2NNSA

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLEVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nnsA00
3D0NA 5FLTA 2FNNA 4RFDA 1KOQA 4MDGA 1CCUA 4KAPA 2Q1QA 4ZX0A 5AMGA 1IF6A 3V5GA 3RZ1B 4Z0QA 1G46A 4M2VA 4YXOA 6CA2A 3OYQA 4E3HA 1FSRA 3ZNCA 4HEYA 1YDCA 3N3JA 3IAIA 2HOCA 9CA2A 4HEZA 1BNWA 3RLDA 1G4OA 3S77B 1G0FA 3MYQA 4WL4A 1KEQA 1LUGA 3BETA 1XEVA 3OIKA 5CJFA 3LXEA 1CA2A 1ZNCA 2FOYA 5FNJA 1AVNA 1CAOA 1I9NA 3OILA 4JS6A 1KWRA 3BL0A 4X5SA 1OKNA 5G0CA 4Z1JA 1UGBA 1ZSCA 4Q7SA 1HEAA 4Q07A 4ZAOA 5A25A 5EKHA 3KOIA 5FL4A 1TTMA 1RAZA 1TG9A 5FL5A 1THKA 1CANA 3R17B 4E5QA 3S71B 4R5BA 3T82A 1I9PA 4YX4A 4Q6EA 2X7TA 1RZEA 2AX2A 2CBCA 4QTLA 2CBEA 5DOHA 5EH5A 5DSKA 2FOVA 5CA2A 1ZGFA 3M5EA 5FNGA 3S75B 5EH8A 3M2XA 5BRWA 3P58A 1BNVA 3KNEA 3F8EA 4IDRX 4Y0JA 1LZVA 3NB5A 2FW4A 2POWA 5A6HA 2WEHA 5DSOA 3MDZA 4HT2A 4YGFA 1CNHA 4WR7A 5HPJA 4CACA 1CZMA 4QIZA 3RGEA 4MDMA 1H4NA 3PO6A 3TVOX 5DSRA 4UOVA 5DSPA 4N0XB 1CNYA 3N0NA 2FMGA 3FFPX 1CNCA 5BRVA 1BN4A 3CAJA 4QJPA 4C3TA 3C7PA 3T5UA 4HF3A 3MWOA 4YYTA 1CVAA 1RJ6A 4Q7WA 4Q81A 3KOKA 4L5VA 4ITPA 1CVCA 2VVBX 4YGKA 5L6KA 2WEJA 4YHAA 1BICA 5JG5B 1BN1A 2EZ7A 4HT0A 3UYQA 1HVAA 4YGLA 4KNJA 1CNKA 1H9NA 3D92A 5BNLA 3V3GB 1YDAA 5JEHB 2NXRA 3NJ9A 3Q31A 4WUQA 1YO1A 1XQ0A 3F4XA 1HUHA 3DD0A 3F7BA 1G53A 1HCBA 3DCSA 4Z1KA 5G0BA 3SBHA 2OSFA 3IBNA 1EOUA 1RZDA 1HECA 4QJOA 4HU1A 4JSZA 1TH9A 2X7SA 5E2KA 1G6VA 2CBAA 3DAZA 1FSQA 1BN3A 3PJJA 5E2NA 4ZWXA 4BF1A 3MHIA 5DSIA 3MNHA 4BCWA 4QY3A 5FLOA 5E5RA 5DSQA 2NN7A 4M2RA 1Z9YA 1JV0A 1CAIA 5EOIA 1CNIA 1DMYA 2W2JA 4YXIA 1ZGEA 1ZE8A 4PYYA 3SAXA 3V3HB 4XFWA 4ETQC 1TG3A 5JDVB 1CCSA 4RN4A 1CVDA 5EKMA 3KS3A 3P5LA 4RFCA 3B4FA 3KIGA 5JEPB 4FVNA 4ZWYA 3T83A 4JSWA 1UGCA 4Q8XA 1BZMA 4Q83A 5CLUA 4ZX1A 2POUA 2VVAX 3D9ZA 3VBDA 4R59A 3U45X 4M2WA 4PQ7A 3KWAA 5JESB 1AM6A 1MOOA 4GL1X 4PZHA 2NNGA 1FLJA 3M1JA 1G54A 1HCAA 4RIVA 5E2SA 3DBUA 3IBLA 1F2WA 3CYUA 3V7XA 2WD3A 4L5UA 4YXUA 3MZCA 3M1QA 1FR7A 4DZ9A 2WEOA 4Q06A 3S76A 3M5SA 3P4VA 3K34A 3IBIA 5E2MA 3RZ8A 3OKUA 1CALA 4KUVA 4WW6A 1LG6A 1J9WA 1BNTA 1RJ5A 2QO8A 3EFIA 5DSNA 4K13A 5DOGA 1UGGA 3DC3A 1G0EA 4QJMA 1CNXA 5SZ5A 3R16A 1XPZA 2NWPA 5FNIA 3RYZA 1IF5A 3IBUA 5FDIA 2NN1A 2NMXA 4RUZA 1DCAA 1URTA 1MUAA 5EIJA 5L3OA 5SZ3A 3MHOA 1V9IC 2HNCA 1G4JA 4KUWA 3OYSA 3M3XA 3T85A 5JEGB 3KLDB 3M67A 1OKLA 3RYVB 2FNMA 1CVFA 3HKTA 4HBAA 1RZCA 1TEUX 5G01A 4MO8A 4Q99A 4Z1NA 5G03A 5DVXA 1ZH9A 2EU3A 3MHLA 3DVBA 5SZ2A 4RH2A 3IGPA 4M2UA 3GZ0A 3V2JA 3DD8A 8CA2A 2FOSA 4G0CA 4JSSA 4CA2A 5BYIA 3MNKA 4Q6DA 4E49A 2AW1A 1YO0A 4LHIA 4YGNA 3TVNX 3S97A 3K2FA 1Z97A 1HEBA 3RG4A 1I9OA 2WD2A 3K7KA 2FMZA 1KOPA 4YWPA 2QOAA 4QJXA 5FNLA 1FR4A 3PYKA 3HLJA 4WUPA 1G3ZA 1LG5A 1UGAA 1BNUA 3HKQA 4Q78A 1UGDA 5JQ0A 1I91A 4Q09A 1RAYA 4FU5A 1V9EA 4QSIA 3EFTA 5FL6A 3V3JA 3DVDA 3HKUA 4KNIA 2CABA 3M04A 4R5AA 3M5TA 4KV0A 1BNQA 2X7UA 2FOUA 1FQRA 3MNAA 2POVA 3RYJB 4E4AA 2HKKA 3MNJA 5DRSA 3OY0A 5LMDA 2O4ZA 1IF7A 1CVHA 4YGJA 4CNRA 1TEQX 2CBDA 3U3AX 3HKNA 5SZ6A 1OKMA 2ILIA 2NNSA 3S8XA 1CRAA 1UGFA 1TBTX 4XIWA 4ILXA 4QK1A 5AMLA 4Q7VA 2CA2A 1CINA 4K0SA 4E9OX 3MHMA 1G52A 1HUGA 2F14A 1RZBA 2H4NA 4FIKA 4IWZA 3CZVA 4KNNA 4MLTA 2NXSA 1T9NA 5EHEA 3ML5A 2NNVA 1ZSAA 5J8ZA 1CIMA 5AMDA 2NWOA 1CRMA 1OQ5A 3P3HA 3S9TA 1CAZA 3M40A 5JQTA 3IEOA 4E3DA 2Q1BA 4PYXA 1DCBA 5E5UA 3DVCA 2ABEA 3QYKA 4MDLA 4YVYA 5SZ1A 4Q08A 4CNXA 1Y7WA 1KWQA 4CQ0A 1CAYA 1HEDA 4ZWZA 3V3IB 3N4BA 4FPTA 3OKVA 2HD6A 2NWZA 3JXHC 5E28A 2EU2A 2GEHA 2HL4A 4WW8A 3W6HA 5EKJA 3M1KA 3KKXA 1FSNA 5BRUA 3BL1A 3L14A 4PXXA 5FLSA 3OIMA 3M2YA 4RUXA 5FNKA 1CA3A 1RZAA 3M14A 3P5AA 4Q90A 1A42A 2ZNCA 3JXFA 4TWLA 2NWYA 1CNJA 3S73B 4LU3A 3S78B 5JGTB 2FOQA 1CNWA 3RYYA 4COQA 4Q0LA 1IF8A 4KP8A 1H9QA 4K1QA 4Q9YA 3RZ7A 3T84A 3U7CA 2H15A 4Q7PA 2IT4A 4L5WA 5EHWA 1I9LA 3M98A 3P3JA 3B1BA 3DC9A 4MTYA 5E2RA 4Q8ZA 5CACA 4XZ5A 3V3FA 1BCDA 5SZ4A 4K0TA 3HS4A 3JXGA 4QSAA 4XIXA 3D93A 5FDCA 1JD0A 1YDDA 3DV7A 3M2NA 3RG3A 3CA2A 1I8ZA 4RUYA 4XE1A 3DCCA 5SZ7A 4QJWA 1YDBA 3RYXB 3DA2A 4E3FA 5FNMA 3RZ0B 1XEGA 3NI5A 4CNVA 3U47A 4KP5A 3M96A 1I9MA 4BF6A 3MHCA 3F7UA 1BNMA 2Q38A 4KUYA 1CCTA 1G45A 4QSBA 3V2MA 1CAMA 1ZFKA 3FE4A 1CILA 1I9QA 3M1WA 4DZ7A 1TB0X 5EHVA 1CAHA 3P44A 4TWMA 3W6IA 4FRCA 3TMJA 3N2PA 5FLQA 1CVEA 2GD8A 5JGSB 3DCWA 4CNWA 4Q49A 4HEWA 1LGDA 2HFWA 4QSJA 1TE3X 3P55A 3RZ5A 3MMFA 4JSAA 1IF4A 1DMXA 2QP6A 4LP6A 3MNUA 5FLPA 7CA2A 3SBIA 12CAA 1CNGA 2FNKA 1IF9A 3T5ZA 1FQMA 4FL7A 1ZFQA 1JCZA 5DSMA 1G48A 4QEFA 2WEGA 4KNMA 4ITOA 1BV3A 1CAJA 1I90A 3M2ZA 5FNHA 1UGEA 2CBBA 4ZWIA 4MLXA 3S72B 5IPZA 4QK3A 5DSLA 1BNNA 4Z1EA 2NNOA 4Q87A 4N16A 5DSJA 3HFPA 2OSMA 3S74B 4K0ZA 4E3GA 1CAKA 3ML2A 1YO2A 3UYNA 3MNIA 1FQLA 4RIUA 5SZ0A 5JG3B 1FQNA 4G7AA 3KONA 5FLRA 4Q8YA 1Z93A 3D8WA 3FW3A 4QK2A 2NXTA 3ZP9A 5EZTX 3SAPA 1ZSBA 1CVBA 1CNBA 1G1DA 4QIYA 4FVOA 4QJ0A 5C8IA 5EH7A 3RJ7A 1AZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D0N A;  5FLT A;  2FNN A;  4RFD A;  1KOQ A;  4MDG A;  1CCU A;  4KAP A;  2Q1Q A;  4ZX0 A;  5AMG A;  1IF6 A;  3V5G A;  3RZ1 B;  4Z0Q A;  1G46 A;  4M2V A;  4YXO A;  6CA2 A;  3OYQ A;  4E3H A;  1FSR A;  3ZNC A;  4HEY A;  1YDC A;  3N3J A;  3IAI A;  2HOC A;  9CA2 A;  4HEZ A;  1BNW A;  3RLD A;  1G4O A;  3S77 B;  1G0F A;  3MYQ A;  4WL4 A;  1KEQ A;  1LUG A;  3BET A;  1XEV A;  3OIK A;  5CJF A;  3LXE A;  1CA2 A;  1ZNC A;  2FOY A;  5FNJ A;  1AVN A;  1CAO A;  1I9N A;  3OIL A;  4JS6 A;  1KWR A;  3BL0 A;  4X5S A;  1OKN A;  5G0C A;  4Z1J A;  1UGB A;  1ZSC A;  4Q7S A;  1HEA A;  4Q07 A;  4ZAO A;  5A25 A;  5EKH A;  3KOI A;  5FL4 A;  1TTM A;  1RAZ A;  1TG9 A;  5FL5 A;  1THK A;  1CAN A;  3R17 B;  4E5Q A;  3S71 B;  4R5B A;  3T82 A;  1I9P A;  4YX4 A;  4Q6E A;  2X7T A;  1RZE A;  2AX2 A;  2CBC A;  4QTL A;  2CBE A;  5DOH A;  5EH5 A;  5DSK A;  2FOV A;  5CA2 A;  1ZGF A;  3M5E A;  5FNG A;  3S75 B;  5EH8 A;  3M2X A;  5BRW A;  3P58 A;  1BNV A;  3KNE A;  3F8E A;  4IDR X;  4Y0J A;  1LZV A;  3NB5 A;  2FW4 A;  2POW A;  5A6H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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