The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
79
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structure length |
79
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Chain Sequence |
KIKNYQTAPFDSRFPNQNQTRNCWQNYLDFHRCEKAMTAKGGDVSVCEWYRRVYKSLCPISWVSTWDDRRAEGTFPGKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
CYTOCHROME C OXIDASE
|
| publication title |
Redox-coupled crystal structural changes in bovine heart cytochrome c oxidase.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| total genus |
23
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| structure length |
79
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| sequence length |
79
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| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-05-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| H | PF02297 | COX6B | Cytochrome oxidase c subunit VIb |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Cytochrome c oxidase, subunit VIb |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EIN H; 3ABL H; 3X2Q H; 1OCR H; 3ABM H; 2EIL H; 2EIJ H; 3AG4 H; 2EIM H; 5B3S H; 1OCO H; 1V55 H; 3ABK H; 2EIK H; 2ZXW H; 5B1A H; 1OCZ H; 3ASN H; 3AG2 H; 3AG3 H; 1V54 H; 2OCC H; 1OCC H; 3ASO H; 5IY5 H; 3AG1 H; 2DYS H; 2Y69 H; 3WG7 H; 2DYR H; 5B1B H; #chains in the Genus database with same CATH topology 2WAF A; 3ZQL A; 3GFJ A; 2DJN A; 1VQO I; 4KIF A; 3HOU J; 3K4L A; 1U2W A; 3LL7 A; 2FXA A; 3E5X A; 3OL3 A; 3FHZ A; 1E0E A; 2DTZ A; 1YRN B; 3N4M A; 2V1X A; 5ERI A; 3S3O A; 2BVM A; 4RMN A; 4B3X A; 2O9L A; 3CC4 I; 3LSI A; 2K9N A; 1FBU A; 2K02 A; 5FKO A; 4LMY A; 2ISY A; 1UAA A; 2HXI A; 2Y30 A; 2CQQ A; 5F27 A; 1QBJ A; 3QAH A; 3CJN A; 2H6B A; 1I3A A; 2R5Y A; 3U9G A; 5EG0 A; 3EUH A; 3ABM H; 3KCC A; 3TOA A; 3L2R A; 2EIJ H; 2HDC A; 4HPQ A; 3EYI A; 1R71 A; 1I27 A; 1ZAO A; 1BC8 C; 2EV6 A; 1SAX A; 3ABK H; 2GAU A; 4MEY F; 2F5D A; 4BQN A; 4DOZ A; 5IT3 A; 2MC3 A; 4BEH B; 2WAQ N; 3TO9 A; 2JVH A; 2Z1D A; 3CJQ B; 2GOX B; 2MW8 A; 4F93 B; 2ZJP F; 1ZR2 A; 3DTE A; 2BEO A; 3F3X A; 3DLL F; 4I02 A; 2XAJ A; 5BNG A; 2BOL A; 3RKW A; 1STZ A; 2W85 A; 3BG7 A; 3IC7 A; 4CCM A; 4MEX F; 1D5V A; 3T8T A; 4GXO A; 2BW3 B; 3GW2 A; 1MNE A; 1RC9 A; 2PEX A; 4D5F A; 1OCZ H; 4BQO A; 3KP4 A; 2XC7 A; 2EFN A; 2W82 A; 3U1K A; 4UUS A; 2HQ5 A; 2R7T A; 3GX4 X; 4XNF A; 3V42 A; 5E3L A; 2GXB A; 4Y33 A; 3GBG A; 2K9M A; 1YLF A; 2KL4 A; 3BLY A; 2AXT C; 1D1A A; 2O0Y A; 2V4J C; 1PVE A; 3E6M A; 5BOX A; 1NK3 P; 4O6J A; 4XMY A; 4HZF A; 2IGK A; 5F64 A; 2NS8 A; 5J3L A; 4Q4Z F; 3VWB A; 1S29 A; 3K6G A; 5F0C A; 4H4K C; 2E1C A; 4M9Z A; 3QYF A; 5C3E J; 2VC0 A; 2HU9 A; 2VAS A; 4LB6 B; 2CV0 A; 1IXR C; 3ZPL A; 3W6V A; 2XF5 A; 2EB7 A; 4O5V A; 1ZG5 A; 4IQJ A; 4DYC A; 3ZOB A; 3H3U A; 2IA1 A; 3OS2 A; 3ZXS A; 3I64 A; 3S17 J; 4G94 A; 1GT0 C; 1QVT A; 2VE9 A; 1SVL A; 3F0C A; 4HOB A; 1KU7 A; 2NYX A; 3PL8 A; 5FO5 A; 3I54 A; 2WTE A; 3SDG A; 3OIO A; 3CUQ B; 1OR7 C; 1Z0X A; 4OIP F; 4I09 A; 1X3U A; 2F2E A; 3TP0 A; 3WTZ A; 3ZRG A; 4AM3 A; 4JP0 A; 4B43 A; 4BHB A; 3BR5 A; 2FJ1 A; 3PSF A; 4V2G A; 1F43 A; 4LIT A; 4IOA F; 3JAM Z; 1DPU A; 1J2X A; 3RPQ A; 4AIJ A; 3S3M A; 1IG7 A; 1O7L A; 3D1N I; 3DKW A; 1FNN A; 1BR2 A; 3G1M A; 1U78 A; 2W1O A; 3CDL A; 3HEF A; 3HTU A; 3DEU A; 3FIS A; 2PQ8 A; 2HPI A; 4Q48 A; 3OIQ A; 4ZC3 A; 4A12 A; 2K3P A; 3C3W A; 3A01 B; 3HKZ A; 1B72 A; 3P9K A; 4EV0 A; 2LKS A; 1FTT A; 3WU1 B; 5FLV A; 2Y9Z A; 2O03 A; 3CF2 A; 3M4O J; 1ETX A; 2V9K A; 4BHC A; 2QSF X; 4TV7 A; 2LBF A; 3ULQ B; 1J0R A; 2VKD A; 2L01 A; 5LRR A; 1U5T A; 2TRT A; 3FBI B; 5JR3 A; 5LD2 C; 1LE8 A; 1C0W A; 2V9V A; 3SJM A; 2C6Y A; 1XG1 A; 1J7K A; 4C9Y A; 5E1Z B; 3VB2 A; 2YSR A; 3FM5 A; 1B59 A; 4DNC A; 2XHK A; 5GAD J; 3KE2 A; 2MLG A; 3B6C A; 4NUB A; 4DZP A; 5DM7 F; 4XLP F; 5D5V B; 4PUS A; 3SFZ A; 1BW5 A; 3J81 Z; 3LOC A; 2K40 A; 1P4W A; 4UY8 I; 3A0H C; 2EA4 A; 3QYE A; 1ZEL A; 4II3 A; 1J9I A; 2JZY A; 3G73 A; 1UMQ A; 1BL0 A; 2XPV A; 3IWZ A; 3E5Q A; 3HPG A; 1HDD C; 5EGO B; 1WWX A; 5DTD A; 2ZJ2 A; 1ON1 A; 5JLX A; 3AG1 H; 2CW7 A; 1G2H A; 1MMS A; 4EJW A; 4A3I J; 3M1E A; 2W7N A; 3K2A A; 2CUJ A; 2A61 A; 3LSK A; 2BY2 A; 3BRO A; 1LJ9 A; 1ZG3 A; 1PP8 F; 1CGP A; 1VQL I; 2K3F A; 3K4J A; 2JA5 J; 4CA0 A; 1ETW A; 1GHC A; 3KEY A; 4RAZ A; 1W0T A; 2CYY A; 2HDD A; 3K4C A; 3OMY A; 2VKE A; 4D7N A; 2ZNZ A; 3OYF A; 2XDV A; 1ZLJ A; 1R49 A; 1I5Z A; 1X1D A; 3GLL A; 4OWR B; 2M4G A; 2XUB A; 2OZ6 A; 1N77 A; 2QSH X; 1MZB A; 1MJA A; 2XB5 A; 1R5I D; 2RNJ A; 4FQG A; 1K4S A; 3AFH A; 2G7H A; 2OF7 A; 2V26 A; 2HS5 A; 3EYY A; 2DO7 A; 2W57 A; 3DEW A; 1VQ6 I; 3G3Z A; 3T5X A; 1TNT A; 4F52 A; 4WK8 F; 4XRM A; 3H1C A; 2LY1 A; 3CCE I; 3ZMT A; 2D1H A; 2VQH A; 3HOV J; 1ONV A; 1D8K A; 4U88 A; 5LGN A; 2VKV A; 1WHU A; 3HDD A; 3R0A A; 4WXC A; 3MFK A; 4ETS A; 5ICE A; 1LVK A; 4HG2 A; 4R79 A; 2BHZ A; 3FWE A; 3KP2 A; 1UCR A; 2ELJ A; 4PGG A; 3CCJ I; 2DK5 A; 4LIV A; 1UEL B; 2ZME A; 3PFI A; 1FOK A; 2ZKZ A; 3LSR A; 2W00 A; 3S3N A; 3GTK J; 1YX5 A; 3BC8 A; 1NH3 A; 1L0O C; 1Q1H A; 3OYG A; 1ACI A; 2M34 A; 3S2D J; 4ENN A; 1DU0 A; 4CCO A; 1JKO C; 4PSX A; 3RZO J; 4RB3 C; 3LAJ A; 1T0F C; 2WB1 A; 5ICC A; 1BIA A; 1VI0 A; 1TWH J; 1T95 A; 1YW8 A; 2JJ7 A; 2OPT A; 5E3N A; 1HW2 A; 3DPT A; 4FE7 A; 1FOX A; 4IQ4 A; 5L3D A; 1MND A; 3BG3 A; 2KFD A; 2OJE D; 3TED A; 3I55 I; 1NG6 A; 3FXK A; 5DUK A; 2K86 A; 4A2U A; 1G3W A; 2IVM A; 6PAX A; 3J7A O; 3WTW C; 1U0J A; 2Q0O A; 1XGM A; 2WAD A; 1VTN C; 3COA C; 3HUG A; 3F8N A; 2A5Y B; 2OAZ A; 3HRT A; 3HOT A; 4YFN F; 3CUQ C; 3DKY A; 1ETO A; 4WWC A; 2L5Q A; 4E7K A; 1PDN C; 2EFQ A; 1FOY A; 4IF4 A; 2GZW A; 3K2Z A; 1OCC H; 4MNU A; 2E1O A; 4UV9 A; 4QIW N; 3GZ6 A; 4F3Q A; 9ANT A; 2X6O A; 3OYN A; 4HDU A; 5JI6 A; 1X1C A; 4RB1 A; 5EEH A; 1FT9 A; 3KP6 A; 3DF8 A; 3ZN0 A; 2XRN A; 2OD5 A; 4UHT A; 3K4B A; 3FMS A; 2O8K A; 2UV1 A; 5J1U A; 2VI6 A; 2FBH A; 4XK4 A; 2VQG A; 3S1Q J; 1ZYR F; 3PSI A; 2DOF A; 1B1B A; 3O8H A; 3CDH A; 3VEP A; 4E7J A; 1FY7 A; 3ABT A; 2L2O A; 1J09 A; 1TLH B; 4M74 A; 3TMO A; 2JA7 J; 3HOZ J; 4PGH A; 4IHT A; 1SD6 A; 2W84 A; 3BR0 A; 3W2V A; 2HQN A; 3WTV C; 2IAI A; 2ZNY A; 1QZZ A; 2R7F A; 3RCO A; 1K61 A; 3K1P A; 5FB2 A; 2FNP A; 2P81 A; 4UNO A; 3FXQ A; 3D5L A; 1RZ4 A; 2M1B A; 5LLQ A; 4XLH A; 5IPA A; 1HKT A; 3OS0 A; 2K9S A; 4RLQ A; 2M2E A; 4I6Z A; 4BXU A; 3F9K A; 1BN5 A; 3I58 A; 5J47 A; 3BDD A; 1TWC J; 4I99 C; 3TOB A; 4RS8 A; 3U21 A; 2EBI A; 3JW4 A; 2KRH A; 2L4M A; 2KRF A; 1F36 A; 5ICF A; 1T38 A; 3S1M J; 1S7O A; 3G4S I; 3V8K A; 1W7P B; 2O6G E; 3A1Y A; 2G0E A; 3I59 A; 4L9V A; 5FRN A; 4B09 A; 1IN7 A; 1Z9C A; 1WVR A; 2KPM A; 3WGH A; 1D1B A; 2CW8 A; 2V79 A; 4IRI A; 1HA8 A; 1X4O A; 3J80 Z; 3ECO A; 1MW7 A; 4HA8 A; 3I71 A; 1A5J A; 4Y4R A; 2Q8K A; 2IS6 A; 3C7J A; 3I3L A; 3ZQF A; 3ASN H; 2LG4 A; 4F7Z A; 3V8J A; 1I3Q J; 3KPH A; 4HX4 A; 1TQP A; 1I6H J; 1B9M A; 4KDP A; 1BM9 A; 2LF8 A; 4A69 C; 3J7Z I; 2Q1Z B; 3MKZ A; 4BBS J; 3SYT A; 2MD5 A; 3RQ4 A; 2HKO A; 4IL6 C; 1BR1 A; 1R36 A; 4BE1 A; 4FCY A; 2P0W A; 1U9N A; 3IRR A; 2VJJ A; 1SVO A; 2A6H F; 3BT9 A; 4XIC A; 1HDP A; 4FE4 A; 3QOP A; 4E70 A; 1G59 A; 4BHP A; 2Q2E B; 1OR7 A; 3H9Q A; 5CVI A; 1GVJ A; 1TTY A; 4CO8 A; 1BR4 A; 3BCA A; 3L00 A; 2R7V A; 4EM0 B; 3QYB A; 1OLT A; 4BJT A; 4L5J A; 2DA2 A; 1JHH A; 4HSR A; 1JTY A; 3C2H A; 1S72 I; 1PUF A; 2KP6 A; 3E6C C; 2IA0 A; 4A5M A; 3BG6 A; 1KGS A; 2KMU A; 5IT9 Z; 2L0K A; 1YYV A; 2HNH A; 5DCF A; 2V9P A; 1W1W E; 4U87 A; 2CRG A; 3FXM A; 2VLA A; 4CYD A; 2XAS A; 2QQ8 A; 4AID A; 1N78 A; 1UHW A; 2NNN A; 1BA5 A; 3CME I; 2PG4 A; 1A04 A; 2GLO A; 4DZJ A; 1QPI A; 4M3E A; 1OFC X; 3JR9 A; 4F55 A; 3O8G A; 1VQ9 I; 2HEO A; 4A5N A; 1XC5 A; 3WE3 A; 4IKF A; 5DS9 A; 3PUB A; 4E4H A; 3M3Y J; 1TP4 A; 3HB9 A; 5KCM A; 3S16 J; 1P7J A; 3JRG A; 3L2W A; 1UHS A; 2GQQ A; 2EIK H; 5JVT A; 2F4M B; 2R5Z B; 4JQF A; 2OQR A; 3LA2 A; 3BY6 A; 5AIP A; 1YRN A; 3DFG A; 2ZO4 A; 3HRU A; 2DMP A; 1Y56 A; 3KIO A; 2E19 A; 4HLX A; 4PJN A; 1HBX G; 4HF2 A; 2P8T A; 2GM4 A; 3P5J A; 4IHV A; 2UXX A; 4LJZ F; 2XAG A; 4G9Y A; 5TIS C; 2OBP A; 4JX5 A; 2X4H A; 4Q47 A; 2NS7 A; 5HVQ C; 1IC8 A; 2XGX A; 5DEQ A; 2J5O A; 4G8X A; 3E6D A; 1TQI A; 3BQY A; 3PNV A; 1N25 A; 2EPF A; 2M3A A; 3FDY A; 3IRQ A; 2EJR A; 4M73 A; 3H5R A; 2DAO A; 3DTI A; 1JXS A; 3CLQ A; 2Z33 A; 3BTL A; 4NNJ A; 3VOE A; 2K27 A; 1J75 A; 5C4X J; 3HOS A; 4W97 A; 1JE8 A; 2DXI A; 4MIM A; 1FJL A; 4B1R A; 2QF7 A; 5D5U B; 2Y0M A; 1G3S A; 1ZTR A; 2DK8 A; 2Z5U A; 4M71 A; 1XCV A; 2M8E A; 3JRE A; 3F21 A; 4Y3O A; 1PP7 U; 3FKI J; 3EUA A; 1E3H A; 1KQ8 A; 2W48 A; 4E7H A; 4BU2 A; 1IGN A; 1WJE A; 1ULY A; 5EZG A; 1X19 A; 5EEA A; 3BJA A; 3E97 A; 1IRF A; 2JA8 J; 5EDN A; 3L9F A; 3E6B A; 4KJZ A; 5H6R A; 4ZYE A; 4RB0 A; 2E2I J; 3OSG A; 1T08 B; 5E17 F; 3E0J B; 3CCR I; 5F04 A; 2X9D A; 1YX3 A; 3FIW A; 4XOR A; 1BC7 C; 2QBY A; 1FSE A; 1IN4 A; 2DT5 A; 2W4S A; 4XL9 A; 2ISZ A; 1DGW Y; 2BY3 A; 1U8R A; 2RNG A; 2HVQ A; 4F92 B; 2R7O A; 3WU2 C; 4UB8 C; 4LLL A; 3JRD A; 1CF7 B; 1QO0 D; 4A3J J; 2IBD A; 5FD5 A; 1FEX A; 2IA2 A; 4KFC A; 4U7D A; 3REO A; 4L9T A; 4A3K J; 1W36 C; 3KLN A; 1XMA A; 4UUV A; 2ME6 A; 1T0F A; 3FXU A; 5DD4 A; 2OZU A; 5F0H A; 3IV5 A; 1Y1V J; 3ML6 A; 2ESN A; 5K5Q A; 5LGU A; 3H92 A; 5M5W J; 1RI7 A; 5FRO A; 4EQQ A; 2CO5 A; 2VBY A; 5DCM A; 4A0Y A; 1IV8 A; 3DV8 A; 3H3Z A; 4KIG A; 4BQQ A; 5B5E C; 3K1M A; 4NBQ A; 3OS1 A; 1HF0 A; 3VSK A; 4PFO A; 2M7A A; 3OOP A; 3OYL A; 3OYM A; 1WJC A; 4DQ2 A; 2ZCW A; 5HS7 A; 4FIS A; 1IV6 A; 1OYW A; 1YW7 A; 2KIM A; 3ZMV A; 4D9J A; 1AKH A; 2DA1 A; 1NHA A; 4IRG A; 2NVQ J; 5D4S A; 2KJC A; 2CS3 A; 1NG7 A; 1ODD A; 1KU2 A; 3RTR A; 2FBK A; 3IKV A; 3K4K A; 4G6T B; 4QPQ A; 3CP2 A; 1ZH5 A; 3BR3 A; 3R0J A; 1YI2 I; 4K2E A; 3IHU A; 2WA0 A; 4CCL A; 4EJO A; 1Z7L A; 1IDY A; 1WH7 A; 2NOJ B; 5F1J A; 3S14 J; 3FXL A; 2GIZ A; 4CDG A; 1S8N A; 5DV5 A; 2EFW A; 1FLI A; 2X6Y A; 4D5C A; 3DXJ F; 3Q0W A; 3HKZ N; 1QVU A; 5B1A H; 2XF6 A; 2IP2 A; 5DD8 A; 4QWQ A; 3A02 A; 3AG2 H; 3OR1 C; 2LLK A; 1G8X A; 2V1N A; 4A3L J; 3QPT A; 3HM5 A; 2X1E A; 4M6X A; 4LB5 A; 2HQR A; 3FK6 A; 2GWR A; 4G12 A; 3AKZ A; 4V2F A; 4ABZ A; 3VDX A; 4DGW B; 4MFD A; 3M07 A; 1AHD P; 4AU7 A; 1R1U A; 2E5Z A; 2ZC2 A; 4YEL A; 1JI8 A; 2IGM A; 5IOY A; 1J59 A; 1QGP A; 4M72 A; 4A6D A; 3CF5 F; 3NRV A; 2K9L A; 3JTH A; 3DBR B; 2JUC A; 4XLN F; 2IPQ X; 2LH9 A; 3F8B A; 3RYR A; 2AS5 F; 3KEO A; 3CCM I; 4GRI A; 3HIF A; 3OL4 A; 2O3F A; 3U2R A; 4M3B A; 3CTA A; 2E60 A; 3KYD B; 2F4I A; 2LC2 A; 3S8P A; 1TQM A; 4B4C A; 3LSG A; 3LSM A; 1GLN A; 3DU5 A; 3J7Y J; 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