2OWTA

Crystal structure of bordetella pertussis holo ferric binding protein with bound synergistic carbonate anion
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
319
structure length
315
Chain Sequence
b'SDEVSLYTTREPKLIQPLLDAFAKDSGIKVNTVFVKDGLLERVRAEGDKSPADVLMTVDIGNLIDLVNGGVTQKIQSQTLDSVVPANLRGAEGSWYALSLRDRVLYVEKDLKLDSFRYGDLADPKWKGKVCIRSGQHPYNTALVAAMIAHDGAEATEKWLRGVKANLARKAAGGDRDVARDILGGICDIGLANAYYVGHMKNAEPGTDARKWGDAIKVVRPTFAGGTHVNISGAAVAAHAPNKANAVKLLEYLVSEPAQTLYAQANYEYPVRAGVKLDAVVASFGPLKVDTLPVAEIAKYRKQASELVDKVGFDN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Anion-dependent hinge motion in ferric binding proteins
rcsb
molecule keywords Putative iron binding protein
source organism Bordetella pertussis tohama i
molecule tags Metal binding protein
total genus 107
structure length 315
sequence length 319
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2owtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2owtA02
3IX1A 3G7WA 1QKBA 1IUDA 3C33A 3KSXA 3KJTA 3N5LA 4IB2A 2ZYOA 3H3GA 5ITPA 4WXJA 3QUFA 2ZNTA 2V84A 4ZDMA 3T9HB 1Q1KA 1MM7A 2PYYA 1SD3A 4DCYA 2F36A 1AOVA 5HBCA 2VGQA 1ELJA 4R2FA 4G68C 5I84A 2CMOA 2O51A 1XC1A 4LQ5A 4QFKA 1MY0A 3MP8A 3DLNA 2B3FA 2Q88A 3PPOA 3CG1A 4UACA 4F3PA 3C35A 2UVJA 2PT2A 5FTHA 5H8HB 2Y84A 2V3UA 4R6HA 2XXPA 3VFJA 3MQ9A 3VXBA 3GLBA 3I3VA 4H0WA 4G8NA 3ZSFA 3PUWE 2VD3A 2XXUA 4G8HA 5A5XA 3OO6A 3G3JA 4DZ1A 1LBCA 3BBRA 5TP9A 4DXUA 3RPWA 3FV2A 2NVUB 1MXUA 5J1DA 4BLAA 2A5TB 2Y7KA 4NWCA 2HAVA 3MVXA 1B9JA 3MVYA 4I8CA 3K6WA 5EHMA 4OFOA 1JEVA 4P0IA 4MBPA 2I6EA 1B58A 3M3KA 2DXRA 2P1SA 1B0LA 3TPAA 2GFEA 5I2KB 1O7TA 4M1VA 3LBSA 1M5FA 3UIFA 3H6WA 4GL0A 2DXYA 4RNSA 3RUMA 2OJTA 1MDQA 4YZZA 2AYSA 2O7IA 3IOWA 3VLWA 3PMVA 4NE4A 3OXNA 1N76A 4OESA 3S4UA 4R6KA 4QHQA 3V8XB 3THIA 3U94A 1VSOA 5FTIA 1JW5A 3SEWA 3MVWA 3IOVA 5F1QA 3A09A 4POWA 1SYHA 2XXRA 4YB7A 1I6BA 1NKXA 3PMWA 4LP2B 4QF9A 1FQEA 4P0GA 3K6UA 4N6PA 5JEIA 4IO4A 1B3HA 2Y7WA 1PB8A 4EXLA 3MUQA 1B7ZA 1MPCA 4FATA 3N6TA 4QSCA 1GTKA 4R72A 2DWIA 2QPQA 3H6TA 1N84A 4F3SA 2H9BA 4UA8A 5FHOA 3BKIB 4Z0IA 4GLIA 2E0SA 1MXWA 3MP6A 3G3GA 4XKPA 3PPRA 2X26A 3PD9A 4G4PA 3IORA 4EF2A 3FIRA 2NOOA 4RPNA 4HW8A 4JWXA 2XX9A 4THIA 3RT6B 1B4HA 1MG1A 1EZ9A 4X9TA 2O1MA 3PU5A 2D3IA 1JVXA 4H1XA 4X1BA 2DOJA 2G29A 4PFYA 1FTJA 3MW0A 1PC3A 1J1NA 4FEBA 2VP1A 5FHNA 4RY1A 2IEEA 1NH7A 1SQYA 2XXHA 1MQGA 1XT8A 4YU0A 1B3GA 2ONRA 1M5EA 3C4MA 4EF1A 1POTA 1UTBA 3IJXB 3MBPA 1Y1ZA 3ILUB 3G3IA 5K2YA 4KYDA 3RY3A 5ITOA 3PMXA 1FTLA 4OMBA 4OERA 4O3AA 3OSQA 3TTNA 3W9WA 2V3QA 1WVJA 4LZ5A 3USDA 4ELPA 3SERA 3C9HA 4GD5A 1UIUA 4OEUA 3BFTA 5I59A 3TQLA 2UVHA 2Z8FA 4I1DA 3SEVA 4ECFA 1USYH 3MPLA 4GXSB 1P1QA 1AMFA 3HHGA 3DP6A 3KN8A 5KCJB 2DWAA 3HV1A 4WEPA 3FXQA 2ZYMA 1H44A 1PBQA 1OQGA 2F34A 3LSXA 5H8QA 4XKQA 4BDRA 5I59B 5AA3A 2Z22A 5ICTA 2Y7PA 5KZTA 1VFDA 3TKDA 1H45A 1H3DA 3S9NC 1GR2A 4ZZEA 3IJOB 2Z23A 4F39A 3MJNA 3I6VA 1OVBA 4C1UA 1S50A 3DELB 1LFHA 3OO8A 1LBBA 3HPIA 4QFLA 4U1ZA 2GRVA 2LAOA 5ICQA 2GH9A 3KGCA 2XXTA 1US5A 1USYE 1Y9UA 3RT8A 3IB0A 3TMGA 4F22A 2DE2A 5I56A 5AA4A 3KZGA 1VR5A 3O6GA 3S2VA 4Q0CA 5I2NB 4KR5A 3D4CA 3TCGA 3LSFB 3O97A 3VVFA 1F9BA 1SW1A 3Q26A 1OMPA 1O64A 3T9VA 2GHBA 2FNCA 1XVYA 2F7CA 1EZPA 1IXHA 3UORA 1JNFA 5I56B 5AA4B 1A40A 4XKNA 3U8QA 5CRYA 1BP5A 1MXVA 1NMUA 2Z8EA 3L6GA 1IQ7A 4OTEA 2O68A 2ALUA 4GQOA 3TTRA 3FGSA 2FA7A 5L9OA 4ZEBA 4F2OA 4Q8RA 5JK4A 4R73A 3M8UA 3VDFA 4FEDA 3JYRA 3U1OA 1IEJA 3CVGA 2IA4A 3FASA 1NNKA 3FXUA 1URDA 5IAIA 4TLMB 1EH3A 3N6UA 2I58A 2DQVA 1Y4TA 5AA1A 2ZMBA 2PMSA 4R9GA 2OZZA 4KPTA 3K0VA 3KG2A 3EHUA 3O66A 5CI5A 1I69A 1S9TA 4U2RA 4N13A 4BDLA 2F35A 1ZIUA 4M4GA 1MY2A 1MPBA 4YMAA 2REGA 1Y20A 3MP1A 4Z7EA 3KFMA 1PB7A 2ESNA 2YLNA 4GVOA 4F3GA 1N7XA 1B4ZA 4E0XA 2DWJA 5BUUA 2M8CA 1RKMA 4KYSA 3PUZE 3ILTB 3FJ7A 4F18A 1RYOA 4ZEDA 4ZE9A 1DOTA 3GBBA 3ZS6A 2XXIA 5H8HA 1MM6A 1ZLQA 3I5OA 4TOZA 5BWJA 3DP4A 2R6GE 3CI8A 4R2BA 2Z8DA 2AL4A 1I6QA 4XKRA 4F3BA 4LA9A 4DLDA 2NUVA 3T93B 2VOZA 2RCAA 1HSLA 2OWSA 2P2AA 3WAFA 1SW5A 5EHSA 3S9MC 1WDNA 4IGTA 1ANFA 1B3LA 1FTOA 2O69A 2XHDA 4U21A 2A5TA 4DXCA 2H5YA 3UGWA 3SEYA 4DIGA 4C1TA 1NNTA 4JB7A 3E9XA 2ZNSA 4NTLA 3Q27A 1A54A 1XVXA 3B6WA 3CFXA 3IOUA 3KN7A 5I2KA 3CR9A 1O63A 3QUJA 4YMBA 3OEMA 4OZ9A 1FCKA 2DVZA 5ELVA 3GZGA 4MF3A 4LUBA 4LONB 5IKBA 3SESA 2O7UA 4ZS9A 3T9UA 5HM4B 4R9FA 1NH8A 3TTLA 2R71A 4L17A 1DSNA 3VVDA 4F29A 5F7VA 3A3CA 5AA2D 2R9JA 5DYHA 1US4A 4C0RA 4DE8A 1Z7ME 3PGFA 4TLLB 2YJPA 4RPOA 1DPEA 2HEUA 1OVTA 3QYTA 3H03A 2B3BA 2OWTA 1Y1MA 5TPAA 1T0KA 1LAFE 2ONKE 3PD8A 3PUYE 3VVEA 4NWDA 1QKAA 1YTVA 3K00A 3S9LC 3K6VA 4YB5A 4YKKA 1GV8A 3SDFA 2RC7A 5DVIA 3IR1A 3G3KA 2F5XA 4KYEA 3O28A 3T22A 5ISUA 1MH4A 3R26A 2UVGA 1YCJA 2WKYA 5TPAB 1D9VA 2XXWA 1POY1 1XS5A 1JW1A 4IY6A 3T66A 1D9YA 2DS9A 4FORA 1B51A 4DXBA 3GBAA 1R6ZA 5JTYB 4MH5A 3V83A 1IZ1A 1LFGA 4N07A 4QSDA 3H6UA 1YAEA 3JZJA 1R1NA 1LCTA 4QFOA 3ODBA 1D3KA 3K1MA 4FE8A 4R74A 1UIVA 1BTJA 4WEDA 4RK2A 4F19A 4GL8A 3Q28A 2XXXA 1H76A 1R9QA 1M5CA 1ZTYA 1EU8A 3V89B 4U1OA 1B3EA 4XIGQ 1MY1A 2OLBA 4FAJA 3EPEA 3O29A 1SI0A 2F7BA 4F1VA 3A3UA 2QMXA 3FVNA 4EDPA 1LAXA 4HCYA 3KN3A 3EHTA 2DE4A 3KJ7A 1UTHA 2ZXTA 4F31B 4YKIA 1GGGA 3TUSA 1B1XA 3CRBA 1IIWA 1ZMGA 4G77A 1MY3A 4KQPA 3UP9A 2ANJA 3M3LA 2F78A 2DE3A 1XHYA 2VHAA 2XXQA 2HZLA 1MQJA 4PE5B 1MXZA 3PUVE 2UVIA 1N3XA 3TFLA 2VD2A 2HCAA 5EYFA 4ELRA 3TODA 1TFDA 2OBGA 3FVOA 5KCJA 1UTHB 3U93A 3PPPA 2OK2A 3HN0A 2Q2AA 2HAUA 1MPDA 3CFLA 3IB2A 5DTBA 4NF5A 4U4SA 3FJMA 2X7PA 3ONMA 4RXLA 4G2ZA 1HSJA 2RKMA 2ZYNA 2BJJX 3MPKA 1B52A 3TELA 3LR1A 4P11A 1SVXB 3ZKLA 1P1OA 5H8NB 1QUKA 1H43A 4JWYA 4IO2A 5FHMA 3OEKA 1PB9A 1N3WA 4ZEIA 4NF5B 3OO7A 2I48A 4MLVA 2DSFA 4JSOA 5I2NA 4PFWA 1B46A 1FQFA 2QMWA 1MQDA 3R6UA 2PBWA 4YICA 1IITA 4GRKA 1Q35A 3S9EA 3SETA 5CM6A 4KCDA 1A99A 3AXFA 2DP8A 4ZEFA 4YKJA 3TTKA 3L6HA 1A7LA 4H65A 5DVFA 3MWBA 1B3FA 2THIA 3K1NA 4H67A 3QK6A 4IO7A 4U23A 4GIZA 3FATA 4MLQA 3RQTA 5AA2A 1VE4A 4MFIA 1TT1A 1XOCA 1SI1A 4ZZAA 3FZVA 4OWDA 1Y3NA 3H7MA 2QS2A 4RJZA 1Y3QA 4OETA 3IAZA 1B6HA 4JBZA 1NNFA 1ZU0A 4GXAA 5M2VA 1LAGE 3ECRA 5I58B 4PQJA 2F6GA 4IO6A 1SW4A 3O6HA 5AA2B 4G68B 3W9VA 3CSBA 4HTGA 3QAXA 2ONSA 5L8DA 3MZ1A 3DP8A 3MZBA 2D21A 5DEXA 4JSDA 3B7DA 4ZECA 3LSWA 4NMYA 4ZE8A 1M5BA 1OLCA 3CG3A 4AB5A 3RTWB 4ELOA 3MAMA 4POXA 5KDTB 5CC2A 5L9SA 2I0BA 5CBSA 1L5TA 4Q5TA 4NF8B 2I49A 3FVGA 4Q30B 4EXKA 3K2DA 4H5GA 5DEXB 2F6PA 2HQ0A 5DT6A 2XD3A 1GVCA 3OSRA 2GHAA 1PDAA 4NF4A 4HCWA 4LVQA 4JWOA 1QULA 2H99A 3TYHA 2D5WA 3OELA 4FJPA 1FW0A 1VFEA 4RK9A 4EQ7A 2G93A 4R6YA 4H5FA 4R75A 4NF4B 2UXAA 3PPNA 4XTCQ 2XXVA 2I3VA 1N7WA 2V3TA 1IXIA 1B7HA 1FQBA 1CB6A 2QRYA 1OIBA 3DM0A 3UA8A 2ZYKA 2PVUA 4KI0E 2A5SA 5I57A 1B1HA 1KWHA 3U72A 1A8EA 4IY5A 5B70A 3TDJA 3ZKKA 4RYAA 3K01A 1FQCA 1B5IA 1JETA 2O6AA 1M5DA 1D4NA 2DYXA 3KBRA 4DDDA 4LZ7A 3B6TA 2YPNA 4K3FA 1II5A 2HXWA 4GF8A 3O9PA 4IO5A 1MS7A 1DTZA 4F2QA 5I57B 4OEVA 3W15C 1Z7NE 5DVJA 4YKPA 2DWHA 4KHZE 3VLVA 2XD2A 3IO4A 3PV0E 4X1DA 5HPQA 2O1LA 3TZAA 3QSLA 1LAHE 3QXMA 1R9LA 2REJA 1LGBC 2QJEA 3KSJA 1B5JA 3CSGA 4PP0A 2UYFA 3K1PA 2I3WA 4G8MA 4BDQA 4U4XA 3G3FA 1I6AA 4GFRA 3LC8A 5CMCA 3TQWA 3VXCA 4ELQA 3QIMA 4DCXA 4XXUA 1SDXA 1MXXA 1P1UA 3IL1B 1AIVA 4BDNA 1FTKA 4JXIA 1A8FA 3PPQA 1WODA 3K4UA 1Y3PA 5A5XB 2QS4A 5TP9B 4O3BA 4H8JA 1QUJA 3EHSA 4KCCA 2O84X 5CMKA 1QUIA 2FYIA 3D4GA 4BDOA 1HSEA 4OFLA 4E0WA 2AIXA 1ATGA 1QVSA 3V5AA 1ZBMA 3TCHA 3UK4A 1B5HA 4X48A 5JTYA 3TCFA 5CMMA 3M3FA 3FXRA 2X7QA 1IXGA 3F11A 2F97A 2ABHA 3IK6B 1OQHA 3CFZA 3CIJA 3EN3A 1FQDA 3SEUA 1FQAA 4QFNA 3OMBA 1TWYA 1B40A 1TFAA 3H4ZA 2P0SA 5B7DA 5CBRA 4QFPA 4YB6A 4ESXA 4I62A 4I9DA 4NF6A 1DTGA 4PETA 3KEIA 2RF1A 4PFUA 2I4BA 4EUOA 1MDP1 3LSLA 1JQFA 3TAJA 3HHFA 3C31A 3MVZA 1LFIA 3KOSA 3T9XB 2Y7IA 3T96B 1P1WA 2F8DA 1URGA 4OQOA 4FIMA 3GXAA 1B05A 2QS1A 1BKAA 2QL3A 3OD7A 3MC2A 3FJGA 4NF6B 3RGYA 4U22A 1MQIA 1EZOA 4KFQA 3RTFB 1P1NA 1LCFA 3Q29A 2W7YA 3VLUA 2ZNUA 4PFTA 3E4RA 2V93A 5AE4A 1LSTA 4ND9A 1NFTA 3OENA 2QSXA 4EQBA 4ZEKA 3IB1A 1YPNA 3RN8A 1DMBA 2DVCA 2RCBA 2Q9TA 1ZKBA 1MY4A 1JVYA 2NXOA 2RC9A 1P99A 3BFUA 3O6IA 2Y7RA 1N04A 1JEUA 4H6DA 1URSA 5K2XA 2HFBA 2XX7A 3OOAA 3KOTA 1A55A 3LUYA 3C34A 3JV9A 5H8NA 4YAHX 3C32A 4OYVA 2RINA 2H98A 4ESWA 2AL5A 1LB8A 4AQ4A 1MRPA 4FECA 3PUXE 1UQWA 1LB9A 2Q2CA 1ZJLA 2NWJA 1IXCA 3O2AA 3B6QA 1UTBB 1SBPA 4ONYA 1PBPA 3MZ9A 4GOTA 5TU0A 4QSEA 2UYEA 1B32A 3E3KA 2RC8A 1B0HA 1NL5A 1MXYA 3E13X 2B65A 3FUZA 4O3CA 2I4CA 1FTMA 3RNNA 1S7YA 5H8SA 3EQ1A 4OXVA 3OO9A 1B2HA 3FV1A 3Q25A 3U92A 2PT1A 4OFJA 3WAEA 3SKPA 1AH5A 3SEXA 3VV5A 5I58A 2V25A 4OVJA 1SYIA 3HSTA 3H06B 4G68A 1B7UA 2E1SA 3P7IA 3K6XA 4H8IA 4JDFA 1Y4CA 4RA1A 5H8QB 4LATA 1SW2A 2OCUA 1TXFA 3TEPA 1JW4A 1RYXA 1DPPA 3N26A 4BDMA 3VE1B 2QS3A 3RLFE 2XXYA 3IOTA 5KDTA 1NNPA 4AB6A 1QW0A 1N0TA 3N94A 3HO7A 3HCQA 4NF8A 5L9MA 4LZ8A 2HZKA 1OLAA 4NEDA 3IO6A 3K02A 2H4IA 3FD3A 4F1UA 2KLFA 1QJMA 3R7XA 2XX8A 4LQ2A 4OENA 1LLSA 4IO3A 2PX1A 1AL3A 2CZLA 4TQUQ 1CE2A 1MQHA 4KD5A 1MH3A 4HS7A 5H8FA 2Q8JA 3G3HA 3C36A 4GWOA 3UN6A 4EQ9A 3EF7A 4QRZA 1PEBA 2I0CA 4OHNA 2H25A 4F1YA 5CMBA 3H6VA 1BLFA 2Q89A 3FVKA 4IGRA 2F7AA 4ISUA 5LOMA 3TTMA 4WKMA 1BIYA 5H8FB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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