2NRXA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc, in the presence of sulfate molecules
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
GLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrxA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrxA01
2W9MA 4DFPA 5KFDA 5BOMA 5DG7A 2PFNA 4M6WA 9ICRA 2NRVA 2ZUBA 4NM2A 3MGIA 4ECQA 9ICNA 5CWRA 4UQGA 5J0XA 1XO1A 1U9LA 1ZJNA 1NKCA 1ZQQA 1PZNA 2ZJ5A 4DQIA 4RNMA 4EYIB 4QZAA 2DPJA 1KDHA 3OJUA 3M9MB 3T5LA 2IBKA 4M2YA 4M9GA 8ICSA 1ZQUA 4DEZA 3ISCA 5KT3A 4ED7A 8ICQA 5KG0A 4R8UB 3OJSA 3K75D 4PHEA 3Q8QB 2UVUA 3NTUA 4KTQA 8ICGA 3HWTA 2ASDA 3BQ1A 3MABA 3M8RA 4RQ3A 4TQRA 4F5RA 3RBDA 4M0AA 1UT8A 4DO9A 3C1ZA 2AQ4A 4I29A 5KFZA 1HUOA 1ZQNA 4KLMA 3RJFA 3K4GA 5DG8A 4ECWA 4ED3A 4UBCA 8ICZA 3ZDEA 4RQ0A 4PPXA 4QZGA 3V6JA 4DQQA 4O5KA 3Q8RB 3UXPA 8ICLA 9ICBA 3N4MB 4RPYA 3NGDA 1S0MA 4MEYA 3T3FA 4RU9A 2MUTB 4I2IA 2PFOA 4IQWA 4MFCA 4QZCA 1ZQHA 2W8LA 5EWGA 2M9NA 1S0OA 5CP2A 2XGQA 3TAQA 4I2EA 1MQ2A 5J0YA 8ICAA 2HVHA 4LZGA 3SV3A 1X9SA 2ISOA 4X5VA 3JPNA 5CB1A 2Y1JA 3RB0A 5J2EA 5EWFA 3TQ1A 4Z6EA 4RPXA 5DB8A 5BOLA 4QWCA 3RBEA 3ORYA 5IIJA 1ZETA 1XSNA 4I2AA 9ICWA 4ECUA 3QEAZ 2ATLA 5J0UA 1TVAA 7ICQA 4UAYA 8ICKA 7ICSA 4JV2A 8ICJA 2NRXA 5KT5A 2W9AA 3C21A 3MR2A 2RDIA 3LWMA 9ICTA 3FDSA 4DLGA 4RT2A 3KHRA 7ICVA 2P6RA 3GV5B 3OHAA 1ZQFA 5KFNA 3SV4A 3TANA 4YXJA 5KTQA 1U4BA 4FBTA 5KFQA 7ICUA 3GV8B 4YMNA 3IHQB 9ICOA 3RJGA 8ICOA 9ICQA 4KLDA 2PFPA 5IIOA 1BVSA 3THVA 4DFJA 2KZZA 5L9XA 4DSEA 1RXWA 3SYZA 1A76A 4B9UA 4B9MA 1NOMA 4DQRA 4P4OA 3B0YA 4PGQA 4KLQA 4QZDA 1ZQXA 5KFMA 4ECSA 3RH5A 3GILA 4KLHA 4PGYA 3BQTA 5DDYA 4GLXA 5KFGA 3MR5A 5KG1A 3V7KA 3MFIA 4JWNA 1ZQCA 1TK5A 1B22A 2C22A 2NRTA 2KN7A 1IXRA 4I28A 4UB1A 4EBEA 2ALZA 3MR6A 1WCLA 2J6SA 5JUMA 1SKSA 1S77D 4ECRA 3QZ7A 2XY5A 3Q8MA 2KFNA 4KLOA 2KZMA 3T5HA 4RT3A 5CJ7A 3JPRA 4J9NA 4Z6CA 1ZQTA 4KLFA 2KTQA 5KG3A 4EBCA 1H38A 1ZQLA 3RAQA 8ICEA 3ZDBA 2FLNA 3HPOA 4RNNA 2ZUCA 3RAXA 3PVXA 1L5UA 4XUSA 2FLPA 8ICBA 8ICYA 4DLEA 1NKBA 1NK8A 3C5FA 1NK4A 4DSJA 3RTVA 3PR4A 4F2SA 1UT5A 1TK8A 2HW3A 2XCAA 7ICGA 2Q0ZX 3KHHA 2MAXA 4ED8A 4UB2A 1HJPA 2MUTA 4O0IA 1ZJMA 2V9WA 2P6UA 8ICNA 3PY8A 5L1JA 4O3NA 5DLGA 4G3IA 1X2IA 5DG9A 4MEXA 3V7JA 2BPCA 1S97A 4EZ6A 3C1YA 3ZD9A 4ED0A 1U49A 4KLUA 1T7PA 5J2CA 7ICJA 4F2RA 4QW8A 4DF4A 3N97B 1ZQBA 4O3SA 3PR5B 3KHGA 2R8HA 4J9SA 3PW7A 3QEBZ 2BQ3A 5KFPA 4O3OA 4Q45A 3MGHA 4F50A 4NXZA 4QZFA 3HP6A 4PGXA 1JXLA 2ZTEA 4RQ1A 1QTMA 4GXIA 4YXMA 4IRKA 4QZ8A 5J2DA 4B9LA 2R8GA 4M9LA 5DBCA 8ICPA 5J0RA 1XC9A 1LV5A 7ICIA 1XU4A 1CUKA 3GIMA 3GDXA 2W8KA 4KLJA 4Z6DA 5DB6A 4RUAA 2PFQA 4C8MA 2UVRA 2W9CB 4K4HA 3RJIA 3TARA 5KG5A 3Q8PB 4JV0A 5F9LA 4RQ6A 1RYSA 2BCVA 3OSNA 4QWBA 1NJYA 1ZQRA 5J2FA 3PMNA 1D9FA 2R8KA 4YQWA 7ICOA 9ICUA 3RH4A 1NK0A 3PO5A 8ICWA 2ASLA 1BPZA 1JN3A 4RQ8A 5CA7A 3E2EA 4DOAA 8ICCA 5DQGA 9ICHA 3AU6A 3ZDAA 4Q8FA 3PO4A 2JEFA 2A1JB 5KFJA 4RNOA 1AROP 3G6VA 1ZQWA 4TUPA 2WTFA 2HHSA 8ICTA 5KT7A 4IQUA 5KFFA 1ZQEA 5KT6A 4C8OA 1D8LA 4KN4A 4BWJA 4QWEA 4FS1A 3C2LA 4M47A 2C28A 1KTQA 4F5NA 4NM1A 7ICFA 3UQ0A 1KEJA 4YR2A 3EZ5A 1RXVA 9ICLA 2BR0A 4O5CA 5J2JA 4LZDA 3Q8LA 1ZQPA 5KFSA 2Y1IA 4YD1A 2PXIA 4DL5A 1WCNA 5F9NA 4ED6A 5L1IA 4MFAA 2C2DA 4F93B 4YCXA 3RJEA 4MF8A 8ICFA 8ICRA 3GFKB 4YFKA 3HW8A 5KFVA 1ZQVA 3MBYA 1T3NA 2FPKA 3V7LA 1JXEA 2ZTCA 4F91B 5J29A 1CEZA 4TURA 4I2BA 2ASJA 5J2IA 1RPLA 3RR7A 5D4BA 2FMQA 2FMPA 1ZQYA 2ISPA 3H4DA 4QZ9A 3TFSA 4UB5A 7ICHA 4EYHB 3IM1A 9ICIA 4IRCA 4JWMA 2AQ0A 2OWOA 5DB7A 5KFWA 3FYHA 5KG4A 2NRWA 2V4QA 4CCHA 4DSIA 4IQTA 4F5PA 4M9NA 3H7IA 1EXNA 7ICEA 1DOQA 1BPDA 5EOZA 2AGOA 1QSLA 3GIIA 4I2GA 7ICTA 4ELVA 3H40A 1ZYQA 5KFLA 4UB3A 4EZ9A 5DGAA 5KFYA 2JZBB 5DQIA 4P4PA 3ISDA 4DSFA 1U45A 2V4RA 1ZQOA 1C7YA 7ICLA 1JX4A 3AU2A 4QWDA 2ZUDA 4EBDA 8ICIA 2DPIA 2JEGA 4DL4A 2W9CA 2UVWA 5IINA 2HHXA 4J9LA 4DOCA 4TUQA 3UXOA 3QE9Y 4O5EA 2KFZA 4C8NA 5J0WA 5CHGA 2XO7A 4DF8A 1SZPA 1TFRA 3BJYA 4BWMA 1UA1A 2W9BB 1ZQAA 1KSPA 4I2HA 3EW9A 9ICAA 4KLEA 5KFKA 3MDCA 3ZD8A 4J9RA 3TI0A 4YVZA 3OGUA 4QZHA 1K1SA 4F5QA 4BXOB 4Z6FA 4O9MA 8ICMA 1N56A 2RDJA 2A1JA 4QW9A 1D8YA 4GC6A 3PNCA 3M8SA 4DSKA 4KMUA 4E0DA 4M04A 5KG2A 5DQHA 1S0VA 4F4ZA 2BQRA 4PHPA 2PI4A 3PX4A 4IR9A 5HP4A 3H8JA 3JPQA 4IRDA 5L1KA 2HHWA 1X9WA 5D46A 4O3RA 4ECTA 4J9OA 9ICFA 3EYZA 1TKDA 4B9SA 4DL7A 2HVIA 1D9DA 2JEIA 1MQ3A 1L3VA 5KFHA 5J2AA 4Q44A 4NLZA 4XA5A 3G6YA 3GQCA 2XY6A 4YMOA 2BCSA 8ICVA 1RZTA 1KFTA 3M9OB 1TK0A 5HNKA 1XWLA 1NJWA 4RQ4A 4C8LA 2ZJAA 2AGQA 3RJKA 4B9TA 3C23A 5KFBA 4RZRA 2JEJA 3AUOA 2R8JA 2C2EA 4KLLA 3EWAA 3C5GA 9ICEA 4MF2A 1KLNA 4F4XA 3RB3A 1S0NA 2BPFA 3HX0A 3OSPA 1V9PA 1U48A 3KTQA 3JPSA 4KLTA 1SL1A 5HMMA 1NJXA 4YP3A 4DFMA 4LVSA 2IHNA 2HHTA 1B43A 4DS4A 3UPQA 4ELUA 3ZDCA 1NK7A 5IIKA 4NLKA 1X9MA 2BCRA 4ECVA 4DWIA 4JK1A 5J2HA 4QZEA 2LYHA 1QSYA 3PMLA 2J6TA 4ECZA 2UVVA 4KLIA 4R64A 4Q8EA 9ICPA 2PI5A 1K1QA 8ICHA 2BQUA 2VA3A 2XCPA 4IQVA 4RQ5A 3GIKA 2FMSA 3UXNA 2JZBA 2BHNA 5J2GA 1Z00B 4EEYA 2J6UA 5KFAA 1S76D 3RR8A 4YG2A 4NY8A 4DFKA 1U47A 1BPXA 4TUSA 9ICKA 3H4BA 1KRPA 9ICJA 4YR0A 5KT4A 3ZDDA 1ZQSA 1Z3EB 4DOBA 1S10A 5KT2A 4RPZA 3PW2A 1NK6A 4B9NA 3C2KA 1JIHA 1Y88A 2HHVA 1ZQJA 9ICSA 1BPBA 1UA0A 4K4GA 5KFOA 2IHMA 1COOA 2W9BA 8ICUA 4ED2A 3BQ0A 3TFRA 5KFXA 4QWAA 4DQSA 2AGPA 4NLGA 9ICXA 7ICKA 4DS5A 5D49A 1ZQZA 4BGDA 4F8RA 8ICXA 4PH5A 5J0SA 2FPMA 3KHLA 4UAZA 2BCUA 7ICNA 4BXOA 4JV1A 4RQ2A 4QZBA 2DFLA 4F5OA 4XQ8A 1ZQGA 3HT3A 3PX6A 4GC7A 1KFDA 5HMLA 5HHIA 1XSPA 3RJJA 5J0TA 4KLGA 7ICPA 5KG7A 5J0QA 3RJHA 7ICRA 3PV8A 4F92B 3T5KA 4UAWA 3LWLA 4J9MA 5HHHA 4F3OA 5J2KA 4BDPA 2ZTDA 2XY7A 1QSSA 4J9QA 4I2JA 9ICVA 1NKEA 2B21A 4F4WA 4ELTA 2NRRA 4TQSA 2VA8A 4RQ7A 5DDMA 2VANA 2C2RA 1ZQDA 4M9JA 4R65A 3C2MA 4PHDA 4J9KA 1T4GA 3PX0A 1N48A 4O3PA 3Q8SB 4M6WB 3RB4A 4UBBA 1ZQMA 5J0OA 1IM4A 3GV7B 2BGWA 1TV9A 1SL0A 2KZ3A 3H8WA 3MFHA 2ZJ8A 5L1LA 4JUZA 5KFTA 3B0XA 4QZIA 3RRHA 1T8EA 3JPOA 4IR1A 1L3SA 9ICGA 2BCQA 1DGSA 2FPLA 1TAQA 2AU0A 4DQPA 3JPPA 1L3UA 3BDPA 5EWEA 2P66A 2XC9A 7ICMA 3H8SA 3GIJA 4R63A 4YD2A 1BPEA 2F1HA 2I1QA 3RB6A 2NRZA 1SKWA 3PW0A 3ETLA 5TZVA 4F4YA 4DL2A 1BGXT 1ZQIA 2IMWP 4FBUA 3C65A 1XS9D 3V6HA 3SI8A 4I2FA 2HHUA 3EPGA 5DLFA 2BKEA 1LB2B 2VA2A 4GXKA 3QZ8A 3MR3A 2HHQA 1NK9A 5DKWA 4KITB 4DSLA 5J0PA 2AJQA 2BDPA 4RUCA 5KFCA 1L3TA 4KLSA 4I27A 2FLLA 1S9FA 4ZH4A 1Z00A 4HYKA 1NK5A 1MSWD 5DGBA 3T5JA 3RRGA 4XRHA 4R8UA 4ECYA 3TAPA 1QLNA 1BPYA 4O3QA 4UB4A 2R8IA 5KG6A 3M9NB 3Q8KA 1XSLA 4ECXA 5CR0A 4J9PA 3JPTA 3V72A 4FS2A 3OHBA 4FO6A 4PHAA 4Q43A 3LK9A 2H5XA 2BPGA 4B9VA 4P4MA 9ICCA 1SKRA 3PW5A 4C8KA 5DB9A 5DBAA 2IA6A 3V6KA 5IIMA 5IILA 4DL6A 1SL2A 4K4IA 4M9HA 3SZ2A 1TAUA 2I9GA 4F4KA 4KN7A 4YMMA 1NJZA 1MC8A 5KFUA 3ISBA 3BQ2A 4MFFA 2F1IA 4YR3A 3EPIA 4YN4A 3LDAA 3UQ2A 1JMSA 2XGPA 4P2HA 4DL3A 4ED1A 3RH6A 5IIIA 5C5JA 1KFSA 2GWSA 4NLNA 5KFEA 9ICMA 3MDAA 2F1JA 1HUZA 4I2CA 3PW4A 5KFIA 1ZQKA 5DBBA 4R66A 4I2DA 1RYRA 4GXJA 5BPCA 3G6XA 5J2BA 5KFRA 1A77A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JS2A 2MA1A 3WU2U 3AVHA 5KFDA 1QQ7A 2DPNA 3D2FA 2Y9UA 1G15A 3V81A 2YB4A 1W0HA 3IUCA 4G1QA 1I3AA 1RBVA 2YJEA 3L3UA 4KH5A 2EH9A 3VQEA 5ALQA 4UQGA 2XY8A 4H0TB 4F72A 1NKCA 4WQ4C 4DQIA 3BF3A 5GADP 1S1VA 1K8KB 3M9MB 4I6MB 5H1SQ 4M9GA 1VQ6N 1ZQUA 2VJ5A 3AV9A 4ED7A 5JLFA 8ICQA 4R8UB 2OCEA 4CZLA 5TKWA 3HWTA 1RT7A 3MABA 3DM2A 4RQ3A 3LVVA 1YXQA 4M0AA 1WSJA 1UT8A 4F71A 3GOIA 3VC8A 1DLOA 2I6XA 4DO9A 4I29A 3GDQA 3KZBA 5KFZA 4WQ5A 3V4IA 1XI1A 3O8MA 4KLMA 3V1QA 5DG8A 2YCHA 4KV8A 4UBCA 4PPXA 3AVFA 4Y2XA 1RDAA 2O8FA 2YNIA 8ICLA 2XRIA 2PFOA 3T3FA 4QS7A 2MUTB 4I2IA 2KQ2A 4E19A 3NMUA 4WJ3B 4QZCA 1ZQHA 4AHVA 2W8LA 4RCHA 3TSPA 5SZTA 3C6UA 4I2EA 5CP2A 4LF6K 5AI9A 3I0SA 4BJQA 3ALRA 2A1SA 2YJFA 1ED1A 2QK9A 1QQNA 4WQ5C 5HBMA 2K8AA 5LL6Z 3VF2A 1O03A 1YTUA 3D2EB 4CFBA 5J2EA 9ICVA 3TQ1A 4I2AA 4FZMA 5BOLA 1IIPA 1KCFA 4I9LA 4EHUA 1M1KO 4KO0A 2G06A 3LWMA 2FI1A 4AF1A 3CD6N 4DLGA 3IG8A 3WXJA 1N32K 3GV5B 3QX7A 2GO7A 2QW9A 2RE2A 4DTMA 4UB6U 5KFNA 4W5TA 3TANA 4YXJA 3OS1A 2PYJA 5KAIU 7ICUA 2VGNA 4YMNA 3IHQB 2FBTA 3RJGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2W9M A;  4DFP A;  5KFD A;  5BOM A;  5DG7 A;  2PFN A;  4M6W A;  9ICR A;  2NRV A;  2ZUB A;  4NM2 A;  3MGI A;  4ECQ A;  9ICN A;  5CWR A;  4UQG A;  5J0X A;  1XO1 A;  1U9L A;  1ZJN A;  1NKC A;  1ZQQ A;  1PZN A;  2ZJ5 A;  4DQI A;  4RNM A;  4EYI B;  4QZA A;  2DPJ A;  1KDH A;  3OJU A;  3M9M B;  3T5L A;  2IBK A;  4M2Y A;  4M9G A;  8ICS A;  1ZQU A;  4DEZ A;  3ISC A;  5KT3 A;  4ED7 A;  8ICQ A;  5KG0 A;  4R8U B;  3OJS A;  3K75 D;  4PHE A;  3Q8Q B;  2UVU A;  3NTU A;  4KTQ A;  8ICG A;  3HWT A;  2ASD A;  3BQ1 A;  3MAB A;  3M8R A;  4RQ3 A;  4TQR A;  4F5R A;  3RBD A;  4M0A A;  1UT8 A;  4DO9 A;  3C1Z A;  2AQ4 A;  4I29 A;  5KFZ A;  1HUO A;  1ZQN A;  4KLM A;  3RJF A;  3K4G A;  5DG8 A;  4ECW A;  4ED3 A;  4UBC A;  8ICZ A;  3ZDE A;  4RQ0 A;  4PPX A;  4QZG A;  3V6J A;  4DQQ A;  4O5K A;  3Q8R B;  3UXP A;  8ICL A;  9ICB A;  3N4M B;  4RPY A;  3NGD A;  1S0M A;  4MEY A;  3T3F A;  4RU9 A;  2MUT B;  4I2I A;  2PFO A;  4IQW A;  4MFC A;  4QZC A;  1ZQH A;  2W8L A;  5EWG A;  2M9N A;  1S0O A;  5CP2 A;  2XGQ A;  3TAQ A;  4I2E A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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