2O3PA

Crystal structure of pim1 with quercetin
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Characterization of a potent and selective small-molecule inhibitor of the PIM1 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-12-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2o3pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2o3pA01
3PVGA 2R3HA 3GXLA 3HP5A 4M69B 2QOBA 3MW1A 4U81A 2R9SA 5H2UA 4BDCA 4DGGA 1OBDA 4H05A 3GOKA 3BLHA 4GVAA 2CLXA 4L42A 4N0SA 4W9WA 4MHAA 2JIUA 2WTIA 1UNLA 1IEPA 3OCGA 4YJSA 4QO9A 3UOLA 2PTKA 4EHVA 1G8SA 4D4RA 4WOVA 3UPXA 1OIRA 5C4LA 1NVSA 1WAKA 2BIYA 2Q0BA 5CF5A 3UIMA 4PP9A 4YZMA 1SM2A 2IO6A 1M14A 3RJCA 5CYIA 3VBQA 3G6GA 2OFUA 1ZMUA 4HGSA 3L9LA 3HUBA 5DNRA 4UMQA 3VN9A 4BICA 4CG9A 3OXIA 1M2PA 3EWHA 3ZEPA 1ZYSA 3PSDA 4HPTE 5K0XA 3AGLA 3FWQA 3HMOA 3DFAA 2PUUA 3EN5A 2VAGA 2WEVA 1APME 5FXQA 2EU9A 5FD2A 5J8IA 3MYGA 3KEXA 3FYKX 4PMPA 5A46A 2NNWB 2C6LA 4ZJVA 4CNHA 3V04A 2X2MA 5EOBA 4DGLC 5CVFA 4RPVA 2YDKA 4W4VA 4IZ5A 1MUOA 2OXDA 3DB8A 4F7NA 3DBQA 3GQLA 4IJPA 5EDQA 3FMMA 2PVLA 3R04A 4G9CA 2HK5A 5TO8A 3IW8A 5JK3A 4IM2A 5IDNA 3FZTA 3UG1A 2QCSA 1FVTA 4MWHA 5HLPA 4L7FA 3QQKA 4FL2A 1RJBA 4EOKA 2IG7A 3Q5ZA 1U59A 3GI3A 1FBNA 3TL8A 2GCDA 1V0BA 2GNFA 4BTJA 1J1BA 4W9XA 4ZTQA 4ZY6A 2WXVA 4X3FA 2OJFE 1KV1A 2UZUE 4JLCA 3JVSA 5HTIA 2XJ1A 2OJGA 3F5UA 1GAGA 4IM0A 2J0MB 1J3HA 3QKMA 4QMMA 4FSWA 4ZXTA 3TNQB 5DEWA 4C33A 5CEMA 2XA4A 1OVEA 3PA4A 4NJDA 4RIYB 3WZDA 3QUPA 4DGMA 5CEKA 4PQNA 3SG8A 3JY9A 5HVJA 1KUTA 4J8MA 5HGIA 1OPLA 1H1PA 3BKBA 3ZHPC 2JFMA 5EFQA 5C27A 4XG2A 5IH4A 4O7TA 1LPUA 4BBFA 3UVQA 4HVIA 4J71A 2EUFB 2QU5A 3DU8A 4NCTA 4YLLA 4BWPA 4DTBA 2YLFA 4G31A 4GMYA 4I24A 3A7HA 4NYEA 3F7WA 2R3RA 3NZ0A 3EL8A 4U41A 2PZRA 4CEGA 2XKCA 3KVXA 2VWUA 4O86A 4R7IA 2WQOA 4BB4A 4QTBA 3WZJA 3FJQE 5IA4A 5DLSA 2C5XA 4FI1A 4WRSA 5DBXA 4GRBA 2QLQA 3EQFA 2VGOA 1J7LA 3AMAA 3KMWA 3ZZEA 5EM5A 3KN5A 1RDQE 2OO8X 1AGWA 3KA0A 4PRJA 5J95A 2E9PA 2WTVA 2O3PA 5HVKA 1A9UA 5DI1A 1L8TA 4FTRA 1ZRZA 4AGCA 2C6OA 3WILA 3HA8A 3LMGA 5IQBA 5AP4A 3FMHA 3CQEA 4DH7A 3O23A 2XNBA 1DI8A 4BCPA 1WZYA 4F7SA 4FIEA 2WMUA 5HO6A 5FQDC 4JI9A 2PK9A 4MNEB 3PSCA 4FV0A 5E92A 1OPJA 4RGJA 5GHVA 1IAHA 3CIKA 4XV1A 4AXAA 2GS7A 3F6XA 5BMSA 2P0CA 3ZLWA 1OZ1A 4L45A 4O7ZA 3VAPA 4BIEA 4ZY4A 3FSFA 4FIJA 4CKIA 4GG5A 3L8VA 5AR8A 3I6WA 3QTIA 4CTCA 3LMHA 4RJ5A 2XIRA 3E7VA 4IANA 3AXWA 2OI4X 4XG4A 3OWLA 5GIPE 5ITAA 3UVRA 3HV7A 4GFGA 3HX4A 4ANOA 2BRHA 3UNJA 3H4JA 3C4EA 4OR5A 5J1WA 3D5WA 4ZJJA 4O83A 4J98A 4M84A 3RBWA 2C68A 3RK9A 4GIHA 5HBHA 4C3RA 5ANEA 2YM5A 4CZYB 1NW1A 3QWJA 3AMYA 2JC6A 1Q3WA 3QYZA 4I92A 4IAYA 5E8WA 3RPYA 3EYHA 3U51A 4ANMA 5BUEA 1YWNA 4FIHA 5DPVA 3VVHA 3VUIA 2PYWA 2I7QA 4O0VA 2P55A 4RIOA 2PVMA 3ZLXA 4XRLA 1PYEA 4AT4A 3G51A 2BTSA 2A4LA 4DHFA 1YXXA 2J0KA 2O2UA 3AC4A 2CDZA 4AP7A 3HA6A 5A4QA 5IMEA 4HOKA 4RIYA 3KXNA 5HLNA 3Q96A 4JX7A 4S32A 2WTDA 3KF7A 1IA9A 2WOTA 4V0GA 4IVCA 4E8AA 1R39A 3MBLA 4FEXA 3FZSA 5A6NA 3R63A 4GYGA 2W96B 4E20A 5F4NA 5C8MA 4LL0A 4MXCA 3RZFA 2XNOA 3SG9A 2VU3A 1Z5MA 4RJ7A 3UQCA 2ITOA 5M06A 2YIXA 5DR2A 2HWPA 4E3CA 2OIDA 2PVHA 5A54A 3HMPA 5JQ8A 3R1NA 2W9ZB 4JDIA 5AAFA 3QXPA 4Z55A 5HO8A 3IOPA 4FF8A 3G0EA 4QPSA 1XQZA 3BWJA 5LMKA 3A61A 2Z7QA 3AC8A 1OECA 3LFCA 4QQ5A 4L01A 4RA5A 2R64A 4OTIA 3UP2A 3PY3A 2RGPA 4QMXA 1Z9XA 4R3CA 4R78A 3TTJA 4D2WA 2UW3A 4BDJA 2FUMA 2RF9A 2VTIA 4FUXA 5L8LA 1XHAA 2XYNA 1RW8A 5DIAA 5EYCA 3V8TA 4DCEA 4EH4A 3CEKA 4ENXA 2OF4A 3EFJA 5CTPA 3D83A 2BDWA 4PDOA 4CMOA 1CKJA 1KV2A 2VV9A 4RQKA 3I0QA 5HG8A 2RFSA 2YM8A 3V8SA 4F4PA 3K5VA 3TXOA 2BHHA 3FXZA 1FMKA 3VBXA 1YWRA 3GCQA 3ZDUA 4YPDA 4MNEA 2IW8A 4AN9A 3GB2A 2IPXA 3IDBA 4D55A 3ERKA 4HZSA 4UYNA 3W2RA 1BI7A 5JFWA 4OT6A 5HCZA 3NYXA 3PJ1A 2H8HA 2OIQA 3BBTB 3OXZA 3UZPA 3NUAA 5L6PA 2A1AB 2WQBA 2I40A 3L8PA 3TZ8A 5M53A 3L1SA 5H8EA 4A07A 5A4LA 3FPMA 1GIHA 2VO0A 4KS7A 4YC6A 4GL9A 4WIHA 4PY1A 4OW8A 5HQ0A 1YRPA 4F9AA 2JBOA 3PE1A 3PXYA 3RM7A 3PDTA 1OMWA 2GHGA 2B55A 4V05A 3WYYA 4RWLA 3MH3A 5ANIA 3EN4A 3O50A 1SVGA 3DGKA 2X7GA 3P1AA 3P23A 3F88A 3G9NA 4IW0A 3GEQA 5HI2A 3OOGA 1IR3A 4EOLA 2ETKA 1YI4A 2J50A 4XG7A 2HELA 3MY0A 3MFSA 4XH6A 3LJ1A 4MTAA 4F09A 2X8DA 5KMKA 2HZ4A 5DT4A 2IZTA 2B9HA 3O8UA 4FKJA 4X2FA 1WMKA 2F7ZE 3L8XA 4RVMA 4CLIA 4NM7A 3K5UA 3TIZA 3TNHA 3D14A 2R3LA 2X6DA 1ZZ2A 2WO6A 2J9MA 2W1HA 3UMXA 3OEZA 2ITQA 4ACCA 1SNUA 4D5HA 2IVVA 3BYVA 3CR0A 5LMBA 3ALOA 4GT4A 3F2NA 1Y6AA 2PE0A 4O91A 5AX3A 4NKSA 4RX8A 5M4FA 1PKGA 2HW7A 1XH8A 5DGZA 3HGKA 3R7UA 3R22A 4YBJA 3A8WA 4ITHA 3U55A 2XKEA 3HDMA 2ZMDA 2W1FA 2J0LA 1HCLA 4I6HA 4BBEA 3OC1A 2YEXA 4AW0A 5CT7A 4O0WA 2Z7SA 1S9JA 3DFCB 4JT3A 3VO3A 4PMSA 4ACGA 2YITA 1GIIA 3SC1A 4CG8A 4A4XA 2Y8OA 2YCSA 4MQ2A 2WTKB 5BUJA 4MWIA 3V5LA 2QD9A 3QTZA 3PJ8A 3Q5IA 4IADA 3V5WA 4BC6A 4E6CA 3NR9A 3NX8A 4IVAA 2F7XE 2R4BA 4P4CA 4RFYA 2PVJA 5M4CA 3AOXA 3PA3A 3ZFYA 4UZHA 4AA0A 2VTNA 1KE6A 3R8PA 4B6LA 2WIPA 3EFLA 4CYIA 5M4UA 1PRYA 2VWXA 5LMAA 5HNGA 5LJJA 3QTQA 2VWZA 4IB5A 3D5UA 4G3CA 4U45A 5E8SA 4BN1A 1P4OA 2QURA 3IW5A 4TYJA 3WF8A 4DG3E 4C4GA 2F57A 5FP5A 2B53A 5HVYA 2XMYA 3UNKA 3LCDA 5AM7A 2W7XA 4MD7E 4QNAA 3TTIA 4O96A 2XK3A 4NWMA 4JX3A 4S34A 3ENMA 3EQHA 2NRYA 4FICA 3ELJA 3H30A 4YJOA 5HE3A 5M4IA 1PXJA 1WVWA 4F0FA 3VW8A 4S2ZA 3ZRLA 4FT3A 4GT3A 3D2IA 4TT7A 4KABA 1ZXEA 3S95A 2SRCA 2UZNA 5EM8A 4KIKB 1OGUA 5FG8A 5T68A 4CRSA 2CLQA 5FBNC 2Y4PA 2PU8A 4IFGA 4Q5HA 2YERA 3W2OA 1AD5A 1YI6A 2B54A 4P5ZA 4WO5A 4JBOA 4LGDA 2AC5A 5HCYA 3ROYA 4IM3A 1OI9A 2W1DA 4Q9SA 5BVFA 3FUPA 3M1SA 4I5HA 1DAWA 2OGVA 4JBPA 3TJCA 2XM8A 3COHA 3G33A 3RVGA 4ASEA 4BCMA 1WVYA 5CAUA 5G6VA 2W06A 3AD6A 4FTMA 4XX9A 4YZNA 4BVUA 4BI0A 5KNJA 5AUZA 4AOJA 4WNMA 4NT4A 2HZNA 3GCPA 4PTCA 3LXNA 3B8RA 5KMLA 1H25A 1PXOA 1URWA 1WFCA 2WMBA 2BDFA 3FV8A 5DEYA 3FSKA 4EZ7A 5I9XA 2XJ0A 3V8WA 3BYUA 2PSQA 5B2KA 3FXWA 4PPBA 2QOHA 3CGFA 4FG9A 4E26A 1H24A 4K33A 4F7JA 5K9IA 4YGAA 4YTCA 3CC6A 2JIVA 4C4HA 1H1QA 4O81A 4ZSGA 3DK3A 4XEYA 2Y0AA 4AE6A 3W33A 4HYHA 3RCJA 3ITZA 5IA1A 3S0OA 4ORKA 4DT8A 4YZBA 5J1VA 5DHJA 2X39A 3OXTA 4MNFA 4YLJA 3FPQA 3BV3A 3MVHA 1JSVA 2ITPA 4KUJA 1PW2A 2Z7LA 3LFFA 3NNVA 5FEDA 4E93A 3FEGA 3LXKA 2XBJA 2QI8A 4XV2A 3K54A 2VWYA 3EQGA 2XK8A 4XV3A 1FINA 4U7ZA 3R7OA 3UG2A 2WU6A 1YDTE 4DFXE 5AA8A 2WMVA 2YIRA 4BDAA 3VJNA 1ZY4A 3DPKA 2WNTA 3F69A 2UV2A 1NA7A 1H01A 3QRJA 3TDVA 3SQQA 4JVGA 3A4OX 3QQHA 3R0TA 5KCVA 4AX8A 3FLNC 4FKOA 3U8WA 5FWKK 4D0WA 3EIDA 3EZRA 1STCE 3LFSA 5JSMA 4FTIA 3VUHA 1G3NA 2WQNA 4X21A 5J9ZA 2LGCA 3DAJA 5AR3A 4CFXA 4E73A 4JQ7A 2BRGA 3QRKA 5HNBA 4C2WA 3ZXTA 3CE3A 4IE9A 4RMZA 5GJGA 4IIRA 3FMEA 4CD0A 2HW6A 3DK6A 4Y5QA 2GHLA 3FAAA 3LHJA 4O7LA 4HGLA 2YABA 4U9AA 5K3YA 2C3KA 4N4SA 4WNPA 2ZAZA 4EKKA 4ZOGA 3UDBA 4XOYA 4QTAA 1ZYDA 3C0HA 1TKIA 1OM1A 2WQEA 1PMEA 4ASZA 3BHTA 2WGJA 1MRVA 3DJ6A 2W1EA 4KKEA 2B9JA 3DV3A 4RIXB 4E6QA 3DS6A 3QLGA 4U79A 2XRWA 3CKWA 3EKKA 1I44A 2V55A 2VTAA 5HOAA 2P33A 2PUPA 3GU8A 2C3LA 2UVXA 4KAOA 2QHNA 5CXHA 5HD7A 1R3CA 3QD4A 3UJGA 4RBLA 5KBRA 3PLAE 5TKDA 3HV6A 3CJGA 2W4OA 4G1WA 4S33A 5EI6A 4J99A 5FTQA 3W8QA 5JRQA 5JGDA 4DH1A 4XMOA 4DAWA 3QZHA 4RX9A 3ZFMA 3G15A 5HG5A 4QMTA 3HV3A 3PPJA 3ZRKA 5IEVA 2EWAA 2PL0A 3VS3A 4HYSA 2WELA 2J5FA 1ATPE 3FHRA 4FTQA 4WHZA 4X6QC 4YZCA 5DRBA 5JRSA 5A4TA 3RNYA 3V51A 4R77A 4O0YA 5C03A 3NIEA 3VUTA 3FZPA 4O1OA 3O7LB 1JPAA 3KF4A 2RFNA 3TWJA 3WE8A 3BEGA 4LOQA 3CP9A 3WARA 1E9HA 3A7GA 5JKGA 4KSQA 5CEPA 2PVYA 4AZFA 2XCKA 4ZEGA 2P3GX 2PVFA 4G6LA 2VNYA 5KMOA 2ACXA 1K3AA 3GQIA 2P4IA 4C35A 4FMQA 4IAAA 4BDIA 2QG7A 1U46A 5AR2A 4MD9E 4EJ7A 5IA3A 5CU2A 1ZZLA 5K0KA 3VBVA 4DG0E 3CD8A 4FKWA 4IAZA 4PUZA 2BUJA 5AUXA 3Q2MA 3PIZA 4ACMA 3GU4A 2UW4A 3TEIA 5AIRA 3EZVA 4Z3VA 1NVRA 4EYJA 3DLSA 3TG1A 4LI5A 4ZTRA 4K9YA 5LCKA 2YJSA 4X3JA 1JWHA 5ANGA 4DLJA 4IZ7A 2OH0E 2CJMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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