2OX1A

Archaeal dehydroquinase
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
MKLVATLSSPEELELAEKADVVELRIDLFDFSGARVDKEKILTCRRVSDGGKFEGDERERIEKMKRAFDSLNPDYVDLESDLPDSAFDFNCRIIESYHNFIRTPDYSELKGIVEGRRGDLVKIATMGKSKRDVETIVRILTNYDDVVAFLMGERFSFTRVLAAYLGSPFIYCYVGSPKAPGQISLDDAREIISRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Archaeoglobus fulgidus
publication title Structure and lability of archaeal dehydroquinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
total genus 62
structure length 196
sequence length 196
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2007-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ox1A00
3W1NA 1VHCA 4NVTA 4LRTA 3GR7A 3L21A 5DXXA 4MIMA 2FPYA 2ZRUA 3W72A 3IGXA 2WQPA 2C13A 3A23A 3M41A 3SFKA 3UWUA 4WJEA 1S3HA 3NPVA 2ZRZA 4MY9A 5I3IA 5AYZA 3STCA 3QPYA 1ZJIA 5KZDA 4NJHA 5CSSA 1OF8A 2QCFA 1B57A 4RZ5A 2WKJA 1PHQA 4CQ9A 4MJZA 4ZZ9A 4JTHA 2GQAA 2PCQA 3U8GA 3F03K 4QQ3A 5TQLA 1EP2A 2WJZA 3WFAA 1KM2A 4RKAA 3NPWA 5D2WA 4U28A 1PIIA 1Q6OA 2CZEA 5LSMA 4YXGA 4IMCA 3L5LA 4I7WA 3QEZA 3QSTA 5K2ZA 5AC6A 3GKFA 3TSDA 4PTNA 3EEGA 5EYWA 3TIMA 1ME9A 1G4TA 2A7PA 1NVMA 3KRUA 3GK0A 2G97A 2DU2A 3G22A 4R7JA 1NF0A 1TO3A 1DORA 4ZQMA 1QDSA 1QR7A 5KTLA 3UPWA 2ZZ6A 4ICNA 1AMKA 4RZ6A 2HS8A 4O16A 3GAYA 3B03A 5F4WA 1QO5A 2H3DA 3W76A 1DQXA 3FJ6A 3M5VA 4ZQRA 1LCOA 3NQVA 2QUTA 5FF4A 4Y96A 2FJKA 1DVJA 2HTMA 3KVJA 4I9AA 4A21A 1K3UA 1B4EA 4K6AA 2Q8ZA 1A5SA 2Y61A 5DBUA 2O7SA 3IVSA 2QCDB 4Z1CA 1TRDA 4IJBA 5G4EA 3THAA 4DPQA 2RDUA 1K02A 4M7TA 4K8HA 5EPDA 2E5CA 3O6YX 3NYZA 1YYAA 3L0KA 3A5VA 1LRTA 3LERA 1TPFA 4XUGA 1IF2A 1VHNA 3I65A 3O15A 1N7KA 3M43A 1RR2A 2B7NA 3KRSA 3R13A 1NSJA 3MP3A 4A22A 1T99A 4NNBA 1F73A 3HGOA 4O57A 3C2FA 4AB4A 4H3DA 2QCDA 3I7QA 4DPPA 1V5XA 3KAOA 4UFJA 5BW6A 4LTSA 2BLEA 2DZSA 2X1RA 3ABSA 2NV1A 2VFDA 3WK3A 3USBA 3TQ0A 3TSBA 3BARA 1H1YA 2D73A 4K8EA 2QCEA 4NJGA 1XCFA 3DZ1A 4NNAA 1M5WA 3IIPA 2W6RA 1VC4A 4XTIA 3W1QA 1RQBA 4LY8A 4MFDA 5EBUA 5DCDA 3LLFA 1GTHA 3W7MA 1VLWA 1KFBA 2ISVA 1R2SA 2RH9A 3OVPA 2E6DA 5L6UA 4O19A 1GOXA 4QSHA 1KV5A 3PBUA 2VEMA 3CWNA 3EX4A 3NM3A 4AH7A 3HMJG 3NNTA 2ZQ0A 2C14A 3M44A 4A3UA 3W7JA 4JY8A 1T96A 1YTDA 2X1TA 1D9EA 4YMZA 1TTQA 1OFQA 3PM6A 3M5XA 1TSIA 1OFRA 4DEFA 4OGZA 2RDTA 3HPZA 1W3IA 2A85A 4FIQA 1W3NA 3WJSA 1N55A 5CPOA 3CWOX 3PBWA 5FEZA 4FB7A 1S5TA 3QZEA 3TAKA 3JS3A 3PAJA 2UV8G 4J9JA 3W2UA 1H7XA 4LC6A 4GUGA 4LV4A 5D2TA 5KZEA 4NJKA 3RFAA 4KFNA 4Y6GA 3UZ5A 4ADTA 3M6YA 5BRBA 1EPXA 1OK4A 5FEWA 1H7OA 3QJAA 1XDMA 1UJPA 4UMAA 3BW3A 2ZRXA 4Z0JA 4K7YA 1YPFA 1FX6A 1SZGA 3PB0A 1J2WA 1IXPA 1H7RA 3M16A 1ZAHA 2W0UA 3C0JA 3PWAA 3W7QA 3IVUA 2CWNA 2DJXA 4IXHA 1OX6A 3B05A 3W7IA 3BW2A 1WYIA 5E1QA 5K9DA 2ZZ1A 2GQ8A 5LZLA 5HMSA 4HNVA 2Q3OA 3FKKA 1SO6A 3G1HA 1L6YA 2Y62A 3R12A 3CEPA 4BWLA 5DY3A 3W9ZA 1QOPA 1Z44A 4UTJA 3PY2A 2WNNA 3E49A 5KSWA 5MHBA 5H91A 3DI1A 3LHZA 4HNNA 5AHEA 5DLCA 2EF9A 3SI9A 3S1UA 3NL6A 3TUUA 4LVBA 1ZHAA 1MEIA 3LHVA 2Y85A 4H4IA 1LBFA 1EWDA 3E12A 3MJYA 1DQWA 1KFLA 2E77A 3U2OA 2NV2A 3S0CA 3INPA 3NG3A 4KFOA 1SZFA 1BEUA 4CCEA 2A6LA 3TJXA 2VC6A 4CLMA 2OCZA 4A2RA 3NM1A 2DZPA 2HSAA 4AXKA 3C2VA 3BK0A 3MW7A 3G1AA 2R14A 1NEYA 2G96A 3MP5A 3EXRA 5FF3A 3W88A 3SGZA 5AOUA 4PODA 3AO0A 2DZWA 1I45A 3EX2A 3FYPA 1O94A 3H53A 3UPBA 1X1OA 2ZZ7A 1FCVA 3NA8A 5K9XA 3FIGA 4C1LA 4HIBA 3S42A 1OYCA 3EKZA 3L5AA 1KM1A 3HG2A 5D2VA 1OVDA 3LI0A 1QPOA 4O15A 1FWNA 3L67A 3QMSA 4WUIA 2EAWA 3BLIA 3FFSA 3NO5A 4QITA 3B0VC 1SU5A 1SO4A 4O8RA 3B8DA 2BX7A 3TE9A 4XKYB 2Z6IA 5BMWA 3U6WA 3PG8A 2NXHA 3GYEA 4ADSA 4JS3A 4FEZA 1R47A 1DBTA 1MEWA 3GIYA 2HS6A 2PURA 2WO5A 2YYTA 4XBSA 1HTIA 4O50A 1OJXA 3C2RA 3SR7A 3TROA 1OFOA 2B0MA 2A7NA 4L4LA 1CI1A 1OABA 2XN1A 3Q94A 3W7DA 1F74A 3UD6A 1JQXA 3W7PA 3HG4A 3PUEA 4RXGA 1Q6RA 2YXGA 1LLZA 3N9SA 1O4UA 2NX3A 4XKYA 4LWWA 1ZFJA 1Q45A 5FI8A 1IXNA 5U7SA 5SWUA 3IGUA 4JEQA 3S9YA 3I68A 3N34A 4M5PA 4O17A 5DY2A 3WK0A 1VQTA 2CLKA 1KM0A 5LHEA 1DJNA 1UB3A 2E5DA 4UNKA 1M6JA 1G4EA 2QCNA 3OVRA 2AGKA 1GG0A 3ELFA 1RQHA 2A1YA 2VFHA 1W5MA 1JCMP 4Y8FA 4FNTA 5K4XA 1LBLA 3GX9A 4O52A 1KTCA 1TV8A 1FWSA 3H54A 4KWWA 4UFKA 4UFLA 3L2IA 4UFIA 1VH7A 5D03A 3T78A 4S2BA 2WPBA 4PFMA 3LTPA 3NDOA 2PRLA 3IIXA 4UTMA 2TMDA 3HQ1A 4M19A 4E2DA 3TR2A 2B7PA 1FWRA 1OF6A 2CLMA 1M7PA 1D3HA 2PE4A 2VENA 3QH2A 3L66A 3TU9A 1QWGA 2OZ0A 3P82A 1WV2A 3C6CA 1UCWA 1R46A 4G1KA 5GVJA 7TIMA 1GJPA 4O13A 1KA9F 1XDLA 3HG5A 2ZRVA 2NXIA 3N19B 4HNTA 3NQGA 4RJEA 3FLUA 4HKPA 3TCEA 2EKCA 4JD4A 5FEPA 3TQKA 1T8XA 5LGXA 2X30A 5DCEA 3ABRA 4GUIA 1XBXA 4ML9A 4UFMA 1B4KA 4FNUA 3OIXA 1AG1O 1JRCA 3HGRA 3W87A 4MKNA 2VEIA 5D05A 4Z0SA 2A5HA 2QKFA 3UWWA 2FTPA 1I2NA 1MO0A 4MZ8A 2VFGA 3LV5A 1GEQA 2A21A 1ZENA 2CLIA 4IGHA 4MUZA 3Q2DA 2DP3A 2ISSA 4XWUA 2Q3RA 1WBJA 3TV8A 1W37A 3KRZA 3BGGA 4LVAA 3LRKA 3L0NA 4O18A 3V1PA 4GNJA 3MI6A 2F7FA 4AMAA 3FS2A 3PSVA 1VPXA 2DZXA 2GPTA 3LXAA 2TSYA 3GB6A 4X3ZA 1QNVA 1BWKA 2GQ9A 1XBVA 1JRBA 3W1LA 3JR2A 1S5VA 1H7PA 5D02A 3G18A 3I7RA 1H7NA 3NQAA 1MZHA 3BO9A 1BKSA 2ZZ4A 1O5XA 4IPIA 3LXBA 3PSWA 3LTYA 5D09A 3W7CA 1PE1A 3QMTA 1B3OA 4WXYA 3QYQA 1OYBA 4JGDA 5LNUA 1GVRA 4UR7A 2QCHA 3Q58A 3NR0A 3LCWA 3WK1A 1KBJA 4UIOA 1LP6A 3HGSA 1JVNA 1Z41A 2X1SA 2QCCA 3EWZA 2E09A 3PR2A 2OT1A 3W86A 1BWLA 3L68A 2NX9A 1VLIA 3NQ6A 3B0UX 3LTSA 1W54A 5HWMA 2FPVA 2QJGA 2B7OA 3LDVA 3BG5A 1QO2A 4AWTA 1KTBA 1F6KA 1XI3A 1NF7A 4O10A 2Y7GA 1YTEA 3EX6A 2WV8A 3G1YA 1V7YA 4BK9A 4WXZA 3KFTA 4N02A 1YXCA 3GAKA 1N8FA 3WJYA 1G69A 3ZWSA 4NT0A 3G1XA 4ZQPA 2QCLA 3CB8A 2FDSA 3VE7A 2RHGA 4RV8A 4RCXA 2WSRA 4BWLC 4K39A 1XBZA 4WX2A 3KVLA 3W75A 2RFGA 3W1AA 3LHTA 3PUOA 4OBTA 2Z0IA 5AYYA 1SSDA 4ONVA 4MYXA 4Y9AA 1XBYA 1WDWA 4I7VA 2ZA1A 4O14A 1JUEA 1PVNA 2ZA2A 3PVFA 2H6RA 1OFDA 1W56A 1QAPA 1VS1A 3BG9A 1EP3A 2J6XA 3OEXA 3ZR4A 2CLOA 3DKJA 4ORMA 3TW7A 3DFPA 1FCBA 5K9CA 4JNMA 4OHQA 5CPLA 3I7SA 1DL3A 2Z2UA 4JTGA 1F2JA 1MXSA 4JR5A 3DBPA 2BSLA 3F4NA 1NAL1 5K7JA 3I6RA 3NQFA 1I2QA 2J88A 3ATZA 4X2RA 4LRSA 4MZ1A 2G5WA 3PF3A 1SO5A 3W71A 1H61A 1C8VA 1VCVA 3HF3A 3GDKA 4OV4A 3LBMA 3EWXA 4MOZA 1KFCA 5D2XA 2V5LA 5LNVA 1PHWA 1MSSA 3P5ZA 4FNSA 1EEPA 4IX0A 4LUJA 1K8ZA 2R8WA 3OVQA 2FQIA 1IIHA 2ABBA 5BNKA 2A2IA 4R53A 2C19A 1PS9A 2B7QA 3D0CA 3UNDA 3DGRA 1FCQA 5C6MA 3E0IA 2A0NA 4IPJA 2C6QA 2YFNA 3LBCA 3W1XA 3W83A 2E68A 2NZLA 4Q4KA 2FB2A 4UCGA 3MHGA 1A50A 2C0AA 3O07A 2E6FA 3W7EA 4JYEA 1BTMA 8TIMA 1OX4B 4MZYA 4GUJA 5F1VA 4AF0B 4POCA 1TPVA 1K8XA 3LRMA 3NGJA 2C18A 2ALDA 3G3MA 1YDNA 5CZSA 1PCKA 4AEOA 4NQ1A 4EF9A 3M0ZA 4NX0A 3RLUA 1LYXA 1TTIA 1ZAIA 1CW2A 3W7HA 2I14A 1KFKA 1RD5A 5F1UA 2RKXA 1LZOA 1VYRA 2J9XA 4NNCA 2F84A 1OX4A 1W8SA 4IXXA 3BG3A 1SPQA 2CU0A 4AF0A 4NZJA 1O95A 4NZFA 3OG3A 3M47A 3UYCA 4TO8A 4XBKA 4WOZA 4RX0A 3GVGA 3EKLA 1SR9A 1R30A 5G4WA 5HR7A 2VELA 3L5MA 4JTKA 4O53A 2E1DA 2V8ZA 2X1UA 3RK8A 5AC7A 5HR6A 3E96A 1TPEA 2NWSA 4JTTA 1TJRA 3RLVA 4FNQA 1TJPA 4UR8A 3LGEA 4ZQOA 2OX1A 4KWVA 2NXGA 1K7XA 3C52A 5I3FA 3W7RA 1F5ZA 3CEUA 4K37A 4JN6A 2CFFA 5CKSA 1P0KA 4JX4A 4ZQNA 5AFDA 5DBTA 3T40A 4MFEA 5KINA 1I8JA 1YPIA 4AHQA 3HJZA 2YFOA 1TPB1 5AN7A 4BF9A 4GC4A 3HGJA 3TSMA 2CZDA 1KFJA 4NJIA 2DZVA 5FF2A 2Y89A 1XKYA 2Q8LA 2A6NA 3ZWTA 3LRLA 2Y7FA 5I3JA 5KITA 3OBKA 3W84A 5J5RA 1LM1A 4PA8A 1X7FA 3NOEA 4BI6A 4N6FA 3GDTA 5AHLA 3A5FA 4O1BA 4QNWA 3L0GA 1SO3A 4DF0A 3Q37A 1GYNA 2DJLA 1AL8A 4JIQA 5E0KA 2QUUA 3MO7A 2IQTA 5HUPA 3NQ8A 1Q6LA 4MJMA 3MMTA 1W3TA 2C1HA 4WQ6A 2NX1A 3MYPA 2QEZA 1TPWA 1JR1A 1H63A 3W2KA 3P7YA 3P81A 4AHOA 3UXAA 1TV7A 5AYXA 2JBMA 1F7BA 4C1KA 3IV3A 5AC8A 2J9ZA 3G1SA 3W74A 4Z1BA 1QFEA 1U5JA 1UBSA 2P10A 3MUXA 3NQEA 4JTEA 4PC8A 1GT8A 1TIMA 1QPNA 2YX0A 4IMFA 3W73A 3C61A 3T4CA 4R33A 2HMCA 1U83A 3S5OA 3N14A 5HINA 4DF2A 2TYSA 1GZGA 1TQJA 4FXRA 3HPSA 1JCJA 3W3OA 5A8GA 3TNOA 3QRHA 5I3GA 4UC5A 2QCMA 4NU7A 1XUZA 3G8EA 5EMUA 2R91A 3C4UA 1THFD 5G2HA 3GXNA 4YL2A 5HULA 5I3KA 6TIMA 2Z1BA 1HO4A 3QQ1A 1KM6A 3B04A 1SZNA 1XXXA 2H8ZA 3GNDA 4EF8A 1GWJA 4JDYA 2XFWA 5C54A 5I3HA 3DFTA 3N73A 3A22A 5F2GA 3C3NA 4EIVA 3A24A 3GDLA 3BLFA 4A2SA 1AW1A 3PULA 3RF9A 5HUOA 3T44A 3NXFA 4WZHA 5G2IA 3STEA 4LVGA 5FF7A 3TW6A 2CZFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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