3EXD A;  1OUA A;  4I8S A;  1IP4 A;  3QY4 A;  4PJ2 C;  5K7O A;  2DQE Y;  4MR1 A;  2Z37 A;  3AJN A;  4E3U A;  5F9X A;  3AB6 A;  3P4Z A;  4H90 A;  5LIO A;  4NHI A;  4XEN A;  3E3D A;  1OP9 B;  1IWT A;  5L3I A;  1B7N A;  1B5V A;  4YOP A;  5KXX A;  3EMS A;  4CHX A;  3W6C A;  1B5Y A;  1GBS A;  1GE2 A;  1IWZ A;  3WUA A;  3WYH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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