The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Paxillin and ponsin interact in nascent costameres of muscle cells
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ponsin
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
15
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1X2Q A; 2FPF A; 1NYG A; 1FMK A; 2L2P A; 1ZUY A; 2A08 A; 2KXC A; 1QWE A; 1E6G A; 2F2X A; 1BBZ A; 2DRK A; 2ABL A; 2LQN A; 3O5Z A; 4AG2 C; 2A28 A; 2ED0 A; 3H0I A; 4F16 A; 1UTI A; 1T0J A; 3SHW A; 4OML A; 1PWT A; 1XOV A; 3QWY A; 5IHN A; 4D8D A; 2YUN A; 2L3P A; 3I5R A; 3PVQ A; 3FJ5 A; 2BZX A; 4AFS C; 5L23 A; 4M4Z A; 3QWX X; 1M3B A; 2C0T A; 3H41 A; 3THK A; 1PHT A; 2CH4 A; 4RTT A; 1UHC A; 2D8H A; 3I9Q A; 2RMO A; 1ZLM A; 1SHF A; 2W10 A; 2HBW A; 1QKX A; 2K79 A; 3VRY A; 3M0R A; 3PE0 A; 2RQT A; 2DE0 X; 2KRO A; 4KRT A; 2LX7 A; 3A98 A; 2G6F X; 1TUC A; 3EGU A; 1OPL A; 1GBR A; 1BK2 A; 2PTK A; 2X3W D; 3NMZ C; 2EYY A; 2JXB A; 1K76 A; 2DL7 A; 4HVV A; 4X1V A; 2ECZ A; 2JM9 A; 1OV3 A; 4GBQ A; 2ED1 A; 1YWP A; 2HEQ A; 2O88 A; 2JM8 A; 2KYM A; 3H0H A; 2DL4 A; 2KT1 A; 1WXU A; 2CH4 W; 2J6K A; 3EG3 A; 1YWO A; 4AFZ C; 2J6F A; 1QCF A; 2BZY A; 2CDT A; 2XMF A; 2VWF A; 3GBQ A; 1OPK A; 4AFQ C; 4K11 A; 3REA B; 1NM7 A; 1VYT A; 2M51 A; 1RLQ C; 1UDL A; 3EHQ A; 2ESW A; 1ZUU A; 1Y57 A; 3EG1 A; 1ZBJ A; 1RI9 A; 1OEB A; 1X69 A; 2OAW A; 3ZL7 C; 1WXT A; 2JT4 A; 1UE9 A; 4HCK A; 1Y0M A; 4RTW A; 2YT6 A; 1WX6 A; 4HVU A; 2DYB A; 2CUB A; 2EW3 A; 2O9S A; 1RLP C; 3M0T A; 1NLP C; 2MIO A; 3TVT A; 1GFC A; 2VVK A; 3LH5 A; 2VKN A; 2O2O A; 5FW9 A; 2AK5 A; 2KRN A; 2IIM A; 2CSI A; 1ZSG A; 2KEA A; 4LN2 A; 2P4R A; 1CKA A; 2M0Y A; 2DL8 A; 1SPK A; 2YDL A; 2GQI A; 4OMQ A; 2EYW A; 1YNZ A; 4A63 B; 3CQT A; 3UF4 A; 1SHG A; 2RQU A; 5ECA A; 1QKW A; 3C0C A; 2CT4 A; 1K0S A; 1PKT A; 2YUQ A; 1U3O A; 1UG1 A; 1AZG B; 2JW4 A; 3UA6 A; 1X6B A; 3REB B; 4CC4 B; 2EGE A; 3VS7 A; 3M0S A; 1JXM A; 2V1Q A; 1YCS B; 3RNJ A; 4CC2 A; 2LQW A; 2CSQ A; 4OMM A; 4GLM A; 1X2K A; 1VYU A; 1UUE A; 4JJC A; 1GRI A; 5FWC A; 2EGA A; 4J9E A; 2AKK A; 1AOJ A; 1E6H A; 1PRM C; 4QT7 A; 4RTV A; 2YSQ A; 2ROL A; 1WYX A; 1YN8 A; 3SEM A; 4AFU C; 4JJB A; 1M3C A; 4OMP A; 1VYV A; 1ARK A; 1NEB A; 2A36 A; 4ESR A; 2GTO A; 2SRC A; 2LCS A; 1A0N B; 3ULR B; 3KFV A; 4RTX A; 2CT3 A; 1ABQ A; 2JS2 A; 2RNA A; 4DEX A; 2JMA A; 2DLP A; 1AWJ A; 2HSP A; 2RQV A; 1U06 A; 1U5S A; 2ROT A; 4RTZ A; 4F17 A; 2KNB B; 2K3B A; 3VS3 A; 3R6N A; 1BU1 A; 1SRM A; 4J9G A; 2EYZ A; 3M0P A; 1HSQ A; 2HCK A; 1SRL A; 2RF0 A; 1MV0 B; 1UHF A; 2BTT A; 1W6X A; 2DM1 A; 2H8H A; 3NPF A; 2NWM A; 1KIK A; 3EG2 A; 1WA7 A; 4OMN A; 4ORZ A; 1EFN A; 2KGT A; 4F14 A; 1MV3 A; 1ZUK A; 1NYF A; 1GCP A; 1T3L A; 1IO6 A; 3UA7 A; 1ABO A; 2YUO A; 1T0H A; 5FWB A; 2LNH B; 5IXB A; 2EBP A; 1V1C A; 1KJW A; 4J9C A; 2JTE A; 2L0A A; 4RTU A; 3NGP A; 2FO0 A; 2RPN A; 2JS0 A; 1BB9 A; 4AG1 C; 1AD5 A; 1QWF A; 2DA9 A; 4LUE A; 2EGC A; 2AZV A; 3EG0 A; 2L3Q A; 2ENM A; 2DIL A; 1TG0 A; 2V1R A; 4LNP A; 2LMJ A; 1UJ0 A; 2K2M A; 1E7O A; 2PNI A; 4HXJ A; 1GCQ C; 2DNU A; 2DJQ A; 5GJV B; 1PNJ A; 2K7A A; 2W0Z A; 2RQR A; 1G2B A; 2O9V A; 2JMC A; 2CUD A; 4ZNX A; 1HJD A; 4JPB W; 1AEY A; 4J9D A; 3EHR A; 4OMO A; 2GTJ A; 4J9F A; 5IH2 A; 3VS4 A; 1NEG A; 1TUD A; 3PVL A; 1VA7 A; 2DF6 A; 2SEM A; 1HD3 A; 2DBK A; 5IXF A; 1JU5 C; 2FRW A; 5HCK A; 5I11 A; 1I07 A; 1JO8 A; 1B3Q A; 1UFF A; 4Y92 A; 2FG0 A; 2DBM A; 2GBQ A; 2FRY A; 1GL5 A; 1AVZ C; 1WXB A; 4EIK A; 1K1Z A; 1M3A A; 4J9B A; 1X27 A; 2DVJ A; 4IIO A; 1AWX A; 2D1X A; 1H8K A; 1N5Z A; 2RN8 A; 1PRL C; 1KFZ A; 2EYX A; 2F2W A; 1SEM A; 1GFD A; 2E5K A; 1I0C A; 1PKS A; 1WDX A; 2J7I A; 2KRM A; 4CC3 A; 2AZS A; 3M0U A; 2C0O A; 3VS5 A; 2EVR A; 1FYN A; 2CRE A; 2KBT A; 2RQW A; 3TSW A; 3VS6 A; 4Z89 A; 1YP5 A; 2MCN A; 2DL5 A; 3VS0 A; 2O31 A; 2DX1 A; 5GJW B; 1WI7 A; 2KXD A; 1UJY A; 4Z8A A; 2J6O A; 1AWW A; 2F2V A; 2J06 A; 5I22 A; 2L3S A; 1X43 A; 3TSZ A; 1NLO C; 1GCQ A; 2EQI A; 3U23 A; 2A37 A; 1WFW A; 2LJ3 A; 1W1F A; 2KYB A; 1M30 A; 3RBB B; 1K0X A; 1M8M A; 2EPD A; 3JV3 A; 1K4U S; 4Z88 A; 2X3X D; 1JXO A; 1X6G A; 2KR3 A; 2BZ8 A; 1H3H A; 2FEI A; 2NUZ A; 4FSS A; 3I5S A; 3UAT A; 3NHN A; 1M27 C; 2C0I A; 1K9A A; 1ZX6 A; 5IHK A; 4J9I A; 1I1J A; 2J05 A; 2HDA A; 2MOX A; 1Z9Z A; 4JZ4 A; 3IQL A; 3M0Q A; 2YUP A; 4R0K A; 4DEY A; 4RUG A; 2DRM A; 2K9G A; 4JZ3 A; 1WLP B; 1B07 A; 1H92 A; 2D8J A; 2LP5 A; 2D0N A; 2GGR A; 3VS1 A; 1AZE A; 1UGV A; 4IIM A; 4D8K A; 1RUW A; 4RTY A; 2DMO A; 1S1N A; 1G83 A; 1LCK A; 1OOT A; 1KSW A; 5IHI A; 2FPD A; 2PZ1 A; 5EC7 A; 4J9H A; 1WIE A; 1UEC A; 4CC7 A; 2OI3 A; 4LUD A; 1NG2 A; 2LZ6 B; 2FPE A; 2KE9 A; 1SSH A; 2KRS A; 4HVW A; 1GBQ A; 1W70 A; 1JEG A; 2QDL A; 1J3T A; 2LJ0 A; 2DL3 A; 2GNC A; 4E6R A; 2OJ2 A; 1QLY A; 1CKB A; 2K6D A; 4LE9 A; 3H0F A; 3I35 A; 3VS2 A; 2B86 A; 1JQQ A; 2EKH A; 2AKL A; 1MUZ A; 3VRZ A; 2KT8 A; 4WCI A; 2LJ1 A; 1Z9Q A; 4JJD A; 1CSK A; 1T3S A; 1AWO A; 2I0N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UGS B; 3MKD A; 1NYG A; 1OX9 A; 2L2P A; 3VU3 C; 2LQN A; 4BY6 B; 2PVO B; 2ED0 A; 4LXC A; 1T0J A; 5C0M A; 1XOV A; 3OY9 A; 4D8D A; 2RI5 A; 3L2W A; 3J80 E; 3X24 B; 2BZX A; 4ZN3 A; 1YJ9 T; 3EGD B; 4ZGJ B; 5AT1 B; 3GNG A; 2CH4 A; 4MDW A; 4RTT A; 3VUZ A; 1UHC A; 2D8H A; 2HL5 C; 2RMO A; 5GAO l; 1Q81 C; 3OSV A; 3CEY A; 1K73 C; 2LX7 A; 3OYC A; 4IUQ A; 3EGU A; 1UGR B; 4HA8 A; 1YHQ Q; 4E7J A; 1EIF A; 3JCM c; 1K9M C; 3EGX B; 3RES A; 3JCM f; 4HVV A; 3A8G B; 2JM9 A; 3MP8 A; 1OV3 A; 2V8K A; 2E4H A; 4GBQ A; 1Q86 U; 1YWP A; 3PMT A; 4HT9 A; 4DQ2 A; 2DL4 A; 1WXU A; 1D1B A; 2CH4 W; 1KQS S; 3EG3 A; 4AFZ C; 2RH2 A; 1QCF A; 1OZ2 A; 2XMF A; 3GBQ A; 2VGM A; 4AFQ C; 1NBE B; 1VQ6 A; 2COY A; 3CBM A; 4AMC A; 1VQ6 T; 2HNI A; 2X4Y A; 1VYT A; 1UDL A; 2HQE A; 1ZUU A; 4C0F A; 4M75 C; 4F7U B; 4MZM A; 3CCE T; 1WXT A; 2YT6 A; 1D3B A; 3OYM A; 2DYB A; 4OGC A; 2MMP A; 1NLP C; 2MIO A; 5LJ5 h; 2PVD B; 3RKY A; 4KGX B; 3M57 A; 2IIM A; 2FZK B; 2NUP B; 1OU9 A; 4LN2 A; 2DKG A; 1AT1 B; 4OMQ A; 3SFM A; 4M77 E; 2ZCF B; 4A63 B; 1VUB A; 3M56 A; 7AT1 B; 2YUQ A; 2R57 A; 5LJ5 e; 4O6J A; 4M78 F; 3EH1 A; 5GAN h; 2CYZ B; 3H9N A; 2HAX A; 1M9S A; 2RHZ A; 3M0S A; 3MPU B; 5GAO r; 2V1Q A; 1YCS B; 2WSE E; 2LQW A; 2CSQ A; 1UUE A; 4JJC A; 2WSC E; 3CXC S; 1M1F A; 2H3E B; 1YHQ A; 1E6H A; 4QT7 A; 2WAC A; 4E7S A; 3JRZ A; 4F7U E; 3QUI A; 2ROL A; 3GPL A; 1MGQ A; 1WYX A; 2ZPB B; 3SEM A; 4N0A C; 1M3C A; 4XTZ A; 4J7I A; 5DY9 A; 3LWH A; 2A36 A; 1Y07 A; 4ESR A; 1A0N B; 3ULR B; 3E9F A; 5GAN j; 2JMA A; 3QBY A; 2YRV A; 1WHM A; 4ME7 A; 2Z0W A; 4HCB A; 4F17 A; 1QVF S; 2K3B A; 3VS3 A; 2EQM A; 2DXT A; 5GAM f; 2HCK A; 1D0Y A; 1D09 B; 3OW2 P; 1KC8 R; 3G71 T; 1W6X A; 2EKO A; 4DBF A; 1O75 A; 3EG2 A; 1JJ2 S; 4ORZ A; 3RUX A; 1EFN A; 2M16 A; 4EMK C; 4RKU E; 1T3L A; 1VQN Q; 3OYD A; 1VQ8 Q; 4C92 A; 1KJW A; 3L2V A; 4J9C A; 3ZBD A; 4M78 A; 2FO0 A; 2RPN A; 4VUB A; 3OW2 A; 1BB9 A; 2DA9 A; 2LT1 A; 2EGC A; 3EG0 A; 2MK5 A; 2L3Q A; 2DIL A; 3ME9 A; 2LMJ A; 1M1K C; 4M7A C; 2ZPH B; 1GCQ C; 4HXJ A; 2DNU A; 4XU1 A; 5LJ3 f; 1N9S A; 2DJQ A; 2DAQ A; 1BIA A; 4XTY A; 1PNJ A; 4HKE A; 2K7A A; 2RHI A; 1VQL T; 4M7D B; 5CK9 A; 4QW2 A; 1G5V A; 1AEY A; 1Q81 R; 2GTJ A; 4PJO G; 4JJN K; 2FVU A; 1K73 R; 1Y71 A; 3RMQ A; 3VS4 A; 1NEG A; 1WQW A; 2XID A; 2L8D A; 3G4S Q; 4JUV A; 1JU5 C; 5HCK A; 2DJZ A; 1KQ2 A; 3QYH B; 5FU7 C; 1K9M R; 4LDY A; 3E9G A; 3CCM T; 4Y92 A; 3URG A; 2FG0 A; 2F5T X; 2QI2 A; 3OYE A; 1W4S A; 5GMK l; 4CRI A; 2GBQ A; 2FRY A; 5GAO q; 3EFO B; 1G3Y A; 3QZ5 B; 3JCM h; 1M3A A; 2XD0 A; 4J9B A; 1X27 A; 2LT4 A; 2RN8 A; 1PRL C; 1KFZ A; 2EYX A; 1BI1 A; 2E65 A; 2ZPE B; 4PJO D; 3OYG A; 1VQM Q; 3OYK A; 1SEM A; 1NJI C; 2J7I A; 3EH2 A; 3LWI A; 1QMC A; 2AZS A; 2FHD A; 1D0X A; 3VS5 A; 1IHW A; 1FYN A; 3JCM e; 4Z02 A; 1YIT Q; 2KBT A; 3TSW A; 4XTV A; 2ZAE A; 4M7D E; 3FJP A; 1JBM A; 4M77 D; 1X6O A; 3CPW S; 1AWW A; 4OGE A; 3M54 A; 2L3S A; 1U1S A; 1X43 A; 3U23 A; 2KDS A; 5GAN 8; 2LJ3 A; 1VQN A; 4FCY A; 1VQ9 Q; 4QQD A; 2KYB A; 1VQ8 A; 3RBB B; 1VQN T; 4OF1 A; 1VQ8 T; 4Z88 A; 1QP2 A; 1X6G A; 3CBP A; 2KR3 A; 1H3H A; 2LCL A; 3OYN A; 3DB4 A; 1RAE B; 3P8B B; 2NUZ A; 4A4H A; 4FSS A; 3UAT A; 5DLO A; 1K9A A; 5CKD A; 5IHK A; 4E47 A; 4J9I A; 2QEX Q; 2J05 A; 5KCH A; 2DYI A; 3JB9 J; 2DER A; 3RKW A; 5IAY A; 2HDA A; 1HYO A; 2RO0 A; 3H6Z A; 4JZ4 A; 1M2O A; 3S6W A; 2DK3 A; 3EGD A; 2DRM A; 4L6V 5; 3C94 A; 1YJN Q; 2LP5 A; 2GGR A; 4DOW A; 3UT1 A; 3G4S A; 4KUD K; 1AZE A; 1DJ7 B; 3CXC P; 4LDX A; 3CCQ Q; 2QGF B; 1VQ4 T; 4A54 A; 3OS2 A; 1WHH A; 1IZ6 A; 2EWN A; 4IUV A; 1PM3 A; 2FPE A; 2M1H A; 4BE0 A; 3M5A A; 3CCU Q; 3EGX A; 1JEG A; 2YWW A; 4FW2 A; 5D7U A; 2DTH A; 2JN0 A; 4KUI A; 1VQM A; 3CC4 Q; 3BE3 A; 1VIE A; 1KK7 A; 1VQM T; 3JB9 F; 4LE9 A; 4CI0 C; 3H0F A; 3JCM V; 1NPP A; 5I2M A; 1JQQ A; 4IUT A; 1M90 U; 2AKL A; 4J83 A; 1YIT A; 1N8R C; 3VRZ A; 4EPC A; 4MDX A; 4WCI A; 1YIT T; 4JLG A; 3V7S A; 5GAM h; 1JJ2 P; 2I0N A; 2RD1 A; 3OMG A; 5KE2 A; 5CAI A; 4RCC A; 1X2Q A; 2FPF A; 8AT1 B; 3SDZ A; 2CS7 A; 2A08 A; 4OVA A; 1QWE A; 2QXF A; 1E6G A; 2F2X A; 2DRK A; 2DIG A; 1RAA B; 2ABL A; 3O5Z A; 1LPL A; 5A0G A; 1VQ9 A; 5LL6 S; 5GAM e; 3S3N A; 1VQ9 T; 1M1K R; 2FZC B; 4BE2 A; 1PWT A; 1V29 B; 1KD1 U; 5CKH A; 3NFC A; 4M78 B; 1I5L A; 4PLI A; 3MEW A; 5LJ5 g; 3RIR A; 3FJ5 A; 2K4Y A; 1YCY A; 4AFS C; 4M4Z A; 3QWX X; 3JCM X; 3H41 A; 5LJ3 h; 4C0Z A; 3THK A; 1PHT A; 1V76 A; 2RI2 A; 3F70 A; 5FU6 B; 5A0L A; 1XJW B; 2QQ9 A; 3AT1 B; 4XU2 A; 1ZLM A; 2DFU A; 1SHF A; 2NUP A; 4LD6 A; 3CCR T; 2W10 A; 3R6O A; 3PE0 A; 2DE0 X; 2KRO A; 3VYH B; 4PJL A; 3UWN A; 3DB3 A; 1JRI A; 2G6F X; 2QTX A; 2WSF E; 1IRX A; 1OPL A; 2E5Q A; 5LJ3 e; 1BK2 A; 1YJN A; 3SWN B; 1YJN T; 3JAM E; 9ATC B; 4PJN A; 2JXB A; 4A4G A; 5CVI A; 1LOJ A; 3CCQ A; 5KCO A; 4J6Y A; 5GAN f; 3CCQ T; 4ZGE B; 4ZTJ A; 3A8H B; 1VQ7 Q; 5AYF A; 4PKC C; 2VUB A; 2QAZ A; 1NJI R; 3H0H A; 3LYI A; 2KT1 A; 2M02 A; 3JSC A; 4A4F A; 3WVD B; 3M59 A; 3CCU A; 1WJS A; 4C92 E; 2QQS A; 3QII A; 4NOY A; 4M78 E; 3CME Q; 2EJ9 A; 2HL3 A; 2CDT A; 4R56 A; 1FMW A; 3CC4 A; 1OPK A; 2QYZ A; 3TRE A; 3I56 T; 1TSF A; 1BI2 A; 1H3Z A; 3L2U A; 3HP9 A; 2ESW A; 2VV5 A; 3CPW P; 3QSU A; 2K5F A; 5GAN 2; 3EG1 A; 1OEB A; 2JT4 A; 1WZO A; 3FIF A; 3CMA T; 5GAO p; 2NYS A; 4M7A F; 2LRQ A; 5CIU A; 3MO8 A; 5GAO n; 1WX6 A; 2GFA A; 2CUB A; 2A0F B; 4X9C A; 3NTK A; 3LH5 A; 4FYV B; 4N0A A; 3J7A F; 2KRN A; 2EQJ A; 2JZ2 A; 1N9R A; 3BW1 A; 2OTJ Q; 1ZSG A; 1MMN A; 4C5I A; 2M0Y A; 1SPK A; 2YDL A; 2NUT A; 2O4X A; 2K5I A; 1YNZ A; 1IGQ A; 2DIQ A; 3FEO A; 3A5Z B; 3PTA A; 2CP0 A; 5GAO m; 4M7D A; 3VS7 A; 1JXM A; 1F1B B; 2MI6 A; 1M4Z A; 1HK9 A; 1X2K A; 2EIF A; 4PJO C; 1GRI A; 5FWC A; 2XDP A; 2F5K A; 1B34 A; 4FYX B; 4XK8 E; 5KH6 A; 3CCL Q; 1AOJ A; 1PRM C; 2E3H A; 1WHK A; 2P0Q A; 2XHC A; 1MNE A; 2YSQ A; 1IRE B; 3OB9 A; 1KHI A; 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