2O8VB

Paps reductase in a covalent complex with thioredoxin c35a
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
b'SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPAKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 3'-Phosphoadenosine-5'-phosphosulfate Reductase in Complex with Thioredoxin: A Structural Snapshot in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphoadenosine phosphosulfate reductase
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2o8vB00
2XPEA 1A24A 3KH7A 3ZITA 3ZVJD 5KEJA 4O32A 2QC7A 1GL8A 4EKZA 1FOVA 1KTEA 3TDGA 5G5FA 4K1FA 2PUKC 4HZ2A 4ZB8A 2KP1A 3GL3A 12GSA 3ZIJA 1WMJA 4WETA 3F4TA 1OKTA 2IMKA 3KD0A 2H6XA 5F8BA 4MZWA 4NXIA 2YANA 4OFTA 3FZ5A 4IW9A 5AISA 1XBSA 4ECCA 5A4UA 3GTUB 2V2GA 2HFDA 4POLA 4Q5NA 5F06A 3CTGA 1I5GA 1GP1A 4K2DA 4PURA 2B7KA 2N5AA 3GKNA 2OKAA 2BMXA 4YQMA 3I9V2 4X1UA 3WYWA 1JZOA 1VF3A 1SK2A 4NV5A 3RDWA 3DYRA 3AY8A 3GFKA 1B8XA 1Z9HA 3H93A 3UOMA 1SKWB 3D4TA 1VF4A 1RW1A 5ECHB 3TJGA 3A2WA 5DQSA 4EF0A 3NIVA 4YAPA 1KEBA 3GHAA 3PGTA 3H79A 3G7YA 1WE0A 2EC4A 1B4QA 3G7IA 2LQQA 2O7KA 2L4QA 2FGXA 5IMFA 2C0FA 4HU7A 2H01A 5B6MA 1K0MA 1HNBA 2IMEA 1FB6A 1OC9B 3LYPA 4IHUA 3MSZA 1M7TA 3A2VA 2F8FA 5C04A 1YY7A 1ST9A 1AIUA 2M46A 3VURA 5DBQA 3CBUA 3WGXA 1EWXA 4TW5A 4OO5A 5HR0A 1BJXA 4ZL9A 4G10A 2C0GA 3L9SA 4JR4A 2HRNA 5ENUA 4GSTA 2CAQA 4RI7A 4K7OA 4V1Ag 1J0FA 2XHFA 2YCDA 3C1RA 5IPGA 5J9BA 4XCSA 6GSWA 4PQ1A 1XW9A 5DALA 5B8BA 1TJDA 1W4VA 4G19A 3F0IA 1OC3A 4J2FA 3QPMA 1YQ1A 2YV7A 2FWGA 2F3MA 5ABRA 2VL3A 2GSSA 5JWQB 2L6DA 1IYHA 3BJ5A 5FWGA 1FO5A 1V58A 5INYA 10GSA 5HR3A 1A2JA 3SWLA 18GSA 4IQ1A 1Z6NA 1V2AA 1BYEA 3ZMKA 5IOWA 2VL2A 3D5JA 3RHCA 5DAKB 1XVQA 3GX8A 2GTUA 2WJUA 1A8LA 2HZFA 2F8AA 2V41A 2P5RA 1V98A 1DBYA 5ECNB 4MMMA 3IXRA 3HVXA 4GRFA 4RQRA 3O6TA 5D93A 4BL7A 1TI1A 3HY2A 2H30A 2WRTA 2A2SA 4NHWA 3APOA 3UBKA 1M9AA 2XPDA 3IK7A 3L0HA 2RUFA 5D9VA 2OE3A 2H6ZA 3FEUA 5IQYA 1ZL9A 5ECRB 4TR1B 3HHVA 1VF1A 1WRYA 4PQHA 2YWIA 1JZWA 2HSHA 3C8EA 4GF0A 3QR6A 3BCIA 2RM5A 4EO3A 4POMA 3DD3A 4DSSA 4PXOA 1T3BA 3QAWA 8GSSA 2CVBA 4FIWA 2AUVA 1A8YA 2DJ1A 1MDKA 4I97A 5ECQB 2WZ9A 3I69A 5HFIA 1Z7PA 3GYKA 1X9MB 3GNJA 1YJ6A 4YQUA 3ZMLA 4OFMA 1ZZYA 4I2UA 4XS6A 3TKSE 3VWXA 2GVPA 1PL2A 4F9ZA 2H1GA 1ZOFA 2YWOA 4O92A 3QOUA 1EP7A 3TOUA 2GQKA 4JRRA 1R5PA 3CSHA 2NPBA 3I43A 4L5OA 3VK9A 4HU9A 4NAXA 1WIKA 5J41A 2H6YA 1OVNA 2VCVA 3D21A 3QAGA 3U5RE 4D73B 1XWCA 2LJAA 1TRWA 2I1UA 5D9XA 1X5DA 2ZUPA 3D0ZA 4DSRA 4MPGA 2YJ7A 2TRXA 3C71A 3UL3A 4HEA2 2JSZA 4TVEA 5D9WA 1FHEA 2PU9C 1IYIA 2C0EA 2OE1A 3WT1A 5E4WA 1MTCA 1ABAA 4TN8A 3ISOA 2I9HA 3HJPA 3TJKA 5J5NA 3MWHA 1CQHA 1HQOA 3H8QA 3O3TA 1F3AA 5ECMB 2YV9A 2GQLA 4XS4B 4IP6A 1WPIA 1XW5A 3GURA 1T7PB 1KBNA 1T4ZA 4PX1A 3C1SA 3E3EA 4NV2A 1TRUA 2DIZA 3ERWA 4FYUA 1XWBA 2VOCA 3ZIVA 1OE8A 4PUAA 4L0WA 1XZOA 5HQPA 1GSDA 3KP9A 4O5RA 4EL1A 4QQ7A 4NPBA 3EURA 5D73A 5AN1A 1DSBA 4ULXA 2NVLA 3F4SA 2R6KA 1N2AA 2O87A 4K8MA 2L6CA 1HYUA 2IFQB 1RK4A 1EV9A 2H1AA 2FY6A 3TKSC 3IR4A 1I9DA 1EZKA 4BWSA 1NW2A 5HFGA 5GAPD 3QDNA 2KHPA 3DWVA 3TJBA 2AJQB 2ZNMA 4ECBA 3FY7A 2C4JA 2GZYA 1A2MA 5EL8A 1A0FA 1GSYA 2IMDA 3DGQA 4CHSA 2GSRA 2VLUA 1QUWA 4OCEA 2D2ZA 1ERVA 2KLXA 5F05A 4DEJA 2AB6A 2PVOC 3D22A 5AIVA 3EMXA 1QK8A 5J4UA 1V57A 3BD2A 5LD0A 2F51A 3FKFA 1E2YA 3GSTA 3FR3A 2HE3A 3I6AA 1NHOA 5L71A 4Q5RA 2GGTA 2VCWA 1BAYA 4RI6A 3NZNA 4IVFA 4HQSA 3RPPA 4OWYA 3DKSA 5AGYA 4HJ2A 4J56E 2I3YA 1PKWA 1LBKA 3BBYA 2CAIA 2L57A 1PL1A 3DEXA 4PGTA 2HLSA 1X5EA 1SK0A 2HZEA 2A4VA 2PGTA 1OYJA 4MZCA 2PVQA 4PNGA 1AAZA 1PGTA 5G30A 1M0UA 2LKUA 2G2QA 3VPTA 4N11A 4ZIJA 5IO2A 3PR8A 1SJ6A 2LV3A 2I81A 2K18A 2OACA 1U3IA 2OA7A 4KX4A 4GSSA 1ERWA 2C1YA 3LXZA 5IO0A 4TR0A 2OBIA 4KDUA 1OAZA 1JFUA 2HNLA 1PD21 3F9UA 2WDUA 1TU7A 4XRDA 4ZB9A 6GSYA 3IAM2 1YZXA 4MH3A 3MAKA 4N0VA 1PRXA 14GSA 2XC2A 1SU9A 2DC5A 4TRXA 1YDKA 1VRSD 2H8LA 4BWQA 2P5QA 1G6WA 6GSXA 2DBCA 1YEPA 4GXZA 3DIEA 4FH8A 1ZYQB 1F37A 3TJFA 4IGJA 3RPNA 2GDRA 3C73A 5H5RA 3VPQA 1JLVA 2LQOA 1QMVA 1URMA 1FB0A 1GSFA 3GKKA 3GH9A 3GTUA 2R5GA 2K9FA 2YZHA 4MCUA 2OE0A 2I4AA 2VLTA 1X9SB 2IWTA 2DMMA 11GSA 5ECOB 4KGIA 4MH2A 4PNFA 5KN3A 1GRXA 3CTFA 3UVTA 4DVCA 1H75A 3KTLA 1T1VA 5D8IA 1X0RA 4L5LA 2R3XA 2C80A 2E0QA 3D4MA 2H1BA 4MP4A 9GSSA 3G7JA 3TKQA 1GLQA 2L5OA 1VF2A 1OC8A 4XS1A 1M2BA 2C8UA 3KP8A 2HYXA 3LQ7A 4LLRA 1AXDA 1K3OA 1Z5YE 2L4CA 3MNGA 5A4VA 3J7Yk 3UAPA 4ID0A 5ECKB 3KZQA 3VI5A 5IPHA 1A2LA 4HI7A 4N0ZA 2AV4A 4WR5A 3GKMA 1FAAA 2B5YA 3VWWA 2IJYA 5EY6A 1ERTA 2OBKA 3UARA 5ELAA 3ZLPA 2CT6A 2EIOA 4PUFC 3KIJA 3N5OA 3ZREA 2VL2C 3KTBA 5ECLB 1PSQA 1Y25A 3H1NA 4WEYA 3UJ1A 2HSYA 2H0IA 4BA7A 2B7JA 2GT5A 3QD9A 1GSEA 2TIRA 4FO5A 2J23A 3DRNA 1PKZA 3GN3A 1XCCA 6GSSA 3RHBA 1T8EB 1TDIA 4KH7A 1B4PA 4K0GA 20GSA 3CRTA 4WXTA 4JZQA 4K6XA 1TI3A 1OE7A 5G1KA 4P3YB 1R4WA 4KDXA 6GSVA 4L0UA 4EXJA 2QKEA 4MF5A 4GTUA 2X8HA 3GL5A 4TR4A 5IMZA 5JCUA 2CZ3A 3IDVA 2O8VB 2DLXA 2DJJA 5AIXA 1SYXA 5CO3A 2CVDA 4EUYA 2C3NA 3EU3A 4DSQA 3GX0A 4HJMA 2JADA 1TK8B 4HS1A 5A4WA 4G9HA 5D9TA 4RUVA 4KAEA 1SD9A 3SBCA 4WKWA 4OMVA 2DMLA 4F82A 2B1LA 3FYGA 2ON7A 1XOAA 2L59A 1X9WB 1ERUA 3M9KA 3A3TA 2IIYA 3GMFA 3F6FA 5GZZB 2DJ3A 3IE3A 3W6GA 5DAKA 3TRQA 1TP9A 4OD7A 4KNDA 2FLSA 3IOSA 1GSSA 2ES7A 5IMDA 6GSUA 3EWLA 1DE2A 1TU8A 2V1MA 2VCZA 3ZFLA 3RAZA 2CX3A 3D6IA 2FWFA 3HVVA 1FG4A 1AUCA 2WFCA 4MDCA 2B5XA 3IAS2 2YP6A 5HR2A 5J3RA 2LRNA 4HQZA 3IV4A 3EINA 2N5BA 5DQYA 1JLWA 2H74A 3LG6A 4IBPA 1EP8A 1U6TA 4GCIA 6GSTA 5JWOB 3KH9A 2E7PA 1NSWA 1XFLA 5GSSA 1GUMA 5JCGA 2P31A 4KE3A 1U87A 1UC7A 3L9UA 2LJKA 3APQA 2V6KA 5ELGA 4MJEA 4E8HA 4TR1A 1U3AA 2GQMA 3O76A 2F9SA 22GSA 3GRXA 4IQAA 4IP1A 1M2AA 5ECPB 4HZ4A 1M9BA 1QXHA 3LWAA 5ID2B 1R26A 4ZBBA 1Z7RA 2DJ0A 4OCFA 1TKDB 1GTUA 4ML6A 1B9XC 1F2EA 1JHBA 2VCQA 3F63A 3ME8A 1Q98A 5H5QA 3CXGA 19GSA 3M1GA 1B48A 1JZRA 1PX7A 4I6XA 2KP2A 4O7HA 5KN0A 1ZMAA 2JZRA 1WOUA 3OR5A 1MD4A 3F3RA 2VL9A 4NWYA 5DJLA 2YJHA 3F3QA 1THOA 2LUSA 1J08A 2LNTA 3ZFBA 5G31A 5CRGA 3FZ4A 2IN3A 3DVXA 4POKA 2RLIA 2FWEA 1MDIA 4D73A 4EVMA 1AQVA 4NMUA 2GSQA 1O73A 2GZZA 2PBJA 2FHEA 3TKRA 2MMAA 1TK0B 1THXA 4YAVA 1J9BA 1Q4JA 2PPTA 3M9JA 1SKSB 4MABA 4KW6A 4TXVA 5IMCA 4Z7XA 4JBBA 5IM9A 2H66A 3P2AA 1CQGA 4ML1A 2XBIA 5CYYA 1E6BA 3FZAA 1SL0B 1TK5B 2R37A 1WP0A 4ZBDA 2MMNA 5H5SA 3ZVJA 1SL1B 1S3CA 5CP1A 1LJRA 1YKAA 4IKHA 1X5CA 1M99A 4KA0A 2DJKA 5IMVA 4HDEA 2LTKA 4GLTA 3KEBA 5F07A 1GULA 1ZYEA 2R2JA 3G9BA 4EC0A 7GSSA 4XS4A 2YNXA 3HCZA 1GSQA 1ZGNA 2L5LA 1PMTA 3FK8A 1K3LA 3W8JA 3FRCA 4X43A 1TRSA 2H75A 1SENA 1MEKA 1PN9A 3ERGA 2WS2A 1UA5A 1VGLA 3CSIA 5DCGA 5DVBA 1SJZA 4JU5A 2CVKA 2PERA 3M0FA 2FUG2 4MF7A 1RQMA 1GTBA 1F3BA 1W89A 2X8GA 1K0DA 2NTOA 3LGCA 3HVSA 1HNCA 2WB9A 2KUCA 2E2MA 5CNWA 1Z3EA 5CRDA 3HJOA 3IHQA 2PN8A 4K9ZA 2LRCA 3CYNA 3EMPA 1FVJA 2LNSA 1QQ2A 2H70A 1SJIA 4IS0A 4MZBA 4TXOA 2IFQA 3QCPA 2MYGA 4QL7A 1SK1A 1ILOA 4V1Ap 3HZ4A 2O89A 3KCMA 4OFNA 4MPFA 1USBA 4ZL8A 1UVZA 1WJKA 1EGOA 4TKYA 5JWRB 3TKSA 4X0XA 4ECIA 4ZXGA 2Z9SA 3NOFA 4AJ6A 3KM6A 5J9CA 2MZCA 2VUPA 4ISDA 4K7NA 3TB2A 2LSTA 4V2MA 2H72A 3ME7A 4Q5QA 1ON4A 4AJ8A 3IK9A 3GKXA 1EEJA 2M80A 2VD1A 5E59A 3L4NA 4ILFA 1TRVA 1LU4A 4BPYA 4NHZA 1AW9A 2JL4A 1FVKA 4POBA 1O8XA 1G0TA 4LMWA 4HUAA 4FYBA 1GTAA 3WGDA 2IPAA 1T00A 4ZB6A 2IL3A 4WBJA 3LSZA 5G5EA 4MJBA 4KSOA 2DSAA 3GIXA 2RUEA 1XPVA 2K8VA 2PWJA 4AGSA 3TRXA 2LJRA 1TOFA 4I2TA 1NM3A 3M3MA 4KCEA 4IELA 1O6JA 5JCWA 2KOKA 1SD8A 1EGRA 3FW2A 1V9WA 2YPMA 2GT6A 4GQCA 1GTIA 3TRPA 3VI7A 2AAWA 1G7EA 2MBSA 3DXBA 3LJRA 2H0GA 4LL4B 2VAFA 3WT2A 1Z6MA 2FA4A 1AQXA 2GSTA 2YOIA 3KMOA 1M2DA 2R4VA 4EDYA 3BOAA 1XWKA 4LMVA 1SKRB 2JZSA 2HXKA 5DALB 2MMOA 2BTOT 2X99A 5HFKA 3VWUA 3F6DA 4KSMA 3UEMA 3IA1A 4ZBAA 1XVWA 2ALBA 2OADA 2CX4A 4QL9A 4L8EA 3LYKA 1PQNA 3DVWA 2FCHA 2VCXA 1SYRA 5G2ZA 1YF1A 2EIRA 2K8SA 1QGVA 3M8NA 3EVIA 1F9MA 4WF4A 3A5WA 3Q74A 3QFBC 4I5QA 1PA3A 3QAVA 3Q6OA 4JE1A 1K0BA 2H73A 3L78A 3HDCA 2FWHA 1JZDA 1OC9A 2MMZA 2ZCTA 2GLRA 1YEXA 4ZL7A 3S9FA 2AHEA 5DJMA 4XTSA 1H4OA 3LEFA 1FW1A 3N9JA 3P7XA 2EIQA 2DJ2A 4XRAA 5GSTA 4WBRD 3CMIA 1DE1A 1G6YA 2QGVA 4G2EA 3TUEA 2X64A 3RBTA 4MJCA 2RM6A 4N30A 2V32A 3ZRDA 3TGZA 4OO4A 3UBLA 2H1DA 3FZ9A 3CSJA 1N8JA 3MDKA 1XIYA 5A5KA 4N10A 3ZL5A 4MJAA 3H4KA 3KXOA 2CZ2A 4MF6A 3HZ8A 1K0CA 4F2IA 3Q18A 2JZTA 2YWNA 4Q5FA 3GUSA 4MK3A 2M72A 3FR9A 3F4RA 3JCML 5D96A 3GH6A 4DSSB 3U6VA 2CQ9A 4ZILA 2NDOA 5F0GA 4CDOA 1MDJA 4H86A 5GAND 5ECSA 3IPZA 2JACA 2HRFA 1EEMA 5IMAA 2H19A 1G7OA 2C3QA 2QSIA 3A2XA 3KMNA 3WD6A 3Q19A 1TTZA 4IN0A 3HKRA 2WCIA 5LNKe 2MBTA 3EE2A 1SL2B 2IMFA 1V40A 4TR3A 4ACSA 4XIHA 3IC4A 4KDYA 3IBHA 4PQIA 3V1WA 3E0UA 3ZZXA 5KN2A 4YQVA 1K0AA 1UN2A 2E2GA 4K7IA 4V2LA 1XW6A 2A2RA 1K0NA 1A0RP 16GSA 2C3TA 5B6NA 1EOGA 3ZTLA 4EDZA 5CRHA 3P8WA 3VFIA 3TCOA 4WR4A 1AC1A 4BVYA 3ED3A 3ZYWA 3UIWA 1S3DA 2VCTA 4GSNA 5LCZA 3L9VA 4BVXA 1XWAA 5DCHA 2H71A 2B3SA 5DDLA 2GS3A 5C00A 5EVOA 3EYTA 1S3AA 2NBSA 5CREA 1QFNA 3IRAA 3APSA 4JR6A 2TRCP 1TW9A 4K0NA 1GLPA 4V2NA 3LORA 3TKPA 4F03A 1GNWA 1YKCA 2REMA 2VO4A 3GV1A 1C72A 4J57E 4IJ3A 3VLNA 4MA9A 1YF0A 1XOBA 2G0FA 2B5EA 4I8BA 1ZCPA 1GNEA 2X8CA 2WULA 2CV4A 1Y6EA 3BCKA 2B1KA 2LRTA 2JSYA 2H76A 5ID2A 2JU5A 3US3A 2C0DA 5FT3A 3PINA 5CAXA 4FYCA 2YWMA 4WF5A 2V6OA 2BJXA 1BX9A 1GUKA 1EV4A 1BG5A 3CRUA 2IMIA 1U88A 4AF2A 4HOJA 4MLYA 2B6MA 2VIMA 4AJ7A 13GSA 4GQFA 4XHMA 3UVHA 3W8SA 4CW9A 3FHKA 2YZUA 4YH2A 1HNAA 5ECIB 4GWRA 1GUHA 2OJLA 3K8NA 1DUGA 1GWCA 3GA4A 4KUNA 1BEDA 1OKDA 4ECJA 5G1LA 1PX6A 1K3YA 1T4YA 3HXSA 5IIZA 2CA8A 2DIYA 1XXUA 1O7UA 3FR6A 4E8EA 1MD3A 2VD0A 1O85A 3HJMA 2VM2A 1TXXA 2ON5A 3J7Yb 3E9JB 3HA9A 4IJIA 3WGEA 4TXOB 3LXTA 4F0CA 2HI7A 3P90A 3VWVA 5FHIA 3C7MA 2LEGA 3EC3A 2HT9A 1WWJA 3KJYA 1B9YC 2FD3A 3EU4A 4F0BA 5KN1A 1ML6A 1NHYA 1KNGA 2GZPA 4LA1A 3R2QA 5B7CA 2N5FA 2FA8A 1EOHA 4LL1B 2LS5A 1XWGA 17GSA 5HR1A 3ERFA 1BQ7A 1O8WA 1GH2A 2XBQA 2FNOA 4RQXA 4KB3A 1GSUA 3LFLA 1AQWA 5IOXA 2WGRA 2PMTA 3F8UA 2H0HA 3TOTA 3HYPA 2HZEB 2AYTA 1HD2A 1K0OA 3PH9A 4KCAA 5COHA 3UMAA 2J9HA 1ACVA 3HD5A 4EE0A 5EPFA 1R5AA 2K6VA 3QMXA 3DMLA 3KGKA 4JEDA 3GSSA 5B8AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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