2NTGA

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant t115r7
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFCNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2ntgA00
113LA 1LI3A 3HH6A 2IGCA 1CV0A 1L02A 1G0MA 1L75A 1L81A 2OEAX 3HDFA 3CDQA 1L0JA 1C6PA 1L38A 4W53A 4W59A 1L26A 1C66A 3HTDA 160LA 4OO9A 2LC9A 4YXCA 1D3FA 1QT5A 1L04A 1KY1A 3HU9A 4PK0A 1L54A 3FI5A 1C62A 1L79A 1PQMA 5I14A 1LYFA 1T8GA 2CUUA 1LPYA 210LA 2B6ZA 1LGUA 1L89A 1QSQA 213LA 228LA 3QAKA 4IAPA 3SB5A 2O7AA 182LA 170LA 1C6BA 1L43A 223LA 2B6YA 2RBQA 3L64A 4I7SA 2ANVA 119LA 255LA 220LA 1L17A 1L99A 3DMZA 1L14A 1L32A 1WTHA 4AQNA 258LA 236LA 216LA 2L78A 1P3NA 244LA 1L08A 2B75A 1OV7A 1OWYA 4I7QA 1L49A 3HT6A 3HU8A 1LW9A 1C67A 141LA 125LA 3HWLA 138LA 3HH5A 4K5YA 4DKLA 1L97A 3C7ZA 3DN8A 3OE6A 1OWZA 201LA 118LA 163LA 1D3JA 253LA 4W56A 4DAJA 1L16A 205LA 111LA 3HT8A 3FA0A 259LA 3GUMA 248LA 3SB7A 1L45A 1L44A 1LWGA 103LA 1CU3A 4EKQA 2HUMA 1CU0A 3DKEX 252LA 1L69A 1L61A 1SSYA 3K2RA 2Q9EA 2NTGA 2OTZX 4I7NA 3L2XA 3RZEA 1QT8A 2QARC 2OE9X 3C8QA 6LZMA 2RBPA 173LA 1QTBA 249LA 120LA 1PQJA 169LA 221LA 1L58A 1L80A 4I7PA 1LI6A 224LA 2RB1X 1QSBA 122LA 246LA 1G0LA 1L07A 1CU6A 1G1VA 1QTCA 1ZURA 1QT6A 1L33A 1CV5A 218LA 1D3NA 1JQUA 227LA 127LA 2B73A 161LA 1L19A 2F32A 1L11A 1C6EA 102LA 3C81A 1B6IA 2B6XA 3GULA 165LA 3UONA 148LE 172LA 3PDSA 171LA 2B70A 1L22A 1OYUA 1LLHA 1P5CA 2LZMA 3C8RA 137LA 3LZMA 4EKRA 1EPYA 4DJHA 152LA 3HTGA 4ARMA 3HTFA 1L47A 1SX2A 239LA 1DYEA 1KW7A 197LA 235LA 4LDOA 1QT4A 1L20A 2Q9DA 1L73A 151LA 144LA 108LA 1L10A 1L57A 1L96A 1G0QA 200LA 243LA 107LA 3VW7A 3CDOA 2RH1A 3D4SA 1QTHA 2OE4X 4PJZA 147LA 206LA 1P46A 3C82A 1C69A 4GBRB 1CU5A 1C6NA 1L76A 3V2YA 1L34A 3HT9A 114LA 2NTHA 4LDLA 1G0KA 187LA 1L64A 1L42A 1C6KA 191LA 4ARMB 131LA 1QTVA 1C6CA 2RBOA 3HT7A 130LA 4ARQA 1CV6A 1L27A 2HUKA 4I7TA 3ODUA 168LA 2F2QA 3SB8A 1L72A 1L93A 1G0JA 115LA 1L98A 3DN2A 139LA 1CVKA 3CDVA 1DYCA 199LA 1P7SA 1L00A 2RB0X 1G06A 2O4WA 1L82A 4LDEA 1L35A 1QT7A 257LA 183LA 1LGWA 184LA 4EJ4A 4I7OA 195LA 177LA 5LZMA 1LGXA 1QUDA 260LA 2RBNA 167LA 1C6TA 3F8VA 4ARQB 1D3MA 3DMVA 1LYHA 1C6FA 4W51A 1I6SA 1L40A 1L12A 1L90A 178LA 1LYJA 1QUGA 1QS9A 2OU9A 149LA 2Z6BA 1KS3A 1L50A 256LA 4I7JA 1L88A 3CDTA 123LA 174LA 3DN1A 3G3WA 109LA 164LA 189LA 1CX6A 1L03A 261LA 1D9WA 4YXAC 2B74A 162LA 1L30A 1QTZA 3C8SA 1P56A 1L71A 222LA 4LZMA 2OTYX 1L36A 4EXMA 129LA 3DN0A 1T6HA 3F9LA 1P6YA 3GUNA 1D2WA 4EPFA 1PQKA 3DN3A 3G3XA 1C60A 186LA 1PQDA 150LA 1C65A 126LA 238LA 212LA 1PQOA 2B6WA 1L91A 3SBAA 251LA 3HDEA 192LA 1T8FA 3PBLA 176LA 1XJTA 2OU0X 4ARLA 1L65A 158LA 140LA 1DYGA 1LYGA 1C6DA 4ARJA 1G1WA 2RAYX 1L06A 1L84A 2F47A 1L28A 3GUKA 1P64A 1C6QA 245LA 1L52A 254LA 231LA 190LA 1L95A 237LA 2RB2X 155LA 1L09A 3SBBC 1QTDA 1SX7A 247LA 3GUJA 1L53A 1LWKA 1L31A 242LA 4I7KA 1L92A 3OE8A 1QT3A 1T8AA 1QUHA 4EPIA 188LA 1C63A 1CV4A 262LA 180LA 1C6MA 1L66A 1L55A 1L63A 1LYDA 1G0GA 1XJUA 3DN6A 4W55A 250LA 4EKPA 1T97A 3HUQA 3GUOA 3CDRA 3GUIA 3HUAA 1DYDA 1KY0A 1L0KA 3OE0A 2QB0B 1JTNA 2OE7X 1ZWNA 3OE9A 3NYAA 4ZPUA 1L46A 175LA 1CV3A 1C6AA 3DNAA 3HTBA 1L48A 1ZYTA 3FADA 1PQIA 1CUPA 1G07A 4EKSA 219LA 1QUOA 1L15A 1LYIA 1L18A 1L87A 159LA 4ARPA 211LA 226LA 3EMLA 3C83A 3SB6A 128LA 1DYBA 1G0PA 1L05A 146LA 157LA 1L62A 214LA 1NHBA 209LA 1DYFA 1C6IA 7LZMA 1L29A 3GUPA 1L70A 2OU8A 1L13A 1CUQA 2B7XA 1KNIA 4I7LA 229LA 1CTWA 1L41A 3DN4A 1L85A 3JR6A 3HUKA 1C6GA 1L39A 110LA 1L68A 2B72A 145LA 4GRVA 2RBSA 215LA 1SWZA 1JTMA 1P2LA 3C7WA 3HH3A 1K28A 1L56A 4W52A 1P2RA 1L23A 1L37A 1SSWA 3NY8A 1C6LA 1D2YA 2A4TA 4E97A 4W54A 1C6JA 1L01A 4S0WA 1CU2A 1OVKA 2B6TA 4I7RA 230LA 3SB9A 1L59A 1L74A 181LA 156LA 1XEPA 1OVJA 3G3VA 3DMXA 3NY9A 1KW5A 233LA 1L83A 196LA 143LA 1SWYA 3V2WA 225LA 2HULA 1LYEA 1L60A 241LA 1QS5A 1CV1A 1L86A 2LCBA 217LA 2RAZX 1C64A 1P36A 4W58A 1L51A 104LA 1L77A 2RBRA 4W57A 1C6HA 112LA 2O79A 1C68A 3RUNA 232LA 166LA 1TLAA 3HH4A 1L67A 1C61A 3C80A 4I7MA 1DYAA 3SN6R 1LI2A 1L25A 4YX7C 3C7YA 1P37A 234LA 240LA 185LA 1L94A 1OVHA 1OV5A 2ANXA 1CX7A 198LA 142LA 1L24A 1L21A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HH6A 1YKXX 2BQMA 3WMKA 1L02A 1BQLY 1I1ZA 1BVXA 2ZIKA 1CKDA 3CDQA 3N9CA 4W59A 4OO9A 4QDNA 2DQGY 4LT2A 1LZRA 3HU9A 4PK0A 3FI5A 1PQMA 1T8GA 1LPYA 3W6DA 210LA 1LGUA 3QAKA 4WOAA 3D3DA 1C6BA 1L43A 3A6CY 4DD2A 2BQKA 2ANVA 3B0IA 4CHXA 258LA 5LA5A 5DL9A 5E4PA 1HEQA 1OV7A 1OWYA 4M4OA 1L49A 1FN5A 1LMTA 4XJDA 1LZTA 1LJIA 1W6ZA 3N9AA 3HWLA 1BVKC 1BB3A 1L97A 5E9RA 3OE6A 201LA 4W56A 1L16A 4QGZA 4EKQA 4G49A 1LCNA 1L69A 3RT5X 3K2RA 2EQLA 1GB7A 4WLDA 3L2XA 5F9UA 1IOSA 6LZMA 221LA 5LAGA 4HPIA 1L80A 1GE4A 224LA 2RB1X 1LHKA 5KXTA 1UC0A 2Y8PA 4KT3A 4ZFPA 4H8YA 1G1VA 1EQ4A 1YKZX 2C8PA 1JQUA 1V7SA 3P64A 1A4VA 1LMOA 2F32A 4NGJA 2B6XA 4RLNA 2BQLA 165LA 4B4IA 5D5FA 2HU1A 3PDSA 1GF4A 4LYMA 1LLHA 137LA 2FBDA 4EKRA 4DJHA 1HMKA 1GF6A 1G7IC 3WW6A 4UWUA 1DYEA 1DZBX 1KW7A 2YBMA 1LHMA 4GN3A 2MEHA 1L10A 4DD7A 3G3AB 1L96A 1H87A 1I56A 107LA 1OP9B 2BQNA 2RH1A 4PJZA 7LYZA 5AMYA 147LA 206LA 1B5ZA 4NGWA 2GV0A 1C6NA 1L34A 4G4BA 4LDLA 1G0KA 2MECA 1LJEA 1G7HC 1C7PA 1JKBA 3A8ZA 191LA 4H92A 131LA 1C45A 3OJPA 3A3RX 5KXZA 130LA 2BAAA 1L27A 3WU7A 4WL7A 2HUKA 168LA 3IWRA 2F2QA 3SB8A 1L93A 1G0JA 1L98A 4LYOA 1J1OY 1LZAA 1VAUA 199LA 2LZTA 2RB0X 2O4WA 1YROA 4LDEA 1NMMA 3WVYA 3AZ4A 1YKYX 195LA 177LA 1C6TA 5FEKA 3QE8A 1D3MA 3DMVA 2D4IA 1LYHA 4II8A 3GXKA 1IOTA 2HTXA 5C6LA 1L12A 1LJNA 178LA 1LYJA 5LYMA 1QUGA 1QS9A 2OU9A 1QSAA 3CDTA 3DN1A 3G3WA 1REZA 3CT5A 164LA 189LA 2Z38A 4H1PA 1D9WA 2BQBA 4YXAC 1GB9A 1KIRC 1G7MC 5LIOA 1L30A 3MGWA 3C8SA 222LA 3M3UA 2W1XA 4LGKA 1XFPL 1WTNA 4EXMA 1LSMA 129LA 4ZIXA 4GCEA 2X0AA 1IP3A 4EPFA 1PQKA 3DN3A 3G3XA 1Z55A 5J7CA 1PQDA 150LA 1C65A 1LZNA 1IY3A 1L91A 4G9SA 4GCFA 1I20A 3P4ZA 1GF9A 2BQJA 4N5RA 2C8OA 2FYCA 1GF0A 1DYGA 2HECA 2A7DA 1J1XY 4ARJA 3T6UA 1G1WA 2RAYX 5I4YA 1L28A 3GUKA 1CKGA 1P64A 1GE0A 5ILFA 237LA 155LA 1LZ1A 4YEMA 1SX7A 2HEAA 1L53A 1OUFA 1AKIA 2D6BA 5KXLA 1L92A 1FLQA 4EPIA 1NQIA 188LA 262LA 5DN5A 4WO9A 1FLWA 1FBIX 4DD3A 1XJUA 250LA 1T97A 3HUQA 3GUOA 4BAFA 1DYDA 1KY0A 1IWWA 1VDTA 4XJBA 2QB0B 1JTNA 1IP7A 2OE7X 1B5XA 2LYOA 3NYAA 175LA 3CB7A 3TXJA 3HTBA 1LZ9A 4B1AA 1JJ1A 1PQIA 3AZ6A 1LHIA 1F6SA 4H91A 4H9AA 1L87A 1LSFA 5IDDA 5KXXA 1IORA 5KXMA 1DYBA 2YBLA 4YM8A 1GFUA 1L62A 1LAAA 1NHBA 1OUGA 209LA 1EQEA 4OWHA 1L29A 3GUPA 4WG7A 1L70A 2G4PA 2ZYPA 1FDLY 1LZ4A 1LTMA 1GFJA 5T3FA 3DN4A 3HUKA 5KY1A 2RBSA 4OWCA 5HQ1A 1NWGA 5B59A 2DQFC 5KXPA 1HFYA 4WM3A 1K28A 1L56A 4PPOA 4GCBA 207LA 4DWXA 5KKJA 1L23A 5APDA 1CKHA 3TMWA 3WUNA 1GFAA 4S0WA 4NGIA 1WQNA 4OWEA 3AGGG 1LJ4A 5DN4A 1L59A 1L74A 1LYSA 1BB5A 1KXWA 3G3VA 3NY9A 2CDSA 3LN2A 143LA 1VDPA 5HNLA 3V2WA 225LA 5F81A 1LYEA 1L60A 241LA 4DQJA 4CGEA 1L86A 3WYHA 4D9ZA 1EL1A 217LA 2RAZX 5L3IA 1P36A 3G3BB 3E3DA 1L77A 2F2NA 2ZQ4A 1C6HA 4TWSA 1VEDA 232LA 1QUSA 3WU9A 1C61A 3SN6R 1J1PY 2HEFA 2DQDY 5JENB 234LA 4HP0A 3WXTA 4NGOA 1GBZA 2YSSC 3QY4A 4NG1A 1OV5A 4B0DA 4DDCA 4LT1A 1L21A 1XEKA 4LYCA 113LA 1LI3A 3RW8A 4HV2A 4LFPA 1L38A 3HTDA 1D3FA 2I6ZA 1QT5A 4CFOA 4NSIA 1L54A 5HMJA 4DD1A 1C62A 2DKVA 4LT3A 5A3ZA 3AZ7A 1C10A 4IAPA 182LA 170LA 2RBQA 119LA 255LA 220LA 1HC0A 193LA 1L99A 1L14A 1WTHA 1C43A 2L78A 3LYZA 3ATOA 244LA 1FKVA 4LYTA 2MEDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HH6 A;  1YKX X;  2BQM A;  3WMK A;  1L02 A;  1BQL Y;  1I1Z A;  1BVX A;  2ZIK A;  1CKD A;  3CDQ A;  3N9C A;  4W59 A;  4OO9 A;  4QDN A;  2DQG Y;  4LT2 A;  1LZR A;  3HU9 A;  4PK0 A;  3FI5 A;  1PQM A;  1T8G A;  1LPY A;  3W6D A;  210L A;  1LGU A;  3QAK A;  4WOA A;  3D3D A;  1C6B A;  1L43 A;  3A6C Y;  4DD2 A;  2BQK A;  2ANV A;  3B0I A;  4CHX A;  258L A;  5LA5 A;  5DL9 A;  5E4P A;  1HEQ A;  1OV7 A;  1OWY A;  4M4O A;  1L49 A;  1FN5 A;  1LMT A;  4XJD A;  1LZT A;  1LJI A;  1W6Z A;  3N9A A;  3HWL A;  1BVK C;  1BB3 A;  1L97 A;  5E9R A;  3OE6 A;  201L A;  4W56 A;  1L16 A;  4QGZ A;  4EKQ A;  4G49 A;  1LCN A;  1L69 A;  3RT5 X;  3K2R A;  2EQL A;  1GB7 A;  4WLD A;  3L2X A;  5F9U A;  1IOS A;  6LZM A;  221L A;  5LAG A;  4HPI A;  1L80 A;  1GE4 A;  224L A;  2RB1 X;  1LHK A;  5KXT A;  1UC0 A;  2Y8P A;  4KT3 A;  4ZFP A;  4H8Y A;  1G1V A;  1EQ4 A;  1YKZ X;  2C8P A;  1JQU A;  1V7S A;  3P64 A;  1A4V A;  1LMO A;  2F32 A;  4NGJ A;  2B6X A;  4RLN A;  2BQL A;  165L A;  4B4I A;  5D5F A;  2HU1 A;  3PDS A;  1GF4 A;  4LYM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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