The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
|
sequence length |
104
|
structure length |
104
|
Chain Sequence |
GAVDFAYLEGFAAGDFAVVDEVLALFREQAALWAPMLDPTHPGWKDAVHTVKGAARGVGAFNLGEVCERCEAGQESLEGVRTALDAALLDIAAYAHEQALRSLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Histidine phosphotransferase
|
| publication title |
Crystal structure of histidine phosphotransfer protein ShpA, an essential regulator of stalk biogenesis in Caulobacter crescentus.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Caulobacter crescentus
|
| molecule tags |
Transferase
|
| total genus |
44
|
| structure length |
104
|
| sequence length |
104
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.3.-: |
| pdb deposition date | 2007-01-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01627 | Hpt | Hpt domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | HPT domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KYI A; 4PAC A; 1C03 A; 2LD6 A; 1BDJ B; 1TQG A; 2LP4 A; 1SR2 A; 1Y6D A; 2LCH A; 3MYF A; 2R25 A; 1C02 A; 1YVI A; 3U3B A; 1WN0 A; 1A0B A; 2Q4F A; 1FR0 A; 1I5N A; 1QSP A; 1OXK A; 3IQT A; 2A0B A; 3KYJ A; 3US6 A; 4G78 A; 4EUK B; 1OXB A; 2OOC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2L7A A; 1LKX A; 2R7O A; 4NQF A; 4R32 A; 2KC3 A; 2YZS A; 3EG9 A; 4QI0 A; 2P6V A; 1SZI A; 2R02 A; 1TKN A; 3DZA A; 1LVK A; 1T9K A; 2LCH A; 3EQL F; 2J9U A; 5JSL A; 2AWY A; 1UFB A; 2YRF A; 1L7C A; 1ZW2 A; 3EG9 B; 2QNL A; 4G0H A; 5A6J A; 2VCA A; 3IQC A; 2RD9 A; 4ZLC A; 2J7P D; 3QZC A; 4EIY A; 2R7Q A; 3CAX A; 1R4T A; 3C8G D; 3K1I C; 4XEF A; 3NMI A; 3OA1 A; 5L0I A; 3KKB A; 4HFK B; 1DOV A; 4EBB A; 3W8I A; 2ZXP A; 3KYJ A; 3BEH A; 2OCC C; 3MYI A; 3NRH A; 2WVN A; 4OD4 A; 2XL8 A; 2LFD A; 4C3D A; 3FMS A; 2A69 F; 3EGD A; 4U9E A; 3B0U X; 3A9C A; 1YLM A; 3GOR A; 2R7W A; 3GM3 A; 1S7Z A; 3ITF A; 2NUT A; 4PJJ A; 4U9D A; 1ZZP A; 4WGZ A; 1VLS A; 2J7P A; 4XWJ A; 4H4K C; 2BL2 A; 1FMW A; 1O87 A; 2J9V A; 5BQG A; 4OIN F; 3QTH A; 5L3Q A; 3EGD B; 2LP4 A; 1B68 A; 3TJ6 A; 2YL1 A; 4MQ9 F; 2Q9B A; 4OD5 A; 2NUT B; 4CSA C; 1VK5 A; 3NYJ A; 2E87 A; 3X1O A; 2HJ3 A; 3NMK A; 5F5F A; 1Q0K A; 3ZDL A; 1YVI A; 4IAQ A; 1M2V A; 1CPQ A; 1PD0 A; 2HUJ A; 3Q7L A; 3RQG A; 5L0H A; 5JRA A; 4ER9 A; 4A2N B; 2KK1 A; 3NKD A; 4GYT A; 2GWW A; 4KNV A; 2Z15 A; 5FZT A; 3IQT A; 3T6G B; 1M2V B; 4YWQ A; 5E3C A; 2WZF A; 1JR8 A; 1PCX A; 3AQB A; 1RKE A; 2EPM X; 1NFO A; 5DVW A; 1LM3 B; 1NU7 D; 3DJN B; 3TJ5 A; 3GAN A; 4N6C A; 4EUK B; 1MNE A; 4HFF B; 2DB4 A; 2LIG A; 3RH3 A; 2CYD A; 3OWT A; 3LNR A; 4NTB A; 2JX0 A; 2YVK A; 1RKC A; 4BJ5 C; 4JW1 A; 3ZTZ A; 1SR2 A; 4DVZ A; 5B3I A; 3UGO A; 1BBH A; 1KU2 A; 1A7V A; 4XQ1 A; 2XRH A; 3G4Z A; 1FNT c; 3QW1 A; 1TFO B; 1HMD A; 2XS8 A; 3KL4 A; 1MMG A; 2EIK C; 4Z9H A; 2H8A A; 1JRA A; 3O55 A; 3UMH A; 5T3W A; 3W4Y A; 2LQG A; 1I5N A; 3JRT A; 3DM5 A; 2H7V C; 3H65 A; 3S29 A; 4JEA A; 1HW1 A; 2DYR C; 3R2P A; 4OIR F; 2A0B A; 4EKW A; 1M6T A; 2EIL C; 3C18 A; 3CQZ A; 2YL7 A; 4NTF A; 3MLG A; 2WVO A; 3AG3 C; 3RVY A; 2I8B A; 2R7X A; 4CDY A; 2IBF A; 1EKY A; 3K1I A; 2NSG A; 4I44 A; 4CIP A; 1J8M F; 3O10 A; 4NC3 A; 5KYN A; 1Q0F A; 3GEI A; 3CSK A; 2HZ8 A; 3GEH A; 1T5O A; 3ASN C; 1SMY F; 2XL4 A; 1LS1 A; 1VMA A; 4MVO A; 3W2V A; 4MS2 A; 3WOD F; 4G7Z F; 4U5H A; 4DJ9 A; 4FX5 A; 3NDB B; 1GGQ A; 1SF8 A; 2JPU A; 1FFT C; 2OJE D; 3DAG A; 3HLZ A; 4PJM A; 5JP7 A; 1EQ1 A; 1OCO C; 3OEO A; 1WTY A; 1OXK A; 2L6G A; 4XEV A; 1GQA A; 2EPK X; 3GM2 A; 3W2W A; 2VH3 A; 4JTD B; 4O6M A; 2R03 A; 3ZWI A; 5A6B D; 2J9B A; 3SYN A; 2HMZ A; 2IXN A; 3L8I A; 2JD3 A; 3EH2 A; 1D1B A; 2ICW G; 5AC4 A; 2Y3H A; 2TMV P; 1IW7 F; 3O6X A; 1Q0D A; 4JVS A; 1BDJ B; 1TQG A; 1TWH A; 2A1D D; 4E0H A; 2AU5 A; 2BC5 A; 4M63 A; 5COF A; 2L81 A; 3FAP B; 4PJN A; 3DJU B; 3IEE A; 2EPN A; 4JZA A; 2D5R B; 3M15 A; 1NFN A; 5HV9 A; 4IGG A; 3EH1 A; 3I4U A; 4IAO A; 3AG1 C; 1VOM A; 1ZU5 A; 3Q7G A; 4NCQ A; 4CBE A; 2FGY A; 2VB6 A; 4H54 A; 1ZHT A; 2YL3 A; 3H2U A; 1V4A A; 3L0I A; 4Q5S F; 3UMK A; 1DOW A; 3DD7 A; 5JLI A; 4CS9 C; 4IB4 A; 2YKZ A; 4IJJ A; 3T6B A; 1T6Q A; 1A7E A; 3ABK C; 3KH2 A; 1XZQ A; 2YLD A; 2J9W A; 2P61 A; 3EFO A; 3CEX A; 3M4C A; 4LLE A; 4K0D A; 1YAU O; 3ABM C; 3DMD A; 2W45 A; 1E84 A; 5DLJ A; 4AL1 A; 4W8K A; 4CDV A; 1OW6 A; 1LE4 A; 3B29 A; 1QLE C; 4WAB A; 4RD9 A; 1KTM A; 4U5E E; 3LS1 A; 4P9T A; 1YJG A; 4PFO A; 4JIO A; 3ZC4 A; 3HKK A; 3AG4 C; 4JTA B; 2XM4 A; 1ZYR F; 4PJL A; 3FXH A; 1OKK D; 2Y39 A; 2P1A A; 3RIP A; 3ZQY A; 2I15 A; 4DRJ B; 5BQI A; 4F4B A; 3ECS A; 1JPJ A; 1G8X A; 2KSF A; 4CS8 C; 4DRH B; 2GA0 A; 1A41 A; 3MFN A; 1D0Y A; 4W8P A; 1CGO A; 3NKE A; 2ASR A; 2QE9 A; 3M4B A; 1CGN A; 2YWA A; 4XTK A; 4Z9I A; 5AC5 A; 2QUP A; 3T6J A; 2HMQ A; 1W2W A; 3U2M A; 3U8V A; 3V7O A; 2GDC A; 4YT4 A; 3EZI A; 1FTS A; 3JZ0 A; 3K1H A; 4J7T A; 2IYL D; 4D4N A; 1BZ4 A; 3K7D A; 2J46 A; 4O79 A; 1QKR A; 1OKK A; 3C8G A; 4I1O B; 1ZVZ A; 4LLC A; 4YL0 A; 3DAF A; 3RYL A; 4BJ6 A; 1Z63 A; 1FMV A; 2F22 A; 2BE5 F; 1M2O A; 4JJG A; 3O39 A; 1ZHX A; 1BR2 A; 3N2Z B; 5B1B C; 4IAR A; 4X0R A; 3WAQ A; 3A11 A; 2IXP A; 2W4M A; 3C8G B; 3B0P A; 3MBG A; 4YL1 A; 2XXA A; 3GOD A; 4C3B A; 3RKO F; 4NY3 A; 1VYI A; 4YL3 A; 3L8J A; 4LER A; 4D4X A; 2XLH A; 2ZXR A; 1TFK B; 2A6E F; 4FES A; 4G78 A; 2D4U A; 1NSG B; 3IQ6 A; 3R7C A; 3US6 A; 2XXA B; 1FAP B; 1M56 C; 3TOM A; 3VAY A; 5B1A C; 4N6H A; 4OIP F; 3LEV A; 2EPO A; 1OR3 A; 3FHD A; 5L3V A; 2IXM A; 2G3K A; 3FOP A; 1RKE B; 1OCZ C; 4YT8 A; 3K6B A; 3M79 A; 1ORJ A; 2ZD9 A; 3TK0 A; 4ULV A; 4AL0 A; 5HSW A; 2R05 A; 1R5I D; 2B0J A; 3MYF A; 2OKU A; 1OR2 A; 4YJW A; 4HEA J; 3SP1 A; 1Z23 A; 1EA8 A; 3QMK A; 1OCR C; 1Q0G A; 2W9Y A; 1FR0 A; 1RJ9 A; 2IOQ A; 3UR3 C; 2ZXO A; 1YA7 O; 2HV7 A; 2LFF A; 4YK5 A; 2PP4 A; 4I1M A; 2FAP B; 1KNY A; 3DI5 A; 3T9O A; 4N4W A; 4BJ1 A; 5L0C A; 3I5P A; 1RCP A; 4GEH A; 4O6N A; 1ORY A; 2AP3 A; 1RJ9 B; 2OOC A; 4G7O F; 3X2Q C; 4FWV A; 1GS9 A; 1Z5Z A; 2CGE A; 3L1M A; 5EK0 A; 2XM0 A; 4MND A; 1CGM E; 2WL8 A; 3LLK A; 2OQM A; 1T6I A; 4WJ0 A; 3DM9 B; 3S28 A; 3AGT A; 2EPL X; 2NPU A; 2WZG A; 3AGU A; 3DE9 A; 5L0J A; 2H7O A; 4JE9 A; 4C3E A; 4UDV A; 1AEP A; 1OQC A; 1U0B B; 3EZH A; 2RSE B; 3I5Q A; 1FFH A; 3FOO A; 4LDR A; 4E7S A; 2IXO A; 2EIJ C; 3JYH A; 2R7U A; 2YQY A; 3GWN A; 1JPN A; 1HE1 A; 2YEV A; 3JTL O; 3S27 A; 4AE4 A; 2Q7R A; 5IY5 C; 1E83 A; 1JMW A; 4U5D E; 1I4Y A; 2YL0 A; 5L0F A; 1GM5 A; 3ZVR A; 3RVZ A; 3UMI A; 1LPE A; 2J45 A; 2P7V A; 1YYJ A; 4AK9 A; 3RF3 A; 4MTO A; 4U5F E; 4CSA A; 1EI7 A; 4AE4 B; 1D1A A; 2Q3T A; 1Q0M A; 2NG1 A; 2Y3G A; 4DBR A; 4FAP B; 1O5H A; 2GFH A; 1QVX A; 1QZX A; 1RXQ A; 1Y4C A; 3C8Z A; 4LDQ A; 2W4B A; 4KBL A; 3ZQV A; 3EGX A; 1WOL A; 2Q9A A; 1Z7Q c; 3VRC A; 2B0H A; 3S90 A; 1C03 A; 3HNL A; 3TUL A; 3F46 A; 2XSE A; 3UGP A; 2LD6 A; 2CDQ A; 2IM8 A; 5A6K A; 3S84 A; 2V3C C; 2HFI A; 3F47 A; 3G50 A; 5L0D A; 3QW0 A; 2ZXW C; 1K04 A; 4CIH A; 3EGX B; 3MX3 A; 5KYW A; 1U6H A; 3FVY A; 1AVO B; 1C02 A; 1D1C A; 4GQH A; 5A6B A; 1G4U S; 5DQT A; 2A68 F; 1ZHW A; 4J7Y A; 2QLA A; 3U9J A; 2KQ9 A; 3AJM A; 4BJ5 A; 1C17 M; 3CZ6 A; 5KYW B; 4EBJ A; 1NLX A; 1Z6A A; 2XS1 A; 4MW8 A; 1K05 A; 5JUA A; 3EPV A; 4U5G A; 2DYS C; 1YZA A; 3U0C A; 2R7S A; 4ULW A; 3Q6N A; 3NYM A; 2PX0 A; 4MVS A; 3POV A; 3V5Z A; 3KYI A; 2HSQ A; 3HNJ A; 3IQ5 A; 4ONS A; 5E33 A; 3BRJ A; 5E2Q A; 5JVE A; 2HKV A; 1T6U A; 1Y6D A; 1D0X A; 2Q9C A; 5B3S C; 4JRZ A; 1TR2 A; 4KC9 A; 4U5C E; 1ZHZ A; 5KYX A; 4QDL A; 3RW0 A; 5F5H A; 1VYK A; 1ZU4 A; 3LES A; 2J0W A; 3EFO B; 2VAS A; 5TJ5 E; 3HJC A; 1U89 A; 1HE9 A; 4PK4 A; 3WHN A; 1ZHY A; 2UUH A; 3SXZ A; 1NBB A; 3SZR A; 2Q4F A; 2R9R B; 3KMI A; 3NYL A; 4E18 A; 5KYX B; 3PMR A; 1NZE A; 3AG2 C; 1QSP A; 3C63 A; 3WG7 C; 4BEM J; 1F1M A; 2WB7 A; 4IWB A; 3DXJ F; 1OW8 A; 3LAY A; 2QY9 A; 1K40 A; 1JOG A; 2L9J A; 1YDI A; 4NTA A; 1H9G A; 3DKA A; 4BJT A; 3GM1 A; 1CPR A; 3HNI A; 1YA9 A; 4N06 A; 2WVQ A; 3JT1 A; 4O6Y A; 4G7H F; 4LAC B; 4OIO F; 1LI7 A; 4YT2 A; 1TWA A; 4QI2 A; 1PV3 A; 5K0I A; 1MMD A; 4CJG A; 2EIN C; 1OCC C; 3GEE A; 1NG1 A; 2LK4 A; 2CCY A; 3U8P A; 2YLI A; 3G4X A; 3HNK A; 1XWJ A; 3DWW A; 5A6A A; 3EJN A; 4CX9 A; 2Y69 C; 1OW7 A; 2PX3 A; 2DGJ A; 1LIH A; 3RQF A; 2KGO A; 3S9O A; 3U3F A; 4I3M A; 1APC A; 4XLN F; 4EWC A; 4BEJ A; 4DOZ A; 2VC9 A; 1J8Y F; 2MYS A; 4XEK A; 1HY5 A; 1MND A; 2Q00 A; 4XLP F; 3PHF 2; 2HSB A; 5KYY A; 1ZW3 A; 2CNW D; 3VF0 A; 2R7R A; 3TD7 A; 1E2X A; 3FAJ A; 3LEO A; 1RMV A; 1L3P A; 2M4E A; 2ZPA A; 3NMJ A; 3ZG1 A; 4XPW A; 5KYY B; 1VLT A; 2Y3B A; 4L6R A; 2XLM A; 2P0N A; 3J06 A; 1V74 B; 3PCV A; 2KW3 C; 3TOL A; 2YLG A; 4P9F A; 4EHP A; 2FFH A; 5F28 E; 4RBN A; 2VCC A; 2ETS A; 2LSE A; 4WGY A; 2CNW A; 2EIM C; 3SNH A; 4JC7 A; 1LE2 A; 4J30 B; 3U9M A; 4CS9 A; 1WWP A; 3K33 A; 3SEO A; 5JS5 A; 2M64 A; 1E85 A; 4XPY A; 3ZSU A; 4HE8 D; 4MW3 A; 1V55 C; 2AWC A; 3GWL A; 5E3A A; 1H7I A; 2KYH A; 4E7Z A; 5D91 A; 2PBE A; 4CDA A; 1TWC A; 2DI3 A; 1HMO A; 4CS7 A; 1YYX A; 3IHU A; 3LNM B; 1TWG A; 1Z3I X; 4E0I A; 5DQZ A; 3K66 A; 5AGF A; 4JJF A; 3C62 A; 4Q7C A; 1WAS A; 3AQC A; 4MTG A; 2PNO A; 2XLE A; 4P6I C; 4XPX A; 4A4A A; 4DRI B; 1ST6 A; 3HTK C; 4PR9 A; 3SXK A; 2OJQ A; 4DVY P; 2R7T A; 4IRU A; 2X51 A; 2KJG A; 4BG0 A; 5EHH A; 2HS5 A; 4JUR I; 4LDK A; 4ZLD A; 4JEB A; 2XL6 A; 5EGY A; 3ZTM A; 1PD1 A; 4CS8 A; 2WZL A; 2R25 A; 5FCL A; 3KPH A; 3ASO C; 1S05 A; 1WAT A; 1V54 C; 3LJB A; 1SYQ A; 2PFD A; 3QVY A; 3U3B A; 4JKV A; 3QVZ A; 1WN0 A; 3E9V A; 2PF4 E; 2XLD A; 4O7G A; 4C7O A; 4BPM A; 256B A; 5CIV A; 5COG A; 3PDM P; 3NG1 A; 1WGW A; 1H6G A; 1G5Z A; 2NUP A; 3U2L A; 2O9X A; 1H9T A; 4C7O B; 1OXB A; 3EHN A; 3VM6 A; 3N0T A; 4K7B A; 3M1C B; 2C04 A; 5CI8 A; 5A69 A; 2HV6 A; 4OIQ F; 1NU9 C; 3SXY A; 5BUO A; 1ORS C; 4PAC A; 1LI5 A; 2NUP B; 3T4R A; 2G3V A; 1G4W R; 2L6H A; 1BR4 A; 4KNW A; 4AX2 A; 2H7B A; 3JYY A; 3Q6M A; 3RFY A; 2NSF A; 5T3T A; 1MQV A; 3RQE A; 5T1D B; 1MMN A; 2XLW A; 4U5B E; 5BQH A; 2VCB A; 3EHM A; 5D92 A; 1N1C A; 1QQ3 A; 1YZC A; 5CI9 A; 4Q4Z F; 3B0V C; 3S0X A; 5L0G A; 2MWQ A; 1D0Z A; 3LUT B; 1A0B A; 1XZP A; 4K1O A; 3LS0 A; 5KYU A; 4B6I A; 2XLO A; 3H2V A; 3ATP A; 1VB5 A; 2R7V A; 3JRM O; 2UUI A; 1O3U A; 2OU6 A; 1JAF A; 4MVZ A; 4BJ6 C; 2YHS A; 1E86 A; 1T01 A; 4DBQ A; 2OEV A; 4JTC B; 5DS4 A; 2A6H F; 5KYU B; 5JT4 A; 4EBK A; 1IZM A; 4J32 B; 2A0U A; 3IPM O; 1I4Z A; 1M57 C; 4E17 A; 1VTM P; 4JCH A; 2OG2 A; 3TQO A; 1HW2 A; 4KI2 A; 2OEX A; 2GAQ A; 3B9Q A; 4MVM A; 1UG7 A; 5COM A; 1LS4 A; 2KNH A; 4PFP A; 3V5X A; 2AVK A; 3U5S A; 3W8H A; 4MVR A; 1QPU A; 4MVU A; 1BR1 A; 3UNG C; 3VYW A; 3FDQ A; 5DS6 A; 4ANJ A; 3JCU Q; 4Z9J A; 2X0C A; 3SXM A; 1AUE A; 3DE8 A; 2V26 A; 3AOU A; 4RDA A; 2XLV A; 3E70 C; 3ZIB A; 1MMA A; 3C7J A; 2G62 A; 4DXW A; 5GPG B; 2L6F A; 4YT5 A; 3ABL C; 4YN0 B; 4JCZ A; 2J8W A; 3N24 A; 4MTF A; 3JSZ A; 4MVQ A; 2C03 A; 3B71 A; 1A7D A; 2J0X A; 3V5Y A; 2Y3D A; 2MHR A; 5DS5 A; 2QTV A; 3LLI A; 3L34 A; 2HJM A; 1YAR O; 3JSE O; 2CW0 F; 4CJO A; #chains in the Genus database with same CATH homology 3KYI A; 4PAC A; 1C03 A; 2LD6 A; 1BDJ B; 1TQG A; 2LP4 A; 1SR2 A; 1Y6D A; 2LCH A; 3MYF A; 2R25 A; 1C02 A; 1YVI A; 3U3B A; 1WN0 A; 1A0B A; 2Q4F A; 1FR0 A; 1I5N A; 1QSP A; 1OXK A; 3IQT A; 2A0B A; 3KYJ A; 3US6 A; 4G78 A; 4EUK B; 1OXB A; 2OOC A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
