2NDOA

Structure of ecdsba-sulfonamide1 complex
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductases
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
publication title Determination of ligand binding modes in weak protein-ligand complexes using sparse NMR data.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli k-12
total genus 69
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ndoA00
2DJ3A 4TN8A 3PGTA 1QGVA 2CA8A 2CX4A 2PU9C 2V6OA 3ZLPA 3Q6OA 3M9JA 1Z3EA 1JLVA 2MMAA 5KN3A 2GZZA 1XW5A 5ECQB 2P5QA 1T4YA 3UL3A 3ZIJA 4ID0A 2XBIA 5GSTA 2R2JA 1VGLA 3GFKA 1SKWB 5E4WA 4KW6A 1SL0B 2L5OA 1G6WA 1IYHA 4FH8A 1EWXA 1VF4A 3M8NA 4PXOA 5ECNB 5IOXA 4XS4A 3ME8A 2PVOC 2CAQA 5JWQB 3FR9A 1IYIA 2HFDA 2VCZA 1K0BA 2YJHA 2QKEA 2LV3A 1JHBA 3RDWA 2IFQA 3QAGA 2IL3A 5ECLB 3A5WA 3DVWA 2ON5A 3MAKA 4AJ8A 3WT2A 3A2VA 5H5QA 2IIYA 2DIYA 5G5EA 4K8MA 1GULA 3LXZA 3RHBA 2H30A 5DJLA 1O81A 2C0GA 2XHFA 4KGIA 3C8EA 1PGTA 3QDNA 4QQ7A 5ENUA 2F3MA 2FNOA 4ZB9A 1EOHA 2C3TA 3LGCA 1XCCA 4I8BA 4ZB6A 2I1UA 4TRXA 2OA7A 1YF0A 2C0EA 1I9DA 5HR2A 2R6KA 1JZRA 3UVTA 1TK8B 2JZRA 1F3AA 3IPZA 1WJKA 5B6NA 1XZOA 2FGXA 1YKAA 3KTBA 2DJ1A 1PRXA 4ZXGA 2C80A 3E3EA 1JZOA 1WRYA 2AYTA 4MF7A 4GTUA 4ZBBA 4WBJA 2RM6A 4MF6A 5B6MA 4LLRA 2LTKA 3CXGA 4F9ZA 4MA9A 4MABA 4WKWA 1O85A 3ZL5A 4J56E 1RQMA 1SL1B 5A4UA 2HYXA 3OR5A 3KMNA 5F0GA 1OE8A 1KEBA 3RAZA 2DJKA 4Q5QA 3F4RA 3EU4A 5B7CA 3EMXA 6GSTA 1VRSD 4DSSB 2LSTA 1H75A 3LSZA 3MNGA 4I2TA 1U3IA 1QXHA 2M46A 1URMA 1Y25A 1K0OA 3EU3A 4EVMA 1GP1A 1UVZA 9GSSA 1EV4A 4TOPA 2NDOA 1BYEA 1SYRA 1U88A 3C1SA 5G30A 3EYTA 3LFLA 3UVHA 1SK1A 2JU5A 5ID2A 3O6TA 3VWUA 2VCXA 3FRCA 4V2NA 1Z7RA 3GH9A 3S9FA 3FZAA 3ERWA 4X1UA 1FHEA 4WR4A 2MYGA 2GSRA 4ECJA 4FYCA 1F6MC 1TRSA 4F82A 3KEBA 1X5CA 3D6IA 3F6DA 5IMVA 4HS1A 4EE0A 2IMEA 3IAM2 5GZZB 1YDKA 4TR1B 1N8JA 1V2AA 5IM9A 1EZKA 4MZWA 4KDXA 3TRPA 1MD3A 3AY8A 1AIUA 4D73A 2GQMA 1GUKA 2E2MA 3C7MA 3Q19A 2O8VB 6GSSA 4MZBA 4YH2A 4POLA 5D93A 3HZ4A 3GRXA 5G2ZA 2IJYA 5D9XA 3ZIVA 3BBYA 3IK9A 1ZMAA 4MCUA 1ZYEA 3VPQA 2TRCP 2NTOA 3HDCA 1B4PA 1N2AA 3HCZA 3GKMA 3D4MA 1U87A 2R3XA 5CRHA 3EMPA 2HNLA 1DBYA 3GYKA 1SKSB 1YKCA 3GSTA 2LRTA 2VIMA 3M9KA 4LMWA 3TJKA 4GSSA 10GSA 1WOUA 4E8EA 1J08A 5J9BA 1SD8A 4BVYA 1SU9A 5DQYA 1A8YA 4GF0A 4ECBA 2WDUA 3TRQA 5AISA 2TIRA 1TRVA 3F3QA 2L4QA 2CVKA 3TKSA 2IMFA 2V41A 5A4WA 3GKKA 4POMA 3NOFA 2B1KA 3FZ4A 1F2EA 1Z6NA 1F9MA 2L6DA 2DBCA 2GQLA 3CSIA 1KTEA 3H8QA 1JZDA 1CQHA 3WGEA 8GSSA 14GSA 4HI7A 1HD2A 1O8WA 3BD2A 2NVLA 1FW1A 2H19A 1BX9A 2GSQA 5LNKe 3IBHA 3Q18A 2GT5A 2HRFA 4I6XA 2H0IA 4PQIA 1ILOA 2XPEA 1V40A 4BA7A 2LS5A 5IMCA 3KP9A 1V98A 1DSBA 3GIXA 4KAEA 4Q5NA 5HFGA 2XPDA 4GSTA 1DUGA 5HR0A 4K7NA 2KUCA 4GQFA 2V6KA 3CSJA 2B5XA 3GKNA 3UARA 2CAIA 1YQ1A 1R26A 3NIVA 4ML1A 4KE3A 4FYUA 2A2RA 2ON7A 4ZL8A 3G7IA 4POKA 2FWHA 1HQOA 4PX1A 3TKSC 3G9BA 1NW2A 4TXVA 2HZEB 5ECHB 4IP6A 4V1Ap 3RHCA 1QQ2A 3FYGA 3TOUA 2H75A 4K9ZA 1PX6A 3RPNA 2X64A 3EVIA 1ABAA 2A2SA 1K3LA 3TGZA 4G2EA 4NAXA 3CMIA 3PINA 3IR4A 3P8WA 2CVDA 2YZUA 4HU7A 5G5FA 5GAPD 1HNCA 2H70A 5CYYA 1GSQA 2I3YA 2N5FA 2WRTA 3A3TA 1ZL9A 4DSSA 2V32A 3GH6A 2IMDA 1T1VA 4FIWA 3E9JB 1G7EA 4G19A 6GSXA 1E2YA 5ABRA 3TCOA 16GSA 1JFUA 2VM2A 1ON4A 4ML6A 2H71A 5ECMB 4MP4A 2FLSA 3ED3A 4H86A 1RK4A 2F51A 1FAAA 1Z5YE 4WXTA 1ZYQB 2GQKA 5INYA 2EIRA 4N0VA 2B6MA 3FW2A 1YY7A 2RLIA 4RQXA 5CNWA 3E0UA 3GURA 1MDKA 1A8LA 4TR1A 4IS0A 1SYXA 1ERTA 2OBIA 1YEXA 5CP1A 4KSMA 5EVOA 3GTUB 1WIKA 3U6VA 3DVXA 3QR6A 1CQGA 4PUFC 4XHMA 2YWMA 3QOUA 1GSDA 3GA4A 2YWNA 2VD0A 3DWVA 2OE1A 3WGXA 5CREA 5DAKB 4JZQA 3LG6A 3ZFBA 3DEXA 6GSUA 4KCEA 1K0NA 3M1GA 2CVBA 2B3SA 2GTUA 3LORA 4G10A 2BTOT 3QMXA 4AGSA 1NM3A 1EP7A 5CAXA 4ACSA 2J23A 2YNXA 5AGYA 3EINA 1TKDB 4TVEA 1XVQA 3TB2A 4K1FA 3I69A 3HYPA 3O76A 5D9TA 4ZBDA 2H0HA 2JSZA 5HQPA 2H8LA 5IQYA 2A4VA 4N11A 2AHEA 1R5PA 1Z7PA 4HZ2A 3EWLA 4CDOA 3QCPA 4Z7XA 1M9BA 2JZTA 1NSWA 4HDEA 3LQ7A 5AIVA 1XWBA 2YPMA 2FY6A 2HSYA 4AF2A 2OACA 3U5RE 4POBA 3O3TA 2FCHA 4XS1A 1PN9A 1XPVA 2C0DA 4PURA 2C3NA 4WF5A 3D0ZA 1AC1A 3VK9A 1GNEA 1MD4A 4JR6A 1USBA 3TKQA 1F37A 2VOCA 2GSSA 1DE1A 4HQSA 4KB3A 2L57A 2JL4A 2GZPA 2O85A 2B1LA 3GN3A 1XFLA 2N5AA 4IVFA 2GLRA 4ZB8A 5ECRB 1VF1A 4P3YB 5CRGA 5IMAA 3VI7A 1T4ZA 2J9HA 3WGDA 4PQ1A 4IP1A 3KXOA 4X43A 1EEMA 4L5LA 5D9WA 4KUNA 4MLYA 1AW9A 2LJRA 2HZEA 4V2MA 4K0GA 2H6ZA 1TW9A 3ISOA 1S3AA 3IRAA 3VFIA 2WGRA 3N5OA 2LNTA 1XOBA 6GSWA 2C0FA 4BPYA 2X99A 2HZFA 3L0HA 2DJ0A 1PA3A 4F03A 1M99A 4ZBAA 1WWJA 5IPGA 2KHPA 4K2DA 2C4JA 2DC5A 3EC3A 4WBRD 5HR1A 2DMMA 2WS2A 1KNGA 1MTCA 2H66A 1GSFA 3ZZXA 18GSA 1GSSA 2V1MA 1LU4A 5B8BA 1UC7A 4I5QA 2OADA 3KD0A 1V9WA 1I5GA 3IV4A 1ERVA 2VAFA 1EGRA 2E7PA 2GS3A 2EIOA 6GSYA 20GSA 4GRFA 1TJDA 4OO5A 2EIQA 4MJEA 1XVWA 2K6VA 4X0XA 2YP6A 1M7TA 3P7XA 2JZSA 4KSOA 3KMOA 2YANA 3GX8A 4OO4A 4IKHA 11GSA 1ZGNA 1GNWA 4NHZA 1SJ6A 2O89A 2X8GA 5KEJA 4HU9A 1PKZA 4JE1A 3VWXA 1FVKA 1M0UA 4EUYA 3HVSA 2QSIA 2YWOA 2NBSA 5DCGA 3GTUA 1OVNA 3LJRA 5KN2A 1HYUA 1B4QA 2C1YA 3GV1A 2C3QA 4AJ7A 3IOSA 1GTBA 3ZREA 3VLNA 1BQ7A 3ZMLA 2H1BA 4GCIA 2R4VA 5DAKA 2VM1A 4I97A 2I9HA 1X5DA 1GSUA 2CZ2A 3KP8A 5CRWA 4QL7A 3W8JA 1A2JA 4N30A 2F9SA 4HJ2A 1T00A 2WZ9A 2GDRA 2VL2A 1XIYA 2BMXA 2IMIA 4KNDA 4L0UA 4L0WA 4XRDA 1EP8A 1TRWA 4K6XA 5CRDA 2GSTA 4XRAA 5H5RA 1AQWA 3VI5A 3C71A 2YCDA 3DYRA 3F63A 3VPTA 4YQVA 5IOWA 3DRNA 5L71A 5GAND 1XWCA 2HRNA 3IXRA 2OE3A 5IIZA 3VURA 4IJ3A 1ZZYA 4OWYA 3FKFA 2P0GA 3APOA 1TI3A 1PSQA 3SBCA 1UN2A 4IQAA 3D21A 2K9FA 2PGTA 4MF5A 1KBNA 5D73A 4MDCA 3W8SA 2YV9A 3TJBA 2E0QA 2HSHA 1BEDA 2YV7A 3DIEA 1U6TA 2H6YA 4EC0A 1OC9B 3TRXA 4FO5A 2VL2C 2D2ZA 1Q98A 3HJOA 3Q74A 2PERA 3I43A 2H6XA 4BWSA 4J2FA 1M2DA 4HEA2 5B8AA 5IMDA 1XWKA 4DVCA 3LEFA 3D4TA 1E6BA 1FB0A 2LJKA 3GL5A 3KZQA 3UOMA 4DSRA 3HVXA 2O7KA 2XBQA 5EL8A 2X8HA 4JR4A 3F4TA 2GVPA 4TXOA 4IW9A 4WR5A 1WE0A 4TR4A 2B5YA 3TOTA 7GSSA 2HI7A 1X5EA 2C8UA 1YJ6A 2P31A 2IPAA 3QAWA 2AV4A 2G2QA 5DDLA 3IC4A 3DXBA 4KDYA 4XCSA 1LJRA 19GSA 4XTSA 2MMOA 2HLSA 3H1NA 6GSVA 2FWGA 1OC3A 4PUAA 3EURA 4HQZA 1T3BA 4EXJA 2L6CA 1B9XC 4K7IA 1ZOFA 4ZILA 4IHUA 1A23A 4MJCA 4IQ1A 4MK3A 4EF0A 2AB6A 2H1AA 4MH2A 2I81A 4EDZA 1NHYA 1NHOA 1VF3A 4WETA 4IJIA 3BCKA 3IE3A 2CZ3A 2DSAA 3ZMKA 1ERWA 1AXDA 1G7OA 3CYNA 3UEMA 4IELA 2EC4A 1TI1A 1B48A 1SL2B 5ECSA 1S3DA 1TK0B 2FWEA 3P2AA 4ECIA 2F8AA 2AJQB 2L4CA 2VCQA 3K8NA 1MEKA 3GL3A 4PNGA 2ZUPA 3KJYA 4BL7A 2H1DA 4KH7A 2PUKC 3TDGA 1Y6EA 5J3RA 2OE0A 5IMZA 1R7HA 4NXIA 1GTIA 5C04A 2JSYA 4GSNA 1SJZA 4FYBA 1UA5A 4OFMA 5DVBA 4WF4A 2VO4A 1YZXA 2KP1A 4GLTA 1BG5A 3BCIA 1XW9A 2ES7A 4K7OA 4NV5A 5HFKA 1A2LA 4JU5A 5ELAA 2H74A 3IAS2 2FHEA 1A0RP 3CSHA 5IMFA 4KA0A 3GUSA 3GKXA 1J9BA 2AUVA 4V2LA 5LD0A 4O92A 5J9CA 17GSA 4XIHA 5G1KA 2CX3A 3CBUA 3JCML 2K8VA 3H93A 3F8UA 1SK2A 2R5GA 5KN1A 4PNFA 4EL1A 1T7PB 1SD9A 3ZYWA 3SWLA 1X9SB 4YQUA 5DCHA 1T8EB 1EEJA 2CV4A 2FUG2 2XC2A 3FEUA 2MMNA 1TU7A 3HA9A 3FK8A 4O32A 4TR0A 1VF2A 3HD5A 3ZVJA 2Z9SA 3ME7A 1M2AA 1GH2A 1PKWA 3DD3A 2N5BA 1R5AA 1THOA 3ZRDA 2DJ2A 4F0CA 2RUEA 5FHIA 5FT3A 4PGTA 2WB9A 1G0TA 2PWJA 3QPMA 4G9HA 1TRUA 2MBTA 5C00A 3VWWA 1C72A 1A24A 1OC9A 4K0NA 3CTGA 2F8FA 2YWIA 4I2UA 3GX0A 3BJ5A 3WT1A 2ALBA 2RUFA 4MJBA 1FVJA 1OE7A 4JRRA 3KCMA 1RW1A 4KCAA 3ZITA 1OKDA 1PQNA 1QUWA 3C73A 5JCUA 5IO2A 2LUSA 2MMZA 2VLTA 4ULXA 4TXOB 3UAPA 3NZNA 3L4NA 5DBQA 1K3YA 5G1LA 2P5RA 2PN8A 1Z6MA 1TXXA 2L59A 3PR8A 3RBTA 3GMFA 5A4VA 5GSSA 1AUCA 2PBJA 5A5KA 5AIXA 2PPTA 1TDIA 1MDJA 1XOAA 5AN1A 5ECOB 4AJ6A 3IA1A 5D8IA 5JCWA 2H1GA 13GSA 3UJ1A 3V1WA 5HFIA 2GGTA 4QL9A 2H01A 1K0DA 2G0FA 2IN3A 4Q5FA 5DALB 5H5SA 4YQMA 5DQSA 2VCVA 5CO3A 2VD1A 4WEYA 1O8XA 1ML6A 1GTAA 1WMJA 3L9VA 3CRUA 1QK8A 5ECIB 2HT9A 1K0AA 3CRTA 3MWHA 3QD9A 2WJUA 3US3A 4MMMA 4LMVA 2B5EA 1SENA 4Q5RA 2WCIA 5ECPB 3HY2A 1XWGA 3TJGA 1V57A 3LYPA 1S3CA 2YOIA 3EE2A 5FWGA 4O5RA 2VL9A 4CW9A 2QC7A 3GSSA 3ZFLA 3FY7A 2ZCTA 2VUPA 1Q4JA 5JWRB 1JLWA 4OCEA 1W89A 3APQA 1TU8A 3LYKA 4O7HA 3TJFA 1V58A 2H76A 2BJXA 1XBSA 4L5OA 2FA4A 2LRNA 2FWFA 1M2BA 3HJPA 3M0FA 1AQXA 2WULA 4EDYA 5KN0A 2K8SA 1XXUA 2LRCA 1JZWA 3J7Yb 3KH9A 2RM5A 3FR6A 1X9MB 5F8BA 1FG4A 2KLXA 5JCGA 2GZYA 1ST9A 4EO3A 1GUHA 5ELGA 1ZCPA 4CHSA 2YN1A 3FR3A 1THXA 1GLPA 1WPIA 3R2QA 4KX4A 4TR3A 2VL3A 4RI6A 4MZCA 1XWAA 1O73A 1TTZA 1ACVA 4XS6A 5DJMA 2DMLA 2WFCA 1OC8A 3QAVA 1GSEA 1QFNA 2X8CA 2CQ9A 1TK5B 2QGVA 3N9JA 5F07A 3HZ8A 3QFBC 2I4AA 3D22A 5E59A 4YAPA 3TUEA 4OD7A 1BJXA 3IDVA 1BAYA 3HVVA 3TKSE 3UBKA 1XW6A 4YAVA 2MBSA 5F05A 4OMVA 1K3OA 3HXSA 1WP0A 3H79A 5ECKB 1Z9HA 3FHKA 3F6FA 4GWRA 3TKRA 2OBKA 5IO0A 4N10A 3A2XA 1W4VA 1QMVA 1X0RA 1GWCA 5JWOB 4NV2A 1ERUA 1U3AA 5EPFA 1DE2A 4KDUA 2DLXA 1K0MA 4XS4B 4GXZA 2PMTA 2L5LA 2LEGA 3DKSA 3F3RA 1EV9A 3H4KA 2B7JA 3F9UA 3I6AA 3L9SA 2VCTA 4F0BA 1X9WB 1SJIA 1TOFA 1GSYA 2IFQB 1FB6A 1TP9A 3HJMA 5J41A 5D9VA 2LJAA 3M3MA 1R4WA 3L78A 4MPFA 2VLVA 2OKAA 2LNSA 4MJAA 4BVXA 3DGQA 1OKTA 1HNBA 1PX7A 3FZ9A 2M80A 1PL2A 2H73A 5D96A 4TKYA 2HE3A 2VCWA 4DEJA 3APSA 2MZCA 1EOGA 3C1RA 3W6GA 1O7UA 2PVQA 2M72A 3IK7A 1B9YC 2R37A 3F4SA 2YJ7A 4PQHA 2LQQA 2GT6A 2O87A 3TKPA 2FD3A 1PMTA 1J0FA 1EGOA 4RI7A 5COHA 4JEDA 3UMAA 2RIIA 3DMLA 4TW5A 4IBPA 5HR3A 2NPBA 5IPHA 1PD21 2H0GA 5LCZA 4ZIJA 4ISDA 1M9AA 3WD6A 2V2GA 4IGJA 4JBBA 3WYWA 4GQCA 3ERFA 5EY6A 3A2WA 4LL4B 3BOAA 3VWVA 1H4OA 3RPPA 1MDIA 4LL1B 1G6YA 1FO5A 2ZNMA 1AQVA 5DALA 1LBKA 3J7Yk 1F3BA 2FA8A 3ZVJD 4N0ZA 4HJMA 3F0IA 4NPBA 4BWQA 4LA1A 1K0CA 3I9V2 2HXKA 4RUVA 5F06A 2TRXA 1YEPA 2CT6A 2LKUA 4V1Ag 1GUMA 3FZ5A 1AAZA 4ECCA 12GSA 4HOJA 3MSZA 4NWYA 3TJJA 5G31A 2IWTA 3GHAA 1A2MA 2E2GA 2YZHA 3P90A 1OAZA 1GTUA 4NHWA 3UBLA 4ILFA 4E8HA 3KM6A 1A0FA 1B8XA 4ZL7A 1GLQA 2DIZA 4L8EA 4RQRA 5ID2B 2B7KA 4DSQA 4NMUA 4F2IA 1O6JA 4ZL9A 4EKZA 1OYJA 2K18A 3L9UA 3GNJA 4MH3A 3KTLA 4OFTA 2VLUA 2DJJA 3HKRA 3ERGA 4IN0A 1GL8A 3QFAC 3KH7A 4HZ4A 1SKRB 3KIJA 3CTFA 1GRXA 4MPGA 2JADA 3D5JA 1HNAA 2AAWA 3KGKA 3LXTA 4OCFA 3UIWA 1YF1A 2H72A 3HHVA 4J57E 3ZTLA 4OFNA 2KP2A 3LWAA 1SK0A 4D73B 1FOVA 4HUAA 22GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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