2O7KA

S. aureus thioredoxin
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
AIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGPCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The conserved active site proline determines the reducing power of Staphylococcus aureus thioredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Electron transport
total genus 29
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2o7kA00
5FWGA 2MMAA 5KN3A 4XTSA 5DCHA 4GTUA 3GA4A 4N30A 5D8IA 2N5BA 3ZZXA 2X8CA 2YV7A 1A24A 4IHUA 1G6YA 2PERA 3CRUA 1PSQA 1NW2A 3GTUA 1AUCA 5COHA 4MLYA 5IO0A 2VL2A 3G7YA 2EIQA 2P31A 3MWHA 1B4PA 1K3OA 2B5YA 5D96A 1TI1A 4DSSA 5GAPD 3NOFA 4O7HA 6GSWA 3LWAA 1OKTA 1V9WA 2BJXA 4J57E 4I5QA 4ZL9A 3HVXA 1GRXA 2WZ9A 4LMWA 4EKZA 5A4VA 3FR3A 1TJDA 3MSZA 2GQMA 1XWBA 3GIXA 1S3DA 4X0XA 12GSA 3H93A 5IMZA 3RPPA 1V57A 1ERWA 1XWGA 3WYWA 2WGRA 1I5GA 5CRWA 2XC2A 2VUPA 3VI5A 5D73A 3UBLA 3A3TA 3DGQA 4ECIA 3F3RA 6GSSA 1SYRA 4KNDA 1E2YA 2L57A 2O89A 2HI7A 2WS2A 2V6OA 2IMDA 2VCVA 2YWIA 3CTGA 3Q6OA 2EC4A 2MBTA 3VWXA 4TR4A 2H1GA 2RLIA 2AV4A 1O8WA 1CQHA 3LSZA 4WXTA 4IELA 4ZL7A 4WBJA 1R5AA 3GKKA 4WBRD 2YJ7A 4ZXGA 5HFKA 5J9CA 4MPGA 3BD2A 4TR3A 3Q74A 2HZFA 3VWVA 3M8NA 1YF1A 5J5NA 1JHBA 2VM1A 3NZNA 3TRPA 1B8XA 1Z6MA 3F8UA 3O3TA 4BA7A 3IPZA 5DALB 1ERVA 2VCXA 4J56E 4YQUA 3I69A 4N11A 3D4MA 3DWVA 2CVKA 5D9WA 2CZ2A 6GSTA 1N2AA 3IR4A 1TW9A 3ED3A 4MPFA 4HI7A 3IC4A 1FB6A 4JR4A 2LUSA 5DQSA 3H1NA 3F63A 2VLUA 3IV4A 5IPGA 5JCGA 4XHMA 2OBKA 1Y25A 3FZ4A 1MEKA 4IGJA 4GSSA 3UVTA 3LFLA 3PGTA 2IWTA 2JSYA 3D4TA 4MF7A 5IOXA 3DYRA 3FR9A 2YP6A 3CTFA 5LCZA 4F03A 4OMVA 1FO5A 1GNEA 1TXXA 2DJ1A 1XOAA 3TCOA 1SK2A 1PD21 2WCIA 1Z7RA 5CRDA 3HJPA 2QKEA 4YAPA 2AJQB 1X5EA 1EGRA 1K0CA 3M9KA 1EV9A 1ABAA 2V1MA 2PU9C 1BYEA 1XOBA 2I81A 1T4YA 2DC5A 2O8VB 5CRHA 3UMAA 4PQHA 3M1GA 2ES7A 2LNTA 1SL2B 1MDJA 2C0FA 3GSSA 1UC7A 4V2LA 4POBA 14GSA 1G6WA 5ECOB 4OFMA 5EY6A 5HFGA 2IPAA 2QGVA 2B5EA 4HUAA 4MK3A 1U88A 2LSTA 2JACA 2GSRA 2MZCA 2C8UA 1U3IA 1GSYA 4KDYA 3UEMA 3KZQA 4OCEA 1QFNA 4PUAA 3KP8A 2VM2A 5IIZA 4WR4A 3F3QA 1SKWB 2FA4A 4XRDA 2C0GA 1O73A 3PR8A 1OVNA 5ECKB 2V41A 2P5RA 2MMZA 2CA8A 5IQYA 1TK0B 3F4RA 2GZZA 2LRNA 4ZB6A 3QPMA 2GZYA 2B1LA 4V1Ap 3L9SA 2OBIA 2JZSA 3HDCA 4YH2A 1XWKA 3UJ1A 2CAQA 3L4NA 1ZGNA 4HZ2A 3ZFBA 2CX3A 1F2EA 3GFKA 1TRWA 1MTCA 2K8SA 1EZKA 2A2RA 1VF3A 2PMTA 3P7XA 1ON4A 2NPBA 3D6IA 1V2AA 3FRCA 2H74A 2L4CA 2NDOA 1OC9B 2TRXA 3KTBA 4E8HA 3PH9A 4OCFA 1SD8A 2DIYA 1UVZA 2L5LA 3KMNA 4AGSA 4EXJA 4EL1A 1WIKA 1K0MA 4P3YB 1HYUA 2O87A 2KP2A 3ZVJA 1OE7A 4PXOA 1JZOA 4JRRA 5G30A 3MDKA 4Q5QA 2XPDA 2KUCA 4TKYA 5AISA 2HZEB 1LJRA 1O7UA 4BWSA 4TR1A 5FT3A 2J23A 3IRAA 3QFBC 2R5GA 2HRNA 2VIMA 2A2SA 5H5QA 1A2JA 5A5KA 3TOTA 4XS6A 1KBNA 4YQMA 2B7JA 2AAWA 3KMOA 2H6ZA 2LS5A 1KEBA 2PGTA 2IMFA 4DSRA 4IW9A 1EEMA 4KGIA 3J7Yb 5INYA 4LMVA 1DE2A 2N5AA 3H4KA 4MMMA 1XCCA 1M9BA 1T4ZA 5G1KA 1TK5B 2LJAA 4L5OA 2H30A 4G10A 4TN8A 3WGDA 1M2DA 7GSSA 2C1YA 3QFAC 5ABRA 4EDZA 5GAND 3NIVA 2IFQB 4HDEA 1PKZA 1EEJA 1DSBA 3US3A 3QMXA 4ZBBA 1YZXA 4HU9A 1OYJA 2DJ2A 4HZ4A 5JWOB 2B1KA 1GSEA 1DBYA 2F8FA 3CYNA 5GZZB 3GSTA 3LORA 1A0RP 5CNWA 4OO4A 2H72A 1PN9A 3TKPA 5H5SA 4L0WA 20GSA 1F9MA 3GH9A 1AW9A 2F51A 2GSSA 3E0UA 1B48A 2EIRA 5G5FA 2F8AA 2IIYA 3J7Yk 1C72A 3LXZA 3ZLPA 4FIWA 1LU4A 1TU7A 3VLNA 2HNLA 4I2TA 1JZDA 1E6BA 2FWEA 1WOUA 5D93A 2YN1A 2H01A 1I9DA 3HVSA 1XXUA 4JBBA 1OC3A 1PGTA 1OE8A 1YKAA 3IK9A 3I43A 1SJ6A 3P90A 4IQ1A 1TTZA 4HEA2 3KEBA 3S9FA 1A8YA 1EOGA 2VOCA 3P8WA 5ECMB 2ZNMA 3CBUA 5J9BA 3SWLA 3FYGA 1M2AA 3MAKA 2VL9A 4GLTA 2BTOT 1XBSA 2GLRA 5E59A 1V58A 4XS1A 3H8QA 1SL1B 4PQIA 1GSUA 3KH9A 4FYCA 3EYTA 4AJ7A 2L59A 6GSVA 2C3QA 1SD9A 3E3EA 3LYPA 1SK1A 19GSA 1EP8A 3KGKA 1F6MC 2OADA 4GCIA 1XIYA 2L5OA 2JZTA 4F0CA 3ERGA 2LNSA 3KP9A 3DXBA 3UL3A 1QMVA 1MD4A 2LEGA 4NHZA 2OA7A 2OJLA 3IK7A 2JL4A 4OD7A 1QUWA 4MZBA 3APQA 3WGEA 4PURA 5IO2A 1VRSD 2C3TA 4ECBA 2H19A 5GSTA 4ECCA 4IJIA 4ZB9A 2YZUA 3GNJA 1K0BA 4HS1A 4ULXA 3TJFA 3GL5A 4YQVA 3O76A 3GHAA 2FHEA 4RI6A 1Z7PA 5KN2A 2I3YA 1GLPA 3OR5A 1FW1A 1M0UA 2WJUA 4HJMA 4YAVA 4KCEA 2ALBA 1H75A 4KCAA 4HQZA 1O85A 4N0ZA 1VF4A 2OE1A 4K8MA 3FZAA 2ON7A 3GKMA 5C00A 1FAAA 5B6MA 2CVDA 3UIWA 5IMFA 2WRTA 4D73A 1J08A 3SBCA 2H0HA 4KDXA 1AAZA 1Q98A 4F9ZA 6GSUA 1WP0A 4MDCA 3Q18A 5HQPA 3FW2A 2H66A 1SJZA 4LA1A 1THOA 3WT2A 4ZIJA 1PQNA 1R26A 4XS4B 3RHBA 3HYPA 2VCQA 2B5XA 2FA8A 3VPQA 3GX0A 1PX6A 4IS0A 4IBPA 4X1UA 1SKSB 1MD3A 3FEUA 1R4WA 1ILOA 3EE2A 1M99A 2LV3A 3GUSA 2HSHA 3EU3A 1GTBA 1X9WB 4RQRA 4MH3A 3VURA 3HKRA 2LRCA 4GRFA 3HCZA 2LRTA 2JADA 2VL2C 4WEYA 4F2IA 1T00A 5G5EA 4Q5NA 1ERUA 2PBJA 3W8JA 4K7NA 1YEXA 2OE3A 5KEJA 3M9JA 1ERTA 2FGXA 2DJ0A 4EUYA 1GULA 1SKRB 5LNKe 1O6JA 2LQQA 3WD6A 3ERWA 2VD1A 6GSYA 4MF5A 5ID2A 3H79A 3UVHA 4NXIA 4G2EA 4GSTA 3LEFA 5AN1A 1KTEA 4GXZA 1UA5A 1THXA 3I9V2 2VLVA 2X64A 3LJRA 4O5RA 4ML6A 1GTUA 5AGYA 5IMCA 2HE3A 1XZOA 1MDKA 1ACVA 4CW9A 1W4VA 1AQVA 3UAPA 2R4VA 2F3MA 1DE1A 4I97A 1X5DA 2PUKC 2H6XA 2IN3A 1UN2A 2YANA 1J9BA 4POMA 3D21A 1NSWA 3RDWA 3O6TA 1WWJA 1ST9A 3V1WA 2G2QA 2X99A 3R2QA 1GP1A 4G19A 3BCKA 4K7IA 5F8BA 3BBYA 4OWYA 2K9FA 3TGZA 5DAKB 2WFCA 3GKXA 4TR1B 3HZ8A 1XW5A 4MJEA 5L71A 1SK0A 2C0EA 4KE3A 4LL4B 3VWUA 4MA9A 1PMTA 5ECQB 2PPTA 2HLSA 1AXDA 3TKSE 4GSNA 2X8HA 4JR6A 4K1FA 2CV4A 4TXOA 3P2AA 1O81A 4L5LA 3F9UA 5IM9A 3IHQA 4MJBA 1DUGA 3HHVA 4FO5A 3BJ5A 1PX7A 2NTOA 4ACSA 5DJMA 1RK4A 1TRUA 3KM6A 1K0OA 1PKWA 1R5PA 4QQ7A 1XVQA 5DVBA 2PVQA 5DALA 4I8BA 1RQMA 2RUFA 16GSA 2E2MA 1TDIA 1QXHA 1VGLA 1W89A 4NHWA 4NMUA 18GSA 2GQKA 1TKDB 3ZREA 2H0GA 1NHOA 3K8NA 2B3SA 3HY2A 3DVXA 4JZQA 1USBA 4NV2A 1TU8A 2GS3A 4EF0A 4KB3A 2ZUPA 1ZYQB 2V2GA 3CMIA 4PQ1A 4L8EA 1YF0A 2JZRA 5F06A 1XW6A 5CRGA 6GSXA 5DBQA 2V6KA 3BOAA 3KH7A 2LTKA 1YJ6A 1A23A 2DMMA 1Z3EA 3ZMKA 3GN3A 2VO4A 1X0RA 5DJLA 2H1AA 5AIXA 2YJHA 1IYIA 1B9YC 5LD0A 4XRAA 1SENA 1FOVA 1NHYA 3CSJA 3FHKA 1SL0B 3PINA 1X9MB 3IBHA 5IPHA 1PL1A 4X43A 2F9SA 3JCML 4BWQA 1V98A 4CDOA 1T8EB 1GNWA 1F37A 3TKSA 1GWCA 5J41A 4PX1A 2H1BA 2WDUA 3C73A 2P0GA 3RAZA 1KNGA 5HR1A 3HVVA 3U5RE 2CQ9A 2H6YA 2H75A 3ME8A 3L9VA 1ZL9A 3ZMLA 2VCTA 3DVWA 1PL2A 3LXTA 2MYGA 1BQ7A 1X9SB 3LG6A 1A2LA 2FNOA 1T1VA 4ID0A 2WULA 4DEJA 1XW9A 4MF6A 1GSQA 2GZPA 3WGXA 8GSSA 4IN0A 3ZIVA 3EMXA 2YWMA 1BX9A 1IYHA 3ERFA 1ML6A 4POLA 5CYYA 5B8BA 3CSHA 2KOKA 4KSMA 3GTUB 3DEXA 1V40A 1GH2A 5EPFA 3A2VA 2GQLA 13GSA 2GVPA 3TJBA 2YNXA 3TUEA 1ZMAA 3GRXA 5A4WA 5HR0A 3EC3A 4TVEA 5CREA 1Y6EA 4DSSB 2J9HA 3KTLA 4K6XA 3DD3A 4XCSA 4JE1A 4WF4A 1XPVA 1N8JA 17GSA 1CQGA 1K0DA 2IMIA 1FB0A 1F3AA 5JCWA 2R2JA 1B9XC 4IP1A 3EURA 3M0FA 3L78A 4KUNA 1GLQA 5C04A 4KX4A 1OC9A 4ZB8A 5JWRB 2PWJA 3RBTA 3HD5A 2YZHA 1EGOA 1ZYEA 5G31A 2WB9A 4K7OA 3D5JA 3DIEA 3QAGA 3TKSC 4MZWA 5J3RA 2KHPA 22GSA 3TKRA 1X5CA 1NM3A 1QK8A 1YY7A 3GURA 4D73B 1TK8B 3TKQA 1A2MA 5ECHB 4Z7XA 1Q4JA 3TJJA 3QCPA 2AUVA 3HJMA 2HZEA 1WPIA 3L9UA 3GX8A 5CO3A 2XPEA 2GT6A 3TJKA 4WETA 1YKCA 2E7PA 4HU7A 4ML1A 3VPTA 2FUG2 3MNGA 4RUVA 4NV5A 2GSQA 1XFLA 4HQSA 1EP7A 3QAWA 4FH8A 3L0HA 2C0DA 4KDUA 2L4QA 4PUFC 5IMDA 1A8LA 3KCMA 5DQYA 4DVCA 5ECNB 1ZOFA 1GSDA 5HR3A 5DCGA 3IA1A 2GSTA 2IFQA 2DJJA 1GUHA 5JCUA 1GTAA 2TIRA 2NBSA 4HOJA 3G7IA 2DMLA 4K0NA 2AHEA 5ID2B 2JSZA 2KLXA 3ZVJD 5KN1A 4QL7A 2M72A 2EIOA 3TRXA 3D0ZA 5E4WA 3RHCA 4EDYA 2O85A 4K9ZA 3F6FA 5J4UA 2FWGA 4ZBAA 3UARA 2A4VA 1T7PB 4EVMA 4N0VA 4FYBA 2VLTA 1FHEA 1JZRA 1URMA 1G7OA 3N5OA 4RQXA 3W8SA 4V2MA 4KSOA 2HT9A 2VL3A 1XWCA 1HNBA 2GTUA 2HRFA 2HXKA 4IKHA 3VK9A 2YWOA 4V2NA 2JU5A 4J2FA 3HXSA 1ZZYA 4TOPA 3A5WA 4ILFA 2XHFA 4MP4A 4MCUA 2O7KA 2AYTA 3GYKA 3BCIA 4I6XA 3DMLA 3FY7A 1TOFA 1SJIA 3VFIA 2KP1A 3GV1A 3FK8A 2X8GA 2DLXA 2M80A 2CAIA 2CZ3A 1JLWA 1XVWA 2IMKA 3N9JA 3A2WA 5HFIA 4O32A 2VCWA 1AC1A 3KIJA 4TXOB 2GDRA 3KD0A 1GL8A 4MABA 4TRXA 1O8XA 4AJ6A 3LGCA 3G7JA 4ZILA 3QR6A 3IAS2 2C4JA 5D9TA 2RM6A 3UOMA 4GF0A 4MJAA 4BVXA 2FLSA 2DBCA 3FZ9A 3IAM2 2REMA 4WKWA 1BJXA 4ISDA 2PN8A 1EV4A 4WF5A 1SU9A 1M9AA 4TXVA 1BEDA 4Q5FA 5ELAA 3ZL5A 3GMFA 4PGTA 3Q19A 4O92A 3APOA 1BAYA 3RPNA 4RI7A 4IVFA 2LQOA 2RUEA 2Z9SA 5GSSA 5AIVA 2P5QA 2FWHA 3IDVA 3TOUA 3FKFA 5CP1A 4JEDA 1QQ2A 5G1LA 4MZCA 3HZ4A 9GSSA 2H76A 3TRQA 1TP9A 1K0AA 2I9HA 1OKDA 2DJ3A 5HR2A 1OAZA 4Q5RA 2DJKA 5ECIB 1K0NA 3EINA 4FYUA 5ELGA 2C80A 2K18A 5JWQB 3GKNA 4BPYA 1K3YA 2CVBA 3ZRDA 2E0QA 1YDKA 2L6DA 5IMVA 1WJKA 5B8AA 4K0GA 2AB6A 1AQXA 2YV9A 1GUMA 4AF2A 1R7HA 4BVYA 1G0TA 5A4UA 4XS4A 5DDLA 1RW1A 1J0FA 4WR5A 4N10A 1XWAA 1M7TA 3KXOA 2DSAA 4LLRA 4V1Ag 1WE0A 2RIIA 2I1UA 4MJCA 3WT1A 1Z5YE 1T3BA 2OACA 5FHIA 3ZFLA 1AQWA 2M46A 4EO3A 4POKA 3M3MA 4OO5A 3ZIJA 3IE3A 3C1RA 1QGVA 2LJRA 2I4AA 3ZITA 4GWRA 3DKSA 3KJYA 3F0IA 1Z9HA 1MDIA 3EMPA 2H70A 4JU5A 2ZCTA 3QOUA 4IQAA 1B4QA 2FY6A 4IJ3A 5G2ZA 1VF2A 2L6CA 3C8EA 3I6AA 4F82A 1PA3A 2K8VA 3IXRA 4F0BA 2YCDA 4QL9A 5B7CA 3F4TA 3ME7A 2IJYA 4KW6A 3CXGA 4XIHA 1YEPA 3CRTA 5ENUA 1SYXA 2HYXA 2VAFA 3C7MA 3ZTLA 3GH6A 2MBSA 3F4SA 4EE0A 3FR6A 5ECRB 4IP6A 5ECPB 3FZ5A 2PVOC 2QSIA 2R3XA 3ISOA 2FD3A 5F0GA 5F07A 4KAEA 1HD2A 2H8LA 1HNAA 2XBQA 1LBKA 2VD0A 5F05A 1TI3A 1GTIA 3QDNA 2H71A 4OFNA 3W6GA 4E8EA 3F6DA 2B7KA 4K2DA 4NPBA 2GT5A 2HFDA 5DAKA 3QD9A 3LYKA 4H86A 5H5RA 2DIZA 2FCHA 3EWLA 1GSSA 5EVOA 3TB2A 1EWXA 4LL1B 3VWWA 1PRXA 2H0IA 2TRCP 3EU4A 4ECJA 5D9XA 2R37A 3EVIA 2B6MA 3G9BA 4EC0A 4G9HA 4L0UA 2RM5A 3IOSA 5IOWA 2LJKA 2ON5A 5D9VA 1HNCA 3TJGA 4GQFA 1GUKA 5IMAA 3C1SA 2V32A 1U3AA 10GSA 3APSA 1EOHA 2OE0A 3LQ7A 2QC7A 1JZWA 3AY8A 1GSFA 1G7EA 2BMXA 3D22A 3VI7A 3DRNA 2MMOA 1YQ1A 3C71A 2N5FA 2VCZA 1BG5A 2YOIA 2H1DA 2OKAA 11GSA 4KH7A 2K6VA 2C3NA 1K3LA 4PNGA 4AJ8A 3A2XA 1WRYA 2MMNA 4ZBDA 4NAXA 5EL8A 3HA9A 5CAXA 4ZL8A 1FVJA 2D2ZA 2XBIA 4BL7A 1JFUA 2E2GA 2G0FA 3U6VA 2R6KA 2FWFA 1Z6NA 4TW5A 4NWYA 1M2BA 1ZCPA 3CSIA 3TDGA 1AIUA 1S3CA 4DSQA 2IMEA 5ECLB 4MH2A 1OC8A 4GQCA 2CT6A 2NVLA 1S3AA 1U87A 3UBKA 1TRSA 1TRVA 3ZYWA 1U6TA 2HSYA 4I2UA 1A0FA 4HJ2A 1HQOA 4OFTA 2H73A 2CX4A 2GGTA 4CHSA 2IL3A 1JLVA 1WMJA 3GL3A 4PNFA 3HJOA 3QAVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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