The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
103
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structure length |
103
|
Chain Sequence |
SALHWRAAGAATVLLVIVLLAGSYLAVLAERGAPGAQLITYPRALWWSVSTATTVGYGDLYPVTLWGRCVAVVVMVAGITSFGLVTAALATWFVGREQERRGH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of KcsA mutant
rcsb |
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Streptomyces lividans
|
| molecule keywords |
FAB-A
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| total genus |
43
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF07885 | Ion_trans_2 | Ion channel |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RAI A; 3STL C; 2WLM A; 1J95 A; 2OCC C; 3ABL C; 4G27 B; 1P7B A; 5EC1 C; 4PA4 A; 3KG2 A; 4JTC B; 2R9R B; 4PDR A; 1XL4 A; 3JYC A; 3SPI A; 4F4L A; 4LCU C; 4MVZ A; 4XDK A; 2BOC C; 2KB1 A; 3F7Y C; 3T4Z A; 3SYC A; 4QNH B; 1S5H C; 1OCR C; 3K08 A; 2DWD C; 5EBM C; 5CBH A; 5CBF A; 2K1E A; 3K06 A; 4GX5 A; 2HFE C; 4MVR A; 2A79 B; 3FB7 C; 4MW8 A; 4OXS A; 4WFE A; 3ZRS A; 3FB8 C; 4MTO A; 3F5W C; 4J9Y B; 3T2M A; 3UM7 A; 3HPL C; 3RW0 A; 4BW5 A; 2ITC C; 4PDV A; 4MTF A; 2EIJ C; 2ZXW C; 4CBC A; 2DYS C; 3AG3 C; 2JK5 C; 3E8H A; 3E86 A; 4P9P A; 4PA3 A; 3F7V C; 4PDM A; 5CBG A; 3E8B A; 4MSW C; 4R6Z A; 4P9O A; 3ABK C; 4JTD B; 3E83 A; 2ZD9 A; 3LDC A; 2YEV A; 2X6B A; 1M57 C; 3RVY A; 3SYP A; 2NLJ C; 1V55 C; 4RUF A; 4QE9 A; 3SPH A; 3GB7 C; 4MVM A; 4J9Z B; 4PDL A; 2EIK C; 4GX0 A; 1QLE C; 4X88 A; 4R8C A; 4H37 A; 2EIN C; 5IY5 C; 3TCU A; 4HYO A; 2WLN A; 4H33 A; 4XDL A; 4MVQ A; 3UKM A; 1OCZ C; 1V54 C; 5BZB A; 2AHY A; 4MVU A; 1KKD A; 5KUM A; 3LUT B; 4GX2 A; 4TWK A; 2Q69 A; 1LNQ A; 5KUK A; 4EKW A; 3STZ C; 4MW3 A; 2H8P C; 3LDE A; 4R50 A; 3ASN C; 3T1C A; 1R3L C; 1R3K C; 3T4D A; 2HG5 C; 3RBZ A; 2HJF C; 2IH3 C; 2AHZ A; 3EFF K; 1R3J C; 3E89 A; 3E8G A; 4LBE C; 5B1B C; 3SPJ A; 3LNM B; 4X89 A; 5EBL C; 2A9H A; 4QE7 A; 3FB6 C; 3IFX A; 4MS2 A; 4RO2 A; 4XDJ A; 5EK0 A; 2WLK A; 2WLL B; 3PJS K; 4MVS A; 2WLJ A; 3AG2 C; 3SYQ A; 4WFG A; 3X2Q C; 4LP8 A; 3SYA A; 2WLI B; 4WFH A; 4MVO A; 3RVZ A; 4UUJ C; 1K4D C; 4P30 A; 2HVK C; 2WLI A; 3K03 A; 3AG4 C; 3TET A; 4RUE A; 4WFF A; 3E8F A; 2BOB C; 2Y69 C; 3VOU A; 2HVJ C; 4I9W A; 5E1A C; 2P7T C; 3OR7 C; 1ZWI C; 1OCC C; 4P2Z A; 4ZBM A; 2A0L A; 3IGA C; 3ABM C; 3AG1 C; 3K0D A; 3OUF A; 1XL6 A; 1K4C C; 4G28 B; 2EIM C; 3OGC C; 5B1A C; 3SPC A; 3BEH A; 1OCO C; 2QKS A; 2ATK C; 2X6A A; 1ORQ C; 4JTA B; 5B3S C; 5J9P C; 2DYR C; 2EIL C; 4PA9 A; 2WLH A; 3LDD A; 4MTG A; 1R3I C; 2Q68 A; 5EC2 C; 3SJQ C; 4GX1 A; 2DWE C; 1G4Y B; 3K0G A; 4PA7 A; 3WG7 C; 2W0F C; 1BL8 A; 2Q6A A; 4R7C A; 1M56 C; 3K04 A; 3ASO C; 4HZ3 A; 1JVM A; 4PA6 A; 3ZJZ A; 2IH1 C; 2WLL A; 4X8A A; 3SPG A; 3R65 A; 2X6C A; 2Q67 A; 3FB5 C; 3OR6 C; 2QTO A; 3SYO A; 4KFM A; 2ITD C; 4DXW A; 5EBW C; 3OUS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1V9P A; 1PV0 A; 4X1I A; 2KQX A; 1NBM G; 3IJ4 A; 2BOC C; 2KB1 A; 2WAM A; 1OCR C; 4BW9 A; 3UT5 A; 1AJN A; 5B1B C; 2QKA A; 3FB7 C; 2NR5 A; 1JFF A; 3UM7 A; 2F66 C; 3CP1 A; 5EIB D; 3ABL B; 2DYS C; 2JK5 C; 1N33 B; 1XRE A; 2DN9 A; 3CYO A; 1Y6X A; 1MSD A; 4X65 B; 1K33 A; 1M1K W; 1AP6 A; 5CN0 A; 3A0R A; 4MVM A; 5BY1 A; 4J9Z B; 3N2G A; 4DW1 A; 4D7T A; 5KAF Z; 4X88 A; 4H37 A; 4OX9 B; 1JJO A; 1PL0 A; 4UCT A; 2ZIN A; 4ABM A; 1YJ9 V; 4I5S A; 2OWO A; 2CH7 A; 3TJT A; 4AHC A; 4DV1 O; 4JV5 O; 1QNM A; 4X20 B; 4X89 A; 3RYI A; 3A2F A; 4JI8 O; 3CX5 F; 4FM1 A; 4I7Z B; 1KD1 W; 3J7A U; 4J10 A; 1IZ3 A; 4FLZ A; 4X1Y A; 2HVJ C; 4B3M O; 2P7T C; 4LFA O; 1OCC C; 4JF3 A; 2E5L B; 2XAH A; 5H9C A; 2P67 A; 1BHA A; 1SZT A; 3SJQ C; 3AG4 B; 5L3B A; 2CTP A; 5FLX N; 3K04 A; 3ASO C; 5KHJ A; 1Y74 A; 1FYJ A; 3AG1 B; 5J2U B; 3SGI A; 2B5U A; 3S3X A; 4WFA V; 1FAF A; 1GM8 A; 4UCO A; 1YIJ V; 4KHP B; 3P3N A; 1J95 A; 3H1L H; 1P7B A; 1F4M A; 4PA4 A; 1H2L A; 4PDR A; 1VQL V; 1Q8I A; 1DGS A; 2HFE C; 1NKD A; 1K97 A; 5HFM A; 2V1D A; 1THZ A; 3QO7 A; 4UV9 A; 2WA4 A; 3CCM V; 2W6I G; 1H8E G; 2QWO B; 3CHX A; 5LGU A; 3CCJ V; 4PA3 A; 3HKE A; 1DLB A; 1NVP B; 5AG2 A; 1CEZ A; 3DTU B; 5D5P A; 2QR4 A; 4N21 A; 4TSF G; 2PZS A; 4NXM B; 4YIO A; 3I55 V; 4GX0 A; 4NKG B; 2F4V B; 3SR2 C; 3LUT B; 4GUN A; 5JCO C; 5JJE B; 4B3T O; 5B1O A; 1N0N A; 2EIK B; 3CRQ A; 2G38 A; 2ZNI A; 4X9Q A; 2HJF C; 2IH3 C; 1K9M W; 2EIN B; 3QTC A; 2JIZ G; 2Z0A A; 3BRC A; 4PJ0 Z; 4D7S A; 4JAV A; 4W4K A; 1K73 W; 5DN6 G; 1OCZ B; 4CH3 A; 2Q7G A; 3K9S A; 2JJ2 G; 2IU0 A; 1AR4 A; 1WJZ A; 1Z5V A; 2K9P A; 3CRR A; 1H2S B; 2P90 A; 5BXZ A; 4DV6 O; 1N0J A; 4UCR A; 3CC2 V; 2R9A A; 2MK3 A; 3IGA C; 5C93 A; 3JAM N; 2ZM6 B; 2DQ3 A; 1NT2 B; 2F23 A; 2X0L A; 5LXT A; 3L72 H; 4PA7 A; 2UUC B; 3D3I A; 1JVM A; 3CCL V; 4DV2 O; 2QM7 A; 1XOU A; 1AB3 A; 1VQ8 V; 2LFR A; 4I0X A; 4QIW F; 1LR1 A; 2JS5 A; 3RYH B; 1KKC A; 5H6R A; 4LCU C; 2N74 A; 3T4Z A; 4TOI A; 4QNH B; 2P6J A; 5J2T B; 1YI2 V; 4NB5 A; 2CUG A; 3I5D A; 3F5W C; 1US6 A; 3TXQ A; 2Q8V A; 3E8H A; 3DSQ A; 4K35 A; 1L8D A; 2QWQ B; 5EZY A; 5B3S B; 1B3Q A; 3OM3 B; 3E83 A; 2EZO A; 2ADP A; 4DR7 B; 2HLD G; 2NLJ C; 2P4V A; 4HBN A; 4DR6 B; 3GB7 C; 1GN6 A; 4PDL A; 3U0Z A; 3ZHT A; 4ZHQ B; 4FZ1 A; 2YS8 A; 3HKB A; 4YY3 B; 2XHB A; 2HJD A; 5GON A; 4NXN O; 1WPB A; 5KX5 B; 3ASN C; 1M5I A; 2LJ2 A; 3T1C A; 3CB2 A; 1I5Y A; 1KYO F; 5F2V O; 1XI1 A; 2E75 B; 3E8G A; 3QO8 A; 2BCC H; 3ZCC A; 1VIB A; 3ML0 A; 3CSX A; 3VBB A; 1I0H A; 1DK1 A; 4LP8 A; 1SRY A; 5LBQ A; 1W2B U; 1S0V A; 2QKC A; 1R6K A; 3JD0 A; 1JCH A; 2BSK B; 2WLI A; 3SDL A; 2DJV A; 3BFR A; 3LSQ A; 2B1G A; 1SF9 A; 3OGC C; 3SPC A; 3ZN0 A; 1DTO A; 2X6A A; 1WAZ A; 2PYL A; 3H9V A; 2UXC O; 1R3I C; 3JD2 A; 1Y67 A; 3WG7 C; 1VQN V; 2FTK A; 2QWP B; 1R1B A; 3SPG A; 2EIM B; 2LQT A; 4TQD A; 2EJ7 A; 4GT1 A; 3CMA V; 5FPR A; 1Q81 W; 4DV1 B; 2GHY A; 1FD9 A; 1SQV H; 2OCC C; 1N32 O; 4ZKI A; 4JV5 B; 2KKW A; 4GKJ O; 3OFN G; 4GYC B; 3K08 A; 5CBH A; 4JI8 B; 2K1E A; 1S76 D; 4O4L B; 1YTF B; 4JI4 O; 4BW5 A; 1F23 A; 4PDV A; 4YHH O; 1Q43 A; 5JVD A; 4U3J B; 4B3M B; 3E8B A; 1PP9 H; 4LFA B; 4R6Z A; 3RGB A; 2YIB A; 4QPJ A; 5GTH Z; 1GO3 F; 3ZMZ A; 1EN6 A; 3H01 A; 1GRJ A; 1NTM H; 4JI3 O; 3AG3 B; 3MD0 A; 4UCS A; 5LOV B; 2RMK B; 4FLT A; 4EB6 B; 2YDE A; 1V54 C; 1WPX A; 2AHY A; 2CTQ A; 2QGN A; 5BZB A; 3KCX A; 4PI0 A; 4O2A A; 3FAV B; 2ETN A; 3EFF K; 2YSU B; 3SPJ A; 3OEH G; 2MW2 B; 3ZMV A; 1Q5O A; 2H3O A; 1VAR A; 1I94 O; 4X20 A; 2ZIM A; 2P06 A; 3WFV A; 2KG7 A; 2Y0I A; 2CGN A; 4P30 A; 2HVK C; 4LH6 A; 2ZR3 A; 3ZMT A; 3VOU A; 3CXC U; 1K8A W; 2A0L A; 3ABM C; 3UKM A; 4G28 B; 4DRX A; 1AR1 B; 4JTA B; 5B3S C; 1S5L Z; 3L71 H; 4DR5 O; 2R9I A; 4I4T B; 1ARO P; 2JRI A; 4G2K A; 4AIL C; 1PNL A; 3B77 A; 5EYP B; 3ZRX A; 2Q67 A; 1QHT A; 3OR6 C; 2QTO A; 5J2U A; 4JZG A; 3OE7 G; 4RAI A; 4B3T B; 1M90 W; 5KHK A; 1KUQ A; 2ZE6 A; 2UXN A; 1HNX O; 3B2E E; 4JI2 O; 1E1R G; 4CC6 A; 3TGU H; 3SJC C; 2VRZ A; 3JAR B; 1BMF G; 1E1Q G; 3I56 V; 1BHB A; 4JI5 O; 3M8A A; 1A32 A; 4LC1 A; 1VQ7 V; 1FXK B; 1OV9 A; 2IJK A; 4DV6 B; 4J7J A; 4MSW C; 1IDS A; 3ZBH A; 2JGD A; 3ZHU A; 2XAQ A; 1NU1 H; 1HP8 A; 3ABU A; 3SYP A; 3DXR B; 1RM1 C; 1NZ6 A; 1NTK H; 1GN2 A; 2OIE A; 1MG1 A; 4DV2 B; 3EHB B; 4HYO A; 4GLX A; 3S3W A; 4GX2 A; 2Q69 A; 2BTO A; 3CEI A; 5IYD O; 2CTR A; 1R3K C; 4CS4 A; 2AHZ A; 3K5M A; 3RYF A; 4UV8 A; 1Q7Y W; 1CPY A; 2JGU A; 4NTW A; 2D2C B; 3UCS C; 1ROP A; 2AXT Z; 4LF6 O; 2ZXW B; 2QTS A; 2WLL B; 3VQX A; 1L0L H; 2XAF A; 4L8J A; 4E2L A; 1YSC A; 2OTL V; 4IT5 A; 1BZK A; 2Y69 C; 3ZHR A; 1H2K A; 4BR6 A; 1VQ5 V; 2AZ0 A; 1P4R A; 1MOF A; 2H94 A; 2IBZ H; 2XUM A; 4YXW G; 2BTQ A; 4EFE A; 2EIL C; 2RJZ A; 2F1M A; 4GX1 A; 4OPA A; 4DV0 O; 3KCY A; 1M56 C; 3CRM A; 4PA6 A; 4Q6G A; 3ZJZ A; 3NR7 A; 4DW0 A; 5JQG A; 2VQE O; 4IIJ B; 4ZI7 B; 4NXN B; 4JI1 O; 2PI4 A; 2UXB O; 4O4H B; 3SPI A; 4O4I B; 4MVZ A; 3RYH A; 2F93 B; 5EBM C; 5CBF A; 3CRA A; 3AEI A; 1AIL A; 4FZ0 A; 2QSA A; 5IJ9 B; 1SC5 B; 2EIJ C; 1EZJ A; 3MHS C; 3JD1 A; 2UU9 O; 1AP5 A; 4UXN A; 4AI8 A; 2CDY A; 1VQO V; 1M57 C; 2UXC B; 1Y76 A; 2OYQ A; 1QLE C; 3FYE B; 2VWK A; 3JAW B; 3ETE A; 3H1K H; 4JYC A; 1SA0 B; 4MVU A; 3GWK C; 3H1I H; 1TVK A; 2DMX A; 4GZR B; 5KMG B; 3A0B Z; 4LWS A; 1FFX B; 1N32 B; 2Q73 A; 5KX5 A; 1R3J C; 4GKJ B; 5IY5 B; 3JD4 A; 3E2E A; 1IX9 A; 2WLK A; 1BQ0 A; 4FLW A; 3X2Q C; 4JI4 B; 4KUM A; 3QVN A; 4YHH B; 2A7W A; 4IL6 Z; 2ZNJ A; 2BSK A; 3HKC A; 4NTY A; 1K4C C; 1AJQ A; 1OCO C; 3AG2 B; 3W7T A; 2Y4U A; 3HR0 A; 5D5Q A; 4JI3 B; 1WA8 A; 2DWE C; 2ZQM A; 4DUZ O; 1GK9 A; 2KSD A; 4FM0 A; 1VF7 A; 4BWA A; 4WFB V; 2ITD C; 4LH7 A; 4LNU A; 4DXW A; 2YEV B; 3OUS A; 1GN3 A; 2DW4 A; 1SQQ H; 4HNA B; 2ZT9 B; 1MZE A; 3D3Q A; 3JYC A; 1GTO A; 1S5H C; 1WN7 A; 1I94 B; 1ZUQ A; 1MAB G; 4MTO A; 2LFS A; 1CXZ B; 2V7Q G; 2YIC A; 5IJ0 B; 2ZXW C; 1BCC H; 5ITZ B; 2CK3 G; 4UVB A; 1YVW A; 2HKO A; 1CP9 A; 4MT8 A; 3AK3 A; 4PEL A; 1KC8 W; 1KB9 F; 1KQS U; 4X64 O; 4DR5 B; 1V55 C; 2XOK G; 1VF6 C; 3SPH A; 1FS0 G; 4U7O A; 1S77 D; 4U3F H; 3CCS V; 1NR7 A; 1F51 A; 1G1X B; 2QA4 V; 1SQG A; 3QO5 A; 3ZED A; 5LOV A; 4H33 A; 4FK5 C; 2JJ1 G; 3C3T A; 3RYC B; 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2YIB D; 2VQE B; 3E35 A; 2RCV A; 4JI1 B; 3OMA B; 4J7K A; 1LNQ A; 3ABT A; 3WB1 A; 4FLX A; 4B7K A; 4R50 A; 1H2N A; 1VMG A; 2UXB B; 3VQV A; 4CC5 A; 3E89 A; 1SER A; 2E74 B; 2PF4 E; 3BPZ A; 2JEU A; 4NR1 A; 3H1J H; 1EM1 A; 2Q4P A; 3KZI Z; 1IBL O; 5A2Q N; 2OTJ V; 1DF5 A; 5LYJ A; 1P49 A; 5A9G A; 3AG4 C; 4PD4 F; 4WFF A; 4B3S O; 2UU9 B; 3P32 A; 1XHZ A; 1VQ4 V; 3G6B A; 3OR7 C; 1ZWI C; 2OCH A; 3AG1 C; 4UB8 Z; 4D6T H; 3BEH A; 1VF6 A; 2ATK C; 1B04 A; 4NYK A; 1RSO B; 3K59 A; 1JFF B; 3JAK B; 5KHG A; 4B08 A; 3K0G A; 2Q6A A; 3O65 A; 4HZ3 A; 3OW2 U; 2IH1 C; 2XAS A; 1XBL A; 5B1A B; 4TUY B; 4A5U B; 1H8H G; 4H44 B; 2LP7 A; 5E79 Z; 4IIJ A; 4ZI7 A; 1VQ9 V; 1HDJ A; 4G27 B; 3KG2 A; 3HKD B; 1PL4 A; 1TUB B; 5LP6 A; 5IE9 A; 2EJR A; 1ZX3 A; 2QEX V; 1GM9 A; 3ZRS A; 4FIP C; 2PY5 A; 5CB4 A; 2UXX A; 2CH7 B; 3DC6 A; 1XNQ O; 3P3P A; 5IJ9 A; 4P9P A; 4EFB A; 2ZCE A; 2QJ1 A; 3ZRV A; 3RYI B; 1L1F A; 1TUE B; 5GTI Z; 1GKF A; 4PHZ A; 2HP8 A; 4WCE V; 1WLE A; 2EIK C; 3G67 A; 4DUZ B; 2EIN C; 1OZ0 A; 4JI0 O; 4DUY O; 4X1Y B; 1KP2 A; 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