2O8VB

Paps reductase in a covalent complex with thioredoxin c35a
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPAKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 3'-Phosphoadenosine-5'-phosphosulfate Reductase in Complex with Thioredoxin: A Structural Snapshot in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphoadenosine phosphosulfate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2o8vB00
2C4JA 4OD7A 1BJXA 5L71A 1FOVA 2H1GA 2BJXA 1HNCA 4GWRA 3TKRA 2LJRA 1GUMA 1V58A 4BWSA 3KP8A 1SL2B 4POMA 4MF6A 1NSWA 1TRVA 1J9BA 2Z9SA 5J9CA 4XS1A 1EEJA 4IGJA 1WRYA 5CRDA 4HQZA 4OFNA 5D73A 5EPFA 1E2YA 4ISDA 5FT3A 5DALA 4LMWA 1MEKA 3ZTLA 1WOUA 1T4ZA 2I1UA 1M0UA 1XWCA 5GSSA 2GVPA 1FO5A 3HZ4A 2DJKA 3WT1A 2H74A 3EC3A 1ABAA 5AISA 5B8AA 4QQ7A 3TJKA 2VL3A 4WR5A 2VLUA 2VLVA 5ID2B 2H6YA 3FR3A 2P5RA 4YQUA 3J7Yk 1NHOA 2YPMA 2C0DA 3FZ9A 2VCZA 3KMNA 1AAZA 4H86A 4OCFA 4AJ8A 4JRRA 1W89A 4WF4A 1XIYA 2ON5A 4O92A 5CNWA 1I9DA 1YY7A 2JSYA 1GLPA 3FW2A 5F06A 3FRCA 3F4TA 4AGSA 1MD4A 1GNEA 2JSZA 2HI7A 2X8GA 2LJKA 2REMA 1X5DA 4MZWA 3LGCA 3I6AA 5DVBA 4WKWA 1K3OA 2DJ0A 3DGQA 1YF1A 2GSSA 2CZ2A 2K9FA 4NV2A 2CT6A 4PNFA 1ML6A 2I3YA 1XPVA 1YZXA 1NM3A 1FG4A 4IHUA 3KH9A 1VF3A 4IELA 2OBIA 2TIRA 1UN2A 2QKEA 3ISOA 2GQKA 2WB9A 1AQVA 5INYA 2H70A 2H0HA 5DQYA 5J5NA 5IM9A 4EXJA 4JE1A 4Q5FA 2B3SA 2HSHA 3MDKA 4K0NA 3A3TA 5J41A 1XW5A 1M99A 1G6WA 4OO5A 3HCZA 3KZQA 3GL3A 2H01A 5EVOA 3CSHA 2B5XA 2PVQA 4K6XA 4EE0A 4XS4B 3VK9A 1SK2A 4BA7A 4KCAA 3ZFLA 3H1NA 4KX4A 1VF1A 2FCHA 1K0NA 4MF7A 4F03A 1E6BA 4TR1A 2VCQA 4ECJA 2JL4A 2LQOA 2AAWA 1AIUA 3Q74A 2IFQA 4RI7A 5ENUA 5AGYA 2JZSA 4JZQA 4MZCA 2DLXA 4OWYA 4KGIA 1AUCA 4N11A 3DD3A 4CW9A 4EF0A 1FW1A 4JEDA 3IXRA 1IYIA 5ECRB 2R6KA 3TRXA 3F3RA 2G0FA 2D2ZA 1V40A 3DEXA 3G7IA 1EV4A 1ZMAA 2DJ1A 4MJAA 1B9YC 3P90A 1ZZYA 1K0DA 1DUGA 5D9VA 5F0GA 3ZMKA 5JWOB 1T3BA 4N0VA 3CTFA 1FVKA 1XWKA 3TJFA 2C3TA 3FHKA 1XCCA 4FH8A 4L5OA 1MDJA 4MZBA 4HU9A 2H73A 2YZHA 2OACA 2QGVA 2F3MA 1GSQA 2V1MA 2DIYA 4I5QA 2HZFA 4IQ1A 2VM2A 5B6MA 3GUSA 5ECPB 2MBSA 4CDOA 3M0FA 1EGRA 1O85A 5GAND 1R4WA 3M9JA 2CZ3A 2CAQA 1U3IA 3F63A 5COHA 1YEPA 5IQYA 5J4UA 1GLQA 2FWFA 3LORA 1LBKA 4FYCA 4PUAA 3EWLA 2H6XA 4YAVA 2R4VA 4G10A 5LD0A 1PGTA 2GT6A 2F51A 4OO4A 2VIMA 3TKQA 3I69A 2F9SA 4Q5QA 2YV7A 9GSSA 1OC9A 1R7HA 2OBKA 1FB0A 1O73A 2PWJA 4ZL9A 2FA8A 3F9UA 3IOSA 2DSAA 1VGLA 5AN1A 4Q5RA 1BG5A 2IJYA 1NW2A 1PL1A 5KN0A 2VCTA 3FR9A 1OC8A 1VRSD 3HY2A 5KN1A 2DC5A 2P31A 2XHFA 3AY8A 4ZB6A 2VCXA 3N5OA 3C73A 4V2LA 4WBRD 2YWMA 3GHAA 3EE2A 2L5OA 1SD9A 1GUHA 1A8LA 1GSYA 2A4VA 1URMA 4DEJA 2WULA 2VOCA 3I43A 6GSYA 1XWBA 1HNAA 3D21A 3EU3A 2HSYA 4E8HA 3QCPA 1M2DA 3W6GA 1M9BA 1GP1A 4ECCA 4V1Ap 1SK0A 1S3DA 2JADA 2R37A 2PMTA 5DJLA 2H1AA 19GSA 5G1KA 1PA3A 2AYTA 4FIWA 3G9BA 3IBHA 3TRQA 1KEBA 2QC7A 5ECKB 2P5QA 2C80A 4MPFA 1WJKA 4IP6A 2V6KA 3F6DA 2LUSA 2BTOT 1HYUA 3GURA 1H4OA 5IOWA 3LEFA 5J9BA 1ZCPA 3UOMA 1XOAA 2V6OA 2HZEB 1OE8A 4O5RA 5FWGA 2B5YA 4O32A 3QFAC 5IMDA 4KA0A 20GSA 3F6FA 5HR3A 1SU9A 2DJ2A 4I97A 4PQ1A 2E0QA 2PVOC 3WT2A 4L0UA 3ZLPA 1C72A 4BVYA 2NBSA 1ERTA 1ERUA 2H6ZA 2FD3A 3ME8A 6GSSA 2GZPA 1G6YA 3GTUB 1GSFA 3VWXA 4D73B 2VO4A 2WZ9A 3APQA 1X0RA 2OE3A 2MYGA 3IR4A 3LYKA 3TGZA 2RM5A 1TRUA 4POKA 4K7OA 1V2AA 2CA8A 3TUEA 2ES7A 5C04A 2PN8A 1RQMA 2LNSA 4AJ7A 4MJBA 3KJYA 4Z7XA 4ZIJA 1GSEA 2EC4A 1X9SB 1EP8A 3HD5A 3MWHA 1ACVA 3F4RA 1YKCA 4GRFA 3PGTA 5G5EA 4PNGA 1SD8A 3TKSA 2YV9A 2L59A 3RHBA 2YANA 2GLRA 2X64A 3SBCA 5C00A 5GAPD 4J57E 1YJ6A 3U6VA 3WGXA 1SKRB 4FO5A 2LSTA 3FEUA 3HJPA 1ZYQB 3DRNA 2YWOA 2K18A 3LFLA 1UA5A 4HS1A 3SWLA 5D8IA 5IMZA 4XCSA 1S3CA 1AQXA 1YKAA 3TRPA 3QPMA 3CYNA 3ZREA 2GSQA 3RPNA 2EIQA 5IO2A 1PKWA 3BBYA 2FHEA 1WWJA 4ML1A 2YWIA 2CVKA 3U5RE 1SL0B 1TK5B 1XVWA 2ZNMA 2LEGA 2YWNA 2LKUA 4YQMA 4BL7A 5DCGA 5IIZA 4NV5A 1M7TA 2LJAA 2PPTA 4GLTA 2OA7A 2C0EA 2RUFA 2R3XA 4G9HA 1GSSA 4MJCA 3VPTA 3KCMA 1G0TA 2VL9A 1AC1A 3APSA 4GF0A 2C3NA 3H79A 2N5FA 2RUEA 4IS0A 3GYKA 1PX7A 3EMXA 2MBTA 3IHQA 4X43A 3C1RA 3EYTA 5HQPA 4XHMA 1DE2A 4IJIA 5CAXA 2H30A 1OKTA 1ON4A 1G7OA 1QGVA 4ZBDA 1W4VA 3A2VA 5JWQB 5F07A 3FKFA 3ZIVA 1A0RP 1K3LA 1UVZA 1TU7A 1PKZA 2A2SA 3LG6A 2H0GA 5H5RA 4OFTA 2CAIA 4P3YB 1ZOFA 1XZOA 2H71A 3GKXA 2VUPA 3HZ8A 3KMOA 5JCWA 2TRXA 2B1LA 3DMLA 4TN8A 2MMNA 5ECMB 1ILOA 3UAPA 3GSTA 4GSNA 2GT5A 1PN9A 2J23A 1ERVA 4EL1A 2RLIA 1R5PA 4NHWA 1DE1A 6GSUA 4EKZA 2YNXA 2WJUA 3LQ7A 2KP1A 5IOXA 3DVWA 1Z5YE 4N30A 1X5EA 1USBA 10GSA 2E7PA 1U6TA 5F05A 2DIZA 1V57A 3DIEA 1PMTA 4PQHA 3FZ5A 4XRAA 2H76A 4K2DA 1K0CA 2WCIA 2IMEA 5JCGA 3TCOA 4O7HA 3L0HA 4KB3A 2AB6A 2AJQB 5D9XA 2J9HA 2AV4A 3N9JA 2K8VA 1FB6A 1TK0B 5IMAA 4ML6A 1K0AA 3A2XA 3TJJA 1EP7A 3C71A 1MTCA 5IPHA 3CXGA 2MMOA 1FAAA 4DSQA 3VWWA 2O8VB 4RUVA 4TR0A 3ZL5A 2ZCTA 4K1FA 4YH2A 2GS3A 5G1LA 3H4KA 2AHEA 3QD9A 5DALB 2OE1A 4WF5A 4N0ZA 3E9JB 3D4MA 3NIVA 1M9AA 3EURA 3UBLA 3KTLA 4TXOB 2P0GA 5G2ZA 1FVJA 3D4TA 2KLXA 2M46A 4MH3A 5ECOB 3IK7A 5H5QA 4EDYA 4JR4A 5CP1A 3LXZA 3WYWA 4PURA 4Q5NA 4WEYA 2VD1A 3KTBA 4OMVA 1EV9A 1S3AA 4TKYA 3GV1A 1THOA 3E0UA 2OE0A 2B1KA 5DCHA 2DJJA 5JCUA 1A0FA 3M9KA 4V1Ag 2CX3A 2MMAA 1TTZA 2V32A 4PGTA 1O6JA 1EEMA 4PXOA 3GNJA 1G7EA 1Q98A 2VLTA 3ZITA 1BEDA 2OADA 5D96A 1TRSA 4IN0A 1ZGNA 2GZYA 4KE3A 3HA9A 1LU4A 2B5EA 1KTEA 1DSBA 1PRXA 3L9VA 18GSA 1U3AA 3D0ZA 4HJMA 4KAEA 4N10A 2KOKA 1OAZA 2FWHA 5IO0A 4I6XA 5B8BA 1LJRA 3P2AA 3H8QA 3WGDA 3QR6A 1JZOA 1Z7PA 5CO3A 5G5FA 1PD21 1SYRA 3ZZXA 4D73A 4XS6A 3C1SA 3CMIA 1SJIA 2IMFA 1A2MA 3FZ4A 4POLA 2VL2A 3O3TA 4MK3A 2O87A 3GX8A 3RBTA 3FY7A 1OE7A 3F0IA 2H19A 1GSDA 3QDNA 3RHCA 2X99A 2NPBA 4ZBAA 1SKWB 1B4QA 1GSUA 4TOPA 2H66A 3C8EA 4NMUA 2L5LA 3TKSE 1IYHA 2IMDA 2PBJA 1JZRA 1WIKA 4KSMA 4KSOA 4TR1B 2HE3A 3DWVA 3GKKA 5A4WA 2I9HA 1ST9A 4RQXA 2BMXA 3GN3A 1EZKA 2M72A 1A2JA 3IPZA 4DSSA 3UEMA 2ALBA 1GRXA 1FHEA 3KEBA 4MLYA 1TDIA 1F3BA 3S9FA 1TP9A 4K0GA 1M2AA 4CHSA 3ERGA 5CRWA 5KN2A 1GTUA 1XBSA 3QOUA 1ERWA 3E3EA 7GSSA 2RIIA 4HOJA 2E2GA 2MZCA 4MABA 2VCVA 2H72A 1A23A 2L4CA 3MSZA 4PUFC 5HR0A 2I81A 1GTBA 3GH6A 1XWGA 1B4PA 6GSVA 4ACSA 1F3AA 1THXA 2IN3A 1ZL9A 3ZVJD 4MA9A 4J2FA 3ZRDA 1B9XC 1YF0A 5FHIA 8GSSA 3MNGA 3RDWA 4AJ6A 3GA4A 5GSTA 4IVFA 2GSRA 3A5WA 4HJ2A 5B7CA 4HI7A 1BAYA 3LSZA 4GQFA 5AIXA 1N2AA 5DAKB 2IWTA 3HVXA 2L57A 1PX6A 3D22A 2C1YA 1TRWA 2H0IA 3A2WA 3KP9A 2NDOA 4XRDA 1JFUA 3IV4A 4IP1A 1TW9A 5IMVA 5HFIA 5KEJA 1GULA 5ID2A 1QMVA 3PINA 1DBYA 1KBNA 3QMXA 1V98A 4IBPA 3QAGA 4TW5A 3HJOA 3GKNA 4GSTA 3GMFA 2MMZA 4MDCA 1I5GA 3KIJA 2LRTA 3UMAA 3VFIA 3D6IA 12GSA 1XVQA 3D5JA 1BYEA 2DMMA 3CRTA 2EIRA 5ECHB 4MP4A 3LWAA 2VCWA 4F82A 1B8XA 1QFNA 3US3A 4I2TA 1EWXA 2F8FA 5DBQA 4F0CA 4DVCA 3VI5A 2YN1A 3P7XA 2FLSA 3KM6A 2VM1A 2WFCA 1OVNA 5CRGA 4PX1A 3TKSC 3O76A 3GH9A 2C3QA 3HJMA 4X1UA 3IK9A 1T7PB 4ZBBA 3IAS2 1WPIA 1O81A 3GSSA 3IAM2 4GCIA 3FZAA 2C0GA 4KDXA 2CQ9A 1UC7A 2FWGA 4KW6A 1KNGA 4MH2A 3VURA 3ZIJA 2O85A 14GSA 1TJDA 3EMPA 5D9TA 4ZILA 5ABRA 4XS4A 4I2UA 3DXBA 3C7MA 1SKSB 3P8WA 2FUG2 2K8SA 2LRNA 3L78A 1JZWA 3H93A 3KH7A 3ERFA 1ZYEA 1X9WB 1N8JA 3BJ5A 3ME7A 4EDZA 1T8EB 4MF5A 1F9MA 4HUAA 4HZ2A 1A2LA 1SK1A 4KNDA 4E8EA 4L5LA 4X0XA 2LTKA 1TI1A 4J56E 3GRXA 1TU8A 1WE0A 1Z7RA 4TXOA 1O7UA 2HYXA 4K9ZA 4G2EA 4WR4A 5ELAA 4ECBA 3IRAA 4QL7A 2NVLA 3HVVA 4EC0A 1MDKA 2HRFA 3QAVA 3JCML 2O89A 2L6CA 4TXVA 3BOAA 3Q6OA 2GZZA 1AW9A 4MJEA 1A24A 3LJRA 3UBKA 3K8NA 3TB2A 4MPGA 2K6VA 3R2QA 2FWEA 2G2QA 5ELGA 3TJBA 2CVDA 4XTSA 2E2MA 4GQCA 3QFBC 4IQAA 4KDUA 1OYJA 1K0OA 4ULXA 2IPAA 4L8EA 3CBUA 4TRXA 3DYRA 3ZMLA 3ZVJA 3EU4A 3F3QA 3TDGA 5E4WA 2LQQA 4POBA 3L9SA 11GSA 1U88A 2ON7A 2XPDA 2L6DA 2R5GA 2FNOA 5E59A 1Z3EA 3RAZA 3FK8A 4NWYA 3ZYWA 4K8MA 1QUWA 1CQHA 2WDUA 1TK8B 3CRUA 3TKPA 4JR6A 5CYYA 2A2RA 1X5CA 2JACA 1QK8A 3F4SA 2CX4A 2KHPA 1XW6A 2HFDA 4WBJA 3UVTA 2F8AA 1F2EA 3HKRA 4TR4A 3APOA 4MMMA 1TOFA 4PQIA 4YAPA 4RQRA 3CSIA 1MD3A 3NZNA 4ZXGA 5HFKA 2PERA 2PU9C 4V2MA 1SJZA 3CTGA 4DSRA 1GH2A 2HT9A 1XFLA 4ZL7A 1HQOA 3IE3A 2XC2A 2PUKC 3IDVA 1GWCA 1JZDA 2H75A 1AXDA 3MAKA 4IKHA 1JLWA 4LL4B 4LLRA 5HFGA 3UARA 2TRCP 4F0BA 4GXZA 2NTOA 1QQ2A 4EVMA 2LNTA 2GDRA 3O6TA 5DQSA 5ECSA 5G31A 5A4VA 1HD2A 2DBCA 1XWAA 2X8HA 4LA1A 1PQNA 2XPEA 1SENA 6GSTA 1O8WA 3OR5A 2N5BA 2GSTA 5DJMA 3WGEA 1OKDA 1YEXA 2N5AA 3PH9A 2HRNA 3L4NA 3Q18A 2YJ7A 3Q19A 1Z6MA 6GSXA 2O7KA 13GSA 4NAXA 4XIHA 5J3RA 3VWVA 4WETA 3QAWA 4HU7A 3UL3A 3FYGA 5HR2A 3TOUA 2GQLA 3W8JA 2HZEA 3I9V2 22GSA 2GTUA 3IC4A 2LRCA 1GTAA 1RW1A 3CSJA 3KGKA 5DAKA 3HDCA 2M80A 2IMKA 2V2GA 4TVEA 4L0WA 1XOBA 5IMFA 2X8CA 3F8UA 3GTUA 4BWQA 3EVIA 4GTUA 1HNBA 5LNKe 1Y25A 2VD0A 1SL1B 5ECIB 1EGOA 4ID0A 2YCDA 1GNWA 2DJ3A 1PSQA 1M2BA 1SJ6A 4ECIA 2R2JA 5CRHA 2VAFA 4G19A 4HEA2 5EL8A 1XXUA 3RPPA 4LL1B 5B6NA 5CREA 4F9ZA 1H75A 1Z6NA 2VL2C 2YOIA 2H1DA 5AIVA 3M1GA 3GX0A 3HYPA 4FYUA 2L4QA 5ECLB 1VF4A 4KCEA 2IFQB 2OKAA 4RI6A 2H8LA 2FGXA 2V41A 3NOFA 4MCUA 4JBBA 4K7IA 1JLVA 4ZL8A 1X9MB 4HZ4A 1YDKA 2CVBA 2FY6A 3VPQA 4HDEA 4IW9A 5G30A 4V2NA 5DDLA 4TR3A 3VLNA 4OCEA 5EY6A 4BPYA 3M3MA 3DVXA 1YQ1A 3VI7A 3BD2A 4GSSA 2OJLA 1TI3A 1VF2A 3GKMA 1BQ7A 1J08A 2WRTA 3UIWA 2KUCA 1BX9A 5F8BA 1QXHA 3ZFBA 1R26A 3DKSA 2XBQA 4ILFA 4BVXA 1MDIA 4ZB8A 5HR1A 4NXIA 1B48A 3ED3A 2YJHA 1SYXA 1K0MA 3L9UA 5IMCA 2IMIA 1J0FA 5JWRB 3GIXA 3EINA 3VWUA 2HLSA 1K0BA 1A8YA 3UVHA 4I8BA 2I4AA 2JZRA 1GTIA 2IIYA 2CV4A 3KD0A 2KP2A 3LYPA 4YQVA 1O8XA 2XBIA 5ECQB 2AUVA 2HXKA 2PGTA 5A4UA 4LMVA 3ERWA 4NPBA 3HXSA 4KDYA 2YZUA 5D93A 17GSA 2C0FA 4JU5A 4ZB9A 1JHBA 4HQSA 1CQGA 1V9WA 3G7JA 1U87A 2QSIA 2WS2A 1Q4JA 4KUNA 1WP0A 2DMLA 4QL9A 1R5AA 2C8UA 4K7NA 1T1VA 3KXOA 1NHYA 4NHZA 1K3YA 5IPGA 3PR8A 1AQWA 4OFMA 1GUKA 3WD6A 1OC9B 2JU5A 3BCKA 2LS5A 3HVSA 1EOGA 1EOHA 3UJ1A 2B7JA 2WGRA 5A5KA 2GGTA 3GFKA 2B7KA 4FYBA 5GZZB 3G7YA 4EO3A 5H5SA 1Z9HA 2GQMA 3M8NA 1TKDB 1RK4A 2HNLA 4AF2A 4IJ3A 2EIOA 1GL8A 3W8SA 2B6MA 3IA1A 2H1BA 4KH7A 2ZUPA 5ECNB 1Y6EA 1F6MC 2YP6A 1WMJA 1T4YA 3TOTA 2FA4A 4EUYA 3V1WA 1OC3A 1TXXA 3J7Yb 3BCIA 2LV3A 3HHVA 4DSSB 1F37A 4F2IA 5D9WA 1PL2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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