2OBJA

Crystal structure of human pim-1 kinase in complex with inhibitor
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification and structure-activity relationships of substituted pyridones as inhibitors of Pim-1 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-12-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2objA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2objA01
3JPVA 4BZDA 4QTEA 3LLTA 2DWBA 3DBQA 4XYFA 2IZTA 3T8OA 5AV2A 2OZAB 1V0OA 1YW2A 2BAKA 3GOPA 5TF9A 3ZUTA 1QPEA 4S2ZA 4BL1A 2PMOX 5I4NA 3DAJA 1JKSA 3Q6WA 5CASA 4RVTA 3W55A 1OPJA 2C1AA 3EQGA 3PPZA 3R9RA 4BF2A 4RLKA 3ZDUA 2WOUA 2QVSE 2UZEA 1XH8A 2BZHB 4E4LA 2WU6A 4HVGA 2X39A 3PPKA 3FZTA 4U44A 4I0RA 2VTPA 3NLBA 4FA2A 3R8UA 4XOZA 5FRIA 3H10A 4KIKB 4IWPA 4C4EA 4D58A 3FKNA 5J9ZA 4QYFA 5HCXA 5KHWA 1M7NA 3O8UA 2XNGA 4IDVA 4QTCA 4IVBA 5KZ0A 4QTAA 1ZYJA 4RQKA 2BKKA 1YI3A 3RPOA 4GIHA 1O9UA 2B55A 4O7ZA 1E9HA 3AT2A 2YZLA 2CJMA 3OWPA 4O0VA 1GY3A 2YLEA 4YUQA 3LQ3A 5CAUA 4NM3A 3PY3A 3NW7A 3Q52A 1SNUA 4Y73A 4MCVA 4L7SA 4IZYA 5H3QA 4QD6A 2YAKA 3JUHA 1DAYA 3WF8A 2R7IA 3S4QA 3DBFA 2H96A 4XV3A 2PY3A 2XNNA 3OXZA 1OKVA 4FSNA 3ALOA 4PP9A 4XHKB 3OTVA 4UYNA 3U51A 4AZSA 3FZ1A 4FKLA 4D2SA 4DHFA 1MRYA 4FEVA 4USDA 2XYNA 1GJOA 3W16A 4PV0A 3NMUF 1H07A 5EDPA 3ZXZA 3EIDA 4YTFA 3F3ZA 1PKDA 4KBCA 1KE6A 1OUKA 3L8PA 5CALA 3OCGA 3AC2A 5HG7A 2C0IA 2R9SA 1RJBA 1R78A 2YZAA 3ENHA 4BBFA 4M68A 3VUMA 2BIKB 4RZWA 4C3RA 4O0YA 5DRBA 4O7VA 3QTIA 3NIZA 2UZOA 4AOTA 1OIRA 2OZAA 4DFBA 1U46A 3KXNA 3VS0A 3TTIA 1WBNA 3LFEA 2HY0A 4K18A 4CVAA 3MA3A 4UWCA 5BVOA 3OCBA 3QRTA 4H39A 1KV2A 4QMLA 2W05A 2X8IA 1E1XA 4QMZA 3PFQA 5T6KA 4BTKA 5DYJA 1R0PA 2HIWA 1UNLA 4LRJA 3V01A 5HIDA 4FT0A 2XZSA 2RFNA 2H6DA 4BDKA 4JDHA 5DGZA 4DAWA 5DA3A 1YI4A 3C0IA 4PTCA 4QMOA 4X2JA 4EHZA 2B0QA 3LHJA 2EXMA 1PY5A 3LZBA 2YISA 3ZH8A 3CSVA 3OWLA 4KIKA 2CSNA 3LCDA 3RTPA 2ZAZA 4RA4A 4FSMA 3BHYA 4WUAA 4RZVA 3IW4A 1VYZA 3BX5A 5EG3A 5IUIA 5IUGA 1LR4A 1NXKA 4ZJIA 2CGVA 2FYSA 1R1WA 2W99B 3QX2A 4D28A 2X4ZA 2GFSA 2ERKA 5HO8A 2UZTA 2C6DA 2VAGA 2GS2A 4CSVA 2CNUA 1GNGA 3PVGA 3SOCA 4AW1A 4BI2A 4YU2A 4ZJJA 2YM5A 3FI3A 4DH5A 3PIZA 4U5JA 2HAKA 3KY2A 1UNGA 5CSXA 5DPVA 3Q4CA 5JZJA 2QOIA 4L53A 5C03A 2KTYA 2XNOA 3MFUA 4YO6A 4L9IA 4RQVA 4BCMA 3F6XA 3TN8A 4NK9A 4LRMA 4PPAA 5L4QA 4BDHA 4FGBA 5FUTA 4K6ZA 3TL8A 3EKNA 2QODA 4M12A 5J1VA 4X21A 1KE5A 4UYAA 1PKGA 2Y6OA 4YC6A 3M11A 3VAPA 3K2LA 4ANQA 2BUJA 3RM6A 4W4XA 3VBYA 3G6HA 5DRDA 3QD3A 5AP2A 2C3JA 3V8TA 5H9BA 4U97A 2CKOA 4K77A 2JIVA 5EYDA 5HE0A 5K0KA 3SLSA 3IW7A 4QMPA 1MQ4A 2JDTA 3R8ZA 2W9ZB 4JDKA 4FT9A 1SVHA 3EQCA 4TZRA 4BWXA 5C26A 1NT2A 3R83A 4O86A 4ARKA 1UU7A 4U80A 4EHGA 2I1MA 3DDPA 3OY3A 1QPDA 1A9UA 4GSBA 3CTHA 3LJ2A 4FSUA 3QF9A 3IS5A 3S3IA 4O6EA 4F08A 2PU8A 1FVRA 3RM7A 2PZRA 2YABA 3BBWA 1O6LA 3TTJA 3ZHPC 5LVPA 2VZ6A 5T3QA 3GC9A 2WMSA 3K3JA 3AQVA 5FXRA 1XR1A 1YWVA 3GENA 3TKUA 1ZOHA 4APPA 3M2WA 2Q0NA 2ITWA 3IW5A 3V5PA 4F09A 2R3OA 2B54A 3P7AA 2R3NA 5HEZA 5E8WA 3T9TA 3W2QA 4TYGA 1Y6AA 2WHBA 3ORPA 2Z8CA 4JRVA 5CXZA 1PXNA 4W9XA 5GZ9A 5AR7A 2Z60A 3C5UA 4L3JA 5G6VA 1SNXA 3OW4A 4RWIA 2IVVA 4PL3A 2X0GA 3BU3A 2ITVA 2JAMA 1R39A 2HYYA 2G2IA 2UW9A 3D83A 4RFYA 5CU3A 5IQEA 5M4FA 3BYVA 5ANEA 4ZS4A 2V5QA 4YC3A 4R3PA 3UQGA 1ZYSA 4LQMA 3PYYA 3SX9A 5E8ZA 4HPUE 2LAVA 3D5UA 4KNBA 4KWPA 4J96A 5A4LA 3IPHA 3ZRKA 3ITZA 1XH6A 3GT8A 4DFUA 4FK6A 4ERWA 2WU7A 3RBWA 2W5AA 3QTZA 4CKRA 4G5PA 3R28A 1YKRA 2GHMA 2R0UA 4QP8A 5H8BA 3F88A 3ODZX 4IC7A 4GKHA 1RE8A 5C8KA 5BUIA 3Q2JA 1K2PA 3D15A 3RNIA 4ZMEA 1KE9A 1NA7A 4GT4A 2BDWA 4K1BA 4GJ2A 4F6WA 4A9UA 3DZOA 3FLZA 3IGGA 4QMQA 4IB5A 4A4XA 4M3QA 3BKBA 3O8PA 4GRBA 2OW3A 3O0GA 3H9FA 5FG8A 3ZUUA 5L2SA 2CKQA 3CQWA 5EKOA 3A99A 4LYNA 5K9IA 1WBOA 3W2OA 4FV6A 3SXRA 3GC7A 4MXAA 3DGKA 4GG5A 5AP1A 3VBXA 4HVDA 3FUPA 1PXKA 2AUHA 3ORNA 2BRGA 3DCVA 2J51A 5F4NA 4WD5A 1H1WA 3U9NA 4EBWA 4AA5A 1OKYA 1YHWA 2G15A 3AMYA 1IR3A 3O50A 3KVXA 3TG1A 5GJDA 5JFVA 2IN6A 1GIHA 3R2BA 5E1SA 5CAQA 3KRJA 5JSMA 2C69A 4RMZA 1BLXA 4NKAA 3GCVA 2B9FA 2E2BA 1OPLA 3MH0A 4AW0A 2XYUA 4C59A 2X81A 3Q9WA 1Y6BA 5TT7A 3CJGA 3GU5A 4AGWA 3RMFA 4TYJA 3VWAA 3SV0A 4BGQA 3O2MA 1ZZLA 4FV0A 1G5SA 3MVHA 5FEDA 5F9EA 1WBPA 4C3PA 2Q0BA 4MF0A 4IZ5A 3CE3A 3GBZA 4FKIA 4KD1A 3E7VA 1CM8A 3IW6A 4DA5A 1YWNA 2VWXA 4ZAUA 5KBRA 5LJJA 2OXXA 5CTPA 3UPZA 1ZOGA 5DIAA 3UO5A 5HG9A 3HAVA 4KS8A 1YXVA 2WTCA 3HUBA 1RW8A 3PIYA 5ETAA 3NYXA 4IWQA 3EHAA 3LCSA 4YZ9A 4DEGA 5F95A 2VTJA 4XG4A 5EYMA 2VO6A 4CLJA 4NCTC 3D7ZA 4G3EA 3LFAA 4I22A 4BCJA 5EQPA 3OOGA 3UTOA 3ZFMA 4ACDA 4NZWB 5CVGA 2XIRA 3COMA 1UU3A 4W8EA 4IVDA 5CAVA 3F2NA 3IECA 1XBBA 2OSCA 2QR7A 5DT3A 4BTJA 3KXZA 2VWUA 4D2WA 2WGJA 4O82A 2ITQA 2B53A 1PXMA 3C0GA 5JFWA 3TZ9A 4AN3A 2PVLA 3BU6A 3QCYA 4I1ZA 3RWPA 1H1SA 4GT5A 5EOBA 4FKWA 2G2HA 2H9VA 5AR8A 5B2LA 2VTAA 4HPTE 3QUEA 5C4LA 3KMMA 3MVMA 2B9JA 3QTXA 3NYNA 1ZY4A 3FXWA 5ANDA 3I7BA 3QFVA 3O96A 4KA3A 4Q5HA 4FOCA 3JVRA 3NNXA 4BWPA 2P2HA 4O96A 1YRPA 2WQEA 2A19B 2P2IA 3HEGA 3VQUA 3I0QA 3QAME 1P14A 3D2KA 5HIEA 3U4WA 3V6SA 4U0IA 2C6TA 2X8DA 1ZYLA 1LP4A 4KIPA 3FI2A 5DOSA 4O0WA 2WPAA 3VRYA 3ULIA 4EI4A 4L46A 5AP5A 3LFSA 2O0UA 1R3CA 5J5SA 4F0FA 4GFMA 4O7WA 4YLLA 3CGFA 4JQ8A 4XV9A 4EOLA 4UMUA 5FBOA 5IZFA 1G8AA 2BKZA 4NYEA 5A3XA 2HXLA 2W0JA 4KS7A 3D2IA 4JI9A 4F65A 3O71A 4LOPA 3LFDA 5AP7A 2BZKB 3MB6A 5FEEA 4CQGA 2OXDA 5CF4A 3EL7A 5HO6A 3WF7A 3HUCA 3ORZA 2CNVA 3WBLA 2RFDA 3G15A 2QOOA 3BGPA 5CY3A 4FIFA 4D5HA 3DBCA 3T3UA 3WZDA 4PMSA 4X6QC 3IOPA 3UVQA 5ETIA 2YIYA 4AZVA 4MVFA 5LMKC 4EORA 4G6NA 4EOPA 5JH6A 4WNKA 2R5TA 3RGFA 3ZRMA 3E87A 1BUHA 1XO2B 2DS1A 2Y4IB 3CEKA 5CU2A 5J9YA 4G5JA 3UJGA 3HA6A 4NT4A 2QU6A 4ERKA 4U3ZA 2CKEA 4FSRA 2WOTA 4XUFA 3ZEWA 2J5EA 3LMGA 4F1TA 4ANSA 5M53A 4FL1A 3HRBA 2QURA 4BICA 2VRXA 4DC2A 4YZCA 2UUEA 2WTWA 4QYEA 2UW0A 3F5XA 4ANOA 4FKTA 2B9HA 3OT3A 2XKFA 3PIXA 2ITNA 3FZRA 4TNDA 2OF2A 4D9TA 4DG2E 3ZC5A 5IA3A 2QHNA 3U9CA 2C68A 3MSSA 2Q83A 2QO2A 1WBTA 1OUYA 2BRBA 4JL9A 5HORA 2UVZA 2Y4IC 3Q4TA 4Y85A 5AR3A 1OGUA 3L9PA 4JDJA 3VBTA 1YDTE 3WZJA 2VTRA 3TJDA 3ANQA 3H9OA 3FY0A 5AJQA 2YM3A 1QPCA 5HCYA 3A7FA 5HBEA 5EKNA 4J8NA 3FI4A 1FGIA 2GNJA 3NGAA 3S95A 5M4IA 1JAMA 3BIZA 4YTCA 5BYYA 4OBOA 3RAKA 4EQCA 2XK3A 4QTBA 4C33A 3E93A 4NKSA 4K33A 4E20A 3BU5A 3PE1A 1JSTA 4RVKA 5A4QA 5EQYA 3ZSHA 5EI8A 4G17A 4X2KA 5L8JA 4F9AA 3LVPA 4U8ZA 4IX3A 4MD9E 5HG5A 5LXMA 4FG7A 4UV0A 3CBLA 4BCKA 3CQEA 5BVEA 4PRJA 3ZS5A 4UZHA 4D4SA 5BUJA 2JDVA 4E4XA 4Z55A 3UDBA 3OHTA 2CHLA 5JK3A 3HMMA 4M0YA 4IAZA 4NL0A 5CSWA 4CZTA 3MW1A 3NRMA 2OU7A 4JBQA 3GCSA 3VS6A 3CJFA 4DT9A 2QOHA 4AAAA 2HW6A 2ZDTA 3C51A 5D7VA 5GNKA 2HELA 2YIXA 2I0YA 5EFQA 2UZNA 2GS7A 4CZUA 4HYIA 4N0SA 3AD5A 3MS9A 3R1YA 4WIHA 3FJQE 5CENA 5FP5A 4HYSA 3TV7A 1M2PA 4V05A 4CKJA 3PJ1A 2ETRA 5EHOA 3FQHA 4R1VA 3UNKA 3PDTA 4DTAA 4KRCA 5C8MA 5CWZA 4U40A 2BRMA 2QCSA 3ZBFA 5HESA 4AUAA 3SXFA 1A06A 4H3PA 3FMKA 5HLWA 2YCFA 3W8QA 1P5EA 2ETMA 4YLKA 5AA9A 5IF1A 4A06A 2QG7A 3GOKA 4FTOA 5L8LA 1J7LA 4U41A 2PUNA 4O83A 1OECA 4XLVA 3POOA 3G9LX 3QQHA 5H8EA 4PQNA 3RP9A 2H34A 3ZRLA 4CFNA 3E92A 3TXOA 5L2WA 4XP0A 4OTQA 3RAWA 3QQKA 5A6NA 4BCNA 3FMHA 3KN5A 1A48A 3CIKA 3D94A 5H2UA 4O7NA 5FWKK 3PXZA 2WMAA 4YJQA 4EOQA 3D7TB 5DWRA 3QZGA 4YJVA 3IDPA 4YHFA 4AZWA 5E90A 4A07A 4AT4A 3NUNA 1KWPA 2JGZA 1Q3DA 1B38A 4RIYB 4Z7HA 4IANA 5HI2A 5AM6A 2HW7A 4GH2A 1U54A 2WMXA 4II5A 4WG4A 4JNWA 3VQHA 3D5VA 1U59A 4LV8A 4EYJA 4KKHA 3R63A 4BBMA 4BCGA 3UOHA 4U3YA 5CEMA 5K4JA 3KU2A 3QCXA 2NRYA 3HLLA 1SM2A 2XRWA 3HMPA 4O1PA 4YJTA 4P5ZA 2R3QA 1IRKA 2R3GA 3C5IA 2JFLA 2FSLX 3WOWA 5K5NA 5IQHA 3DXPA 4C57A 4RC3A 4D4VA 4DTBA 3P7BA 4AQCA 1JWHA 1Q97A 5E8SA 1P4FA 2Z7LA 2R3JA 5D12A 2W96B 1W98A 2QLQA 5HE1A 4RRVA 1Z57A 1OL5A 3AC1A 3U8WA 3DZQA 3I0OA 4BKJA 4XV1A 4E73A 5CQUA 2CGUA 5CQWA 5E4HA 5AV1A 2PZIA 4LMUA 4D2TA 3DKGA 4DFXE 3QCSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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