2OK2A

Muts c-terminal domain fused to maltose binding protein
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
MIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTHMEETSPAVEALENLDPDSLTPRQALEWIYRLKSLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli k12
publication title Escherichia coli MutS Tetramerization Domain Structure Reveals That Stable Dimers but Not Tetramers Are Essential for DNA Mismatch Repair in Vivo.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, DNA mismatch repair pro
total genus 132
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A01
3VVEA 4QSDA 1Z7NE 1FTMA 4GWOA 3SDFA 1SD3A 5FHNA 4DE8A 2VGQA 1D9VA 4F3PA 2BJJX 2M8CA 1NMUA 1JVXA 1II5A 4KD5A 3DLNA 4FE8A 3OMBA 5DT6A 1MM6A 3RTFB 4AQ4A 4ELRA 2H5YA 3K00A 3USDA 2ANJA 2HAUA 4JXIA 3Q28A 4YKPA 1MRPA 5I2NB 3P7IA 2WKYA 4F1YA 2ZMBA 3PPNA 2F6PA 1RYOA 3PUXE 1B3GA 1XC1A 3LSFB 2NOOA 3HSTA 3QSLA 4X1DA 4R73A 1P99A 3FXRA 4NF6B 3RQTA 5JTYB 4X1BA 4ZE8A 2HCAA 5DVIA 3SEYA 3S9EA 4H0WA 5I58A 1FQAA 4IO6A 3C32A 1UQWA 1URDA 3DELB 2DQVA 1OLAA 4ZE9A 4C0RA 1H76A 4TLLB 3B6QA 3CSGA 3MVXA 4EXKA 4YAHX 5ITPA 2REJA 3G3KA 4XKQA 2R71A 4PP0A 4DLDA 4G4PA 3KBRA 4HCWA 3C9HA 3TDJA 2Y7WA 1LFIA 1LBBA 3R6UA 3N94A 2UVJA 2V3TA 2CMOA 3O6HA 3T9VA 2DXYA 3MAMA 1JW1A 5JK4A 4JDFA 4QFLA 1MXVA 2ALUA 1XHYA 3K6VA 2IEEA 4OFLA 3PUVE 4WEDA 1EZPA 2F7AA 4EQ9A 1YAEA 4R6YA 2ONKE 2XX7A 4BDQA 2QPQA 4RPNA 3OO8A 4RPOA 3KEIA 1H45A 5DTBA 4ZEBA 1A99A 2REGA 3MZ1A 4LUBA 4L17A 3VXCA 4DIGA 1QKBA 3R7XA 3FXUA 3LSLA 4U23A 3O97A 1L5TA 1TT1A 4EDPA 3BBRA 4R6KA 5DVFA 1IXCA 3MP1A 5CMCA 3IB2A 4PETA 1DTZA 1CE2A 1DMBA 2V25A 3IB0A 3V5AA 1RYXA 3CG1A 3U93A 4OESA 4Z0IA 3UIFA 4JWOA 4O3BA 5EYFA 4ND9A 4QHQA 1MXYA 2OK2A 2A5TB 3QUJA 4OZ9A 3T9HB 5HBCA 3UP9A 3LSXA 4ZEKA 1JEVA 2G93A 1AH5A 4ZEIA 4TQUQ 4EF2A 2PVUA 4KYDA 3FVNA 1NNKA 5DEXB 3SEUA 4E0XA 3L6GA 1IXHA 1N3WA 1FQCA 4ELQA 4HW8A 4ISUA 3IOVA 5L9OA 3E9XA 5AA4A 1EH3A 1BP5A 1NNFA 3IL1B 4R75A 3GZGA 2R9JA 4OXVA 2F36A 2Q88A 1SW2A 3IO4A 4QSEA 3O6GA 1B46A 4NTLA 3TFLA 4R9GA 5AA2A 4U22A 1N0TA 5ICTA 2XXUA 5L8DA 1DOTA 4FIMA 3U94A 4GRKA 1IXGA 4LONB 1NNPA 3FJMA 4U4SA 1ZJLA 1B5IA 4M1VA 2RKMA 2A5SA 5FTHA 1MPBA 2XXPA 4OMBA 4DDDA 1S9TA 2I4CA 2FYIA 4YB6A 5I56B 5ELVA 5CM6A 4R2FA 4BDMA 5H8QA 1LCTA 3TQWA 4QFKA 1M5BA 5IKBA 5EHSA 3MPKA 1N76A 3BFTA 4YICA 1FQDA 2QS3A 2DP8A 2IA4A 4RK9A 1SYHA 1B51A 2Q2AA 1QUIA 1USYH 5I84A 1MH3A 3T9UA 3FV2A 2GFEA 1GR2A 4YKKA 4P11A 4DCXA 4KYEA 2HEUA 1QVSA 3WAFA 5KZTA 1P1QA 1ZIUA 3OO7A 3AXFA 4TLMB 1NNTA 1B52A 1PBPA 3K02A 3MUQA 3OSRA 3O6IA 1O7TA 3OSQA 2QS4A 4POXA 4C1UA 3MQ9A 2D21A 3VV5A 5ISUA 1MXWA 1NFTA 3FV1A 4U4XA 2Z22A 1IXIA 3TCGA 3DP6A 3IR1A 1US5A 4ZECA 1B7HA 5A5XA 2QMWA 4GOTA 5I58B 4IGRA 5CBRA 1SDXA 1N7WA 4P0GA 4KCCA 1MPCA 4QFOA 2QMXA 3FD3A 2I6EA 4H6DA 4WKMA 2GHAA 2DOJA 1YPNA 2O7IA 2O6AA 3N6TA 3MVYA 4ESXA 3E13X 3IOTA 1URGA 1QULA 1D9YA 1FQBA 4PQJA 1R6ZA 4F2OA 1D3KA 1T0KA 1R1NA 4ZDMA 4EQ7A 2DXRA 1ANFA 3U72A 2D3IA 1DSNA 3I6VA 3TQLA 3S9MC 3EHSA 2Y84A 3TMGA 2ZYOA 2F7BA 4BDRA 3C31A 3MWBA 3UA8A 3DP8A 4G68C 1B4HA 3EQ1A 4KHZE 4GLIA 4C1TA 1XOCA 1XT8A 2B65A 4OEUA 1ZLQA 1B9JA 3MZ9A 1B6HA 3ILUB 1R9QA 1IITA 4GVOA 3QIMA 1H43A 1F9BA 4YB5A 1POTA 4LA9A 5CI5A 2Z8EA 4THIA 1UTBA 3OXNA 1Y9UA 2UYFA 3KN3A 3QYTA 3MPLA 4PE5B 1B2HA 1PC3A 4G77A 2UVHA 1TWYA 1SYIA 5AA2D 3G3JA 4NF8A 3TODA 2ZNUA 4ECFA 3MP8A 3PGFA 5I59A 2Q89A 3CFZA 3IK6B 4MH5A 2HAVA 4O3AA 1R9LA 2NXOA 1Y4CA 4I8CA 5K2YA 3KJ7A 1B0HA 2O68A 4GD5A 5ITOA 1A55A 3MBPA 4ESWA 3SESA 4K3FA 4OYVA 5CRYA 2P2AA 3G3IA 3KSXA 2I58A 4NE4A 3BKIB 3FVKA 2I48A 3OD7A 2DWHA 4JSOA 2G29A 2ZNTA 2RC7A 1GGGA 2I49A 4BDLA 3VFJA 1MS7A 4PFTA 1MY0A 2PT1A 2ONRA 4JSDA 3OOAA 3QAXA 4I62A 1POY1 4KQPA 5M2VA 3IX1A 5DVJA 4KPTA 3ZS6A 3H6TA 2XXIA 3PMXA 4EQBA 1URSA 3DM0A 1NL5A 4GQOA 1Y1ZA 3LBSA 2RC9A 4IGTA 3SERA 3KSJA 2XD3A 1FW0A 1GVCA 1VSOA 3VLWA 2XXQA 3PUWE 3H03A 1UIVA 1US4A 3FUZA 1FCKA 2O1MA 4YMBA 1B1XA 2ZYMA 5AA4B 1LB9A 3A3CA 2OLBA 1RKMA 4EF1A 4UA8A 1BIYA 2PT2A 2RF1A 2F5XA 4WXJA 1AOVA 3C35A 2XX8A 5AA2B 3H4ZA 4GXAA 1IIWA 2R6GE 5I57A 3JV9A 1H44A 3S9NC 3KGCA 3L6HA 1ZMGA 4ZEFA 5KDTA 1Y3PA 2Y7IA 4ZZEA 1MXZA 1AL3A 4UACA 1OLCA 1MQHA 4OETA 3FGSA 3TKDA 3A3UA 3RLFE 2HFBA 2YJPA 1P1OA 5H8QB 3KOTA 4POWA 4IO5A 2DWAA 4I1DA 5FHMA 4R6HA 3MZBA 3MC2A 3TZAA 3PD9A 4GXSB 1B05A 3E4RA 3QUFA 1QUKA 2PYYA 3OEMA 3VE1B 4F39A 1MXXA 1B7UA 3IORA 2XXXA 3G3HA 3IO6A 3S4UA 1YCJA 4ELPA 3IJXB 4LZ8A 3CFXA 1DPPA 4FORA 3I3VA 1Z7ME 1Y3QA 4MLVA 4LVQA 3EF7A 4O3CA 1WVJA 5L9MA 2GRVA 3Q25A 4JWYA 2UVIA 3LUYA 1UTHA 2H98A 3QXMA 4OWDA 5A5XB 1A8FA 1PBQA 1N3XA 4DXUA 3TTKA 1MG1A 1M5DA 2Y7PA 3PUZE 4F3GA 3H7MA 4GFRA 4QRZA 4F1UA 1MDQA 1PB9A 4RY1A 4AB5A 4MBPA 1MPDA 4F3SA 4RYAA 2I0CA 3U1OA 3Q29A 2ABHA 5CMMA 4QFPA 3UORA 3GXAA 3TPAA 1EZ9A 2VD3A 1WDNA 1MQGA 2DE4A 1EU8A 3UGWA 2DSFA 4Q8RA 2D5WA 4I9DA 3PPRA 4GF8A 4JBZA 2OWTA 1USYE 3FASA 1M5FA 3JYRA 2H4IA 1LAGE 3FIRA 4Q0CA 1TXFA 1A40A 1MY1A 1UTBB 4OERA 4U2RA 1KWHA 3ODBA 3C34A 3CG3A 1P1UA 3O9PA 2FNCA 1MY4A 4NF8B 3IJOB 1N7XA 5I59B 4H8IA 5AA1A 3VVFA 5AE4A 4DXBA 4YKIA 4G8NA 1OQHA 1ELJA 1MQDA 1SVXB 3M3FA 2HQ0A 1XVYA 2F35A 3VLVA 3RUMA 3SEXA 4H5FA 2E0SA 3SKPA 2Z8DA 4FAJA 3VXBA 4N13A 5K2XA 1FQEA 3O2AA 3KN7A 4NWCA 2I0BA 4LQ2A 3M8UA 3RNNA 2F8DA 4XIGQ 3T66A 3T96B 4FATA 4H1XA 2QS2A 4ZZAA 3M3LA 2DYXA 3OO9A 2QSXA 3LSWA 3GBAA 3G7WA 3HPIA 3U92A 5AA3A 1LAFE 4GL8A 3M3KA 2V93A 1B1HA 1ZBMA 4YMAA 2FA7A 1B5JA 5CC2A 1IEJA 1LAXA 2X7PA 1QKAA 4KFQA 1JVYA 1FTLA 4IO7A 1WODA 1O63A 1B40A 5DYHA 5KCJA 4TOZA 2THIA 4F29A 3ILTB 3V89B 2AYSA 3H6UA 2Q8JA 3KFMA 1TFDA 5I57B 3C33A 1N04A 5ICQA 2V3UA 5KDTB 1NH7A 4P0IA 4LATA 3K4UA 4IO2A 1SW5A 2ONSA 2P1SA 1GV8A 5H8SA 4OEVA 4NWDA 2NWJA 1AIVA 3K6WA 1MXUA 5H8FA 1OIBA 2DVZA 2QJEA 3W9WA 3K1NA 3RN8A 4KCDA 1PB7A 3H6VA 2AL5A 3RT8A 5J1DA 3BFUA 4KYSA 5TP9A 3HCQA 1VFDA 3QK6A 3O28A 1I6QA 5TU0A 2V3QA 1SBPA 2O7UA 1IQ7A 1H3DA 4FECA 5FTIA 3JZJA 3ECRA 5B7DA 1PEBA 4HTGA 2VD2A 3G3GA 3T93B 4ZS9A 2RINA 4JWXA 1UTHB 1A8EA 1VE4A 3Q27A 4N07A 2XX9A 4RJZA 3PPPA 3H6WA 3EHUA 3VVDA 2I3WA 2I3VA 3KG2A 3KJTA 3UK4A 4EUOA 2X26A 2HXWA 1P1NA 2PMSA 2NUVA 2ZXTA 2XXTA 1LCFA 5BWJA 3LC8A 3HV1A 4H5GA 1JW4A 2UVGA 2VOZA 4QF9A 3WAEA 1NH8A 4MF3A 2ZYNA 1I6BA 3V83A 1B32A 3K2DA 4OTEA 4F22A 3TTNA 1SW4A 1XS5A 3MJNA 5BUUA 2UXAA 1I6AA 3KZGA 1BTJA 3PUYE 4M4GA 1I69A 4XKRA 4GL0A 1LB8A 4NF4A 1B58A 4NEDA 3B7DA 1LBCA 1Y4TA 3MVWA 5TPAA 2DE3A 1B0LA 2GH9A 1TFAA 4LZ7A 3CFLA 3SEVA 3TUSA 3H06B 1LSTA 2Q9TA 4NMYA 2XD2A 4WEPA 3IB1A 3ZSFA 4G68A 1YTVA 3N5LA 1OVBA 2O84X 4F19A 4YKJA 3RPWA 1J1NA 4OFJA 4RXLA 1B3HA 1SI1A 2OCUA 1EZOA 2HZKA 3HHFA 1MM7A 1JQFA 3MVZA 1QJMA 4KR5A 3FVGA 4ZEDA 5F7VA 3TAJA 3TCHA 2NVUB 2Y7KA 1FTJA 4PFWA 4LZ5A 3O66A 1OMPA 1UIUA 2Q2CA 1MY2A 1MQJA 5HPQA 1B3LA 4F31B 3A09A 3D4GA 4H65A 5FHOA 3D4CA 3EPEA 3C4MA 1LFGA 2XHDA 1BLFA 4AB6A 4F18A 5I2KA 4F3BA 1QUJA 1HSLA 3TTRA 2H25A 3KOSA 1MH4A 1B3FA 2F6GA 3B6TA 2H9BA 2Z8FA 3TTMA 1FTOA 4R2BA 3PMVA 1B4ZA 3E3KA 3W9VA 5F1QA 4QSCA 1ZTYA 2Y7RA 2ZYKA 4G2ZA 4NF5A 3FJGA 3MW0A 4RK2A 5KCJB 2PX1A 2ESNA 1SI0A 3THIA 5H8NA 2ZNSA 4IO4A 3K6UA 1S50A 3K0VA 1O64A 1MY3A 4R74A 2OBGA 4H67A 2CZLA 2VHAA 3B6WA 3PV0E 4EXLA 4YB7A 2V84A 2XXYA 3TYHA 3N6UA 3FJ7A 3V8XB 4LQ5A 4XKPA 1Y3NA 2XXVA 5I2NA 3PMWA 5H8FB 3IAZA 3TTLA 4LP2B 1S7YA 5CMKA 1MQIA 1VFEA 3TEPA 4FJPA 3EHTA 3HO7A 1FQFA 2OWSA 4U1ZA 3I5OA 2F7CA 4QFNA 3OEKA 3S9LC 4NF6A 3CIJA 3TCFA 5JTYA 1Q1KA 3FZVA 4BDNA 4IO3A 1ZU0A 4X9TA 2OZZA 2HZLA 5TP9B 4XTCQ 4U21A 3W15C 1N84A 5LOMA 5B70A 5IAIA 4BDOA 3RT6B 3T22A 3FATA 3RY3A 1JETA 2RCBA 1FTKA 4OQOA 2DWIA 3K6XA 3OENA 3U8QA 1LFHA 3K1PA 2W7YA 4IY5A 1OQGA 3F11A 4DCYA 4MLQA 4JB7A 5H8HB 2DS9A 2F97A 5CMBA 2RCAA 2YLNA 4RA1A 4E0WA 4OVJA 3PU5A 1LAHE 4OFOA 3GBBA 1Q35A 1JNFA 3PPQA 3IOWA 2LAOA 3GLBA 5L9SA 3R26A 3FVOA 3SEWA 1A54A 4ONYA 1SW1A 3CRBA 3S2VA 3PD8A 5HM4B 3ZKKA 4OHNA 4DXCA 3EN3A 4R9FA 4PFUA 2F78A 2OJTA 4XXUA 4OENA 3MP6A 2UYEA 2E1SA 1JW5A 1ATGA 2AL4A 2O51A 4Q5TA 3CVGA 1P1WA 2PBWA 4NF4B 1B7ZA 3VDFA 3CSBA 5TPAB 2RC8A 1ZKBA 3CI8A 4N6PA 3VLUA 3SETA 3G3FA 4KI0E 2YPNA 3PPOA 2H99A 3OELA 5EHMA 1IZ1A 3N26A 5JEIA 2XXWA 2KLFA 1HSEA 4G8MA 3O29A 4R72A 4G68B 4X48A 3HN0A 3OO6A 3RGYA 1DPEA 4BLAA 3IOUA 1VR5A 1D4NA 4HS7A 1LGBC 2P0SA 1IUDA 3Q26A 4RNSA 5CBSA 2VP1A 2DE2A 2XXHA 1M5EA 3DP4A 1A7LA 3HHGA 4Q30B 3UN6A 2A5TA 2QS1A 2AIXA 1DTGA 4HCYA 2X7QA 3K01A 3KN8A 4FEBA 1AMFA 3LR1A 4F2QA 3ONMA 4MFIA 1HSJA 1B3EA 1Y20A 2XXRA 5DEXA 1OVTA 1SQYA 2DVCA 2I4BA 3C36A 4YU0A 3T9XB 2F34A 2GHBA 1B5HA 4XKNA 4GIZA 4U1OA 4Z7EA 2B3BA 2B3FA 3TELA 3H3GA 1PB8A 4PFYA 4FEDA 2QRYA 4YZZA 5I2KB 1LLSA 1GTKA 1CB6A 4IY6A 2O69A 4G8HA 4H8JA 1XVXA 3FXQA 1JEUA 1MDP1 5H8HA 2QL3A 1BKAA 3K1MA 4F1VA 3CR9A 1M5CA 2O1LA 1QW0A 2DWJA 5I56A 2Z23A 4IB2A 4NF5B 3ZKLA 3RTWB 1PDAA 1NKXA 5H8NB 4DZ1A 4ELOA 1Y1MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VVEA 1EYJA 4QSDA 1Z7NE 1FTMA 4GWOA 3SDFA 4NQ8A 1SD3A 5FHNA 4DE8A 2VGQA 1D9VA 4F3PA 2BJJX 2M8CA 5EYGA 5ET6A 1NMUA 1JVXA 1II5A 4KD5A 3DLNA 4FE8A 3OMBA 5DT6A 1MM6A 3RTFB 4AQ4A 4ELRA 2H5YA 3K00A 3USDA 2ANJA 2HAUA 4JXIA 3Q28A 4YKPA 1MRPA 5I2NB 2OWZA 3P7IA 2WYPA 2WKYA 4F1YA 2ZMBA 3PPNA 2F6PA 1RYOA 4P9KA 3PUXE 1B3GA 3B50A 4DI4B 1XC1A 3LSFB 2NOOA 1FSAA 3HSTA 3QSLA 4X1DA 4R73A 1P99A 3FXRA 4NF6B 4NHBA 3RQTA 5JTYB 4X1BA 4NF0A 4ZE8A 2HCAA 5DVIA 3SEYA 3S9EA 4MMPA 4H0WA 5I58A 1FQAA 4IO6A 3C32A 1NV1A 1UQWA 1URDA 1YYZA 3DELB 2DQVA 1OLAA 4ZE9A 4C0RA 4PFRA 1H76A 4TLLB 3B6QA 3CSGA 3RPLB 3MVXA 4MNIA 4EXKA 5FBPA 2KQZA 4YAHX 5ITPA 3A29A 2REJA 3G3KA 4XKQA 2R71A 4PP0A 4DLDA 2V4CA 1FPLA 4G4PA 3KBRA 4GBVA 1AWBA 4HCWA 3C9HA 3TDJA 4OA4A 2Y7WA 1LFIA 1LBBA 3R6UA 3N94A 2UVJA 2V3TA 2CMOA 3O6HA 3T9VA 2DXYA 4OVPA 3MAMA 1JW1A 5JK4A 4JDFA 4QFLA 1MXVA 2B4MA 2ALUA 1XHYA 3K6VA 2IEEA 4OFLA 3PUVE 4WEDA 1EZPA 2F7AA 4EQ9A 1YAEA 4R6YA 2ONKE 2XX7A 4BDQA 2QPQA 2WX9A 1NUWA 5EQ7A 4RPNA 3OO8A 4RPOA 3KEIA 1H45A 5DTBA 4ZEBA 1A99A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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