2OJTA

Structure and mechanism of kainate receptor modulation by anions
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and mechanism of kainate receptor modulation by anions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ojtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ojtA02
1JQFA 3HHFA 2Y7WA 3PUWE 3N94A 3RN8A 4DZ1A 2I49A 4C0RA 5CBSA 2A5TB 2GRVA 1DTGA 4KYSA 2VOZA 2Z8FA 3TKDA 3JYRA 5J1DA 4F1VA 3OO6A 4UA8A 3TFLA 1IZ1A 1B0LA 3FXRA 2DE4A 2PT2A 4F3PA 3K0VA 1JVXA 4YKKA 3QUFA 1A54A 3T96B 3TCHA 3E13X 4BDQA 2REGA 1PB7A 1Y3QA 3QIMA 5CBRA 2I48A 4F18A 3IJXB 1BTJA 3M8UA 2HZLA 5AA2A 3FVKA 1QUJA 2XHDA 3OENA 5KCJB 1ANFA 1LCFA 1QJMA 3KJTA 4TLLB 3KN3A 2R6GE 3C36A 1J1NA 3RQTA 4RYAA 1Z7NE 3B7DA 2BJJX 1B9JA 3CI8A 1ZJLA 5I56A 3KN7A 2Y7PA 3FV1A 1MY1A 4R2BA 4G8NA 5EHSA 1QVSA 2WKYA 3H6TA 2DWIA 1FQDA 4RXLA 2DS9A 3RTFB 3H06B 4IO4A 4RY1A 4ONYA 2ZYKA 5KDTB 3K2DA 1URSA 3N5LA 2Z8DA 1MQGA 4GOTA 3ONMA 2AYSA 2D5WA 3CIJA 2Q2CA 5DVFA 1I6AA 4NF8A 5ICQA 4IY6A 5A5XA 4XKQA 3PUXE 5CMKA 1MS7A 3B6WA 3UA8A 1N3XA 3OO7A 5TP9A 1EZPA 1AMFA 4RJZA 4YKJA 4ISUA 1TT1A 3MZBA 2RCAA 2PBWA 2DXRA 3WAFA 3PD9A 3SEYA 4GWOA 3U1OA 3R26A 1Q1KA 2OWTA 4H0WA 3LC8A 4X1DA 3CFLA 3OSRA 3FJ7A 3BFUA 1R6ZA 3PUVE 1URDA 2W7YA 4O3BA 4K3FA 3RUMA 4PP0A 1GTKA 3KN8A 2DYXA 4IGTA 3UORA 4ZS9A 1D3KA 1MH3A 4KCDA 5L8DA 1MRPA 3K1MA 1KWHA 2X7QA 3DM0A 1LCTA 4M1VA 3HPIA 2LAOA 3PV0E 3LSWA 3O2AA 4MH5A 2V3TA 4G8MA 2NXOA 2HAUA 4G68B 3MZ9A 2AIXA 1SW5A 5LOMA 2DOJA 3FVNA 3MP6A 4FIMA 5DYHA 2QSXA 1NH8A 3WAEA 1NH7A 1UTHB 2UYEA 4WEDA 3HN0A 2ESNA 2RKMA 2DVCA 2O7UA 3IOVA 4QSEA 2QRYA 2ALUA 3UGWA 3PPNA 3PU5A 2HZKA 3KZGA 2XXVA 1TFAA 3UP9A 4PFUA 4JXIA 1ZLQA 4GQOA 3U94A 1S50A 1WDNA 1LAGE 3MW0A 2Y84A 3H4ZA 3ZKLA 2XXQA 1B32A 2XXRA 5A5XB 4YICA 1A8EA 2DSFA 1EZ9A 3W15C 5JK4A 4THIA 3KFMA 2D3IA 5FHNA 5FTHA 5AA1A 3MP1A 2I58A 1BKAA 4F3BA 1SW2A 4IO6A 4IO2A 4NWDA 5I2KA 3AXFA 4GIZA 4KR5A 1B51A 1PC3A 3TDJA 5JTYA 4GRKA 2Q8JA 3SDFA 1FQFA 3HV1A 4YU0A 1T0KA 5ISUA 5DTBA 1Z7ME 2ZNTA 4QFLA 4BDRA 4IB2A 1B3LA 2QL3A 3SKPA 1QKAA 4KYDA 1FTKA 1CB6A 2XD2A 3DP6A 1LFGA 2XXWA 1N84A 3LBSA 1B52A 4LA9A 3QAXA 1JNFA 5BUUA 4JSDA 1VE4A 2F5XA 3C31A 1PDAA 4MFIA 4QRZA 2YPNA 1B5JA 1Y9UA 4F31B 1WODA 1AIVA 3RT6B 4F2QA 3CVGA 4BLAA 2E1SA 4N07A 2RINA 1LAXA 1MH4A 1H3DA 4L17A 3F11A 4WXJA 2I0BA 3A3CA 2UVIA 1DPPA 4IO5A 4H65A 5TPAA 4FAJA 2PVUA 3PUZE 3IORA 3FASA 1Y3PA 3VXCA 4XKPA 4LQ5A 4EF2A 1DSNA 5CI5A 4YMAA 3VVFA 3E4RA 3TYHA 1LFHA 2DVZA 4EDPA 4BDMA 3TTRA 2H9BA 1H45A 3SEXA 1UIVA 3RLFE 5I2NA 4XKNA 4U4XA 2NUVA 2F78A 1N04A 2ZXTA 4EQ7A 4QSDA 3BKIB 3E9XA 1OQHA 2XXIA 4OHNA 3I6VA 4ZE8A 1D9YA 5I2KB 4LONB 4ZEDA 1ZTYA 4NF6B 2F35A 1B7HA 4LZ8A 5L9OA 4HCYA 1WVJA 5ICTA 4G77A 1MY3A 3DLNA 1XHYA 2XXPA 3EQ1A 2H4IA 2OBGA 1D9VA 2P0SA 1MM7A 2ONSA 4OTEA 4P11A 3TELA 1ZU0A 3O66A 1A40A 4FECA 3PPPA 4MLQA 3ECRA 3K01A 2F97A 3R7XA 1FTOA 3MC2A 1MG1A 1NKXA 2I0CA 4YB5A 2X7PA 2FYIA 4JSOA 3TAJA 2ZNUA 4Q5TA 4R6KA 4R6YA 2F6GA 5ITOA 4X48A 1LGBC 1OVBA 5CMMA 3VV5A 2FNCA 5TU0A 3TCFA 3FD3A 4RK2A 1EH3A 1MY0A 1ZMGA 2P1SA 3KOTA 5BWJA 3C35A 3USDA 1B3FA 4P0IA 1LAFE 1LSTA 4KCCA 1M5FA 2OWSA 3IR1A 2GHAA 1B05A 1MY2A 4DXBA 1SVXB 1FTMA 3C9HA 1JW5A 3FUZA 2XXYA 3T9XB 3S2VA 3ZSFA 1ZKBA 1MXYA 5DT6A 4TLMB 3LR1A 4G2ZA 4G8HA 5FHMA 3TQWA 1S9TA 4ZEKA 2V84A 1H76A 4EXKA 1QULA 1MXZA 4Z7EA 4JBZA 2Q2AA 1FQEA 5CMBA 4IY5A 4XIGQ 2Q88A 5H8NA 3M3FA 4JB7A 2FA7A 2O7IA 1B5HA 3U72A 1TFDA 3HSTA 2RCBA 4I62A 3S9NC 4DE8A 4ZEFA 4BDLA 2XXXA 5IKBA 2HEUA 1MQDA 1LLSA 2DP8A 1A99A 3OD7A 3KSJA 3VFJA 4FATA 3RY3A 1A55A 5H8FA 1O7TA 1B40A 3LSXA 4AQ4A 4XKRA 2H25A 1R1NA 3Q27A 2HXWA 3OO9A 4KPTA 2NOOA 2HCAA 1B4HA 1IXHA 3SEWA 2O84X 3MBPA 5B7DA 3VVEA 1VSOA 4RPNA 2OCUA 4XTCQ 3QYTA 3T22A 3IL1B 2RC8A 3A3UA 1Y1ZA 3BFTA 1SYHA 2HQ0A 3FIRA 4ESXA 1L5TA 4GF8A 5AA2B 5AA3A 1EU8A 4FORA 1JW4A 2V3QA 2XX8A 3MVYA 5FHOA 3U93A 2XXUA 4F3SA 4U23A 4H8JA 4GD5A 1SBPA 3FXQA 3OO8A 2UXAA 1OQGA 3MWBA 3GZGA 2XX7A 2XX9A 2D21A 3PPOA 3TMGA 1M5DA 3O97A 5I56B 1JW1A 1USYH 3VDFA 5AA4A 2GHBA 1NL5A 1M5EA 5L9MA 5FTIA 4U1ZA 3DP4A 1DOTA 3CG3A 4OFOA 4ECFA 3S9EA 3S9MC 3FVGA 3T66A 4DCXA 4P0GA 3O6HA 4HS7A 4QFNA 3IJOB 1RYXA 4R75A 4KD5A 3LSFB 4TOZA 3HO7A 3B6QA 4QSCA 2DWJA 3OSQA 5DEXA 5M2VA 5CMCA 4GL0A 3RTWB 3UIFA 4E0XA 1RYOA 1MPCA 4YKPA 4NF8B 3JZJA 3PPRA 3C32A 4I1DA 3CG1A 1NFTA 3UN6A 1B3HA 4R9GA 4FE8A 2O51A 3CR9A 5H8FB 4QF9A 3K4UA 5TP9B 1MQIA 2VHAA 4C1TA 1NMUA 3MAMA 3IB2A 3A09A 1AH5A 1MPDA 4KI0E 2DQVA 4FJPA 4R74A 1Y1MA 5I57A 4GXSB 4ZECA 3ILTB 1LB9A 1BLFA 4EQBA 3M3KA 1N3WA 1B46A 3VLVA 1NNFA 4BDNA 3TTLA 1URGA 3FGSA 2H5YA 4EQ9A 4F39A 2O6AA 5I58A 2F7AA 4AB5A 3ILUB 2B3FA 4DDDA 1B6HA 4U21A 2I3VA 3OEKA 1B3EA 2O68A 4LQ2A 2ZYNA 2O1MA 2H99A 1SQYA 1JVYA 3SETA 4G68C 3TTNA 4F22A 2VD3A 1DPEA 4IO7A 5HPQA 1NNTA 1XVXA 2I3WA 1FCKA 1IUDA 4Q0CA 2R71A 3RPWA 5K2YA 3QK6A 4OFLA 1LB8A 1TXFA 3TPAA 5KZTA 3KGCA 4ZE9A 2A5TA 2QPQA 5IAIA 1TWYA 3TUSA 3OELA 2DXYA 1UTBA 2ANJA 4NMYA 1OVTA 3L6HA 4EF1A 4H67A 3D4CA 4POWA 5H8HA 3W9WA 1B2HA 3K02A 4XXUA 4OENA 1LAHE 2RF1A 1MDQA 3MQ9A 5H8QA 1OLAA 1N7WA 3EHTA 1BIYA 3ZKKA 4OFJA 1GR2A 3TEPA 4NE4A 3V5AA 1LBCA 1ELJA 2VD2A 4QHQA 3E3KA 3LUYA 4ZDMA 3CSGA 2PT1A 2THIA 3GXAA 3H6VA 3IB0A 2I4CA 1B1XA 4KHZE 4C1UA 5I84A 2ONRA 3P7IA 3V8XB 4OQOA 1I6QA 3S9LC 1M5CA 4F2OA 3GLBA 2F36A 1JETA 1SD3A 4DLDA 4O3CA 1B0HA 3G3GA 5JTYB 2X26A 4ZZAA 4LP2B 3TTKA 2Z22A 3G3HA 4UACA 1QUKA 2ZMBA 4NF5A 3QUJA 3G3KA 3C33A 2RC7A 1MPBA 4U2RA 4Q8RA 5I58B 2QS4A 4LUBA 3KG2A 1Y4TA 4HW8A 3W9VA 3MPKA 4Q30B 4QFPA 4EUOA 4MBPA 1UIUA 1YTVA 1FQCA 3O9PA 4JDFA 2XD3A 3H3GA 2PX1A 4KYEA 2UYFA 2V25A 4OEVA 3Q25A 5HBCA 1P1WA 2NWJA 1XT8A 3OMBA 1XS5A 1P1UA 1ZBMA 3GBBA 3TODA 1HSJA 1USYE 2PYYA 2QS1A 2ZYOA 1JEVA 1IEJA 3G7WA 3KEIA 3G3IA 5L9SA 1UTBB 3PMWA 1LBBA 4ELPA 1BP5A 2VP1A 2UVHA 5H8SA 5TPAB 4PFTA 3EF7A 3PMVA 4IGRA 1HSEA 5H8HB 1IXIA 4MLVA 1D4NA 1N76A 1O63A 1SW1A 2AL5A 1SI1A 2YLNA 5H8QB 1M5BA 3RNNA 2DE3A 3HCQA 2F8DA 3BBRA 4PFYA 1R9LA 5DVJA 5CC2A 2DWAA 2Z23A 1PEBA 3MP8A 4ESWA 1II5A 2NVUB 5I2NB 3L6GA 4R6HA 3IAZA 4QFOA 4MF3A 4U1OA 1SYIA 2Q9TA 2V93A 1MXXA 2V3UA 1B3GA 3D4GA 4G68A 4ZZEA 3OXNA 1B5IA 2F6PA 2QMXA 2UVGA 1I6BA 1B7ZA 1FW0A 5I59A 4YB7A 2ZYMA 1I69A 1UTHA 5B70A 3G3JA 3Q28A 1ZIUA 1N7XA 3TTMA 1R9QA 3Q26A 5DVIA 1GVCA 1QKBA 3THIA 1B1HA 3I3VA 4OEUA 4NF5B 4OESA 2QS3A 2IEEA 4ELRA 1SI0A 5EYFA 3IO6A 2R9JA 1EZOA 4ZEBA 3O29A 4U22A 3PD8A 4NTLA 1YPNA 1OIBA 3IOUA 1MY4A 4AB6A 1AOVA 4GFRA 4OETA 3T9HB 1CE2A 3VLWA 4WEPA 2UVJA 4R9FA 2DWHA 4PETA 1S7YA 3FZVA 3VE1B 3U8QA 1MXUA 5HM4B 1POY1 2GH9A 3ZS6A 1XOCA 1Q35A 1P1QA 3KBRA 4F1UA 1US5A 1GV8A 3CFZA 3B6TA 3QSLA 3ODBA 1XC1A 3IO4A 4PFWA 2AL4A 2KLFA 4N6PA 2F34A 1IIWA 3MJNA 4QFKA 3T9UA 4TQUQ 2QMWA 4R73A 1SDXA 4F3GA 5ITPA 1B7UA 1MQHA 4M4GA 3EHUA 1US4A 3FJMA 4F1YA 4H1XA 2QS2A 3MUQA 2Y7IA 4FEDA 1A8FA 4DCYA 3IX1A 3HHGA 2Y7RA 4RA1A 1YCJA 4JWYA 1MQJA 3MVZA 3EN3A 4DXUA 3PMXA 2I6EA 1IQ7A 1B58A 4ND9A 4G4PA 2B3BA 3DP8A 4NF4A 1N0TA 3K1NA 3PGFA 5H8NB 2I4BA 2Q89A 3MZ1A 3PPQA 3JV9A 1PB9A 3C34A 3TCGA 5I59B 4YKIA 4X9TA 2H98A 4RNSA 4H5GA 2ZNSA 1O64A 2ONKE 3K1PA 2ABHA 4ELQA 4R2FA 3VXBA 1FTLA 1H44A 3RT8A 4LATA 2PMSA 4PE5B 2YJPA 3FATA 3IB1A 3IOTA 2F7BA 4OYVA 4DXCA 2OJTA 5CM6A 4LVQA 2OZZA 4H6DA 4DIGA 5EHMA 1LFIA 4OERA 3V83A 5AA2D 3K6WA 1FTJA 5JEIA 5AE4A 2CMOA 2CZLA 1DTZA 3IK6B 4N13A 3SEVA 4OMBA 4I9DA 3N6TA 2G93A 3U92A 2RC9A 4JWXA 1DMBA 3H7MA 3TQLA 3PUYE 3DELB 3O28A 4LZ5A 3MVWA 5CRYA 3M3LA 3GBAA 4YZZA 1NNPA 3EPEA 3OOAA 3CSBA 1H43A 4NF6A 2O1LA 1RKMA 1JEUA 3T9VA 3K6VA 4BDOA 3MPLA 3K6UA 4JWOA 1OMPA 1Y3NA 3O6GA 2B65A 1QUIA 1Y4CA 3KOSA 3N6UA 4YMBA 3H6WA 1ATGA 4H8IA 1PBQA 5AA4B 3FXUA 3K6XA 1P99A 1P1NA 3KJ7A 4GVOA 3T93B 3CFXA 5K2XA 3FV2A 3RGYA 1VR5A 4RPOA 1VFDA 4ZEIA 4GLIA 3K00A 1F9BA 4NF4B 1HSLA 4I8CA 3C4MA 2DE2A 1MXVA 4HCWA 4GXAA 3V89B 4PQJA 3OEMA 2HFBA 2OLBA 2P2AA 3FJGA 3SESA 4POXA 2Z8EA 1P1OA 1QW0A 1OLCA 3UK4A 3FVOA 4FEBA 3VVDA 4NWCA 5DEXB 1A7LA 2XXHA 4X1BA 3I5OA 4HTGA 4F19A 4OZ9A 1PB8A 5KCJA 2OK2A 1VFEA 4OWDA 4IO3A 3CRBA 1UQWA 4NEDA 4E0WA 4U4SA 4EXLA 2GFEA 2A5SA 3TZAA 2Y7KA 4WKMA 1XVYA 2QJEA 1AL3A 3MVXA 2IA4A 4H5FA 3LSLA 2XXTA 3O6IA 2HAVA 4Z0IA 2E0SA 5F1QA 3KSXA 1PBPA 1YAEA 3VLUA 2VGQA 5I57B 2F7CA 3S4UA 1B4ZA 1MM6A 3N26A 3H6UA 1IXGA 4F29A 1Y20A 4RK9A 4R72A 2REJA 3EHSA 4KFQA 4LZ7A 4OVJA 5KDTA 2M8CA 1MDP1 3H03A 1MXWA 1FQAA 3SEUA 3R6UA 1POTA 1GGGA 4OXVA 4KQPA 2G29A 3Q29A 1SW4A 3QXMA 4ELOA 3IOWA 2O69A 4YB6A 1NNKA 3SERA 4O3AA 1IXCA 1FQBA 1IITA 5ELVA 4GL8A 4YAHX 3G3FA 5F7VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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