2OK2A

Muts c-terminal domain fused to maltose binding protein
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
b'MIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTHMEETSPAVEALENLDPDSLTPRQALEWIYRLKSLV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Escherichia coli MutS Tetramerization Domain Structure Reveals That Stable Dimers but Not Tetramers Are Essential for DNA Mismatch Repair in Vivo.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, DNA mismatch repair pro
source organism Escherichia coli k12
molecule tags Sugar binding protein
total genus 132
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A01
3T93B 1B7UA 4BDOA 1R1NA 4E0XA 3PUWE 1SQYA 4G77A 5CBSA 3PUZE 2OWTA 3CSGA 1POTA 3RPWA 3HPIA 2QPQA 3MZBA 4ZEFA 3H06B 3GBAA 3IOWA 3H6UA 4IB2A 3T9XB 4ND9A 3V5AA 3G3IA 1LFGA 3H6TA 4EQBA 4O3BA 1PBPA 4YKPA 4XKQA 3KJ7A 4GF8A 3IB2A 2CZLA 3MAMA 3EF7A 3MP8A 3TKDA 4KQPA 2GHBA 4G68C 3FATA 1RKMA 1Y20A 4R9FA 2THIA 3K02A 1PDAA 1YAEA 3LR1A 1N7WA 1I6QA 2RC7A 4Q0CA 5DEXB 2KLFA 3DP4A 4LONB 2F35A 3PMWA 3IB0A 3KN7A 1AL3A 3ODBA 2V25A 3FJ7A 3PUVE 1NL5A 4C1UA 1FQEA 1Y3QA 2DWAA 2ONSA 5M2VA 4MLVA 1IEJA 4GVOA 1OIBA 2DYXA 5EYFA 2I48A 3CVGA 4NF8A 4YU0A 4ZE8A 2RF1A 2GFEA 1NFTA 1PB9A 3W9VA 2V3UA 4GOTA 1H43A 4RK2A 3C4MA 1R6ZA 3TDJA 1MXZA 2XXQA 3H3GA 1B7ZA 4NMYA 5IAIA 2I6EA 3QUJA 3H7MA 2UVGA 4JWXA 1QJMA 3K6VA 3SERA 1A99A 3Q26A 5AA4B 3THIA 3LSXA 3PPRA 3SDFA 1A8EA 4XKNA 1HSJA 4GWOA 3RLFE 1XOCA 4XIGQ 1MDQA 2DXYA 3VLWA 5I84A 3VFJA 3K00A 3Q27A 2P0SA 4RPOA 4DCYA 4KI0E 4WEPA 3K1PA 3KOSA 4KCDA 1D9YA 2HCAA 1MY4A 4YB7A 1N3XA 3RNNA 2NVUB 4QFOA 2G93A 1MDP1 3G3HA 4KYDA 2HAVA 4PP0A 3FVGA 4DCXA 3C35A 3CR9A 1B5JA 2HQ0A 5I57A 3ZKLA 5L9OA 1M5BA 3IR1A 3IJXB 3CRBA 4G8HA 3FVKA 1JETA 4OTEA 1B3GA 3FD3A 4F2OA 4GL8A 5H8FA 3K2DA 3QXMA 4NF6B 1LBCA 4NWCA 3PV0E 3OEKA 3IOVA 2R71A 1MQDA 2PYYA 4OYVA 2Z8FA 1IITA 4ELQA 3OD7A 3FASA 5JEIA 3T96B 1SYHA 4H8IA 4HS7A 4ECFA 1II5A 1MM6A 2QS3A 1P1UA 2XX9A 4QSCA 3RGYA 2DE3A 3TCHA 4X48A 4R9GA 1SBPA 1MG1A 3QSLA 1MPDA 3I6VA 4F3GA 4E0WA 4G68A 3CG3A 1VE4A 4U1ZA 2D21A 4MFIA 5KDTB 4ELRA 1Z7ME 3RTFB 1JW5A 5DTBA 4BDQA 3HV1A 1B05A 2F78A 2Z23A 1IXIA 3SEWA 4OMBA 3TTMA 4H5FA 4GXAA 2O1MA 2NXOA 3FV1A 5FHNA 1L5TA 5I2NB 2DE4A 2QSXA 3IOUA 1LLSA 4WKMA 1MS7A 5IKBA 3S9EA 3B7DA 3V89B 3K0VA 1P1NA 1JVXA 3HHFA 2F7BA 5AA2D 1TXFA 1MXVA 2RINA 2ZYKA 3VV5A 4U2RA 1FTMA 3O66A 2ZYMA 3SEUA 4AQ4A 3QK6A 3N26A 3O29A 2XXVA 4N13A 3VVDA 2H98A 2UVHA 4LUBA 3OO8A 3V8XB 3GXAA 2XXRA 4R6YA 2BJJX 2O7UA 3Q25A 1M5EA 2X7PA 3EQ1A 3B6TA 4JBZA 3E3KA 2F8DA 4LQ5A 4ZECA 3QAXA 2AYSA 4Q30B 2ZYNA 1SI1A 1SVXB 5H8QA 3N5LA 2CMOA 4F19A 3IORA 1GTKA 1N0TA 1B58A 4FEDA 1UTHB 4H65A 5JTYA 1QULA 3OO7A 1AOVA 1LCTA 2F36A 3U1OA 4U23A 1IUDA 1A40A 3DELB 1EZ9A 1ATGA 2RC9A 4I1DA 1B4ZA 5LOMA 1B0LA 2F7CA 1UIVA 3FV2A 1ZMGA 3FGSA 3LBSA 2B3FA 4FATA 5TP9B 2F6GA 3MP6A 3PPQA 2UVIA 2O51A 1N04A 2IEEA 5ELVA 3L6HA 1B3LA 1JEVA 1Y3PA 2X26A 4QSEA 1LFIA 1QUJA 1ZJLA 5I58B 4KYSA 3CSBA 4LVQA 4YAHX 3KG2A 1FTLA 3TFLA 4ZEBA 4THIA 1OVTA 2H4IA 4FORA 3MP1A 4IO6A 1LCFA 4KR5A 3VLVA 1FTKA 3TPAA 1GGGA 3G3FA 3RTWB 3T22A 4KHZE 3TZAA 5CBRA 1QKBA 1ANFA 3BBRA 5AA2A 2HAUA 3VE1B 4C1TA 1Y3NA 1FTOA 2HEUA 4U22A 5H8NB 1D9VA 4R2FA 4DDDA 2DQVA 3F11A 2XX8A 4JWOA 4P11A 3TCGA 1CB6A 4OFJA 3ZSFA 3C36A 3RT8A 1O64A 3UK4A 2I3VA 1DPPA 3K1NA 2PT1A 2ZXTA 2XHDA 1VFEA 4XTCQ 2HZLA 1R9LA 4U21A 4F31B 1NNFA 5CC2A 2AL5A 4QRZA 4X9TA 1GR2A 1M5DA 2ZYOA 4YKKA 1SW1A 3M3KA 3FJMA 1UTBB 3FIRA 1NNTA 5H8SA 3VXCA 1IXCA 3T9VA 5I59B 1OQGA 2ANJA 4YB6A 3KSJA 1SD3A 5EHMA 2DP8A 5TPAB 1TFAA 2YPNA 4RY1A 4HW8A 3E9XA 1MY0A 3A3UA 5CI5A 2I0BA 4KCCA 4U4XA 1M5FA 4XXUA 1O63A 5K2YA 1H44A 2O84X 4TQUQ 3MW0A 1B9JA 4K3FA 3Q28A 3LUYA 1XS5A 4I8CA 2P2AA 3FJGA 3B6QA 1I6BA 3E4RA 1UIUA 3DLNA 4QHQA 1DMBA 5I2KA 4KD5A 4F1UA 3QIMA 5DVJA 3Q29A 1JQFA 2Q89A 2OWSA 4BDLA 4X1DA 3OSQA 3EPEA 2A5TA 2ABHA 1H76A 4FEBA 5EHSA 2RCAA 5HBCA 3KN3A 4EQ9A 3IJOB 3ZKKA 3MVXA 3EN3A 3JV9A 1US5A 1LAFE 3S9MC 4EXKA 1A55A 1S9TA 4Z0IA 3IL1B 1OVBA 1ZBMA 3SEYA 3SETA 4C0RA 3N94A 4GD5A 1SYIA 3OSRA 4LZ5A 3PMVA 3BFUA 1BTJA 3TTLA 2XXTA 1B6HA 2H5YA 3SKPA 4TLLB 1USYE 1B5HA 1MH4A 1TWYA 2XXPA 1LAGE 2OCUA 4H5GA 1P1OA 1N84A 3T9UA 2M8CA 3UP9A 2Y7KA 4MF3A 4G4PA 1D4NA 2YLNA 1MQIA 1FQCA 1VSOA 3OO6A 2ONKE 1AMFA 2R9JA 4I9DA 3LSFB 4OFLA 4KFQA 2DWJA 2Y84A 2Q2CA 4DZ1A 3T66A 1EZPA 2OK2A 5ITPA 3TODA 3K4UA 2Q8JA 4JDFA 5AA4A 3K1MA 5BUUA 4H8JA 4U4SA 5ICQA 3KJTA 5L9SA 4AB6A 4PFYA 1XT8A 1JW4A 3ONMA 2QS2A 1EU8A 1Y4CA 4QF9A 3SEXA 1BLFA 4GLIA 1AH5A 4ZE9A 2B3BA 1YTVA 2D5WA 2O1LA 1YCJA 1ELJA 1B3HA 5I56A 3U93A 5AA3A 3KSXA 5JK4A 5ISUA 1B46A 3U72A 4POWA 1GV8A 5FHMA 1FQAA 3IB1A 4PE5B 3ILTB 3U94A 5DT6A 1RYOA 3H03A 5CMBA 1NMUA 4AB5A 2Z22A 1B0HA 4NF6A 1QUIA 2OJTA 1IIWA 1OLAA 1FQDA 4ZEDA 4JB7A 1CE2A 2RC8A 4DXBA 1DOTA 1A8FA 3MBPA 4ZS9A 4IY5A 1JEUA 1MPCA 3PUYE 1B40A 3O6HA 4NF4A 1M5CA 4PFUA 1H45A 4TOZA 3IO4A 1B32A 4HTGA 1MXUA 4MLQA 4JSOA 5B7DA 1LFHA 4QFKA 3V83A 1AIVA 3K6XA 2VOZA 3CG1A 3TTRA 3H4ZA 2DWIA 2VD3A 4IY6A 2VD2A 3TMGA 2ESNA 1I6AA 5KDTA 4ONYA 4R74A 3IAZA 4ZEIA 2UXAA 3MUQA 5B70A 1P1QA 1TT1A 1JW1A 4MH5A 4NF5A 5I2NA 4IGRA 2FNCA 3FUZA 4FE8A 1MH3A 1MY3A 3TCFA 1MQJA 4UA8A 4GRKA 1T0KA 3MZ9A 2FYIA 1UQWA 4ZZEA 4ISUA 4QFPA 5A5XA 2Z8EA 2O7IA 1LB9A 3SESA 1LB8A 2LAOA 4RPNA 3T9HB 3LSWA 5ICTA 3VXBA 1ZTYA 3W9WA 3BKIB 1MXWA 3FXQA 4IGTA 3EHTA 4N6PA 2I4BA 4N07A 2F5XA 2R6GE 4YMBA 2V93A 3VLUA 4OEVA 3S9NC 5F1QA 1FQFA 1Y4TA 4PFTA 1DPEA 1MM7A 3O6GA 3A09A 4IO3A 5K2XA 4YKIA 4RYAA 1UTHA 2QRYA 3UORA 1PC3A 3PU5A 5CMKA 2VGQA 2I0CA 5H8HB 1PBQA 4OFOA 3UIFA 5AA1A 3RUMA 4OHNA 5KCJA 1XVXA 4JSDA 1EH3A 2I49A 1N3WA 5TP9A 1MXYA 4GQOA 2HZKA 1B52A 1IQ7A 4FAJA 2QMXA 2E1SA 4F39A 2ZNSA 2H25A 1BKAA 3TTKA 5I58A 2YJPA 1B1XA 2DE2A 3QUFA 3CI8A 2Y7PA 4F29A 5BWJA 2O6AA 4NTLA 4DLDA 4R2BA 3ILUB 4H67A 3CFZA 3N6TA 4G8MA 1ZU0A 3U92A 2V3TA 4LP2B 1URDA 3C31A 3IX1A 4OQOA 5DYHA 2O69A 1QKAA 4RNSA 2PMSA 3H6WA 4EF1A 2ZNTA 2XXWA 1US4A 3W15C 2D3IA 3GBBA 1NNKA 2E0SA 1POY1 1S50A 1B7HA 4OESA 3KFMA 5AE4A 4I62A 4F18A 5I2KB 1PB8A 4ZDMA 4P0GA 2AL4A 3L6GA 3SEVA 3VVEA 3MPKA 3I5OA 3G7WA 4IO2A 2XXHA 3HO7A 4WXJA 3EHUA 4IO5A 4LATA 2DXRA 4NWDA 3H6VA 2A5TB 3FZVA 4EUOA 1EZOA 4GL0A 1SW4A 1VR5A 3U8QA 1ZKBA 3HCQA 1URGA 3UA8A 2REJA 4NF8B 2UVJA 2RCBA 3O28A 3B6WA 1UTBA 3KBRA 2GH9A 4YICA 3MVWA 3VDFA 5I59A 1WDNA 3PUXE 4M4GA 1NKXA 4BDRA 1JVYA 4O3AA 3LC8A 3MPLA 1FCKA 5TPAA 2XD2A 2V3QA 4JXIA 2XXYA 4OEUA 1R9QA 3R6UA 4GXSB 2AIXA 1MXXA 2ALUA 1LSTA 1VFDA 3RT6B 2RKMA 1S7YA 4Q8RA 1P1WA 3RQTA 4G2ZA 4TLMB 4ZZAA 5ITOA 2I58A 4YKJA 1B5IA 3IK6B 1DTGA 3DM0A 1JNFA 2IA4A 4OVJA 1B4HA 2Q2AA 5DEXA 4F3BA 1IXGA 4EF2A 4OXVA 3IOTA 4Q5TA 4R6KA 4ESWA 2PVUA 5I57B 2H99A 1QW0A 3TAJA 3CFXA 3IO6A 1RYXA 4LZ7A 4WEDA 4F3PA 1Q1KA 2H9BA 1SW2A 2Y7IA 1IXHA 2HXWA 4YMAA 2DWHA 3HN0A 5H8FB 5TU0A 4L17A 4GFRA 3TQWA 3PMXA 3OOAA 3TUSA 4QFNA 3D4GA 3KZGA 3K6UA 5I56B 2Q9TA 5DVFA 2G29A 1MPBA 4Z7EA 1USYH 2WKYA 2OZZA 2QS1A 1BP5A 2PBWA 3OO9A 1WVJA 4HCYA 3MZ1A 3MQ9A 3PD8A 1Y1MA 4G68B 3PPOA 2O68A 3AXFA 1N76A 3PPPA 2DVCA 1WODA 3G3JA 3M8UA 4LZ8A 3I3VA 3TQLA 1O7TA 3E13X 1Q35A 3RY3A 2VP1A 1NNPA 4X1BA 1B2HA 4H6DA 4NEDA 3O6IA 5HPQA 1D3KA 1B3FA 3FXUA 5FTHA 4DE8A 4F3SA 3KOTA 4FECA 2HFBA 2QJEA 4NF4B 3JZJA 3CFLA 3N6UA 1OMPA 1SI0A 4HCWA 1A7LA 4F1YA 4QSDA 4XKRA 3PPNA 2XX7A 4BLAA 4BDMA 1NH8A 2QL3A 3S4UA 2NOOA 2A5SA 3MVZA 4NE4A 1PB7A 3GZGA 5L8DA 1J1NA 4EDPA 4R72A 3OENA 2QS4A 3DP8A 3O9PA 4ESXA 2XXUA 3C33A 5CRYA 3CIJA 3EHSA 2OLBA 4H1XA 3K01A 5DVIA 2Y7WA 2XXXA 1I69A 3M3FA 3TTNA 3DP6A 4KYEA 3TYHA 3A3CA 1DTZA 3R26A 4ELPA 4NF5B 1BIYA 1A54A 5CMMA 2X7QA 1YPNA 2F34A 1FQBA 2F7AA 1URSA 2Y7RA 1PEBA 3MVYA 2PX1A 3MWBA 1Y9UA 4FJPA 5H8QB 1LBBA 4UACA 3C34A 3K6WA 4FIMA 3WAEA 3PD9A 4RJZA 3FVOA 4GIZA 3BFTA 2DVZA 5A5XB 4O3CA 4PFWA 5JTYB 2I3WA 1H3DA 3O2AA 3G3KA 4QFLA 1HSLA 3LSLA 1NH7A 4MBPA 4PETA 3HHGA 1GVCA 5HM4B 1MQGA 3C9HA 5J1DA 3MC2A 2GRVA 1ZLQA 1XC1A 3ZS6A 4OETA 5FHOA 4M1VA 2UYFA 4F2QA 3S9LC 4YZZA 1B51A 2VHAA 3OEMA 4DIGA 2W7YA 4OZ9A 1DSNA 1SDXA 3D4CA 1ZIUA 2F97A 3OMBA 3S2VA 3PGFA 4DXCA 1SW5A 2DS9A 3HSTA 2PT2A 2ONRA 1XHYA 3G3GA 1TFDA 4XKPA 3ECRA 5KCJB 2XD3A 3P7IA 3RN8A 1Z7NE 5CMCA 1FTJA 2NWJA 4POXA 4OERA 4R75A 2ZMBA 3WAFA 2FA7A 1B1HA 3R7XA 1LAHE 1LGBC 3QYTA 4EXLA 2P1SA 5AA2B 1OLCA 3FVNA 3TEPA 1MY2A 2B65A 3UGWA 3GLBA 1OQHA 2I4CA 3FXRA 4OWDA 4G8NA 5L9MA 4LQ2A 4R73A 2XXIA 3O97A 3JYRA 2Z8DA 2F6PA 4PQJA 5FTIA 3C32A 4DXUA 2DSFA 2ZNUA 4ELOA 3OELA 1FW0A 3KEIA 1LAXA 4ZEKA 2QMWA 5F7VA 4H0WA 4JWYA 4RXLA 2NUVA 3USDA 5CM6A 4P0IA 2Q88A 4BDNA 4EQ7A 3KGCA 3MJNA 1MQHA 1N7XA 5H8HA 2DOJA 1QVSA 2OBGA 1IZ1A 2UYEA 4RA1A 2REGA 3UN6A 1B3EA 5KZTA 3VVFA 1MY1A 2V84A 4F22A 2GHAA 4KPTA 4F1VA 4IO7A 4U1OA 1F9BA 1P99A 1MRPA 1Y1ZA 4RK9A 3OXNA 1HSEA 1QUKA 1XVYA 1KWHA 4YB5A 3M3LA 4IO4A 5H8NA 4OENA 3KN8A 3TELA 4R6HA 4LA9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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