The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High Resolution X-Ray Structures of Myoglobin-and Hemoglobin-Alkyl Isocyanide Complexes
pubmed rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage
|
| source organism |
Physeter catodon
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN (METHYL ISOCYANIDE)
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| total genus |
67
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-08-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UHW A; 2Z6N B; 3BCQ A; 4L2M A; 3ECL A; 1Y4G B; 1Y4P B; 1JP9 A; 1Y8W B; 4IT8 A; 3IC2 B; 4HSX A; 1LFZ B; 4C0N A; 1NZ2 A; 2AA1 B; 1C7C B; 3ONZ A; 2ZLT A; 107M A; 4DWU A; 2W72 C; 2ZFB A; 3OO5 B; 3QQQ A; 1LUE A; 2EKT A; 1S61 A; 3PI3 A; 4HRR A; 2PEG B; 1H97 A; 3NMM A; 1YIE B; 3ASE A; 1NGK A; 1UVX A; 1J40 A; 1KFR A; 3M3B A; 1IDR A; 2ZS0 B; 3AT6 A; 2MYC A; 1GJN A; 1Y85 A; 3BOM B; 2R4W A; 2QFN A; 1O1O B; 1LFT B; 1C7D A; 4MQH A; 1HV4 B; 1MNK A; 3R5I A; 3UHT A; 2W6W A; 2EKU A; 1HGB A; 1DXT A; 2QU0 A; 2AV3 A; 3OZU A; 1YFF A; 2G3H A; 2SPN A; 3HYU A; 1GVH A; 1XXT A; 3SZK B; 1FCS A; 2LH1 A; 3ZJO A; 3GLN A; 2LHB A; 1ECA A; 1MYT A; 1XZ7 B; 1YE0 A; 1YHU C; 2ZSO A; 2BWH A; 1GZX A; 2W6Y A; 2LH7 A; 1DO3 A; 1DXV B; 1J3F A; 3R0G A; 1MOC A; 1YOG A; 1GLI A; 1LA6 A; 5HAV A; 1HLM A; 4TWV A; 1J3Y A; 3ZJJ A; 1S5X A; 5ILE A; 1CMY B; 2H8D B; 2RAO A; 3WCU B; 1M9P B; 5EE4 D; 2HBS B; 4MXK A; 5AB8 A; 1YVT A; 1YHR A; 3BCQ B; 1O1L B; 3VRE A; 2HBE B; 3PT8 A; 2D2N C; 4MBN A; 5IKS A; 1O1P A; 4HBI A; 1HBA A; 1HDB A; 4MQC A; 106M A; 2BKM A; 1JL6 A; 2D2M C; 2O58 X; 2ZLT B; 2EB8 A; 1AJH A; 2XYK A; 1K1K A; 2ZFB B; 1O1K A; 3MKB B; 1LH6 A; 3GDJ A; 4HRR B; 3NMM B; 1HGA A; 2MHB A; 3AT6 B; 4XS0 A; 1JY7 A; 2V1E A; 6HBI A; 1Y4B A; 5CMV A; 1C7D B; 1YDZ A; 4MQH B; 5JDO E; 2HBF B; 1Y4Q A; 3K8B A; 2W6V A; 3QJD A; 1G08 A; 1YFF B; 3HEN A; 1MBO A; 3PI8 B; 2V1K A; 1Y8K A; 1XXT B; 3D17 A; 5JGG A; 3ZJM A; 2Z85 A; 4PQC A; 3A2G A; 4G1V A; 2VYY A; 2IG3 A; 3DUT A; 1B0B A; 1GZX B; 3HF4 B; 1ASH A; 1MGN A; 3BJ3 B; 1V75 B; 2FRK X; 3ODQ B; 1Y35 A; 2XKI A; 4JAC A; 1Y0A A; 3LR7 A; 3MJU A; 3E5I A; 4BJA A; 102M A; 1AZI A; 4LPI A; 3GQP A; 1S5X B; 1V4U A; 2KSC A; 3GKV A; 4ROM A; 3RJ6 A; 2RAO B; 1MYI A; 1BAB A; 1MLR A; 3QJB A; 3U3E A; 2GNW A; 4FWY A; 1JEB A; 111M A; 1GDJ A; 1YE2 A; 1MYJ A; 1YVT B; 1DXU A; 4F6G A; 3VRE B; 3ARL A; 5E6E A; 1DWR A; 4MPM A; 3PT8 B; 1QXE B; 3S1J A; 1O1P B; 1HBA B; 2ZFO B; 1YEQ A; 1HDB B; 3IA3 B; 1YHU D; 1F5P A; 3D1A A; 1T1N A; 3NG6 A; 1C7B A; 3AG0 A; 2IN4 A; 3GDJ B; 2BNL A; 1XZ2 A; 1IRC A; 2VRY A; 3QMA A; 1X9F C; 1HGA B; 2MHB B; 1FDH A; 4XS0 B; 1JY7 B; 4NI1 B; 3QM8 A; 1MOA A; 1OUU A; 2MGK A; 2W31 A; 1FAW B; 1YEN B; 1YDZ B; 2EVK A; 1IWH B; 2HZ1 A; 1FLP A; 1CPW A; 3G4U A; 1Y4Q B; 2D2N D; 1BZ1 A; 4F6J A; 108M A; 3K8B B; 3QJD B; 1G08 B; 1MNH A; 1HBH A; 2G0V A; 3D17 B; 2PGH A; 5JGG B; 1GCV A; 1LHS A; 5CNF A; 3FH9 A; 3QJC A; 1UC3 A; 3DUT B; 4ZVA A; 1MBD A; 1N9H A; 4H0B A; 1XZU A; 3ZJP A; 5HU6 A; 1VHB A; 1L2K A; 1O1I B; 3SDH A; 3V2V A; 1Y0A B; 3MJU B; 3S66 B; 3H57 A; 2ZT2 A; 2LH5 A; 1C40 A; 1V4U B; 2H35 A; 1BAB B; 4M4B A; 2HBG A; 1JEB B; 3UHR A; 3UHC A; 3HC9 A; 3EDA A; 1YE2 B; 3PEL A; 1BZ0 B; 3UHN A; 2W6X A; 1DXU B; 3WCW A; 3WCV D; 2AUP A; 5E6E B; 1IBE B; 2JHO A; 1DXD A; 1HBB A; 4N7P B; 1YEQ B; 4U8U C; 1OUT A; 1NQP B; 5CHR A; 1CQ2 A; 4MQJ A; 1T1N B; 2GRH A; 3NG6 B; 1C7B B; 2C0K A; 3ZJI A; 4ODC A; 1VXA A; 2ZLU A; 3UHI A; 2HZ2 A; 2MGF A; 1S5Y A; 2ZT4 A; 4KMV A; 1PBX A; 1AJ9 A; 3UHU A; 4MXL A; 2NRM A; 1OUU B; 1ABW A; 5KDQ A; 3MBA A; 5HLU A; 3E4N A; 2QFK A; 1TU9 A; 4FC3 B; 1CLS A; 4XDI A; 2FRI X; 1HHO B; 1NAZ A; 1BZ1 B; 1ECN A; 1Y7C A; 2ZLW A; 5ILM A; 2ZS1 B; 3HRW B; 1HBH B; 1JF4 A; 2PGH B; 1DO4 A; 3P5Q A; 1IRD B; 1GCV B; 5CN5 A; 3FH9 B; 1J52 A; 3UGY A; 1CH2 A; 1XZU B; 1X9F D; 3EU1 A; 2W72 A; 1QXD A; 3UBC A; 3GK9 A; 3GQG A; 3G4V A; 1M6C A; 4OF9 A; 1MWC A; 5MBA A; 4F68 A; 1MDN A; 1I3E A; 2O5B X; 3AQ7 A; 1C40 B; 1O1J B; 3WFT A; 4F69 A; 2H35 B; 4M4B B; 5ILR A; 4NI0 A; 1G09 A; 3PEL B; 1W92 A; 3WCW B; 1CBL A; 4FH7 A; 1NS9 A; 2OH9 A; 3WCT D; 1QSI A; 5EE4 C; 103M A; 1HBB B; 2DN1 A; 1A9W E; 1OUT B; 1CG8 B; 1NZ5 A; 1O16 A; 2VYW A; 2QLS A; 4MQJ B; 1RTX A; 4F6F A; 1A0U A; 1MYG A; 3HEO A; 2ZLU B; 3ZOL A; 5EET A; 2HCO B; 3OO4 B; 1GBU A; 1S5Y B; 1Y8H A; 1YHU A; 1IT2 A; 1NZ4 A; 4O2G A; 1PBX B; 1AJ9 B; 2G14 A; 2XKG A; 1HBS A; 2VEE A; 1YEU A; 1DUO A; 2QRW A; 1MTJ A; 1ABW B; 1A9W A; 1URV A; 1CLS B; 1XZV A; 1MLQ A; 1MKO A; 1Y7C B; 2E2Y A; 1SHR A; 4U8U D; 2Z6T A; 3NL7 B; 1SWM A; 1Y46 A; 1YZI A; 2WTH A; 3UHG A; 1R1X A; 2V1J A; 1JF3 A; 1HDS A; 2QMB B; 4M4A A; 3FS4 A; 2ZT0 A; 2D2M A; 3EU1 B; 1MYM A; 1BBB B; 4C44 A; 3GQG B; 3V2Z A; 1MCY A; 2R80 A; 5M3S A; 1RQ3 A; 2YRS A; 3G4R A; 3OZW A; 1CH5 A; 3VRF A; 1GBV B; 4IRO A; 2DHB B; 2AV0 A; 1Y5F B; 2FRF A; 1BZZ A; 4TYX A; 4NI0 B; 1A3N B; 2DN3 B; 3CIU B; 2MBW A; 2QSS A; 5KER A; 2VLZ A; 1NS9 B; 1KR7 A; 3BJ1 B; 1QSI B; 1ABY B; 2ZSS A; 1EMY A; 2DN1 B; 2ZS0 C; 4UIQ A; 2GRF A; 3UHS A; 1J7S A; 2HHE A; 2QLS B; 5EYJ A; 1G0B A; 1Y0T A; 1A0U B; 1X46 A; 1UIW B; 3WTG A; 3ZJN A; 3K9Z A; 3DHT A; 1V9Q A; 1Y22 A; 3G4Q A; 5EOH A; 1O1N A; 1GBU B; 1Y8H B; 3UHB A; 2GLN A; 2O5T X; 1N9X A; 3WFU A; 1YEU B; 1CBM A; 3WFX A; 1U7S A; 1A6N A; 1CP0 A; 1F5O A; 4HSW A; 1Y09 A; 1YGD A; 3K3U A; 3ZJH A; 4PQB A; 1XZV B; 1B86 B; 2MGH A; 4NS2 A; 1S0H A; 1QSH A; 2GKN A; 1YVQ A; 2D60 B; 3QQR A; 1MKO B; 5F2A A; 1JDO A; 1QI8 A; 1SHR B; 1YZI B; 1DLY A; 3KMF C; 1Y4F A; 2CMM A; 2GTL A; 1R1X B; 3KUO A; 1NXF A; 1HDS B; 1JWN A; 3B75 A; 4M4A B; 3FS4 B; 1YMA A; 2HBD A; 3UH5 A; 1DXC A; 2D2M B; 3WCU C; 3AQ9 A; 5CHQ A; 3ONZ B; 2MGA A; 3BJ2 A; 4NZI A; 2R80 B; 3EOK A; 1XQ5 A; 5CNE A; 1RQ3 B; 1X9F A; 1MLG A; 1CH1 A; 3UHY A; 1ECD A; 3UI0 A; 1J40 B; 1VXD A; 1SDK A; 4N7O A; 3VRF B; 4IRO B; 2QSP A; 1J7Y A; 1Y85 B; 4ESA A; 4L7Y A; 1BZZ B; 1HBI A; 2MYE A; 2MGD A; 3TM9 A; 2NRL A; 4TWU A; 3LB3 A; 1MLM A; 2QSS B; 1MLL A; 1ABS A; 4X0L A; 3R5I B; 3MN0 A; 4JYQ A; 2FAM A; 4UZV A; 4B3W A; 2BLJ M; 3ZJQ A; 1BUW A; 1HGB B; 1DXT B; 4NK2 A; 2QU0 B; 4HHB A; 3ZJL A; 3WCV C; 2ZSX A; 2HHE B; 3MJP A; 3HYU B; 1G0B B; 1Y0T B; 3IC0 A; 3WTG B; 1UVY A; 4ZVB A; 3DHT B; 1Y22 B; 1VXE A; 1MLU A; 4GZG A; 1YE0 B; 1CIK A; 1Y31 A; 1U7R A; 2OLP A; 2BW9 M; 4F4O A; 1Y09 B; 3NML A; 1GLI B; 1MBA A; 1XZ5 A; 4MU5 A; 2GL3 A; 1LA6 B; 1J3Y B; 3TLD A; 1J7W A; 1S0H B; 2ZLX A; 5CN7 A; 1NZ3 A; 2OHA A; 2G0R A; 1QI8 B; 5HBI A; 1THB A; 3E5O A; 2BLI A; 4NXA A; 3M39 A; 1LFY A; 2ZS0 D; 3WFW A; 1YHR B; 4WJG A; 2BLH A; 2GTL B; 1LFL A; 3B75 B; 1IOP A; 1G9V A; 3ECZ A; 3LB2 A; 2R4Z A; 4MQC B; 1NWN A; 3NFE A; 3BJ2 B; 4DWT A; 1K1K B; 1Y4V A; 3WCP A; 1NIH A; 1XQ5 B; 1O1K B; 2V1I A; 4DC7 A; 4FWZ A; 5E83 A; 5B85 A; 1Y2Z A; 2ZFO C; 1VWT A; 4N7O B; 4SDH A; 1AJG A; 2Z6S A; 4ESA B; 1JZL A; 3ARJ A; 1YCB A; 1LTW A; 1Y4B B; 1XCH A; 3ZJR A; 1HBR A; 2DXM A; 1Y0W A; 1Y7G A; 4X0L B; 1JPB A; 1MBS A; 1XY0 A; 3GYS A; 5CND A; 2D5Z A; 5AZQ A; 1BUW B; 2DN2 A; 3PIA A; 2W6V B; 4HHB B; 2ZT1 A; 3MJP B; 3WCU D; 1Y8K B; 1OBM A; 1Y01 B; 3IC0 B; 3A9M A; 3PI9 A; 3LB1 A; 3WCT C; 1I3D A; 2M6Z A; 5CN9 A; 1DWT A; 4N8T A; 2G10 A; 2MGC A; 1SI4 A; 1DO7 A; 1MLS A; 1FSL A; 2V1H A; 3M3A A; 1JP8 A; 1A3O A; 1Y35 B; 3ZHW A; 4F4O B; 1HAB A; 4FWX A; 1NPF A; 1Y45 A; 1XZ5 B; 3LQD A; 1MLH A; 4MQG A; 3GQP B; 1DLW A; 2G0X A; 3HXN A; 2GNV A; 4ROM B; 3GKV B; 1HLB A; 1RQ4 A; 2ZLX B; 3QJB B; 1THB B; 1HAC A; 1LFY B; 4AVE A; 1LJW A; 1UFP A; 1RSE A; 1LFL B; 1G9V B; 2V1G A; 3D1K A; 4F6B A; 3AT5 A; 1CQX A; 4KN3 A; 1X3K A; 1MNJ A; 4ILZ A; 3D1A B; 3NFE B; 1NWI A; 1YIH B; 1HGC A; 1Y4V B; 1YG5 A; 1JP6 A; 1A0Z A; 3G46 A; 5MBN A; 5E83 B; 1XZ2 B; 1Y2Z B; 1WMU A; 3QM5 A; 1Y0D A; 4H2L A; 1TES A; 2MGL A; 1VWT B; 5CN4 A; 4DC8 A; 3QJE A; 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1MYH A; 2HBC B; 1D8U A; 2HHD B; 2MGB A; 3MVC A; 2W72 B; 1QXD B; 3OVU C; 3A0G B; 1LFV A; 7HBI A; 4NXC A; 4N7N A; 1O1L A; 3WI8 A; 2HBE A; 3KUN A; 2D5X A; 1MLK A; 2MGI A; 2R4X A; 1LFQ A; 1NS6 A; 5JOM A; 1R1Y A; 1LH7 A; 2Z8A A; 5CN8 A; 1G09 B; 4MQI B; 3MKB A; 3A59 A; 1MNO A; 3GQR B; 1KD2 A; 3IXF A; 2MGE A; 1MLN A; 1LH5 A; 1DTM A; 3WCV A; 2R4Y A; 1N9F A; 1Y4R B; 5D1V A; 1MBN A; 3UHH A; 1J41 A; 4WJG 1; 3QM7 A; 3S65 A; 1A01 B; 2ZS1 D; 1MWD A; 2HBF A; 3CY5 A; 1XZ4 B; 1Q1F A; 1Y0C B; 1YOI A; 2G11 A; 4KMW A; 1YHU B; 1V4W A; 1HBS B; 5SW7 A; 3PI2 A; 1YEV A; 3PI8 A; 1GDL A; 5EU2 A; 1CH3 A; 5AZR A; 1BIJ B; 2G0S A; 1RQA A; 3W4U A; 2SPM A; 2O5L X; 3HHB B; 1CO9 A; 3ZJS A; 1A6G A; 3HF4 A; 3MYM A; 1JW8 A; 3BJ3 A; 2O5Q X; 1V75 A; 1Y5J B; 3ODQ A; 3UHZ A; 3DHR A; 1FHJ A; 1Y46 B; 2MGJ A; 3OZV A; 1CG5 B; 2O5O X; 2D2N B; 1WLA A; 3WCW D; 1EBT A; 3A5G A; 3PT7 B; 2MYB A; 2SPO A; 2NX0 A; 1LFV B; 1SDL A; 3S1I A; 3LR9 A; 4N7N B; 2D5X B; 1QXE A; 2YRS B; 5HY8 A; 1ECO A; 2ZFO A; 1MTK A; 1LFQ B; 4AVD A; 3MOU A; 1SPE A; 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