2NYYA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody cr1
Total Genus 385
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
385
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin/immune system
source organism Homo sapiens
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
total genus 385
structure length 1267
sequence length 1294
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nyyA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nyyA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nyyA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nyyA01
2AFGA 4FPKA 4XBLA 1B09A 5IK8A 4FPYA 3BADA 1KDKA 3C88A 3CAHA 1LULA 1FV2A 3RS6A 4HR6C 2VSEA 1V6LA 2ZMLA 1WW6A 3V79C 3SH4A 1Q8SA 1RZOB 3IAGC 4ITCA 4ZXKA 2E4MA 3N35A 4I4YA 3NV1A 3AYEA 3POWA 4X38A 1W3AA 1QDCA 1RY7A 2WT0A 2Y9GA 1Z0HA 4YLZA 1JOJA 3OY8A 1YVGA 3CRHA 4LBMA 3BA5A 3ASIA 1FYUA 3WLUA 1WLCA 1Q04A 2E6VA 1GICA 2ZQNA 1IILA 4JQ0A 4ISRA 4I4QA 2RG9B 4PCRA 2DURA 3TB0A 3C89A 1SLBA 2PHWA 1C57A 1DQ6A 2XHLB 1GGPB 2ESUA 2ZA9A 3NV3A 3FIEA 3Q7WA 3ZC9A 2UURA 3PVEA 3CRGA 4AN6A 1YBIA 2ET2A 5BQUA 4I4XA 2C9AA 2AAIB 4AN7B 1HQLA 2DREA 2WT2A 5DZFA 5BXPA 1GZWB 5BP5A 4YM2A 1S1AA 2G7PA 2DVBA 2R9KB 5JLVA 1P63A 1V6NA 4YW5A 3OJBA 1S0EA 1ABRB 4DRVA 3F62B 4GP0A 4CRQA 4TYSA 3AXEA 3VKLA 1DIWA 1WW4A 4FOVA 4GOYA 2DVDA 1GANA 2BQPA 1OKQA 1YXWA 4BLIA 3BRFA 2BEAA 4GOVA 2FGFA 4YW3A 2R1BA 5FZYA 1MS4A 1C4RA 4XOGA 4Y1UA 3V0BA 3Q7YA 3WMUA 1VALA 3DGTA 3A21A 5HCBA 3M1HA 4AGVA 3CQAA 4H04A 3QCWA 4FPOB 4I1EA 2ZMKA 1HKNA 4WV8A 3JUTA 3VSFA 1LEMA 1I3HA 1JBCA 4GA9A 3AK0A 1AZDA 1BFBA 4HA2A 1RIRA 1MS0A 3BA7A 4WBCA 2P34A 1MZ6A 4ATEA 3MALA 5T5OA 1JT3A 3VT0A 1FN0A 2ETFA 3DDAA 4ZA3B 5T5JA 5GLVA 1EV2A 3WG3A 4JKXB 4IY9A 1KQRA 2ZHMA 4BMBA 2WNEA 2ZBJA 2IWTB 1VAVA 2ZGRA 2CL2A 1YRZA 5E24E 4ASMB 3OJMA 1HQWA 3P6JA 1V6IA 1W6MB 1KJRA 2P39A 5FZUA 4XJ9A 3HN1A 1AFCA 2NYYA 4LBLA 3WUCA 5JOYA 1LOBA 1G9CA 1WUVA 4YW4A 5KXEA 4D0TA 4M3CA 4D8HA 4WZFA 4Y22B 3IPVB 1BFCA 4D0ZA 4GWNA 5LK5A 3FJAA 3VWCA 3OYWB 5DUYA 3PVNA 1I1BA 4U36A 1MACA 1W6QA 4XKIA 3WINC 4UW4A 2Y9WC 1QMJA 2G4IA 3NF3A 3WG1A 1JN2P 3FUOA 3VKNA 2EIGA 1N47A 1FWUA 4OWJA 4J2KA 3BIWE 4Y1XA 4GP3A 2WSVA 2PHUA 1W0OA 1GLHA 4EL4A 5EHAA 5JOZA 5DUVA 4XILA 4EFPA 1FGAA 2ERFA 1MS8A 2R1DA 1Q8OA 2D6PA 1H9WA 1PWAA 2IMAA 3AH1A 4Q9PA 5BXRA 1AVXB 1HWNB 5H9QA 2D24A 3N7MA 3WZ1A 1SCRA 5D63A 4UW5A 5CBLA 2AH2A 3WCSA 3CA6A 3S8JA 1A8DA 3B9CA 1SLCA 3ZXDA 1G9AA 1APNA 1Q56A 1UZYA 4OZXA 5KXCA 4KTXA 4UW3A 4XFTA 2NM1A 1IS5A 2FO1A 4Z8BA 4LBKA 4FPJA 3A07A 4Y26A 2GNMA 3K1XA 1TWMA 1CIWA 4P14A 1FNZA 2DRYA 2UWAA 4OW4A 2ZGQA 1CPMA 2ISEA 3QJ0A 5GJ6A 5GAQA 1MZ5A 4FPHA 5FREA 3SISA 4I4UA 3AKFA 4AVVA 4J1LA 4A7YA 1Z2VA 2DVFA 4II0A 1MR5A 4OUJA 5IT6A 3BRGC 1PUUB 4I8MA 1LECA 2WQZC 3AYCA 3ZXJA 2G7KA 1SR4C 2CWSA 4IQPA 3CU1B 2R49A 1BARA 3BX1C 2JD4A 3FJFA 1JYIA 3M3QA 2ISHA 1G9FA 1UMZA 4USPA 4JCKA 1UAIA 1SBFA 4BPZA 4A7KA 2JJ6A 4RL7A 2CY6A 1HLCA 2JE7A 2DTWA 2ZGMA 4GAIA 2KKIA 2HW9A 3BODA 2JKBA 1N3QA 2G7NA 4F83A 3W59A 3BAOA 3AXDA 2WRYA 5HCFA 4QD2B 2HZ9A 1W6PB 3IM5A 3CA5A 1DZQA 3PUBA 4P0JA 3FJHA 3ZC8A 4RA0A 1MD6A 4I37A 5T50A 2D7IA 3FIIA 1T3CA 1LEDA 2YXSA 2GZBA 5DVHA 4LO1C 4Q2FA 4I1BA 5BXSA 2Y9XE 4JC1A 2KM2A 1UL9A 5BVPI 2OW4A 1Q8PA 4Y1ZA 3S8KA 2A3XA 3RMXA 4NOTA 1WLWA 1KITA 3MW2A 3BAQA 4YGCA 3CRIA 3LCPA 5AVAA 1SLAA 1FAYA 3FBYA 5JMCA 5DUUA 5GLWA 3UD7A 3IKWA 1JHNA 1IKQA 2D7FA 2P23A 1AJKA 1ONAA 4EEEB 3JU9A 2ZHLA 2DUQA 3O12A 1DGLA 2VXRA 1S0LA 1Z4SA 4I4PA 2A97A 3Q9OA 2FFVA 4JP0A 3VT2A 3OBRA 3QW5A 1ISZA 3BOPA 3N7LA 2D43A 5BYNA 1E0OA 3V64A 4QKSA 2Z48A 1V6MA 3UDAA 4W65A 4PBOA 1LGBA 2D22A 1N1VA 1V6JA 5DXDA 3FJDA 4XTMA 1UX6A 1MS3A 1MS5A 3ATGA 2V5YA 3POKA 1F82A 5DUXA 1W6NA 3IM6A 5DG2A 1ISYA 4DENA 3FFZA 2ZGLA 3AZXA 4LO0C 4K1ZA 4G6JA 2LALA 1QQKA 3I8TA 1W0PA 4KEKA 2IMBA 3WDTA 4DRRA 1TWEA 3FJ9A 2A75A 2NMNA 1PC8B 1IOBA 4DPNA 3CNAA 1K5UA 4DCKC 3HR9A 4Y24A 1F31A 2ZKNA 1V6UA 5F8WA 1WBCA 2ZGPA 3QW8A 2ZACA 5JVVA 1DLLA 2D20A 1Q1UA 3UK9A 1BKZA 1J0SA 1CONA 2CTVA 1VLNA 2MC2A 5JOWA 1YO8A 1AXZA 1XHBA 1PZ8A 3C2UA 2GN3A 1C1LA 1F5FA 4USOA 3O4CA 4PQ9A 4QD2C 3M3OA 1ILR1 3ZXFA 4I96A 1LHUA 1WW5A 3NBCA 1SBEA 1LODA 4PBPA 3H6RA 1ULDA 2ZGOA 3DS9A 4HANA 1ZKXA 3WUDA 2P3JA 2D6KA 2RHPA 2R0FA 4FGFA 4OEEA 4G6MA 4C1WA 1S0FA 4R9BA 4ZJXA 3AH4A 4I30A 3ZUSA 1IOAA 4K1YA 3BTAA 1AXMA 1HIBA 1V00A 1U0AA 3IN9A 4I4SA 1DBNA 1OQ1A 4QBCA 3FJKA 4YW1A 1HDKA 1GNZA 2ZZJA 4YGBA 5F90A 4ZKTB 1HCEA 4QALA 3VEQA 3R05A 1C1FA 5D62A 4ZFUB 1CVNA 5H9RA 2JDZA 5FZZA 1GBGA 1IT0A 4YZ2A 3ZSLA 3SNMA 3SH5A 4L4IA 1JQZA 2P3IA 3FGMA 1LGCA 3L2YA 3A23A 1DQ4A 3JUUA 1YIFA 1WBLA 3AP4A 2FHRA 3HSMA 3N0KA 4XJZA 2VW1A 4CTEA 1FMZA 2ZGUA 3SITA 1FATA 4XXPA 3C8BA 3UJQA 5EYYA 3ZXLA 4J2YA 3SLIA 1G82A 2VXTI 4DQAA 2DVGA 1QXMA 1YF8B 2VLCA 2ZMNA 2NN8A 2J3PA 3OY8B 1LOFC 4L8QA 2Y9FA 3AP7A 2NP0A 3M3EA 5F9TA 4YGEA 1F9KA 3WOGA 2A70A 2UU8A 1IKPA 3AP9A 2WBCA 1Q8VA 1IS6A 4ZOTA 3O49A 2WJSA 3M2MA 3P53A 5CA6A 3WNXA 1URXA 1OFSA 4JKQA 1R8NA 1CJPA 5DUWA 1JLYA 1GV9A 2F2FA 2X2TA 4LO3C 3A0NA 2NMOA 2K4AB 2A3WA 1LGNA 1ZA4A 3BWIA 4XJAA 4X37A 2GNTA 4DS0A 2NZ9A 2A5ZA 3WHUA 2OUJA 3V65A 3OGGA 1YI7A 4P9XA 3AP5A 5BOWA 3CA3A 4LO2C 1FWVA 3T1LA 1PUMB 1BLAA 1JT5A 3Q7XA 4SLIA 4GKYA 2ENRA 4BMEA 3F1RA 2ZGTA 3VKFC 3FJBA 4M3CE 4J2XA 2BFHA 3NWKA 1ZN3A 1ZL6A 1CE7B 3IIRA 4GALA 1AJOA 4G9NA 1H30A 1DFQA 3V0BB 2Z42A 5JOXA 1UZZA 4XMAA 3ZX7A 3ZUQA 1PZ9A 4LO1A 2R0HA 1QU0A 1AVWB 2D3PA 5GZCA 3APBA 1II4A 1JLXA 2AREA 3CA4A 3WDWA 3VKOA 2VW0A 2H0BA 1NZKA 2A71A 1A78A 4FP3A 4XJUA 2EXJA 4GKXA 4Y20A 3BB2A 5GLZA 2DWRA 2GN7A 5L73A 5GZEA 1DQOA 2EXHA 1FQ9A 1Z78A 4R6UB 2D6NA 2E4MC 4FPCA 2CYFA 2DU0A 3D4KA 2PHXA 2VH9A 1LOAA 4JAWA 5FRAA 3OPZA 3U4XA 1WBAA 5F8SA 1ZKWA 4IZXA 1DQ5A 4YG6A 3H0OA 3UJ4A 3BRDA 4HEVA 2HYKA 3WCRA 3HBWA 1WD4A 2AENA 1DFCA 4XFUA 3PG0A 3NBDA 1W6OA 3MPPG 1QOOA 5EWSA 1SCSA 3RQ0A 1S0BA 1XTFA 3TAYA 4M3CB 4MYEA 2KI6B 41BIA 3ZXEA 1S0DA 4FOYA 2DYCA 1VIWB 1JW6A 1XQNA 4FPGA 5FNWA 2EXKA 1DYKA 5BQMA 1W6QB 4LBQA 5BQUC 4LO7B 4Q1PA 1BASA 1JTCA 1YYNA 3ILAA 2E7TA 3B3QE 3FJCA 1FX5A 1V6KA 2W2DA 1N1YA 1MC9A 2ZHKA 4Q8LA 3LSDA 2ISGA 4P0LA 3H6SE 1TEIA 3WO4A 2W39A 1V6OA 4WVWA 3PMEA 1LOGA 1LHVA 4IHZA 3A4UA 2L5XA 4NO4A 4YGDA 3AKIA 3AYDA 4ENDA 2TEPA 1DQ0A 4I4RA 4R9CA 4KEIA 3AKGA 2FFUA 1VAMA 3ZXGA 1BYHA 5DZUA 2D6MA 3KM5A 4YZ4A 4AGRA 3USUA 1QGLA 3FJ8A 3BAHA 4XYXA 5T5PA 1XZZA 1IRPA 3DDBA 4DEPA 1OQLB 3I29B 2D3SA 4Y1YA 4J2SA 3POSA 1AXKA 3V0AA 1NUNA 3SNVA 3WDUA 3BA4A 4P9WA 4K20A 1R8OA 3EF2A 1QNWA 2XG3A 2A6VA 4XDQA 5GZFA 3IMNA 1ULCA 1ENSA 2KH2A 4I7IA 1LU1A 1TFMB 2A6YA 3WA1A 1HWMB 4X3AA 1HKDA 1FMMS 4KC3A 4JRAA 4YFWA 3GNEA 4FVVA 4ATFA 4YM3A 1JT4A 2LIEA 4XZPA 1MS1A 5IK4A 3O44A 2DRZA 4I0YA 1QF3A 5KXDA 1SLLA 3K3QB 3CA0A 3O5SA 2PELA 3O0VA 1ONKB 2ARXA 3AZYA 1CR7A 3AJ6A 3I2XA 4KEJA 3DEBA 1DYPA 5EG6C 3ZURA 5DZGA 1R1ZA 1X50A 3B00A 3R4SA 1JY0A 2EXIA 3RSJA 4FQ4A 1XTGA 4Z8SB 1G7YA 2B7YA 2E7QA 1O4YA 5DSSB 1T4QA 3QR5A 4LO7C 1ITBA 4EB2B 3WG4A 3WDYA 3NBNA 3ENRA 2WSUA 1BFGA 2K43A 4LBQD 2V73A 5GZGA 1LCLA 3FLRA 5EYXA 4CZSA 6I1BA 4Q1RA 3BAUA 5H9SA 4D69A 2OUHA 5GLTA 3AZVA 1K5VA 2FMDA 2YUGA 3O4OA 9ILBA 2SLIA 1LHOA 2ZGNA 1RMLA 3OBTA 3FJEA 1G9BA 1DZCA 2D6OX 4GAFA 1LENA 2DVAA 3AJYA 1BZWA 2PHFA 4FPEA 4I3NA 3MW4A 4IYBA 2UWBA 1BLDA 3MW3A 2WKKA 4AGGA 1AX2A 3RTJB 3FUQA 2Q3NB 3DUIA 2M49A 2YY1A 3BONA 3HALA 1JXNA 5EC5A 2WLQA 5D61A 4XE9A 4KUFA 4R9DA 1ULEA 4Q91A 1TP0A 3WG2A 1A3KA 4P0KA 4A7ZA 3QIYA 2PHRA 2XHLA 4P6AA 2I1BA 3BOOA 3AJZA 1S0JA 3ILFA 4PF5A 3WINA 3TC2A 3PHZA 1N1SA 3D5OA 1G86A 2EAKA 1W6NB 3DSEA 4OEFA 4JPZA 1EYLA 4UW6A 4XXAA 1GZWA 3PVOA 1D2SA 1Y7BA 3MEPA 4XTPA 1PZZA 2IMCA 2D3RA 2DTYA 1CESA 2C5DA 3RMYA 4XJ8A 3OJVA 3HMYA 1ENQA 1E1HA 5B2HA 3KMVA 1GZ9A 1LHNA 1GZCA 1KJLA 3B9UA 1BXHA 1LOCA 2E53A 3ZSMA 2CNAA 3AYAA 3ZSKA 3AZZA 2KLLA 4FP2A 2KI4A 3LLPA 2VW2A 4Q26A 2GNDA 2Q9XA 2EALA 2EF6A 3T8SA 4QKRA 1N1TA 2UWCA 2MLLB 3NJ5A 1WBFA 3RG0A 5KXBA 3B69A 4LBJA 1KRIA 4BM8A 4WVVA 1M2TB 3AX4A 3N7KA 3ZYRA 2GMEA 1LESA 1CPNA 3WVJA 2ZHNA 3H6RB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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