The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN (ETHYL ISOCYANIDE)
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| publication title |
High Resolution X-Ray Structures of Myoglobin-and Hemoglobin-Alkyl Isocyanide Complexes
pubmed rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
67
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-08-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4C0N A; 1X9F B; 1JY7 A; 1Y4F B; 3LR9 A; 2G12 A; 1G0A A; 3ED9 A; 1IBE A; 3UHT A; 2GRZ A; 2ZSN A; 5HY8 B; 3PEL B; 3DHT B; 1HRM A; 1EBC A; 3KUO A; 3UH5 A; 4MXK A; 1O1J A; 1J7S B; 1Y5J A; 4IRO B; 1JZL A; 2V1K A; 2R4X A; 3WR1 A; 1OBM A; 3LB2 A; 1YHU A; 1UVY A; 1A4F A; 3WCW B; 1BZ0 B; 1Y0W B; 5CHQ A; 3HHB B; 2O5B X; 1MTI A; 1YCA A; 1A3O B; 4NI1 A; 1DXD A; 5HU6 A; 5CN7 A; 2ZS1 A; 1G09 A; 3VRF B; 1A3N A; 1NPF A; 1MTK A; 2QLS A; 1O1N A; 1R1X B; 2ZSX A; 1Y31 B; 3IC2 A; 1FLP A; 1HGB B; 3HF4 A; 3RJ6 A; 3S65 A; 2Z6N B; 3QJB B; 5KER A; 3HEP A; 2V1F A; 1K1K B; 1SPG B; 3D7O B; 1SI4 A; 1ABW A; 1AJG A; 4TWU A; 3A2G A; 3BJ2 A; 3D1A A; 4MAX A; 1Y85 A; 1IWH B; 1XY0 B; 1ABS A; 4FC3 A; 4LPI A; 1YHU D; 2PGH A; 1AJ9 B; 1EWA A; 1JZK A; 1H1X A; 3MJP A; 3ZJM A; 1F5P A; 1G9V A; 1Y83 A; 5CNC A; 1NS6 B; 3GYS B; 1A9W A; 1LFY B; 3D17 A; 3IXF A; 1K0Y A; 1XZ4 B; 1KFR A; 2ZSR A; 1Y22 B; 3AG0 A; 4O2G A; 1MTJ A; 3A5G A; 1HDS B; 1WVP A; 1CH7 A; 1UFJ A; 3EDA A; 2MBW A; 3M38 A; 2ZS1 D; 1XXT A; 1HBR B; 3AQ7 A; 1GVH A; 1RPS A; 1QSH B; 3KUN A; 1QI8 A; 1HAB A; 2HBC B; 1YFF A; 2AUR A; 1HDA B; 1LH6 A; 2D2N D; 2AV0 A; 5F0B A; 5EE4 D; 2RI4 B; 1CH3 A; 3PI4 A; 1VXE A; 1YOG A; 2Z8A A; 1LFL A; 3ASE A; 3O89 A; 1YIH A; 2O5S X; 2BWH A; 1MYI A; 1PBX B; 3HXN A; 1B86 B; 5AZR A; 3MYN A; 3VAU A; 2VEE A; 2DXM B; 1Y0A A; 1M6M A; 1SDK A; 1DM1 A; 5E29 B; 1NAZ A; 2FRF A; 1NQP B; 3ZJL A; 111M A; 1MYM A; 3PI1 A; 2W72 C; 1MGN A; 5CMV A; 3R0G A; 3UHR A; 1O1O B; 1URV A; 1MLK A; 2GTL C; 1SDL B; 1MYZ A; 2ZLV A; 1DXT A; 5CN8 A; 4O4T A; 2G14 A; 5EOH A; 3UI0 A; 1LUE A; 1XQ5 B; 1UX9 A; 1BUW B; 1GBU B; 4M4A B; 1YE0 B; 4N7N B; 1LFZ B; 1MNJ A; 2ZT4 A; 4WJG A; 1H97 A; 1DKE B; 1KR7 A; 1X9F A; 3G4V A; 1HCO B; 2ZLW B; 1Y4F A; 5JGG A; 1CH5 A; 1EBT A; 1MWC A; 5HY8 A; 3PEL A; 1O1K A; 3DHT A; 4MBN A; 1LTW A; 1XZV B; 1J7S A; 3UHI A; 4IRO A; 2ZFB B; 5AB8 A; 1Y5F B; 4MQH B; 1HGC A; 3WCW A; 1FDH G; 1NWN A; 2BKM A; 1Y0W A; 3HHB A; 4DWT A; 4HHB B; 1Y46 B; 1IT3 A; 1A3O A; 1MWD A; 1FAW B; 1RVW B; 2GKN A; 3UHZ A; 3VRF A; 3UBV A; 3UHV A; 1RSE A; 1LFV B; 1CMY B; 2MYB A; 5HLQ A; 1XCH A; 1HGA B; 1R1X A; 1Y31 A; 2D2M D; 3H58 A; 1HGB A; 1MNO A; 4NXA A; 3BJ3 B; 2Z6N A; 3QJB A; 1YVQ B; 1X9F D; 1K1K A; 1LH3 A; 1G08 B; 1N9X A; 1SPG A; 3D7O A; 1Y8H B; 1OUT B; 4XDI A; 4U8U C; 1J52 A; 1IWH A; 1XY0 A; 1NGK A; 1AJ9 A; 3A59 B; 4N7P B; 1HBS A; 2SPN A; 3CY5 B; 1Z8U B; 1BVC A; 3WCW D; 3BCQ B; 3QZX A; 1MNK A; 1LH7 A; 3S48 C; 1NS6 A; 3GYS A; 1LFY A; 5CN4 A; 2G3H A; 1FSX A; 1XZ4 A; 1EW6 A; 1Y22 A; 2ZS0 C; 2EKU A; 1HDS A; 3FS4 B; 3G4Y A; 1V4U B; 4MPM A; 1J40 B; 1ECN A; 1HBR A; 3OGB A; 3UH3 A; 1Y8W A; 1QSH A; 2ZFO B; 5MBA A; 2VYW A; 2HBC A; 1MZ0 A; 1YHU B; 2AV3 A; 1SWM A; 1HDA A; 2EKT A; 4DWU A; 5CNB A; 4YU3 B; 1OJ6 A; 2XKH A; 2GRF A; 3PT8 B; 2RI4 A; 2LH5 A; 2ZSZ A; 2ZT0 A; 4NI1 B; 4TWV A; 5CN6 A; 3IA3 B; 1B86 A; 4MU5 A; 1VXH A; 2BK9 A; 3QM8 A; 2DXM A; 1WMU B; 4H07 A; 1MLR A; 1HBI A; 5E29 A; 2DN2 B; 3IC0 B; 3PI3 A; 3WFW A; 1HBB B; 1NQP A; 1TES A; 1YOI A; 1UC3 A; 3TM3 A; 5EUI B; 1DLY A; 2D2N B; 3PIA B; 4TYX A; 1O1O A; 4HRR B; 1SDL A; 2FRJ X; 1LH1 A; 1CG8 B; 2MGF A; 1Y5K B; 4BJA A; 1XQ5 A; 3W4U B; 5MBN A; 1GBU A; 2XKI A; 5F2A A; 3PT7 B; 2GLN A; 3D17 B; 1YE0 A; 4N7N A; 1LFZ A; 1SHR A; 3E55 A; 7HBI A; 1DKE A; 4NI0 B; 1HCO A; 4M4B B; 2ZLW A; 1DXC A; 1V4X B; 1VXA A; 3LQD B; 1MBC A; 1MLH A; 1XZV A; 2MYD A; 5CNG A; 2ZSS A; 3GK9 A; 2ZFB A; 4KMV A; 1I3D A; 5EQM A; 1J7Y B; 1Y5F A; 4MQH A; 1BZP A; 3NL7 B; 3LR7 A; 2ZS1 C; 2MHB B; 106M A; 3UGZ A; 4NK1 A; 3WCT B; 4HHB A; 1Y46 A; 4NK2 A; 2MGD A; 3MJU A; 5EU2 A; 4B3W A; 1ASH A; 1FAW A; 1RVW A; 2LH3 A; 1A6M A; 1CO9 A; 1JZM A; 5E6E B; 1LFT B; 3OZU A; 1LFV A; 1CMY A; 1GCW B; 3MKB B; 1HGA A; 1TU9 A; 3MOU A; 5EE4 C; 2Z85 A; 3BJ3 A; 1UIW B; 1YVQ A; 2SPM A; 2HBE B; 1G08 A; 2GDM A; 3A9M A; 3A5A A; 3ZH0 A; 1Y8H A; 4ESA B; 4X0L A; 4OF9 A; 1OUT A; 1J3Z B; 2QFN A; 1XZ7 B; 4AVE A; 2VYZ A; 1Y8I B; 3QJD B; 1BAB A; 2SPL A; 1HDB B; 3O7N A; 3A59 A; 4N7P A; 3CY5 A; 2H8F B; 1VXD A; 3BCQ A; 3UHX A; 1RQA B; 3HYU B; 3LB3 A; 3WFX A; 1J3F A; 2MGA A; 3OJ1 A; 3OZV A; 2D2M B; 4MQK B; 1A6N A; 5CNE A; 3QJC B; 3B75 A; 3FS4 A; 1DTI A; 3M3A A; 1DXV B; 2AUQ A; 5M3S A; 1V4U A; 5JGG B; 2VEB A; 1J40 A; 2SPO A; 3U3E A; 1JEB B; 1O1K B; 5JDO F; 2ZFO A; 2RAO B; 2QRW A; 1MYJ A; 1O1M A; 5HLX A; 1QSI A; 1HGC B; 3NFE B; 4YU3 A; 1A00 A; 3SZK A; 1O1P B; 1B0B A; 5JDO E; 3PT8 A; 1YHR B; 102M A; 2G0R A; 1NEJ B; 2B7H B; 1Y0D B; 1N9I A; 2QU0 B; 4PQB A; 1Y0T B; 1VXC A; 1WMU A; 5IKS A; 2XYK A; 1A6G A; 2DN2 A; 3IC0 A; 105M A; 4UZV A; 1HBB A; 1Y7G B; 1YHE B; 2HBG A; 2HHD A; 3QM7 A; 3GQG B; 5EUI A; 2DN3 B; 3TLD A; 2D2N A; 1ECD A; 3PIA A; 3A5B A; 1MOH A; 2ZFO D; 4HRR A; 2W6X A; 4WCH D; 3UHE A; 1Y7Z B; 3ECL A; 4MQC B; 1MNI A; 1X46 A; 4YU4 B; 3D4X B; 1CG8 A; 2ZWJ A; 1HBS B; 1Y5K A; 107M A; 1D8U A; 4KJT A; 4MXL A; 3QM6 A; 1X9F C; 2BW9 M; 3ARL A; 3W4U A; 4HBI A; 1YVT B; 3PT7 A; 2ZSY A; 1FSX B; 2HCO B; 2G0Z A; 4NZI A; 4NI0 A; 3OO4 A; 4F6B A; 4M4B A; 1XYE B; 1V4X A; 3KMF C; 2OH9 A; 3LQD A; 1Y8W B; 1COH B; 3WCW C; 1YMB A; 2V1G A; 1CQ2 A; 3MN0 A; 1YEU A; 3UHG A; 2VYY A; 1J7Y A; 3ZJI A; 3NL7 A; 1Y4Q B; 2ZSP A; 1J7W B; 3WCU B; 2MHB A; 1MLG A; 3WCT A; 1LH2 A; 3GQR B; 2V1H A; 1Q1F A; 4ZVB A; 5E6E A; 1LFT A; 1Y35 B; 3BOM B; 1GCW A; 3MKB A; 2R1H B; 4O1T A; 1BIJ B; 2W31 A; 1UIW A; 2FAM A; 1YGF A; 1ABY B; 1KD2 A; 2HBE A; 3UHH A; 4ZVA A; 1NPG A; 1A0U B; 4ESA A; 4ODC B; 1GCV B; 1MCY A; 2XKG A; 1IRC A; 1J3Z A; 3WCV C; 1XZ7 A; 3S66 A; 1Y8I A; 5ILE A; 3QJD A; 2FRK X; 1HDB A; 1Y2Z B; 2HZ3 A; 1OFK A; 3VHB A; 2H8F A; 3VRE B; 1LA6 B; 1RQA A; 1PMB A; 3HYU A; 1SHR B; 2O5L X; 3NG6 B; 3WCT D; 1YEQ A; 2D2M A; 4MQK A; 1CH4 A; 1V75 B; 3P5Q B; 3QJC A; 4HSW A; 1DXV A; 3OZW A; 1MYF A; 1NZ3 A; 1Y4B B; 5ILR A; 1F63 A; 1JEB A; 2AUP A; 1YEV B; 1JL7 A; 4ILZ A; 2RAO A; 1JP8 A; 2EVP A; 2NRL A; 1UX8 A; 4H2L B; 1CIO A; 3OVU C; 1C40 B; 4SDH A; 3QZZ A; 1DUO A; 4OOD A; 1BVD A; 3NFE A; 4FWY A; 1MLM A; 1Y8K B; 1O1P A; 2ZS0 B; 2VLY A; 4VHB A; 1YHR A; 4DC8 A; 5EYS A; 1JP9 A; 3MJU B; 1NEJ A; 3HC9 A; 2B7H A; 4O4Z A; 1A0Z B; 1Y0D A; 3HRW B; 4KN3 A; 2QU0 A; 2MGI A; 3PI9 A; 1Y0T A; 1S5X B; 2H8D B; 1YHE A; 1Y7G A; 4PQ6 A; 1U7R A; 1BZZ B; 4O35 A; 3D1K B; 1GDL A; 4ROM B; 3GQG A; 1UT0 A; 2DN3 A; 4X0L B; 1MDN A; 4HSX A; 2MGB A; 1BAB B; 1Y7Z A; 4MQC A; 4YU4 A; 3D4X A; 3MYM A; 3G52 A; 1MBN A; 3FH9 B; 1CLS B; 5EET A; 1RQ3 B; 1YVT A; 1BBB B; 1MBD A; 2MGM A; 2BLI A; 2W72 A; 3AT5 B; 2HCO A; 1FHJ B; 3B75 B; 1J41 B; 1X3K A; 2D5Z B; 1BIN A; 1XYE A; 4GZG A; 1COH A; 2MGE A; 2NX0 A; 109M A; 2R4Y A; 3QJE B; 3UH6 A; 2GNW A; 1O1M B; 1QSI B; 1DO4 A; 2ZT3 A; 1Y4V B; 3LB1 A; 1GDK A; 1A00 B; 3SZK B; 1JDO A; 1Y4Q A; 3WCP B; 1J7W A; 3WCU A; 1A6K A; 1Y0C B; 3NMM B; 3WFT A; 2KSC A; 1YEN B; 3GQR A; 1Y7D B; 1S5Y B; 2DHB B; 2IN4 A; 1HLM A; 2BMM A; 2FAL A; 4G1V A; 3CIU A; 1DO3 A; 6HBI A; 3A0G B; 1Y35 A; 3BOM A; 1L2K A; 2R1H A; 3E5O A; 1BIJ A; 2HHD B; 103M A; 3VRG B; 1Y4R B; 1VXF A; 1ABY A; 4DC7 A; 1HBH B; 110M A; 1A0U A; 6HBW B; 4G51 B; 2MGJ A; 4ODC A; 1GCV A; 1Y09 B; 1QPW B; 3OO5 B; 4FWX A; 1JF3 A; 2QMB B; 3SDH A; 2EB8 A; 4XS0 B; 3ZJP A; 1Y2Z A; 1LJW B; 1JW8 A; 2WTH A; 2YRS B; 1V9Q A; 1MWB A; 3AT6 B; 2HBD B; 1CG5 B; 3VRE A; 1OR6 A; 1IT2 A; 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3M39 A; 3AQ6 A; 3K3U A; 2W6Y A; 1XZ2 B; 1BZ1 B; 5JDO D; 4HRT B; 3UHK A; 2G0S A; 2ZSO A; 3QMA A; 3QM5 A; 3QJE A; 1VXG A; 3WCT C; 1GZX B; 1Y4V A; 3ZJR A; 4MBA A; 3WCP A; 1MKO B; 4F6F A; 1U7S A; 4JYQ A; 3HEO A; 1Y0C A; 3MVC A; 2NSS A; 3NMM A; 3ZJN A; 1YEN A; 1Y7D A; 3WFU A; 5HLU A; 1S5Y A; 2DHB A; 1NIH B; 1VWT B; 3PI9 B; 1GDJ A; 1T1N B; 1OR4 A; 2H35 B; 3A0G A; 5E83 B; 3GKV B; 4NS2 A; 2R50 A; 1LHS A; 1CH1 A; 1Y4R A; 3VRG A; 1YMA A; 2Z6S A; 3UHW A; 1HBH A; 1HV4 B; 6HBW A; 4G51 A; 1Y09 A; 1QPW A; 3OO5 A; 3ONZ B; 2QMB A; 2OHB A; 3WHM B; 2O5Q X; 4XS0 A; 4N8T B; 3R5I A; 1LJW A; 1IOP A; 2YRS A; 2G0X A; 3LHB A; 2D2M C; 1YE2 B; 3AT6 A; 2HBD A; 1CG5 A; 3AQ9 A; 5B85 A; 1QXD B; 3V2Z A; 1XZU B; 2W6V A; 1NZ5 A; 1R1Y B; 2W72 B; 1ITH A; 2HBS B; 2HBF A; 1MNH A; 1O1L A; 4F69 A; 1G0B A; 1VRE A; 1V4W B; 1MBA A; 2HHB B; 3WCV B; 1DXU A; 4MQJ A; 1HHO A; 1LHT A; 2GTL B; 1S6A A; 3G53 A; 4MQG B; 1YEO A; 2M6Z A; 2G10 A; 1YDZ B; 4F6D A; 3EOK A; 2MGG A; 1MLF A; 2MGH A; 1S0H A; 2MYC A; 1BJE A; 1C7C B; 1CPW A; 2GL3 A; 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