2OWTA

Crystal structure of bordetella pertussis holo ferric binding protein with bound synergistic carbonate anion
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
319
structure length
315
Chain Sequence
SDEVSLYTTREPKLIQPLLDAFAKDSGIKVNTVFVKDGLLERVRAEGDKSPADVLMTVDIGNLIDLVNGGVTQKIQSQTLDSVVPANLRGAEGSWYALSLRDRVLYVEKDLKLDSFRYGDLADPKWKGKVCIRSGQHPYNTALVAAMIAHDGAEATEKWLRGVKANLARKAAGGDRDVARDILGGICDIGLANAYYVGHMKNAEPGTDARKWGDAIKVVRPTFAGGTHVNISGAAVAAHAPNKANAVKLLEYLVSEPAQTLYAQANYEYPVRAGVKLDAVVASFGPLKVDTLPVAEIAKYRKQASELVDKVGFDN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Anion-dependent hinge motion in ferric binding proteins
rcsb
source organism Bordetella pertussis tohama i
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Putative iron binding protein
total genus 107
structure length 315
sequence length 319
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2owtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2owtA02
1YTVA 4R9FA 4TQUQ 2DWAA 3CFXA 4U21A 3TYHA 1EZOA 4Q30B 1II5A 2RC8A 2P0SA 3KSXA 4RK9A 4NMYA 3D4GA 3T66A 1M5DA 4GL0A 1ZMGA 5I59A 1MPDA 4YB5A 3IX1A 4EQBA 4F2QA 2D3IA 5L9OA 5I59B 1A54A 4OTEA 4U1ZA 2QMXA 2X26A 4G68C 3KZGA 4Q5TA 1LFGA 4NE4A 4DLDA 5CBRA 3MVWA 5A5XA 4EXKA 2ABHA 3QK6A 3C31A 4F1UA 2XXQA 3TZAA 5HPQA 4JSDA 1USYE 4MLVA 3FJGA 3TTRA 2I0BA 1TXFA 1B05A 4ECFA 3FJ7A 1Q1KA 4TLMB 4YZZA 3QIMA 2DP8A 1LCFA 4ELOA 1QKBA 1DPEA 1H3DA 5AA2B 4PFUA 4ZS9A 5ICTA 1US5A 2I58A 2OCUA 2Y7PA 4RA1A 4F31B 5AE4A 2Z8DA 2H4IA 4OYVA 1IQ7A 3PPPA 2DVCA 5I2NA 3BBRA 3SERA 1NH7A 3VVEA 1Q35A 5H8NA 4EQ7A 3Q26A 1FTMA 1MG1A 3OO8A 3K02A 1N04A 1O63A 4WEDA 3FXQA 3ZKKA 1MDP1 1SYHA 1FTLA 2QPQA 2V93A 3A3UA 4MLQA 5H8SA 3G3JA 2NVUB 5L8DA 5JEIA 1MQJA 5TP9B 3C9HA 2F6GA 3CSBA 5CRYA 2Q2CA 4U2RA 5I2KA 1SDXA 1B5IA 2RC7A 2RCAA 3I3VA 4WKMA 3TDJA 3U92A 5EHMA 2V84A 1TFAA 3PMVA 1MQGA 4ZDMA 4GF8A 5L9MA 4ZEIA 5IAIA 1URGA 1H44A 3JYRA 4OERA 1SQYA 4KYDA 3ILTB 3HPIA 1B5HA 3C35A 3WAEA 3IO6A 1ZBMA 1LB9A 1EZPA 4NF4A 1LAFE 1ZJLA 1JETA 2QL3A 2FNCA 2Z23A 1DMBA 3CSGA 3OEMA 3OSQA 4HCYA 1B5JA 3S9EA 4R75A 3C36A 2V25A 4YKJA 3VFJA 4LZ7A 4X1BA 1EZ9A 3PD8A 4N07A 3U1OA 3UP9A 4YU0A 5TU0A 1JVYA 3IJXB 1FQAA 1MXXA 2ONSA 3FV2A 3K01A 3MUQA 3PMWA 3HCQA 3RT8A 3S9LC 5FTIA 4X48A 4GLIA 3TUSA 3H4ZA 4G8MA 2Z8FA 3PMXA 4LP2B 1TFDA 3CG1A 2XHDA 1SW5A 4H6DA 4PFWA 1RYXA 1N3XA 3B6WA 3D4CA 1T0KA 4GRKA 3FD3A 3SEYA 2O68A 4NF8B 4Z0IA 3FZVA 1R6ZA 4XKPA 1EU8A 3N6TA 3CRBA 1QUKA 2DS9A 5EYFA 4FAJA 3KOSA 1N76A 2H99A 3LBSA 3EPEA 3S9NC 2HEUA 2Y7WA 3MC2A 1XC1A 3C34A 4IO3A 4YB6A 3I5OA 4HW8A 1MS7A 2DQVA 1D4NA 3I6VA 1LB8A 3IB2A 4PFYA 3WAFA 4ZEDA 1IEJA 1XHYA 1LBBA 1JNFA 4DDDA 4POXA 4LONB 3TTLA 4POWA 4BDLA 4EF2A 3MZ9A 2O84X 2XXRA 2I0CA 1UTHB 4ZEKA 2FA7A 2Y84A 1MY3A 3IB1A 4M1VA 4DXBA 5KZTA 4OEUA 3UK4A 1POTA 1QKAA 4O3AA 1JEVA 3MZ1A 3M3FA 4GFRA 3S2VA 3H6WA 2ANJA 5DVFA 1B1XA 1PB9A 5KDTA 1BLFA 4C1TA 1J1NA 1OLCA 1FQEA 2VD2A 1PB7A 1EH3A 4FECA 4IB2A 4TLLB 5CM6A 5I2NB 3SKPA 1IUDA 3A3CA 2XD2A 3MAMA 1O64A 4N6PA 4ZECA 1I69A 1B1HA 1MQDA 3FVOA 4GWOA 3DM0A 1NNPA 1URDA 2ZYOA 3C32A 3CFLA 4JBZA 4U4XA 2H25A 5F1QA 3TAJA 3CIJA 3T96B 4G8HA 3T9HB 3IOVA 3KSJA 1Y4CA 1MXWA 4U22A 3VLUA 1QUIA 3P7IA 1QW0A 3PUVE 4P11A 3HV1A 4OFJA 1MXVA 1P1OA 5L9SA 3VXBA 3OO9A 2GHBA 3SEXA 3UIFA 4IGTA 4G68B 2UVJA 2XXIA 3CI8A 1NL5A 1UIVA 3E9XA 3G3FA 3MP8A 3OD7A 3OEKA 4G68A 4IGRA 4QFKA 1UTHA 4Q8RA 1FTKA 4H1XA 1B0LA 4JB7A 2IEEA 1Y4TA 2F7AA 3FV1A 1Y3PA 4KCDA 3FVKA 4IY6A 4YKIA 3GLBA 4DZ1A 4YAHX 3M3LA 3V8XB 2HAVA 2ESNA 4OETA 3ODBA 5AA4B 1IZ1A 1XVXA 2Y7KA 4NEDA 4N13A 4O3CA 2DE4A 1NH8A 2Y7IA 3Q28A 1DTGA 1B3LA 1ZU0A 3CR9A 4OWDA 3VXCA 3S9MC 3B6TA 3IL1B 5H8NB 3K4UA 4LZ8A 3FGSA 2F35A 2AL5A 3G3IA 4GL8A 1ELJA 3K00A 3MWBA 4H0WA 3V83A 5JTYB 4P0IA 5I56B 2QRYA 2AL4A 3PGFA 1MDQA 2V3UA 1A8FA 4BDMA 5BUUA 1H76A 3QUJA 4RY1A 1FQBA 4XKRA 5DT6A 1ZKBA 4R6HA 5H8FB 5FHNA 1QJMA 2I3WA 4FEBA 5A5XB 1S50A 2DWHA 3KN7A 3TCFA 4NF4B 3DP6A 4QSEA 2W7YA 2XX9A 3K2DA 3K6WA 3N6UA 5CBSA 3N26A 3SETA 1NKXA 2E0SA 1P1QA 4RXLA 2P2AA 1N3WA 2ONKE 1PC3A 4C1UA 4OVJA 4KCCA 2HZKA 3ZSFA 4H5FA 2ZXTA 3IJOB 5I58B 3W9VA 1B58A 4R2FA 2UVHA 1LLSA 3H6TA 3QSLA 5CMKA 1BKAA 3MP1A 3HN0A 1UTBB 2XXTA 2ZMBA 2WKYA 4ELPA 1P1NA 1LAXA 2QS3A 1B46A 4OZ9A 3CFZA 2DSFA 2F7BA 2OLBA 3G3HA 1OQHA 3O6IA 2O7UA 5TPAB 4OESA 3TQLA 3KN3A 1SBPA 5DEXB 4ELQA 5JTYA 2DWJA 2F97A 1WDNA 3ILUB 3OMBA 2Y7RA 3IR1A 4HTGA 1BIYA 1SVXB 3FUZA 4QFPA 3K1NA 3HSTA 2QS4A 2ZYMA 3H6VA 2A5TB 4I1DA 5AA2D 3UGWA 4AB6A 5J1DA 2I6EA 1CB6A 2LAOA 4OFLA 3BFUA 3FXRA 3G3GA 3O6GA 3PPOA 3RTFB 1UIUA 1SW4A 1BP5A 2B65A 2Z22A 4DXCA 4F39A 5KCJB 1HSEA 3O66A 3RY3A 1Y3NA 1Z7ME 1P99A 2I4CA 5CC2A 1YPNA 1DSNA 3EHUA 4KPTA 3TMGA 3TCGA 2D5WA 1WODA 1OVBA 5HBCA 4RNSA 4DE8A 3G7WA 2O7IA 4DXUA 5I58A 1SW2A 3IAZA 3EF7A 3JZJA 4FEDA 4BDRA 2BJJX 2ONRA 3MVZA 2ZNUA 1DOTA 2VGQA 3O9PA 1UQWA 4RYAA 4XTCQ 1KWHA 4F29A 1OQGA 1GGGA 2UYEA 5CMMA 4H65A 3SEWA 1MY2A 1JQFA 4JSOA 2RF1A 2CZLA 4NF8A 4AQ4A 5IKBA 4BDNA 4QSCA 2YJPA 1LGBC 5AA3A 2UVGA 5K2XA 1N84A 1P1UA 3LSXA 2VOZA 3CVGA 3RTWB 1AMFA 1B52A 3EHSA 3BKIB 1SI1A 3DP8A 1JW1A 3R6UA 4G4PA 5H8HB 3BFTA 3IB0A 3K1MA 3N5LA 1N7XA 5CMCA 3VVDA 1USYH 5DVJA 2UYFA 3QUFA 5I57A 4JWYA 1ZTYA 1JVXA 3MPKA 3VV5A 1B51A 4ZE9A 2Q8JA 2XXHA 4R73A 4ISUA 1L5TA 5AA2A 5ISUA 3RGYA 3VE1B 4NF6B 3O29A 1MM6A 4ZE8A 3R7XA 1B9JA 1B32A 3FJMA 4PP0A 5AA4A 2ZNTA 5CMBA 1S9TA 2KLFA 1Y1ZA 3IK6B 1US4A 3K6VA 4F2OA 5AA1A 5I84A 1MH4A 1MY1A 5EHSA 4ZZAA 5B7DA 5FTHA 2GFEA 3UN6A 1CE2A 3UA8A 4O3BA 3TODA 2ALUA 4EQ9A 3KN8A 2PT1A 2VHAA 4FATA 3LR1A 2PX1A 1PB8A 5TPAA 2HCAA 3ECRA 3EQ1A 2O69A 4PETA 1I6AA 3GBAA 3TPAA 3S4UA 3W9WA 3E4RA 1B4HA 3CG3A 4M4GA 4TOZA 4UACA 3DP4A 5FHMA 3K0VA 4GVOA 3B7DA 5JK4A 4RPOA 1FQFA 2DWIA 2ZYNA 1AH5A 2Q88A 4GD5A 1A7LA 2F8DA 1B6HA 4KFQA 2Z8EA 1VFEA 2A5SA 1FW0A 3KEIA 1AOVA 4THIA 4KHZE 2O6AA 3PPNA 3KG2A 4OEVA 3ZKLA 1OMPA 1AIVA 4OENA 1B3GA 3T9XB 5DYHA 3VLWA 4OQOA 4EUOA 4ND9A 2HFBA 1M5FA 3O97A 3ONMA 3O28A 1HSLA 2I49A 4QFLA 4KYSA 2RC9A 1M5EA 3FVNA 4YKPA 1HSJA 4HCWA 3TKDA 1IIWA 1LSTA 3HHGA 3TTNA 1O7TA 1SI0A 3FASA 2PYYA 2B3FA 2GRVA 1M5CA 1MPBA 1Y9UA 2HZLA 3KOTA 1OIBA 4H5GA 3W15C 1MXUA 2V3TA 2XXXA 2DE2A 3H7MA 2UXAA 3LSWA 2RCBA 5H8QB 3SEUA 1MXZA 3MP6A 5HM4B 1F9BA 3H6UA 4KD5A 2DXRA 1A8EA 4H8JA 2ZNSA 1B7HA 1LCTA 4I8CA 4PFTA 4R74A 4ZZEA 2DXYA 4MFIA 4RJZA 2NUVA 3T93B 1YAEA 2XXUA 2M8CA 2H9BA 3VDFA 4GIZA 1IXCA 4GQOA 4GXAA 4KR5A 3TQWA 4EF1A 3T22A 3OOAA 3Q27A 4R9GA 3L6GA 4G8NA 4XXUA 2PBWA 4BDQA 3EHTA 4JWOA 4QSDA 4R72A 2H98A 5BWJA 3LSLA 4QHQA 2I4BA 3TFLA 2Q89A 4NF6A 5F7VA 3TCHA 4ZEFA 1A40A 3SESA 3PPQA 1R9LA 2XX7A 1MQIA 3M8UA 4RPNA 1JW5A 4FE8A 2AYSA 1RKMA 1TWYA 2F6PA 2GHAA 2REGA 1PEBA 1JEUA 1Y20A 2THIA 1SYIA 3QYTA 3IOUA 1RYOA 5ICQA 2G93A 3TEPA 1M5BA 2CMOA 4YKKA 1URSA 2OK2A 1LAHE 1MM7A 2F34A 1JW4A 1GR2A 3E3KA 3PU5A 4K3FA 4KYEA 4DIGA 3B6QA 4FJPA 1ZIUA 2X7PA 3C33A 4NTLA 1IXGA 3DELB 4H8IA 1Y3QA 4I9DA 1ATGA 3KGCA 2A5TA 4XKNA 5ELVA 1D3KA 4BDOA 2ZYKA 4JDFA 3H3GA 3SEVA 2OJTA 5H8FA 2XXVA 3G3KA 4ELRA 2NXOA 3N94A 1LAGE 1LBCA 1MQHA 4OXVA 1TT1A 1LFHA 3LC8A 3TTMA 3LSFB 5KCJA 4OHNA 1FTJA 1VR5A 3KFMA 4QF9A 3U93A 4LUBA 1Y1MA 4E0WA 1B7UA 1R9QA 1I6QA 2OZZA 3RLFE 3SDFA 4F1YA 2X7QA 3TELA 1A55A 3O2AA 3RNNA 2O1MA 1GV8A 2F36A 1MRPA 4R6YA 1S7YA 4Q0CA 3OO6A 4X1DA 1B7ZA 3RPWA 2HAUA 2V3QA 2G29A 3OELA 4QRZA 1NNTA 4OFOA 2E1SA 4LQ5A 1N7WA 2NOOA 1MH3A 1NFTA 2R9JA 3O6HA 3OENA 4JXIA 1IXIA 3A09A 5TP9A 1B0HA 1B2HA 1NNFA 1PBQA 1SD3A 3MVXA 4E0XA 4OMBA 2B3BA 3Q25A 4F22A 3TTKA 2HXWA 2DYXA 5KDTB 4YMAA 1PBPA 2RKMA 5H8HA 3GXAA 3FVGA 3PUYE 4IY5A 4QFNA 4YICA 3V5AA 4ESWA 2DOJA 4EDPA 3OO7A 3IORA 3MJNA 3IO4A 2R6GE 1VFDA 1QVSA 2F5XA 3PUXE 1I6BA 4MH5A 4NWCA 1B3EA 4UA8A 1Z7NE 4X9TA 1QULA 3QAXA 3AXFA 4P0GA 1PDAA 1D9YA 3HO7A 4XKQA 3K6XA 1R1NA 2XXYA 1FQDA 5FHOA 3KJ7A 2REJA 1MXYA 1MY4A 3MQ9A 2DVZA 3PV0E 4U4SA 5DTBA 4ZEBA 1B4ZA 4YB7A 4HS7A 5DVIA 2XXPA 2O1LA 2QSXA 3T9UA 1UTBA 4QFOA 5CI5A 4F3BA 3FATA 3KJTA 2OWTA 4KI0E 3KBRA 1DTZA 1POY1 1XT8A 2GH9A 3IOWA 4U1OA 3EN3A 2H5YA 3H06B 4PQJA 2F7CA 3FIRA 4FORA 5K2YA 3THIA 5DEXA 1QUJA 5B70A 3PUWE 1AL3A 1IITA 1XS5A 3MW0A 1XVYA 5I56A 4JWXA 3F11A 3VLVA 4IO5A 2QMWA 3RUMA 2OWSA 4LA9A 2FYIA 2XD3A 4NF5A 2QS2A 4MBPA 3E13X 4YMBA 1NNKA 4H67A 4NF5B 3VVFA 4IO2A 4IO6A 2Q9TA 4AB5A 5M2VA 2I48A 3V89B 3FXUA 1WVJA 2OBGA 4RK2A 5I57B 4F3SA 2NWJA 4R6KA 1ZLQA 1H45A 3K1PA 5ITOA 3USDA 4F1VA 4F3GA 3C4MA 2PT2A 3L6HA 4LQ2A 1B40A 1D9VA 4GXSB 3JV9A 1MPCA 1MY0A 3T9VA 4C0RA 5LOMA 1BTJA 1FCKA 2YPNA 3K6UA 4DCYA 4F18A 3MPLA 4WXJA 1GVCA 4BLAA 1FTOA 4WEPA 5ITPA 4IO4A 2D21A 3ZS6A 1YCJA 1DPPA 1GTKA 2QS1A 3OXNA 3QXMA 3RT6B 3U72A 4PE5B 3PUZE 4ESXA 2Q2AA 3RQTA 4EXLA 2O51A 4MF3A 2XXWA 4R2BA 1VE4A 4F3PA 2VD3A 1IXHA 2AIXA 2P1SA 3PD9A 5H8QA 3MZBA 1OVTA 4G2ZA 4LZ5A 5I2KB 2QJEA 3U94A 3MBPA 3U8QA 3HHFA 3GZGA 2DE3A 3IOTA 1H43A 4F19A 2PVUA 1FQCA 3LUYA 3GBBA 3R26A 4GOTA 1LFIA 1B3FA 4KQPA 1P1WA 4LATA 4NWDA 3DLNA 3Q29A 2YLNA 1OLAA 4ONYA 2F78A 2RINA 4FIMA 3OSRA 1SW1A 4G77A 3PPRA 3MVYA 2R71A 2UVIA 3M3KA 1XOCA 2HQ0A 1N0TA 2PMSA 3H03A 1ANFA 4L17A 4U23A 4XIGQ 4Z7EA 1NMUA 2IA4A 1B3HA 1VSOA 4IO7A 1A99A 2XX8A 4LVQA 2I3VA 3RN8A 4DCXA 3UORA 4I62A 2VP1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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