The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
145
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structure length |
145
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Chain Sequence |
ADFDAVLKCWGPVEADYTTIGGLVLTRLFKEHPETQKLFPKFAGIAQADIAGNAAVSAHGATVLKKLGELLKAKGSHAAILKPLANSHATKHKIPINNFKLISEVLVKVMQEKAGLDAGGQTALRNVMGIIIADLEANYKELGFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
S-nitrosylation-induced conformational change in blackfin tuna myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transport protein
|
| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
58
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| structure length |
145
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| sequence length |
145
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ZJH A; 5ILP A; 1NQP B; 1AJG A; 1Y7D A; 2GNW A; 1YHU B; 1N9F A; 3E4N A; 1G0A B; 1MNI A; 1YHU D; 1NS9 B; 1AJH A; 1LTW A; 3PI4 A; 1VWT A; 3WFT A; 1A0U A; 1MWD A; 1RTE A; 4FC3 A; 1XZV A; 4HBI A; 1Y0D B; 3M3B A; 1GLI A; 4O4T A; 2AV0 A; 4U8U C; 3UH6 A; 1ECD A; 3OK5 A; 1HAB B; 1HJT A; 1YG5 A; 1JF4 A; 1J7S A; 1QSH B; 2MGH A; 5MBN A; 3WCW A; 2AUP A; 1MTK A; 3NFE A; 3VRE B; 3QM7 A; 4PQ6 A; 2FRF A; 2GTL B; 5E29 A; 2LH2 A; 1THB B; 2GTL D; 2HBS B; 2SPO A; 4MQJ B; 1DLY A; 3ECZ A; 1RQ3 A; 4MQG B; 3O89 A; 1CO9 A; 1BZR A; 5ILE A; 1MLO A; 2PGH A; 2D60 A; 2EVK A; 5E83 A; 2B7H B; 3GK9 A; 1UFJ A; 1MLK A; 4H2L B; 5E6E B; 2DN2 B; 1BZ6 A; 1Y8W B; 2G0V A; 1N9H A; 2HBD A; 1XZ4 A; 4IRO A; 1MZ0 A; 4MU5 A; 1YEQ A; 3LHB A; 3ONZ B; 3LB3 A; 4PQC A; 5CNG A; 1HLB A; 3VAU A; 1LJW B; 1MLJ A; 3QM9 A; 2G0R A; 1DXT B; 1OUT B; 1GZX A; 1T1N B; 3SZK B; 5KER B; 1MNJ A; 1MOA A; 1MBO A; 1OR4 A; 2G0Z A; 1Y7C A; 1MNO A; 3HRW B; 2R4Z A; 3PI3 A; 1O1J A; 1CIK A; 3NL7 B; 1YMC A; 3BCQ A; 4N7P A; 4ODC A; 3PI9 B; 1BIJ B; 4C44 A; 3NML A; 1R1Y A; 5CHQ A; 3WTG A; 1LA6 A; 3K8B A; 1FN3 B; 1A9W E; 3NMM B; 1DXV A; 2GL3 A; 2ZLW B; 1LFT A; 2R1H B; 1MBA A; 1Y8K A; 2QU0 B; 1HDS A; 3TM3 A; 1S6A A; 2GNV A; 1YIE B; 3QM5 A; 3UBV A; 1YOI A; 3DHR B; 1PMB A; 5CN7 A; 4BJA A; 3GQR A; 1C7C A; 1RVW A; 4TYX A; 2BMM A; 1A01 A; 3KUN A; 2EB9 A; 1HBR A; 1A00 B; 2AA1 B; 1GCV A; 3QJC A; 1DXU A; 2ZLU B; 1O1P B; 1V4X B; 1NS6 A; 1MYG A; 1IRD A; 1JP9 A; 1A4F B; 2ZLT B; 1Y7G B; 4IT8 A; 2Z6S A; 1U7S A; 4N8T B; 1YEV B; 3PT8 B; 3E55 A; 1NEJ A; 3V2V A; 3BOM B; 5M3S A; 4M4A A; 2W72 C; 1YHR B; 3FS4 A; 1HHO B; 3M3A A; 4KN3 A; 2ZS0 B; 2ZSN A; 1DTM A; 1MLN A; 1QXD B; 3S66 A; 1FHJ A; 1O1M B; 2BKM A; 5IKS A; 1CH3 A; 3WR1 A; 1Y8H A; 1LFZ B; 2FAL A; 2FRJ X; 1Y4F A; 1HGA B; 2D2N A; 1K0Y A; 4F4O B; 3WI8 A; 1YZI A; 3WCV B; 1RQA B; 1JP8 A; 5CNB A; 3H57 A; 3BJ1 A; 4MAX A; 1RPS B; 3LB2 A; 4ILZ A; 1M6M A; 2DN1 B; 3OO5 B; 4YU3 B; 3WCU A; 3OO4 B; 1MLH A; 1SWM A; 1Y22 A; 5JGG A; 2KSC A; 1Y0T B; 3FH9 B; 3PI1 A; 3QJE A; 2AUQ A; 1YGD A; 1A6M A; 4NI0 A; 1QSI A; 1C40 B; 4HRT B; 3AQ8 A; 1ABW B; 3UHV A; 2DN3 A; 3UBC A; 2AUO A; 2MYB A; 1V4U B; 1LFY A; 1R1X A; 1YE2 B; 3TLD A; 1CLS A; 3PI8 B; 1XZ2 B; 3SDH A; 3UHY A; 1YCB A; 1MLR A; 2M6Z A; 1MYJ A; 3AT6 A; 3MYN A; 2ZLV B; 3MJP B; 2D2M A; 106M A; 2YRS B; 1VXE A; 1SHR A; 2RI4 B; 4O4Z A; 4U8U B; 4B3W A; 3D1K B; 1J3Z B; 4U8U D; 3M38 A; 2ZFO A; 1BZ0 A; 1O16 A; 2W6W A; 1V4W A; 1PBX B; 1B0B A; 5CNE A; 4NK2 A; 1SDL B; 3M39 A; 2ZT2 A; 3GKV B; 1XY0 A; 1MTI A; 1YHE A; 5CN9 A; 1YE0 B; 2ZLX B; 1Y4G B; 1CH4 A; 5CHR A; 2ZS1 A; 1QXE A; 3HEN A; 3VRF A; 3PEL B; 4F68 A; 4XS0 B; 3IXF A; 2OIF A; 1U7R A; 1HDA B; 5F0B A; 103M A; 5HLX A; 1XZ5 B; 3S65 A; 1CG8 B; 1Y09 A; 3DUT B; 1IBE A; 5EV5 A; 1SDK B; 3ZH0 A; 1Y83 A; 1YDZ B; 2VRY A; 2Z6N B; 3UHZ A; 1AZI A; 3B75 A; 3WCW C; 2QRW A; 2G3H A; 1GVH A; 1LFV B; 1FAW A; 4KMW A; 3KUO A; 3MJU B; 1FDH A; 1MBI A; 3MKB B; 1C7B B; 3ODQ B; 4NK1 A; 1OUU A; 4NI1 B; 1YGF B; 1B86 A; 1CO8 A; 3ED9 A; 1Y35 A; 5SW7 A; 3BJ2 B; 2MGD A; 1CH5 A; 1Y5F A; 3QJB B; 105M A; 1CMY A; 1MLU A; 1MYF A; 5CND A; 5EU2 A; 4MQC A; 1LHT A; 1BAB A; 1IWH B; 3HF4 B; 5EUI A; 1ABY B; 3HHB A; 2OLP A; 2QSP A; 2HHB B; 1A0Z B; 1FSX A; 1DO7 A; 2VLY A; 3R5I A; 2ZSX A; 1Y5J A; 1IT3 A; 1HGC A; 1O1N B; 3IC2 A; 5KDQ B; 2WTH A; 3HC9 A; 2QMB A; 3AQ6 A; 1HBS A; 1NGK A; 4F6I A; 1YH9 B; 1XZU B; 1HGB A; 1SPG A; 3GYS B; 1J3F A; 3ZJI A; 3EOK A; 3UHN A; 5HAV A; 5F2A A; 6HBI A; 1BZZ B; 2HCO A; 3HEO A; 2VEB A; 1G9V B; 3ARK A; 1BZP A; 3G4R A; 3ZJM A; 3HYU B; 4HHB B; 2QSS B; 1S5X B; 3D7O B; 3HEP A; 1XQ5 A; 2ZSR A; 1UC3 A; 2O5B X; 5KKK A; 1J52 A; 3ZJQ A; 1MYI A; 2MGE A; 3ZJL A; 1CBM A; 4MQK B; 1YIH A; 3BJ3 B; 1HBH B; 2HZ1 A; 1C7D B; 1MCY A; 3SDN A; 3A5A A; 1NAZ A; 3GQP B; 1YHU A; 1G0A A; 2MGA A; 3D1A B; 4PQB A; 1Y0C B; 3GKT A; 2HBF B; 1XYE A; 3OZV A; 1CG5 B; 1RTX A; 5B85 A; 1Y5K B; 3EU1 A; 1Y45 B; 1Y8I B; 4GZG A; 1VRF A; 1J3Y B; 2D5X B; 2NRM A; 1KR7 A; 2SPM A; 1JWN A; 2RAO B; 1MOH A; 1O1K A; 3OJ1 A; 1Y0D A; 1XZ7 B; 1YVQ A; 1KD2 B; 1HAB A; 1A6G A; 1QSH A; 1GDI A; 2V1K A; 3OZU A; 1YVT A; 2DXM B; 1VXB A; 4TWU A; 3VRE A; 2D2N C; 2AUR A; 1X9F A; 2GTL A; 2XYK A; 4M4B A; 3VRG B; 1K1K A; 1THB A; 1COH B; 1J7W A; 3G4Q A; 3WCT B; 1LH3 A; 2HBS A; 3WCT D; 4MQG A; 1G0B B; 2D5Z B; 3WCU C; 1G08 B; 1ABS A; 3UHB A; 1XCH A; 3LQD A; 2ZFB B; 4H2L A; 2DN2 A; 1Y8W A; 5JDO E; 1Y7D B; 2QFK A; 3LR9 A; 1JZM A; 3UHR A; 3UH3 A; 1MOD A; 3DHT A; 3ONZ A; 5AZR A; 1A0U B; 1Y7Z A; 2ZWJ A; 3IC0 B; 1SPE A; 2HBC A; 3D4X B; 4FC3 B; 1XZV B; 2D2M C; 3W4U B; 1S56 A; 1LJW A; 1DXT A; 1OUT A; 1WLA A; 3UH7 A; 4MQH B; 1T1N A; 5KER A; 3AG0 A; 4JAC A; 1N9X A; 1UT0 A; 1YG5 B; 3PIA B; 1DO3 A; 2OH9 A; 2ZFO C; 2EKU A; 3HRW A; 3WCW B; 5JOM A; 3G46 A; 3NFE B; 1V75 B; 3PI9 A; 3RGK A; 3A5G A; 2Z8A A; 1FCS A; 1CP5 A; 1S5Y A; 1F5O A; 109M A; 1J40 B; 1JL6 A; 2QU0 A; 1VXD A; 1O1I B; 2D60 B; 2ZS1 C; 1YIE A; 5EE4 D; 2BWH A; 1S61 A; 3MOU A; 1MBC A; 3ECX A; 2H35 B; 2O5T X; 1A00 A; 3PT7 A; 3GDJ A; 2ZLU A; 1O1P A; 1MBD A; 4HSW A; 1V4X A; 1HBB A; 1HBA B; 1MLS A; 1A4F A; 1GDK A; 1GDL A; 1VRE A; 1Y7G A; 1DKE B; 1GZX B; 4N8T A; 4H07 A; 1YEV A; 3P5Q B; 1MWB A; 7HBI A; 4F69 A; 1Y7C B; 3BOM A; 5HY8 A; 1Y2Z B; 3G4Y A; 3K9Z A; 2DC3 A; 1YHR A; 2MGI A; 5HU6 B; 3BCQ B; 4N7P B; 4ODC B; 3UHT A; 4ROM B; 2O5O X; 3CIU B; 2MGG A; 1QXD A; 1R1Y B; 1O1M A; 3WTG B; 1LA6 B; 2NX0 A; 1H97 A; 3G4V A; 1OR6 A; 3CY5 B; 1HDS B; 3QJD B; 1HGA A; 3AT5 A; 1MLG A; 2GRF A; 1DWS A; 2CMM A; 1C7C B; 1RVW B; 3G4U A; 2ZS0 D; 2DN1 A; 1L2K A; 4YU3 A; 2QLS B; 3OO4 A; 4KJT A; 4MXK A; 4O35 A; 5JDO F; 1Y0T A; 3FH9 A; 1CIO A; 2LH5 A; 1DXU B; 5CMV A; 1MKO A; 1Y4B B; 1LFL B; 1JZK A; 1NS6 B; 1IRD B; 1ABW A; 3UHU A; 2NSR A; 3WCV D; 1O1L B; 2E2Y A; 1MTJ A; 3HXN B; 3MVC A; 4L2M A; 5AB8 A; 2PEG B; 1KFR A; 1J41 B; 4AVE A; 1NEJ B; 1M6C A; 3PI8 A; 1XZ2 A; 1OBM A; 4N7O B; 3FS4 B; 1YEN B; 2EKT A; 5EYJ A; 2ZLV A; 1UFP A; 1UX8 A; 1URV A; 1NIH B; 2YRS A; 2V1F A; 2R50 A; 1GBU B; 4DC8 A; 4U8U A; 2R4Y A; 1MDN A; 2W6V B; 3D1K A; 3GOU B; 3WCP B; 1S0H B; 3LB1 A; 2HHE B; 2HBE B; 2ZSP A; 2D2N B; 2H8F A; 1BZ1 A; 1GCW A; 4DWU A; 5MBA A; 1O1O B; 2R4W A; 1Y0W B; 1LH6 A; 1SDL A; 2G11 A; 2O5S X; 2ZSQ A; 1XXT B; 5HLU A; 1JY7 B; 1YHU C; 1UMO A; 1CH2 A; 2BLI A; 1QI8 B; 1YEO B; 2G10 A; 2R80 B; 1Y4V A; 1YE0 A; 1Y22 B; 1Y4G A; 5JGG B; 3ZJO A; 3G52 A; 4XS0 A; 1DLW A; 1YGD B; 1Y46 A; 2MGJ A; 3VHB A; 1HDA A; 2HBG A; 5C6E B; 1XZ5 A; 1CG8 A; 3D17 B; 3UHD A; 1FSL A; 3DUT A; 2XKI A; 3ZJR A; 2HZ3 A; 3UHH A; 2W31 A; 1SDK A; 1YDZ A; 2Z6N A; 1CP0 A; 1LFY B; 4N7N A; 4ROL A; 1LFV A; 1AJ9 B; 3QZZ A; 2M6Z B; 2VLX A; 3G4W A; 2BLJ M; 1X9F C; 2GTL C; 2MGL A; 3AT6 B; 1SI4 B; 2D2M B; 1A3N B; 2LHB A; 3ZOM A; 3MKB A; 1HSY A; 3KMF A; 4AVD A; 1C7B A; 3ODQ A; 2VYY A; 3ARL A; 4NI1 A; 3H58 A; 3EDA A; 3GQG A; 1Y4Q B; 2ZST A; 4ESA A; 3QJB A; 104M A; 1HRM A; 1Y85 B; 1NZ3 A; 1HAC B; 1DTI A; 3LR7 A; 4FH6 A; 1XY0 B; 1IWH A; 1ABY A; 1A6N A; 3A0G B; 1Y0A A; 2ZT3 A; 1HBG A; 3UHI A; 3AQ5 A; 1YFF B; 3K3U A; 1MLM A; 1Y01 B; 1QXE B; 2HHB A; 2ZS1 B; 1A0Z A; 1MOB A; 2GKN A; 3U3E A; 2V1H A; 3ZHW A; 3R0G A; 2GLN A; 1Y09 B; 1YEU A; 1G09 B; 1IBE B; 2H8D B; 2EVP A; 4G51 B; 5JDO C; 1FAW B; 3UHX A; 3ECL A; 1GBV B; 1YH9 A; 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5EYS A; 1W92 A; 102M A; 2VYZ A; 1DXD A; 4MQJ A; 2VEE A; 1XYE B; 2HHD B; 2V1G A; 2BW9 M; 2MYD A; 3EU1 B; 3IC0 A; 1DO4 A; 2B7H A; 3D4X A; 3S48 C; 1EW6 A; 4F6D A; 1JDO A; 2Z85 A; 3NG6 B; 1UVX A; 1JP6 A; 5E6E A; 1O1K B; 3W4U A; 2R4X A; 1CH9 A; 2O58 X; 1MYM A; 2GKM A; 3QM8 A; 4MQH A; 1YVQ B; 3PIA A; 1S69 A; 4O1T A; 1I3E A; 1YVT B; 2MGM A; 1VWT B; 3MYM A; 1FLP A; 1CH1 A; 1V75 A; 1X9F B; 4WJG A; 4M4B B; 1K1K B; 1YCA A; 1X9F D; 1J7W B; 3UHC A; 2GDM A; 2MGK A; 1GLI B; 1VXG A; 3LB4 A; 2V1E A; 4TWV A; 3SZK A; 1J40 A; 1JPB A; 5EQM A; 1O1I A; 1J7S B; 4JYQ A; 4OF9 A; 2ZT4 A; 3LQD B; 1DWR A; 5C6Y A; 3NL7 A; 2VLZ A; 3WCW D; 3UHS A; 1BIJ A; 2H35 A; 5EET A; 5E29 B; 3UI0 A; 1DWT A; 2V1I A; 2W6X A; 1V9Q A; 1FN3 A; 1RQ3 B; 3NMM A; 3DHT B; 2ZLW A; 2R1H A; 1MYT A; 1TU9 A; 1Y7Z B; 1NPF A; 2PGH B; 4WCH D; 5E83 B; 1HBA A; 2HBC B; 2G14 A; 3DHR A; 1HBI A; 3PI2 A; 3UH5 A; 1EBC A; 1DKE A; 3KMF C; 1LUE A; 1BVD A; 2HBD B; 1XZ4 B; 1MNH A; 3P5Q A; 1F63 A; 2AA1 A; 4VHB A; 4IRO B; 1Q1F A; 3WFW A; 1Y2Z A; 1YEQ B; 1NZ2 A; 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