2OTZX

N-methylaniline in complex with t4 lysozyme l99a
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Predicting absolute ligand binding free energies to a simple model site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2otzX00
148LE 1L87A 4DKLA 143LA 1L67A 195LA 1WTHA 1PQKA 1LYGA 4I7RA 1L55A 2B74A 127LA 1L94A 1CU2A 3LZMA 1P46A 245LA 1DYGA 184LA 1L25A 1C67A 2B6XA 3GUNA 4LDLA 173LA 1T97A 1CUPA 1L77A 161LA 142LA 209LA 4W52A 1C60A 206LA 107LA 4I7QA 1QT6A 4ARQB 1L65A 236LA 4EKSA 4EPFA 189LA 187LA 2B6WA 2B70A 1L29A 128LA 1KW7A 3NY9A 262LA 1D2YA 1C6CA 3DN6A 4W57A 1CU6A 4OO9A 1DYBA 3CDRA 4GBRB 144LA 1P5CA 2F32A 217LA 185LA 2B6YA 163LA 221LA 160LA 1PQOA 3C82A 252LA 1C66A 1L14A 5LZMA 188LA 1CU0A 1P2RA 4ARQA 4K5YA 3G3XA 1LI6A 2Q9DA 1L66A 138LA 239LA 3C8RA 257LA 3DN3A 1L68A 2HUKA 1I6SA 1B6IA 233LA 223LA 3JR6A 151LA 1LLHA 1CV4A 2F47A 1EPYA 4W59A 159LA 1L59A 1L48A 241LA 4W55A 3GUIA 1L33A 213LA 1CVKA 1G0JA 1L34A 1L93A 1D3MA 1SWZA 169LA 1L96A 1G1VA 3HDEA 251LA 180LA 3F9LA 1P56A 1G0GA 109LA 3PBLA 1G0MA 2B72A 4YXAC 4ARLA 2B7XA 171LA 1QTCA 139LA 4W51A 3V2WA 1G1WA 1PQIA 1ZYTA 255LA 3GUJA 1D9WA 1G07A 149LA 1D3FA 1L10A 230LA 3L2XA 192LA 4W56A 232LA 1L43A 112LA 1T6HA 1L75A 3L64A 1L91A 146LA 1L95A 1P37A 1LYHA 103LA 3GUKA 211LA 3OE6A 2OTYX 1JQUA 1KS3A 1C6LA 1L47A 4YX7C 186LA 175LA 198LA 1T8AA 1L44A 1G0QA 234LA 3UONA 3HH4A 155LA 1DYCA 110LA 1PQJA 1C6PA 1L62A 1LI2A 3DN1A 247LA 1XJTA 1DYAA 1QUGA 104LA 2OU0X 2B6ZA 2F2QA 2HUMA 1CTWA 1C6TA 2LZMA 1DYDA 156LA 3CDOA 102LA 214LA 2RH1A 3DN4A 3HH6A 4I7TA 1L90A 3C80A 1ZWNA 1QT5A 1P7SA 2QB0B 1LYIA 1L98A 1T8GA 1L0KA 4LZMA 1OVKA 1L40A 1QTBA 3HUKA 1L88A 2OEAX 1CV5A 4DAJA 1C6HA 4PK0A 242LA 123LA 1L84A 3C8SA 3HTGA 3V2YA 3HT8A 1L11A 1QUOA 2RB1X 1C6KA 3RUNA 235LA 174LA 4I7KA 4I7PA 1L79A 4EJ4A 3HT7A 1QS9A 3G3VA 1TLAA 3FI5A 113LA 2LCBA 114LA 1L76A 1QTDA 3C83A 1DYEA 3C7ZA 176LA 224LA 238LA 1L45A 1L08A 1L50A 212LA 3VW7A 2OE9X 3DMXA 1C6EA 191LA 183LA 2QARC 1QTVA 227LA 181LA 1L13A 197LA 1L38A 1L31A 1C6QA 3HH5A 3QAKA 166LA 4EKQA 165LA 3HT9A 1LGWA 150LA 1QUDA 1G0PA 1LPYA 244LA 1T8FA 152LA 2RAZX 1L12A 3CDQA 1L52A 1OWYA 147LA 1L19A 1C62A 1L26A 1LGUA 200LA 3C81A 2NTHA 1QTZA 246LA 2IGCA 1L73A 115LA 1L92A 1L49A 1XEPA 1L04A 1L05A 3SB5A 1L22A 3DNAA 3PDSA 1D3JA 1JTNA 3FA0A 3HUQA 2RBRA 1KW5A 3HTBA 1KY1A 3DMVA 1CU3A 182LA 260LA 108LA 1L28A 3G3WA 4EPIA 190LA 1C6JA 3RZEA 1L18A 3SBAA 4IAPA 1L81A 2RB0X 1L69A 3ODUA 140LA 4I7LA 1L51A 1OVJA 1DYFA 1C6GA 3DN8A 2OE7X 1KNIA 1QT7A 261LA 137LA 215LA 3F8VA 1L09A 1LWGA 3GUOA 1D2WA 1L39A 1G0LA 1L35A 1QTHA 1NHBA 1C6NA 4LDOA 1LW9A 4I7JA 2ANVA 2B6TA 1L85A 1QUHA 3DN0A 3FADA 178LA 1L57A 2Q9EA 3CDTA 1XJUA 3OE0A 1L70A 254LA 1P2LA 2OU8A 4ARPA 3HT6A 1C6BA 3SN6R 218LA 1L86A 1L60A 1L72A 1C68A 258LA 3C7YA 240LA 2RAYX 222LA 1KY0A 3OE8A 1L24A 3GUPA 120LA 1PQDA 1L74A 216LA 4LDEA 4I7SA 168LA 1C64A 1JTMA 1SWYA 2B73A 3NYAA 2RBOA 1L53A 3SB9A 5I14A 130LA 1OWZA 119LA 1QT4A 228LA 4EKRA 1C69A 1L80A 3D4SA 3SBBC 1L71A 2OU9A 1QSQA 2NTGA 3EMLA 3OE9A 4PJZA 1K28A 170LA 229LA 1L83A 1L15A 167LA 2O4WA 3HDFA 4DJHA 1LYDA 1ZURA 3GUMA 4W53A 1QT3A 2RBSA 1P3NA 1LI3A 3HU9A 1L42A 2Z6BA 220LA 1L99A 3NY8A 3SB8A 4I7NA 1L46A 1LYJA 1CU5A 1OV7A 164LA 1L23A 225LA 3DKEX 2L78A 199LA 1C6AA 118LA 1CX6A 3C7WA 1SX7A 2O7AA 256LA 4S0WA 4E97A 4ARMB 125LA 1P36A 129LA 1C65A 1CV1A 1L56A 253LA 231LA 3C8QA 7LZMA 1QSBA 3HWLA 1CV3A 1L07A 1D3NA 145LA 4EKPA 1L0JA 4ARJA 1LGXA 157LA 3CDVA 2RB2X 1QT8A 141LA 3HTFA 1L01A 4YXCA 1L61A 1L97A 1CV0A 2O79A 1C6IA 1L20A 1P64A 1L30A 1L32A 1LYFA 1OVHA 205LA 2RBQA 1L63A 158LA 4ARMA 1L06A 1L27A 226LA 3GULA 1G0KA 3HUAA 4I7OA 237LA 1L41A 1QS5A 2B75A 2OTZX 3DN2A 126LA 4AQNA 1CX7A 1L36A 201LA 2OE4X 4GRVA 249LA 1L89A 2RBNA 6LZMA 2CUUA 1L64A 3HH3A 3K2RA 1L21A 1L58A 3HU8A 177LA 1OYUA 3HTDA 4W54A 1C6FA 1SSWA 1SSYA 1SX2A 4I7MA 210LA 2RBPA 1L37A 259LA 1C63A 131LA 1L16A 1PQMA 1OV5A 1L17A 1LYEA 2HULA 4EXMA 1L82A 1L03A 3DMZA 1L02A 1CV6A 4ZPUA 1P6YA 1CUQA 1L54A 122LA 172LA 1C6MA 1L00A 162LA 111LA 1C61A 1C6DA 250LA 2ANXA 3SB6A 1G06A 219LA 243LA 2LC9A 4W58A 3SB7A 248LA 1LWKA 2A4TA 196LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L67A 3TXDA 3RU5A 2MECA 1WTHA 153LA 1PQKA 3TXIA 4DDBA 4N1EI 1HF4A 3GUNA 161LA 142LA 5DLAA 4J1AA 3B0IA 2ZYPA 4I7QA 3P66A 189LA 187LA 1HEQA 2B6WA 5LIOA 128LA 2BQMA 3A67Y 4Z46A 4W57A 5K7OA 5KXKA 144LA 1OP9B 3TXGA 1P5CA 1FLUA 3TMXA 1JITA 1PQOA 1IC4Y 1D6QA 3C82A 5B1FA 1C66A 1WQOA 188LA 4ARQA 1F6SA 1LSMA 2DQEY 4XJIA 4NGWA 4P2EA 2ZQ4A 1EQEA 1GF3A 1LJFA 1L68A 2VB1A 3QNGA 1B6IA 151LA 208LA 4N9RA 1G7LC 1LLHA 1IVMA 1LAAA 159LA 1L48A 1PS5A 2XBRA 4HPIA 1SWZA 4NSHA 169LA 3J6KA 251LA 1WQPA 1UCOA 1F10A 1NHEA 3V2WA 5FHWA 255LA 3GUJA 1D9WA 4HJYA 149LA 230LA 1D0KA 1LSZA 232LA 1LSYA 1IR9A 1YL0X 4MSTA 3L64A 1JKBA 1P37A 5I5QA 103LA 1I20A 1LZ6A 4TTDA 1UA6Y 5B1GA 1YIKA 2DQJY 4GN3A 4ETAA 2F2NA 1T8AA 3WYHA 3UONA 1HEWA 4LYMA 1DYCA 4C3WA 1KIRC 3B0KA 1LZTA 4PRQA 1GBWA 1YAMA 1NBZC 4ETEA 1LMTA 3B6LA 5F9UA 1LZ9A 2G4NA 214LA 4ETBA 4EOFA 1LTMA 1IP1A 3AJNA 2QB0B 3BKVA 1GEZA 1HFYA 1LYIA 5I53A 2LYMA 2BQKA 3WW6A 1QTBA 3WXTA 3AZ5A 1IP3A 1L84A 3C8SA 3HTGA 4NSGA 3HT8A 2HEEA 1QUOA 2RB1X 1IX0A 2YBNA 174LA 4WLXA 1NMMA 1BGIA 1D6PA 1C45A 1QS9A 1TLAA 3AZ7A 1XFPL 3A3QA 2LCBA 4L41A 1HEPA 3C83A 4B4IA 5KXWA 1L45A 4DD2A 212LA 4CHXA 3DMXA 4QY9A 181LA 3M3UA 197LA 1L38A 4WMGA 4ZFPA 1GDWA 4EKQA 165LA 150LA 1QUDA 5E9RA 132LA 2Q0MX 2W1LA 3P64A 3A34A 4H9CA 1NBYC 244LA 1T8FA 1LJNA 1HNLA 2HEAA 3CDQA 1T6VL 4DD7A 1OWYA 4OWBA 1L19A 1C62A 3W6CA 4KT3A 1LGUA 1XSFA 3C81A 4H91A 4WG7A 1OUHA 1L92A 1L49A 1UIAA 1TDYA 1JJ3A 1XEPA 1L04A 2BQJA 1L05A 4DDCA 4YEMA 1EL1A 3K3TA 5F14A 4HJZA 5A3ZA 1D0LA 1QTEA 4RW1A 5DN5A 1BB6A 2C8OA 4YF2A 4FJRA 4LYZA 1L18A 3SBAA 4IAPA 1GBXA 140LA 4N8ZA 2ZNWY 1Z55A 1OVJA 1B7SA 1RJCB 1QT7A 137LA 1L09A 1L39A 1QTHA 1TBYA 1C6NA 207LA 3EXDA 1GFAA 4I7JA 1TEWA 5LVIA 2ANVA 4TWSA 5L9JA 3W6DA 1YILA 178LA 4I8SA 4MR1A 1L57A 2DQAA 3LHMA 1JPOA 4XJBA 2OU8A 4ARPA 3HT6A 5KXYA 1IWWA 1L60A 5APFA 4LT1A 2RAYX 5D5CA 120LA 1B9OA 4LDEA 4I7SA 1G7IC 3NYAA 1SWYA 1ZMYL 2B73A 3EBAB 5I54A 2RBOA 4HJVA 1L53A 4HP0A 4EKRA 1C69A 4B49A 1L71A 4PJZA 1K28A 1L83A 4W53A 2YDGA 5HMVA 1BB7A 5B05A 1L42A 4GN5C 1L99A 4LGKA 3VWOA 1OV7A 1CU5A 164LA 4WOAA 5KXMA 1GDXA 1L23A 4XJGA 225LA 2L78A 1C6AA 2G4PA 193LA 3C7WA 1NDMC 4E97A 3WU7A 1B7MA 4Z3MA 4C5FA 3A8ZA 3C8QA 1D3NA 1RI8B 4H90A 5B59A 1LGXA 1LZEA 2RB2X 1HEOA 141LA 2LYZA 1YKXX 2WARA 1L61A 1XGUC 1C6IA 1LYFA 1OVHA 205LA 1L63A 158LA 3WPLA 1KXWA 1L27A 1MLCE 226LA 1LZCA 1L41A 2B75A 2OTZX 126LA 1JSFA 4LYCA 4XJHA 3WUMA 2RBNA 5DM9A 1B7NA 1L21A 5LYTA 3HU8A 1GXV2 1C6FA 3WVXA 1F6RA 2HULA 1LYEA 1L82A 1IY4A 4NGJA 1BVKC 1QDTA 3D3DA 3LYMA 3HFMY 1CUQA 2Z39A 122LA 162LA 2ZNXY 3TMWA 4IATA 1LSDA 2LC9A 4Z98A 1DKKA 1L87A 4TSBA 3B72A 4QEQA 1IIZA 1HMKA 1AZFA 1XEJA 4TUNA 2DQGY 2B74A 2DQHY 127LA 1P46A 245LA 2MEFA 184LA 4DWXA 1IOTA 1T97A 1A2YC 1CUPA 1L77A 209LA 4R6CA 1VDTA 1LHIA 4N5RA 3LN2A 4UWUA 1QT6A 4CFPA 1L65A 236LA 1IWZA 2B70A 1L29A 2DQDY 4NHSA 262LA 1D2YA 1RFPA 3DN6A 4OO9A 3CDRA 3WUNA 4GBRB 1QUTA 2IFFY 1B5VA 163LA 1IP6A 160LA 1HEMA 2ZQ3A 5FCPA 5IDDA 2YBIA 4DQ7A 1L14A 5KXNA 1UC0A 1CU0A 1P2RA 1LZGA 4UWNA 1OUFA 1LI6A 1IP7A 2Q9DA 2HEDA 5KKJA 138LA 1BB4A 257LA 3AGGG 3DN3A 2HUKA 1I6SA 2CWIA 4HV1A 1YKYX 223LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L67 A;  3TXD A;  3RU5 A;  2MEC A;  1WTH A;  153L A;  1PQK A;  3TXI A;  4DDB A;  4N1E I;  1HF4 A;  3GUN A;  161L A;  142L A;  5DLA A;  4J1A A;  3B0I A;  2ZYP A;  4I7Q A;  3P66 A;  189L A;  187L A;  1HEQ A;  2B6W A;  5LIO A;  128L A;  2BQM A;  3A67 Y;  4Z46 A;  4W57 A;  5K7O A;  5KXK A;  144L A;  1OP9 B;  3TXG A;  1P5C A;  1FLU A;  3TMX A;  1JIT A;  1PQO A;  1IC4 Y;  1D6Q A;  3C82 A;  5B1F A;  1C66 A;  1WQO A;  188L A;  4ARQ A;  1F6S A;  1LSM A;  2DQE Y;  4XJI A;  4NGW A;  4P2E A;  2ZQ4 A;  1EQE A;  1GF3 A;  1LJF A;  1L68 A;  2VB1 A;  3QNG A;  1B6I A;  151L A;  208L A;  4N9R A;  1G7L C;  1LLH A;  1IVM A;  1LAA A;  159L A;  1L48 A;  1PS5 A;  2XBR A;  4HPI A;  1SWZ A;  4NSH A;  169L A;  3J6K A;  251L A;  1WQP A;  1UCO A;  1F10 A;  1NHE A;  3V2W A;  5FHW A;  255L A;  3GUJ A;  1D9W A;  4HJY A;  149L A;  230L A;  1D0K A;  1LSZ A;  232L A;  1LSY A;  1IR9 A;  1YL0 X;  4MST A;  3L64 A;  1JKB A;  1P37 A;  5I5Q A;  103L A;  1I20 A;  1LZ6 A;  4TTD A;  1UA6 Y;  5B1G A;  1YIK A;  2DQJ Y;  4GN3 A;  4ETA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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