2OJTA

Structure and mechanism of kainate receptor modulation by anions
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and mechanism of kainate receptor modulation by anions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ojtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ojtA02
3KJ7A 3O29A 4NF5B 3MZ1A 5CMKA 3FGSA 3IOTA 3OEMA 1HSLA 2ZYKA 4PQJA 4NF6B 3FVOA 3GBBA 3EN3A 1BKAA 3C33A 2RCAA 1XVYA 5A5XA 5F1QA 3W9VA 3OO7A 1TT1A 1S7YA 3TDJA 3H6WA 5CM6A 1Y3PA 2F7CA 2DS9A 2I3WA 4BDMA 1N3WA 5FHOA 1J1NA 1B4HA 4BDOA 2REJA 3PPPA 4BDNA 4DE8A 1LAHE 2IEEA 3OXNA 4LQ5A 1A7LA 5I56B 4OFJA 2V84A 1MM7A 2V3QA 4XKQA 3SEWA 2HQ0A 2NUVA 1B46A 1LFGA 4FECA 4Q30B 2H4IA 4F1YA 2Q2AA 4JXIA 3O97A 3CFZA 4XKNA 2GHBA 3V83A 1IXCA 1SVXB 3DELB 2ZXTA 1M5DA 4NF4B 3ZSFA 4FEBA 5H8HA 3OOAA 3OELA 1R6ZA 4WEPA 2HFBA 4IO3A 3PU5A 4NF5A 2XXWA 2OCUA 3BKIB 2FA7A 5L9SA 1USYE 4NF6A 1DPPA 3VVEA 3ODBA 1FQBA 1MH4A 2I3VA 1BTJA 2I58A 4OTEA 2NXOA 4TLLB 3IB1A 2FNCA 4ELOA 4L17A 4F3GA 1B7HA 1SYHA 5CMMA 5JTYB 3IK6B 4QFPA 5I56A 3IB0A 3HO7A 3G3JA 5ICQA 4ZE8A 2AL4A 3PPNA 3TELA 4RK9A 2RC9A 3CSBA 4I8CA 2ESNA 3THIA 5TPAB 3O2AA 3CFXA 4KCDA 3RY3A 4NF4A 5JK4A 3H06B 1UQWA 3M3KA 5H8QB 1A40A 3CI8A 3PUYE 4WXJA 2R71A 2Z23A 1RYOA 2HAUA 1MH3A 1LBBA 3S9MC 2Y7KA 3OEKA 2XXUA 3TTKA 3VLVA 3FUZA 3LC8A 3MWBA 4YKPA 4ELPA 1YPNA 4OZ9A 5FTIA 4DXUA 3FD3A 4IO5A 4LONB 1D9YA 1M5EA 2Y84A 5TU0A 5JTYA 2GRVA 4EXKA 3TPAA 1LGBC 3UORA 4OQOA 2KLFA 4F39A 3C35A 3T93B 3W15C 1MY3A 1NNPA 4YKIA 5TPAA 2DVCA 1MXUA 4RYAA 4PFUA 1RYXA 3T9UA 2YLNA 2OK2A 1HSJA 3DP4A 1EZPA 1H76A 3M8UA 5ITPA 1XS5A 5H8QA 1ZKBA 1LFHA 1B7UA 2UXAA 3IO6A 3K0VA 2O6AA 3U1OA 3D4CA 3DM0A 5LOMA 2DVZA 1B3HA 1JW4A 4ZEIA 4BDLA 4H0WA 3VDFA 4X48A 2F34A 3IORA 2O68A 4ZECA 4ZEBA 1B5JA 1SW5A 4OEUA 2XD3A 4RJZA 3G3IA 3SEXA 4FJPA 1SI1A 4HTGA 3U93A 1OVBA 3SEYA 1B3FA 2XXPA 4FE8A 1VR5A 3R26A 1OIBA 3KGCA 4ECFA 2A5SA 1NMUA 4P0GA 2QSXA 3MW0A 1FQCA 3KOTA 2QMXA 3TCGA 3PD8A 4OVJA 4YB5A 1SDXA 4U4SA 4ZEFA 4M1VA 4IY6A 3T9VA 1P1UA 1D4NA 1A55A 5IKBA 3O6IA 2QS1A 5K2XA 3L6GA 5FTHA 1NL5A 1N0TA 1XVXA 4H6DA 1Y1ZA 1B5HA 3CVGA 3CFLA 2IA4A 3FV2A 2X26A 5JEIA 3KEIA 4F2QA 1MQHA 4EQBA 4RXLA 3FVGA 1SD3A 2QPQA 4TLMB 3L6HA 2H99A 5I2NB 1VSOA 4YKKA 1YCJA 3PUXE 3S4UA 4QRZA 4E0XA 3S9LC 3JV9A 1LB8A 4TOZA 2XXTA 2M8CA 3E4RA 1LAGE 3EHUA 4F29A 4F1VA 1A54A 4P11A 5J1DA 3F11A 2AL5A 2PMSA 4OERA 4ZEDA 4OFOA 1O63A 3M3LA 3TQLA 1MXXA 3QSLA 2DXYA 1Y4CA 1Q35A 3IR1A 4F31B 2UVJA 5ICTA 1P1WA 4NWCA 5H8FB 5DTBA 4KFQA 1ANFA 2HAVA 3TCHA 4DLDA 2DQVA 3QUFA 5I57B 4POXA 3V5AA 3KSXA 1ZU0A 3TMGA 4I1DA 1H43A 4LZ5A 4QFKA 4R6HA 3Q29A 3TAJA 2DOJA 3K6XA 1MQJA 1URDA 3O28A 4GL0A 1FTKA 1MY2A 2DYXA 3LUYA 4KYDA 4OETA 5EHSA 2V25A 2H25A 5I2NA 3H3GA 1B5IA 1MDP1 4G8HA 3O66A 1MG1A 1UTBB 3G7WA 5H8NB 2Q8JA 4PFTA 4R6YA 4YB6A 1ZIUA 3K2DA 4POWA 1NFTA 1QUKA 1MXZA 4BDQA 4PFYA 4QHQA 4NWDA 4HCYA 3MVWA 1SI0A 4GOTA 4GD5A 2P1SA 5H8FA 2I49A 4OHNA 1SW4A 5CBSA 1M5FA 1QKAA 5I57A 4FIMA 4JWYA 2DWHA 1LAFE 3RTFB 4QFNA 3U72A 1OLCA 3K6UA 4Z7EA 3GBAA 2V93A 3R7XA 4KI0E 3N94A 3HHGA 3VLWA 5CBRA 5CMCA 4R9FA 4MH5A 2PYYA 1UTBA 3N6TA 1IZ1A 5H8NA 3IB2A 4MF3A 5I59B 4KD5A 2H5YA 4IO7A 1FQAA 3PUZE 3O6GA 2DWIA 1B51A 3K4UA 4MFIA 5B7DA 3T66A 1TFDA 2VD3A 2Y7WA 3PMXA 3QYTA 2R9JA 2F6GA 2H98A 3RT8A 3B6QA 1PBPA 1PBQA 3Q25A 3Q28A 4O3AA 1MXWA 3Q26A 3C9HA 1IXGA 1A8EA 3FIRA 3VXCA 3H6TA 1FTLA 4U22A 1JEVA 3B6WA 2O7UA 3BBRA 2GFEA 5TP9B 1XHYA 2E0SA 4KR5A 5I58B 2PX1A 1MXVA 3EHTA 3PMWA 3KSJA 1QJMA 3QK6A 1OQHA 1P1OA 1LFIA 3E13X 2ZNUA 4IY5A 4LQ2A 3MVXA 1D9VA 5EYFA 2RF1A 5F7VA 1IIWA 4PETA 3HV1A 1B7ZA 3A3UA 4OWDA 1TXFA 1YTVA 2X7QA 5AA3A 1JQFA 5I59A 2F6PA 5CMBA 1QVSA 1PC3A 5AA2B 1N3XA 1I6QA 3TKDA 3FXRA 1XC1A 1WODA 3FXUA 3KG2A 4F3BA 3VXBA 2ONRA 4H8JA 4QSEA 3MZ9A 5DVIA 3IOWA 4KYEA 1LLSA 2B65A 3C31A 1POY1 4Q8RA 2PT2A 1HSEA 2QS3A 3MVZA 1SW1A 1MS7A 3FVNA 1JETA 2F97A 5CI5A 1GTKA 5TP9A 3CG1A 2Z22A 4QSDA 5I58A 1MRPA 3SKPA 1B32A 1PB8A 4RNSA 3U8QA 3OO9A 4DXCA 4ND9A 4AQ4A 1N04A 3MBPA 3E3KA 1AL3A 4P0IA 1DTZA 3TTRA 2I4BA 1B0LA 5AA2A 2OWSA 3BFUA 1AH5A 3V8XB 4GLIA 5DT6A 1R9QA 2RCBA 3VV5A 1WDNA 5BUUA 1MQDA 4X1DA 3IJOB 1MXYA 2W7YA 4NF8B 4DXBA 1B9JA 4X9TA 2HZKA 1M5CA 1B0HA 3FZVA 1BP5A 3JZJA 4O3BA 5FHMA 2B3BA 3G3GA 1IXIA 1XOCA 3RGYA 1Z7ME 3TTLA 2DXRA 4JSOA 5DYHA 3OMBA 4F3SA 1QUIA 2F5XA 2XXVA 4H8IA 4DZ1A 3N6UA 1DPEA 5M2VA 1VFEA 1Y3NA 5AA4B 2F7AA 3IOVA 3UA8A 3VVFA 3G3HA 2LAOA 3OSQA 1M5BA 1MY4A 2V3TA 5HM4B 2ZYNA 1S9TA 2VD2A 4F18A 1URSA 3ECRA 1ZJLA 4OXVA 4G2ZA 4QSCA 4NF8A 2R6GE 5AE4A 2F36A 3TTMA 3ZS6A 1P99A 1H3DA 4I62A 2UYEA 1O64A 2DE4A 4EUOA 3D4GA 3K6VA 4Q5TA 1GR2A 2DSFA 2HXWA 1A8FA 3HPIA 5ITOA 5ISUA 1FQFA 4NTLA 2UVIA 2ABHA 4NE4A 1IEJA 1POTA 1B2HA 1I6AA 3MP8A 1N76A 3MJNA 4IGRA 4F19A 1Y3QA 5KZTA 3SDFA 1B3EA 1LBCA 3P7IA 3W9WA 4EQ7A 4OEVA 4YZZA 5AA4A 1Q1KA 2DE2A 2XXYA 1A99A 4OESA 3MAMA 3MP1A 1B4ZA 5IAIA 5KCJB 4FAJA 3RT6B 4M4GA 1WVJA 3KN3A 1Y1MA 3C4MA 4U2RA 3HSTA 1US4A 4NEDA 2Z8DA 4LA9A 4UACA 4R72A 1N84A 2D3IA 4U21A 4YAHX 4YICA 1S50A 4OFLA 2ZNTA 3VFJA 2O84X 3PPRA 1FTJA 4F2OA 2ZYOA 3CIJA 3U94A 5H8SA 2I0BA 2DWAA 3V89B 3H03A 2OBGA 2O1LA 4UA8A 2QS4A 2XXQA 3MPLA 3USDA 1T0KA 1IITA 1PB9A 4LVQA 4YB7A 3H7MA 3N5LA 2P2AA 2H9BA 1PB7A 5CRYA 3Q27A 1H44A 1VE4A 4O3CA 3MVYA 3U92A 3EQ1A 3IAZA 3JYRA 2D5WA 1B58A 3PUVE 5KCJA 4DIGA 2XXXA 4HW8A 3DLNA 1QULA 2O51A 4ELQA 2XXIA 1PEBA 1LAXA 4NMYA 4GQOA 1B1XA 4LZ7A 5I2KB 1NKXA 1UIVA 4U23A 3SETA 4GVOA 4OYVA 3O9PA 2Q88A 1BLFA 4E0WA 2XX7A 4JDFA 1P1QA 5B70A 2ANJA 3LSWA 4KPTA 3K02A 3PUWE 1NH7A 2VHAA 3FV1A 5L9MA 4RPOA 4GXSB 3G3FA 4G68C 4H67A 1F9BA 3K6WA 4KYSA 5AA2D 2VGQA 3FJ7A 4ZZEA 4XKRA 4GF8A 3CR9A 1IXHA 3PV0E 3QUJA 3FXQA 1VFDA 1UTHB 2RINA 1DOTA 1JW5A 2Z8FA 2B3FA 1GGGA 3TYHA 2F78A 1GVCA 3ILUB 3WAEA 4N6PA 1UIUA 3VE1B 3K1MA 3RPWA 1DSNA 2FYIA 3N26A 4OMBA 2NOOA 5I2KA 2VP1A 1L5TA 3PD9A 1LCFA 2V3UA 3PGFA 3MC2A 3IJXB 4EF1A 3KJTA 4Q0CA 4R73A 2F8DA 3PPOA 4YMBA 4JSDA 4ZE9A 1ZLQA 4JWXA 2OJTA 1YAEA 4AB6A 2I4CA 2XX8A 1TFAA 4R2BA 4G68B 4THIA 4U1ZA 3E9XA 2NVUB 3BFTA 4XTCQ 3CG3A 3ONMA 3RN8A 2QRYA 3WAFA 2VOZA 1BIYA 1UTHA 3VVDA 1SQYA 2AIXA 4IO4A 3K00A 3KOSA 2G93A 1XT8A 2I48A 1FCKA 4BLAA 3KFMA 3QXMA 3SERA 3VLUA 4ONYA 2OLBA 2DP8A 2F35A 3ZKKA 2O69A 4G4PA 4R9GA 1Y20A 2E1SA 3ILTB 1NNTA 1NNKA 1ELJA 3LSLA 3K01A 4ESXA 4LATA 4LZ8A 5EHMA 4U4XA 4HS7A 3KN7A 4WKMA 3KZGA 4K3FA 1TWYA 3HCQA 3OO6A 4G68A 2Q89A 1N7WA 4GL8A 4GIZA 1IQ7A 4IO6A 4GFRA 1PDAA 1P1NA 3R6UA 4H5FA 4KCCA 4ZEKA 2OZZA 1QUJA 2ZNSA 3IL1B 4RPNA 2ALUA 4FEDA 2XXHA 3C36A 3B7DA 3G3KA 2WKYA 3TEPA 4LP2B 1QKBA 3DP6A 3H6UA 3T22A 4EDPA 3M3FA 1ZMGA 3TTNA 2X7PA 5FHNA 3SEVA 4U1OA 1Z7NE 1URGA 3RLFE 1NH8A 3S9NC 3PMVA 3ZKLA 1B3GA 4LUBA 2PBWA 3UP9A 4DDDA 3S2VA 2Y7IA 1II5A 2I0CA 1EU8A 4AB5A 3A3CA 3T9XB 3GXAA 3EPEA 4KQPA 3RQTA 4PE5B 1ATGA 3T96B 4YMAA 5HPQA 4MLVA 4G8MA 1B40A 4ZZAA 1FQDA 4EQ9A 2O1MA 1OVTA 3I6VA 1JVYA 5BWJA 2G29A 3PPQA 1B52A 1EZOA 3B6TA 2ONSA 3S9EA 5K2YA 4WEDA 3GZGA 3QIMA 3UK4A 2Z8EA 3FVKA 4PFWA 3DP8A 3SEUA 4H5GA 1US5A 1SW2A 3TZAA 3CSGA 4ESWA 2UVGA 4DCYA 4R74A 3C32A 1MM6A 4R2FA 1SBPA 4GWOA 2XHDA 2HZLA 3TUSA 4H1XA 2Y7RA 4G8NA 1Y9UA 1I6BA 2XXRA 4IB2A 2AYSA 3RNNA 1USYH 4KHZE 1JNFA 1R1NA 3K1PA 3TQWA 3UN6A 1JVXA 5KDTB 2RKMA 2D21A 2ZMBA 3MPKA 2QJEA 3C34A 1MPBA 3FJMA 1CB6A 2F7BA 2XX9A 3MQ9A 2I6EA 3CRBA 2PT1A 3H6VA 3EHSA 4QFLA 2DWJA 2NWJA 4Z0IA 1OMPA 3QAXA 1SYIA 4BDRA 1JW1A 1N7XA 4GXAA 2THIA 1ZTYA 3SESA 1RKMA 2XD2A 2ZYMA 1FQEA 3FJGA 5DEXB 3IX1A 4ELRA 5I84A 4X1BA 2CMOA 5HBCA 2CZLA 1MPCA 2GHAA 3RTWB 2GH9A 1B1HA 3HN0A 3UIFA 4PP0A 3H4ZA 3EF7A 1EZ9A 4RK2A 3UGWA 3FATA 4C1UA 5CC2A 2YJPA 4JWOA 3FASA 5KDTA 4H65A 3K1NA 2O7IA 1OLAA 4F1UA 3HHFA 4FATA 1EH3A 2DE3A 4F22A 1B05A 2Q9TA 2HCAA 1IUDA 1O7TA 3LR1A 5DVJA 4IGTA 1ZBMA 5DVFA 4HCWA 4OENA 4YKJA 1MY0A 1LSTA 3AXFA 1LB9A 4XKPA 4ZS9A 2PVUA 1KWHA 3T9HB 1Y4TA 2QL3A 5DEXA 1DTGA 4C0RA 4ISUA 3IOUA 2Q2CA 2RC7A 3O6HA 4IO2A 2A5TB 5L9OA 2ONKE 1MY1A 4JB7A 3OO8A 2RC8A 1B3LA 1MDQA 5ELVA 3I5OA 4XXUA 5L8DA 3A09A 2P0SA 3TFLA 4N07A 2QS2A 3LBSA 3OD7A 1FTMA 1NNFA 3MP6A 2HEUA 4N13A 4TQUQ 3OSRA 4DCXA 1MPDA 3MZBA 3I3VA 3GLBA 3LSFB 4RA1A 1GV8A 4MLQA 2BJJX 1QW0A 1FW0A 4FORA 2REGA 5A5XB 1I69A 4QF9A 3RUMA 2Y7PA 3LSXA 4EF2A 2OWTA 4C1TA 3KBRA 3MUQA 4ZDMA 4RY1A 1LCTA 4QFOA 4R75A 1DMBA 1CE2A 2QMWA 4JBZA 4MBPA 4YU0A 3KN8A 2A5TA 4XIGQ 1OQGA 4R6KA 4G77A 1AMFA 3TODA 3TCFA 1D3KA 1MQIA 4I9DA 1FTOA 1H45A 1AIVA 1R9LA 4F3PA 2YPNA 4GRKA 3IO4A 1B6HA 1JEUA 5AA1A 1AOVA 5H8HB 1MQGA 2UYFA 4EXLA 3OENA 2UVHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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