2OK2A

Muts c-terminal domain fused to maltose binding protein
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
MIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTHMEETSPAVEALENLDPDSLTPRQALEWIYRLKSLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, DNA mismatch repair pro
publication title Escherichia coli MutS Tetramerization Domain Structure Reveals That Stable Dimers but Not Tetramers Are Essential for DNA Mismatch Repair in Vivo.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli k12
molecule tags Sugar binding protein
total genus 132
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A01
1I6BA 2HZKA 2O1MA 4H65A 3PUZE 3K6WA 5I84A 2O7IA 3O6IA 3IJXB 3C9HA 5H8QA 4U22A 1AIVA 1J1NA 4OFJA 4JSOA 5AA4B 4BLAA 1OVBA 4ECFA 2F36A 3SEYA 3UK4A 1B0HA 1RYXA 1SBPA 4H8IA 3IB2A 1Y3NA 4ELPA 3MBPA 3H03A 5CBSA 1LFGA 1O64A 4RYAA 2B65A 3N6UA 2F6PA 4YMBA 3ODBA 5A5XA 4K3FA 2DOJA 1A99A 3LR1A 3PD8A 3N94A 1LAHE 4OFOA 4R73A 3HV1A 3IOTA 1R6ZA 1QJMA 4YB6A 2AL5A 4F1VA 4X9TA 2D5WA 4LZ5A 1MQJA 5FHOA 2XXXA 4NMYA 4EF1A 3H4ZA 1TFAA 3S9MC 3K1NA 3WAFA 1XT8A 3JV9A 3EHUA 3MZBA 3C34A 4YKPA 5ITPA 4XKNA 4AQ4A 1SDXA 3KN8A 2NOOA 3IORA 3MC2A 3PMWA 2X7QA 4MBPA 4O3AA 1PC3A 1B5HA 3SDFA 4OETA 4QSEA 3SERA 2UYEA 3C33A 1OLAA 3TTKA 3A3UA 1TFDA 3U92A 1PEBA 4EQ7A 1P99A 1SI1A 4ZS9A 2O1LA 5CMBA 1BLFA 1DSNA 1T0KA 2OWSA 3PUWE 1OLCA 2UVJA 4KYEA 1BP5A 3R6UA 3TELA 3RTFB 1NNTA 2V3QA 1S50A 3ILTB 2Y7KA 2ANJA 2XXUA 3CVGA 4QFPA 1SI0A 1OQHA 3T9UA 4R9FA 4DDDA 3MP6A 5I2KA 4I9DA 4GRKA 3KGCA 3E4RA 3GXAA 4RA1A 1MXVA 3OXNA 4U21A 3IAZA 2I49A 3OD7A 4LA9A 4GL8A 3G3JA 1GTKA 4YAHX 2DE4A 1ZLQA 4F31B 4ZEDA 4BDNA 5KCJB 3W15C 1B32A 4E0WA 3KZGA 5TPAB 1Y1MA 1M5CA 3ZSFA 4R6KA 4QSDA 5TP9A 3K1MA 3C35A 3TUSA 3H7MA 3M3KA 4XTCQ 4FEDA 3KJ7A 3B6TA 4QRZA 3QAXA 3TCFA 1D9YA 2GH9A 4PFWA 4BDMA 1SD3A 4MLVA 4ZDMA 3K0VA 5ICTA 5I57B 1ZTYA 5HBCA 2QMWA 2ZYMA 5DVFA 2NXOA 2F7CA 2X7PA 4GIZA 5JEIA 3ZKLA 4MFIA 2ZYOA 4QFOA 2O68A 3ECRA 3EN3A 3KSJA 4IY5A 4ESXA 5ELVA 4H5FA 3B6QA 4TOZA 3K01A 1UTBB 4U2RA 3PGFA 1MRPA 1IIWA 3K00A 5CI5A 4C1TA 2H5YA 2XXRA 4PQJA 2QRYA 4G8HA 5CM6A 4Z0IA 1MG1A 3RNNA 1R9LA 1N3WA 3VXCA 3VXBA 1QW0A 1SYIA 1YPNA 2XXHA 1GV8A 4YU0A 4E0XA 1RKMA 3RN8A 1B4HA 4IO3A 4THIA 3DM0A 1AL3A 2VD2A 1OIBA 1VFEA 3B6WA 4KCDA 2Z8EA 4ONYA 3FJMA 2O7UA 1M5DA 1B40A 4NWCA 2I6EA 1D9VA 3MPLA 2QPQA 1ZJLA 4ISUA 1FTOA 3MP8A 3EQ1A 5KZTA 2D3IA 4PE5B 4RK9A 3HPIA 5ICQA 4R72A 4OMBA 3U94A 5FTHA 4KR5A 2PVUA 2P2AA 4JXIA 1H44A 2UVIA 1R9QA 4KQPA 4JDFA 3O28A 3TKDA 1UIUA 4IO7A 3VLUA 2WKYA 3OSQA 3TCHA 5ITOA 3MJNA 3BBRA 4TLMB 1B58A 3PUXE 3U72A 3IL1B 4F39A 2BJJX 2VGQA 3T22A 2F8DA 1N76A 2ESNA 5KDTA 2XD3A 3O97A 3OMBA 2X26A 3JZJA 2GHBA 3TYHA 1BKAA 4GD5A 5EHMA 1GVCA 4F3BA 1N0TA 3O6GA 4F19A 3K02A 5BWJA 1XOCA 3PPQA 1US5A 3IB0A 2DXYA 4KYSA 1N04A 1FQAA 4XIGQ 4POXA 4OVJA 1B9JA 3RY3A 3K2DA 1NMUA 4LZ7A 3E3KA 1NNFA 3FV1A 1FQBA 1S9TA 1RYOA 5EHSA 4IO4A 3EHSA 4LQ5A 4RJZA 4EDPA 1OVTA 2YPNA 3QUFA 3RT6B 2DS9A 4Q30B 1M5EA 4PFTA 1NFTA 4ZZAA 4FAJA 1ZKBA 1JW1A 2RF1A 1PBQA 3D4CA 3GBAA 3MAMA 3FJGA 4G68B 1DPPA 3HHFA 1F9BA 2DWIA 1MDP1 2HAVA 4R2FA 3CFLA 4LZ8A 3USDA 4YB7A 2XX7A 5DYHA 5H8NA 2Y7PA 3HHGA 1MY1A 2QS4A 3DLNA 1H43A 2DP8A 3RQTA 5AA4A 4R2BA 3SEUA 3LSXA 1EU8A 1TXFA 4OXVA 1IQ7A 5I56B 2FYIA 4QFKA 3K6VA 2Q2CA 4ELQA 3KN3A 1LBCA 3ZKKA 4YZZA 2M8CA 2ONKE 4OEUA 4KI0E 3CR9A 3S9EA 4DZ1A 1XHYA 1Y20A 2OZZA 3PMXA 4KPTA 4OESA 1DMBA 2QS1A 4OFLA 4HTGA 5H8FA 2NVUB 2I48A 3FASA 3QYTA 4NF6B 2GHAA 5HM4B 3MVZA 1USYH 1QKBA 4N13A 3PPRA 3QIMA 1LFIA 5DT6A 1SW2A 4R9GA 3TTRA 1B3HA 3FXQA 1OMPA 1GGGA 5L9SA 1A54A 3UP9A 4FORA 1O63A 3W9WA 1II5A 1LAFE 1Y3QA 3W9VA 3BKIB 3U93A 4JBZA 1B3EA 3I3VA 4M4GA 1I6QA 3IO6A 2V93A 3V89B 3MWBA 1OQGA 2XXYA 3KSXA 3MQ9A 3K4UA 3IOWA 5DTBA 5A5XB 4IO5A 1QVSA 2PX1A 1YTVA 2XXTA 4ZEIA 4JSDA 2ZNUA 5K2YA 2R6GE 1B7HA 1Y3PA 2Z8FA 1YAEA 4BDRA 4RPNA 1B51A 4H6DA 3RPWA 2H9BA 3U8QA 4NF5B 1HSLA 1P1WA 4QF9A 1N3XA 2G93A 3C31A 1HSEA 4LUBA 2YJPA 1XS5A 3L6GA 4EXKA 2QL3A 3TZAA 1B46A 5M2VA 2NUVA 3SEWA 3P7IA 3QXMA 2AIXA 1A8EA 2D21A 3PMVA 1P1NA 4H8JA 1JQFA 5DEXA 2ZMBA 1H3DA 4POWA 1B1XA 1MM7A 2E0SA 1LB8A 4N07A 5F7VA 5CBRA 3T66A 2IEEA 3LSWA 4DXCA 1JEVA 4U1ZA 1NNKA 1MY3A 2XXWA 4YMAA 3FD3A 1N7WA 1B0LA 1URSA 3CG1A 1MPCA 5B7DA 3V5AA 4PFYA 4EF2A 2F6GA 2F7BA 1TT1A 3FXRA 5I2KB 1NH7A 3FVKA 4GFRA 4LQ2A 4H67A 1FTKA 2G29A 5I57A 2XXQA 3T93B 3MPKA 4F18A 2Z22A 2XX8A 4O3BA 2DWHA 4KHZE 5F1QA 3TDJA 4PFUA 3EHTA 2RINA 1GR2A 5I58A 3IX1A 3A09A 1EZOA 4QFLA 2PT2A 4X48A 5L9OA 3TEPA 3PPPA 4NF4A 4BDQA 1WDNA 2ZXTA 4DXUA 2HQ0A 4JB7A 5CRYA 2I4BA 2RCBA 3DP4A 1Y9UA 3S4UA 4U1OA 4IO6A 5I59B 1S7YA 3HN0A 4QFNA 5H8HA 3KFMA 1N7XA 1ELJA 2ALUA 4DLDA 2A5TB 5JTYB 1SW4A 1USYE 1EH3A 3KJTA 3R26A 2F97A 4IGTA 1UTHB 1PB9A 3H6WA 3OO7A 1CE2A 3RLFE 4FEBA 3IJOB 4OWDA 3G3FA 1HSJA 3KEIA 5B70A 3HO7A 4XKPA 3SEXA 3OEMA 3CG3A 2H99A 2XHDA 3JYRA 3TAJA 1ZBMA 1MXUA 4OENA 3N6TA 1I6AA 3LC8A 3H6VA 3Q29A 4PETA 1PB7A 3H3GA 3KN7A 3MVWA 3VLWA 3DP6A 3G3KA 5CMCA 3FXUA 1MDQA 3E9XA 3TQWA 4X1BA 2QSXA 1MM6A 2HEUA 4GXAA 2XD2A 4F22A 1CB6A 3FVNA 1LFHA 4IB2A 4LATA 4C0RA 3Q28A 3VVDA 3OO8A 4YKKA 3OEKA 2DVZA 3FIRA 2GFEA 3VFJA 2Q9TA 1AOVA 1B7ZA 5LOMA 1A40A 4NTLA 4FECA 2P1SA 3M3FA 4DCYA 1B2HA 4OYVA 4XKQA 4G8MA 1M5FA 2Q2AA 2THIA 4NE4A 4M1VA 3S9NC 5AA1A 1SYHA 4WEPA 4H1XA 1KWHA 3PU5A 3LBSA 2DE2A 4QSCA 1MS7A 3L6HA 3ILUB 4RPOA 2F35A 3H6UA 1PBPA 3FVGA 1Y1ZA 1MQIA 2OJTA 1FTLA 3VV5A 3LSLA 1POY1 4GF8A 4ZEBA 4P0GA 1B3GA 1VE4A 1A55A 3O29A 3I5OA 1VSOA 1I69A 2PYYA 3QUJA 5I2NA 2HAUA 1JETA 3OSRA 4UA8A 3TMGA 4DIGA 3IK6B 3CRBA 3G3IA 4LVQA 2I3WA 4BDLA 2R71A 4WKMA 4U4XA 2ONSA 1IITA 4DXBA 5CC2A 2RKMA 2OK2A 2Y7WA 4ZZEA 5K2XA 3FV2A 2I58A 4ZE9A 4QHQA 4UACA 2DE3A 4EUOA 2Q8JA 4JWXA 1B7UA 4DCXA 1LCTA 3U1OA 3BFTA 2I0BA 4F29A 3LUYA 4Q8RA 5AA2A 1UQWA 4OTEA 4GL0A 5FHNA 1B5IA 5I56A 4F3SA 1NH8A 1O7TA 3GBBA 4I8CA 4GLIA 5IKBA 4KCCA 1UIVA 2ZYNA 2RCAA 4ND9A 3AXFA 1DOTA 1VR5A 5L9MA 2PBWA 3F11A 3D4GA 4FIMA 2ONRA 4NEDA 3I6VA 3SEVA 4OQOA 2QJEA 3R7XA 3TTLA 4NF8B 1MPBA 4NF6A 1QUKA 1B3LA 1DPEA 2HXWA 3T9HB 1MPDA 1BTJA 2VHAA 2DQVA 4G8NA 3CFZA 5H8NB 5L8DA 4AB6A 1MH4A 4RY1A 1POTA 1SW5A 2I0CA 4RXLA 3MP1A 3OENA 2A5SA 1SW1A 2AL4A 2F78A 2O51A 4X1DA 1EZPA 4NWDA 5ISUA 1US4A 2LAOA 1B05A 4GVOA 3CI8A 3G3HA 5H8QB 3ONMA 3IOVA 4JWOA 1QUIA 3T9VA 1B1HA 2QMXA 4P11A 1N84A 4ZEKA 3UA8A 2DYXA 1MQHA 3E13X 1XVXA 1AH5A 1MXZA 5H8FB 4G77A 1TWYA 2ABHA 2ZNSA 3RTWB 2P0SA 5CMKA 2Z8DA 4NF5A 1LAXA 3B7DA 3CFXA 2VP1A 1YCJA 1PDAA 1XVYA 5FHMA 4RK2A 2XXPA 4ZECA 2FA7A 1D3KA 2REGA 4I62A 1B52A 2V25A 4OZ9A 4ELOA 2QS2A 2Y7IA 2Q88A 2UYFA 2DWAA 3S2VA 5BUUA 1JW4A 1NKXA 4GQOA 3MZ1A 2NWJA 3OO6A 4N6PA 2H98A 3CSGA 3K6UA 3FJ7A 3UN6A 4GXSB 3Q26A 4HCYA 4MLQA 4HS7A 3M3LA 1WODA 3C4MA 3VE1B 4C1UA 4FE8A 2H25A 1FW0A 3FATA 1D4NA 2DSFA 3KOTA 1A7LA 3T9XB 5IAIA 2RC7A 2HCAA 2ZYKA 3MW0A 4KYDA 2KLFA 4U23A 1A8FA 4R75A 4BDOA 5KCJA 5TPAA 4F1YA 5J1DA 1DTZA 1IUDA 3N26A 2RC9A 1VFDA 1JVXA 3O9PA 1EZ9A 5H8SA 1WVJA 3TPAA 2H4IA 1FQCA 5DEXB 1FQDA 1MXXA 2F34A 1LBBA 1B3FA 2V84A 2O69A 2QS3A 1FQEA 2OBGA 1IXHA 1JVYA 1ZIUA 3T96B 2HFBA 3IR1A 1ZMGA 4OERA 2FNCA 4H5GA 3CIJA 4YICA 2VOZA 2V3TA 3OOAA 4IO2A 3FUZA 4GOTA 4R6YA 1B6HA 1NL5A 2O84X 2PMSA 3PD9A 3LSFB 4KFQA 2GRVA 4EXLA 3GLBA 1Y4CA 5TP9B 5I59A 1IXCA 2I3VA 1UTBA 1FTJA 2Z23A 2VD3A 2A5TA 5JTYA 2RC8A 3TTNA 1QKAA 1URDA 4YKIA 3TCGA 3DP8A 4XKRA 1R1NA 1MH3A 1MY2A 1UTHA 1NNPA 3DELB 3KBRA 3OELA 3K6XA 4G68C 1ZU0A 2B3FA 3FVOA 4Z7EA 5I58B 3O2AA 1FCKA 3O6HA 1XC1A 3A3CA 2CMOA 2AYSA 3HSTA 3RGYA 4ESWA 3GZGA 1P1OA 1URGA 4R74A 1JEUA 4NF4B 4OEVA 3VVFA 1SVXB 1H45A 2F5XA 2XXIA 1JW5A 3H06B 4O3CA 4TQUQ 1LB9A 3K1PA 1PB8A 1H76A 3PPOA 4FJPA 2F7AA 4ZE8A 3UIFA 1MY0A 2OLBA 3IOUA 3TODA 3SKPA 4LONB 4F2QA 3FGSA 5H8HB 2UVGA 2V3UA 3G7WA 1B4ZA 4F3PA 5TU0A 2CZLA 3PUYE 3RUMA 4XXUA 3EF7A 3M8UA 3PV0E 1IEJA 1IXGA 2ZNTA 4IGRA 1Z7ME 2UXAA 4DE8A 4FATA 1LLSA 3S9LC 3OO9A 2W7YA 2DXRA 3FZVA 1B5JA 3TQLA 3ZS6A 4I1DA 3HCQA 4G2ZA 4F2OA 5CMMA 3SESA 2UVHA 4ZEFA 1MQGA 1MXYA 2B3BA 3H6TA 1FQFA 4JWYA 5DVJA 4H0WA 1P1UA 3MVYA 3WAEA 3CSBA 1P1QA 3PPNA 4LP2B 3RT8A 1ATGA 3KOSA 2HZLA 3BFUA 3UORA 1ANFA 4L17A 4EQBA 1Y4TA 2YLNA 2R9JA 4Q5TA 4F1UA 3V8XB 5EYFA 4TLLB 1IXIA 3Q25A 1LAGE 4PP0A 4OHNA 3C36A 3IB1A 3PUVE 3O66A 3THIA 2IA4A 1MXWA 1LGBC 4AB5A 1FTMA 1DTGA 4MH5A 5AE4A 4HCWA 1Q35A 1MQDA 4R6HA 5KDTB 2Y7RA 1L5TA 3VLVA 1BIYA 4MF3A 2Q89A 4EQ9A 3Q27A 3VVEA 3V83A 4WXJA 3MZ9A 4G68A 2PT1A 5AA2D 1JNFA 1SQYA 1LCFA 2DVCA 2XX9A 5I2NB 1Z7NE 3SETA 4G4PA 5HPQA 4F3GA 4Q0CA 4WEDA 4IY6A 3VDFA 1MY4A 4RNSA 5JK4A 2XXVA 2REJA 1LSTA 3KG2A 3IO4A 4U4SA 4YKJA 4GWOA 2E1SA 3MUQA 3N5LA 3UGWA 1QUJA 3EPEA 3QK6A 4NF8A 1M5BA 3MVXA 5DVIA 2OCUA 5FTIA 2OWTA 4P0IA 5AA3A 3TTMA 4YB5A 2O6AA 3TFLA 3QSLA 1Q1KA 4KD5A 4ELRA 1QULA 3C32A 2I4CA 2DWJA 4HW8A 1AMFA 5AA2B 2Y84A 1IZ1A 3G3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1I6BA 2WEFA 2HZKA 2O1MA 4H65A 3PUZE 3K6WA 5I84A 5EQAA 2O7IA 3O6IA 3IJXB 3C9HA 5I5PA 5H8QA 4U22A 1AIVA 1J1NA 4OFJA 4JSOA 5AA4B 4BLAA 1OVBA 4ECFA 2F36A 3SEYA 3UK4A 1B0HA 1RYXA 1NV4A 1SBPA 4H8IA 3IB2A 1Y3NA 4ELPA 3MBPA 3H03A 4GBVA 5CBSA 1LFGA 1O64A 4RYAA 2B65A 3N6UA 2F6PA 4YMBA 3ODBA 5A5XA 4K3FA 2DOJA 1KA1A 1A99A 3LR1A 3PD8A 3N94A 1LAHE 4H46A 4OFOA 4P3LA 4R73A 3HV1A 3IOTA 1R6ZA 1QJMA 4YB6A 2AL5A 4F1VA 4X9TA 2D5WA 4LZ5A 1MQJA 4PFRA 5FHOA 2XXXA 4NMYA 4EF1A 3H4ZA 1TFAA 3S9MC 3K1NA 3WAFA 1XT8A 3JV9A 4I3EA 2XWKA 3EHUA 3MZBA 2ZZVA 3C34A 4YKPA 5ITPA 4XKNA 4AQ4A 2WBDA 1SDXA 3KN8A 4O7IA 2NOOA 3IORA 3MC2A 3PMWA 2X7QA 4MBPA 4O3AA 1PC3A 1B5HA 3SDFA 4OETA 2CEYA 1VDWA 4JVCA 4QSEA 3SERA 4GX6A 2UYEA 3C33A 1OLAA 3TTKA 5EQ9A 3A3UA 1TFDA 3U92A 1PEBA 4EQ7A 1P99A 1SI1A 4ZS9A 2O1LA 5CMBA 1BLFA 1DSNA 5EYHA 1T0KA 2OWSA 3PUWE 1OLCA 2UVJA 4KYEA 1BP5A 3R6UA 3TELA 1NV5A 4X04A 3E78A 3RTFB 1NNTA 2V3QA 1S50A 1RDYA 3ILTB 5ET7A 2Y7KA 2ANJA 2XXUA 3CVGA 4QFPA 1SI0A 1IMCA 1OQHA 3T9UA 4R9FA 4DDDA 3MP6A 5I2KA 4GWUA 4I9DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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