2NUXA

2-keto-3-deoxygluconate aldolase from sulfolobus acidocaldarius, native structure in p6522 at 2.5 a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MEIISPIITPFDKQGKVNVDALKTHAKNLLEKGIDAIFVNGTTGLGPALSKDEKRQNLNALYDVTHKLIFQVGSLNLNDVMELVKFSNEMDILGVSSHSPYYFPRLPEKFLAKYYEEIARISSHSLYIYNYPAATGYDIPPSILKSLPVKGIKDTNQDLAHSLEYKLNLPGVKVYNGSNTLIYYSLLSLDGVVASFTNFIPEVIVKQRDLIKQGKLDDALRLQELINRLADILRKYGSISAIYVLVNEFQGYDVGYPRPPIFPLTDEEALSLKREIEPLKRKIQELVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural exploration of the catalytic capacity of Sulfolobus KDG aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-keto-3-deoxygluconate/2-keto-3-deoxy-6-phospho gluconate a
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus acidocaldarius dsm 639
total genus 114
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nuxA00
1VR6A 1OFEA 1LBLA 1WBJA 5LSMA 5FEPA 2EAWA 3E02A 2CLEA 1ZNNA 1BWLA 1PIIA 4WY0F 3M0ZA 1VYSX 1NAL1 3G3DA 3IIZA 3I7RA 4WY0A 2QCEA 4M6PA 1G69A 1H63A 2ZRXA 5HMSA 3CWOX 3L5LA 2R91A 3W3OA 2C18A 1MEIA 2CU0A 3G1DA 2FTPA 4MUZA 4UMAA 3F03K 2H8ZA 1XKYA 5FEZA 1TTPA 3SR7A 2B7OA 1LRTA 3DHDA 4GC4A 3QW4B 2P0OA 3GIYA 2FPYA 5LNRA 3UY7A 3W1RA 3N9RA 4KWWA 4FXRA 1TCDA 1AMKA 4RK8A 4NZJA 4Z08A 4AHPA 3IGUA 3R13A 4ZQRA 4MJMA 3EXRA 2W6RA 3IV3A 4LNYA 3TW7A 4JTTA 3GDLA 1I2OA 5DBUA 3S1UA 2FB2A 1AW5A 3EWUA 4YWIA 1Q6QA 4JTLA 3FJ6A 3L0KA 2VFDA 4LV9A 4MPQA 4S1FA 3IGXA 1RR2A 2ZA1A 3VI2A 2NV1A 3C61A 5CPOA 1R2SA 1TPB1 3NPUA 2CZEA 2OMAA 4H4IA 2YW3A 2A7RA 1GVQA 4AWTA 4ORIA 3U6WA 2ATSA 4FNPA 4N2YA 5DY3A 1DJQA 3G8EA 3L5AA 5AHIA 3GYEA 4O0ZA 4JEQA 1JCJA 2X30A 3HB9A 4Z0SA 5AHLA 3FLUA 4O17A 4O10A 3PUDA 3GB6A 1IIHA 1YDNA 3CPRA 5AHNA 1VCFA 1H7WA 1R2RA 1ZCOA 5AYYA 2E6FA 5E0KA 3STGA 3HGRA 3CIXA 1ICPA 1FCUA 4KFNA 3UPBA 4UFJA 4UTUA 5AFDA 2E5BA 2VELA 1RQEA 5CSRA 2A21A 3N3MA 3SW6A 2AGKA 3W1MA 1Q45A 3R89A 4CCEA 3GZ3A 4UNLA 1NF0A 2Z6IA 2QCFA 2ZBTA 3RMJA 1P0KA 1JRBA 4O18A 3MHGA 1MXSA 1KM1A 1VLWA 3OVRA 1YTEA 1WXJA 3LRKA 1VCVA 5F4XA 1BTMA 3IVSA 3UZJA 5D33A 1OX6A 4OBTA 4R53A 1ZAIA 2BSLA 2V81A 3V75A 1KFJA 1PVNA 1HG3A 2HMCA 3FKRA 1FX6A 2NWSA 3CB8A 3O8AA 4LV4A 1XBYA 2AQWA 3GNDA 3O6CA 5D2WA 6TIMA 1HL2A 4N6FA 4QITA 2CLFA 3PBWA 2V82A 1OYAA 1OFRA 3TXZA 1MEWA 4IJBA 1GJPA 2W79A 4GUHA 4XBKA 3TV8A 4XTDA 4CCDA 4ZQNA 3HO8A 4DO5A 2I1OA 3O1NA 4GUJA 3ABRA 3S1VA 2JKEA 5D03A 1YYAA 2DZVA 2ISWA 4O11A 3PF3A 3QH2A 2Y88A 1FQ0A 4GBUA 5D09A 1ZHAA 3G1SA 1WYIA 5C5YA 1KM0A 5DY2A 4AF0B 3LTPA 3T40A 2GPTA 3LXCA 1B57A 4K6AA 3W07A 4KFPA 2BLEA 3TH6A 2QAFA 2XN2A 1SW0A 3OG3A 4UTTA 1I2RA 5K7JA 2F7FA 5G1YA 3G1YA 4MZYA 3DI0A 1YTKA 4ZQMA 3C8FA 3L2IA 2PRMA 1VPXA 2ZZ2A 2J9XA 2Y85A 1JJKA 2V5LA 1KBJA 4WY0B 1TTIA 5EL1A 1XM3A 2QCNA 2H3BA 4UR8A 1KTCA 2CZFA 2YR1A 4Y6GA 2GQ8A 5KTLA 3W73A 4GFSA 2QCHA 1ZJIA 2CLLA 3USBA 4LOCA 4FB7A 4AXKA 2E68A 3B03A 4N4PA 4DEFA 4UFHA 1SQ7A 5EPDA 3N34A 2J24A 2O7QA 3A5FA 3STEA 1EUAA 5I3IA 4P2VA 4IQLA 1IXPA 5K2ZA 3A23A 3PR2A 2F84A 4MZ8A 3W87A 4TX9A 4IXXA 4JTHA 4QAIA 1N7KA 3DH7A 3KRUA 3NQCA 2YDAA 1VGAA 4HNVA 3W2MA 1SO4A 5HJLA 4UTLA 2FDSA 1SSDA 4GUFA 2YYUA 1ML1A 4UTWC 4AHOA 4O50A 2C0AA 5I3HA 4EWND 3PS7A 4JXCA 4FNTA 3EX4A 3LERA 2QCDB 1EEPA 2EPHA 4MIMA 3CHVA 1SZGA 4O54A 3TJLA 1H7PA 2YCEA 2W0UA 1JCMP 3N14A 2B7NA 3MYPA 1M5WA 1W5MA 4LC8A 2GUUA 3QW3A 4ALDA 2Z0IA 3DFOA 1X1ZA 4H6KA 3QQ0A 3BGJA 1P4CA 3CQ0A 2C19A 2DU2A 3B8DA 4OE7A 3G1HA 3S9YA 2J27A 1F74A 3W7CA 2FIQA 1K3UA 1C9DA 3DKLA 1FXQA 4FX6M 4O1BA 4OT7A 4LVFA 3TKFA 4NVTA 3VKJA 4O8RA 4XZ9A 3L9CA 3TXVA 4TMCA 1LBMA 4FNSA 2C14A 2DZSA 3O06A 4ADSA 2E5DA 5F2LA 4E0CA 2JK2A 5KSWA 1RZMA 2CLHA 3YPIA 2YXGA 5HUPA 2B7PA 3TROA 3LBMA 4IPIA 2Y70A 4AWSA 5I3KA 2H6RA 3O6YX 1HO1A 4KWVA 3UZ5A 1RQHA 3ELFA 3LHZA 1LDCA 2BXVA 2GOUA 3BW4A 3NL5A 3P5ZA 3NQAA 4FNUA 3SGUA 3MYOA 3UY8A 3BG3A 3I68A 3W7GA 3NM1A 1QFEA 3MO7A 5HR6A 3W7EA 4AVFA 1VLIA 4KFOA 4M6QA 3BV4A 4N9EA 1ZAJA 4K38A 3EWXA 4HNUA 3W22A 1K8XA 5K4XA 2RKXA 5GVJA 1CW2A 1LCOA 1JUEA 3CU2A 5J5RA 5CG7A 2D73A 2ISVA 1SO5A 1THFD 2OX1A 5D2YA 1KV5A 3U8GA 4DXVA 3FIGA 3ATYA 4UTTC 4LVBA 3CT7A 4OHQA 1TB3A 3B0UX 3PC0A 1OX4B 5CGQA 1GTEA 2FQIA 3WK0A 5CPMA 1LLWA 3BW3A 4K8EA 1W31A 2YFNA 5HQEA 1JULA 2FPTA 3N9SA 2ZTJA 1B3OA 4JD4A 4AWUA 1V7YA 3NA8A 3NQ8A 2C6QA 5F4WA 1DBTA 4IMFA 4BI6A 1EWEA 2TSYA 1KTNA 3A22A 2HS8A 3BARA 4E38A 3Q37A 2HSAA 1TREA 1P5BA 2ZRUA 4UUIA 4A21A 3LCIA 4N02A 1DL3A 3FA5A 4FEZA 4O1DA 2Z1BA 4DBEA 2PC4A 2VFHA 3W1AA 4MKNA 4QIUA 1QPRA 1AL8A 3LTSA 3E9AA 4XBSA 4NJJA 4JIPA 3QJAA 2RDWA 4DPPA 4RLIA 1QMLA 1YXCA 3PSWA 3C6CA 4I9AA 2QJIA 5D38A 4I7VA 5KZDA 1H50A 3ZWTA 1NF7A 1G67A 2YGYA 2EF9A 2NLIA 3LHYA 5I3GA 3LHTA 1RD5A 1JR1A 3GVGA 1K02A 1IXQA 2Y7DA 3RNDA 1OJXA 4U4MA 3VNDA 3W2JA 1DOSA 4ADUA 2RDTA 1ADOA 3FKKA 3EX1A 2GVJA 1EP3A 1VH7A 2OZ0A 3ANYA 4S2BA 1ZENA 3QPYA 3HPSA 1XDMA 1W1ZA 4S2CA 4JYDA 3PG9A 2WKJA 3QMRA 1C29A 4WJEA 3FFSA 2ZYFA 3OVQA 3TFCA 2E5CA 2QKFA 2Q3RA 1PV8A 4HSNA 2QAPA 4TU1A 4Z0JA 1K7FA 4B5NA 1QPOA 4A3UA 4MFDA 1GZGA 3N2MA 1WAUA 2X1RA 1Q6LA 3BG5A 4MZ1A 1DQWA 3FS2A 1PCWA 1HFBA 2WNQA 3EWWA 1R46A 4LVAA 3S42A 3R5EA 1G7UA 1FUYA 4U28A 8TIMA 3TC6A 3P81A 5D2TA 1EUNA 3NQFA 1ME8A 4JYEA 4A22A 4EVZA 1PHQA 3LI0A 2V0TA 2A4AA 3W6YA 3T55A 4O13A 3W23A 4IXHA 4Q32A 3UXDA 3UWWA 1OK4A 1EWDA 3I7SA 2ZRYA 3STCA 3EKZA 3TIMA 3GXPA 3F4NA 4LS0A 4AF0A 4C1KA 1GG0A 3PULA 3QFEA 1IGSA 1TPWA 4K36A 1FCVA 1H60A 1JQVA 1QOPA 4HSOA 3PY2A 2DZUA 3WFAA 3HGSA 3CWNA 1JUBA 3M9YA 5D2VA 4MY8A 3QYQA 3IVUA 4QNWA 3W7RA 4IOTA 3G1AA 4GJ1A 3TSDA 2V2CA 1UB3A 4Z1CA 1KM3A 2A6NA 1W56A 3QMTA 2V2DA 2WQPA 1EPXA 3M5ZA 1UBSA 4DBDA 3S1WA 2ZA3A 1P1XA 1UASA 1S5VA 5U7SA 1BKSA 4GE8A 4GUGA 2VFFA 4XQ6A 3HF3A 3TAKA 1H61A 1S5WA 3DXIA 5CZ0A 1G4TA 4Z1DA 3PWAA 3P5YA 4XUGA 3KAOA 1FWWA 4WZHA 5CPLA 1Q6RA 4LY8A 3GNNA 1XBVA 1XUUA 2DZTA 4LRTA 4QISA 5H2ZA 1TV5A 3LCLA 3UYCA 4WOZA 1DVJA 3HJZA 3QZEA 1YADA 3I6RA 1LOLA 3SZ8A 1LTDA 2DZXA 4PODA 4Y9AA 4JTIA 3W88A 1HO4A 4UCGA 3EX6A 1GVRA 2DP3A 1TTJA 4KKXA 4UMCA 1L6YA 4CLMA 4H3DA 3E96A 2ZRVA 3C0JA 3KVLA 4UTWA 2CLOA 3ZWSA 2C16A 2YYTA 3PVFA 1IF2A 3W7HA 2E6AA 2QCDA 5AYXA 2E1DA 2A1YA 2FPVA 2O7SA 1PS9A 4ONVA 3BO9A 2QUUA 5L6UA 4MLJA 3W2NA 5G4WA 3MW7A 3W71A 2YZRA 2G95A 1OK6A 2E6YA 4R7JA 1OFQA 3F4WA 1VC4A 2OJPA 3W7OA 3O07A 1Z42A 3KXQA 4PEKA 3G3MA 1YPFA 2QCGA 1JQXA 1KW1A 3Q58A 4JX6A 4UFLA 1Z41A 2YX0A 3LXBA 4JICA 2H8XA 2PE4A 2CZDA 2ZCGA 3OHIA 5KZMA 4NJKA 3TX9A 3IIOA 3CLMA 3L0GA 3G0SA 4ICNA 3UQNA 2VC6A 4RZ6A 4Y96A 3LBCA 5FESA 4GNJA 2WPBA 4JTSA 5D04C 5HUOA 1QPNA 3PBUA 2GQAA 1TSIA 4JNMA 4QJ1A 3B0PA 2G96A 1X8FA 4MLRA 3NG3A 3VFLA 3LHVA 5D05A 3MP5A 1A50A 3W7DA 3W7QA 3WK1A 2QUTA 3UWZA 1D3GA 3DU0A 3NQMA 1QO2A 3L5MA 4IGHA 3CC1A 5K3VA 1SFJA 4OWGA 3NYZA 3HBLA 5TQLA 3PSVA 4CNPA 4EOUA 1XL9A 2NZLA 2BTMA 3TK7A 2B7QA 2ZDRA 1Z44A 4AMAA 2LLEA 1GEQA 5AB3A 2Y62A 5EKYA 4MOZA 1WBHA 3DFSA 3TSBA 3A9IA 2UV8G 1IXOA 2GVLA 3PUEA 1BEUA 2ZZ3A 1OABA 1LRQA 4ZL1A 1EP1A 5CZJA 3S0CA 1K7XA 3GAYA 3IIXA 3LOTA 4K39A 1H7XA 3NPXA 4UTIA 1F6KA 3NPVA 1OX4A 4O19A 4HPJA 4BF9A 1VZWA 1VJIA 2NXIA 4MY1A 2ZZ7A 3KRZA 3N2XA 1I4NA 2CWNA 2NXHA 3SECA 3W1PA 5DXYA 3T44A 4NU7A 3TA6A 3PG8A 4O0KA 3TW6A 2PRLA 4HNNA 1VCGA 3JRKA 3G18A 3HG2A 3M1ZA 3LRLA 3U2OA 4UTMA 1TQXA 4X9SA 1FCBA 1I45A 4DELA 4G1KA 3L68A 2A2IA 2NWRA 1GYLA 4UTHA 1JVNA 1UUOA 1TPVA 3NQVA 3O63A 1B4EA 5EMUA 2J88A 5BMXA 2XN1A 1A5BA 3W86A 3C2EA 1H7RA 3R12A 1KFEA 1Q3NA 4WUIA 2IQTA 3LHUA 3RK8A 3M5YA 1XC4A 2Z2UA 3FEMA 3OIXA 1I2NA 3ZS4A 2VEKA 3HPXA 1PHWA 1ONRA 1ZALA 3W75A 4NJIA 4L4LA 1SZEA 1GPWA 1K8ZA 3SFKA 3I65A 3NQDA 2VEMA 3AO0A 1EP2A 1TMHA 3ZR4A 1DQXA 3GK0A 3NQGA 4O16A 1F05A 4K8HA 3WJZA 3P60A 1TPFA 2QJHA 1PL9A 2XFWA 1TPC1 1QCWA 3CIWA 3TSMA 2DJXA 3GLCA 3W76A 5D30A 2EKCA 3EWBX 1LBFA 2OT0A 4X2RA 2DORA 1W54A 4CNNA 3S1XA 4YL2A 4DF2A 1F73A 3D0CA 1QNVA 5IM51 3T4CA 1ICQA 3H53A 3MBFA 2G97A 1A53A 2CLMA 3GX9A 5DCBA 4GRSA 2EHHA 4UTJA 4DF0A 1TV8A 3IRDA 3N73A 4AH7A 4EF9A 1A5AA 1LP6A 2WSQA 4IWWA 2WSYA 1G4SA 4IMGA 4IPJA 3QQ1A 1OG0A 1KLYA 4RXFA 3LXAA 2A0NA 2R8WA 5G4EA 5K9DA 3W1UA 2QEZA 2YFOA 3GR8A 3BLEA 3A5VA 4WD0A 3S5YA 4CNOA 4J9JA 4RJEA 1JCLA 3W72A 4P61A 4O4VA 1VYRA 3NPWA 3THAA 2OCZA 5EA9A 1FDZA 3MUXA 4JTUA 1JCYA 4TO8A 5G2WA 3FYOA 1YXYA 4ZZ9A 4LU0A 1WDWA 4JDBA 3LCFA 4UIOA 4YLWA 4JTEA 2JGYA 3ABQA 5AHEA 1OFPA 1FDYA 5BOOA 3CEPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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