The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
|
sequence length |
103
|
structure length |
103
|
Chain Sequence |
SALHWRAAGAATVLLVIVLLAGSYLAVLAERGAPGAQLITYPRALWWSVSTATTVGYGDLYPVTLWGRCVAVVVMVAGITSFGLVTAALATWFVGREQERRGH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of KcsA mutant
rcsb |
| molecule keywords |
FAB-A
|
| source organism |
Streptomyces lividans
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| total genus |
43
|
| structure length |
103
|
| sequence length |
103
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF07885 | Ion_trans_2 | Ion channel |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OCZ C; 2R9R B; 3F7V C; 3K04 A; 3OUS A; 4HZ3 A; 3SPG A; 5CBH A; 2Q67 A; 4GX2 A; 3ZJZ A; 2QTO A; 3LNM B; 4PA9 A; 4PDR A; 3AG4 C; 3OR6 C; 1K4C C; 2ZXW C; 3ASN C; 4MTG A; 4TWK A; 4R50 A; 3TCU A; 3X2Q C; 4ZBM A; 3ABL C; 1R3K C; 4PA6 A; 1R3J C; 2QKS A; 4QE7 A; 3SJQ C; 2Q68 A; 3E86 A; 2A0L A; 2ITD C; 4P2Z A; 3UKM A; 1V55 C; 3VOU A; 1P7B A; 4LCU C; 2K1E A; 2NLJ C; 5B1A C; 1G4Y B; 4RUE A; 4MVZ A; 4PA7 A; 3SPI A; 3BEH A; 4XDK A; 3AG1 C; 3SYA A; 5EC2 C; 2WLI A; 5CBF A; 4UUJ C; 5EBL C; 2OCC C; 4RUF A; 3WG7 C; 4GX5 A; 2DYS C; 2IH1 C; 4MVR A; 2WLL B; 1OCO C; 1OCR C; 4QE9 A; 5KUM A; 1K4D C; 1M57 C; 1ZWI C; 2H8P C; 4MTO A; 3K03 A; 5KUK A; 3PJS K; 3SYO A; 3T1C A; 3IFX A; 3UM7 A; 4J9Z B; 1R3L C; 2HFE C; 2WLH A; 2X6B A; 3E8B A; 3EFF K; 4P9O A; 4PDV A; 4X88 A; 3STL C; 4KFM A; 2AHY A; 4PA3 A; 1KKD A; 3R65 A; 2DWE C; 2HVK C; 4GX0 A; 3T2M A; 4MVU A; 4XDJ A; 1S5H C; 4OXS A; 3RBZ A; 4CBC A; 3LUT B; 1LNQ A; 2HJF C; 4WFF A; 2HG5 C; 3HPL C; 2AHZ A; 3RW0 A; 5B3S C; 4WFH A; 3E8G A; 2A9H A; 4LP8 A; 4P30 A; 4P9P A; 2Q69 A; 4MSW C; 5EBM C; 2BOB C; 5EK0 A; 2A79 B; 2ZD9 A; 4XDL A; 2WLL A; 2P7T C; 2EIM C; 3LDE A; 4MVS A; 4MVM A; 2Q6A A; 3E8H A; 2YEV A; 2EIL C; 3JYC A; 2HVJ C; 5EC1 C; 2W0F C; 2DWD C; 4EKW A; 4J9Y B; 4HYO A; 5E1A C; 4RAI A; 3LDC A; 4JTA B; 3RVZ A; 2IH3 C; 1OCC C; 2BOC C; 4R6Z A; 3OUF A; 4F4L A; 4H37 A; 4MVQ A; 3FB8 C; 3SPJ A; 4BW5 A; 5IY5 C; 2KB1 A; 4I9W A; 4PDM A; 4GX1 A; 2JK5 C; 3ASO C; 3SPC A; 1XL4 A; 2WLJ A; 3K06 A; 2X6C A; 3RVY A; 3SYC A; 2EIK C; 3T4D A; 4LBE C; 2DYR C; 4H33 A; 5CBG A; 5J9P C; 1V54 C; 4PDL A; 2WLN A; 4MVO A; 3F7Y C; 2EIN C; 1XL6 A; 1JVM A; 3K0G A; 4RO2 A; 3ABM C; 3LDD A; 4G28 B; 4MW8 A; 4WFG A; 4X8A A; 2ITC C; 3FB7 C; 3OR7 C; 1QLE C; 4WFE A; 3FB6 C; 3F5W C; 3SPH A; 3ZRS A; 5BZB A; 4MS2 A; 3E89 A; 3K08 A; 2Y69 C; 3AG2 C; 4QNH B; 3OGC C; 2WLM A; 3FB5 C; 1M56 C; 4MW3 A; 2WLK A; 4JTC B; 3STZ C; 1BL8 A; 3ABK C; 5B1B C; 1J95 A; 4PA4 A; 1ORQ C; 3GB7 C; 4G27 B; 4R8C A; 4R7C A; 3SYQ A; 3KG2 A; 4MTF A; 2EIJ C; 4DXW A; 4JTD B; 2ATK C; 3E8F A; 3T4Z A; 2X6A A; 4X89 A; 1R3I C; 3K0D A; 3AG3 C; 3SYP A; 3IGA C; 5EBW C; 2WLI B; 3TET A; 3E83 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1OCZ C; 3ABM B; 3W7S A; 2QGN A; 2KG7 A; 1ZSP A; 1R3K C; 5GON B; 5LGN A; 1SER A; 3A2F A; 2Q68 A; 3OW2 U; 4EFB A; 4DV6 O; 1EZV H; 4IHJ B; 2AZ0 A; 4X65 O; 3AK1 A; 3D3Q A; 1VQN V; 1GM7 A; 2PF4 E; 5IWA B; 4WF9 V; 4HAM A; 1XEQ A; 2QTS A; 2H8P C; 3T1C A; 3CC7 V; 3GWK C; 4DV4 B; 4X88 A; 1FD9 A; 3WU2 Z; 4X62 B; 2KQX A; 3ZN1 A; 3KCY A; 4LNU A; 4DR6 O; 3MDS A; 2DWE C; 1GRJ A; 4JI7 O; 3Q4H A; 3RBZ A; 1ZX3 A; 5HFL A; 3HR0 A; 3RW0 A; 3CCL V; 1Y74 B; 4I0X A; 1IBK B; 1SQV H; 3ZMS A; 4RAI A; 4X65 B; 4FZ0 A; 1NZ6 A; 4J11 A; 3CPW U; 2JK5 C; 2WLJ A; 5CBG A; 4YY3 O; 2OIE A; 3F7Y C; 1XL6 A; 3T4D A; 5FNV B; 1B3Q A; 3N2G B; 2OT5 A; 2Y48 A; 2ITC C; 1VEW A; 4JI1 O; 4ZI7 B; 2OIG A; 1V9P A; 1VP7 A; 2EIM B; 2Y0I A; 5FL7 G; 4RWU A; 5KHK A; 1WPX A; 3CCJ V; 4DR5 O; 5JCO A; 4N23 A; 5IJ0 A; 2W0X A; 4DUZ O; 4DR7 O; 5BMV B; 1HW7 A; 2VWK A; 1SQF A; 1K92 A; 3JAL A; 2R9R B; 3ZRX A; 2ZDI A; 2QM7 A; 4NXM O; 2QKA A; 5KMG A; 1G1X B; 4MTG A; 3HKE B; 4JYC A; 3SGI A; 1L0L H; 2QKC A; 4DV0 O; 4JI5 O; 3S3X A; 1V55 C; 3OFN G; 4J80 A; 2NLJ C; 1KKC A; 3JAT B; 4PA7 A; 4JAV A; 1NTM H; 3JAR A; 5EC2 C; 1S76 D; 1EZJ A; 3M99 B; 3S3W A; 4YJ2 B; 1OCO C; 1K4D C; 5C8Y A; 4DUZ B; 2E76 B; 3CEI A; 3ZMZ A; 3D8C A; 1R3L C; 1US6 A; 3L75 H; 3E22 A; 4AIL C; 3P30 A; 1BSM A; 1E79 G; 3LUT B; 5LHI A; 1X4T A; 3VQX A; 4JI5 B; 1IVS A; 1AJP A; 2P7T C; 4NTX A; 3QVN A; 3IC7 A; 1IBM O; 1H2G A; 2F4V O; 2YSU B; 1M57 B; 1H2L A; 1CP9 A; 1H8E G; 1YF2 A; 1M93 A; 1WB7 A; 1R6T A; 4DV1 B; 4TSF G; 4Q6G A; 1DF5 A; 1WN7 A; 4QPK A; 3FB6 C; 3LSU A; 2ZE7 A; 3DGE A; 4LF6 O; 2BCC H; 4O4H A; 1I94 B; 1BHA A; 2JIZ G; 2UU9 O; 4X1I A; 3OEH G; 3SJB C; 3R66 A; 1THZ A; 1EM1 A; 2IJJ A; 5JWP A; 3I55 V; 3QTC A; 3C90 A; 4O2A A; 1GN3 A; 4UCO A; 3TXQ A; 1AR4 A; 1B6Q A; 3ZS8 C; 4NYK A; 4H0L B; 3L71 H; 3TCU A; 2ZXW B; 4JI3 O; 4FK5 C; 2L35 A; 4U3J B; 4YHH O; 1E1R G; 5B1B B; 5LL6 Y; 1H2M A; 1HNZ B; 4BIU A; 1R6N A; 2ILM A; 2R72 A; 1XHZ A; 4LC1 A; 4UUJ C; 5LXT B; 4FFB B; 5B5E Z; 5LOV B; 2W6J G; 1Q43 A; 4EFE A; 1YZB A; 5KUK A; 5BY1 A; 3LNN A; 1RM1 C; 2UXD B; 3ABL B; 1SZX A; 1YTF D; 2P4V A; 2JGU A; 1S77 D; 4PI0 A; 1X59 A; 2HVK C; 4MVU A; 5IT9 N; 1XBL A; 4BW9 A; 1DGS A; 4GKJ O; 3HPL C; 2GSM B; 3JAK B; 1TGO A; 1GN2 A; 4J7J A; 5D5P A; 1SQX H; 4FFK A; 5EZY A; 1XNR O; 2BOB C; 2ZD9 A; 4J10 A; 4JYB A; 2GTS A; 2UXX A; 4B3T O; 2N05 A; 1B04 A; 4LFC B; 3CC2 V; 3LDC A; 3H9V A; 4GZR B; 2N04 A; 2XUM A; 4UFZ A; 4F4L A; 1IXB A; 3FB8 C; 3ML0 A; 4ZHQ A; 1AVM A; 1JCH A; 1RSO B; 2IM9 A; 1HNW B; 1FFX A; 4RO2 A; 4J41 A; 4XBF A; 2GTA A; 3SPH A; 4JI4 B; 2IU0 A; 4UCR A; 1KP2 A; 3CCE V; 3STZ C; 5JQG A; 1H38 A; 4DR4 B; 1XNR B; 3OTO B; 1PNK A; 1XNQ O; 1Q5O A; 3CRQ A; 1G6U A; 5L3F A; 2Q73 A; 4I0X B; 4YIO A; 3PN1 A; 2JRI A; 3CSX A; 4HZ3 A; 3OUS A; 2FTK A; 1QR8 A; 4X66 B; 1K4C C; 2ZXW C; 3ASN C; 2WA4 A; 4FZ1 A; 3L72 H; 3K5O A; 3THO A; 4JI6 O; 1M9N A; 2F66 C; 3OMN B; 2ZM6 B; 3QO5 A; 1N4C A; 1PP9 H; 5CA0 B; 1SQP H; 5DN6 G; 3TK1 A; 2DYS C; 2E74 B; 4CS4 A; 4DR2 O; 4GUN A; 1KUQ A; 1A32 A; 2V7Q G; 4LH7 A; 3N27 A; 4J9Z B; 4NXN O; 1NT2 B; 3ZRV A; 2UXB O; 3JCU Z; 1FAF A; 4TV9 A; 3E8G A; 1YI2 V; 3P3N A; 2ODM A; 4MSW C; 4RQE A; 5ITZ B; 5E79 Z; 3LDE A; 4EKW A; 2YEV A; 1Y76 B; 1QR9 A; 2LGW A; 1QBZ A; 3CD6 V; 2P67 A; 1Q82 W; 3UT5 B; 2LGQ A; 4UCV A; 2YIC A; 5KLV H; 4DV5 O; 2DYR C; 4ABM A; 4H33 A; 2VQE B; 3DC5 A; 5KUM A; 4B7K A; 3E2E A; 3K5L A; 5EYP A; 2N74 A; 1ZTE A; 4O4L B; 4KHP O; 2M6Y A; 3HKB B; 1YHQ V; 3G6B A; 3CE2 A; 4MW3 A; 1N33 O; 4PA4 A; 3FYI B; 2EUL A; 2Q4P A; 2RN9 A; 2CE4 A; 2ATK C; 2VQF O; 3ZMV A; 2BTO A; 2YS8 A; 1HDJ A; 1J5E O; 2LFS A; 2WLI B; 2DMX A; 2ARH A; 2WPD G; 2F23 A; 1R73 A; 4PA9 A; 2CDY A; 5EIB D; 1IBL B; 1ROP A; 4DV5 B; 2UUB O; 2XAF A; 2P6J A; 3JAM N; 4LF5 O; 2E5L O; 3RYH A; 1AJN A; 1F4N A; 4UCT A; 4YJ3 B; 4B3S O; 1VQ5 V; 5DM6 V; 2P5O A; 5EBL C; 2OCC C; 3J80 N; 2WLL B; 1QU7 A; 1OCZ B; 3ABT A; 3IAY A; 3CYO A; 1MZF A; 3K03 A; 3QF7 A; 1J5E B; 2HFE C; 4CS2 A; 3E8B A; 1XMQ O; 4JI8 B; 5JCO C; 2AHY A; 3ZIA G; 2EBO A; 2CGN A; 5KX5 A; 4XDJ A; 1K5S A; 4OXS A; 1FJG B; 2LJ2 A; 4PI2 A; 2ZDI C; 1P4R A; 4TV8 A; 2PYJ A; 3GVM A; 3MD0 A; 4UV8 A; 1YJ9 V; 4TQD A; 4QJF B; 4E2L A; 4LWS B; 2XAH A; 4FLX A; 1L1F A; 4R6Z A; 3SR2 C; 5IYC O; 2DE0 X; 1NU1 H; 1W0J G; 3CJH B; 4JI2 B; 4ICG A; 1GTO A; 3RGB A; 4H44 B; 4MW8 A; 4AQY O; 3LSS A; 4WFE A; 2DOS A; 4MS2 A; 1WP7 A; 4O2B B; 2JDI G; 2AXT Z; 1GH6 A; 1NS1 A; 2AW9 A; 5JJN B; 3B77 A; 4PHZ A; 5H2F Z; 1TVK A; 3VQV A; 5J2T B; 3G4S V; 1S5J A; 4YXW G; 2EZP A; 4W4L A; 2PI5 A; 2GUZ A; 4LFA B; 5EZY B; 1XRE A; 2YUA A; 4K3A A; 5K1X A; 3ZJZ A; 3I5D A; 4GKK B; 4DUY B; 3C3S A; 1Y66 A; 5JH7 B; 2FYU H; 3RT3 C; 2QKS A; 4AQY B; 4IL6 Z; 1FFT B; 3UQ8 A; 5IWA O; 3T1Y B; 1NTK H; 3JSL A; 3UO3 A; 2WA3 A; 4LCU C; 4MVZ A; 1FFX B; 4DV4 O; 2HEP A; 1MAB G; 2C2A A; 4GX5 A; 4X62 O; 3G71 V; 2H3O A; 1MSW D; 4QE9 A; 3P3P A; 3B09 A; 4O4I B; 1VQ4 V; 2JVD A; 1AI6 A; 4ZKI A; 2WLH A; 4YIP A; 1KKD A; 1IBK O; 4DRX A; 1RP3 B; 4GX0 A; 3T2M A; 2DW4 A; 3W7X A; 1V55 B; 2OTJ V; 3IJ4 A; 5JJJ B; 5C93 A; 2HJD A; 3CRA A; 4FVM A; 3G67 A; 1AI5 A; 1OCO B; 2YDE A; 4IIJ A; 3RVZ A; 2DQ3 A; 1BMF G; 4UCU A; 2BOC C; 4KL1 A; 3RYI A; 4MVQ A; 2LP7 A; 2KB1 A; 4GLX A; 2ZE5 A; 1YTF B; 2Z5U A; 3FAV A; 1SKV A; 4PDL A; 4MVO A; 1JVM A; 1V54 B; 1AR1 B; 3JD3 A; 3LDD A; 4G28 B; 4X8A A; 3B40 A; 1H8H G; 3E89 A; 2FB5 A; 2EZO A; 2Y69 C; 4DW0 A; 3W7W A; 3KKY A; 3CWB H; 4U3F H; 4TUY A; 4N21 A; 5LYJ B; 2BTQ A; 3QNE A; 1WB8 A; 3ABK B; 4JZG A; 2R9A A; 4DXW A; 1IDS A; 2Z3Y A; 2X6A A; 1EN4 A; 1R3I C; 3IGA C; 5KA6 A; 3ZRW A; 3E83 A; 1ZUQ A; 1BS3 A; 4F6R A; 4ZOL A; 2F95 B; 1OHH G; 3OR6 C; 3FYE B; 3CS5 A; 1WA8 B; 2WAM A; 4J7K A; 4DR3 O; 4UB6 Z; 5CB4 A; 5LMU B; 4JZ2 A; 1P7B A; 4JI0 B; 2K1E A; 1YIJ V; 5B1A C; 1JX9 A; 1G4Y B; 5DED A; 4CH4 A; 4GYC B; 1AI4 A; 3CCR V; 1M4U A; 3HKC A; 3RYC A; 1U97 A; 2NN4 A; 5BXZ A; 4PEL A; 1R1B A; 2HHH B; 3ZHV A; 2UUA O; 5LP6 A; 1W59 A; 4KUM A; 1DF4 A; 3CC4 V; 1KEC A; 3JD1 A; 4NB5 A; 4X1K B; 2XAJ A; 1LUV A; 3DTU B; 3CMA V; 2UXC B; 1URF A; 1AP6 A; 3CCS V; 2AHZ A; 5B3S C; 1JJO A; 1GMG A; 3FD9 A; 4LP8 A; 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3ZHQ A; 1BZK A; 3UO2 A; 1Q8I A; 4QPJ A; 1NVP D; 2EIN C; 1QNM A; 5FLX N; 1NR7 A; 3FB7 C; 4B08 A; 4DR4 O; 3SJA C; 3OTO O; 2KG7 B; 2GV9 A; 2R70 A; 5KAF Z; 4UB8 Z; 4FM2 A; 5JVD A; 1N32 O; 3GB7 C; 3CP1 A; 2KSD A; 3KG2 A; 3T4Z A; 4X66 O; 2ZIO A; 5AG2 A; 1NR1 A; 2Q0O C; 1XI1 A; 4UCS A; 1JA8 A; 2DYR B; 3SPG A; 1PNM A; 5H9C A; 2ZM6 O; 3EXA A; 3ZHU A; 3AG4 C; 1MA1 A; 3X2Q C; 4ZBM A; 1N8R W; 3BFR A; 4LNU B; 4QE7 A; 1SES A; 5J2U A; 2HR3 A; 3Q4H B; 3UKM A; 2R9I A; 1M90 W; 3JD0 A; 1TAE A; 1N32 B; 4I55 A; 3H01 A; 1K3E A; 3D3I A; 4FM0 A; 5EIB C; 2BTQ B; 1BE3 H; 3A0H Z; 3ETQ A; 3STL C; 3JD4 A; 5GON A; 1XMO B; 1CPY A; 3H1I H; 1BGY H; 1E1Q G; 4IHJ A; 4P30 A; 1S0V A; 1YCI A; 2JS5 A; 2XAG A; 2OCC B; 1F7Y A; 3JYC A; 3OM3 B; 4LF4 B; 4J9Y B; 5B1N A; 5L3B A; 2VQE O; 3OEE G; 3ZHR A; 3SPJ A; 5KA5 A; 4I9W A; 1M5I A; 5IJ0 B; 2LQT A; 3K06 A; 1VF6 A; 1AJQ A; 1VF7 A; 3L70 H; 1HNX O; 3B8N A; 1Y74 A; 3JAL B; 1WLE A; 2W6I G; 2B1G A; 1Q6H A; 4OX9 B; 1K9M W; 2HLD G; 1YEW A; 5KMG B; 3K08 A; 2GDS A; 1IZ3 A; 3CME V; 1PD3 A; 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