The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Paxillin and ponsin interact in nascent costameres of muscle cells
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Ponsin
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| total genus |
15
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| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FMK A; 1CKA A; 2J6F A; 3TSW A; 2GGR A; 4CC2 A; 2W10 A; 2KBT A; 2FRY A; 2DRM A; 2JMC A; 2EYY A; 1X2Q A; 3EG3 A; 1WI7 A; 2HDA A; 3VS4 A; 1X27 A; 1JU5 C; 1YCS B; 2BTT A; 2L3Q A; 1PRL C; 2D8J A; 3M0U A; 1MV3 A; 4JJD A; 1T0J A; 1Z9Z A; 1Y0M A; 2DL5 A; 2L3P A; 5FW9 A; 2JT4 A; 1G2B A; 1UUE A; 3THK A; 3VS7 A; 4OMO A; 2KEA A; 5IHN A; 2DM1 A; 1WA7 A; 1T0H A; 1KJW A; 2LQN A; 2O9S A; 3M0Q A; 4AG1 C; 1WFW A; 1WXT A; 1UJ0 A; 2KRO A; 2GTJ A; 3PVQ A; 1AZG B; 3VS1 A; 1IO6 A; 5EC7 A; 4RTV A; 1UGV A; 4QT7 A; 1W1F A; 1RI9 A; 3UA6 A; 1NEG A; 2OI3 A; 2EW3 A; 1AVZ C; 4X1V A; 1CSK A; 3UF4 A; 3A98 A; 5IH2 A; 1NLO C; 2KXC A; 3M0T A; 2VVK A; 3RNJ A; 1QWE A; 1U3O A; 3VS6 A; 2YUO A; 4K11 A; 2D0N A; 2F2X A; 3GBQ A; 3EG1 A; 3NGP A; 2LQW A; 1MUZ A; 2EQI A; 4HVU A; 5GJV B; 3U23 A; 1K9A A; 2CT4 A; 2CRE A; 1T3L A; 2EGC A; 2NWM A; 4LN2 A; 1UHC A; 2ED0 A; 3CQT A; 2JTE A; 4E6R A; 1A0N B; 5IXF A; 5HCK A; 2AKL A; 1E7O A; 2LJ3 A; 2P4R A; 2DJQ A; 4HVW A; 4CC4 B; 3C0C A; 1T3S A; 1OEB A; 1KSW A; 1BK2 A; 1WXU A; 2BZY A; 2DL8 A; 2QDL A; 2KYM A; 2RQV A; 2KE9 A; 1AWW A; 1QCF A; 2D8H A; 2KRM A; 4CC7 A; 2DA9 A; 4J9I A; 3RBB B; 1UG1 A; 2FG0 A; 2X3W D; 4HXJ A; 4IIM A; 3NMZ C; 1N5Z A; 1PNJ A; 1JO8 A; 1E6H A; 3R6N A; 4OMN A; 2ECZ A; 1GL5 A; 1HD3 A; 2FRW A; 2VKN A; 2DL7 A; 4RTY A; 2DX1 A; 4AFU C; 4Z89 A; 4OML A; 2E5K A; 2CUB A; 2OJ2 A; 2EKH A; 2KNB B; 1YN8 A; 1K0X A; 3H0H A; 1BB9 A; 1NM7 A; 1ZLM A; 2FO0 A; 3ULR B; 2K2M A; 2I0N A; 2ROT A; 2M0Y A; 2GQI A; 1LCK A; 1UE9 A; 3TVT A; 1BBZ A; 1NYG A; 3EHR A; 1QKX A; 2CT3 A; 2GTO A; 2XMF A; 2RN8 A; 1HSQ A; 2BZX A; 5GJW B; 1AOJ A; 1K4U S; 3H0I A; 2AK5 A; 1OPL A; 4J9H A; 4JZ3 A; 1NG2 A; 4RUG A; 2RQW A; 1AWJ A; 2FEI A; 4AFQ C; 2CSQ A; 4AFS C; 1WDX A; 2DE0 X; 4LNP A; 1QKW A; 1UHF A; 2A36 A; 4A63 B; 1M27 C; 1M3A A; 2OAW A; 1W70 A; 2NUZ A; 4JZ4 A; 1ZX6 A; 4DEY A; 3H0F A; 2X3X D; 5ECA A; 2YT6 A; 1TG0 A; 2EGE A; 2F2V A; 2DBK A; 2FPE A; 1AD5 A; 2KGT A; 1ZSG A; 1YNZ A; 1OPK A; 2EVR A; 4RTX A; 1J3T A; 2JW4 A; 4GLM A; 2JS0 A; 1SEM A; 1QLY A; 2B86 A; 4J9B A; 2RQT A; 2GBQ A; 2CUD A; 3M0S A; 1OOT A; 1Y57 A; 4IIO A; 4RTW A; 1PKT A; 2KYB A; 1M30 A; 2JMA A; 3VRY A; 4EIK A; 3EGU A; 1NEB A; 2KRN A; 4CC3 A; 2CDT A; 5FWC A; 2DRK A; 4AFZ C; 5IHI A; 2LCS A; 5L23 A; 1PKS A; 3UAT A; 1SSH A; 1GFC A; 2DL3 A; 2PZ1 A; 4J9E A; 1X6B A; 1I0C A; 2A28 A; 1JQQ A; 3IQL A; 2FPF A; 1H92 A; 1S1N A; 1KIK A; 2DLP A; 4JJC A; 1W6X A; 2YSQ A; 2KT8 A; 3TSZ A; 3I9Q A; 2DF6 A; 2J05 A; 2J6O A; 2EYW A; 2JXB A; 2LZ6 B; 4J9C A; 1AWO A; 1UDL A; 1JXM A; 3M0P A; 1E6G A; 2AZV A; 2ABL A; 4F16 A; 1U5S A; 1UEC A; 1GBR A; 1M3B A; 2JS2 A; 2KT1 A; 2O9V A; 2A37 A; 4RTU A; 2CSI A; 3KFV A; 2EGA A; 1UJY A; 4M4Z A; 4DEX A; 2HBW A; 2SRC A; 2CH4 W; 1RUW A; 2K7A A; 1GCQ C; 2VWF A; 1KFZ A; 2F2W A; 1ZUU A; 1AEY A; 4D8K A; 4Z88 A; 1X43 A; 2ED1 A; 1H8K A; 5IHK A; 1K1Z A; 1WYX A; 1MV0 B; 2C0O A; 3ZL7 C; 4LUD A; 2RQR A; 3VS3 A; 4JJB A; 1HJD A; 2LNH B; 2YUQ A; 2O31 A; 1WIE A; 4GBQ A; 5I11 A; 1WX6 A; 1ZUY A; 1TUC A; 3UA7 A; 3VRZ A; 2BZ8 A; 1V1C A; 1YWO A; 2AKK A; 1SHG A; 2K79 A; 4J9G A; 5I22 A; 2V1Q A; 1PRM C; 1SPK A; 2EBP A; 2YUP A; 3EG0 A; 1ZUK A; 1VYV A; 2GNC A; 1H3H A; 2L0A A; 1YP5 A; 3M0R A; 3I5R A; 2HCK A; 1U06 A; 4J9D A; 2W0Z A; 2DNU A; 3NHN A; 2JM8 A; 2JM9 A; 4LE9 A; 4HVV A; 1NLP C; 3I5S A; 1YWP A; 1PWT A; 2M51 A; 2SEM A; 1UTI A; 2ESW A; 1WXB A; 2J6K A; 2LP5 A; 4OMM A; 1SRM A; 2FPD A; 3VS5 A; 1XOV A; 2H8H A; 1I07 A; 3VS2 A; 2L3S A; 3PVL A; 1AWX A; 4ZNX A; 4OMQ A; 3EG2 A; 3REA B; 2ROL A; 1X6G A; 2LMJ A; 4JPB W; 1TUD A; 3NPF A; 1K76 A; 2LX7 A; 1CKB A; 1UFF A; 1WLP B; 1M3C A; 2EYZ A; 3I35 A; 2K6D A; 2MIO A; 2KR3 A; 1M8M A; 4AG2 C; 1VYU A; 2RNA A; 1I1J A; 1JXO A; 2LJ0 A; 2DIL A; 2J06 A; 1GRI A; 2RPN A; 2PNI A; 4F17 A; 1JEG A; 2A08 A; 2DBM A; 1PHT A; 2AZS A; 2YUN A; 2K9G A; 4R0K A; 1G83 A; 1X69 A; 4J9F A; 2CH4 A; 2C0I A; 1OV3 A; 4LUE A; 1VYT A; 3FJ5 A; 1ABO A; 4KRT A; 1B3Q A; 1ABQ A; 3EHQ A; 4OMP A; 1NYF A; 4FSS A; 3VS0 A; 2V1R A; 1AZE A; 1QWF A; 3QWY A; 4ORZ A; 1ARK A; 3QWX X; 1SRL A; 2G6F X; 2LJ1 A; 2DVJ A; 1GCQ A; 4RTZ A; 3PE0 A; 1RLQ C; 3JV3 A; 2ENM A; 2MCN A; 4HCK A; 1SHF A; 1GCP A; 1BU1 A; 2O2O A; 2YDL A; 1Z9Q A; 3REB B; 3H41 A; 5FWB A; 2DL4 A; 2KXD A; 2HEQ A; 2L2P A; 1ZBJ A; 2IIM A; 4RTT A; 4Z8A A; 2KRS A; 5IXB A; 1B07 A; 1RLP C; 3LH5 A; 2J7I A; 1GFD A; 2EPD A; 2PTK A; 3O5Z A; 2EYX A; 2HSP A; 4WCI A; 2C0T A; 2O88 A; 3SHW A; 1K0S A; 4D8D A; 2RQU A; 2D1X A; 1VA7 A; 2MOX A; 1X2K A; 2DMO A; 3SEM A; 1EFN A; 1GBQ A; 4F14 A; 2DYB A; 2K3B A; 4ESR A; 2RMO A; 4Y92 A; 2RF0 A; 1FYN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JLI A; 3MEW A; 1HK9 A; 2J6F A; 1TXQ A; 2W10 A; 3G71 T; 4RCC A; 1Q95 G; 2DRM A; 2JMC A; 3EG3 A; 2HDA A; 1VQ6 A; 4M7D C; 3C4S A; 4PJO D; 3HP9 A; 3WXM B; 1M8V A; 2XDB A; 4JJD A; 3A5Z B; 3QII A; 2QEX T; 2DXT A; 1M90 R; 2L3P A; 5FW9 A; 4FYW B; 1YJW T; 1G2B A; 2RHZ A; 2CZ6 B; 3VS7 A; 3CMA Q; 2E3H A; 2Y4X A; 2DVE A; 5GAM f; 2K3X A; 2LQN A; 1PSE A; 2O9S A; 4X34 A; 4Y91 A; 2H3J A; 1Q7Y C; 3FJP A; 1WXT A; 2KRO A; 2VGM A; 4RG8 A; 1VQN A; 4A4H A; 3JCM f; 5EC7 A; 3C95 A; 4M77 G; 4PFZ A; 1IGQ A; 2OI3 A; 3EFO A; 1VQP Q; 2EW3 A; 4IUV A; 4X1V A; 1CSK A; 1VIF A; 2QQB A; 3A98 A; 3V7S A; 5GMK h; 1QWE A; 3CCS T; 2LQ8 A; 2HQE A; 2RI5 A; 2F2X A; 3GBQ A; 3EG1 A; 2LQW A; 1MUZ A; 3CPW S; 3VYG A; 1K9M C; 2CT4 A; 2EGC A; 2NWM A; 4LN2 A; 3CME T; 1UHC A; 3NFC A; 2JTE A; 4E6R A; 3OBY A; 3SWN A; 1RI0 A; 4ZGJ B; 1FX7 A; 1MMD A; 4HVW A; 1KK7 A; 2LDM A; 2K5F A; 1BK2 A; 1YIJ Q; 5DLO A; 2QDL A; 1UGS B; 4BD3 A; 2D8H A; 3EGX B; 2KRM A; 4B9X A; 4CC7 A; 1Q7Y U; 1RAD B; 1UG1 A; 2IG0 A; 3JB9 J; 1N5Z A; 2CP3 A; 1QVF A; 4KGZ B; 1JO8 A; 4M75 D; 3RKX A; 2HKQ B; 5FU7 C; 2FL7 A; 1WJQ A; 3N5B B; 1YIJ A; 4AFU C; 4OGE A; 3CCU Q; 2QEX Q; 2MAM A; 3RMS A; 4XAX B; 1KC8 C; 2QTV A; 3H0H A; 2LT4 A; 2Y90 A; 3ULR B; 1VQL Q; 1Y07 A; 3HFN A; 3ZEH A; 2OTJ T; 2R58 A; 5GAN g; 3CCU A; 1LCK A; 1UE9 A; 1BBZ A; 1D1C A; 3L42 A; 3OY9 A; 1G3Y A; 3T9N A; 5A2Q E; 4Z02 A; 1QKX A; 3RKY A; 2CT3 A; 5GJW B; 1BCO A; 2JJ9 A; 3TU4 K; 1VQL A; 3DKM A; 3CC7 T; 4JZ3 A; 1NG2 A; 4N4G A; 2LCC A; 4PNO A; 4AFQ C; 1K73 R; 4JDS A; 2YWW A; 5GAN e; 1OU8 A; 4J7F A; 1PD1 A; 4A63 B; 2NUT A; 2DEU A; 2F1L A; 4RMO A; 2X35 A; 3H0F A; 2YT6 A; 5CKB A; 4DBH A; 3CEY A; 3BY7 A; 2KGT A; 3CBM A; 5CK9 A; 4E7S A; 4ELY C; 4C5G A; 3ZBD A; 1QW1 A; 2B86 A; 2E3I A; 2CUD A; 1XQH A; 4A4G A; 1OOT A; 4PK4 A; 2AT1 B; 4PJO G; 3OW2 S; 1QMC A; 2JTF A; 2EAY A; 3UPU A; 1M30 A; 4KT0 E; 1JBM A; 1D09 B; 1VQ9 Q; 3S3M A; 2EJG A; 1KD1 R; 4M7A B; 5FWC A; 2LCS A; 5L23 A; 3EFR A; 4E7L A; 3DLL A; 1X6B A; 2V8K A; 4HKE A; 3IQL A; 2M0O A; 4FT4 A; 1AHJ B; 1KIK A; 1UB4 A; 2LNV A; 1IRE B; 1VQ9 A; 2KT8 A; 3I9Q A; 5FRN A; 2GQV A; 2LZ6 B; 2JXB A; 2D0Q B; 1EIF A; 1JXM A; 3CCJ T; 4F16 A; 3AHU A; 1U5S A; 4X9D A; 2JS2 A; 1D0Y A; 1R0B G; 3KFV A; 1KHI A; 3EFS A; 4DEX A; 2KY9 A; 3WVE B; 5GAN f; 2EQK A; 2XKO C; 3EGD B; 2VWF A; 1KFZ A; 3OS0 A; 1BIA A; 4FM4 B; 1C1A A; 4IUR A; 1Q86 R; 2ED1 A; 5IHK A; 1WYX A; 3FEO A; 2RQR A; 4JJB A; 4LDW A; 1HJD A; 3EAE A; 2E10 A; 2OTL T; 5GAM h; 3UA7 A; 4A54 A; 1B34 A; 4LDU A; 2BZ8 A; 1NJI U; 1V1C A; 2EIF A; 2K79 A; 4BDY A; 2EBP A; 3JCM h; 4PL6 A; 4QVD A; 3HRU A; 9ATC B; 2A7Y A; 2L0A A; 3FIF A; 3A8M B; 3CPW P; 2HCK A; 1U06 A; 4M75 G; 1VQK T; 2ZAE A; 4L5G A; 2JM9 A; 4HVV A; 1NLP C; 2P84 A; 5CKE A; 1YWP A; 4BY6 B; 2M51 A; 2SEM A; 1VOM A; 1KHC A; 3TRE A; 2J6K A; 5CQY A; 3CCR T; 1AWX A; 5GMK e; 2NUP A; 4OMQ A; 5I21 A; 1TUD A; 1M1F A; 1K76 A; 3OYA A; 1W2B A; 4M7D E; 1CKB A; 1WLP B; 1YIT T; 1WQ7 A; 3OBW A; 3UWN A; 3O8V A; 1YHQ A; 5I2S A; 1N8R R; 4J6Y A; 1I1J A; 2LJ0 A; 3JCM Q; 2J06 A; 1MMA A; 3EG9 A; 4FSX A; 2RPN A; 2PNI A; 4F17 A; 3H9N A; 4IKF A; 1MMN A; 5GAO p; 3X28 B; 2HSE B; 2DD5 A; 4DOV A; 2DBM A; 2EYQ A; 4XU2 A; 3GNF B; 2KK4 A; 5FRO A; 1R8O B; 2YUN A; 2K9G A; 4R0K A; 3GPL A; 1G83 A; 1X69 A; 5J39 A; 4B9W A; 3DLM A; 2C0I A; 3PGG A; 2JOY A; 2ZPB B; 4PFP A; 3MCA B; 4M78 B; 2LQK A; 3OYE A; 4F7U A; 4KRT A; 2M02 A; 1VQ7 Q; 4FW1 A; 3OYH A; 1M2V B; 4ORZ A; 1H3Z A; 5GAO n; 1M1K U; 2LJ1 A; 2QTX A; 2QI2 A; 1MNE A; 1RLQ C; 3JV3 A; 2MI6 A; 1TSF A; 3HL8 A; 2KMT A; 4M7A C; 4XTY A; 2XU8 A; 1GCP A; 2O2O A; 2O4X B; 1ZA2 B; 2KXD A; 4FT2 A; 3CBO A; 3RES A; 1VQ7 A; 2HEQ A; 2KVQ G; 5HK0 A; 2LCL A; 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1F1B B; 1IRX A; 1FWZ A; 1VQM T; 3C0C A; 1Q7Y R; 1T3S A; 2DXU A; 1U1S A; 3CBP A; 1KSW A; 1WXU A; 4MML A; 2L89 A; 2DL8 A; 5GMK m; 2RQV A; 2KE9 A; 1AWW A; 4F7U F; 2CP7 A; 1QCF A; 2QAS A; 2YRV A; 4ZN1 A; 3JCM e; 3G6E A; 3FLG A; 4C92 D; 4J7I A; 3RBB B; 4ZGD B; 2X3W D; 4QQ6 A; 1PNJ A; 4M78 C; 3S3O A; 1E6H A; 1VQ4 T; 4OMN A; 1HD3 A; 2FRW A; 2DL7 A; 4BAC A; 4ZTJ A; 2DX1 A; 4OML A; 3OYI A; 2E5K A; 1R77 A; 2MPX C; 2OJ2 A; 2KNB B; 1YN8 A; 1BB9 A; 1K9M R; 2Y4Y A; 2VXE A; 4BI8 B; 4NOY A; 2FO0 A; 2K2M A; 4R55 A; 4M77 B; 2ROT A; 4E7H A; 3OMG A; 2M0Y A; 1Y96 B; 1QP2 A; 4OVA A; 1KQ2 A; 4PJO A; 1G3T A; 2GQI A; 3RDV A; 2RK1 A; 3V7R A; 4JLG A; 1MMG A; 2X4X A; 4Y28 E; 4C0Z A; 3VKI A; 1HSQ A; 2BZX A; 3I56 Q; 3H0I A; 3JCM X; 1OPL A; 3M53 A; 4J9H A; 2RQW A; 4M77 F; 2FEI A; 1QVF S; 2CSQ A; 3QJY A; 1N27 A; 2E64 A; 1QKW A; 3LGL A; 3QDF A; 2A36 A; 1W70 A; 4QQG A; 2BIV A; 3I56 A; 5GAN d; 4DEY A; 3BDL A; 2RM4 A; 1KC8 R; 1RL2 A; 1C0M A; 2DXB A; 1TG0 A; 4C8Q G; 1W4S A; 2EGE A; 1S72 T; 2MMP A; 3WVD B; 1OPK A; 2DET A; 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