The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of manganese- and cobalt-substituted myoglobin in complex with NO and nitrite reveal unusual ligand conformations.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
61
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NI0 A; 2BNL A; 3PEL B; 5CNG A; 1J7W A; 2MYA A; 2VYY A; 3PT8 B; 2ZLU B; 2ZS1 D; 111M A; 1S0H B; 1CO8 A; 1MOC A; 2D2M D; 1LH1 A; 1MYJ A; 1MBS A; 3A2G A; 1T1N A; 4MAX A; 1YZI B; 3OVU C; 3UHW A; 101M A; 5ILR A; 4IRO A; 1IRC A; 1DTM A; 3DHR B; 3ASE A; 3A9M A; 1A3O B; 1MNO A; 2MGM A; 3PEL A; 3G52 A; 3UHB A; 3A59 B; 1YIE B; 4XDI A; 1K0Y A; 1V4W B; 3GQG A; 4N7O B; 4WJG A; 4OF9 A; 1YH9 A; 1BJE A; 1HBS B; 3D1A A; 3PT7 A; 3GLN A; 1A00 A; 3E4N A; 2MYD A; 2D2M B; 1Y0C B; 4HHB B; 2HZ1 A; 1YG5 B; 4KMW A; 2O5Q X; 4U8U A; 3WCV B; 3HEN A; 2OIF A; 3WFW A; 3AT5 B; 4YU3 B; 2ZFO B; 1G0A B; 3E5O A; 1YE2 B; 2FAL A; 5JDO C; 2VRY A; 1NIH B; 4MBA A; 2VHB A; 5JDO E; 2AUP A; 1UIW B; 1Y0T B; 4X0L A; 3IA3 B; 1LFT B; 3UGZ A; 3G4V A; 1CH1 A; 1SI4 B; 1J3F A; 4HHB A; 1HDS A; 2NSR A; 1MZ0 A; 1JP8 A; 4UZV A; 3HHB A; 1OFK A; 1BBB B; 1NZ5 A; 1NZ3 A; 1O1L A; 2LH1 A; 3V2Z A; 3P5Q A; 2ZS1 C; 1HHO A; 2AA1 B; 1MLS A; 3M3B A; 3ZJP A; 3CIU A; 1J7Y B; 1FSL A; 2W72 B; 1THB B; 2W6W A; 2D5X B; 1GDL A; 3AQ5 A; 1MWC A; 2DN1 B; 1SI4 A; 1B86 A; 2NRL A; 1YMC A; 1MBD A; 1YIH B; 3A5G A; 3LQD B; 3B75 B; 3ZJL A; 1NWI A; 4C0N A; 2AA1 A; 3NL7 A; 1MBO A; 3RJN B; 1C40 B; 1XYE B; 3ZJJ A; 3HC9 A; 4ROM A; 1THB A; 2AV0 A; 2ZFB B; 4H2L B; 2D5X A; 1CP0 A; 1LFQ A; 1IWH B; 5ILP A; 2DN1 A; 3VRF B; 1MBC A; 2DN2 B; 1XZ2 A; 2IG3 A; 2W6V B; 4O35 A; 1DWS A; 2BLI A; 1HV4 B; 1HGB B; 2EB8 A; 4FH7 A; 1SDK B; 5EYJ A; 1OFJ A; 3ECL A; 1HRM A; 1BVC A; 1MOH A; 1IWH A; 2HHD B; 2DHB A; 4F4O A; 5SW7 A; 1MWB A; 2HCO A; 3UHN A; 1O1P B; 3QMA A; 1SDK A; 1VHB A; 3ARK A; 3GKV B; 1R1X B; 3SDN A; 3LB3 A; 1MLJ A; 2QLS B; 1WVP A; 1A0Z B; 1VXA A; 1BIJ B; 1DXT A; 1QSH B; 3GQR B; 2DC3 A; 4TWV A; 3S1I A; 4NZI A; 1NS9 A; 1LFZ B; 1S5Y B; 3WCT B; 3HEO A; 3W4U A; 1O1P A; 1URV A; 3ZJR A; 1HAC B; 1COH B; 3EU1 A; 7HBI A; 2V1H A; 2YRS A; 2XKI A; 1RTX A; 5E83 B; 3GQP B; 1JP6 A; 1YEQ B; 2EKT A; 2Z6N B; 1A0Z A; 4H07 A; 3QJE B; 1BIJ A; 1Y8H B; 3TM3 A; 3GQR A; 4OOD A; 1OUT A; 3MJU B; 1A6G A; 3WHM A; 3ZOL A; 1QI8 B; 1Y4R B; 1GZX B; 3AQ7 A; 1HLM A; 3BCQ A; 5E83 A; 3AT6 A; 2QU0 B; 1HGC A; 1A4F B; 1YEQ A; 1Y22 B; 1ECO A; 3UH6 A; 1Y4Q B; 1VXH A; 5CMV A; 2VEB A; 3IXF A; 3QJE A; 5HLQ A; 3DUT B; 1Y8H A; 5AZR A; 2FRF A; 2DXM B; 1Y01 B; 1DLW A; 104M A; 1SPG A; 5D1V A; 2D60 B; 4MQH B; 1S61 A; 1Y31 A; 1QI8 A; 2D2N A; 3S1J A; 108M A; 2R1H B; 1YGD B; 1ECN A; 3UHI A; 1Y0D B; 3ZOM A; 1A4F A; 1JY7 A; 1Y22 A; 2BW9 M; 5E29 A; 1Y4Q A; 4N7P B; 3WCW B; 3HYU A; 2EKU A; 1TU9 A; 1O1N B; 2MGL A; 3S65 A; 2D60 A; 1CG8 B; 2DN3 A; 3S66 A; 1YMA A; 1DXU B; 1VXD A; 1HSY A; 2R1H A; 1YGD A; 1Y4G A; 4F6B A; 1L2K A; 3UHU A; 2RI4 B; 1A6M A; 1X3K A; 2HHB B; 1MBA A; 1HBB B; 2VYZ A; 5IKS A; 1J3Z A; 1V75 B; 3FH9 A; 1GCV A; 106M A; 1C7B A; 1VRF A; 4O2G A; 4F6J A; 3UHR A; 2EVK A; 1WMU B; 2GDM A; 5HBI A; 1DXU A; 2MGD A; 3O7N A; 1G09 A; 1MYZ A; 2HHB A; 1O1M A; 3A5A A; 3QQQ A; 1EBC A; 1FSX B; 2MGA A; 1V75 A; 1RPS B; 2QFN A; 1BZ1 B; 2CMM A; 4G1V A; 4PQC A; 3UHE A; 1C7D B; 3K3U A; 3ZJI A; 1A6K A; 4F68 A; 2HBF B; 2V1G A; 1BUW A; 4ESA B; 5HY8 A; 5EE4 D; 1I3D A; 4DC7 A; 1VXC A; 2GTL B; 1O1J B; 1A0U B; 3UHC A; 3D17 A; 1Y35 A; 5F0B A; 1DO4 A; 4NK2 A; 5ILE A; 3WCU B; 2VEE A; 1CMY B; 1JP9 A; 1Z8U B; 3AQ6 A; 4VHB A; 1CH3 A; 3IC0 B; 4ESA A; 107M A; 5EV5 A; 1Y46 B; 1LFL A; 1MYM A; 2NX0 A; 2HZ2 A; 2MYB A; 1JL6 A; 1LH2 A; 1BZZ B; 3QJD A; 3SDH A; 1V4X B; 3OO4 A; 4M4A B; 1O1J A; 1A0U A; 1MLO A; 2NSS A; 3MYM A; 1SPE A; 1MLR A; 3K9Z A; 1YOI A; 1PMB A; 1IRD B; 102M A; 3QJC B; 4KMV A; 1YVQ B; 4MQK A; 1Y5J A; 3ARJ A; 1Y46 A; 1W92 A; 1FN3 A; 2HBS B; 3MJP B; 1Y4B A; 5CN7 A; 3KMF A; 2ZS0 D; 1V4X A; 1QPW B; 1IBE B; 1SHR B; 3G4R A; 1LJW B; 1BZ0 A; 2W6X A; 3IC2 B; 4F6I A; 2OH8 A; 1YMB A; 4F6G A; 2LHB A; 1NAZ A; 3WFX A; 2G11 A; 3H57 A; 5F2A A; 1BZR A; 1CH5 A; 1Y7C A; 1B0B A; 1MLK A; 3CY5 B; 2V1F A; 1AJG A; 4XS0 B; 5EE4 C; 1OR4 A; 1GJN A; 2HBS A; 1Y4F B; 1S5X A; 3LB2 A; 1FHJ B; 1QPW A; 1Y7D B; 1Y2Z A; 4YU4 B; 1HBH B; 1RQ3 A; 2IN4 A; 1YHR B; 3IC2 A; 3ONZ A; 4HSX A; 3SZK B; 1SWM A; 1HAB A; 5KKK A; 3NMM A; 1Y5K B; 3FS4 B; 1G0B B; 2OHA A; 2QSS B; 4F69 A; 5EUI A; 1Y4F A; 2O5B X; 1FAW B; 1XZU B; 3VAU A; 1Y5F A; 3WFU A; 4U8U D; 1J3Y B; 2LH5 A; 1Y7D A; 4DWU A; 1NS6 B; 1ASH A; 2O58 X; 2PEG B; 5EYS A; 4FC3 B; 3OZU A; 4MQG A; 1RQA B; 3PT8 A; 2ZLU A; 1S0H A; 1JPB A; 1A01 B; 1MOD A; 1J3Y A; 2ZS1 B; 3BJ3 B; 3ECZ A; 2ZS0 C; 2ZLV B; 1AJH A; 2M6Z B; 1MNK A; 3R5I B; 3OO5 B; 1YZI A; 2FAM A; 3M38 A; 2ZSY A; 1ITH A; 4FC3 A; 5HLX A; 1YCB A; 3DHR A; 2H8D B; 2D6C A; 2GKM A; 1A3O A; 2RAO B; 4L2M A; 4MU5 A; 3A59 A; 1YIE A; 5CNE A; 1YEN B; 1V4W A; 2O5L X; 4N7O A; 1A01 A; 1HBS A; 4TYX A; 3EOK B; 1XZ7 B; 2ZLV A; 2Z85 A; 2M6Z A; 1LHT A; 1CBM A; 2D2M A; 1HBG A; 4O4Z A; 2MHB B; 1EWA A; 1Y0C A; 1YG5 A; 1CPW A; 1DO7 A; 5CNF A; 2LH2 A; 3WCV A; 1MOB A; 2LH3 A; 3AT5 A; 4YU3 A; 2ZFO A; 1RVW B; 4ILZ A; 1G0A A; 3UHV A; 2ZSQ A; 2ZST A; 1MLL A; 1YE2 A; 1Y45 B; 4MXK A; 1MNJ A; 1R1Y B; 1XZ5 B; 1CH2 A; 1XZ7 A; 1XY0 B; 1NIH A; 4U8U C; 1UIW A; 1Y0T A; 1Y4V B; 1MYF A; 2BWH A; 1LFY B; 1N9I A; 1NZ4 A; 1LFT A; 3HEP A; 1EMY A; 1J41 B; 1PBX B; 1BBB A; 6HBW B; 1MLH A; 3BJ1 B; 3KUO A; 1RVW A; 1RSE A; 1UFJ A; 1HBR B; 1R1Y A; 1XZ5 A; 1XY0 A; 1J7Y A; 2W72 A; 1J7S B; 5JOM A; 3WI8 A; 2V1I A; 1LFY A; 3LHB A; 1YOG A; 1V5H A; 2KSC A; 4DC8 A; 3MOU A; 3M39 A; 1MGN A; 1G08 B; 1DKE B; 1J41 A; 1PBX A; 3UH3 A; 4NK1 A; 1YIH A; 1BAB B; 6HBW A; 1YCA A; 3LQD A; 3B75 A; 5C6E B; 3DHT B; 5AB8 A; 4GZG A; 1LH6 A; 3HF4 B; 1HBR A; 3R0G A; 1C40 A; 1XYE A; 1CIK A; 4L7Y B; 1J7S A; 1O16 A; 2R4W A; 1GCW B; 1LH5 A; 1N9H A; 2ZFB A; 4H2L A; 3VRF A; 5CNC A; 1BZP A; 1NZ2 A; 2DN2 A; 2W6V A; 3GK9 A; 1HV4 A; 1HGB A; 3LB4 A; 2MGI A; 1N9F A; 1DO3 A; 3ZH0 A; 1YEU B; 2GNV A; 4G1B A; 4ROL B; 3HF4 A; 3TM9 A; 2BMM A; 4NS2 A; 3S48 C; 1GCW A; 4O4T A; 2EVP A; 2HHD A; 3ZJS A; 1A9W A; 3PI8 B; 4JAC A; 3GKV A; 1R1X A; 110M A; 2MGH A; 1CH4 A; 2D2N D; 2QLS A; 2OH9 A; 3UHQ A; 4QAU A; 1QSH A; 1BIN A; 4UUR A; 1V4U B; 112M A; 1YEO B; 3QM5 A; 2MBW A; 3QM9 A; 3V2V A; 3ZHW A; 2ZLT B; 1GDI A; 2ZLX B; 2FRI X; 1LFZ A; 1S5Y A; 2C0K A; 3WCT A; 3BOM B; 1HAC A; 1COH A; 1MTI A; 3U3E A; 3ORD A; 1C7C B; 4MXL A; 3ZJQ A; 3GQP A; 2Z6N A; 1EBT A; 1HDA B; 4G51 B; 2BLH A; 1X46 A; 1V4U A; 1YEO A; 3MJU A; 4NXC A; 2ZLX A; 1JDO A; 3QJB B; 3VRE B; 5D5R A; 1S6A A; 1O1I B; 1Y4R A; 1X9F D; 5MBN A; 2AUR A; 5B85 A; 3BJ2 B; 1MLG A; 1GZX A; 1C7C A; 1OUU B; 2QU0 A; 2BK9 A; 2QSP B; 1YE0 B; 3DUT A; 4AVD A; 4G51 A; 1N9X A; 2DXM A; 5EET A; 2FRK X; 3UHY A; 4MQH A; 2MGF A; 2G0V A; 3QJB A; 1O1K B; 2BKM A; 1NWN A; 1ABY B; 3BJ2 A; 4LPI A; 3MVC A; 3QZX A; 5HLU A; 1Y0D A; 4NI1 B; 5M3S A; 1OUU A; 1JF3 A; 2ZSP A; 3UHK A; 4ZVA A; 3ZJO A; 4N7P A; 1CQ2 A; 2MGG A; 3G4U A; 3VHB A; 2D2N C; 1Y8W B; 2H35 B; 3WCW A; 3G4Y A; 3OK5 A; 1O1N A; 5CN8 A; 4H0B A; 2R80 B; 1CG8 A; 3PI2 A; 4FWY A; 4MPM A; 1GVH A; 1CG5 B; 2G0S A; 3UH5 A; 2WTH A; 2V1K A; 3NML A; 1NQP B; 1VXG A; 3MKB B; 2RI4 A; 1HBB A; 3HXN B; 1NEJ B; 1XQ5 B; 3VRG B; 3UBV A; 1GDJ A; 2MYC A; 1F5O A; 1RQ4 B; 4PNJ A; 1CLS B; 2QMB B; 5JGG B; 2ZT2 A; 1WMU A; 2GRZ A; 2SPM A; 1HCO B; 2QRW A; 3UHZ A; 1X9F C; 1LFV B; 1J40 B; 1CO9 A; 4ODC B; 3QM7 A; 4MQC B; 3G4Q A; 1JZK A; 3HXN A; 1FSX A; 1RPS A; 1NEJ A; 1BZ1 A; 1XQ5 A; 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3UH7 A; 1Y5K A; 3GQG B; 3FS4 A; 1YH9 B; 1G0B A; 4AVE A; 3D1A B; 1DXV B; 3PT7 B; 2PGH A; 2QSS A; 3LB1 A; 5HAV A; 2ZSS A; 1FAW A; 1A00 B; 1XZU A; 2HHE B; 3OJ1 A; 1JF4 A; 1MLN A; 1KD2 B; 2WTG A; 1F65 A; 3WCV D; 3UBC A; 3A5B A; 1Y0W A; 1NS6 A; 2ZFO D; 1LTW A; 2LH7 A; 4U8U B; 1O1O B; 5CNB A; 2PEG A; 1YHE B; 1QSI B; 1Q1F A; 2O5O X; 1OR6 A; 1HBI A; 4WJG 1; 3H58 A; 2MB5 A; 1MBN A; 1RQA A; 1DXV A; 1M9P B; 5KDQ B; 2HBE B; 4IT8 A; 1M6M A; 2HHE A; 1QXD B; 4X0L B; 1HBA B; 1KD2 A; 2R4Z A; 1FDH G; 2ZS1 A; 3BJ3 A; 1KR7 A; 2Z6S A; 1F63 A; 4MQI B; 2O5S X; 1HDS B; 1NPG A; 3HHB B; 1MLU A; 3R5I A; 3UHS A; 1O1O A; 3OO5 A; 1O1L B; 1YHE A; 1QSI A; 2ZSO A; 1V9Q A; 3P5Q B; 1F5P A; 3BA2 A; 2H8D A; 1HHO B; 2GL3 A; 2NRM A; 2RAO A; 1M9P A; 1XCH A; 3CIU B; 5KDQ A; 1YEN A; 1YEV B; 3HRW B; 2HBE A; 1QXD A; 2V1E A; 1UC3 A; 4SDH A; 1HBA A; 3EOK A; 4MQI A; 1B86 B; 2WY4 A; 1OBM A; 2ZWJ A; 2MHB A; 1MYG A; 2ZSZ A; 5CND A; 3NL7 B; 3UHX A; 3DR9 A; 3D1K B; 5CN6 A; 1YEV A; 3HRW A; 1YVT B; 2D2M C; 1QXE B; 4ROM B; 1ECA A; 1NXF A; 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