2NTGA

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant t115r7
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFCNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2ntgA00
169LA 1DYCA 1L32A 3PBLA 1C60A 4W56A 3SB6A 4LDEA 1L0KA 1ZURA 3DN3A 3LZMA 1C6GA 1L85A 4OO9A 1L42A 191LA 1DYGA 211LA 4I7KA 239LA 4DAJA 171LA 176LA 5I14A 181LA 1G0JA 1G07A 3HWLA 6LZMA 1C62A 1L68A 1T8FA 3JR6A 2RAZX 1LPYA 1CV0A 2F32A 1L58A 3C7WA 125LA 255LA 1LYDA 1D3MA 2QARC 2RAYX 1QT7A 4DJHA 1DYFA 1QS9A 1C6MA 3HH3A 1L0JA 1L47A 1L08A 2OU0X 130LA 1C6EA 2B72A 3V2YA 1L97A 1SX2A 1CV4A 1QT4A 1D2YA 2HUKA 159LA 187LA 158LA 3CDQA 225LA 2HULA 146LA 245LA 142LA 1KY0A 2O79A 4I7OA 1L65A 131LA 1CU0A 2O7AA 1SX7A 3HTDA 1L74A 3OE9A 2OU9A 1C6KA 4ZPUA 3GUPA 1G1WA 115LA 1OVHA 217LA 1L75A 1QTBA 1L92A 190LA 3DNAA 1L49A 1D9WA 4LZMA 156LA 184LA 1LW9A 120LA 1L34A 1QUGA 1OV5A 2B74A 111LA 1OV7A 168LA 1L54A 4YXAC 1L55A 1CU2A 3GUNA 235LA 2RB2X 251LA 1OWYA 3HUKA 4GBRB 2Q9EA 2OE4X 221LA 2B70A 149LA 4EJ4A 1L18A 3G3XA 1SSYA 1LWGA 223LA 1KW5A 1QSQA 3HT7A 172LA 1L67A 1L50A 1CX7A 1L12A 1QTZA 141LA 1L07A 3C81A 109LA 199LA 3C80A 256LA 4I7SA 3CDRA 258LA 177LA 1NHBA 262LA 3SN6R 119LA 1L17A 186LA 174LA 188LA 1C6IA 3OE0A 4I7JA 243LA 1L04A 1KNIA 3RUNA 236LA 2RBPA 1B6IA 1L69A 1G1VA 1LYJA 2L78A 198LA 1L95A 1C6NA 4W52A 1SWYA 122LA 2ANVA 1L39A 3DMZA 3G3VA 214LA 3C8RA 1P37A 4W54A 231LA 3DN6A 1C66A 234LA 3HH6A 1CX6A 1D3NA 259LA 3GUKA 152LA 2ANXA 4IAPA 155LA 1CTWA 1L62A 1L15A 3RZEA 3VW7A 2B73A 1LYFA 167LA 151LA 1L70A 1L13A 249LA 4ARPA 219LA 4EXMA 1P36A 224LA 3GUMA 3C83A 246LA 1G0KA 1XJTA 182LA 3HU9A 1C64A 112LA 103LA 1CV6A 218LA 1L21A 1L96A 2RBSA 215LA 3NY9A 196LA 3CDVA 3C7ZA 4W57A 2RBRA 113LA 4LDLA 3DN0A 1C6JA 4ARMB 1CU6A 3HUQA 147LA 3SB7A 166LA 183LA 1C63A 2Q9DA 2OE9X 1C6DA 1C6QA 1T6HA 1L27A 170LA 1D2WA 2LC9A 1L22A 1L38A 2Z6BA 3NYAA 232LA 1CUQA 3HTGA 1XEPA 4ARLA 2F47A 3CDTA 1L11A 1LYHA 1QT3A 2O4WA 3PDSA 1L23A 244LA 4EKSA 3DN1A 1L37A 4S0WA 4ARMA 213LA 3HT9A 4PK0A 1C69A 212LA 1L91A 3HUAA 161LA 138LA 4EKPA 1QT8A 1LI2A 1OYUA 3DN8A 1DYEA 1P46A 2RB1X 1JQUA 1LGWA 205LA 1L63A 1LYEA 1G06A 4W59A 2B75A 3OE6A 1P6YA 242LA 1LI3A 3F9LA 1L26A 129LA 1L81A 1L05A 1OWZA 1PQOA 1L30A 1CVKA 4EPFA 1L28A 3L2XA 1L98A 2B6WA 2OE7X 1JTMA 102LA 238LA 257LA 3SB9A 1L46A 3HDEA 1L25A 1L29A 3GUOA 1L56A 1L87A 1L03A 1L71A 1QSBA 230LA 2RBNA 1XJUA 1C6HA 3C8SA 233LA 150LA 3QAKA 4GRVA 1L73A 1LLHA 4EKQA 1L51A 4I7MA 1L01A 1DYDA 144LA 1L36A 1TLAA 1OVKA 1G0MA 4YX7C 1L93A 3D4SA 4E97A 1P56A 4W55A 3G3WA 2LCBA 1P3NA 261LA 1L16A 1QT6A 1L72A 3SB8A 7LZMA 206LA 137LA 228LA 1CV5A 197LA 1T8GA 260LA 1LGXA 2QB0B 1PQDA 3EMLA 4PJZA 2A4TA 1L80A 248LA 4AQNA 1L53A 2RB0X 1PQJA 200LA 1QTVA 1CV3A 1L94A 2OU8A 2B7XA 3F8VA 4I7LA 2RBOA 3C7YA 1G0GA 1L00A 2RH1A 3GUJA 3C8QA 3DMVA 108LA 241LA 1L02A 3SBAA 1L06A 3HT6A 1C68A 3HU8A 2RBQA 1LYIA 2OTZX 1CV1A 1K28A 1L89A 1L24A 3K2RA 1L10A 178LA 162LA 3HH4A 3ODUA 2HUMA 1L57A 118LA 1L52A 173LA 1C6FA 1LWKA 126LA 1C6CA 3FA0A 4W58A 1D3JA 1C6AA 1L31A 1L77A 4W53A 220LA 201LA 157LA 1QTDA 192LA 4YXCA 107LA 160LA 1OVJA 1P2RA 4DKLA 114LA 1P5CA 1G0QA 1L83A 3CDOA 4I7PA 4I7TA 1KS3A 1L60A 1L19A 3HT8A 4I7RA 1P64A 1SWZA 3FADA 1L61A 1C6LA 2LZMA 1L59A 1L88A 2B6XA 1L66A 226LA 1G0PA 1L82A 216LA 1L45A 2B6TA 3SBBC 1QT5A 1C6PA 1L33A 2OEAX 3HTBA 1DYAA 1L79A 180LA 1EPYA 4EPIA 2IGCA 1PQMA 145LA 1CUPA 2B6ZA 4I7QA 3HH5A 3NY8A 175LA 1L43A 1QUHA 4ARJA 254LA 1L40A 4ARQB 1LYGA 1I6SA 2F2QA 1L90A 1L14A 185LA 1L86A 3DKEX 1L35A 3DMXA 1C6BA 3L64A 127LA 1C65A 3DN4A 237LA 163LA 1L64A 252LA 1QS5A 1G0LA 3OE8A 4K5YA 1ZYTA 110LA 1L99A 1LGUA 1L76A 1C61A 1QTCA 253LA 2CUUA 1D3FA 148LE 1KY1A 4ARQA 128LA 1WTHA 1KW7A 1L09A 2B6YA 1PQIA 1P7SA 3FI5A 1SSWA 1L44A 5LZMA 1QUDA 1QUOA 1JTNA 3V2WA 1C67A 1L48A 210LA 3UONA 143LA 3C82A 1ZWNA 189LA 1P2LA 3HDFA 1PQKA 227LA 240LA 250LA 229LA 3GULA 4I7NA 3SB5A 195LA 2NTHA 2OTYX 1QTHA 3HTFA 104LA 4EKRA 1CU3A 3DN2A 1C6TA 209LA 247LA 123LA 1LI6A 165LA 1L84A 1T8AA 222LA 3GUIA 140LA 1T97A 1L20A 4W51A 2NTGA 1DYBA 164LA 139LA 1CU5A 4LDOA 1L41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
169LA 3PBLA 4DD2A 3TXKA 2F4GA 5M1YA 3LZMA 1C6GA 1EQ5A 1DYGA 2BQHA 211LA 3G3BB 4HPEA 239LA 5I14A 3TXFA 1L68A 2RAZX 1LPYA 4M6DA 4DT3A 3AGHA 5ILCA 208LA 1QT7A 1DYFA 1QS9A 2FYCA 1C6EA 3AGIA 4H94A 4N1EI 3V2YA 1L97A 1HMLA 2YBHA 2LZTA 1LZCA 1TDYA 3TMVA 4B4EA 1FLWA 3ZEKA 159LA 187LA 3A93A 3CDQA 4QY9A 2B5ZA 4LFXA 1KIPC 131LA 1L74A 1LJEA 3AZ7A 1G1WA 2F30A 1CKCA 2CGIA 4ETCA 1QTBA 4LZMA 1L49A 4I8SA 2BQJA 1LW9A 1OV5A 3D3DA 4YXAC 251LA 3HUKA 149LA 3G3XA 1KW5A 1QSQA 4OWHA 1CX7A 1L12A 141LA 1L07A 3LN2A 1GBOA 6LYTA 3WH1A 256LA 4DD0A 3CDRA 4ETEA 1XGQC 3EXDA 2YBMA 3SN6R 1L17A 3OK0A 188LA 1L04A 1KNIA 236LA 1IWYA 4UWVA 198LA 1B5VA 3W3EA 5LVJA 4NGYA 4NG1A 1HNLA 3C8RA 1NBZC 5KXTA 1D3NA 259LA 3GUKA 5B06A 152LA 1I20A 1J1OY 2BQEA 1L62A 3P66A 1KIRC 1LSBA 4WLYA 4EXMA 4OWEA 1G0KA 1XJTA 182LA 5KXKA 1C64A 112LA 103LA 1CV6A 215LA 1B7MA 3NY9A 1UICA 5I4XA 1AM7A 2BLYA 1HEMA 1LZRA 3CDVA 3C7ZA 113LA 2EIZC 4IJ4A 4ARMB 3AZ4A 1C63A 3J6KA 2OE9X 1C6DA 2YBJA 1C6QA 1L27A 170LA 4WO9A 1MLCE 4NSHA 1LSGA 2X0AA 1QT3A 244LA 3DN1A 4XJBA 3HT9A 1GDXA 4PK0A 1L91A 5HNCA 3HUAA 2XBSA 138LA 4WG1A 1DYEA 1F0WA 2RB1X 4N0JA 2DQEY 1BVKC 1L63A 3F9LA 1L26A 4B1AA 132LA 1PQOA 1IO5A 3E3DA 4ETAA 2OE7X 5KY1A 1OUFA 238LA 1L46A 1L29A 4LT2A 4H9CA 1L03A 3WUMA 4NGVA 4N8ZA 5B07A 1QSBA 3AW7A 1LJHA 2RBNA 4CFPA 7LYZA 1AKIA 1NHEA 4GRVA 3A6BY 1BWHA 4EKQA 4I7MA 1L01A 1JKBA 4I0CA 5L9JA 3AB6A 4NGOA 4J0LA 3FI7A 3N9CA 2F2NA 4IASA 5KXSA 1CV5A 197LA 1T8GA 2Q0MX 1YIKA 4W96A 2QB0B 1SLYA 3AZ5A 4LT3A 3A3RX 3QY4A 1L80A 1GF9A 1ZMYL 2HECA 2RB0X 3A96A 1PQJA 1C45A 1LSMA 1L94A 2OU8A 1G0GA 1L00A 1C7PA 1JIYA 2RH1A 2HTXA 3C8QA 1L02A 1L06A 1GHLA 1B5YA 1YAQA 4XENA 1C68A 1LYIA 1K28A 2XJWA 1LZSA 2IHLA 4LYTA 4C3WA 5LXWA 3AW6A 126LA 4RDSA 1JUGA 1C6AA 2DQDY 1QDRA 2D6BA 1WTMA 1H87A 1P2RA 3CQLA 5KXYA 2HEBA 1UUZC 4I7PA 1JEFA 3FADA 4DDAA 1BWJA 2LZMA 3TXGA 2B6XA 1G0PA 3SBBC 1C6PA 1BB6A 1DYAA 1GB8A 2BQLA 4UWNA 1PQMA 2B6ZA 2BQMA 1B7NA 3HH5A 1BHZA 1D6QA 1I6SA 1L14A 185LA 1L86A 1IOSA 1BB5A 1YQVY 1WQRA 4BAPA 4NHSA 1UIAA 252LA 1IR9A 1OQMA 2MEHA 4DC4A 1G0LA 3OE8A 2XQOA 1TCYA 1ZYTA 3TMUA 4ET9A 1L76A 1C61A 1QTCA 2CUUA 1KY1A 1WVVA 2G4QA 1F6SA 3FI5A 1P7SA 2MEGA 1SSWA 1L44A 4II8A 4AXTA 4YENA 1GB9A 210LA 2XBRA 2LYMA 1YANA 195LA 4GCFA 4WMGA 3VWOA 3HTFA 1IP6A 3WU9A 3QE8A 1Z55A 1OUCA 1PS5A 4W94A 4WM2A 1L84A 1OUJA 1LHHA 1JSEA 4LDOA 1UBZA 1LHIA 1D9UA 2DQAA 2DQJY 2NTGA 1DYBA 4H9IA 1ZURA 1IWXA 1L41A 1DYCA 1L32A 5HMJA 3WL2A 1C60A 4LDEA 5KJ9A 1BB3A 4OO9A 1VDQA 1L42A 3W6BA 2ZQ4A 4DAJA 2C8OA 176LA 181LA 1G7JC 3HWLA 5I53A 1T8FA 3LYZA 5DN5A 1GE4A 2F32A 1LYSA 3C7WA 1T6VL 1DPXA 2Z2FA 1SQ2L 4QGZA 1LYDA 2QARC 4LZTA 1GXV2 3TMWA 3LYTA 1C6MA 1B7RA 3WPLA 3P4ZA 2OU0X 1GE0A 1IX0A 5D5CA 5B59A 1H6MA 1LHKA 4XADA 4B4JA 3OJPA 1CJ9A 1C08C 4I7OA 4LFPA 1QTKA 1LCNA 3HTDA 1KIQC 1TAYA 1N4FA 1UIGA 217LA 1GF5A 1L75A 1LSNA 1D0MA 1L92A 3A95A 190LA 1DPWA 4HV1A 3DNAA 1UCOA 4H9HA 156LA 4A7DA 1L34A 1QUGA 2HEEA 4NGKA 111LA 1UA6Y 2MEEA 1P2CC 235LA 3BKVA 1NKHA 2Q9EA 2OE4X 221LA 1CKFA 5HMVA 4GN3A 1I56A 4HTNA 223LA 1QUSA 1VFBC 3HT7A 1L67A 1QTZA 1QQYA 1RFPA 4DDCA 1IWZA 3C81A 3C80A 1NHBA 1C6IA 5LVGA 1GBXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 169L A;  3PBL A;  4DD2 A;  3TXK A;  2F4G A;  5M1Y A;  3LZM A;  1C6G A;  1EQ5 A;  1DYG A;  2BQH A;  211L A;  3G3B B;  4HPE A;  239L A;  5I14 A;  3TXF A;  1L68 A;  2RAZ X;  1LPY A;  4M6D A;  4DT3 A;  3AGH A;  5ILC A;  208L A;  1QT7 A;  1DYF A;  1QS9 A;  2FYC A;  1C6E A;  3AGI A;  4H94 A;  4N1E I;  3V2Y A;  1L97 A;  1HML A;  2YBH A;  2LZT A;  1LZC A;  1TDY A;  3TMV A;  4B4E A;  1FLW A;  3ZEK A;  159L A;  187L A;  3A93 A;  3CDQ A;  4QY9 A;  2B5Z A;  4LFX A;  1KIP C;  131L A;  1L74 A;  1LJE A;  3AZ7 A;  1G1W A;  2F30 A;  1CKC A;  2CGI A;  4ETC A;  1QTB A;  4LZM A;  1L49 A;  4I8S A;  2BQJ A;  1LW9 A;  1OV5 A;  3D3D A;  4YXA C;  251L A;  3HUK A;  149L A;  3G3X A;  1KW5 A;  1QSQ A;  4OWH A;  1CX7 A;  1L12 A;  141L A;  1L07 A;  3LN2 A;  1GBO A;  6LYT A;  3WH1 A;  256L A;  4DD0 A;  3CDR A;  4ETE A;  1XGQ C;  3EXD A;  2YBM A;  3SN6 R;  1L17 A;  3OK0 A;  188L A;  1L04 A;  1KNI A;  236L A;  1IWY A;  4UWV A;  198L A;  1B5V A;  3W3E A;  5LVJ A;  4NGY A;  4NG1 A;  1HNL A;  3C8R A;  1NBZ C;  5KXT A;  1D3N A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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