2NZTA

Crystal structure of human hexokinase ii
Total Genus 340
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
340
sequence length
897
structure length
871
Chain Sequence
b'DQVQKVDQYLYHMRLSDETLLEISKRFRKEMEKGLGATTHPTAAVKMLPTFVRSTPDGTEHGEFLALDLGGTNFRVLWVKVVEMENQIYAIPEDIMRGSGTQLFDHIAECLANFMDKLQIKDKKLPLGFTFSFPCHQTKLDESFLVSWTKGFKSSGVEGRDVVALIRKAIQRRGDFDIDIVAVVNDTVGTMMTCGYDDHNCEIGLIVGTGSNACYMEEMRHIDMVEGDEGRMCINMEWGAFGDDGSLNDIRTEFDQEIDMGSLNPGKQLFEKMISGMYMGELVRLILVKMAKEELLFGGKLSPELLNTGRFETKDISDIEGEKDGIRKAREVLMRLGLDPTQEDCVATHRICQIVSTRSASLCAATLAAVLQRIKENKGEERLRSTIGVDGSVYKKHPHFAKRLHKTVRRLVPGCDVRFLRSEDGSGKGAAMVTAVAYRLADQHRARQKTLEHLQLSHDQLLEVKRRMKVEMERGLSKETHASAPVKMLPTYVCGDFLALDLGGTNFRVLLVRVRGVEMHNKIYAIPQEVMHGTGDELFDHIVQCIADFLEYMGMSLPLGFTFSFPCQQNSLDESILLKWTKGFKASGCEGEDVVTLLKEAIHRRDLDVVAVVNDTVGTMMTCGFEDPHCEVGLIVGTGSNACYMEEMRNVELVEGEEGRMCVNMEWGAFGDNGCLDDFRTEFDVAVDELSLNPGKQRFEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKRGLLFRGRISERLKTRGIFETKFLSQIESDCLALLQVRAILQHLGLESTCDDSIIVKEVCTVVARRAAQLCGAGMAAVVDRIRENRGLDALKVTVGVDGTLYKLHPHFAKVMHETVKDLAPKCDVSFLQSEDGSGKGAALITAVACRIRE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of human hexokinase II
rcsb
molecule keywords Hexokinase-2
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 340
structure length 871
sequence length 897
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nztA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nztA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 2nztA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 2nztA03
5AFUA 2HF4A 5BPNA 2D1KA 2A41A 2IVOA 3U8XA 3WXLA 4GNIA 2ASOA 4JHDB 1D4XA 2PAVA 4ISFA 1YXQA 1NGDA 4H0XB 3B8AX 3VGMA 3VERA 3VEZA 5AFUH 4K25A 4PKIA 3J8AA 5KQ8A 1IG8A 1NGGA 4BR9A 4BR0A 2FSKA 3ZETB 2GWJA 3ZEUB 3UKUA 2V7YA 4KBOA 3DXMA 1NBWA 3L4IA 3FZFA 4FWRA 3WXIA 2D0OA 2F9TA 4O5FA 5AQZA 3SK3A 1NGFA 5EOYA 3EN9A 3G25A 3C7NB 1S3XA 5KPRA 4I6MB 2FXUA 2HMPA 4Y0WA 2Q2RA 2YHXA 4H0VB 1NWKA 3O8MA 1BDGA 3CJBA 4CJ7A 4BRGA 3GBTA 4YDUC 3UKRB 3OHRA 5F0XA 2P9NA 3VENA 3VF2A 2F9WA 4FOEA 4CZIA 3ENHA 3WEEB 5AQTA 4CZHA 2A5XA 4BRDA 1TUYA 3VGLA 3CQYA 4F9OA 1RDWX 2V7ZA 4FO0A 3SJHA 1ATNA 3FZKA 3MN9A 3FFKB 3VOVA 3QFPA 4B1VA 1TUUA 1NGIA 1WOQA 1HX1A 2FF6A 4B1YB 2YHWA 3AAPA 3MN7A 4MLHA 5B8HA 4CD3A 3F9MA 4M63C 5FPEA 3W0LA 3DXKB 3ULEA 3MMVA 3CQXA 3KVGA 3SMSA 2A42A 2P9KB 4JN4A 2QWMA 1K8KB 4CBUA 2NZTA 3VEXA 4CBXA 3WXKA 1ESVA 1BU6O 2HF3A 3A5NC 3A5OC 4H5NA 4XH5A 4B1ZA 4WQ5C 1G99A 2P9LB 2GELA 4HTLA 1X3MA 5AQYA 1XQSC 4XH4A 5BPMA 5LJVA 5BN8A 3H3NO 3ZX0A 3R6MA 1NGBA 4BRKA 1V4SA 1GLDG 4CZKA 5CE3A 2CGKA 1RGIA 2ASPA 2QWRA 2P9UA 2A40A 1P8ZA 2P9PB 3U4LA 1BA1A 2E88A 2OANA 4DQ8A 2BUPA 3RSEA 3IMXA 4K42A 3C0BA 2P9IA 3R8EA 1QQOA 4WQ5A 5AQKA 1NGEA 1GLCG 3O80A 4M7XA 3ZX2A 2ASMA 2IVPA 3IUCA 4BRQA 4IJAA 1MA9B 1MWMA 3LDQA 2QWOA 4EIAA 5AZJA 5BPLA 4B1XB 1U2VB 3O6WA 5AQFA 1TYQB 1QZ6A 1Q18A 4AM6A 2V52B 5EX5A 2E8AA 4GY2B 3QMLA 3FGUA 3LM9A 1BUPA 4MO4A 5BN9A 5JLFA 3U9ZA 2QM1A 4IZ9A 4J8FA 1QHAA 1XC3A 4BR4A 5AQPA 3VETA 1Y64A 3WQUA 3H45C 3A5LC 3DJCA 1S22A 4FWLA 1QQNA 4WQ4C 3W3DA 3CJCA 3LDOA 3O08A 4A2AA 4QS7A 5TKYA 1HUXA 1MDUB 5BRFA 1NGJA 1QZ5A 4BG8A 2IIRA 4H5TA 1YAGA 2KHOA 1ATRA 4B1UB 3EO3A 1JCEA 1BOTO 1E4GT 5E26A 4C23A 3GE1A 1SAZA 4H5VA 3IFRA 5AQQA 2VYPA 3DWLA 4PKHA 3H3OB 3GDQA 2QWQA 4CZLA 3VEYA 1HJOA 1E4FT 2DPNA 2QW9A 4CD1A 3GOIA 4IXCA 5AQSA 3M1FA 4QS8A 3A5MC 5AQRA 4EHTA 4CBWA 4EHUA 5ADXA 3EL2A 4JHDA 5FPNA 2YI1A 2QWLA 1Z6RA 5AZIB 5LJWA 4BGAA 3BF3A 5JLHA 1U6ZA 5JICA 4IJNA 4WYBA 4BGBA 4XH1A 2Q0UA 5EVZA 5E84A 4FSVA 5LY3A 5ADXH 5F2RA 4JD2B 1BO5O 2E1YA 1DEJA 3ZETA 1IJJA 4BRAA 1MWKA 3ZEUA 4XEIA 3WXJA 3HBTA 5FPDA 2W40A 1BA0A 2H3GX 3ID8A 3D2EB 3UB5A 4JAXA 4BRIA 2CGJA 4DHYA 1HPMA 4YDUA 5F1XA 4BC3A 4BVOA 4BQZA 4H0TB 2W41A 3O1BA 3C7NA 5EY4A 2GTDA 3FZMA 2Q31A 4I6MA 3UE5A 4H0YB 2UYTA 2ITMA 3HSCA 4HWIA 3UKRA 3KHYA 1GLLO 3A8YA 1KAYA 1HKBA 2GWKA 4BC2A 4ISEA 2PBDA 2E2PA 3IDHA 3WEEA 3I33A 2FF3B 1X3NA 3BP8A 2P9UB 4H5WA 3M3ZA 3O5BA 4FWSA 2E2NA 2CH6A 2E1ZA 2HOEA 1ZC6A 4DCHA 4L3QA 1HLUA 1SQKA 1XUPO 2QXLA 4H03B 3MN5A 3JXUA 4BR7A 5BR9A 4MLEA 2Q1NA 2EWSA 1WUAA 3QBWA 3L0QA 1DKGD 2Q36A 4BREA 3FZHA 4RCHA 3DXKA 4CZEA 3FZLA 3LDNA 3CETA 2ZGYA 3H1QA 2BTFA 3HTVA 3L6QA 2P9SA 1X9JA 1T6DA 5I9EB 3HI0A 2P9KA 3GG4A 1K8KA 5FPMA 2Q97A 4IWVA 2AA4A 4BR2A 4CZJA 3LDPA 2ZWHA 2IVNA 3UKUB 4BQLA 3DXMB 4EFHA 2P9LA 1RFQA 2NRHA 3CJ9A 4FPBA 1EQYA 3QBXA 3ATUA 3D2FA 5AQJA 3HZ6A 1GLFO 4NO7A 5KPTA 2FSNA 1HKGA 3BEXA 2QWNA 4FL9A 1KXPA 2P9PA 4H0OA 1NM1A 1YVNA 5AQHA 5AQXA 4BR5A 3LL3A 4BRCA 2NLXA 3CHWA 3ZX3A 2Q0RA 4A62A 4CZFA 2P9NB 4IO8A 3VGKA 3MCPA 1U2VA 4B1WB 4WQ4A 1LCUA 1TYQA 1T6CA 2AP1A 3S41A 1DGKN 4B9QA 1C0FA 2GUPA 4JNEA 4O8KA 2CH5A 1J6ZA 4QS9A 2A6AA 2VWBA 3EKSA 4BRFA 1SZ2A 1OKJA 3DAWA 3CI5A 4NB4A 3FE1A 4FWKA 4LC9B 3VEWA 3CJAA 2E20A 4ISGA 3WT0A 3AY9A 1QQMA 3QDKA 3A0IX 1HKCA 5KPZA 5JMVA 4FWQA 4PL7A 2E2OA 2YHYA 3KZBA 3ULEB 1JCGA 3SMPA 4BRLA 2E2QA 3LM2A 3H1VX 3GL1A 2YCHA 1GLAG 1KAZA 1ZBSA 5AQLA 1V4TA 1BG3A 3MK6A 4PL8A 3VF6A 3VPZA 4RWTA 3TPQA 5AQMA 1NGAA 2YJEA 3FR0A 4FWPA 4BC5A 3TU5A 3I8BA 5EXWA 4AM7A 3QB0A 2GEMA 3AARA 4BRMA 3M6GA 5AZIA 4CI6A 4FWOA 4BRNA 4H5RA 3AAQA 2V51B 3EZWA 3HM8A 1T44A 2I7PA 4FWNA 4K43A 4Z94A 2ZF5O 3CJ1A 1ZXOA 4EAHD 4JD2A 4A61A 1R59O 4FPAA 4M7YA 4CZMA 1YUWA 3D7EO 1Z05A 3RSEB 2VCPA 1H1VA 3JS6A 2P9IB 3D2EA 3R9PA 5AQNA 3VF4A 4CZGA 5BRDA 3O4WA 4A2BA 3VEVA 5BREA 1NGCA 4MO5A 2QWPA 3WQTA 4BRHA 3BUZB 1BWFO 2P9SB 5KQDA 1NLVA 2I7NA 1KAXA 5AR0A 1GLEG 5AZJB 5AQVA 3ENOA 5AQWA 4E1JA 1LOTB 2A3ZA 3CIPA 4BVPA 3QICA 5AQGA 3QFUA 3LDLA 3CERA 3SLCA 1GLBG 5BRHA 5AQUA 3CJ7A 5AQIA 3O1WA 3P4IA 1C0GA 2D4WA 3WUHA 3D2FB 4BC4A 2CGLA 4PKGA 4K41A 3EKUA 4FOIA 2FLOA 5ELZA 1GLJO 4BRPA 2D0PA 2J4RA 4DB3A 1NGHA 1ATSA 3VESA 4H0PA 3H6EA 4BROA 3BF1A 4RTFD 3VEOA 4FWMA 2FSJA 3U9DA 1NMDA 5AQOA 3MDQA 1JCFA 2WUSA 3FLCO 2ZGZA 1CZAN 3ATVA 2YJFA 4BG9A 3MN6A 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B8CA 3S3MA 4CESA 2D1KA 3WXLA 1UA0A 4FJ9A 2ASOA 4JHDB 1D4XA 3KK3A 2YNHA 3J8AA 1T05A 1KCFA 4Y1DA 1TKXA 3VQ9A 4KREA 4KBOA 1NBWA 3ZT0A 2QKBA 2JWLA 4FWRA 3OYHA 3WXIA 4DLGA 2D0OA 1U04A 4O5FA 4PHTX 3QEPA 5AQZA 3ISNC 3SK3A 2HHQA 3ASMA 3G25A 4KAZA 1S3XA 5KPRA 4J2EA 2FXUA 1NJWA 3CD6N 1N6QA 2YHXA 1S9GA 4CJ7A 3QESA 3GBTA 3UKRB 5F0XA 1S6PA 3T1YK 1FKOA 1J54A 3OYMA 3MWTA 4X66K 4AHUA 1FK9A 2F8TA 4DFJA 4F9OA 4AHRA 1ATNA 3FZKA 5TKWA 3CMAN 3LAKA 5KTQA 4GKJK 1NGIA 1SL1A 1UOCA 4M63C 5LMUK 5FPEA 3W0LA 3NVKA 4DR6K 3ULEA 2FBVA 4B9MA 3E9OA 2HVHA 4Z4FA 2P9KB 4JN4A 1XC9A 3THXB 1K8KB 2VWKA 3OYCA 3VEXA 4CBXA 2RKIA 4CGGA 3KK2A 3CCSN 1BU6O 4DS4A 4B1ZA 1QTMA 1G99A 3NE6A 3LP0A 2GELA 4XH4A 1VQ7N 4CJ3A 4NYFA 4M3TA 3EYZA 1L3VA 3L3UA 2NRXA 1X9WA 3TAFA 4DSLA 4CK3A 3KLHA 4DU4A 1BCMA 3HP6A 5JVGL 5HRNA 4KH4A 3THWB 1K6YA 1SUQA 4KHQA 2HSTA 4BY9C 4DQ8A 1BCOA 3K0SA 4JI0K 2YNIA 5GIPA 3R8EA 1QQOA 2ASMA 2IVPA 3IUCA 4BRQA 1MA9B 1MWMA 2NRVA 4ID1A 2P51A 3LDQA 3IS9A 4B8AB 2QWOA 4EIAA 5AZJA 5BPLA 4E7HA 3TAEA 4B1XB 3G4SN 1U2VB 5AQFA 4CFBA 1TYQB 4LD0A 4AM6A 1QVGM 2O8DA 5JLFA 4YOVA 3K57A 1Q86O 4IZ9A 4DR2K 4BR4A 3NMUA 1Y64A 4FXDA 4A5BA 3KLFA 3A5LC 4AILC 1S22A 4CGHA 3P38A 4A2AA 3HPGA 3ZT2A 5TKYA 2XY7A 5BRFA 1TL3A 4BG8A 3RRHA 3L2VA 1RT5A 4E1MA 2KHOA 1JCEA 3KJVA 3ZT4A 4KFBA 4C23A 2IC3A 1SAZA 3MEDA 4CF2A 4GVMA 3HVRA 1NK4A 3V1RA 1XHXA 1HQEA 3LALA 5C25A 4Z4IA 2QW9A 3AVMA 2YKNA 1Q8IA 3SCXA 3ZSRA 3KD5E 2B5JA 4DTJA 2QWLA 5GAGP 1Z6RA 4NLBA 4O44A 1L3SA 1U45A 4BGAA 3SV4A 3CCLN 4E0DA 2YHBA 3BF3A 4IJNA 5KRSA 3ID6A 3OYDA 4NCAA 1EWQA 5AJ3K 3JYTA 4DSFA 4IO9L 4FJIA 3ZETA 4IG3A 5K14A 3WXJA 3V81A 3OYKA 3ID8A 3UB5A 3D2EB 2CGJA 1YI2N 3QIOA 4AHCA 1EX4A 3O9QA 1ZBLA 2Q3SA 1K73O 4DTSA 3LP1A 2D0CA 2Y1IA 3C7NA 4IFYA 2GTDA 4IOCL 2Q31A 4I6MA 4JKAA 3UE5A 4H0YB 1SKWA 3RR8A 1HNXK 1TKZA 2VGMA 1TK5A 3BY5A 4B3MK 3A8YA 1KAYA 4ICLA 4DS5A 4F8RA 1WSIA 4BC2A 1VSDA 2XHBA 1WSHA 2PBDA 1TAQA 1P90A 4YNQA 1XI1A 3WEEA 3PIOL 2FBTA 4IG0A 1X3NA 3TSPA 4K8XA 1IKWA 4H5WA 4FZXC 4Y1CA 3LPUA 3RR7A 3NF9A 2E1ZA 3ZSOA 1RBSA 2ZQBA 3OBYA 1XUPO 1YF5L 5SWMA 3R1XA 3JXUA 5H1SQ 1NK0A 4C1NK 4WF9L 4JKCA 3O9UA 1VQ4N 3CCMN 3NAEA 3L0QA 1DKGD 3PSFA 4RCHA 4CJKA 5C0YA 2WTUA 3MX5A 3CETA 3H1QA 3HVTA 1BIZA 5M1QA 1X9JA 2VG7A 3NGZA 3LWLA 3CCJN 3TI0A 3GG4A 2Q97A 4BR2A 2O8FA 3LDPA 2ZWHA 1T8EA 2IVNA 4JI8K 2FBXA 3D45A 2YKMA 2PFUA 1U47A 2P9LA 4FJ5A 3KKRA 2OPRA 3SV3A 2XY6A 1Q81O 3Q7CA 1FJGK 2OZSA 3I0RA 4I2QA 1RBRA 4NO7A 3OW2M 3ZYYX 3ENBA 4FL9A 3BGRA 4KHWA 5AQHA 3OS2A 3LL3A 4BE1A 1L3TA 3ZX3A 3N4QA 4CHZA 4A62A 4CERA 4IEIA 5FRMA 2BE2A 3O4NA 1LCUA 2AP1A 3SQ0A 1DGKN 4B9QA 1GOAA 1XWLA 1RBTA 4FM2A 3O9RA 1ZBUA 5HRRA 3QEWA 2VWBA 4FJMA 5JVHL 3DAWA 3HOTA 4FWKA 3ZSYA 3OJUA 2E20A 1QQMA 1KD1O 4CGJA 1HKCA 3G71N 2NNWA 1D9FA 5JMVA 2I5JA 2E2OA 4ELTA 1JCGA 3OYNA 4WE1A 4BACA 1C1AA 3LM2A 3H1VX 1HNZK 1VQMN 3CC2N 1NK5A 3MK6A 4DG1A 3VPZA 4AQYK 4DR1K 1QSYA 4BDPA 3G6EN 3K9KA 4JRQA 2YJEA 4RW8A 2HHXA 5EXWA 4AM7A 3QB0A 3OYAA 3PV8A 3AARA 3BZKA 3D6RA 4BRMA 3M6GA 4DSJA 1LW0A 3QETA 4BRNA 3AAQA 2V51B 1MU2A 4FWNA 4K43A 3S3OA 3SQ2A 3P83D 4JD2A 1R59O 1TVRA 4MDBA 1YUWA 1K8AO 4YHHK 3JS6A 5AQNA 4DU3A 5BREA 4MO5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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