The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
b'GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Paxillin and ponsin interact in nascent costameres of muscle cells
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ponsin
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
15
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FRW A; 2I0N A; 3H0F A; 4GBQ A; 1A0N B; 1T0J A; 3VS4 A; 2DL3 A; 2DRK A; 4M4Z A; 2V1R A; 2J6F A; 4ESR A; 2GTJ A; 2CT3 A; 2EQI A; 2E5K A; 3EG1 A; 2KNB B; 2DYB A; 2JMC A; 2KYB A; 1M3B A; 1SRL A; 3EG0 A; 2BZ8 A; 1JQQ A; 4HVW A; 5GJW B; 3KFV A; 3TSZ A; 3LH5 A; 1OOT A; 2MCN A; 1QWF A; 4HCK A; 2VVK A; 4E6R A; 1QCF A; 2KBT A; 4JZ3 A; 2L2P A; 2HCK A; 2DX1 A; 3CQT A; 3H41 A; 2H8H A; 1UFF A; 2KR3 A; 1K0X A; 4A63 B; 2O2O A; 1BBZ A; 1FYN A; 1WXT A; 2JXB A; 1QKX A; 2LCS A; 2CH4 A; 2LX7 A; 3VS1 A; 5IXB A; 1CKB A; 1QLY A; 1JEG A; 1B3Q A; 3UAT A; 2LZ6 B; 1UDL A; 1N5Z A; 2A37 A; 1HSQ A; 3EHR A; 3NPF A; 2NWM A; 2L3P A; 3H0I A; 1J3T A; 1I0C A; 2KEA A; 1NLP C; 2LJ0 A; 2W0Z A; 4R0K A; 2A28 A; 1I07 A; 2PTK A; 4Z88 A; 3RBB B; 2DVJ A; 4LE9 A; 1IO6 A; 2DL5 A; 1PRM C; 3M0T A; 4ORZ A; 1H8K A; 1OPK A; 4OMQ A; 1WFW A; 3REA B; 5GJV B; 2YUN A; 2FEI A; 4IIO A; 2F2W A; 4OML A; 2RNA A; 1E6H A; 3I5R A; 1GCQ C; 1SHF A; 2DLP A; 5L23 A; 2L3S A; 3VS7 A; 2HBW A; 3TVT A; 2JS0 A; 1BB9 A; 2YSQ A; 1AVZ C; 1WIE A; 2YUQ A; 4CC2 A; 1K9A A; 1NYF A; 2MOX A; 1Y57 A; 1GBQ A; 2ABL A; 1GL5 A; 2FPF A; 5IHN A; 3REB B; 2K2M A; 1JXM A; 2EPD A; 2RPN A; 2RQW A; 2HDA A; 4J9F A; 4OMO A; 4FSS A; 2O31 A; 2CUB A; 4J9E A; 1UHC A; 2DBM A; 1CKA A; 1ZUK A; 1KSW A; 1VYU A; 1U3O A; 2V1Q A; 2KRN A; 1SSH A; 1WXU A; 2GNC A; 1RUW A; 5FWB A; 4F17 A; 1X69 A; 3I5S A; 1M27 C; 2KRS A; 2OJ2 A; 2ED1 A; 1E7O A; 1XOV A; 1QKW A; 1WI7 A; 2DBK A; 1AWJ A; 4D8K A; 1PKS A; 1JU5 C; 1K0S A; 2OAW A; 2W10 A; 2M51 A; 1UTI A; 3FJ5 A; 2K9G A; 1SEM A; 5FWC A; 2GGR A; 1MUZ A; 4ZNX A; 2C0O A; 2CRE A; 3UF4 A; 1FMK A; 2O9V A; 2DF6 A; 2KE9 A; 2KRO A; 1PHT A; 2LQN A; 4OMN A; 1UJ0 A; 2F2V A; 4JJC A; 1Z9Q A; 1HJD A; 2RN8 A; 2EYZ A; 1UEC A; 2A08 A; 3SHW A; 3EGU A; 1W1F A; 4JJD A; 1AD5 A; 3I35 A; 4AFS C; 1NEG A; 4X1V A; 2DE0 X; 2L3Q A; 1VYV A; 5I22 A; 2KT1 A; 3U23 A; 2CSI A; 2FO0 A; 2VKN A; 1SRM A; 3RNJ A; 2ROT A; 4LNP A; 1V1C A; 2DJQ A; 2EGC A; 2K7A A; 1WXB A; 2LJ3 A; 1PWT A; 2J6O A; 1B07 A; 1K4U S; 2KXC A; 1G2B A; 2ED0 A; 2ROL A; 1NM7 A; 2F2X A; 3JV3 A; 1PKT A; 4DEY A; 2ECZ A; 2BZY A; 4AG1 C; 2DA9 A; 1GBR A; 4CC7 A; 2AKK A; 2CDT A; 4J9G A; 3I9Q A; 1RLP C; 3NMZ C; 1KFZ A; 1OV3 A; 4J9D A; 1H92 A; 2LJ1 A; 3VS3 A; 2D8J A; 2JMA A; 2SEM A; 4RTY A; 4LN2 A; 1UHF A; 2BZX A; 2CH4 W; 3M0S A; 2EVR A; 1X6G A; 2LQW A; 1YNZ A; 1AWW A; 1BU1 A; 1ZSG A; 2KGT A; 1NLO C; 3M0U A; 4RUG A; 4JJB A; 1WYX A; 1M3C A; 2SRC A; 1G83 A; 2EYX A; 3R6N A; 2AKL A; 4OMM A; 1WDX A; 2D0N A; 3VS2 A; 4AG2 C; 2EYY A; 2D1X A; 1PNJ A; 3QWY A; 4HVV A; 1ZBJ A; 1BK2 A; 2JS2 A; 1GRI A; 4K11 A; 2CUD A; 2AZS A; 2GBQ A; 1OEB A; 5FW9 A; 2EGE A; 2DM1 A; 4RTT A; 1OPL A; 1RLQ C; 3VS5 A; 2DL8 A; 1T0H A; 2GTO A; 4HVU A; 2O88 A; 1VA7 A; 2CSQ A; 2RQT A; 2X3W D; 2ENM A; 2D8H A; 5EC7 A; 1EFN A; 3THK A; 1NEB A; 1YCS B; 5IXF A; 1K1Z A; 4F16 A; 2J6K A; 2FPE A; 1AEY A; 3NHN A; 1W6X A; 4LUD A; 1ABQ A; 2CT4 A; 1UJY A; 2B86 A; 5IH2 A; 2YUP A; 1MV3 A; 1ZLM A; 2J7I A; 1LCK A; 2X3X D; 5HCK A; 1WA7 A; 2EKH A; 2DNU A; 3NGP A; 1K76 A; 4Y92 A; 1UE9 A; 1UG1 A; 1UUE A; 1ABO A; 2ESW A; 2KXD A; 2NUZ A; 1AOJ A; 4Z8A A; 2LNH B; 1TUC A; 2DMO A; 4RTX A; 2BTT A; 2K6D A; 2DIL A; 2KYM A; 4HXJ A; 2VWF A; 4WCI A; 4LUE A; 3ZL7 C; 1T3S A; 2HSP A; 2OI3 A; 1AZE A; 1JXO A; 4J9B A; 2GQI A; 2JW4 A; 3H0H A; 1QWE A; 4J9I A; 1Z9Z A; 2EGA A; 3C0C A; 3A98 A; 3EG3 A; 3IQL A; 1GCP A; 1E6G A; 4J9H A; 2KRM A; 1AWO A; 4KRT A; 1WX6 A; 4JPB W; 1PRL C; 2YUO A; 1YWO A; 4EIK A; 2EBP A; 2RQR A; 2DL7 A; 4QT7 A; 1W70 A; 4RTV A; 2G6F X; 1GFD A; 3TSW A; 1M3A A; 4AFZ C; 2QDL A; 2FRY A; 3EG2 A; 2J05 A; 1JO8 A; 3SEM A; 1I1J A; 2YT6 A; 1Y0M A; 4JZ4 A; 1VYT A; 2RQV A; 4Z89 A; 2K79 A; 4CC3 A; 2YDL A; 2RMO A; 1ZUU A; 3PE0 A; 3O5Z A; 5ECA A; 5IHI A; 1WLP B; 2FG0 A; 4AFU C; 1SPK A; 1CSK A; 2K3B A; 2M0Y A; 2KT8 A; 4RTZ A; 1X2K A; 2EW3 A; 3PVL A; 2PNI A; 3UA7 A; 2AK5 A; 4CC4 B; 1YN8 A; 2AZV A; 2O9S A; 4DEX A; 4RTW A; 2JM9 A; 1AZG B; 2LP5 A; 4OMP A; 1ZX6 A; 1KIK A; 1ZUY A; 4J9C A; 1X27 A; 1YWP A; 3GBQ A; 1SHG A; 2C0T A; 2DL4 A; 1H3H A; 1TUD A; 2DRM A; 2XMF A; 2J06 A; 2RQU A; 1U06 A; 3QWX X; 1NG2 A; 2L0A A; 2MIO A; 1AWX A; 4D8D A; 1U5S A; 5IHK A; 3M0R A; 3UA6 A; 1MV0 B; 1T3L A; 3M0P A; 1UGV A; 3M0Q A; 3VRZ A; 2LMJ A; 2FPD A; 1YP5 A; 1M8M A; 3VS0 A; 2RF0 A; 2EYW A; 3VS6 A; 1M30 A; 1S1N A; 3VRY A; 2PZ1 A; 1RI9 A; 4GLM A; 1NYG A; 2C0I A; 3ULR B; 2A36 A; 2P4R A; 4RTU A; 2JTE A; 3PVQ A; 2JM8 A; 1X2Q A; 2IIM A; 2JT4 A; 5I11 A; 4IIM A; 4AFQ C; 1X6B A; 1KJW A; 3EHQ A; 1GCQ A; 1X43 A; 1ARK A; 1GFC A; 1TG0 A; 1HD3 A; 4F14 A; 2HEQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FRW A; 2I0N A; 5GAO p; 1ZBX A; 3JCM P; 3L1A A; 1RL2 A; 3DB4 A; 3A8G B; 1KQ1 A; 3QJY A; 2GTJ A; 2CT3 A; 2E5K A; 2KYB A; 2DTH A; 1SRL A; 2LTO A; 2P0P A; 3GNG A; 2BZ8 A; 1JQQ A; 4XU1 A; 3SWN C; 5GJW B; 2CKK A; 8AT1 B; 4PNO A; 2FVU A; 1OOT A; 2MCN A; 4HCK A; 4BD3 A; 4JLG A; 4KUL A; 3OBW A; 1HYO A; 1LNX A; 1QCF A; 2HCK A; 5LJ5 d; 1YIJ T; 2E3I A; 2O2O A; 4A63 B; 1NE8 A; 1WPY A; 2CZ6 B; 1OU8 A; 2LCS A; 2CH4 A; 2NUT A; 4A54 A; 2LX7 A; 5IXB A; 1W2B S; 5CVI A; 1Q7Y C; 4AT1 B; 2LZ6 B; 1N5Z A; 2I2L A; 4XAX B; 3H0I A; 3NTH A; 2XHC A; 3JAM E; 4R0K A; 4DA4 A; 2A28 A; 2PTK A; 3RBB B; 2DD5 A; 2P84 A; 4KUD K; 2RO0 A; 1IO6 A; 3A8M B; 5KYN A; 4PJO A; 1OPK A; 2YLB A; 3REA B; 3JCM g; 2DTO A; 4DBR A; 2G3R A; 3CCV T; 1GCQ C; 4LD6 A; 3BDL A; 2DLP A; 5KYU A; 5L23 A; 2L3S A; 1OYX A; 3VS7 A; 2HBW A; 3PT9 A; 1FX7 A; 3QZ5 B; 3M54 A; 1BB9 A; 2YSQ A; 3EGX B; 1D1C A; 1WIE A; 4BB7 A; 5CKD A; 2LDM A; 1VQP T; 3P8D A; 1K9A A; 5GAN f; 3DKM A; 3SFM A; 1GBQ A; 3QO3 A; 2FPF A; 1RAF B; 4PJO F; 2RPN A; 3OQ5 A; 2RQW A; 4C5E A; 2FYK A; 2HDA A; 4OMO A; 2QK0 A; 5CKH A; 4M75 G; 3LH0 A; 1Y07 A; 3AHU A; 3MCA B; 4C92 G; 1ZUK A; 3CC4 Q; 1RAE B; 1M1G A; 3M53 A; 3LLR A; 1VQK T; 1SSH A; 1YHQ T; 2E12 A; 1C6V X; 5LJ5 e; 2LQ8 A; 3G4S Q; 2GFU A; 4E7K A; 1KQS A; 3HRU A; 3TQ7 P; 1WI7 A; 4BE1 A; 1JU5 C; 3TCJ A; 3LX7 A; 3VKI A; 2M51 A; 1VQ4 A; 3BDU A; 3CC2 Q; 1WJR A; 3FJP A; 5LJ3 g; 2EJ9 A; 4J83 A; 3FRN A; 4ZTF A; 1NBE B; 3CME Q; 2QA4 Q; 1M4Z A; 5GAN 5; 4QW2 A; 4OMN A; 4M77 G; 3CCJ Q; 4JJC A; 1Z9Q A; 2CS7 A; 5D6Y A; 4JS5 A; 2QAS A; 3QG1 A; 3FLG A; 4JJD A; 3CPW P; 1AD5 A; 1WJQ A; 1NEG A; 2CGH A; 4AFS C; 2QDY B; 4X1V A; 2L3Q A; 1VYV A; 4EPC A; 4DOW A; 3EGD A; 2FO0 A; 4FM4 B; 2VXE A; 2PVG B; 3SWN B; 2ROT A; 2OTJ Q; 3HRS A; 3A5Z B; 4C5G A; 1G3Y A; 1YIJ A; 5GMK h; 5GAM d; 1QW1 A; 3M58 A; 2J6O A; 3INZ A; 1QVF S; 5CQY A; 1G2B A; 1IGQ A; 2RJD A; 2Y4X A; 1YJ9 A; 4FW2 A; 4NOY A; 2DA9 A; 2LC4 A; 2AKK A; 4J9G A; 1RLP C; 3NMZ C; 7AT1 B; 4ZGJ B; 3RER A; 2O4X A; 1OX8 A; 2FL7 A; 2LJ1 A; 3L2V A; 4J7I A; 2RK1 A; 2E4H A; 1VQ7 A; 3E2U A; 1UHF A; 2PVO B; 4RKU E; 1KC8 R; 5I21 A; 3G7Z A; 3M0S A; 4N0A A; 2F69 A; 2EVR A; 1X6G A; 2LQW A; 5GAN 6; 1BU1 A; 1N8R R; 5GAN 2; 3OW2 A; 1NLO C; 4E47 A; 4EMG A; 3CCV A; 1M3C A; 1MMN A; 3C95 A; 4R56 A; 2SRC A; 2E6Z A; 2KDS A; 3CCL Q; 1H3Z A; 4AG2 C; 1Q82 C; 1VQP A; 1PNJ A; 4HVV A; 3Q1J A; 2JS2 A; 5A2Q E; 4FYX B; 1GRI A; 4K11 A; 3L2W A; 3J7A F; 4A4F A; 3PTA A; 2K3X A; 4RTT A; 1T0H A; 5IAY A; 1VQK A; 4LDV A; 3OYL A; 3OBY A; 1X6O A; 5EC7 A; 1M5Q 1; 1EFN A; 2L8D A; 1YCS B; 5GAM e; 4KT0 E; 1HK9 A; 1G3W A; 3NHN A; 4BE2 A; 3JCM e; 3DB3 A; 3S6W A; 3LW5 E; 1PSE A; 2CT4 A; 4BAC A; 5IH2 A; 4F7U B; 2E3H A; 1XQH A; 2WAC A; 1ZA2 B; 2DAQ A; 1ZLM A; 4LDW A; 2QEX Q; 2J7I A; 3E1S A; 1Y71 A; 3QXE B; 2GF7 A; 4Y92 A; 4PLL A; 4DOV A; 2ESW A; 2VV5 A; 4M7D D; 4WCI A; 2DIL A; 1T3S A; 2RI3 A; 4J9B A; 3JB9 H; 4MMK A; 2A0F B; 3H0H A; 4J9I A; 2EGA A; 3GP8 A; 3A98 A; 2QAZ A; 3V8K A; 3VYG A; 1C0M A; 1GCP A; 1E6G A; 4J9H A; 1AWO A; 3A1P A; 5FRM A; 2DXC A; 1F1B B; 2LVM A; 4C8Q D; 4QT7 A; 5FRN A; 2P4T A; 4AFZ C; 2RJC A; 4LDY A; 1JO8 A; 1Y0M A; 4JZ4 A; 3MEV A; 2AT1 B; 2ZGW A; 1MMA A; 5LJ3 e; 3J80 E; 1YIT Q; 2LX9 A; 4CC3 A; 1VOM A; 2XD0 A; 1BCM A; 4L5G A; 1BIA A; 1ZUU A; 1U8R A; 2KMT A; 3PE0 A; 5ECA A; 5GMK j; 2K5I A; 2YHT A; 9ATC B; 1R0C B; 1SPK A; 5CAI A; 1CSK A; 2VAS A; 2XID A; 1TTH B; 4KBM B; 2AK5 A; 2V8I A; 4CC4 B; 3RKY A; 2O9S A; 3SWN A; 1Y96 A; 5GMK i; 4MDX A; 1BCO A; 3S3M A; 4ELZ C; 5KE3 A; 4QQG A; 5EG2 A; 1VQN T; 1I81 A; 1K73 C; 1SHG A; 1NJI C; 1M8V A; 3L2Z A; 1MGQ A; 2DRM A; 2YRV A; 4J6Y A; 3CD6 T; 1VQ8 T; 2CP6 A; 3N5B B; 3OS0 A; 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4BUG A; 4PJN A; 4OMQ A; 4MZT A; 1VQ4 Q; 2COZ A; 4EMH A; 4F7U F; 3MET A; 2HZY A; 2F2W A; 2RNA A; 2F5T X; 4DBF A; 1E6H A; 1WHG A; 4C0G A; 1SHF A; 3JB9 D; 3EFR A; 3MEW A; 3OYH A; 2HL3 A; 5GMK l; 5D7U A; 2QI2 A; 3CMA T; 5M9O A; 5DLO A; 2MOX A; 4Y91 A; 1Y57 A; 3BY7 A; 1VQN A; 2ABL A; 3REB B; 1QMC A; 4FW1 A; 2EPD A; 4E7L A; 1VQO T; 5GAO r; 4NL2 A; 4O6J A; 3CD6 A; 2ZPH B; 1VQ8 A; 4FSS A; 2O31 A; 4GLK A; 2CUB A; 4J9E A; 2X51 A; 3OYE A; 2DBM A; 3J81 E; 1KSW A; 3MKD A; 2RHY A; 2WSE E; 1VYU A; 4IUU A; 4NS5 A; 1UGR B; 1YIJ Q; 2GNC A; 5FWB A; 4M7A E; 4XTW A; 4FL6 A; 1KQS P; 4KUI A; 3CCE Q; 5KCH A; 2D0Q B; 1Q86 C; 2MI6 A; 1Q81 U; 1VQ9 T; 1E7O A; 3CBP A; 1XOV A; 1YJ9 Q; 1QKW A; 5I2M A; 2DBK A; 1AWJ A; 1K0S A; 2KSS A; 1D0X A; 1WQ7 A; 3LGL A; 3HKS A; 1YI2 A; 2K9G A; 2OTL T; 2RJE A; 3QJ6 A; 2R5M A; 2GGR A; 1VQ7 Q; 2LT4 A; 1MUZ A; 2C0O A; 1VQM T; 5GAN g; 1N6A A; 4JJN K; 2KRO A; 3OYJ A; 3MP6 A; 4IUR A; 3G71 A; 2A7Y A; 2RN8 A; 3I55 T; 2V26 A; 4BI8 B; 2KQW A; 3OYB A; 3EGU A; 2H3E B; 5FLX E; 4N4I A; 2QGF B; 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