2O89A

S. aureus thioredoxin p31t/c32s mutant
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
AIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGTSKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The conserved active site proline determines the reducing power of Staphylococcus aureus thioredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Staphylococcus aureus
total genus 29
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2o89A00
4WBJA 5HFKA 4WKWA 3GL5A 3EWLA 3GKXA 3TJKA 1XWKA 4V2NA 1F6MC 1XVWA 5JCGA 1B4QA 3RBTA 4TVEA 4WF4A 2YWOA 3FEUA 2CVDA 4BPYA 1YKCA 5ELGA 2H1AA 6GSWA 3GHAA 6GSSA 2JZTA 5KN0A 4WBRD 1HQOA 1R26A 1ZL9A 5INYA 4KGIA 1Y6EA 3LEFA 4PNFA 4MABA 4TXOA 4XS1A 5ECHB 1KTEA 4K8MA 3F8UA 1EP8A 2VD0A 4QL9A 3ZZXA 1U6TA 1QMVA 5HR0A 1YEPA 2YV7A 2J23A 2AUVA 5ID2B 3QCPA 4YQVA 3APQA 2WS2A 2C3NA 4MJAA 1OE8A 4WETA 3F63A 2NPBA 1XOAA 3UAPA 5D73A 3V1WA 4ZL8A 3KM6A 4KDXA 4MDCA 3FKFA 1JHBA 1LBKA 4JBBA 2WJUA 3DXBA 3D6IA 1K0BA 5EY6A 2OA7A 2LNTA 1PGTA 2X8HA 1GRXA 1B9YC 1KNGA 2O87A 3FR3A 5DQYA 2WCIA 2WRTA 4N0VA 3IE3A 5C04A 5DAKB 1O73A 1R4WA 2KLXA 4EKZA 4MPGA 3LYKA 1TKDB 1O6JA 5ELAA 2QC7A 2LV3A 4MF6A 4POMA 2J9HA 5H5SA 2YNXA 3I43A 3IC4A 2DJJA 3KZQA 2OE0A 5IO2A 1GSFA 4AJ8A 1SK0A 5D96A 1XBSA 2H1DA 2DIYA 2ZCTA 4Z7XA 1GLPA 1K3YA 1JZWA 3EYTA 2JSYA 2PBJA 2MZCA 1GL8A 1K0OA 3DVXA 4WEYA 22GSA 3WGDA 3ZMLA 4GLTA 3C1RA 1NM3A 1FB0A 2MMZA 1F37A 3GUSA 3CMIA 3F4RA 5A4WA 4Q5QA 3FY7A 4TXOB 1NW2A 1MTCA 4FYUA 4KAEA 3UVTA 1K0MA 3HJPA 2M72A 3IPZA 4EO3A 3H4KA 2TRCP 1SL1B 3LG6A 4IVFA 3US3A 1GSEA 3ZMKA 1CQGA 4XHMA 2FWHA 4PQ1A 5HR2A 3RHBA 2E2MA 1XW9A 1UVZA 1Z3EA 1MD3A 4DSQA 5EL8A 4WR4A 3TJGA 5DCHA 3GKKA 2B5XA 1PRXA 3MDKA 4F2IA 2C0DA 4LLRA 4IHUA 4DSSA 1SYXA 2EIOA 2YWIA 3DGQA 3LORA 4KH7A 2GZYA 1TP9A 3GFKA 1BQ7A 1WRYA 3W6GA 3GYKA 2IMIA 1ON4A 3LWAA 3DEXA 3H93A 5E4WA 5GAPD 1RQMA 1X9MB 2YOIA 1JZRA 1GLQA 2NVLA 2FA8A 1PD21 1Q4JA 3KTBA 3ZRDA 1F2EA 2OE3A 3TKQA 4NMUA 4N30A 4V2MA 4K1FA 2DJ2A 2HZEB 2IWTA 2H72A 2P5RA 4XTSA 5D8IA 1WE0A 5G1KA 1T7PB 5ECKB 3LJRA 3NZNA 1BEDA 2QSIA 3IR4A 2GZZA 1AIUA 2E0QA 1V9WA 1BJXA 2HLSA 1TK5B 5F06A 1MD4A 2K9FA 2HYXA 1XZOA 5GSTA 1HD2A 1SU9A 2LRTA 1GUHA 4KDYA 4XS4A 1GSUA 2G0FA 2IMDA 3O6TA 1K0CA 1O81A 3DYRA 3EU3A 1T8EB 1M9BA 1TW9A 2F9SA 1TU7A 5ABRA 4TRXA 2C3TA 4HU9A 2VLVA 2GSSA 2IL3A 4GQCA 4ZBDA 5IMFA 4V1Ap 3FR9A 5FWGA 3WT1A 1LJRA 2IFQA 4IJ3A 4N0ZA 4ZB9A 1OAZA 4OCEA 4H86A 3QFAC 4DSSB 3H8QA 2BTOT 3FYGA 2LRCA 5HR1A 2LNSA 4LMVA 2A4VA 2KP2A 1OC8A 1EGRA 4I97A 4PXOA 4BL7A 3QDNA 2CAIA 5KN2A 2XBIA 3EVIA 18GSA 1AAZA 3UVHA 3MAKA 1B4PA 3BOAA 3H79A 2AB6A 4ILFA 3QFBC 5A5KA 1VF2A 1JZOA 2NBSA 2F8FA 1FVJA 2LEGA 1Z6NA 2GS3A 3GMFA 6GSUA 1K0DA 4KX4A 3IA1A 3ZL5A 1DE1A 3TCOA 3A2WA 4OMVA 4I2UA 5C00A 2G2QA 1HYUA 5EPFA 2X99A 1EV9A 1A0FA 1X5DA 3GA4A 4TW5A 2JZSA 1THOA 1YQ1A 5IMAA 1AQVA 2O89A 3ME8A 4XS4B 2YANA 2C1YA 5CRGA 4F82A 2X64A 4N10A 2H19A 4MCUA 2Z9SA 1TXXA 3HVXA 1SL2B 4V1Ag 1KEBA 2GDRA 2TRXA 4X0XA 2GLRA 1A24A 4KNDA 1V2AA 5F07A 4L5OA 1G6YA 4RQXA 1M0UA 2QGVA 3IK9A 1V98A 4JU5A 3J7Yk 2FA4A 2RIIA 3WD6A 1B9XC 5IPGA 10GSA 4JZQA 4PX1A 4KW6A 2VLUA 2DC5A 3GV1A 1GTAA 4IQAA 1K3LA 3VI5A 3GTUA 5H5QA 2YWNA 5G5FA 3D4MA 1FOVA 3IK7A 1S3CA 3CTGA 1TRSA 4TN8A 2JSZA 3VWXA 1EP7A 2PGTA 4IGJA 2DSAA 3RHCA 3Q74A 1T4ZA 4CW9A 1A0RP 4OO4A 2CT6A 4ECIA 3F6FA 5CRWA 4GWRA 2EIQA 2L5OA 1G6WA 3LXTA 2I1UA 2NTOA 3FZAA 1R5PA 1SJIA 3RPNA 2WGRA 2PU9C 1O8WA 4EUYA 1M99A 3C7MA 1EZKA 4RUVA 4BVXA 2IN3A 4Q5NA 3QOUA 2V1MA 1BG5A 2H1GA 1X9SB 5COHA 3TOUA 5G2ZA 3GKMA 5J9CA 3ME7A 3AY8A 3TJJA 2K18A 2YJ7A 5DVBA 5J9BA 3HVSA 4OFMA 1O8XA 1SKWB 1ZYQB 1F3BA 3Q18A 4N11A 5AISA 4ZILA 19GSA 1TI1A 2ZNMA 2VCVA 4MH3A 4FYBA 3ZFLA 3TKRA 5IIZA 3FZ9A 4ID0A 2GT5A 3E3EA 3Q19A 2H75A 1X5EA 1ABAA 3DIEA 4XS6A 3EURA 2GZPA 5CRDA 3IHQA 1A23A 3UJ1A 4XCSA 1B48A 2N5AA 3MWHA 1QQ2A 1GP1A 4F0BA 4JR4A 2MYGA 1YEXA 1K0AA 1F9MA 2YN1A 1SJZA 2ON5A 3LQ7A 1I9DA 1H4OA 5CNWA 2CX4A 5E59A 4LL1B 2DLXA 1QXHA 1GNEA 2H74A 5KN1A 4O92A 2IMKA 4EL1A 1VGLA 5F05A 3HCZA 4DEJA 3ZIVA 1PSQA 3VWWA 2KHPA 1E6BA 3IBHA 4I2TA 2CVKA 3GH9A 2CVBA 4CHSA 1VF4A 1OE7A 3ZYWA 4MZCA 2ALBA 4NPBA 2CAQA 4AJ6A 1U87A 4L0UA 1GNWA 5B8AA 3TKPA 2AYTA 1GUKA 2I3YA 1FB6A 4NXIA 4L5LA 3FZ4A 3L0HA 4Q5RA 4RQRA 2IJYA 2DMMA 3E9JB 1PN9A 3ZLPA 4GRFA 5HFGA 3QAWA 2JL4A 4QQ7A 1GTBA 2RUEA 1C72A 2ZUPA 2REMA 1OC9A 4K9ZA 1TI3A 4XIHA 3KCMA 3KMNA 5ECOB 1EOGA 3G7JA 5F0GA 1ERTA 5A4VA 1Z9HA 2MMAA 4KB3A 4TR1A 1DSBA 4KSMA 5AIXA 2YJHA 1TTZA 3F0IA 2I9HA 1SYRA 3HZ4A 3PINA 5IO0A 5DBQA 4ZIJA 3Q6OA 3GL3A 4X43A 3BBYA 1XW6A 2VCWA 4MJEA 1M9AA 2QKEA 3N9JA 4LA1A 3ISOA 3JCML 3NIVA 3M3MA 3TGZA 3G7YA 2DJ1A 1NSWA 4NV2A 5ECSA 3S9FA 16GSA 2F3MA 3KMOA 2GSQA 1FW1A 2ON7A 1M2DA 1ZZYA 2GSRA 1RW1A 2HSYA 4PUFC 4ZBBA 3IAS2 3TUEA 3RDWA 1XWCA 3DD3A 1WWJA 4HJMA 5IOXA 6GSTA 1O85A 1NHOA 3EMXA 1VF1A 1N2AA 4BVYA 4OFTA 3GURA 3QD9A 2EC4A 4L8EA 3QAGA 2CV4A 2X8GA 2HFDA 4YQUA 2VL3A 3PR8A 5H5RA 5JWRB 2C8UA 4F9ZA 3KXOA 3TB2A 3O76A 3KGKA 4EVMA 2V32A 3GIXA 2HSHA 4IJIA 3HVVA 5HFIA 4O7HA 3I69A 3M9JA 5IQYA 1OC3A 3KP9A 3UBKA 4YQMA 2JU5A 3KH7A 5EVOA 1OC9B 2R5GA 3ERGA 1MEKA 20GSA 3FK8A 4ZB8A 2FNOA 3TOTA 1Z6MA 2OJLA 2PN8A 3QAVA 1TOFA 5CO3A 1UN2A 3U5RE 4D73A 5DJLA 2V6KA 4EXJA 1A2LA 4OO5A 4IP1A 4EDYA 2VCXA 3QR6A 2CQ9A 5JCWA 5GSSA 1W89A 2OADA 1Z5YE 2CZ2A 1ZMAA 5G30A 2GT6A 2VD1A 2H1BA 5F8BA 5J41A 4JR6A 5JWOB 3IDVA 3M9KA 2EIRA 2FWGA 4G10A 3ZREA 3HDCA 3NOFA 2B1LA 2PERA 4RI7A 3L78A 5JWQB 3BJ5A 1N8JA 4NAXA 1PA3A 3VPTA 1I5GA 2B3SA 4BWSA 1SL0B 4POLA 4XRDA 5DJMA 5JCUA 3P90A 1U3AA 3EC3A 1VF3A 3QPMA 3CBUA 1U3IA 2P31A 4IS0A 2VAFA 1YF0A 1QK8A 2BMXA 1URMA 3L9VA 3SBCA 2GVPA 2A2SA 4KA0A 4K7IA 2H8LA 1R7HA 2C3QA 4HJ2A 2HXKA 3VURA 1TK8B 3BCKA 1X9WB 2FWEA 3GKNA 3P7XA 2AV4A 2P5QA 2O7KA 2PUKC 2OE1A 3QMXA 1RK4A 1FG4A 3GNJA 1XCCA 3CRTA 3HJOA 1GSSA 1VRSD 1Z7PA 3F9UA 2HZFA 4F0CA 3P2AA 5B8BA 2K8SA 1FHEA 3A2XA 4ISDA 3CYNA 3GSSA 1DE2A 2HE3A 1K0NA 2MBTA 4OFNA 2H70A 5G31A 3HHVA 3D21A 5D93A 4ML6A 1X0RA 4LL4B 2VL9A 3CSIA 2OBKA 2L4QA 1ZOFA 3I9V2 3IV4A 4ZB6A 4X1UA 3CRUA 2HRFA 3UL3A 4G19A 4D73B 5IMVA 4HQZA 1PKWA 2MMOA 1AUCA 4TXVA 2JACA 2YP6A 3VWUA 4FYCA 3M1GA 2B6MA 1YF1A 4J57E 1H75A 4HU7A 4ML1A 1E2YA 4GXZA 2H71A 2WDUA 2RUFA 1JZDA 2XPDA 3SWLA 1HNAA 3ZITA 3TKSA 5ENUA 4MZWA 2C0EA 2X8CA 3ZIJA 2CA8A 2R37A 1XOBA 3DRNA 3UOMA 3HY2A 1WP0A 3UBLA 3PH9A 4PGTA 3D22A 3HA9A 2L6DA 5B6NA 3GX0A 2L5LA 4MMMA 2DJ3A 7GSSA 2IFQB 1LU4A 2I81A 2VL2A 3EE2A 2YPMA 13GSA 4KDUA 5AN1A 4J56E 1J9BA 3EINA 2RLIA 3CSHA 2M80A 3VK9A 1PL2A 4RI6A 5ID2A 3LFLA 2ES7A 2F8AA 3DWVA 4HOJA 5G5EA 3F3RA 4TR4A 4ULXA 9GSSA 5AGYA 1SD8A 4F03A 5ECIB 5ECRB 1WJKA 3FW2A 2C4JA 2MMNA 5ECPB 2K8VA 2XPEA 2IPAA 4K0NA 3CSJA 4PUAA 4ECCA 1UA5A 2H30A 1PX6A 1V57A 1V40A 3KIJA 5DAKA 3ZTLA 3IXRA 4GCIA 2VUPA 4NHZA 1PKZA 5FHIA 2V41A 1WOUA 3F4SA 1QGVA 2DJ0A 4E8EA 1A2MA 3ZFBA 6GSVA 1A8LA 4I8BA 1GWCA 1GTUA 1XFLA 4L0WA 5CYYA 3TKSC 2B7JA 2OKAA 3C1SA 3DKSA 4I5QA 3O3TA 2A2RA 1J08A 1Y25A 1OVNA 1USBA 3M0FA 1PQNA 3CXGA 1SKRB 3VI7A 3WGEA 4GSSA 4O5RA 3DVWA 2H0HA 4J2FA 4MPFA 2FHEA 4HUAA 1R5AA 1HNCA 2I4AA 3HKRA 1SKSB 4MA9A 3C8EA 1YKAA 2E7PA 1A8YA 1EEJA 4HZ2A 5DDLA 2FUG2 1SJ6A 1JFUA 4ECBA 1A2JA 1BAYA 3U6VA 14GSA 2VL2C 5D9WA 4HQSA 5ECQB 1T3BA 3EMPA 2R3XA 3GTUB 1ML6A 2XC2A 1SENA 5J5NA 3APSA 1G7OA 3TRPA 3LGCA 3D5JA 1J0FA 4GSTA 6GSXA 4EC0A 2XBQA 3E0UA 2WZ9A 1PMTA 5A4UA 3LXZA 2XHFA 5CREA 3IRAA 4XRAA 4NHWA 3IAM2 2LTKA 3ERFA 2WB9A 2FCHA 4FH8A 3TDGA 2H73A 3M8NA 3VFIA 5B6MA 2VOCA 1TRVA 4OCFA 1ZGNA 2AHEA 2FWFA 3L9SA 1GSYA 1JLVA 3WYWA 4EF0A 4IQ1A 4ZXGA 2HNLA 5IMDA 2GQLA 4MH2A 4PQIA 1XWBA 3MSZA 4PNGA 4YAPA 3WT2A 2WULA 3LYPA 5L71A 5ECLB 2YZUA 1XWAA 2O8VB 1F3AA 2HZEA 2LSTA 2O85A 2VIMA 4NWYA 5J3RA 5HR3A 4FO5A 1IYHA 4YAVA 2LS5A 3LSZA 2PVOC 1O7UA 4WXTA 4G9HA 4MJCA 1MDKA 2VCTA 17GSA 4ECJA 4ACSA 2YWMA 1EV4A 2WFCA 3GH6A 2FGXA 2KOKA 1ERVA 3BCIA 3RPPA 4EDZA 5GAND 5CP1A 1NHYA 3GX8A 3TJFA 4YH2A 5GZZB 2N5BA 1ACVA 5D9XA 1AXDA 4G2EA 1MDJA 2R4VA 3KD0A 3IOSA 3W8SA 5CAXA 4JEDA 4IN0A 2VCQA 3F6DA 2IMEA 3G7IA 5IM9A 1XIYA 3KJYA 3F4TA 4K2DA 1DUGA 1FO5A 1M2BA 1Z7RA 2YV9A 1EEMA 3D0ZA 3C73A 2LJRA 4DSRA 1U88A 1ILOA 1WMJA 3GSTA 4NV5A 1TRUA 3GN3A 2LKUA 2DMLA 4GF0A 2IMFA 4I6XA 1T00A 4GTUA 1AQWA 1T4YA 1ZCPA 3P8WA 3KTLA 4PQHA 1M7TA 4ZBAA 4BA7A 4IW9A 1PX7A 1PL1A 1T1VA 1S3AA 3FRCA 1XWGA 2FY6A 4AGSA 4HEA2 3TKSE 1OKDA 1MDIA 2C0FA 2NDOA 1KBNA 2M46A 1B8XA 2H66A 4TR1B 5IOWA 1GSDA 5HQPA 5D9TA 3F3QA 1YDKA 1WPIA 2PMTA 3ERWA 3HJMA 2B1KA 1ZYEA 2TIRA 2H6YA 1GUMA 5ECNB 5KN3A 3KP8A 1V58A 2AJQB 4CDOA 2KUCA 4WR5A 3A3TA 3TRXA 5D9VA 1X5CA 3UMAA 1HNBA 1YY7A 4IBPA 3TJBA 4AF2A 3BD2A 1ERUA 2VLTA 3W8JA 1IYIA 2YCDA 2JZRA 3TRQA 2RM6A 3ZVJA 2LJKA 4AJ7A 3H1NA 2VO4A 3ED3A 4TOPA 4GQFA 2VM1A 4MP4A 1TK0B 1BX9A 4POBA 2DJKA 1S3DA 4KCAA 2AAWA 2E2GA 2HT9A 4MF7A 2LJAA 3FHKA 3I6AA 1YZXA 2L57A 1TU8A 3VLNA 5ECMB 2JADA 3MNGA 1FVKA 1SK1A 2B5EA 4FIWA 4HDEA 3DMLA 1GSQA 3APOA 3WGXA 2L6CA 2B5YA 3D4TA 1Q98A 2RM5A 5AIVA 2OACA 2N5FA 2L59A 2V2GA 3UARA 4V2LA 2GQKA 3L9UA 2IIYA 5B7CA 4HZ4A 2GGTA 4GSNA 4K6XA 3HD5A 1EOHA 1YJ6A 3G9BA 1ERWA 4E8HA 1QUWA 4PURA 1GULA 12GSA 2H6ZA 3EU4A 5CRHA 5LD0A 4K0GA 4MF5A 3C71A 4ZL7A 4IELA 1XXUA 5KEJA 4KUNA 2FD3A 4OWYA 4KSOA 1JLWA 2H6XA 2C80A 1SD9A 2CX3A 2FLSA 4K7NA 1K3OA 1DBYA 1G7EA 2MBSA 2K6VA 3VWVA 5DALA 3ZVJD 1GH2A 5G1LA 2DIZA 2LUSA 4HS1A 4MZBA 3R2QA 5IPHA 1UC7A 1SK2A 2LQQA 1XPVA 1M2AA 6GSYA 2H76A 2DBCA 4Q5FA 5IMCA 2P0GA 4IP6A 1W4VA 3OR5A 1QFNA 1TDIA 2BJXA 3FR6A 4HI7A 11GSA 4IKHA 3VPQA 4OD7A 2PWJA 4MJBA 4DVCA 1THXA 2H0IA 2YZHA 2H0GA 3L4NA 3UEMA 5J4UA 2KP1A 2L4CA 4LMWA 2LQOA 4WF5A 5DCGA 4P3YB 1XVQA 1AW9A 1TJDA 5DQSA 2R2JA 2PVQA 3CTFA 1G0TA 1TRWA 3J7Yb 5FT3A 2HI7A 2H01A 2OBIA 4JE1A 3GRXA 1BYEA 1XW5A 3RAZA 1OYJA 1EGOA 2GQMA 2B7KA 3K8NA 8GSSA 2V6OA 4QL7A 5IMZA 4TR0A 1EWXA 4KCEA 5LNKe 1ST9A 2GTUA 2GSTA 4O32A 4JRRA 4MLYA 1CQHA 1FAAA 4ZL9A 3HYPA 3PGTA 2VCZA 4BWQA 3A5WA 2LRNA 3KH9A 3A2VA 2D2ZA 1GTIA 2PPTA 4EE0A 1WIKA 3FZ5A 3UIWA 1AC1A 4KE3A 4K7OA 1AQXA 4MK3A 4TR3A 2VM2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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