2OU9A

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant t115r1/r119a
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFCNSLAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2ou9A00
3HH3A 1LYDA 1SWZA 3HT7A 137LA 1QT6A 4W52A 1L03A 1CUQA 1JTMA 148LE 1P7SA 1L73A 3HH5A 1L68A 4LZMA 2HULA 1CV3A 1C6AA 1LWGA 1L28A 2B6WA 4DAJA 1L76A 1L37A 125LA 1P36A 4W51A 243LA 139LA 2B72A 1C6DA 122LA 2OE9X 1DYFA 171LA 201LA 189LA 1L0KA 188LA 1L85A 234LA 237LA 2RBRA 1QT8A 1P64A 1L34A 2RH1A 249LA 1G0JA 1JQUA 1DYDA 1SX7A 3HU8A 1OWZA 246LA 1L12A 3VW7A 178LA 175LA 1L54A 1L98A 3DN0A 2IGCA 1CUPA 1L65A 222LA 3DN6A 1L90A 2B6XA 1KNIA 1G0LA 1G0KA 3GUKA 3GUNA 4OO9A 1QT5A 3QAKA 1QS9A 2RB2X 1CVKA 216LA 3NY8A 3PBLA 198LA 3K2RA 102LA 110LA 1ZWNA 3DMVA 3DN4A 1KS3A 1L16A 1L71A 2O7AA 3JR6A 1C66A 140LA 1C68A 1I6SA 1L18A 4EJ4A 2B73A 3NY9A 4ARQB 1L60A 1PQDA 4W56A 3F9LA 1SWYA 218LA 1L62A 1L23A 1L35A 174LA 1C6QA 141LA 149LA 1LGXA 3OE6A 4ARQA 3PDSA 4PK0A 241LA 3FADA 1L21A 1L48A 4PJZA 1P5CA 1QUGA 1L94A 3C8SA 3CDQA 253LA 195LA 1CX6A 1L52A 1L63A 3C8RA 1L75A 3HDFA 1QTZA 4EKRA 1L84A 1ZYTA 245LA 1QTCA 3DN1A 3C7ZA 1L02A 147LA 229LA 3CDRA 1L92A 1L88A 1D3FA 1L57A 1C6EA 4I7MA 3RZEA 184LA 3D4SA 112LA 1L93A 3C80A 2B6YA 4AQNA 214LA 127LA 2B74A 131LA 1C6CA 1D3JA 1CX7A 150LA 1L17A 262LA 146LA 1L10A 2RB0X 138LA 2F2QA 228LA 1CTWA 2LC9A 191LA 1G0PA 1QUDA 3DMXA 1L87A 2ANXA 3G3WA 252LA 109LA 143LA 1L40A 3SBBC 2Z6BA 1L77A 2OU9A 1P2RA 1T8FA 3CDTA 3G3VA 220LA 1PQMA 1WTHA 3C7WA 227LA 186LA 1KW7A 1C67A 235LA 1P6YA 1L00A 169LA 2B70A 1C6MA 182LA 3SB5A 1L26A 3OE9A 1L97A 1CU0A 1JTNA 3DN2A 2NTHA 1D9WA 3SB6A 4E97A 3RUNA 4W58A 1L05A 4GBRB 3LZMA 1D2YA 1XJTA 224LA 1L82A 1C64A 3FA0A 1KW5A 2NTGA 4EPIA 4ARLA 3C7YA 3CDVA 196LA 7LZMA 1QT3A 3V2YA 1L09A 1G1WA 4I7LA 3NYAA 180LA 2CUUA 212LA 1C6KA 1K28A 183LA 1C6LA 1NHBA 111LA 1L24A 1L79A 166LA 255LA 3HU9A 219LA 2OE7X 1KY1A 1QUOA 2OEAX 261LA 2Q9DA 114LA 3L64A 167LA 176LA 2ANVA 1T8GA 168LA 1D3NA 142LA 1L74A 233LA 3HH6A 3HT9A 4LDOA 2HUMA 1CU3A 1CU2A 1L06A 1L91A 3GUPA 3ODUA 1QTDA 1L15A 4YX7C 130LA 4K5YA 4EKSA 1L07A 251LA 1DYEA 1C63A 236LA 123LA 4W59A 2F47A 1L99A 1QTHA 3CDOA 3SBAA 1PQJA 1KY0A 2LZMA 113LA 3SB7A 3C83A 3C81A 197LA 5I14A 2Q9EA 1L01A 3HDEA 119LA 4I7PA 3HUQA 3GUOA 162LA 225LA 1L14A 3DN8A 1OVKA 1L56A 3OE8A 104LA 1L86A 1L81A 3G3XA 4I7QA 4EXMA 1ZURA 4W54A 1P37A 3C8QA 1L70A 1C6BA 1L22A 4ARJA 145LA 1L49A 2F32A 223LA 2RAYX 1C69A 1C6NA 4I7JA 217LA 1C61A 3UONA 3HTDA 1L72A 1P46A 1D2WA 1P3NA 1OV7A 192LA 1LGWA 1C65A 4ARMB 210LA 4S0WA 1PQKA 4I7KA 1L44A 1LWKA 164LA 247LA 170LA 2RAZX 4LDEA 1QSBA 1OVJA 3GUMA 155LA 1L36A 1SSYA 3L2XA 1L55A 4ARMA 128LA 181LA 4I7OA 4YXAC 4DKLA 3HUAA 1L11A 1G0MA 1LYJA 3V2WA 2RBSA 3GULA 3DKEX 2O79A 2QB0B 4W55A 1PQOA 2RBNA 205LA 3EMLA 259LA 2B6ZA 254LA 1DYCA 126LA 221LA 240LA 3DN3A 4EKQA 4EKPA 258LA 1LPYA 1G06A 3HUKA 173LA 1QTBA 2OU0X 2RBQA 118LA 1L66A 1XEPA 2QARC 156LA 157LA 230LA 1L89A 1C62A 1LYHA 3F8VA 120LA 1L50A 213LA 5LZMA 211LA 1C6HA 1B6IA 2RB1X 2OU8A 1LYFA 3HWLA 1QSQA 226LA 1L0JA 1L51A 1LLHA 1L39A 3HTGA 206LA 1L13A 1L59A 177LA 172LA 1L80A 4LDLA 232LA 4W53A 1L45A 244LA 1CV1A 2B6TA 160LA 1D3MA 1QS5A 161LA 4I7RA 242LA 1C6GA 1C6IA 129LA 108LA 215LA 1P2LA 3SB9A 1CV4A 3DNAA 1L61A 1L64A 3HTBA 250LA 3GUJA 1L20A 209LA 1QTVA 1L08A 1C6FA 1L33A 2A4TA 115LA 1L29A 4DJHA 260LA 1CV5A 1L96A 3FI5A 151LA 1G1VA 3DMZA 1C6PA 1L53A 2OTZX 1T8AA 1LW9A 1DYAA 4IAPA 4GRVA 231LA 1OYUA 2B7XA 1L69A 1G07A 1L30A 1LI6A 1C60A 4EPFA 1OVHA 1L04A 1L47A 2B75A 3HH4A 1G0QA 1CV6A 1OV5A 238LA 163LA 1LYEA 248LA 1EPYA 2RBOA 1L67A 107LA 3OE0A 1L95A 185LA 1DYGA 3HTFA 4W57A 1L27A 2LCBA 1LI2A 1L38A 1SSWA 2HUKA 152LA 158LA 6LZMA 1G0GA 1L46A 2OE4X 3GUIA 3HT6A 4I7SA 144LA 3SN6R 1CU6A 1CV0A 1T6HA 1L32A 1L58A 3C82A 1L25A 1QT7A 1CU5A 1L83A 1LYGA 2L78A 4ZPUA 1C6JA 2OTYX 1SX2A 1LGUA 1QT4A 4I7NA 1PQIA 3SB8A 199LA 1LI3A 3HT8A 1L42A 1OWYA 4I7TA 4YXCA 1QUHA 1C6TA 1T97A 1L19A 1XJUA 200LA 2RBPA 2O4WA 239LA 1DYBA 187LA 1L41A 1TLAA 159LA 1P56A 190LA 1L31A 1L43A 257LA 1LYIA 103LA 4ARPA 256LA 165LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
137LA 1BB4A 1P7SA 2C8PA 2YBJA 1L68A 7LYZA 4IJ4A 1VFBC 1VEDA 3E3DA 1IOQA 4LYZA 4W51A 2I6ZA 139LA 2FBDA 122LA 2G4NA 3P4ZA 4NFVA 201LA 171LA 1L85A 234LA 188LA 1LZYA 1QT8A 1IP2A 1L34A 4WLDA 5DL9A 3N9AA 3HU8A 3WW5A 246LA 1VAUA 5L9JA 2IGCA 1CUPA 4C3WA 1OUJA 4XJGA 4AXTA 2AUBA 1LZSA 1GB7A 1KNIA 1UIEA 1JKAA 2Z19A 4XJIA 3AW7A 1IR7A 2F4AA 1LJ3A 2ZWBA 3A91A 3W6DA 6LYZA 5F16A 1QS9A 2RB2X 4IATA 3NY8A 198LA 1GEZA 102LA 110LA 1JJ1A 1CJ7A 1KS3A 5KXYA 2Q0MX 1REMA 1C66A 1I6SA 5LVKA 4EJ4A 2B73A 1PQDA 3AZ7A 5T3FA 1IP5A 1JIYA 1QUTA 1L35A 149LA 5I54A 2HU3A 2XTHA 4H93A 4ARQA 2CWIA 3FADA 1L48A 2BQMA 1IORA 4CFOA 2MEIA 1QUGA 1L94A 3C8SA 253LA 1KIQC 1RCMA 3RW8A 1CX6A 1OUIA 1JKCA 5B07A 4WM5A 4J1BA 5HQ1A 245LA 1QTCA 4BS7A 4Z46A 2LYZA 229LA 1L92A 2DKVA 4NGVA 5I5QA 5B05A 4G4HA 1UUZC 1NBZC 4NGKA 2B6YA 1GF5A 1DI5A 131LA 1BVKC 1CX7A 150LA 262LA 2RB0X 1L10A 1MLCE 3M18B 1GBZA 5IHGA 1TEWA 1BB5A 5I53A 1LSEA 2HEEA 3VWOA 2W1XA 191LA 1L87A 4TWSA 252LA 2Z6BA 2OU9A 1T8FA 1P2CC 3TMVA 3CDTA 3G3VA 3M3UA 220LA 1LJEA 227LA 235LA 2IFFY 1L00A 2B70A 3LN2A 3CQLA 4GCBA 3N9EA 4NGJA 1DPXA 3SB6A 2W1MA 4LT2A 2BQNA 4LYTA 1LYSA 1XJTA 1L82A 1C64A 4OWEA 5KXKA 3B6LA 4EPIA 4ARLA 3C7YA 1GAYA 3CDVA 153LA 1GB9A 2FBBA 1GBSA 3GXKA 1C10A 5APFA 2CUUA 1C6KA 4NSGA 111LA 1GFAA 3HU9A 219LA 4ETDA 1C43A 1WQMA 2OEAX 3L64A 1WQNA 3HT9A 3TXJA 3ODUA 1JTTL 1L06A 4TSCA 5APCA 4HJVA 1QTDA 1IP6A 4RW1A 2DQDY 3OK0A 1HC0A 1BWJA 1L07A 251LA 1DYEA 1JJ3A 1YAMA 5HLLA 1L99A 1LSAA 1QTHA 3CDOA 1JITA 1T6VL 2DBTA 1JPOA 4DT3A 1F10A 1XGUC 4XJBA 1C08C 119LA 1WQPA 4B49A 208LA 3DN8A 2HEAA 1L56A 3OE8A 1L86A 5B59A 154LA 4II8A 1ZURA 4W54A 4DD2A 4DD7A 145LA 1D6PA 1V7TA 223LA 1QTKA 2RAYX 4WM3A 2B5ZA 1C6NA 2ZQ4A 4I7JA 1VDPA 2D4JA 3AYQA 4LYBA 2BQDA 1LGWA 4HV1A 164LA 170LA 5ILFA 4LDEA 1L36A 4LYOA 2WARA 4ARMA 4YXAC 3HUAA 1BHZA 3V2WA 1GFVA 2F4GA 4W55A 205LA 2B6ZA 254LA 221LA 126LA 240LA 1LPYA 2HTXA 3LZTA 1I20A 4B4EA 1XEPA 1LZTA 2QARC 156LA 4NGWA 3B0IA 1YQVY 2FYDA 5LZMA 1HEQA 1SQ2L 5LA5A 2OU8A 5KXOA 1DXJA 1LSFA 1LLHA 1L39A 3HTGA 2IHLA 1L59A 3QY4A 1IOTA 244LA 1RE2A 2XBSA 4FJRA 5D5FA 5F9XA 1QTEA 4BAPA 242LA 108LA 4AGAA 1P2LA 3SB9A 1EQEA 3EO5A 3HTBA 250LA 1GF8A 1CJ9A 209LA 5FHWA 1YAOA 2RSCA 5E4PA 1NDGC 5I4YA 260LA 4QEQA 1LJFA 1HERA 3FI5A 1G1VA 4H9EA 1C6PA 1G7HC 1T8AA 1DYAA 4GRVA 2B7XA 1QUSA 1L69A 1G07A 3WPJA 2EKSC 1LI6A 1L04A 2VB1A 1B7NA 238LA 1GFRA 3A96A 2DQIY 3A93A 4Z98A 1GE4A 1L67A 1ZVHL 3P65A 185LA 1DYGA 3HTFA 4CJ2A 1L27A 2LCBA 1L38A 1XEJA 1GF0A 152LA 2EIZC 5LINA 1T6HA 4N1CC 1FKVA 1L25A 1QT7A 4DD1A 1LMAA 4ZPUA 4NSIA 4PRUA 1LSMA 1LZNA 4UWNA 1QT4A 4RW2A 2G4QA 2BQKA 1OWYA 1LZ6A 5APEA 1LSZA 1GFKA 1C6TA 4NHQA 3GXRA 1GE0A 4B4IA 239LA 3QNGA 1P56A 257LA 5B1FA 3BKVA 103LA 3BKHA 256LA 1F0WA 1GEVA 1DZBX 3HH3A 1JUGA 4LT3A 1HHLA 2HULA 1L76A 1B7LA 4MR1A 125LA 1P36A 4CFPA 243LA 4LYMA 1C6DA 2OE9X 1LZRA 1LZEA 1TCYA 1XGPC 1P64A 5L3IA 1JKDA 2RH1A 1G0JA 1YKXX 1LKSA 1KXWA 4B4JA 4NG8A 1B5UA 4H91A 175LA 1L54A 4NGZA 3RU5A 3DN6A 1NWGA 1L90A 4H9AA 1BB3A 1G0KA 5I4XA 3GUKA 4X3BA 4WG7A 1QT5A 3P64A 3QAKA 4G4CA 3K2RA 3DMVA 5KXSA 1L71A 1XGTC 1UIFA 4ZFPA 3NY9A 4ARQB 4A7DA 1YAPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 137L A;  1BB4 A;  1P7S A;  2C8P A;  2YBJ A;  1L68 A;  7LYZ A;  4IJ4 A;  1VFB C;  1VED A;  3E3D A;  1IOQ A;  4LYZ A;  4W51 A;  2I6Z A;  139L A;  2FBD A;  122L A;  2G4N A;  3P4Z A;  4NFV A;  201L A;  171L A;  1L85 A;  234L A;  188L A;  1LZY A;  1QT8 A;  1IP2 A;  1L34 A;  4WLD A;  5DL9 A;  3N9A A;  3HU8 A;  3WW5 A;  246L A;  1VAU A;  5L9J A;  2IGC A;  1CUP A;  4C3W A;  1OUJ A;  4XJG A;  4AXT A;  2AUB A;  1LZS A;  1GB7 A;  1KNI A;  1UIE A;  1JKA A;  2Z19 A;  4XJI A;  3AW7 A;  1IR7 A;  2F4A A;  1LJ3 A;  2ZWB A;  3A91 A;  3W6D A;  6LYZ A;  5F16 A;  1QS9 A;  2RB2 X;  4IAT A;  3NY8 A;  198L A;  1GEZ A;  102L A;  110L A;  1JJ1 A;  1CJ7 A;  1KS3 A;  5KXY A;  2Q0M X;  1REM A;  1C66 A;  1I6S A;  5LVK A;  4EJ4 A;  2B73 A;  1PQD A;  3AZ7 A;  5T3F A;  1IP5 A;  1JIY A;  1QUT A;  1L35 A;  149L A;  5I54 A;  2HU3 A;  2XTH A;  4H93 A;  4ARQ A;  2CWI A;  3FAD A;  1L48 A;  2BQM A;  1IOR A;  4CFO A;  2MEI A;  1QUG A;  1L94 A;  3C8S A;  253L A;  1KIQ C;  1RCM A;  3RW8 A;  1CX6 A;  1OUI A;  1JKC A;  5B07 A;  4WM5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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