2OTZX

N-methylaniline in complex with t4 lysozyme l99a
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Predicting absolute ligand binding free energies to a simple model site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2otzX00
233LA 144LA 4GRVA 1ZURA 1G0QA 1LPYA 1LGXA 2B6ZA 234LA 3HH5A 155LA 1L05A 4ARQB 6LZMA 1C6IA 237LA 1CV0A 2OE7X 3OE6A 3FA0A 3DN0A 3K2RA 2RAYX 252LA 182LA 1L86A 1ZWNA 1L23A 3V2WA 3GUKA 3DN4A 4I7KA 1L49A 198LA 1CU3A 1L11A 115LA 1OVHA 1T97A 187LA 1LWGA 1L36A 1L91A 1PQDA 2Q9DA 3EMLA 1SX7A 1G0MA 1QUHA 4I7MA 1G06A 248LA 1JQUA 1QT3A 1L69A 1PQJA 1DYGA 1L0JA 1QT4A 3C7YA 1C6TA 230LA 239LA 1C6KA 1P46A 103LA 2OU8A 3HTFA 4ARMB 129LA 1SWYA 221LA 127LA 1L88A 3RUNA 2ANVA 1L40A 148LE 4PK0A 1L89A 172LA 4OO9A 1C67A 3DMXA 243LA 1L07A 176LA 1QS9A 4ARMA 4EPIA 2HULA 3NY8A 4EKPA 3OE8A 3HU8A 4W54A 1L47A 3DN2A 1D2YA 2Z6BA 183LA 4E97A 150LA 1CX6A 4I7SA 1QSQA 114LA 3DKEX 3RZEA 1XEPA 146LA 1C65A 4EPFA 1L44A 224LA 1PQMA 1L73A 123LA 1L68A 2HUMA 1LI3A 251LA 1L13A 2B72A 3JR6A 163LA 1L09A 3NY9A 3VW7A 241LA 1T8AA 104LA 1QUDA 256LA 1L57A 1CU5A 1C6QA 3HH3A 125LA 3HDEA 3OE9A 109LA 220LA 254LA 2ANXA 1L95A 3HH6A 4EKSA 226LA 3LZMA 2RB2X 1CU0A 3CDVA 3G3WA 216LA 2O79A 2B6WA 1C68A 2LZMA 1QT8A 1L77A 2F32A 3GUJA 2F47A 4IAPA 138LA 1QTZA 1L74A 3SB7A 170LA 1C6GA 1L76A 188LA 255LA 1L38A 1L59A 3GUPA 1CUPA 195LA 177LA 3F9LA 3SB8A 250LA 1G0PA 1KY1A 2B6XA 1P56A 2LCBA 3SB6A 1L45A 235LA 225LA 1CV6A 2O4WA 3HU9A 3ODUA 1L03A 113LA 157LA 258LA 180LA 107LA 1QSBA 4YXAC 1P2RA 1L15A 3HUQA 217LA 1L56A 1L67A 3C80A 110LA 3GUOA 1TLAA 209LA 201LA 167LA 3HT7A 4W57A 1PQOA 1NHBA 1L34A 4I7RA 1L52A 3HDFA 178LA 4W58A 4W55A 4PJZA 1L10A 2B73A 1G1VA 160LA 4ARQA 240LA 1L75A 1CU2A 236LA 2B6YA 1QTCA 4EXMA 1L02A 1C62A 1I6SA 1G07A 1KNIA 1LYIA 1D2WA 3DNAA 1L01A 1P64A 1L92A 1QUGA 2A4TA 238LA 3HTGA 3C8RA 253LA 1SX2A 118LA 1C6LA 1L51A 1C66A 1L31A 2B7XA 126LA 3SB5A 3SN6R 1L24A 1L00A 1L55A 1L12A 4AQNA 161LA 2RBNA 206LA 2B6TA 1C6EA 3CDOA 3L2XA 3FI5A 1DYAA 1L90A 1CTWA 3PDSA 4LZMA 1L58A 214LA 197LA 1QT7A 1L08A 2IGCA 1QT6A 2RB1X 1L99A 140LA 2F2QA 4EKQA 1C6HA 3C7ZA 112LA 1LW9A 1L54A 1SWZA 249LA 1L37A 262LA 2RBRA 4LDOA 2OTYX 2OU0X 1C60A 1C6BA 1L16A 3C82A 1L93A 1OV7A 1L72A 1DYCA 175LA 4ZPUA 4DKLA 1OWZA 1P3NA 1L32A 244LA 1L60A 4S0WA 185LA 1LYHA 1L14A 3CDQA 3HUAA 1QTVA 1L20A 1EPYA 2B75A 4I7NA 166LA 1JTMA 1L25A 2B74A 1P36A 1C6CA 3GULA 4ARJA 2Q9EA 4I7PA 3D4SA 1L41A 260LA 4ARPA 1L06A 1L21A 4K5YA 2CUUA 1L81A 158LA 1T6HA 3GUNA 4DJHA 1G0LA 139LA 1C69A 186LA 2HUKA 1L27A 2RB0X 1SSYA 1XJTA 257LA 1L97A 1G1WA 3DN1A 3HTDA 2RAZX 3HT6A 4I7OA 4W52A 1C64A 3CDRA 1OWYA 3QAKA 1LGWA 4EJ4A 1L43A 223LA 1PQKA 2O7AA 4EKRA 184LA 2RH1A 1L70A 5I14A 1L18A 247LA 215LA 1LYEA 4YX7C 1L61A 2RBPA 1LYDA 181LA 1C6NA 1D3NA 1LYJA 1G0GA 1CVKA 1QT5A 1T8GA 2OE4X 142LA 1T8FA 2B70A 231LA 1C6MA 1L62A 130LA 1CV5A 3DMZA 261LA 1D9WA 1DYFA 1JTNA 151LA 2OU9A 3C7WA 1L39A 152LA 4LDLA 3FADA 1DYDA 159LA 4GBRB 131LA 1L71A 1D3JA 1P5CA 1PQIA 190LA 1KW5A 1QTBA 205LA 3DMVA 2NTGA 141LA 1L50A 2QB0B 1G0JA 1L53A 147LA 1G0KA 1C63A 3CDTA 1CUQA 3V2YA 1L83A 1XJUA 1L85A 1L84A 4W53A 232LA 3PBLA 228LA 128LA 1P2LA 1B6IA 3SBBC 2RBOA 227LA 1L30A 1OVKA 3SBAA 3NYAA 108LA 3OE0A 4DAJA 1L66A 3HT8A 162LA 1C6PA 2RBQA 1LYGA 1QS5A 1C6AA 1L22A 1DYEA 4W59A 1OVJA 122LA 1D3FA 1LI2A 1C6FA 1L94A 1L65A 245LA 1L17A 119LA 1LI6A 111LA 189LA 1CV3A 1L29A 1L33A 3G3XA 173LA 3DN8A 3UONA 3HTBA 165LA 5LZMA 174LA 3GUMA 246LA 1KW7A 4W56A 219LA 191LA 1P7SA 2OEAX 4YXCA 200LA 3C83A 2QARC 3C8QA 164LA 1L28A 229LA 4I7TA 1P6YA 1D3MA 1L46A 3GUIA 1DYBA 1L96A 1QTHA 3HT9A 1LWKA 2OE9X 1L64A 4I7JA 3F8VA 143LA 1L26A 1L35A 210LA 169LA 1L82A 1L42A 4W51A 1WTHA 4I7QA 102LA 1OYUA 3HUKA 1QTDA 1SSWA 1L63A 2L78A 137LA 211LA 4ARLA 120LA 1P37A 1L79A 2LC9A 3DN3A 168LA 1L98A 1CU6A 1L87A 1L19A 2OTZX 213LA 222LA 1L04A 7LZMA 3C81A 1LGUA 3L64A 192LA 1C6JA 1C6DA 1L48A 3DN6A 4LDEA 1KY0A 1OV5A 1CV4A 1CX7A 212LA 1CV1A 199LA 1QUOA 1L0KA 3HWLA 3SB9A 1KS3A 1ZYTA 3G3VA 1L80A 218LA 4I7LA 242LA 196LA 2RBSA 145LA 259LA 2NTHA 171LA 149LA 1LYFA 1K28A 1C61A 1LLHA 3C8SA 3HH4A 156LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GCDA 1BVKC 132LA 1ZMYL 1LZ4A 1BVXA 6LYZA 3HH5A 3TXHA 3TXFA 3TXJA 3WVYA 4PHIA 6LZMA 1CJ8A 4BS7A 3RT5X 1LZGA 1LZDA 1IY4A 1CV0A 3ATOA 3DN0A 1GFTA 5LXWA 1ZWNA 1L23A 3WPJA 198LA 1GEVA 2MEGA 1PQDA 4DYGA 2Q9DA 4TUNA 3EMLA 1VEDA 1DKKA 1QUHA 248LA 1GF7A 1QT3A 1XEIA 1L69A 4WM6A 3ZEKA 1L0JA 3C7YA 230LA 4B4IA 3TXDA 1LHJA 1PS5A 3WW6A 2A7FA 127LA 3EXDA 2N5ZA 133LA 4OO9A 3DMXA 2I26L 1JSFA 243LA 2Z39A 1WQOA 1AM7A 2HULA 3NY8A 2PC2A 4W54A 5M1YA 1D2YA 2Z6BA 4HJYA 1QSQA 1C7PA 5KXMA 146LA 1L44A 1KIPC 1PQMA 1L73A 1ZV5L 251LA 1L13A 1LZNA 1IC5Y 4QGZA 5J7CA 2B72A 3JR6A 3J4GA 1G7MC 256LA 3HDEA 3J6KA 1LZBA 254LA 2ANXA 1L95A 1B2KA 3LZMA 4LYZA 2O79A 1DI5A 5DM9A 1HMKA 3A96A 1L77A 1VDTA 1JJ1A 4IAPA 2HU3A 1B5WA 1L74A 170LA 2ZIKA 188LA 1JISA 4LYBA 1I20A 1LJGA 1BB6A 5D5FA 5KXXA 4II8A 1YAMA 1KY1A 2B6XA 2LCBA 3SB6A 4H91A 4WL7A 3ODUA 1LHIA 1LSNA 4KL7A 1GB0A 1QSBA 1UC0A 1YAPA 1IWVA 1L15A 3HUQA 1L67A 1UIBA 201LA 2G4NA 2FYDA 1GB5A 5HMJA 5FHWA 1NHBA 1DPWA 3WULA 3AZ4A 1MLCE 4W96A 4PJZA 3TXKA 4H93A 1G1VA 160LA 4ARQA 1L75A 4H9CA 4H8YA 5C6JA 5KKJA 1LYIA 3DNAA 1AT6A 8LYZA 2A4TA 4B0DA 1OP9B 1L51A 1L31A 4R0FA 2WARA 1FLQA 2B7XA 6LYTA 3SB5A 3SN6R 1QIOA 1L55A 4AQNA 1VDPA 5LIOA 206LA 1DQJC 2B6TA 3CDOA 3AYQA 1DYAA 1CTWA 3PDSA 3TMUA 4KXIA 2MEDA 4G4HA 1JTOL 1UA6Y 1QT7A 1L08A 1NKHA 1L54A 1RFPA 1C6BA 1L16A 3C82A 3AB6A 1LMPA 4DC4A 1BWHA 1IR8A 4DQJA 1QTVA 1BB3A 1EPYA 1JTMA 3AGHA 4N1EI 5LVKA 4NWEA 3D4SA 4NGJA 4ARPA 4XN6A 1LZ1A 1G0LA 139LA 2LYOA 5DL9A 4OOOA 3LYMA 1XJTA 3F6ZA 3DN1A 3CSZA 4XJFA 2YSSC 3HT6A 5F9UA 3LYTA 1IWXA 4W52A 4LFXA 3HBDA 1LGWA 1OUEA 2NWDX 184LA 1QQYA 247LA 2F4GA 1QTEA 3LYOA 4J0LA 4TX7A 1XEKA 2RBPA 1YIKA 1LYZA 1QDTA 1LYSA 3TMXA 2OE4X 2RSCA 1G7JC 1GE3A 2B70A 2ZYCA 1GE4A 5ILFA 3CT0A 1JEFA 3HBHA 261LA 3CT1A 1DYFA 4Z3MA 1DYDA 131LA 190LA 1B5YA 3WVXA 3WL2A 205LA 4NGWA 141LA 2QB0B 4M4OA 147LA 1G0KA 1C63A 2IFFY 3CDTA 1CUQA 3V2YA 1XJUA 3PBLA 1CKCA 2LHMA 3WMKA 227LA 1LSAA 4OWBA 3TXIA 2I6ZA 1C6PA 1QS5A 1IP1A 1L22A 1DYEA 4O34A 1LSBA 1OVJA 122LA 1QDRA 1LI2A 1NBYC 5I4YA 1HFYA 1L65A 1GB2A 5FDJA 119LA 1IIZA 1LI6A 1JKBA 1CV3A 3TMWA 4H9HA 4I0CA 2HEBA 219LA 2CWIA 1LTMA 3C83A 1L28A 3N9AA 2MEBA 4I7TA 1D3MA 1L46A 1L96A 1QTHA 1YANA 3HT9A 2OE9X 4I7JA 143LA 4EMNA 1WTHA 1YQVY 2L78A 137LA 211LA 4HSFA 3EMSA 1DPXA 3WUNA 1YAQA 4XYYA 1QSWA 213LA 4HTKA 5DLAA 1KIQC 3FE0A 2DQIY 192LA 4WM1A 3B0IA 4WG1A 4YOPA 212LA 1GXXA 1P2CC 1L0KA 3HWLA 4NGYA 1C45A 1KS3A 4R6CA 218LA 1GDXA 5AMYA 2RBSA 4NEBA 1QUSA 1LYFA 4KT3A 2BLXA 3WUAA 1C61A 1LLHA 4RW1A 3P4ZA 1LSGA 144LA 1YKXX 1IP2A 4GCBA 4N9RA 2ZYPA 1LPYA 5KXKA 155LA 1B7MA 4ARQB 2YBMA 1C6IA 237LA 1DKJA 1F0WA 1HFZA 2EKSC 3W6CA 2OE7X 4UWVA 1B7QA 2XTHA 4WO6A 1I56A 1B5XA 3GUKA 4N5RA 4I7KA 1L49A 1QTKA 115LA 1T97A 1LHLA 1GBYA 1FN5A 187LA 1L36A 1L91A 1CKGA 3WPKA 1SX7A 1G06A 1JQUA 1HENA 1PQJA 1IP4A 1YKZX 1C6TA 5E9RA 2G4QA 1TDYA 4DD0A 4H8ZA 2BQHA 1P46A 1GFGA 4ARMB 1V7TA 1SWYA 2ANVA 154LA 1FLYA 4QY9A 1C67A 4B1AA 5KXPA 1IC7Y 176LA 1LZ9A 2MEHA 2Z12A 3OE8A 1HNLA 1HF4A 5F9XA 1I1ZA 183LA 4PPOA 2DBTA 2DQJY 3DKEX 1GB6A 4RW2A 123LA 1GAZA 3E3DA 1LI3A 3W6BA 5ILCA 2FBBA 4AXTA 1T8AA 104LA 1GE2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GCD A;  1BVK C;  132L A;  1ZMY L;  1LZ4 A;  1BVX A;  6LYZ A;  3HH5 A;  3TXH A;  3TXF A;  3TXJ A;  3WVY A;  4PHI A;  6LZM A;  1CJ8 A;  4BS7 A;  3RT5 X;  1LZG A;  1LZD A;  1IY4 A;  1CV0 A;  3ATO A;  3DN0 A;  1GFT A;  5LXW A;  1ZWN A;  1L23 A;  3WPJ A;  198L A;  1GEV A;  2MEG A;  1PQD A;  4DYG A;  2Q9D A;  4TUN A;  3EML A;  1VED A;  1DKK A;  1QUH A;  248L A;  1GF7 A;  1QT3 A;  1XEI A;  1L69 A;  4WM6 A;  3ZEK A;  1L0J A;  3C7Y A;  230L A;  4B4I A;  3TXD A;  1LHJ A;  1PS5 A;  3WW6 A;  2A7F A;  127L A;  3EXD A;  2N5Z A;  133L A;  4OO9 A;  3DMX A;  2I26 L;  1JSF A;  243L A;  2Z39 A;  1WQO A;  1AM7 A;  2HUL A;  3NY8 A;  2PC2 A;  4W54 A;  5M1Y A;  1D2Y A;  2Z6B A;  4HJY A;  1QSQ A;  1C7P A;  5KXM A;  146L A;  1L44 A;  1KIP C;  1PQM A;  1L73 A;  1ZV5 L;  251L A;  1L13 A;  1LZN A;  1IC5 Y;  4QGZ A;  5J7C A;  2B72 A;  3JR6 A;  3J4G A;  1G7M C;  256L A;  3HDE A;  3J6K A;  1LZB A;  254L A;  2ANX A;  1L95 A;  1B2K A;  3LZM A;  4LYZ A;  2O79 A;  1DI5 A;  5DM9 A;  1HMK A;  3A96 A;  1L77 A;  1VDT A;  1JJ1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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