2NPBA

Nmr solution structure of mouse selw
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
MALAVRVVYSGACGYKPKYLQLKEKLEHEFPGCLDICGEGTPQVTGFFEVTVAGKLVHSKKRGDGYVDTESKFRKLVTAIKAALAQCQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Solution structure of selenoprotein W and NMR analysis of its interaction with 14-3-3 proteins
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
molecule keywords Selenoprotein W
total genus 24
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2npbA00
3MDKA 4F0BA 4GSNA 3D6IA 3D0ZA 2DIZA 5B6NA 2LV3A 2JL4A 3FZ9A 5JWRB 3IC4A 2YZUA 4EDYA 2OACA 1JZOA 1GRXA 3H1NA 2CQ9A 2IMKA 4OFNA 1X5CA 2JACA 3EU4A 4WKWA 1B4QA 4LMVA 1GULA 3QDNA 1WIKA 4XS4A 1NW2A 4ISDA 5ECRB 2N5FA 3GMFA 1O73A 3UVTA 4MJAA 4ZILA 1S3DA 3L9VA 1ZGNA 2VOCA 1F3BA 3ZZXA 3HHVA 3QFBC 1AW9A 2FD3A 3TDGA 3KP9A 1B9YC 1LU4A 5HFKA 5COHA 3HCZA 4WF5A 3ZRDA 1G6WA 1TTZA 4HU9A 4BWQA 4KA0A 2OE3A 5C04A 4WEYA 1MTCA 2CVBA 3F63A 3ZIVA 4DSQA 4FIWA 1YEXA 2KLXA 3IV4A 3TGZA 1O8XA 2O89A 3DD3A 1GTIA 3KH9A 4F0CA 2OA7A 2H70A 3C73A 4KCEA 4BWSA 4XS4B 2WRTA 1EOHA 2P31A 3FKFA 5IMCA 2H6YA 3KJYA 4PUFC 5IQYA 2MMNA 1R5AA 2IIYA 4GWRA 1RW1A 3UIWA 1A8YA 3QOUA 4L0UA 4IJIA 3FEUA 2LEGA 4NHZA 4ZB6A 2JADA 3EU3A 5ELGA 1TOFA 4I2TA 4HI7A 5J5NA 3QD9A 4PURA 4OCEA 2M80A 1WOUA 2K8VA 3GTUB 2VD0A 5IM9A 1JLWA 3HJOA 4HZ2A 3EWLA 2C1YA 2EIOA 2FNOA 2YWNA 4EC0A 5D8IA 3UARA 11GSA 1O6JA 5GSTA 4LL1B 4OO4A 2DJ1A 4K7IA 5J4UA 1MDIA 1GNEA 5KN3A 3RPNA 4QL9A 1MD4A 2IWTA 3DVXA 3TCOA 2XPDA 4MK3A 4NPBA 5G31A 5ECLB 4ML1A 3HDCA 4IQAA 1HD2A 3QR6A 4H86A 4MJBA 3F9UA 2V2GA 3ERGA 1ZL9A 1TI3A 4NV5A 4RQRA 1GSUA 1GL8A 3GL5A 4OFMA 1PKWA 1XVQA 4WF4A 1XW9A 3IE3A 3RPPA 4L5LA 3CRUA 1XXUA 3HZ4A 3VI7A 1SL2B 3O76A 2GT6A 3TJFA 1SL1B 4ULXA 5HR0A 1FB6A 1EV4A 2BMXA 4KW6A 1EOGA 4TXOA 1JLVA 1BEDA 1YEPA 4XRAA 1GWCA 1U88A 2ZNMA 3F3QA 1XW5A 1AUCA 2B5EA 3DEXA 4F2IA 4ZL8A 2I1UA 5ECMB 2R6KA 5IO2A 2H76A 5A4VA 2JZTA 1ZMAA 4IN0A 2AAWA 1R4WA 1FAAA 5EY6A 1M9BA 4DSSA 1I5GA 2PPTA 4ECIA 2CA8A 1X9MB 2V1MA 5FHIA 3ISOA 4V1Ag 2LNSA 3VI5A 4MA9A 2IMIA 1V9WA 2WZ9A 1UN2A 1A2LA 6GSXA 2H66A 2HSHA 1Y6EA 2AB6A 4TXOB 4XIHA 1A8LA 1R5PA 2QGVA 4MCUA 2DJKA 3PGTA 3CXGA 4ID0A 1N8JA 1QQ2A 3H8QA 2HLSA 1G7EA 1XWCA 2YJ7A 1PN9A 4RI6A 4ILFA 3LXZA 5KN1A 1ZCPA 1U3AA 4IGJA 4DSSB 3FZAA 2NPBA 1AQWA 4L0WA 2WJUA 2GLRA 4ZXGA 3F4TA 1CQGA 1VRSD 1HNAA 2VLTA 4G10A 1YF0A 2GSQA 1AIUA 3D4TA 1FO5A 1JHBA 1OC9A 2OADA 3RHCA 3J7Yk 1G7OA 2B3SA 2HRNA 5B6MA 2C0GA 3UAPA 1HNBA 1SENA 2E0QA 3U5RE 1KBNA 4DEJA 5IMAA 3UVHA 3F6DA 1A2MA 1GUKA 2VL2A 2IFQA 3U6VA 3KM6A 3VWWA 2VL2C 3GURA 2I4AA 2C3TA 2C80A 1TXXA 3NIVA 2VLVA 3LJRA 5IOXA 3TOUA 2B7KA 4I5QA 3VWUA 5C00A 1B4PA 3FZ4A 3E0UA 4HEA2 4RQXA 4K2DA 1ML6A 4NMUA 2VCVA 3HA9A 1A2JA 3FR3A 2JZSA 4CDOA 2MMAA 2R4VA 3FRCA 4BVXA 3GFKA 3D21A 3EVIA 3CRTA 1GSQA 4MLYA 2KHPA 1URMA 3VLNA 4KUNA 1HNCA 1K0MA 1GSEA 1GLPA 2JZRA 3F4SA 4Z7XA 1DBYA 3G7YA 3M3MA 3KH7A 2VCZA 4GQFA 2L6CA 2H30A 3EC3A 5GAPD 4LL4B 1K0BA 6GSVA 1V58A 4HQZA 1B48A 3CSHA 2Z9SA 1TRUA 4TN8A 4HQSA 4HUAA 3GKMA 5ABRA 1K3OA 3LSZA 2V32A 4CHSA 3HYPA 5DJLA 2GSTA 3OR5A 4MZBA 2H1GA 2H73A 1KEBA 4IELA 5JWQB 1J9BA 3KMNA 1KNGA 3GL3A 3GN3A 1SU9A 1PL2A 1GLQA 4MMMA 1UA5A 1OKDA 1F2EA 4TW5A 2CZ2A 2VO4A 4J2FA 2HFDA 1ST9A 5B7CA 2GQLA 2X8HA 2GS3A 3TKSA 1EV9A 3WGXA 2VCXA 3IAS2 2E2MA 5E4WA 4IQ1A 3HD5A 1S3AA 5E59A 1XWAA 6GSWA 3K8NA 5ECOB 4MH2A 3TKSE 4MJCA 2HZFA 3TB2A 5J3RA 3F3RA 1GP1A 4XS6A 2BJXA 3L9SA 3IK9A 2R3XA 2KUCA 4TKYA 3NZNA 5CNWA 1EWXA 4X43A 6GSTA 3QFAC 17GSA 1EZKA 4KX4A 3KP8A 1LBKA 3QAWA 4ECCA 4J57E 4EDZA 3IA1A 4JBBA 4HS1A 4JRRA 4ZBBA 1W4VA 20GSA 1Z6NA 2RIIA 1K0DA 3RDWA 3IDVA 2VCTA 1ILOA 5ECSA 4RUVA 5CO3A 3QMXA 1DE2A 2H1DA 1TDIA 2R5GA 1ACVA 5J41A 2LUSA 2H72A 4O92A 3RHBA 4P3YB 1TU8A 3PINA 4LLRA 3BBYA 3VWVA 1XZOA 2IPAA 5IMVA 3LEFA 2F8FA 2K18A 2XPEA 4ML6A 5G1KA 2HYXA 2P5QA 2A2RA 1XOAA 1TK5B 5D9VA 4N30A 5F0GA 1THOA 4JEDA 1NHOA 5DAKA 5LD0A 1GSDA 1OKTA 1HQOA 2YP6A 3CBUA 3DMLA 5B8AA 2X64A 3TKQA 3DYRA 1K0AA 3TKRA 2H6XA 5ECPB 2PERA 3WGDA 4XHMA 4O5RA 2GDRA 5FT3A 2WS2A 3IXRA 1B8XA 2IJYA 2VM2A 4OMVA 3W8SA 1DUGA 3W8JA 2KP1A 1F6MC 2PU9C 3IOSA 5J9BA 2O8VB 2H0IA 2N5AA 2WFCA 4PNFA 1OC3A 2YZHA 4WXTA 4F9ZA 2HSYA 4MPGA 5DAKB 2VL3A 2I81A 3GRXA 4HZ4A 1E6BA 3N9JA 3MNGA 3IK7A 2O85A 3EMPA 4ZL9A 2NTOA 2LQQA 5ECKB 3F8UA 1O85A 3KZQA 1AC1A 2LRNA 2VUPA 3L78A 2O87A 1U3IA 3UOMA 3ZYWA 3GA4A 4IP1A 2PMTA 3E3EA 4V2MA 6GSUA 2CV4A 2YWIA 3TRXA 2NBSA 1F9MA 3GKXA 2WB9A 1EP7A 2VCQA 4FYCA 1EP8A 4AJ7A 3UEMA 1THXA 2XBQA 3LORA 1ZYEA 3KCMA 5JCWA 1MD3A 2RUFA 5L71A 3GUSA 5HR1A 2EIRA 4E8EA 4PX1A 2DMMA 10GSA 4V1Ap 1TI1A 2E7PA 1Y25A 2F3MA 1X5EA 4I2UA 5A4WA 1YF1A 1M9AA 2L5OA 1R26A 1OAZA 4MH3A 2FGXA 1XW6A 1K0CA 1KTEA 5IIZA 1QUWA 4YQUA 5DDLA 1NHYA 2RUEA 3TJBA 2ON5A 1USBA 2G2QA 1SKRB 4FO5A 4JZQA 5ECIB 4ZL7A 2IL3A 1IYIA 1TW9A 5A4UA 2LQOA 3C8EA 1X0RA 2B7JA 2FWHA 1E2YA 2FA4A 1T7PB 2VD1A 5KN0A 3HZ8A 2MBSA 3HVXA 2DJ0A 4IVFA 3UBLA 4EVMA 5D73A 2VCWA 2GSSA 1PX7A 2H0GA 4KH7A 5DCHA 4FH8A 12GSA 4OCFA 2DJJA 4LMWA 3M1GA 1SKWB 3GIXA 2PVQA 3A2VA 4IP6A 3Q6OA 4TVEA 4V2LA 2P0GA 4GXZA 2YANA 5AIXA 4JR6A 1A23A 3APOA 2ALBA 3GH9A 4Q5QA 3KTBA 2MYGA 4MPFA 3H79A 4TR1A 4PNGA 2FA8A 4N0ZA 1T00A 4WBRD 3R2QA 1ZYQB 5D9WA 2MMZA 1FG4A 2GT5A 1FVJA 2B5YA 4IBPA 1F3AA 2GSRA 5DVBA 4BL7A 2CVDA 3EURA 2YPMA 4ZBDA 1XCCA 1ON4A 3ZMKA 2QC7A 3IAM2 2FCHA 2JSYA 1GTBA 2N5BA 5ECQB 2DLXA 3FR6A 4Q5FA 5AISA 4YQMA 2R37A 1GTUA 5G5FA 4WETA 4DVCA 2LJKA 2HT9A 3VURA 3US3A 1V2AA 4CW9A 3QCPA 4PUAA 4TR1B 4MF7A 5ECNB 3GNJA 4ECJA 4TR3A 4ZB8A 3GH6A 1TU7A 3I6AA 3C71A 4AGSA 1TRWA 1AAZA 1T4ZA 1Z9HA 4FYBA 3SWLA 5KN2A 2FWEA 2AV4A 1Z3EA 4AJ6A 1WRYA 5DBQA 3BCIA 2C3QA 2DJ2A 1GUHA 1BJXA 1ERWA 2FY6A 2GZZA 2PBJA 5ID2A 3GX8A 1PQNA 4OD7A 1H75A 4BVYA 2LJRA 4G19A 4PQ1A 5FWGA 1QK8A 2LRCA 3HXSA 1OC9B 2H0HA 3P90A 5H5RA 4XCSA 2X8CA 3WYWA 3ZVJD 2OE0A 4EUYA 2H75A 1BX9A 3ED3A 2V41A 4KNDA 4GF0A 2PUKC 4NHWA 3I9V2 2VM1A 5DCGA 4GCIA 2V6KA 2IFQB 2C0FA 4WR4A 1K3YA 4Q5NA 4EE0A 3VFIA 2R2JA 3CYNA 4HJ2A 1LJRA 3A2WA 4YH2A 4GTUA 5ECHB 3WD6A 1PRXA 5ID2B 2YV7A 3HKRA 2EC4A 3BD2A 1PMTA 3VPTA 1SYXA 1FOVA 4HDEA 2LSTA 5IO0A 1TP9A 2GQMA 3TUEA 1SJ6A 5DALA 4K6XA 3I43A 4D73A 5D96A 2MZCA 5D93A 4MF5A 3VK9A 3SBCA 5B8BA 1VF4A 2GGTA 4MZCA 1TK0B 2H71A 3CTGA 3CTFA 3M9KA 3Q19A 2I3YA 1FB0A 1I9DA 2YWOA 4GRFA 1ERTA 2DMLA 3ERFA 2G0FA 3EINA 2OE1A 3WT2A 1NSWA 1FHEA 1T1VA 3TKSC 3ME7A 4MDCA 2DC5A 2NVLA 1XWKA 2H19A 3EE2A 5CRGA 1TRSA 7GSSA 5D9TA 5LCZA 1FW1A 3KD0A 5IMZA 2A4VA 1N2AA 1M0UA 2IN3A 2M72A 3WT1A 2FWFA 4GSTA 5DALB 4D73B 1R7HA 5HQPA 2WDUA 3ZREA 1A0FA 3TJKA 4ZIJA 1VF2A 4NWYA 4K1FA 5JWOB 4K0NA 2XBIA 1CQHA 1X9WB 3KTLA 4TRXA 2PWJA 4L8EA 1YKAA 3H4KA 4KE3A 5DQYA 2ZUPA 3PR8A 4EO3A 3TJGA 1YY7A 3C1SA 4MF6A 3ZTLA 1PD21 4YAVA 1XWGA 4ZB9A 2H1BA 5G2ZA 4POKA 2LTKA 3G7JA 4PQHA 3BJ5A 3IBHA 2TIRA 3CSJA 5CYYA 3D22A 2B5XA 2WCIA 3DRNA 4KSMA 4KDUA 1WJKA 1EEJA 2VL9A 3KGKA 1K0NA 1O7UA 3ZMLA 3APQA 2X8GA 3MWHA 1JFUA 5DQSA 4EF0A 1GTAA 1Z5YE 2HXKA 1K3LA 1YDKA 3ZFBA 1YZXA 2GZYA 3DWVA 2IMEA 5HFGA 3HJMA 1XWBA 2L4QA 2WGRA 1YKCA 3GHAA 2L57A 3LGCA 4IJ3A 2ON7A 1V98A 2RM6A 3DVWA 1BAYA 3L4NA 4IHUA 4E8HA 3RAZA 4MP4A 3HY2A 1G0TA 5EVOA 6GSYA 1K0OA 3LYPA 1DE1A 1PA3A 1EGRA 4KAEA 3LWAA 3IRAA 2LNTA 3TJJA 4EXJA 5ELAA 4NXIA 4BPYA 3ZVJA 2GVPA 2KP2A 2RM5A 2PGTA 3Q74A 2C4JA 4XTSA 1EGOA 4X0XA 4I8BA 2TRCP 3LYKA 2H1AA 4AF2A 5CRDA 3NOFA 3H93A 3I69A 5G1LA 4QQ7A 3GYKA 4GLTA 2A2SA 3UMAA 1XOBA 4X1UA 4KGIA 4WBJA 4RI7A 3GTUA 1G6YA 2MBTA 2JSZA 2BTOT 2WULA 1XBSA 1WE0A 1XFLA 2CAIA 2FLSA 5IPGA 5D9XA 1OVNA 2YOIA 1O8WA 2HRFA 1MDKA 5F05A 2VIMA 1T8EB 1FVKA 3APSA 3IPZA 2M46A 1GH2A 3HVSA 4OFTA 9GSSA 1JZRA 1ZOFA 1PKZA 4V2NA 2DSAA 2K8SA 2GZPA 5EPFA 4O7HA 2XHFA 1X5DA 2YWMA 3L0HA 4J56E 1QFNA 2L6DA 1U87A 1SJZA 1Z7PA 4K7NA 2YN1A 3P7XA 4MABA 3V1WA 4PXOA 1GUMA 1YQ1A 3LFLA 3IR4A 2C8UA 1PX6A 1VGLA 1SJIA 4IS0A 4EKZA 1TK8B 3QPMA 2J23A 1SD9A 2OJLA 2B1KA 3GV1A 1VF3A 3ZIJA 2TRXA 2ZCTA 4OO5A 3BCKA 2CT6A 3GKKA 2IMDA 1J08A 3EYTA 4YQVA 1OYJA 1Q4JA 5CAXA 3M9JA 4I6XA 1T3BA 3A3TA 2LRTA 4N10A 3F6FA 3FYGA 3PH9A 5H5SA 1SK0A 2FUG2 4POLA 4HOJA 5F06A 4POBA 5AIVA 1WP0A 5HR3A 2LS5A 1PSQA 1U6TA 2CVKA 2FWGA 1V57A 4GSSA 5JCUA 3C7MA 5INYA 3GX0A 2PVOC 2X99A 3ZL5A 3MAKA 3D5JA 4O32A 3FW2A 1A24A 2H8LA 3JCML 1GSYA 1XVWA 3LG6A 3GSTA 2DIYA 4JR4A 3EMXA 3G9BA 2ES7A 4N0VA 18GSA 4DSRA 3FY7A 2V6OA 3DGQA 2YV9A 5G5EA 1V40A 2P5RA 4LA1A 3VWXA 1WWJA 1Z7RA 1UVZA 2KOKA 1X9SB 16GSA 4I97A 2DJ3A 2IMFA 1ERVA 2XC2A 3O6TA 3VPQA 3M0FA 1DSBA 2RLIA 1M7TA 4K7OA 4POMA 4XS1A 6GSSA 3ERWA 4YAPA 5HFIA 3S9FA 4NV2A 2AHEA 1ZZYA 1QGVA 3IHQA 4KSOA 4Q5RA 3MSZA 3KIJA 1PL1A 3DKSA 13GSA 5JCGA 3N5OA 19GSA 3QAVA 1Z6MA 1B9XC 1M99A 4FYUA 3FK8A 1M2DA 2L59A 3UJ1A 2AUVA 4F03A 14GSA 1ERUA 4K0GA 4G2EA 2CAQA 3UL3A 2EIQA 3F0IA 1C72A 2PN8A 2MMOA 5IPHA 3DXBA 3RBTA 2REMA 1RK4A 2OBKA 4PGTA 4BA7A 3P8WA 3BOAA 2F9SA 4KDXA 1M2BA 1VF1A 3TRQA 3A5WA 2HI7A 5F8BA 4AJ8A 3GKNA 1PGTA 4NAXA 4TR0A 3E9JB 4MJEA 2L4CA 4HJMA 3J7Yb 4XRDA 2F8AA 3ZITA 1QMVA 3KEBA 2LJAA 1Q98A 3GSSA 4F82A 2DBCA 2E2GA 2C0DA 1T4YA 1ABAA 2NDOA 2I9HA 2GQKA 5IOWA 5CP1A 4TOPA 4TR4A 2CZ3A 1OC8A 5G30A 5GSSA 4EL1A 3FZ5A 1SYRA 4IW9A 1A0RP 5H5QA 2FHEA 5KEJA 3DIEA 2HNLA 2L5LA 5IMFA 3WGEA 4OWYA 2GTUA 3TOTA 2JU5A 1TKDB 3KMOA 3KXOA 4MZWA 2OKAA 1SKSB 4KB3A 2QKEA 4GQCA 5IMDA 2YNXA 2B6MA 2B1LA 3P2AA 1TRVA 4L5OA 1OE8A 5CRWA 4K9ZA 1GSSA 1MDJA 1QXHA 5CRHA 2K6VA 1H4OA 4JU5A 3FR9A 2J9HA 3ZFLA 2AYTA 2AJQB 1SD8A 2H74A 3F4RA 3ZLPA 22GSA 4K8MA 4JE1A 2OBIA 3QAGA 1O81A 4KCAA 1F37A 8GSSA 5EL8A 5LNKe 3HJPA 2HZEA 3CMIA 3O3TA 4HU7A 2VLUA 2D2ZA 2C0EA 5DJMA 4IKHA 3ME8A 1HYUA 4WR5A 5A5KA 3A2XA 2CX4A 2C3NA 3AY8A 1JZWA 1S3CA 2K9FA 3UBKA 1XIYA 2CX3A 3D4MA 3M8NA 2H6ZA 1UC7A 1SK1A 1SL0B 2HE3A 3FHKA 2VAFA 4KDYA 2YCDA 4TXVA 1W89A 1M2AA 1YJ6A 1AQVA 1WMJA 3W6GA 2LKUA 1JZDA 1TJDA 1MEKA 3HVVA 5AGYA 2HZEB 2YJHA 5ENUA 5HR2A 3TKPA 5F07A 1EEMA 1AQXA 1BQ7A 3Q18A 4G9HA 2H01A 5CREA 5AN1A 1GNWA 1SK2A 1BYEA 3C1RA 3LXTA 1NM3A 4ECBA 1GSFA 2O7KA 1OE7A 4PQIA 1IYHA 4QL7A 1XPVA 1J0FA 5GZZB 2QSIA 1BG5A 4N11A 4ACSA 1WPIA 3TRPA 1RQMA 5GAND 2F51A 3G7IA 5J9CA 3L9UA 3LQ7A 3CSIA 4ZBAA 1AXDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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