2NRWA

Crystal structure of the c terminal half of uvrc
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
217
structure length
204
Chain Sequence
GLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 63
structure length 204
sequence length 217
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrwA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrwA01
2BQRA 1K1QA 2MAXA 3EPIA 3M8SA 3GIKA 9ICBA 1RXVA 3PW7A 4DL4A 1SKSA 5KFXA 4QZDA 3RAQA 5J0XA 2FLNA 3G6XA 5KFKA 5CB1A 1SZPA 1L5UA 3RBEA 3SV4A 1D9DA 4BDPA 4R64A 4BWJA 1ZQHA 3B0XA 4Z6CA 3RRGA 1NK7A 9ICSA 2PI4A 4QZCA 3HPOA 3T5KA 1ZQUA 4PHDA 3NGDA 4DL2A 3C1YA 1L3VA 4DQIA 1S0VA 4I2FA 4RNNA 1NOMA 1IXRA 2R8JA 4O3SA 8ICLA 1KLNA 4RZRA 9ICJA 2AQ0A 2I9GA 7ICLA 5DGBA 5J0RA 5J2KA 2XGQA 2Q0ZX 3RH4A 3BQ0A 2BCVA 3ZDBA 4IRKA 2HVHA 9ICXA 5J2FA 1XWLA 4YFKA 4O3RA 4C8OA 2DFLA 2UVWA 3RJEA 4RPXA 4UAYA 5KG7A 4QWBA 1NJXA 5DBBA 4ECZA 3H8JA 4KLUA 9ICEA 2W9MA 3PW0A 4DLGA 7ICJA 4KITB 3BQTA 5DB6A 3H4DA 3TARA 2ZUCA 4DL7A 5KT4A 2V4QA 2ASDA 2J6TA 1CEZA 1HJPA 4UB5A 5HP4A 4DFMA 3C2MA 2XC9A 4EEYA 7ICRA 4O5EA 1KFTA 5DLFA 3EWAA 4ED8A 3MGHA 4XQ8A 3T5LA 5IIKA 4YMOA 4MF8A 1XS9D 1XC9A 4M2YA 2VA8A 4GXKA 3RJGA 3V6JA 5BOLA 5HHIA 3AU6A 4R63A 2R8KA 1RXWA 3GV7B 1Z00A 8ICTA 3GILA 9ICAA 4DOBA 4XRHA 4KLGA 5KFTA 4RQ5A 2W8KA 3PW2A 1XSPA 4ELUA 1SKRA 8ICSA 1KEJA 5KT2A 4UBBA 4DL5A 2P66A 4LZDA 3C5GA 1ZQCA 1ZQIA 5KFIA 7ICEA 2J6UA 1T7PA 2ASJA 5DGAA 1UA1A 4J9RA 2ZTDA 4F93B 3ZDAA 8ICQA 3JPNA 3ZDEA 1CUKA 3PMLA 4I2AA 5DLGA 3PO4A 2W9BA 5HNKA 5D49A 1NK9A 7ICIA 4UBCA 4Q45A 2BCRA 3PNCA 2KZMA 5KFQA 5J0WA 3PX4A 1TKDA 4YVZA 4DSIA 1AROP 1BPDA 4RQ8A 8ICVA 3MFIA 5IIJA 9ICFA 1Y88A 5KFZA 1ZQOA 4QW8A 3ORYA 3K75D 2ZJAA 3MABA 3RJJA 4DF8A 3Q8PB 1ZQEA 4MEYA 4NLKA 4O3OA 5KFHA 4J9PA 2C2RA 8ICHA 4ZH4A 5L1IA 8ICXA 5DB9A 2FLPA 1U49A 2KZZA 3PX6A 4YD2A 1SL1A 1HUZA 5J2AA 9ICCA 2VA2A 3EZ5A 4MFFA 4DWIA 4P4PA 3UQ0A 1D8YA 4F2RA 4PGXA 4UAZA 4F92B 4C8KA 4XUSA 1TK5A 4O3NA 1Z3EB 4I2JA 4KN4A 3HP6A 4FO6A 3RJIA 5CJ7A 5J0OA 3OHBA 3G6VA 5CR0A 1A76A 4PHPA 3RB0A 2ASLA 4RPYA 4NM2A 4YCXA 1V9PA 4RU9A 1IM4A 1K1SA 4O9MA 3PW5A 7ICVA 5CA7A 2C2EA 2Y1IA 4I2EA 3RRHA 8ICNA 4YR0A 4UB4A 4KMUA 3OJUA 2BHNA 5J2GA 3PV8A 4F4XA 4RQ7A 5J0QA 3MR2A 2JZBA 5KFLA 3QZ8A 3QE9Y 4BWMA 1SKWA 3BQ1A 4KLDA 3RB6A 3RH6A 2F1HA 4DS5A 1S97A 4TURA 4M9GA 2UVVA 5DG9A 5J0TA 2OWOA 5KFAA 1ZQJA 2IMWP 3KHLA 4J9MA 1MQ2A 3RJFA 1SL0A 2XY5A 2JEFA 1ZQRA 3RJHA 4IR9A 4O5KA 4G3IA 7ICGA 3MDAA 4KLTA 2DPJA 3MDCA 4FS1A 1U9LA 4M9NA 3E2EA 3FDSA 4YN4A 5KFRA 2P6RA 4YG2A 3Q8SB 2BQ3A 7ICOA 4F4KA 1TAUA 5J0SA 3OSPA 1U4BA 4M9HA 2JEJA 7ICHA 5KG2A 2WTFA 3V7KA 2BCUA 3V6KA 2FPKA 4F91B 4I2GA 4DFKA 3PY8A 4B9NA 2XY7A 1L3UA 8ICIA 1NK5A 5IIIA 4I28A 4QZEA 1TVAA 3GIJA 4M47A 2BPGA 5DB8A 4C8MA 2HHXA 5KFSA 4EZ9A 2V9WA 4Z6DA 2AQ4A 3ZD9A 3GV8B 5J2EA 3JPSA 4F4WA 4RNMA 2W9CB 4ECWA 1ZQBA 4I2CA 3LDAA 9ICTA 5D46A 5KFEA 2ISOA 3BDPA 2MUTB 2B21A 4J9KA 1BGXT 2DPIA 1U48A 5DBCA 4B9LA 5IIMA 3AUOA 2PFQA 3N4MB 4DSFA 3TQ1A 4ECSA 3TAQA 4KLQA 3TFSA 5KT5A 3V7JA 1JXEA 3QZ7A 2JZBB 1KRPA 3TFRA 1BPXA 4ECRA 4P2HA 5J0PA 2FMPA 4YQWA 3SYZA 4PGQA 1QSLA 4B9UA 2P6UA 5J2HA 4C8LA 4YR3A 4GC6A 5DB7A 4F5OA 4RQ1A 5BPCA 2NRXA 5HMLA 2R8HA 4F5QA 1QSSA 4O5CA 4NM1A 2XGPA 3GDXA 9ICPA 1T8EA 2ZUDA 5KFUA 1S0OA 4QZAA 2Y1JA 7ICQA 5CHGA 3UPQA 4KLFA 1ZJMA 4RNOA 3LWLA 1ZQTA 1X9SA 4HYKA 5KT7A 3MBYA 3RTVA 4QZBA 3Q8MA 2FMQA 4Z6EA 4JUZA 5KFCA 4DQPA 4IQWA 1NK0A 3SI8A 8ICPA 4M9JA 3Q8LA 5DBAA 4YMMA 3MGIA 4QZ8A 3GQCA 3SZ2A 3PX0A 3RB4A 4DSJA 1NK4A 4YP3A 3H4BA 1NKBA 3PR5B 3JPQA 1X9WA 4KLSA 4Q8FA 4MF2A 1S76D 2V4RA 1QSYA 8ICKA 2H5XA 3RAXA 5L1LA 1N56A 4DF4A 2BPCA 1C7YA 9ICIA 1JIHA 4I2IA 4DL3A 4YMNA 4DQRA 1JXLA 5J0UA 5KG4A 8ICEA 5KFDA 4F5PA 4C8NA 3C21A 5L9XA 4DLEA 4O3PA 3C2LA 1XSLA 4TQRA 4R65A 2IA6A 5KFYA 1BPYA 1XSNA 2UVUA 4GC7A 4I2BA 1EXNA 1RPLA 5F9NA 3PMNA 4DSKA 1QTMA 3OJSA 4BXOB 4TUPA 2XO7A 3TI0A 3EPGA 1DOQA 4X5VA 1SL2A 1S0NA 5KFOA 4XA5A 2KN7A 1ZQWA 3KTQA 4PH5A 4PHEA 5IILA 1BPBA 4DQQA 1ZYQA 4DFJA 1ZQNA 2BQUA 9ICGA 9ICVA 1UA0A 4Z6FA 4DOAA 4PPXA 9ICMA 4IRCA 5KFJA 1ZQZA 5J2JA 2W9CA 4F4YA 3NTUA 2M9NA 3RR7A 2HVIA 1JX4A 1MC8A 2KZ3A 2MUTA 2VANA 5KT3A 1ZQFA 4RQ6A 4B9MA 1A77A 5J2CA 2AJQA 8ICUA 3MR3A 4EYHB 2AGOA 4M6WA 2BGWA 8ICGA 4NXZA 1U47A 1MQ3A 3H7IA 3C65A 3RBDA 1RYRA 8ICZA 2IHMA 4RQ3A 3QEAZ 3AU2A 2HHTA 3RH5A 1KSPA 4KTQA 1ZQXA 3H8SA 5HHHA 5DQHA 5EOZA 2W9AA 3QEBZ 8ICFA 4DS4A 4MFCA 3RJKA 3C2KA 4QZIA 2NRTA 4QZFA 2UVRA 4JV0A 2IHNA 4ED3A 5KTQA 5KFFA 2LYHA 4RQ0A 2PFNA 2C2DA 5D4BA 4EZ6A 4ELTA 3H8WA 4IQUA 3JPPA 4NLGA 4UAWA 3H40A 5TZVA 1ZQQA 4J9LA 9ICKA 3GIIA 1DGSA 1WCNA 5EWFA 5DQGA 4GXIA 3T5JA 8ICRA 3OGUA 3M9MB 2BR0A 2FLLA 4QZ9A 3JPTA 4LZGA 2GWSA 2IBKA 4ECTA 1ZQVA 2A1JB 2AGPA 4I2HA 1KFSA 4QZHA 5J0YA 3UQ2A 1NJZA 5HMMA 3ZDDA 1L3TA 7ICFA 7ICSA 4Q43A 3THVA 2C22A 4UB1A 3GFKB 4P4MA 3HX0A 5DG7A 1S9FA 4MEXA 1RZTA 4CCHA 4FBTA 2KTQA 3V7LA 4QZGA 3Q8QB 9ICOA 4RUAA 3ZD8A 5KG3A 5L1JA 2R8IA 1RYSA 3SV3A 4DSEA 1NKEA 4FBUA 3HWTA 1ZQAA 4Q8EA 2JEIA 8ICOA 4BGDA 4RQ4A 3T5HA 2HHSA 1COOA 4IQVA 4DOCA 4ECVA 4ECYA 4M6WB 3ISCA 3N97B 1T3NA 4TQSA 3GV5B 1HUOA 5DKWA 3UXNA 4IR1A 4QWDA 8ICMA 2AU0A 4FS2A 1LV5A 4BXOA 5L1KA 4E0DA 4R66A 4KLOA 4JV1A 1WCLA 1NK6A 1ZQKA 4UB2A 4O3QA 1S77D 8ICAA 4KN7A 2NRVA 5KFGA 3M8RA 4J9NA 2XCAA 1UT5A 3KHRA 4ED6A 3UXOA 1ZQSA 2BDPA 2PFOA 3FYHA 2ISPA 1UT8A 4YXJA 3TANA 1B22A 2ZJ5A 3JPRA 3Q8KA 1LB2B 5EWGA 4RT2A 4KLLA 1MSWD 4EYIB 2KFZA 4JWMA 4I2DA 2BCSA 8ICCA 4ECXA 2F1IA 2VA3A 1L3SA 2ATLA 5KFVA 1T4GA 1TK0A 4I27A 3UXPA 1X9MA 2PFPA 2FPLA 5KFNA 3V6HA 3C23A 3ETLA 5KT6A 2XCPA 1X2IA 1NK8A 1BVSA 1ZQYA 4ECUA 1BPEA 5EWEA 4DL6A 4KLMA 4O0IA 1KFDA 2FPMA 3HT3A 4ED1A 2HHQA 9ICHA 7ICUA 3OHAA 3G6YA 4Q44A 4JV2A 2NRZA 1D8LA 2J6SA 4F8RA 3M9NB 3RB3A 4JWNA 1TAQA 3MFHA 3JPOA 1TV9A 4NLZA 2AGQA 3PW4A 4LVSA 4UQGA 2KFNA 1JMSA 4R8UA 4ED0A 4KLIA 4K4IA 5J2DA 7ICNA 3K4GA 5IIOA 4F50A 8ICBA 2F1JA 3LK9A 4NY8A 3B0YA 4B9VA 3PVXA 4YR2A 3C5FA 5KFBA 1XO1A 1NKCA 4GLXA 9ICRA 2A1JA 3T3FA 5F9LA 3M9OB 4IQTA 3ISDA 4IRDA 5C5JA 4F5NA 1ZQPA 2XY6A 2JEGA 4M9LA 1TFRA 5KG6A 3EW9A 5BOMA 3ISBA 1TK8A 2RDIA 5KG1A 4YD1A 4B9TA 4DSLA 7ICPA 4PGYA 1NJYA 2PXIA 4F4ZA 1H38A 2FMSA 2PI5A 5DDYA 3MR6A 5KG0A 5CP2A 5DDMA 2C28A 1D9FA 3PO5A 4QWCA 3BQ2A 4DFPA 3ZDCA 1QLNA 2HHVA 4K4GA 3PR4A 1ZQDA 2ALZA 2BKEA 4DO9A 4DEZA 3KHGA 3BJYA 8ICYA 5CWRA 4QW9A 3GIMA 4F3OA 1U45A 1KDHA 4KLHA 7ICMA 5DG8A 1NJWA 3TAPA 4YXMA 4RQ2A 5J29A 5KFPA 4NLNA 2HHWA 4RUCA 4DQSA 3C1ZA 5IINA 4M04A 7ICKA 1S10A 3KHHA 3V72A 4ELVA 4F2SA 5DQIA 1KTQA 4ECQA 4B9SA 4M0AA 5KFWA 4I29A 2HW3A 4PHAA 4J9OA 4GXJA 1BPZA 1Z00B 2I1QA 1PZNA 9ICUA 2ZUBA 7ICTA 3IM1A 2W8LA 4F5RA 2R8GA 4MFAA 8ICWA 5KG5A 3LWMA 9ICQA 1N48A 5KFMA 4R8UB 3OSNA 4TUSA 2ZJ8A 4RPZA 4EBDA 2NRRA 3EYZA 5JUMA 3Q8RB 2BCQA 9ICWA 2ZTEA 5J2BA 9ICLA 4UB3A 1B43A 1ZQMA 1ZQGA 4KLEA 4EBCA 2ZTCA 4ED2A 1JN3A 2NRWA 4QWEA 4RT3A 4EBEA 4ED7A 1ZQLA 9ICNA 2BPFA 3MR5A 3HW8A 2RDJA 4K4HA 3IHQB 4QWAA 2W9BB 5J2IA 4J9SA 4TUQA 4J9QA 1ZETA 1ZJNA 1S0MA 2HHUA 4JK1A 4P4OA 3RR8A 4KLJA 8ICJA 1XU4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQRA 1Z4OA 5AQOA 3SQ2A 2KIWA 3GIKA 3BF1A 9ICBA 1RXVA 3CJBA 4CNQA 4GFJA 5AI4A 4QZDA 2E2PA 4CF8A 3NASA 2MRLA 3RBEA 4FLUA 3DLHA 5CY4A 4BWJA 2E8PA 2ESEA 3B0XA 1ZQHA 2JMGA 3RRGA 3FZLA 9ICSA 5E84A 2PI4A 2H3VA 2FSNA 5C2FA 4BE1A 4IDHA 3MDQA 2UYTA 3SMSA 2IVOA 1GLLO 3C1YA 3AVCA 2HMXA 2DQNB 5AKHA 4FK0A 2QXLA 2R8JA 5C15A 4KMOB 4MFBA 3OYCA 1KC8O 3GDQA 3VQAA 3J7ZO 3AVHA 3C28A 3VN5A 4M3WA 2XGQA 2BCVA 3J81j 3BQ0A 3ZDBA 4CZGA 2ZIWA 2H3QA 4YFKA 3SCXA 3PIOL 1GLDG 3OYNA 1HNIA 5GINA 1V4SA 1Q3VA 3L3VA 5FPNA 4FLWA 2F8LA 1LCUA 3DLLL 3M5RA 3F2BA 2ZF5O 5AK4A 2I7PA 4C4SA 4CESA 1A5WA 1GOAA 4LFCK 4DLGA 3G6EN 3LP2A 1OKJA 1VQKN 3CM5A 3MECA 3I76A 1MWKA 3S3MA 5L1MA 3AM9A 1HJPA 5HP4A 3LAKA 2XC9A 4EEYA 7ICRA 1XMQK 2YHXA 1YZ7A 5DLFA 3EWAA 1GLEG 3LPUA 3LZJA 4M41A 3MGHA 1XS9D 2KNJA 3OYMA 4MF8A 1KVBA 3V6JA 5GAHP 4BX9C 3BS5B 3VQPA 3ITHA 4R63A 1NBWA 3GILA 4DOBA 4J03A 4BG8A 4GIBA 4DV6K 2G08A 1K5OA 3K2PA 3VETA 2DL0A 3AV9A 3C7NB 4LF4K 1ILYA 4CERA 5AQWA 2D1KA 4NB4A 2JHDA 1QCKA 3QB0A 4KPYA 3WK5A 4Z4EA 3CCRN 3EN9A 3SK3A 3WXIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BQR A;  1K1Q A;  2MAX A;  3EPI A;  3M8S A;  3GIK A;  9ICB A;  1RXV A;  3PW7 A;  4DL4 A;  1SKS A;  5KFX A;  4QZD A;  3RAQ A;  5J0X A;  2FLN A;  3G6X A;  5KFK A;  5CB1 A;  1SZP A;  1L5U A;  3RBE A;  3SV4 A;  1D9D A;  4BDP A;  4R64 A;  4BWJ A;  1ZQH A;  3B0X A;  4Z6C A;  3RRG A;  1NK7 A;  9ICS A;  2PI4 A;  4QZC A;  3HPO A;  3T5K A;  1ZQU A;  4PHD A;  3NGD A;  4DL2 A;  3C1Y A;  1L3V A;  4DQI A;  1S0V A;  4I2F A;  4RNN A;  1NOM A;  1IXR A;  2R8J A;  4O3S A;  8ICL A;  1KLN A;  4RZR A;  9ICJ A;  2AQ0 A;  2I9G A;  7ICL A;  5DGB A;  5J0R A;  5J2K A;  2XGQ A;  2Q0Z X;  3RH4 A;  3BQ0 A;  2BCV A;  3ZDB A;  4IRK A;  2HVH A;  9ICX A;  5J2F A;  1XWL A;  4YFK A;  4O3R A;  4C8O A;  2DFL A;  2UVW A;  3RJE A;  4RPX A;  4UAY A;  5KG7 A;  4QWB A;  1NJX A;  5DBB A;  4ECZ A;  3H8J A;  4KLU A;  9ICE A;  2W9M A;  3PW0 A;  4DLG A;  7ICJ A;  4KIT B;  3BQT A;  5DB6 A;  3H4D A;  3TAR A;  2ZUC A;  4DL7 A;  5KT4 A;  2V4Q A;  2ASD A;  2J6T A;  1CEZ A;  1HJP A;  4UB5 A;  5HP4 A;  4DFM A;  3C2M A;  2XC9 A;  4EEY A;  7ICR A; 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 2RDI A;  5KG1 A;  4YD1 A;  4B9T A;  4DSL A;  7ICP A;  4PGY A;  1NJY A;  2PXI A;  4F4Z A;  1H38 A;  2FMS A;  2PI5 A;  5DDY A;  3MR6 A;  5KG0 A;  5CP2 A;  5DDM A;  2C28 A;  1D9F A;  3PO5 A;  4QWC A;  3BQ2 A;  4DFP A;  3ZDC A;  1QLN A;  2HHV A;  4K4G A;  3PR4 A;  1ZQD A;  2ALZ A;  2BKE A;  4DO9 A;  4DEZ A;  3KHG A;  3BJY A;  8ICY A;  5CWR A;  4QW9 A;  3GIM A;  4F3O A;  1U45 A;  1KDH A;  4KLH A;  7ICM A;  5DG8 A;  1NJW A;  3TAP A;  4YXM A;  4RQ2 A;  5J29 A;  5KFP A;  4NLN A;  2HHW A;  4RUC A;  4DQS A;  3C1Z A;  5IIN A;  4M04 A;  7ICK A;  1S10 A;  3KHH A;  3V72 A;  4ELV A;  4F2S A;  5DQI A;  1KTQ A;  4ECQ A;  4B9S A;  4M0A A;  5KFW A;  4I29 A;  2HW3 A;  4PHA A;  4J9O A;  4GXJ A;  1BPZ A;  1Z00 B;  2I1Q A;  1PZN A;  9ICU A;  2ZUB A;  7ICT A;  3IM1 A;  2W8L A;  4F5R A;  2R8G A;  4MFA A;  8ICW A;  5KG5 A;  3LWM A;  9ICQ A;  1N48 A;  5KFM A;  4R8U B;  3OSN A;  4TUS A;  2ZJ8 A;  4RPZ A;  4EBD A;  2NRR A;  3EYZ A;  5JUM A;  3Q8R B;  2BCQ A;  9ICW A;  2ZTE A;  5J2B A;  9ICL A;  4UB3 A;  1B43 A;  1ZQM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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