2OK2A

Muts c-terminal domain fused to maltose binding protein
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
MIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTHMEETSPAVEALENLDPDSLTPRQALEWIYRLKSLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Escherichia coli MutS Tetramerization Domain Structure Reveals That Stable Dimers but Not Tetramers Are Essential for DNA Mismatch Repair in Vivo.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, DNA mismatch repair pro
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli k12
total genus 132
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A01
4POWA 1ZIUA 3CSGA 3SERA 2I3VA 3E13X 1YAEA 2M8CA 1HSEA 2ZYKA 1SDXA 1PB7A 3RT8A 4Q0CA 4OFJA 1YTVA 4QSEA 1TWYA 1MXWA 4HCYA 4Q5TA 1D9YA 3IJXB 4JBZA 1FTMA 5FHNA 1Y9UA 4C1TA 1QUJA 1P1NA 4I62A 4ZEDA 1MQIA 4F18A 3ZS6A 2NUVA 3PUXE 3EHSA 4U21A 3CSBA 4I8CA 2O7UA 3T96B 3PMVA 4NF5B 3KZGA 1Y1MA 1FQEA 3Q27A 1R6ZA 1LB8A 4G2ZA 5H8FA 5A5XA 3PD8A 4EQ9A 1GGGA 4ZEFA 3TTKA 2PT2A 4NEDA 5L8DA 3PUYE 1H44A 1F9BA 2ZNTA 2XD3A 2UVJA 2ZMBA 2XXWA 3I6VA 2O84X 3H3GA 3ILTB 3DM0A 1MXVA 1OLAA 1A40A 3RLFE 1AL3A 4KYSA 3TCGA 3C35A 1Y3QA 3LSFB 2KLFA 3CFZA 4EQBA 1M5CA 4Q30B 4U4XA 3GZGA 2VD3A 4PETA 2UXAA 3OD7A 4IGRA 5ICQA 3LSWA 1USYE 3IO6A 4KD5A 5DEXA 3V8XB 1QUIA 3S9EA 3SEVA 4O3CA 1MG1A 1JEVA 3QXMA 3IORA 3PPPA 3IB0A 4FATA 5I84A 4HTGA 3E9XA 5F7VA 1MY1A 2QMXA 1O64A 1SVXB 5K2XA 4F39A 1P1UA 4QRZA 4LA9A 3K6UA 5DTBA 3TDJA 2FA7A 3WAEA 4KPTA 1UIVA 3VXCA 3FXUA 4C0RA 1ZKBA 3IX1A 3A3UA 4OERA 1B2HA 1USYH 1UTHB 1GV8A 2D21A 3T22A 4H5FA 2REJA 4ECFA 3VVFA 4ESWA 1PDAA 2YJPA 2OBGA 1NH8A 4NF8A 2V3UA 3H4ZA 4LZ8A 3S9LC 5M2VA 4ZE9A 4DXBA 3C36A 3K0VA 3E4RA 2PBWA 1XVXA 2I0CA 4YKJA 5FTHA 4X1BA 5JTYB 1B3GA 3S4UA 3VDFA 3O2AA 2Q9TA 3PV0E 2XXIA 4XXUA 3HO7A 3BFTA 3V83A 4ISUA 3MZ1A 4OTEA 3N6UA 2ABHA 1Q35A 2LAOA 2DE4A 2QJEA 4UACA 4YICA 1SQYA 1DTGA 3K4UA 1IEJA 1AOVA 3K1PA 4IO3A 1B58A 1D9VA 3T9XB 2I58A 3OEMA 1EZ9A 1ZLQA 1MQHA 1JETA 1MQDA 4EF2A 1Y1ZA 1POY1 2XX7A 1MY3A 4F1UA 1OMPA 1B0HA 1A8FA 3TODA 5CMKA 2OWSA 2VOZA 2XXPA 2ONSA 4OXVA 3EPEA 5BWJA 2H99A 4FJPA 1FQCA 4ZEBA 4GXSB 2ESNA 3S9NC 3DELB 4R6KA 3SETA 4MLQA 1PBPA 5EHMA 5B70A 5BUUA 3ECRA 3KEIA 1MPCA 3C32A 4IGTA 3PD9A 4P0GA 3OEKA 4NF5A 3OENA 3PUWE 2I0BA 3TPAA 3SEYA 4F29A 4EXKA 4R74A 4THIA 4GIZA 3CRBA 1MM6A 2RC7A 1Z7ME 3H6UA 1RYOA 3RT6B 1MPDA 3GBAA 3IO4A 4PFWA 5JK4A 1MQJA 2UYFA 3CG3A 5ITOA 1LFHA 2HXWA 3KFMA 4YMAA 1PB8A 2AL5A 3RPWA 1LGBC 3O66A 4ZEIA 1HSLA 4EDPA 5H8NB 2GH9A 1B51A 3G3HA 4O3AA 1ZU0A 1FCKA 1FQAA 5I58B 1IXIA 3RTWB 1A7LA 1OQGA 3KSXA 1SW5A 2ZXTA 3H6VA 3ONMA 1MQGA 3PUVE 1FQBA 1XVYA 4QFPA 3FVNA 3K1NA 4BDMA 4QFOA 1I6QA 1B3LA 3UA8A 1H43A 2PYYA 2ZNSA 4IO6A 3USDA 2F6PA 1XT8A 1OVBA 1M5DA 3MP8A 4X9TA 3T9HB 1JVXA 4ZEKA 2Z8DA 4K3FA 2QS1A 4U22A 1UTHA 3VLUA 3JV9A 2GHBA 3RGYA 2UYEA 2DWAA 4OEVA 1CB6A 5L9OA 3UP9A 3G7WA 3KN7A 2X26A 2W7YA 1LCTA 5FHOA 1TFAA 5I56B 4IO4A 4IO5A 3TELA 2HFBA 4F22A 2CZLA 2Y84A 2R9JA 4U2RA 4G8MA 2HZLA 2Q88A 4OFOA 5JTYA 1Y4TA 4OVJA 3FIRA 3G3FA 4R2BA 3UGWA 3JZJA 3FXQA 1LLSA 2VHAA 1LBCA 4IY5A 3KGCA 3IOTA 4OYVA 4JWOA 3HHGA 4ZS9A 3U72A 1ELJA 1PBQA 2GRVA 2QSXA 2OWTA 2Q2CA 3R7XA 1B40A 4PFUA 3FD3A 1BKAA 3C33A 4GVOA 3P7IA 4H8JA 1JQFA 3KSJA 3R6UA 2RCBA 1B05A 3FUZA 1IXHA 4FIMA 4YU0A 3LSXA 3OOAA 4O3BA 3B6QA 3MAMA 3B6TA 1URSA 1BP5A 1P99A 5ELVA 4OENA 4KYEA 4YB7A 4Q8RA 4RNSA 4LZ7A 3GLBA 4U23A 2F97A 2F6GA 3L6HA 1JW5A 1FTLA 2P2AA 3PPRA 3TTRA 1R1NA 1SYHA 4L17A 3KOTA 2I6EA 5TP9B 3TAJA 5H8HB 3S9MC 1O7TA 1DMBA 4RA1A 3M8UA 3FXRA 1II5A 5H8QB 3UIFA 5I2KB 1LAXA 3KG2A 1CE2A 2Q2AA 5ISUA 3FJ7A 3T66A 3K2DA 3KN3A 1QW0A 5F1QA 3IOWA 1A8EA 2OZZA 3O6HA 3I3VA 1IXGA 5H8NA 4DXCA 4JXIA 3O97A 2ANJA 5I58A 4WEPA 3TZAA 3T9VA 1B5IA 2Z8FA 3IL1B 1ZMGA 2A5TB 4R2FA 3VV5A 4NWDA 2D3IA 3TTLA 3QIMA 1UIUA 3G3IA 4F3GA 2RKMA 2XD2A 2DOJA 3N26A 5KDTB 4P0IA 4RXLA 3MVWA 3FGSA 1M5FA 4QSDA 2Y7PA 3IJOB 3CG1A 1OLCA 1US4A 3LUYA 3MW0A 2X7PA 2V3QA 3FJMA 2RINA 4GQOA 5B7DA 3TKDA 2UVGA 1HSJA 4NF4B 1QUKA 4F1VA 2F34A 4BDQA 2WKYA 1Y3PA 1UQWA 3O29A 4NMYA 1A99A 5I56A 4AB5A 4C1UA 1MDQA 3KN8A 4MF3A 2HAVA 1EZOA 3RQTA 1EZPA 3THIA 3EQ1A 4GXAA 1B4ZA 3PPNA 4F3PA 4LP2B 3IB1A 3MVXA 3Q28A 1D4NA 1POTA 2ZYNA 4KR5A 2E0SA 1ZTYA 2HCAA 2DP8A 1IUDA 3K02A 4ZECA 1SD3A 3TEPA 1TXFA 4XKNA 3DP6A 1ANFA 2BJJX 3U92A 2OLBA 2NWJA 1WDNA 4NF6B 1SYIA 2DWJA 1ZJLA 2DVZA 2REGA 1N7XA 4GOTA 3C4MA 1B7UA 2F8DA 5FTIA 4QFNA 5L9MA 2F78A 4GRKA 2ZYOA 2Y7WA 4YZZA 2DXRA 5EYFA 1BLFA 4NWCA 4GLIA 1DPEA 1FW0A 5DT6A 4ONYA 5KZTA 4G4PA 4RPOA 1J1NA 1XHYA 1M5BA 5CC2A 3D4GA 1LBBA 1XC1A 3CI8A 1NL5A 3QK6A 2FNCA 2B65A 3IR1A 2OJTA 4IO7A 2Z22A 5HPQA 1JW4A 2ZNUA 4FORA 4LATA 2XHDA 2Q8JA 4ELPA 5FHMA 5TP9A 4KQPA 5H8HA 4QHQA 2DVCA 2R71A 3W15C 3M3LA 3MVZA 5CI5A 1Y20A 4PE5B 1JEUA 3TFLA 5H8QA 1IXCA 5I2KA 3RUMA 3Q26A 1B3HA 5I2NB 2ZYMA 4YB5A 3TCFA 3G3GA 2O69A 5DYHA 4ELOA 2H5YA 3VVDA 1T0KA 3CR9A 1MXXA 4GF8A 3ODBA 4YKIA 3IK6B 3K6VA 2GHAA 4DCXA 3FV2A 5CM6A 1US5A 3LR1A 2V84A 3MVYA 2PMSA 2HZKA 3CIJA 4JSOA 2A5TA 4LZ5A 1NNTA 3HSTA 4IY6A 4JB7A 5JEIA 2O1MA 1ZBMA 1OQHA 1SI0A 1S7YA 3PMXA 3TQWA 4R75A 1SW4A 4BLAA 1Z7NE 5HM4B 1XOCA 1LCFA 5KDTA 3OSQA 1B5HA 1VE4A 1MH4A 2QMWA 2AYSA 2RF1A 1P1QA 4RYAA 1N0TA 3HPIA 1DTZA 3HV1A 1GTKA 4F31B 1B52A 3D4CA 4MLVA 4DE8A 4YMBA 1MXZA 3TYHA 4TOZA 1DOTA 3OELA 4ZZEA 2RCAA 3MBPA 2DXYA 3FVGA 4LQ5A 4ELQA 4G68C 1B1HA 3A3CA 3PMWA 4H1XA 1TFDA 1ATGA 3R26A 2XXUA 5IAIA 4NF4A 2AIXA 1B7HA 1MXYA 1JVYA 2H25A 2G29A 3F11A 1MH3A 2F7AA 3ZKKA 3N94A 3QYTA 2XXQA 1AMFA 4IB2A 4P11A 1MRPA 4U4SA 4HW8A 4BDOA 1P1OA 5KCJB 3VLWA 1B4HA 3T93B 1NKXA 2XX8A 2DQVA 4ZDMA 3KJ7A 3RTFB 4TQUQ 4GL0A 3L6GA 1BIYA 3ZKLA 3SEUA 4HS7A 1EU8A 2H9BA 1NMUA 4YB6A 3A09A 1QKBA 2PVUA 5ITPA 3C34A 2Q89A 4NF6A 4E0XA 2V3TA 2XXHA 2HAUA 3MPLA 2IA4A 4OMBA 4U1OA 3TCHA 3LC8A 3JYRA 4EF1A 3U8QA 5AA1A 4PFTA 2ONRA 4WXJA 4FECA 4M4GA 3H6TA 3EN3A 4MFIA 4LVQA 1URDA 4TLMB 3ZSFA 1I6AA 5CRYA 1B9JA 4QFKA 3SKPA 3EHUA 3W9VA 5LOMA 3MP6A 1URGA 2DS9A 1QULA 4M1VA 4FEBA 3H6WA 5DVJA 2V25A 3Q29A 2I3WA 3PU5A 2DE3A 1FQDA 4H67A 2ONKE 1H45A 3VLVA 2YPNA 2I48A 4H0WA 5H8SA 3OO9A 3MC2A 3MP1A 4HCWA 4JWXA 4RK2A 4EUOA 4H6DA 2OCUA 2I4CA 3S2VA 5I2NA 2PX1A 4F2QA 1UTBB 2O68A 3QAXA 1P1WA 3FVKA 2RC8A 1AH5A 3QSLA 1MPBA 4YAHX 1BTJA 1PEBA 2XX9A 4WEDA 1LFGA 2QS2A 1LB9A 1B46A 2YLNA 1D3KA 2E1SA 4ESXA 4H8IA 2Y7IA 3CFXA 3DLNA 4MBPA 5EHSA 2O1LA 2OK2A 1PB9A 2VP1A 4R72A 4KYDA 5HBCA 1I69A 5I59B 2XXTA 1B7ZA 4G68B 3FV1A 4OQOA 1JW1A 2DWIA 4DLDA 3FZVA 1R9QA 2QS4A 1S50A 1FQFA 1VFDA 3EHTA 1AIVA 4OFLA 4NTLA 1PC3A 1NH7A 3CFLA 4Z0IA 2HEUA 1SW2A 1VSOA 5CMMA 3V5AA 3PPQA 3LSLA 2Z8EA 2UVIA 3TQLA 2P0SA 1IZ1A 4GL8A 4DXUA 2DYXA 4GWOA 4G8NA 4XKRA 3V89B 5KCJA 1NNFA 3OSRA 2P1SA 2O6AA 4ELRA 1M5EA 5TPAB 3MPKA 5AA2D 1LAHE 3I5OA 2NOOA 3PGFA 4OETA 3DP4A 3GBBA 4GFRA 1RKMA 2Z23A 3K6WA 1FTOA 2I49A 2VD2A 3FJGA 3K1MA 1I6BA 3OO7A 4LONB 2Y7RA 3N5LA 3UK4A 3VFJA 3SEWA 4DIGA 3OO6A 3H7MA 4NE4A 3MJNA 4JDFA 4XTCQ 3H03A 1XS5A 2DE2A 3FVOA 1OIBA 3CVGA 4JWYA 4QF9A 4OEUA 2X7QA 4X48A 3C9HA 3U93A 4POXA 3E3KA 1NFTA 3B7DA 1B5JA 5I57B 4X1DA 3EF7A 4KCDA 1IQ7A 3MQ9A 4EXLA 1N76A 4E0WA 1IIWA 1B1XA 4F1YA 2I4BA 3HN0A 1S9TA 4R6HA 1GVCA 3K6XA 3KOSA 3VVEA 4FAJA 2O7IA 3O9PA 4PQJA 5AA4B 4KHZE 3B6WA 4FE8A 4R9GA 1Y4CA 5L9SA 1MXUA 1DSNA 3AXFA 1MM7A 1DPPA 4YKKA 1IITA 1UTBA 4RK9A 3O6GA 3MZ9A 2V93A 5AA2B 1QVSA 3U1OA 2O51A 1Y3NA 2H4IA 3KJTA 1B3EA 4RJZA 2F5XA 5CBRA 2G93A 3U94A 1Q1KA 1YPNA 2F35A 3KBRA 3OMBA 1WODA 4I9DA 3LBSA 2D5WA 4F2OA 1LAGE 4EQ7A 4LQ2A 2QRYA 1GR2A 3K01A 4IO2A 3SESA 2CMOA 2H98A 2DSFA 4QFLA 4N07A 3BBRA 3SDFA 1FTJA 4LUBA 3UN6A 5J1DA 1MY2A 1MDP1 1LFIA 4QSCA 4ZE8A 3FASA 3DP8A 5I59A 4G68A 4WKMA 4BDNA 3GXAA 4PP0A 4PFYA 2FYIA 1MY4A 2UVHA 2B3FA 2F36A 4F3BA 3BFUA 3O6IA 2VGQA 4XIGQ 4JSDA 1VFEA 3M3KA 1A54A 4ZZAA 1QKAA 4F19A 3OO8A 4N13A 1OVTA 3HCQA 2Y7KA 4OHNA 4G8HA 2AL4A 3IAZA 4F3SA 3SEXA 1VR5A 1NNPA 3RNNA 3T9UA 5TPAA 4UA8A 4KI0E 2XXVA 3O28A 2HQ0A 3MWBA 3BKIB 5DVIA 1LSTA 1MS7A 5CMCA 1N3WA 2QPQA 1N84A 1QJMA 1H3DA 3RY3A 2XXXA 4DDDA 3IOVA 4I1DA 4KCCA 1RYXA 5H8FB 4DZ1A 4H65A 5A5XB 1H76A 3RN8A 5IKBA 1WVJA 2XXYA 1MY0A 3MUQA 3N6TA 5K2YA 3H06B 5I57A 3K00A 4AB6A 5ICTA 4R9FA 4BDRA 3PPOA 2RC9A 2IEEA 2R6GE 1O63A 2F7CA 4DCYA 4R6YA 4G77A 3OXNA 3QUJA 1EH3A 4OWDA 1SI1A 5DVFA 2ALUA 5DEXB 1N04A 1B32A 4BDLA 5AA4A 1TT1A 3MZBA 2NVUB 3PUZE 5AA3A 3W9WA 1A55A 3TMGA 2PT1A 4YKPA 4XKPA 4OZ9A 1YCJA 4GD5A 5AE4A 4RY1A 3QUFA 1B3FA 4H5GA 5AA2A 4FEDA 5CBSA 3TUSA 1NNKA 1JNFA 1N3XA 2NXOA 1L5TA 3VXBA 2GFEA 2B3BA 1FTKA 1B6HA 1B0LA 5TU0A 2XXRA 2DWHA 4NF8B 4Z7EA 3G3JA 3IB2A 3G3KA 4TLLB 3UORA 3TTNA 4KFQA 3FATA 3C31A 3M3FA 4XKQA 4N6PA 5CMBA 4MH5A 3VE1B 3HHFA 3IOUA 4AQ4A 2A5SA 3TTMA 2QL3A 2THIA 4R73A 1LAFE 2F7BA 3ILUB 1SW1A 3WAFA 4U1ZA 3Q25A 4ND9A 4RPNA 1KWHA 1R9LA 2QS3A 4OESA 1N7WA 1SBPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4POWA 1ZIUA 3CSGA 5IZ1A 3SERA 2I3VA 3E13X 5I3SA 1YAEA 2M8CA 1HSEA 2ZYKA 1SDXA 1PB7A 3RT8A 4Q0CA 4OFJA 1YTVA 4QSEA 3SZPA 1TWYA 1MXWA 4HCYA 4Q5TA 1D9YA 3IJXB 4JBZA 1FTMA 5FHNA 1Y9UA 4C1TA 1QUJA 1P1NA 4I62A 4ZEDA 1MQIA 4F18A 3ZS6A 2NUVA 3PUXE 4LN5A 3EHSA 4U21A 3CSBA 4I8CA 2O7UA 4NAPA 3T96B 3PMVA 4NF5B 3KZGA 1Y1MA 1FQEA 4JVCA 3Q27A 3LUZA 1R6ZA 1LB8A 4G2ZA 5H8FA 5A5XA 3PD8A 4EQ9A 1GGGA 1IMEA 4ZEFA 3TTKA 2PT2A 4FBPA 4NEDA 5L8DA 3PUYE 1H44A 1F9BA 2ZNTA 2XD3A 2UVJA 2ZMBA 2XXWA 3I6VA 2O84X 3H3GA 3ILTB 3DM0A 3E79A 1MXVA 1OLAA 1A40A 3RLFE 1AL3A 4KYSA 3TCGA 3C35A 1Y3QA 3LSFB 2KLFA 3CFZA 4KXPA 4EQBA 1M5CA 4Q30B 4U4XA 4OVQA 3GZGA 2VD3A 3GYYA 4PETA 2UXAA 3OD7A 4IGRA 5ICQA 3LSWA 4GX3A 1USYE 3IO6A 4KD5A 5DEXA 3V8XB 1QUIA 4IR8A 3S9EA 3SEVA 4O3CA 1MG1A 1JEVA 3QXMA 2R8TA 3IORA 5EQ7A 3PPPA 3IB0A 4FATA 5I84A 4HTGA 3E9XA 5F7VA 1MY1A 2QMXA 1O64A 1SVXB 5K2XA 4F39A 1AWBA 1P1UA 4QRZA 4LA9A 3K6UA 5DTBA 3T1BA 3TDJA 2FA7A 3WAEA 4KPTA 1UIVA 3VXCA 3FXUA 3BIGA 4C0RA 1ZKBA 3IX1A 4OA4A 3A3UA 4PDDA 4OERA 1B2HA 1USYH 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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