2NWJA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.75 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.75 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nwjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nwjA02
4H65A 3A09A 3OSQA 4P0GA 3ZKLA 1ZLQA 5AA4A 3CSBA 2ZMBA 5I2KA 5M2VA 2D3IA 1P1WA 3JYRA 4LQ2A 2D21A 1OLCA 2WKYA 4X48A 4F39A 3V89B 3KZGA 4QF9A 2O84X 3B6WA 1NMUA 1SQYA 4U4SA 4GF8A 4F3PA 4G68B 5I58A 4UA8A 2PBWA 4HW8A 3F11A 1NNKA 4G4PA 1SBPA 2XXUA 3TCFA 1PBQA 4GLIA 2E0SA 3QUJA 3HHGA 4Z0IA 1ZU0A 1FTMA 3MVZA 3PPOA 2KLFA 3V5AA 3MVYA 1FTJA 3GBBA 1O7TA 4PQJA 3SESA 4KQPA 4NF6A 1MPDA 1EH3A 1FTLA 1Y1MA 1LSTA 2AIXA 3QUFA 3LC8A 1B4ZA 4BDOA 3EQ1A 4OESA 4EQ9A 3OO7A 1PB7A 3O29A 1MQDA 3PUZE 5TP9A 1JVXA 3CIJA 2Q2CA 4R2BA 3PPQA 3C33A 5DTBA 3PUVE 2P1SA 4RK2A 1LBCA 5AE4A 3T93B 1A54A 2GHBA 3OO9A 5I59B 1OMPA 1PB9A 3DLNA 2Q89A 1EZ9A 5BUUA 2VGQA 2GRVA 3MP1A 2ZNUA 3KEIA 5ITOA 2F7BA 4LATA 3SKPA 1A7LA 2ONRA 2F7CA 2F34A 1MM6A 3H3GA 2QMWA 4AB5A 4YB6A 4DZ1A 3KN3A 2PVUA 5DEXB 4PFTA 3IK6B 2Y84A 4YB5A 2XXIA 4DE8A 3FV2A 2VD3A 3I3VA 4GXAA 3IB0A 4OETA 5J1DA 2HEUA 3RNNA 3L6GA 4YB7A 1D9VA 3VLUA 4EUOA 2ESNA 1R1NA 2HFBA 3S9MC 4IGRA 3K1NA 2ANJA 1SW4A 1H3DA 4Q30B 3GZGA 1B58A 1MY3A 3IJXB 2CMOA 1EZOA 1B52A 2XXQA 4QSDA 4TOZA 1UTBA 3Q26A 2RC9A 1ELJA 1O63A 4IO6A 3RT8A 3H03A 1WDNA 3R7XA 2DYXA 1HSJA 1IQ7A 2ZNSA 4OZ9A 1Y4CA 2V3TA 2OWSA 1N0TA 2DE2A 3FIRA 1US4A 1D4NA 2PX1A 1MXZA 3VXCA 1LCTA 2G93A 3HPIA 5AA4B 3K2DA 2F35A 1LAFE 4I62A 4JWYA 4ELRA 5B70A 5CRYA 3DELB 4QRZA 4JXIA 2DE4A 4R9GA 1UTHA 3VDFA 5AA3A 1FQCA 1JVYA 4KPTA 2ZYOA 4FIMA 4QFLA 5I58B 3FASA 4YKJA 5FHMA 1A8EA 5KCJB 4RPNA 3IB1A 4NEDA 5DVJA 1RYOA 3O97A 1P1OA 3EPEA 2ABHA 3ILUB 4LZ7A 2R6GE 1OLAA 1B1XA 4OHNA 2XX9A 2RCBA 3CRBA 4FEBA 1UIVA 1A99A 4TLLB 5ITPA 3OEMA 5IAIA 1SI1A 1TXFA 4GL0A 3RT6B 2UVIA 4U23A 1Q1KA 4THIA 1XT8A 2IEEA 5JTYB 4EDPA 1N7WA 3TODA 4OEUA 4OWDA 3E13X 3D4GA 3FXQA 2RCAA 5I2NB 3UGWA 4FATA 3KN7A 1MH4A 3ILTB 4KCCA 1OVBA 3B6QA 5DYHA 4KI0E 3T96B 2XX7A 2H98A 2DWJA 1PBPA 1AMFA 3TTNA 2HZKA 3O9PA 3VXBA 4KD5A 5AA2B 4YKIA 3CSGA 4G68A 3S4UA 3U93A 3KSXA 2O1LA 4Q0CA 3VLVA 1UQWA 1M5BA 5DVFA 1B5IA 3IL1B 1B6HA 4XKPA 4IGTA 3TQLA 2F7AA 3TTRA 1D3KA 4QFOA 1EU8A 3QSLA 4YAHX 1DPEA 1I69A 1MG1A 1SDXA 4ZS9A 3KOSA 1GR2A 3IO4A 4ZEDA 5CBRA 1DPPA 4R6KA 2DVCA 2DXRA 2M8CA 1B3FA 1DOTA 3RTFB 4ZZAA 3D4CA 1VE4A 3KFMA 1MQIA 4ZE9A 3C36A 4IO3A 4H1XA 1BKAA 4IY5A 1UTBB 1M5DA 1SW5A 1BIYA 1FCKA 1TFAA 3QXMA 1B40A 1NH7A 3BKIB 4HS7A 1AH5A 5H8FB 4OENA 5I59A 5H8SA 2V84A 3MJNA 4IO4A 1Y1ZA 1US5A 1L5TA 5I57B 3C35A 1LAXA 4U1OA 1Y3QA 3FXRA 4GD5A 2THIA 2XD3A 3K1MA 4K3FA 2CZLA 3U1OA 1H45A 3TMGA 4G68C 4G8HA 1JEVA 1MY0A 3IR1A 1JW4A 4GVOA 3V8XB 4TLMB 5I56B 3IOTA 3TELA 3MUQA 4KYEA 4RY1A 1B05A 3PD9A 3I6VA 4G77A 3OENA 4R72A 5CMCA 2RC8A 3MQ9A 1JQFA 1B1HA 2OLBA 1NH8A 2XXRA 4H8IA 4LVQA 1MQGA 5TU0A 3K0VA 1NNFA 3KOTA 4DXCA 1YCJA 4F3BA 2YJPA 2UVJA 3FXUA 3CVGA 3KSJA 4C1UA 3ZS6A 3H6UA 2DWHA 3CFXA 2XXPA 2XXYA 2OCUA 2RINA 4U4XA 4EQBA 2O7UA 1LAGE 3FD3A 5FHNA 5FTHA 3VVDA 2ONKE 1MH3A 4BDMA 4N07A 3CFZA 3N6UA 4ECFA 4NTLA 3AXFA 3VLWA 1CE2A 1M5EA 4FORA 3U92A 1SYHA 2Q88A 2XXXA 5L9MA 4P11A 1MXUA 2Z8FA 4QSEA 2QRYA 5CC2A 3FV1A 4U1ZA 4HCWA 2AL5A 2V3UA 4IO2A 3VFJA 4KCDA 2LAOA 4ELQA 3RLFE 1B7HA 3UA8A 4ZEFA 2PMSA 4BLAA 1QUJA 3LSXA 3OEKA 3B6TA 4JWXA 4FE8A 4WKMA 5KCJA 4R2FA 4LP2B 2IA4A 2Q8JA 1SVXB 5EHMA 2V25A 1N3WA 3KG2A 4F2QA 4LA9A 1FTKA 3C34A 4LONB 4ELOA 3TYHA 3IOUA 4ZE8A 1PDAA 4YKKA 4OFOA 3SEXA 3MPLA 4IY6A 3CG1A 1IIWA 4OEVA 3RTWB 3K02A 3OXNA 1DMBA 3VVFA 3FVOA 1B5JA 5JTYA 1XS5A 3BFUA 1MQHA 4ZEKA 3MZ9A 2XXTA 2I6EA 3PUWE 2F8DA 4WXJA 5TPAB 2H25A 4E0XA 5I2NA 1XVYA 2I49A 3SEUA 4H0WA 3RUMA 4I8CA 4F31B 5CI5A 1B5HA 1SW1A 2HXWA 4EF2A 1B7ZA 3KGCA 1ZMGA 3N5LA 5AA2A 4O3CA 2H9BA 1TFDA 5B7DA 2UXAA 3PPPA 1N7XA 5FTIA 1PB8A 2I4BA 2ZYKA 3UIFA 3C31A 1PC3A 5HM4B 4RNSA 3FVGA 1IUDA 3P7IA 3QK6A 3MVWA 1Y3PA 4GQOA 4YKPA 2I0BA 1NKXA 3HN0A 1MY4A 4G8MA 4OQOA 4BDRA 2P2AA 2HAUA 3H4ZA 5CMKA 2A5SA 3G3KA 1QKAA 3TCGA 1LB8A 1A40A 2OK2A 2Y7PA 3TAJA 1LAHE 3K00A 1QVSA 4U21A 2REGA 3C9HA 1Y4TA 2ZXTA 3S9NC 5H8FA 4OXVA 4BDLA 4ZEIA 3MZBA 4QHQA 3IX1A 4FEDA 1N76A 5I57A 2VP1A 1II5A 4L17A 2UYFA 2I48A 4ISUA 1LFHA 1FQFA 2F5XA 3FGSA 2NXOA 2H4IA 1NNPA 3UORA 2FA7A 2ONSA 4TQUQ 4F1YA 1N04A 4X1BA 1R9QA 3RQTA 2GHAA 5I56A 2P0SA 1DSNA 2AYSA 3ZKKA 3FUZA 1MY2A 3KJTA 3MAMA 4NWDA 2GH9A 3VE1B 4XKQA 1H43A 4LZ5A 3SEVA 4JWOA 3G7WA 3TTKA 1NL5A 3OD7A 3CI8A 1BTJA 3RGYA 2RF1A 3C4MA 3KJ7A 2O68A 1USYE 2Z8DA 2Y7KA 2NUVA 2B3BA 2Q2AA 4I1DA 2A5TB 2QS1A 1LBBA 1MPCA 4YMBA 1SYIA 2NWJA 4OYVA 4OERA 1B7UA 5L9OA 4OMBA 1B3HA 3DP8A 5HBCA 5H8HA 2XXVA 4O3BA 4Q8RA 1OIBA 3TEPA 3OO6A 2D5WA 4ND9A 2DOJA 4DCYA 1JNFA 1H76A 2X26A 2PT2A 5ELVA 4JSOA 3M3LA 4XTCQ 2VOZA 4HCYA 1YTVA 4ZECA 3OO8A 2UVHA 5F1QA 3PPNA 5EHSA 4OFLA 2OBGA 3H6VA 3H7MA 4JBZA 4EXKA 4GOTA 3H6TA 1P1QA 1B3LA 1FQBA 2R9JA 2W7YA 4R6HA 1IITA 1CB6A 4N6PA 5CMMA 3W15C 1B46A 4XKNA 3TZAA 4QFNA 1AIVA 2O51A 3IB2A 1RKMA 3PMXA 3DP6A 4DIGA 2X7PA 3O6HA 3K1PA 1UIUA 3H6WA 3MBPA 5CMBA 1MY1A 3GBAA 3HCQA 1B4HA 4PFWA 2XD2A 3LSWA 1TWYA 1ZKBA 4H6DA 3MP6A 3K6UA 2E1SA 2DWIA 5TPAA 2HCAA 2RKMA 3PPRA 3T9VA 1TT1A 2Z22A 1B51A 1MXVA 2DXYA 4E0WA 1RYXA 2HZLA 1LGBC 3UP9A 2XHDA 3JV9A 2QS4A 4P0IA 1R9LA 1IZ1A 3LR1A 1B0LA 3IJOB 2G29A 4MLVA 1Y3NA 4F22A 4YMAA 5FHOA 1R6ZA 4I9DA 1VFEA 1POY1 3G3GA 3IOWA 3K6VA 4GL8A 1VFDA 3LSLA 1GGGA 4ZDMA 3FVNA 3T9XB 1HSLA 1LCFA 4RA1A 1MQJA 2XX8A 3LBSA 1AL3A 5HPQA 4JDFA 1B0HA 1MRPA 5I84A 5ICQA 4HTGA 4H67A 4POXA 3C32A 3TCHA 4O3AA 4KYSA 4U2RA 3N26A 3IOVA 5H8QA 4QSCA 1FQEA 1MM7A 1DTGA 4OFJA 3K01A 4YZZA 4GIZA 5JK4A 3FJMA 4PE5B 1M5FA 5EYFA 5H8HB 4ONYA 1N84A 4PETA 3MVXA 2Q9TA 2FYIA 2YPNA 5IKBA 1JETA 1MDQA 2PYYA 2NVUB 1S9TA 2QS2A 4FJPA 1MDP1 4XKRA 1ZJLA 4Z7EA 1Y9UA 3LSFB 3VV5A 4NF5B 1OQHA 1FQDA 1Y20A 2UVGA 2F6PA 5F7VA 1QULA 3MWBA 3N94A 4NF4A 3QYTA 1SW2A 3CG3A 4ZZEA 3HHFA 3FJ7A 4ESWA 3SETA 3SDFA 4MF3A 3U94A 1ZTYA 2F36A 2F6GA 3O28A 4ELPA 3T22A 1WVJA 3KBRA 2DQVA 4KFQA 5JEIA 4X1DA 2A5TA 3LUYA 1T0KA 1J1NA 1GVCA 3VVEA 4GFRA 1P1UA 4NF8B 2DSFA 2ZYMA 1BLFA 4DDDA 1IXGA 4R9FA 4F19A 3UN6A 4FECA 4QFPA 1I6AA 2X7QA 3O6IA 3HSTA 1LB9A 3HV1A 3O66A 3B7DA 4ZEBA 4KYDA 4GRKA 3N6TA 1NNTA 3QAXA 5LOMA 4DCXA 2Z8EA 4F2OA 2RC7A 3RY3A 3U8QA 2QS3A 3K6WA 4F1VA 2DP8A 3PUXE 3IAZA 1S50A 5AA2D 3T66A 2YLNA 5A5XB 4RYAA 4UACA 1FW0A 1B9JA 1M5CA 1B32A 2I58A 1FTOA 4R6YA 1URGA 4YU0A 3PD8A 3HO7A 1A8FA 5K2YA 4F18A 4R75A 2DWAA 3E4RA 1P1NA 3M3KA 3FVKA 3BBRA 2Y7IA 4R74A 3M3FA 2QPQA 3KN8A 4EQ7A 1QUKA 3PU5A 3SEYA 2DS9A 3PMWA 2ZNTA 1B2HA 4NE4A 3Q27A 1KWHA 1VSOA 5BWJA 4FAJA 2B3FA 4RXLA 2R71A 4PFYA 1SI0A 3GXAA 3O6GA 4PFUA 4F29A 4MFIA 2ALUA 3ODBA 2DVZA 1XHYA 5H8QB 2VD2A 2F97A 3R6UA 3PV0E 3EHTA 2I3VA 3PUYE 4IB2A 3E3KA 3T9HB 5CBSA 1B3GA 3M8UA 1MPBA 3IO6A 3L6HA 1OVTA 5DVIA 5H8NB 1JW1A 4RK9A 4XIGQ 1I6BA 2QMXA 3PMVA 2GFEA 1Q35A 1OQGA 3Q28A 1S7YA 1EZPA 2VHAA 3FZVA 3A3UA 3S2VA 3TTLA 1AOVA 3RN8A 2UYEA 5I2KB 1XOCA 3U72A 1I6QA 1POTA 4MLQA 4NF4B 1H44A 4JSDA 4MH5A 4H5GA 1YPNA 3MP8A 3I5OA 4JB7A 5KDTA 2O6AA 2OWTA 2QL3A 3K6XA 4KHZE 2I0CA 1VR5A 2QSXA 1QUIA 4POWA 3TQWA 1N3XA 4LUBA 4C0RA 2ZYNA 3TUSA 1MXWA 3QIMA 2PT1A 4H5FA 4NF6B 3S9LC 2OJTA 2O7IA 3IORA 3Q25A 1ZBMA 3OSRA 3G3JA 3UK4A 3CFLA 4U22A 3RPWA 1GTKA 1URSA 4H8JA 1XVXA 3FATA 4WEDA 5TP9B 2NOOA 3TPAA 1F9BA 1QW0A 3MPKA 5KZTA 2I3WA 4N13A 2H5YA 2V93A 4NF5A 2DE3A 3O2AA 4LZ8A 3EHUA 1YAEA 4DXUA 3Q29A 4PP0A 1MXYA 4GWOA 2H99A 2Z23A 1MS7A 3THIA 3W9WA 5L9SA 3MZ1A 2Y7WA 4WEPA 1ATGA 4XXUA 2F78A 2V3QA 2Y7RA 4EXLA 4G8NA 3R26A 4OVJA 4KR5A 4LQ5A 4R73A 1HSEA 4RPOA 4RJZA 4GXSB 4QFKA 3CR9A 2HAVA 3TKDA 2HQ0A 3WAFA 4AQ4A 3OELA 1XC1A 3EF7A 5AA1A 5ISUA 2AL4A 4NF8A 1BP5A 2O1MA 2XXHA 4M4GA 1PEBA 3OMBA 1IEJA 1LFGA 4X9TA 5K2XA 1ZIUA 1JEUA 4ESXA 4NWCA 3WAEA 3SERA 1NFTA 4G2ZA 3H06B 1O64A 3BFTA 4DLDA 2B65A 3TDJA 3V83A 1QKBA 4BDNA 5CM6A 2REJA 3EHSA 3JZJA 3FJGA 3MW0A 3DP4A 3ONMA 3K4UA 5A5XA 3G3IA 1MXXA 3SEWA 5L8DA 2BJJX 3S9EA 4DXBA 5DEXA 4M1VA 3DM0A 1IXHA 3OOAA 4F1UA 1FQAA 4IO7A 3TTMA 2FNCA 3G3FA 1DTZA 3E9XA 1UTHB 1Z7NE 1A55A 3ECRA 3ZSFA 5KDTB 2OZZA 4IO5A 1SD3A 4OTEA 5DT6A 4BDQA 4YICA 4C1TA 5ICTA 3EN3A 1Z7ME 1IXCA 1QJMA 4AB6A 2QJEA 2XXWA 1ANFA 3TFLA 1LFIA 3MC2A 4EF1A 3W9VA 4MBPA 3G3HA 1LLSA 1WODA 3GLBA 1IXIA 1B3EA 2I4CA 3USDA 3A3CA 1GV8A 2O69A 3PGFA 1URDA 3T9UA 1D9YA 1P99A 5H8NA 1USYH 4F3SA 4F3GA 1JW5A 4NMYA 4Q5TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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