2OKAA

Crystal structure of q9hyq7_pseae from pseudomonas aeruginosa. northeast structural genomics consortium target par82
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
b'AKPEIVITYCTQCQWLLRAAWLAQELLSTFADDLGKVCLEPGTGGVFRITCDGVQVWERKADGGFPEAKALKQRVRDRIDPQRD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Q9HYQ7_PSEAE from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 25
structure length 84
sequence length 84
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2okaA00
3O76A 5F8BA 1M9BA 1N2AA 5G31A 3NZNA 5IPGA 4JRRA 2A2SA 5J3RA 5IQYA 1TI3A 4V2NA 4EE0A 5C00A 3F0IA 1SL1B 1V57A 2F8AA 2O8VB 3J7Yb 2LJKA 2GT6A 2A4VA 1SENA 2HE3A 2QC7A 1MEKA 1BX9A 3CRUA 1YDKA 1OVNA 3I6AA 4JU5A 5H5RA 3JCML 4GTUA 4RUVA 1E6BA 4HU9A 5AIXA 2J23A 4YQMA 5ECHB 4HJ2A 5D93A 1XXUA 4RI7A 2DJKA 2PU9C 5CREA 3ZFLA 2C0EA 4BWSA 1F9MA 2CX4A 2KOKA 4DSRA 4MZWA 3TJFA 1GH2A 2GQKA 2O89A 3TKSE 3CTFA 1TI1A 1V58A 1MDIA 2JL4A 3UMAA 1GNEA 2N5FA 5GSTA 2C4JA 3L0HA 2HI7A 2YJHA 4DVCA 3HZ4A 3LWAA 2NDOA 1PGTA 1WJKA 3S9FA 4ECIA 1ST9A 3CTGA 4N30A 2V1MA 4MZCA 5ENUA 1PRXA 4IGJA 1A23A 5GZZB 4I8BA 1N8JA 4CDOA 2YV7A 1VF2A 2NTOA 4LA1A 4WEYA 1AQVA 5F06A 2IFQA 1VF4A 5G1LA 1SKRB 2DSAA 3EU3A 2GTUA 4HDEA 2WS2A 4DSQA 10GSA 3IA1A 4XCSA 1F3AA 2H70A 2VCQA 1TK8B 2XBIA 1EOHA 5B8AA 2BTOT 3APOA 3KJYA 5ID2B 3HY2A 5IOXA 5AN1A 2LQQA 2JZSA 4I2TA 2YWOA 5GAPD 3FEUA 2PWJA 3LQ7A 4ECCA 4ZB9A 2V6KA 1FHEA 1J08A 2LS5A 3KP9A 2OADA 4G9HA 4WKWA 2CAQA 3ED3A 4I6XA 1ZCPA 5ECMB 3G9BA 5H5QA 4JZQA 2JSZA 5FHIA 3GUSA 4JBBA 3F6FA 1X9MB 1TK5B 1XWCA 1DSBA 3DYRA 3KEBA 1WMJA 5IPHA 1K3OA 1SU9A 2DIYA 4N11A 5GSSA 1NW2A 3RHCA 3I69A 1PN9A 3UARA 3FZ5A 1I9DA 3QFBC 2H1GA 1XWGA 4PUFC 3KZQA 1BG5A 3D6IA 2HFDA 1EP7A 3UVHA 1ZYEA 4EL1A 1XZOA 4PXOA 4LLRA 2IMDA 4MDCA 4E8EA 3HDCA 5JWRB 5JWOB 1G6WA 1OAZA 1JHBA 1PKWA 2NVLA 2L59A 1TW9A 3ME7A 2YZHA 4NPBA 2DJ0A 3FHKA 4RQXA 2M80A 1X5CA 1SJIA 2VAFA 3DVWA 3H8QA 4PGTA 3ERGA 1BEDA 3O3TA 1GULA 4F0CA 1PQNA 3M0FA 1A8LA 2WDUA 2YNXA 1ZMAA 4FYCA 4AJ6A 1C72A 4J56E 1A0FA 5CRDA 1EV4A 1TTZA 2L4QA 4G19A 3P7XA 1O7UA 1JZOA 1LBKA 4TKYA 3KCMA 4IQ1A 4TR1B 4MH3A 4HUAA 4L5LA 2H19A 4OD7A 1U3AA 2O85A 1Z3EA 3GFKA 4TR4A 1JZWA 1JZDA 1X0RA 2NBSA 4K0GA 1FB0A 3ZREA 4BL7A 1WWJA 1B48A 1FVKA 5F0GA 4ZB6A 4OFTA 1XIYA 4NHZA 13GSA 3W8JA 2X8CA 1WRYA 2EIOA 2CV4A 2TRXA 3VPTA 3GKXA 3G7IA 2HNLA 4TXOB 3CMIA 3WGEA 5IIZA 1QQ2A 3APQA 3BCKA 6GSUA 1GUKA 3HVSA 3D4TA 1TP9A 3FR6A 3ME8A 5HR1A 4I5QA 4ML1A 2K6VA 1SKWB 3NOFA 2HZEA 4KDXA 3F8UA 5LNKe 3M9JA 2K18A 2YOIA 4MA9A 1K0OA 2FUG2 2L6CA 1UN2A 5E4WA 1TK0B 1ZYQB 4KSOA 1TRVA 3FKFA 3H1NA 2ZUPA 2H72A 4OFMA 2H01A 4PURA 2LTKA 2H6ZA 1YEXA 4HI7A 1WE0A 3HJPA 4HQSA 2VCTA 2VCVA 1EGRA 2K9FA 1FB6A 3KMOA 1YKAA 4POMA 4RI6A 3UL3A 4KGIA 1HD2A 4IKHA 2HRNA 2E0QA 2OA7A 3EE2A 4PUAA 4MCUA 2FNOA 1TJDA 3FR9A 1OYJA 3US3A 3VI7A 2CVBA 2WULA 1V40A 1SJZA 2GDRA 3TDGA 2LEGA 5A4VA 4EUYA 1T7PB 4OFNA 3TGZA 2XC2A 5HR3A 4Z7XA 4POBA 4I97A 5AISA 1GSYA 4DSSB 2IMKA 1BQ7A 2GZYA 2K8SA 4MABA 4WBJA 4PQIA 2PN8A 4MMMA 2OJLA 3LEFA 3PGTA 1JLVA 2GVPA 1GSUA 2P5RA 2WZ9A 2IN3A 3DIEA 1GTUA 3EINA 5INYA 2WCIA 3I9V2 3I43A 3ZZXA 3TUEA 4MP4A 16GSA 1GL8A 2N5BA 5G2ZA 4IBPA 5A4UA 2QKEA 5DJLA 3GV1A 2NPBA 1O8XA 2IMFA 1GP1A 3OR5A 3IV4A 4XS4B 2QSIA 2DJ2A 1MDJA 4EKZA 4HQZA 1R5AA 2LRNA 4O92A 2ZNMA 4XHMA 1O85A 2C8UA 2RIIA 4IP1A 3ZVJD 3GTUB 5IMFA 1ILOA 1TU8A 2AB6A 3P90A 3VK9A 4GQFA 4ACSA 4NAXA 5CO3A 5AIVA 2FWHA 1Q98A 3LXZA 3ZFBA 5B8BA 3FYGA 4EDYA 3P2AA 1WIKA 4HS1A 4AF2A 5F07A 3WT1A 1T1VA 2MMOA 2H1DA 4ECJA 1GSQA 2VD1A 4J57E 3KH9A 3F3RA 2CT6A 3CSJA 3A2VA 4KH7A 1TU7A 3HXSA 2H6YA 3A5WA 3PR8A 1EWXA 4EF0A 3ZTLA 3Q19A 3C1RA 2ON5A 3IDVA 3GA4A 4WBRD 5IMCA 4G10A 4WF4A 1KNGA 1QFNA 1QUWA 1XBSA 3TKSA 2VL2C 5CYYA 3GKMA 3LYPA 1Z7RA 4L0WA 3ZIJA 4IVFA 2JACA 5HQPA 4CW9A 2LRTA 1V98A 3IR4A 2G0FA 1U6TA 2VLTA 1F37A 3RPNA 2LRCA 1K0MA 3HD5A 3CYNA 2FY6A 2CAIA 4ML6A 2C0DA 1Y25A 4Q5QA 3APSA 2L6DA 3CSHA 1MDKA 5ECOB 2DIZA 4TXVA 3CRTA 3IBHA 3HKRA 2P0GA 1ABAA 4G2EA 1G7OA 4IQAA 3FZ9A 4OWYA 1G6YA 2B3SA 5ECQB 1SD8A 2MBTA 1GNWA 3KMNA 5B7CA 1HQOA 4ZBBA 1PX6A 1XWBA 2HXKA 6GSTA 3E3EA 1AQXA 2DLXA 3H93A 1UC7A 4FYUA 2FCHA 2IIYA 4GQCA 4IJIA 4KW6A 5J4UA 4KX4A 5DAKA 4ISDA 2VM2A 3VWWA 1PSQA 2OE0A 3F4RA 1X5DA 1GLPA 4MF6A 1VF3A 1Q4JA 2MMNA 1GTIA 2HSHA 2K8VA 2F8FA 4IP6A 3A2WA 1PL1A 3QDNA 3FW2A 3LORA 1PX7A 4MPFA 3H79A 4K8MA 4O5RA 2VCWA 2HZFA 5FT3A 2GZPA 4Q5FA 4L0UA 2IMIA 3KGKA 2L57A 1QMVA 4EVMA 2YWNA 3VFIA 1YF1A 3DD3A 2FWFA 3M3MA 2DJ1A 3C8EA 1FG4A 4TW5A 4J2FA 1FO5A 1JLWA 2DJJA 3EURA 3D22A 2GQLA 1ERUA 1VGLA 1KBNA 1WOUA 1B9YC 4ID0A 4YQUA 1QK8A 1GSDA 3L9UA 4WF5A 5J9CA 2YANA 1F2EA 1SK1A 2H75A 4GLTA 2RLIA 2C3QA 1A2JA 5D73A 3ERFA 1NHOA 1AIUA 3GRXA 2H1BA 4RQRA 2VUPA 5KN0A 3IE3A 4FO5A 4LL1B 4FIWA 5LD0A 3U6VA 4TR1A 3VWUA 5G5FA 5ECNB 5KN3A 2CA8A 2X8GA 2LNTA 3LXTA 4WR5A 3ERWA 22GSA 3E0UA 5HR0A 1HNBA 3HYPA 2YP6A 3EC3A 3EU4A 2EC4A 1TDIA 2XPEA 5ELGA 2GQMA 2KP1A 4NWYA 1THXA 2EIQA 4ZBDA 1ERTA 1Z6NA 5A4WA 3M8NA 4GSSA 4KCAA 3WGDA 5DDLA 2DBCA 3DWVA 3GH9A 2R3XA 1SD9A 2IFQB 2IL3A 2C0GA 2VO4A 1S3CA 2B5YA 5KN1A 4N0ZA 4ZBAA 3LJRA 4LMVA 4WETA 2YJ7A 1H4OA 2V41A 5DBQA 2B7JA 5J9BA 1TRSA 4JR6A 1E2YA 2AHEA 5ABRA 4NV5A 2E2GA 2GSSA 1MD4A 4HZ2A 1B4QA 1O81A 2AAWA 3SWLA 2PPTA 5HR2A 3TJBA 2VCXA 5G5EA 3HVXA 3MSZA 3C7MA 3KP8A 4JEDA 1A0RP 5G1KA 3ZYWA 1V9WA 3DXBA 3WT2A 3MAKA 2J9HA 2B5XA 1MD3A 5ELAA 1EP8A 2VL3A 4ZILA 2YWMA 4ULXA 2WRTA 2I9HA 3AY8A 3RDWA 3HCZA 1GRXA 3V1WA 1R26A 1HNAA 1URMA 4JR4A 4ZB8A 3LSZA 3SBCA 2YN1A 1YKCA 2WJUA 2R37A 2YPMA 3BBYA 4IJ3A 1Z6MA 3MDKA 3M1GA 2AUVA 3ZITA 3CSIA 4TVEA 4DSSA 1XW6A 7GSSA 2H66A 3W8SA 2H74A 4ZL8A 2MBSA 1KTEA 4K9ZA 5IMAA 3NIVA 5FWGA 2ALBA 4KCEA 1ERVA 2JSYA 5ECIB 2HT9A 5CRHA 3FK8A 1M0UA 4HOJA 5DVBA 3TKRA 3GNJA 3D0ZA 3QAGA 1NM3A 5D9VA 1IYHA 4FH8A 4POLA 3KIJA 4O32A 1UVZA 4F03A 3N9JA 3KM6A 4KSMA 3VWVA 2FHEA 5DCHA 5IO0A 1YJ6A 3HA9A 2VD0A 2BJXA 2PERA 2MMAA 5ECSA 4D73A 3GTUA 4OCEA 3HHVA 2FA8A 1OC9A 3FZ4A 2L5OA 5IMZA 1B9XC 3E9JB 17GSA 3BJ5A 2P31A 4V2MA 3F63A 3MWHA 2M72A 2X8HA 3TJGA 1OC3A 3CXGA 4TR3A 2ZCTA 5ECRB 2H8LA 4K7NA 3IOSA 3QPMA 1YF0A 3GL3A 2IPAA 1T00A 1ERWA 2I4AA 4YQVA 1RQMA 5ECLB 3F6DA 1AAZA 2WB9A 1J9BA 1M9AA 3BD2A 1T4YA 5IMVA 1BJXA 2D2ZA 1GSFA 3PH9A 1DUGA 1PMTA 1SYRA 1SKSB 2O87A 2CVKA 3GIXA 2HZEB 3HZ8A 1ON4A 3HVVA 5DCGA 2N5AA 3KTLA 5JCUA 2DJ3A 4WR4A 2V32A 2B7KA 4QL7A 1SL0B 3UBKA 1MTCA 4K1FA 3L78A 3UJ1A 2OE3A 2P5QA 3L9SA 3DMLA 1F6MC 2F3MA 2ON7A 3WD6A 4HEA2 2GT5A 1PD21 4KE3A 3D5JA 3KH7A 4MH2A 4AGSA 4MZBA 4HZ4A 4K7IA 3TKQA 3IRAA 1T8EB 3DEXA 2RUFA 2R6KA 2REMA 4MJEA 11GSA 4AJ7A 3ZMKA 2E7PA 1A8YA 1I5GA 2LSTA 2E2MA 2H73A 1K0NA 2CQ9A 3N5OA 2X99A 3TB2A 2G2QA 5D9WA 5ECKB 4ZL7A 1R4WA 2DMLA 1QGVA 1W4VA 2GSRA 4NMUA 2C80A 4OCFA 4WXTA 2IJYA 2R2JA 3IAM2 2H30A 4K0NA 2WFCA 1IYIA 3D21A 5JCGA 1GTBA 1AC1A 3G7YA 4XTSA 1M2AA 3EMXA 2C1YA 3L9VA 5IO2A 1O6JA 1THOA 1T3BA 3C1SA 1CQHA 3IHQA 2CX3A 4ECBA 1BAYA 1XWAA 8GSSA 1RW1A 1ZGNA 3TKSC 3BCIA 2KHPA 4P3YB 4KB3A 1DE2A 1OE8A 1GUMA 1XVWA 5A5KA 1ZOFA 2H71A 1EGOA 1YQ1A 4L5OA 1R7HA 4ZL9A 3TJKA 1HYUA 2B1LA 1Z7PA 1EEMA 4YAPA 1K3YA 5HFGA 5J5NA 2FWGA 2H0HA 4L8EA 4Q5RA 4EDZA 1NHYA 3IXRA 4PX1A 4BVYA 2PVOC 3GMFA 3VURA 2PUKC 1LU4A 5ID2A 2VOCA 2AV4A 3O6TA 4KA0A 3LFLA 1K0AA 3HJOA 5COHA 1YEPA 1U88A 3TKPA 2KLXA 5H5SA 1EOGA 2PGTA 3TRQA 5CRGA 2CVDA 1USBA 1V2AA 3HJMA 3Q18A 5DALB 1GWCA 3GSSA 5DJMA 3VWXA 1Y6EA 2H0IA 1AUCA 1RK4A 1TOFA 4KDYA 4H86A 2GSTA 3FR3A 1QXHA 1GTAA 1TRUA 2LV3A 2GLRA 4LMWA 3TRXA 3L4NA 3GX0A 4BVXA 1SYXA 1XFLA 1DE1A 1A2LA 1U87A 6GSSA 4F9ZA 2YWIA 3DGQA 1TKDB 2A2RA 4GCIA 3DRNA 3KD0A 6GSWA 2B1KA 3DVXA 1O73A 4KNDA 2L4CA 4EXJA 4MF7A 5G30A 1HNCA 1K0DA 1YY7A 2L5LA 1K0CA 1U3IA 2VLUA 4QQ7A 1XPVA 2OKAA 2I3YA 5GAND 1A24A 4X0XA 4XS1A 2C0FA 2FLSA 5EY6A 4K7OA 2HRFA 4GRFA 4JE1A 1GUHA 1ZL9A 2FGXA 5CAXA 3UAPA 4F82A 2TIRA 2JZTA 3UEMA 3IPZA 3QAWA 3RAZA 1B8XA 2OBIA 2X64A 1Z9HA 5EL8A 3EVIA 3ZVJA 2VCZA 4MF5A 2LUSA 1AW9A 6GSYA 2GS3A 3LG6A 2HYXA 2B5EA 3IAS2 3GSTA 4PNFA 5E59A 12GSA 4X1UA 2VLVA 4LL4B 1GSSA 5EVOA 5DAKB 2YZUA 3A3TA 2GSQA 1JZRA 1K3LA 4PQHA 3F4TA 4ILFA 3DKSA 3RHBA 5LCZA 5L71A 2I81A 5JWQB 1S3AA 2F51A 3F4SA 3PINA 1SL2B 3ZMLA 2DC5A 4NV2A 4IW9A 5C04A 4TXOA 3Q6OA 1X9SB 2OBKA 2V2GA 1XOBA 2YCDA 2R4VA 2H1AA 3C73A 4IN0A 3GHAA 3KXOA 2KUCA 1O8WA 2KP2A 2XHFA 4HJMA 3K8NA 3IK7A 4ZIJA 2PVQA 3GURA 3ZL5A 1OE7A 4K6XA 5DQYA 5AGYA 1SK0A 2JADA 5CNWA 1EZKA 3G7JA 4F2IA 3FZAA 1ZZYA 2M46A 4BPYA 1T4ZA 3LGCA 4KDUA 4DEJA 3M9KA 2RM6A 1GLQA 3Q74A 4MJAA 4Q5NA 4MK3A 5IMDA 5ECPB 1OC8A 4KUNA 5CRWA 2AJQB 1VRSD 4POKA 2F9SA 6GSVA 2CZ3A 1FW1A 1PKZA 2LNSA 5B6NA 2QGVA 1BYEA 2LKUA 4O7HA 4IELA 2GGTA 1X5EA 2BMXA 2GZZA 1M2DA 3WYWA 1M2BA 5JCWA 1EV9A 3GL5A 3RPPA 1W89A 3EYTA 3VPQA 4GSTA 3TOTA 3D4MA 4EC0A 2MMZA 4MLYA 1G0TA 2H6XA 18GSA 5HFKA 3MNGA 1AQWA 3RBTA 3J7Yk 4X43A 3QR6A 3QAVA 3EWLA 1XW5A 2HSYA 3UVTA 4NXIA 3LYKA 1YZXA 2XBQA 1F3BA 4GSNA 2HLSA 3GX8A 2TRCP 1ACVA 3TJJA 2C3TA 2PBJA 4V1Ap 4XS6A 5KEJA 3ZLPA 2MYGA 2VM1A 4MJCA 2LJRA 4GF0A 5EPFA 4XIHA 4PNGA 4OMVA 1FAAA 4OO4A 2I1UA 3P8WA 1NSWA 3ZIVA 1K0BA 1VF1A 5KN2A 19GSA 4FYBA 1M7TA 5J41A 4XS4A 2Z9SA 5CP1A 2EIRA 2B6MA 1TRWA 4HU7A 4I2UA 3W6GA 2MZCA 2FWEA 5D9TA 3F9UA 4YAVA 3QFAC 3TOUA 4V1Ag 2FD3A 1DBYA 1AXDA 2JU5A 5IOWA 2OE1A 4BWQA 1GSEA 4ZXGA 5F05A 1KEBA 3QOUA 1SK2A 4IHUA 3IK9A 3ISOA 2OACA 4K2DA 1LJRA 3IC4A 3GN3A 3VLNA 4MPGA 3GYKA 4N0VA 5D8IA 4TRXA 4TR0A 3KTBA 3UIWA 2JZRA 3CBUA 1S3DA 3C71A 3GH6A 1XW9A 4XRAA 1B4PA 3VI5A 1SJ6A 1Z5YE 2LJAA 2YV9A 4PQ1A 3UOMA 2WGRA 3U5RE 1X9WB 4E8HA 3GKKA 4AJ8A 3EMPA 2XPDA 3QCPA 5HFIA 2C3NA 1FOVA 4KAEA 20GSA 2LQOA 1XOAA 2O7KA 4GWRA 3FRCA 1PA3A 4GXZA 2AYTA 4EO3A 4MJBA 14GSA 4IS0A 2R5GA 4QL9A 5DQSA 1H75A 4V2LA 3ZRDA 1OKDA 1M99A 4D73B 2IWTA 4OO5A 2VL9A 3GKNA 1OC9B 3QD9A 1R5PA 2VIMA 1UA5A 2ES7A 1ML6A 4XRDA 2PMTA 6GSXA 1FVJA 4CHSA 2VL2A 2V6OA 1J0FA 1G7EA 3UBLA 5D96A 2RUEA 2DMMA 2H76A 1JFUA 1OKTA 1PL2A 1WP0A 5B6MA 9GSSA 3H4KA 4NHWA 1EEJA 1XVQA 5IM9A 4YH2A 3F3QA 1XWKA 2FA4A 2IMEA 1TXXA 5DALA 3QMXA 4F0BA 1WPIA 3BOAA 4N10A 3WGXA 1CQGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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