2NRRA

Crystal structure of the c-terminal rnaseh endonuclase domain of uvrc
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
151
structure length
139
Chain Sequence
MEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLATVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 44
structure length 139
sequence length 151
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrrA00
2NRWA 2NRZA 2NRXA 2NRTA 3C65A 2NRVA 2NRRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SI6A 4CBUA 1S1TA 1YHQN 3P83D 4CBXA 4BRKA 1B92A 2NLXA 3T1AA 3SUPA 3AY9A 4H0PA 3T19A 2F7TA 3AO3A 5EOYA 4FWKA 3DXKB 3HPHA 4E1MA 4CJWA 3BZCA 2WC9A 4I6MA 4GV3A 4DV5K 4DS4A 2GUPA 4IOXA 3SBTA 4E3SA 2GELA 4BY9C 1X9SA 2O8CB 4X66K 4MO4A 4CF8A 2JWLA 3O80A 4F3TA 5JLFA 1W9HA 5BRHA 3TSUA 4CHOA 4IZ9A 5BR8K 4KPYA 3SMSA 5KPZA 2PBDA 1U6ZA 1C0TA 1KLNA 2QXLA 3FFIA 1RBUA 4CGDA 2G8HA 1GLLO 2A5XA 3HZ6A 3VOVA 2A6AA 1YVUA 3H45C 1NJWA 1NGIA 3WXMB 3IKMA 1OH8A 3BF1A 2A40A 5HRRA 2ZGZA 3NF6A 1X9JA 1S1XA 3U3YA 4DG1A 2YKNA 3NGZA 3P39A 3HVRA 1QQOA 3B6PA 3CC2N 4CJ5A 1FW6A 1S3XA 2VWBA 1M90O 4FM0A 4OPKA 3DLLL 4H5VA 4H5NA 1NK8A 2ZQBA 1XNQK 1IBLK 2A1RA 4LF8K 2VWKA 1ESVA 1DTTA 4CK3A 5DM7L 3O3HA 2P9KB 5AQQA 3D7EO 4Y1DA 3J7YP 4F2RA 1KRPA 1VSLA 2XY7A 1C1BA 2QA4N 1Z26A 4A2BA 1VQ9N 3RMAA 4DTJA 1NGCA 4DTMA 4ISGA 2YI1A 1XI1A 3C7NB 5C2FA 4Z4IA 2F4VK 2UUAK 2UU9K 4WF9L 4IG3A 2JGUA 1S6PA 4B8AB 4RCHA 3ZSYA 5AZIB 4NYNA 3C6UA 2I7PA 1EXQA 3ULEB 2F8TA 1NGEA 1MDUB 1U04A 5FLXO 3H6EA 1RILA 4IXCA 4DFJA 4CZIA 3J81O 1XUPO 5D3GA 1MA9B 2W41A 1JLQA 5BRDA 3DWLA 2X6SA 3I56N 4FJMA 4FJ7A 3L2UA 2Q36A 3RSEA 3TTFA 4I9QA 2KZZA 4DQSA 4BRQA 4HTUA 5BN9A 2KLAA 1SL0A 5TKWA 4FJHA 5AQJA 3TWHA 3TI0A 5AQNA 2AA4A 5JS2A 4JKDA 1NBWA 3WQTA 1HYSA 2O8BB 4ICLA 3OYEA 1W0HA 3HJFA 3D45A 3CCMN 4JI0K 3DXKA 4JKFA 2UXBK 3U6FA 1HPMA 3A8YA 3KD1E 4KHWA 3DI6A 4Q0BA 1VQ8N 1RT2A 3ULDA 1XMOK 3D2EB 3A5MC 4U7BA 3D0PA 3O5BA 3QDKA 2O8CA 1EKEA 3ZT1A 2V7YA 1KFSA 5EU7A 5TKYA 2G8IA 1BIUA 3AAQA 4YDUC 1VSFA 1V4TA 3VQ8A 1LCUA 2IVOA 4JI2K 4BR4A 3CCSN 3VA0A 4JI5K 5C42A 4AHVA 5EVZA 4JI8K 4NB4A 3SJJA 1TK0A 1Q82O 1X3MA 3RTVA 2W6LA 3J7ZO 5AQPA 3AO4A 1GLAG 3CF5L 3O3GA 3QNOA 4YOWA 3WXLA 1Z6RA 3PV8A 3HK2A 2RPIA 4FOIA 4K25A 3LDSA 4FVUA 2D0OA 3CPEA 4AM7A 3QFPA 4KAZA 4CF0A 3QIOA 5FRNA 1TAUA 3AA3A 1BISA 2P51A 1KAZA 3ENOA 1S22A 4K43A 4NLBA 3VQPA 5HBMA 2P9KA 3SLCA 3O9TA 4FPBA 1RBRA 4B9SA 4X62K 1K73O 5KGWA 4KHPK 3F9MA 3VQ4A 4M42A 4H0VB 1T3VA 2HHSA 2ZJPL 3MEGA 3KLIA 2J4RA 3E1YA 3C7NA 3S41A 4O44A 4CCHA 4W5RA 3ZSZA 2UXCK 1NGJA 5AZIA 4RTFD 1NK7A 1L3VA 3KIOA 4FLUA 2IVNA 3N4QA 4A59A 3ULEA 1SL1A 1QHAA 1JLCA 3HYFA 2YHBA 3OBYA 4M45A 4E7KA 4DQ8A 2AP1A 5JMVA 4L8RB 3OTOK 4CJEA 1L3UA 4BC2A 1HNIA 3AVJA 5J2PA 1YAGA 1JLGA 3L2RA 3NH1A 2DFFA 4W5TA 4M7XA 3MCAB 4BVOA 1VQ4N 2O8BA 1KAXA 4YNQA 1BO5O 4BRHA 2P9NB 4E7IA 2NUBA 3MN7A 3CCQN 1HKGA 3O4QA 1WSEA 4LFBK 4FWNA 4Z94A 3WUHA 1WNSA 5ELZA 4B3RK 4KI6A 4RW4A 1HR0K 4DQQA 3D2EA 1X9WA 5LY3A 3S3NA 4HWIA 4FWSA 5SZTA 1D4XA 3T1YK 1VQ6N 2OZSA 4C8NA 1QQNA 2Q97A 4RWTA 1QVFM 3NHGA 1NJZA 2HHWA 3EZWA 1TGOA 3K0SA 1J53A 2QWRA 3LAMA 4B08A 4FWMA 3T1HK 1K8KB 5FPMA 4FJ8A 4E7JA 3THXB 3I0SA 3IG1A 4ZTJA 1CLQA 1KVAA 4FWRA 4OPAA 2WBNA 2HNDA 1Y64A 3G10A 3OYMA 3AO2A 4BC3A 3RMDA 1LWFA 4DHYA 1BL3A 1WB9A 1HJOA 2WTUA 4N41A 1KTQA 1ATSA 5LMUK 3ZSQA 3F5TA 4J8FA 5CZ2A 3V9ZA 4FJ5A 3L3VA 1S6QA 1G15A 3LDNA 2CGLA 3DAWA 5AQOA 3HTVA 5I42A 4CIGA 3C95A 3SAHA 3VENA 3SQ2A 1VSJA 4F2SA 3L0QA 3HRGA 5M1KA 4MLHA 1DT9A 3VF2A 3VEYA 1RDBA 3ZT4A 4W5NA 2HVIA 1S1WA 4Z0UA 4KRFA 4FSVA 4A61A 3THVA 3DLRA 3SPYA 3L4QA 3P1GA 3OYGA 3QBXA 3SUNA 3AVMA 3CQYA 3VESA 1J6ZA 2G8VA 3K57A 2QKKA 3V6DA 3KKRA 3IRXA 3W3DA 4CHPA 3LAKA 3Q7BA 1RT1A 4FZXC 2KHOA 3G71N 2P5GA 1VQLN 4GV6A 1LAWA 1TAQA 1SKRA 1YIJN 4IO9L 3AVNA 3VQQA 3KD5E 2RKIA 3DRPA 2ZM6K 3FZFA 3V1OA 1NLVA 3O3FA 2ZE2A 3KK7A 3M6GA 2Z1HA 4C8LA 3WEEB 4BR9A 1LW0A 4BC5A 4M3UA 2P9PA 3AARA 4DV0K 1RBSA 5KQ8A 3KLGA 5FDLA 3QESA 3DXMB 5FPNA 2ETJA 3LM2A 4RW8A 3SAGA 4FM2A 5AQHA 5DM6L 2Z1GA 2QWMA 4DSJA 2R7YA 3VEWA 3S9HA 3RR7A 3VEOA 4LFCK 3TANA 4B1VA 1BCOA 4HUGA 3HT3A 3HP6A 1J9AA 3DLGA 1EO1A 4JI7K 1MWKA 4DLGA 2FBXA 3LP3A 4NYFA 1Z25A 4M7YA 4YHHK 4DCHA 4CZFA 3KVGA 3I33A 4YORA 3U9DA 2WONA 2P1JA 3LPUA 4CJTA 3M3ZA 4RW9A 1K8KA 3AO5A 2NRTA 2I7NA 5A2QO 3L2QA 5FRMA 2DFEA 5FROA 3FLCO 1WSIA 4EHTA 1BU6O 4UQGA 5J2NA 4EFHA 4OO1J 2WOMA 1TK8A 5CY4A 4CEEA 2Q2RA 4DU1A 1LWEA 3O8MA 4NCBA 5KPRA 1X1PA 4B1YB 3BZKA 4BR0A 3L3UA 3J80O 3AA5X 1T6CA 3C6TA 4AILC 1YJ9N 3CERA 4ZHRA 1B9FA 3LZIA 4ZTFA 3VETA 1N32K 4FLZA 1IKXA 1NK5A 2W6KA 1YXQA 3QFUA 2FSNA 2ATQA 5AQUA 3A5LC 1HRHA 4O8KA 4GV9A 3CI5A 4BQZA 4B9LA 1U2VB 1TYQB 4ILHA 3W0LA 4FJLA 4DTRA 2E5LK 3O9SA 3HVTA 5KTQA 1S72N 1VRUA 1A5WA 3VTHA 3MDQA 3VERA 3LANA 2IC3A 4DTOA 1JXEA 1VQ7N 2UXDK 5KRTA 2E8AA 4CEAA 5HP1A 3QNNA 4BDPA 2ZJQL 4O55A 4LFAK 1FKPA 5KPTA 4LD0A 4DR6K 4DB3A 1WSGA 1NM1A 2QM1A 2ZJRL 1ZBUA 1TL3A 4DV7K 3QIPA 4DR1K 3WEEA 3P38A 4JAXA 4MLEA 4AHCA 1EQYA 2NRXA 3T69A 1HNVA 4O5BA 1IH7A 3DXMA 5JVGL 2P9IB 2PYLA 3NBPA 3OJSA 4CESA 4LH4A 2P9UA 4JHDB 2HF4A 3CETA 3NE6A 1C0GA 1VQPN 3L6QA 1G99A 3LP0A 2B5JA 4EHUA 2KKZA 4KTQA 5GINA 4DSEA 4H0OA 4JRQA 3PIOL 3MECA 2EX3A 3DLHA 2YV0X 3AVAA 4CZKA 2UUBK 1WSHA 4CJSA 4CHZA 4N5SA 4JI4K 4CEDA 1DGKN 2KQ2A 3KTQA 4FJGA 5AJ3K 4B9VA 2WFBA 2A3ZA 4CHNA 3CFRA 1XC3A 2NRVA 4OKEA 4BC4A 1GLJO 3CJBA 4DTSA 2X78A 1HKCA 3L2VA 3QEWA 3THWA 1EETA 1U49A 1Z05A 4CJQA 1NK4A 2KFNA 3V1RA 4W5OA 3KLEA 4CFDA 1ZXOA 3O1BA 3NGYA 4BROA 3CCUN 4CEBA 5I3UA 1HYVA 3OS1A 4DSKA 2F96A 2QXFA 3LDOA 2Q1NA 4K0KK 1TYQA 4J2BA 1JLFA 1QZ5A 3GE1A 4H0YB 3TSQA 2G8FA 1QE1A 3H08A 5HRNA 5SWMA 1BA1A 3NAEA 3CMAN 3OYFA 4FK4A 1XHXA 1NK6A 1KQSM 3LM9A 4BDZA 1VQKN 3HI0A 3QICA 4PUOA 1HNZK 1WN7A 4KH6A 1T6DA 3EZ5A 4JI3K 4JLHA 2XY6A 1U45A 3BY5A 3RRGA 4ILGB 3AVHA 4DV1K 3HSTB 4A57A 5KRSA 1O1WA 4BRFA 3AVFA 4K8XA 4CIEA 3VMFB 4FL9A 4JRPA 5BN8A 5C10A 1VRTA 3ASMA 3CCRN 4KHUA 3NGIA 3CM6A 3ZT2A 4QS8A 1BOTO 4DU3A 2P9LB 2Q0RA 2P9IA 3U4LA 3M8SA 1MWMA 3I0RA 3F73A 4H03B 5MLCQ 4GKKK 4JKGB 4DUZK 3MN5A 4JKBA 1DTQA 3SBGA 3NCIA 2YNIA 4PA1A 4PL8A 1NJYA 4FJXA 4JKHA 4CHYA 3CQXA 1BUPA 1KXPA 2KFZA 4IDKA 2HHQA 2YJEA 3DRRA 1W97L 3ZSVA 1C6VA 4JD2A 1XQSC 1VSDA 4RW7A 4AHRA 3SQ1A 4CF2A 4FLWA 4FJJA 3MXIA 2GUIA 1R0AA 4PKHA 4JS4A 3VQEA 4FJ9A 1ATNA 2HHXA 4DR3K 2BANA 4CI6A 5GADP 1D5AA 4BRLA 4B1XB 3CJ9A 3MEDA 5CYMA 4B3SK 3VTIA 3GL1A 1HNXK 2E1YA 1SV5A 1RBVA 1WUAA 2BUPA 3NVMA 4JNEA 2VQFK 4BR2A 4GVMA 1RTJA 3WNEA 4CJPA 4HCCA 4DR2K 1NGAA 4WFNL 1T03A 2GBZA 2OTJN 4KHNA 3H3NO 3JXUA 5AQRA 3CCLN 3EO3A 3H1VX 4CFCA 4FPAA 1SAZA 2HHHK 5IT9O 1GOAA 3UKRB 1Q9YA 2CH5A 2DY4A 4KHSA 5J2QA 4FLXA 3BUZB 1GOCA 4BRNA 1YJWN 2VG5A 3VA3A 4KH4A 4HVJA 2QWQA 3A2FA 3CHWA 4CJFA 4MDAA 4CJ3A 3CC7N 2VYPA 4AHSA 3CCVN 1U48A 3SCXA 4H8KA 3KK3A 2E6MA 4OPJA 3OYCA 3HBTA 3R8EA 3FZKA 1HPZA 2OA8A 1RT6A 4FZYA 2IGIA 2PAVA 4F8RA 5AQMA 1RTIA 3QLHA 5LJWA 1VSEA 1ITGA 3VQBA 2O8FB 2D0BA 3KK1A 4XIUA 4KO0A 3I8DA 2DFHA 4CERA 1TKDA 3AA4A 1T44A 3L2WA 3SZ2A 3TTCA 3IDHA 1C1CA 2HHTA 1DEJA 3E01A 3O1WA 2W42A 1NG9A 2DTUA 3H3OB 3NF7A 2P9LA 2NNWA 4UY8O 4CJ7A 1RDUA 2OCEA 2KZMA 3MK6A 3LWLA 3ENHA 3K9KA 2QWNA 3QINA 1HMVA 4FM1A 3PUFA 1RBTA 2O8EB 1S9EA 4FK0A 3HM8A 4KTZA 1C0FA 2VG6A 4OKJA 2A1SA 3SJHA 4FYDA 2XY8A 4XEIA 2Q3SA 4A5BA 1YITN 3CCEN 1RDWX 1HQUA 2H3GX 1XMQK 1N36K 5AQFA 2Z1IA 5HRPA 3DLBA 5C25A 2BH1A 3V9UA 1NGFA 4B1UB 1TKZA 3O6WA 3OW2M 1IO2A 1NJIO 1YF5L 2ZWHA 1TV6A 3C0BA 1J5OA 2FSKA 3KHYA 3TAPA 1GOBA 3QEXA 4BQLA 4G9ZA 2YHAA 3PLAA 3NF9A 3VEVA 4I2PA 5CHIA 4IO8A 2F9TA 5GIPA 4U67L 4YOTA 4CGJA 4LSNA 4AM6A 4DV4K 2Q31A 2IAJA 5HLFA 4AQYK 3VGKA 4QS7A 4A5AA 3O9UA 3P4IA 3Q7CA 1QVGM 4DFMA 4DSLA 1IG9A 3OJUA 2NZTA 4FOEA 5CE3A 1W2BM 1BCMA 4H5WA 3THYB 4DR7K 2F9WA 3EKUA 1KFDA 4PKGA 4L3QA 4CJRA 5T7BA 2G8UA 3QETA 4BGBA 3KZBA 1IV0A 3RVCA 1UAXA 3CJAA 3PX4A 3CC4N 4JN4A 3QERA 4WE1A 4BG8A 3HP9A 4WQ5C 1JXBA 1ASVA 4BWJA 2IS3A 3E9LA 2HHVA 3DM2A 4YOXA 2O8FA 3M8QA 4BRCA 1FXXA 4EAHD 5LL6Z 2HOEA 4QCLA 3AA2A 4KREA 4QS9A 4DMNA 1KAYA 5E41A 3O08A 5M1QA 1QHTA 1FJGK 2BE2A 4IOAL 4FZZA 2HVHA 4X65K 1C1AA 3VQAA 5C12A 3OYIA 2QI2A 4IDHA 4I2QA 1IBKK 1JCGA 4E19A 3S3OA 2ASMA 4BE0A 1T8EA 1TUUA 1ZYQA 2FBVA 1J54A 2X74A 3GOIA 3SMPA 3L4IA 3J8AA 5FPDA 2E2PA 5F1XA 1WOQA 3SUOA 2YHWA 1HNWK 1JLEA 2D4WA 4GNIA 2O8EA 1Q86O 4C23A 2EWSA 4Z4FA 3CYMA 4BRMA 3HPGA 1BGXT 2E88A 5M1PA 3K58A 4B1ZA 4M3YA 5AQYA 3FE1A 1E4GT 4XH5A 4CEZA 3AO1A 1JL2A 4HHTA 1QTMA 1VK0A 1EP4A 1RDCA 1OH7A 4DSFA 3D2FB 3S3MA 4F3OA 4B9UA 1X3NA 4KTWA 4Z4EA 3U9ZA 1WAJA 4DQRA 3EE8A 3LDLA 4AF1A 2P9NA 2UUCK 1YTAA 5AFUH 3R6MA 1YTUA 1IKYA 3LALA 4KH5A 1CXUA 4C1NK 2AJQA 3RRHA 4OPHA 4FCYA 1GLFO 4LF7K 4LF9K 3SQ0A 4LF6K 4CZMA 1K9MO 4BRDA 4DU4A 1T05A 1P8ZA 1QZ6A 1NKEA 1Q18A 4JV5K 4B3OA 1WSJA 4GMJB 1LW2A 2HW3A 3DLKA 4Y1CA 1QQMA 3MWPA 3OBWA 1VSMA 1N33K 4YDUA 2ITGA 3JYTA 1OVQA 2Z1JA 1RT3A 1V4SA 2JLEA 1SKWA 5AQLA 3THYA 3NF8A 3VQ6A 2ITMA 4E7HA 3UB5A 3WNGA 3CJCA 3GDQA 3CXCM 1VSHA 4NCGA 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 2NRW A;  2NRZ A;  2NRX A;  2NRT A;  3C65 A;  2NRV A;  2NRR A; 
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 3SI6 A;  4CBU A;  1S1T A;  1YHQ N;  3P83 D;  4CBX A;  4BRK A;  1B92 A;  2NLX A;  3T1A A;  3SUP A;  3AY9 A;  4H0P A;  3T19 A;  2F7T A;  3AO3 A;  5EOY A;  4FWK A;  3DXK B;  3HPH A;  4E1M A;  4CJW A;  3BZC A;  2WC9 A;  4I6M A;  4GV3 A;  4DV5 K;  4DS4 A;  2GUP A;  4IOX A;  3SBT A;  4E3S A;  2GEL A;  4BY9 C;  1X9S A;  2O8C B;  4X66 K;  4MO4 A;  4CF8 A;  2JWL A;  3O80 A;  4F3T A;  5JLF A;  1W9H A;  5BRH A;  3TSU A;  4CHO A;  4IZ9 A;  5BR8 K;  4KPY A;  3SMS A;  5KPZ A;  2PBD A;  1U6Z A;  1C0T A;  1KLN A;  2QXL A;  3FFI A;  1RBU A;  4CGD A;  2G8H A;  1GLL O;  2A5X A;  3HZ6 A;  3VOV A;  2A6A A;  1YVU A;  3H45 C;  1NJW A;  1NGI A;  3WXM B;  3IKM A;  1OH8 A;  3BF1 A;  2A40 A;  5HRR A;  2ZGZ A;  3NF6 A;  1X9J A;  1S1X A;  3U3Y A;  4DG1 A;  2YKN A;  3NGZ A;  3P39 A;  3HVR A;  1QQO A;  3B6P A;  3CC2 N;  4CJ5 A;  1FW6 A;  1S3X A;  2VWB A;  1M90 O;  4FM0 A;  4OPK A;  3DLL L;  4H5V A;  4H5N A;  1NK8 A;  2ZQB A;  1XNQ K;  1IBL K;  2A1R A;  4LF8 K;  2VWK A;  1ESV A;  1DTT A;  4CK3 A;  5DM7 L;  3O3H A;  2P9K B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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