2P9LA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
415
structure length
399
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 124
structure length 399
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2p9lA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9lA04
4H0YB 3ID8A 3O4WA 3CETA 5AZJA 1BOTO 1ATRA 1JCGA 2YJEA 4CZFA 1HUXA 3LDPA 5AQFA 2VCPA 2QWOA 3FLCO 3VENA 3IFRA 2FSNA 4A61A 4FWKA 5AQJA 3IDHA 1KAXA 4B1ZA 1SAZA 2E2OA 1MDUB 3VEZA 1GLFO 5FPEA 1NGFA 4ISEA 5AQHA 3SJHA 1QQMA 2YJFA 4O5FA 1T6CA 5I9EB 4PL7A 4IWVA 4A2BA 4Y0WA 5BRFA 2E2NA 1RGIA 5FPNA 3QICA 3BUZB 3H45C 3W0LA 3ATVA 5FPDA 3UKRB 1V4TA 3ENOA 4CZLA 3KHYA 3R6MA 4A2AA 1NWKA 2GELA 5EVZA 3RSEB 1BA1A 4FOEA 3WQUA 3CJCA 4K43A 1NGBA 3MK6A 3CJAA 2OANA 2Q31A 5EOYA 2A5XA 3M3ZA 3UKRA 3F9MA 3SK3A 3DAWA 4QS9A 4JD2B 3FZFA 4DHYA 3ULEA 3O8MA 3A5MC 2QM1A 3KZBA 3MDQA 2P9SA 1DKGD 3DXMB 4PKHA 4AM6A 1P8ZA 4B1XB 4DQ8A 2QWNA 1K8KB 2UYTA 4FSVA 1BUPA 3JS6A 1BA0A 4H5VA 4NO7A 1EQYA 1HJOA 3VEVA 4FWOA 2NZTA 3H3NO 5KQ8A 5BN8A 4L3QA 1U2VB 4FWSA 1Z6RA 1HX1A 4RWTA 3EZWA 3TU5A 5EX5A 2P9PA 1TYQB 2ZGZA 3TPQA 5JICA 4QS8A 1SZ2A 3SMSA 3QBWA 5AQPA 5AQIA 1WUAA 1ZXOA 5AR0A 3D2FA 5KQDA 3S41A 1U2VA 1GLJO 3QDKA 2D0PA 2Q2RA 1TYQA 3CHWA 2E20A 3CJ1A 3CIPA 2P9IA 1X9JA 3UKUB 2HOEA 2BUPA 4JNEA 4CZIA 2P9KA 2GEMA 5AFUA 4JN4A 4EHUA 1X3MA 4FWPA 4IO8A 1IJJA 2CH6A 4A62A 5LJWA 3ZEUB 3HM8A 3H3OB 4FPBA 5B8HA 4H0PA 3ZETA 2D1KA 4I6MA 3BEXA 2FSKA 1OKJA 3VEOA 3LDOA 4BC5A 4CZJA 4EIAA 3WXJA 4H03B 5BR9A 1GLAG 3EN9A 4XEIA 2KHOA 2E1YA 4WQ5A 3M1FA 3D2EB 4CD3A 5AQRA 3ZX2A 3A5OC 4BRIA 4CZHA 4BC2A 2V51B 2A40A 2V7ZA 3VOVA 5AQMA 5AQTA 1XUPO 4RTFD 3VEXA 3R8EA 2FF3B 4JHDA 2QWLA 4BQLA 5BREA 2IIRA 3QMLA 3A5LC 3WEEA 2QWQA 1S3XA 3FE1A 3O5BA 5AFUH 3SLCA 1NM1A 1Z05A 3J8AA 1E4FT 3H6EA 2YHYA 4M7YA 2EWSA 3H46O 3C7NB 4PKGA 1JCEA 3I8BA 3QBXA 4BVOA 1NGIA 2ZWHA 2P9UB 4C23A 2AA4A 3DJCA 3AY9A 4IJAA 4HWIA 2YHWA 2NRHA 5E26A 2W40A 3GDQA 4BQZA 4BROA 3MCPA 3HTVA 3FR0A 2FF6A 2YHXA 3BF3A 3CQYA 4EAHD 5BPLA 1NGCA 2Q36A 1TUUA 1T6DA 1RFQA 1NGAA 4FWQA 3HSCA 4YDUA 5BRDA 3I33A 2VWBA 4BRQA 4GY2B 3FGUA 3W3DA 4K25A 3MMVA 4BG9A 2Q0RA 3B8AX 1Y64A 4FO0A 4CZMA 5LY3A 3FZLA 3CI5A 4ISGA 3RSEA 4NB4A 2NLXA 3MN6A 5AQLA 1S22A 2ZF5O 1HKCA 4CZGA 5AQGA 2I7PA 1WOQA 4M7XA 1YUWA 3U8XA 5F1XA 3VF6A 2QWPA 4XH4A 3VF2A 1ATNA 4BREA 3O08A 1TUYA 1XQSC 5ADXA 1XC3A 4JAXA 3AARA 1BG3A 2H3GX 4JD2A 5EY4A 4KBOA 4B1YB 4WQ5C 3IUCA 5JMVA 2P9LB 4IXCA 2I7NA 5AQQA 3DXMA 5EXWA 2ASPA 2W41A 1H1VA 1GLBG 1NGGA 1K8KA 5AQZA 4B1WB 1NGJA 2ASOA 3LDLA 4BRPA 4F9OA 4BR9A 3ATUA 2YI1A 3WQTA 3LM2A 3UE5A 2QWRA 4ISFA 3O1BA 1GLCG 4WYBA 2V52B 2D4WA 4MO5A 1C0GA 3EKSA 2A3ZA 3GG4A 3AAPA 2F9TA 4WQ4C 4H0TB 5AQSA 2IVNA 2VYPA 4GNIA 3VPZA 2HF3A 3ZX3A 4MO4A 2Q97A 3DXKB 3VERA 4BRCA 5AQOA 5ADXH 5LJVA 4CI6A 1BDGA 2GUPA 3QFUA 5F2RA 2WUSA 1RDWX 3MN5A 3R9PA 5AQVA 3UKUA 2A41A 3FZHA 4PKIA 3BF1A 4FPAA 1YAGA 3GOIA 3HZ6A 5BPMA 4CJ7A 2FLOA 5E84A 5F0XA 4Z94A 3ZEUA 4BRNA 4YDUC 4MLEA 1HKBA 3M6GA 4MLHA 1MWMA 3GBTA 3A5NC 5AQNA 1ZC6A 5AQKA 1HPMA 2E2QA 2CGKA 4BRKA 4BR7A 5TKYA 3SMPA 2A6AA 4BVPA 1YVNA 2GWJA 4BR2A 5BRHA 4EFHA 2D0OA 3D2EA 4PL8A 3O6WA 3L4IA 1NMDA 1ZBSA 2FSJA 1BO5O 4DB3A 3LDNA 2DPNA 5KPTA 3O80A 3U9DA 4B1UB 4WQ4A 2QWMA 5CE3A 4CZEA 4M63C 4RCHA 4BC4A 1Q18A 3VF4A 4FL9A 4H5RA 4BRGA 1ATSA 3JXUA 5BPNA 3EO3A 1DEJA 4H0XB 1MA9B 4BRDA 2IVPA 2E88A 5JLHA 1KAYA 4K41A 1C0FA 4BC3A 1HLUA 1CZAN 3QFPA 2GWKA 3C7NA 4XH1A 3HI0A 5ELZA 3O1WA 4H5NA 3L0QA 4H0VB 4O8KA 3A8YA 2P9UA 1QZ5A 1JCFA 2BTFA 4BR0A 1NGEA 3HBTA 3U9ZA 1IG8A 3WXKA 4H5WA 5AZIB 2E1ZA 4CBXA 2A42A 3ULEB 3ZX0A 4BRLA 1MWKA 5AQWA 1HKGA 2FXUA 2P9SB 3CERA 1ESVA 3ENHA 3L6QA 3BP8A 1BWFO 1R59O 1BU6O 5BN9A 3H1QA 1GLLO 1KXPA 3WXIA 4CZKA 1LOTB 3MN9A 3FZMA 4BGBA 1U6ZA 3VEYA 1NLVA 3P4IA 5AZIA 3KVGA 2V7YA 3EL2A 4QS7A 4BRMA 4BR4A 3WXLA 2QW9A 3CQXA 4HTLA 2HF4A 1KAZA 4FWNA 2PBDA 2HMPA 2P9PB 4CBUA 4IJNA 2CGJA 4CBWA 3CJBA 4H5TA 3LL3A 3GE1A 4B1VA 2P9LA 5KPRA 3D2FB 2E2PA 2CGLA 4BG8A 4BRAA 4XH5A 1NGDA 1V4SA 3VEWA 4FWRA 4BRFA 1GLEG 3CJ9A 1YXQA 2J4RA 2ZGYA 4H0OA 2Q0UA 2GTDA 3DWLA 3EKUA 2QXLA 4AM7A 4BR5A 2YCHA 4EHTA 2P9IB 4FWMA 2P9NB 3U4LA 3WT0A 2AP1A 2P9KB 3G25A 1QHAA 5AQXA 3FZKA 4DCHA 4K42A 1QQNA 1DGKN 4BRHA 2E8AA 5AQYA 3VESA 3CJ7A 3WUHA 4FOIA 3ZETB 1G99A 4I6MB 3GL1A 4E1JA 3D7EO 2P9NA 4BGAA 3DXKA 5KPZA 2IVOA 4IZ9A 2ITMA 2CH5A 3H1VX 4FWLA 4J8FA 3UB5A 5JLFA 1NBWA 3C0BA 5AQUA 3MN7A 1QQOA 4CD1A 3LM9A 1T44A 1QZ6A 3VGKA 3A0IX 3OHRA 1NGHA 3AAQA 1E4GT 3VGLA 4JHDB 3LDQA 5AZJB 1X3NA 1LCUA 1SQKA 1GLDG 1D4XA 5FPMA 3WEEB 4LC9B 3FFKB 3IMXA 3VGMA 3QB0A 3VETA 2F9WA 2PAVA 2Q1NA 1J6ZA 4B9QA 2ASMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C1NI 3CETA 2BDPA 5AZJA 1LAVA 4Z4EA 2QWOA 4B9NA 3OBWA 3AVAA 3LAKA 3FLCO 3VENA 3IFRA 2FSNA 1J9AA 2YX6A 3D0PA 3SBGA 5FPEA 4ISEA 5AQHA 3TAQA 1W2BM 5LMNK 1QQMA 1UOCA 4N47A 1BL3A 5I9EB 3CQ8A 1WSGA 3TI0A 4GVMA 4CJVA 4Y0WA 5BRFA 2G8IA 4RG8A 2RKIA 4GMJB 1Z26A 2ZJPL 3KHYA 4CJPA 4YOYA 5EVZA 4B3RK 1F21A 1JXBA 3EZ5A 4FOEA 3O9SA 1QQCA 3QESA 3S5TA 3MK6A 4IG0A 3L2QA 1Q8IA 5EOYA 2A5XA 4KO0A 2HNDA 3SK3A 3CPWM 3QEPA 3KK3A 4ID5A 3FZFA 4B3SK 3ULEA 3RMDA 2QM1A 3DXMB 2O4GA 1NKEA 4IFYA 4DQ8A 2QWNA 2W42A 1BUPA 2X6SA 5C15A 3TR8A 4NO7A 3NH1A 1C1AA 3H3NO 1RBVA 4IOAL 1W97L 4L3QA 4JK9A 1Z6RA 3PO5A 4O0JA 1TV6A 4DS5A 4FW2A 4FLUA 3SMSA 1X9MA 1RTDA 4QOZB 1NJXA 4FK4A 4KRFA 4G1QA 3AVKA 1WSJA 4CJ3A 1RCHA 2D0PA 4AHRA 2Q2RA 3Q7BA 3VA3A 3TWHA 4DR7K 5HLFA 1X9JA 4IDKA 4CECA 2BUPA 4CZIA 1J54A 1FJGK 3SUNA 4JN4A 4FLVA 4A62A 1NK9A 3ZEUB 2F8TA 2D1KA 1ASWA 2FSKA 2YHBA 1IKXA 3VEOA 1HNXK 4DQIA 4CZJA 5KRSA 3E9PA 4H03B 5SZTA 4B9TA 4PA1A 1UWBA 4CHNA 1ZBIA 2VQFK 1WSEA 2PYLA 4BC2A 1HQUA 5M1NA 4KH5A 3P83D 3P38A 5AQMA 3LP2A 4ID1A 4RTFD 2KZMA 2O8FA 3NH0A 5JS2A 3THWA 3PIPL 2G8KA 2VGMA 3O5BA 4WFAL 3UIQA 4J2BA 1IKWA 1B9FA 4CJTA 2EWSA 3H46O 3C7NB 4QCLA 1L3VA 4HUGA 3I8BA 3LPTA 1HNZK 5M1KA 4CGHA 3T1AA 3DJCA 1DTTA 4IJAA 3MWTA 1KFDA 3GDQA 5MLCQ 4BROA 3HJFA 3HTVA 1Q82O 3O4NA 1S1XA 2QTDA 3CQYA 1NGCA 2BH1A 4JI4K 4BY9C 3DMJA 2KKZA 3KK1A 1VQMN 4BDZA 4BRQA 3QEVA 3NF9A 5C42A 3PO4A 5M1FA 1N36K 4FO0A 2VG7A 1YTUA 1EWRA 3CI5A 4NB4A 1S22A 4CZGA 1YJNN 2O8DB 5F1XA 1VQ7N 1Q7YO 3VF6A 3MXJA 2DFHA 3IG1A 4BREA 1XQSC 3ZT1A 2RF2A 1N34K 2NRVA 4JD2A 4CFAA 3IUCA 4OX9K 3RWUA 2ASPA 5T7BA 3VQ9A 4WE1A 1K8KA 1GOAA 3T1YK 4CW7B 1JL2A 4B1WB 5M1QA 2G8VA 1QE1A 3QEIA 4LF7K 3AVCA 3DRSA 4BR9A 4B3MK 3LM2A 3S9HA 2QWRA 2XRIA 1TVRA 3NGYA 4ILGB 4LSNA 2WC9A 2V52B 3RRHA 4MO5A 3EKSA 3THYB 5J2NA 4WQ4C 4H0TB 2HMIA 2OPRA 3ZSZA 1RBSA 4KFBA 3ZX3A 4B9MA 2OZSA 1KVBA 4K8XA 1NK8A 1XI1A 4BRCA 4HVJA 5ADXH 3LZJA 4FYDA 1NK6A 4CI6A 2GUPA 1RDWX 3R9PA 2F8SA 2YNHA 1VK0A 5AQVA 2A41A 3WXMB 1IBLK 1HQEA 3BF1A 1YAGA 1N6QA 1IO2A 5E84A 1GOCA 3DOKA 4YDUC 4MLEA 4CF9A 1D9DA 1YJ9N 1OVQA 4Z4HA 3SQ0A 1JLBA 4PQUA 4FJ5A 1HNWK 4G9ZA 5AQKA 4DG1A 3NGIA 1VHXA 3KLFA 3CCSN 2G8UA 5C2FA 1SKSA 5TKYA 4ELVA 2O8CB 1YVNA 3ASMA 1DT9A 3SV3A 4KHWA 3D2EA 5JS1A 1WLJA 1U48A 1VRUA 3U3GA 1BO5O 4DB3A 4GKJK 2WOMA 2DPNA 3CCJN 4B1UB 4WFBL 3QINA 3PX6A 5CE3A 2ZJRL 1I94K 4MQ3A 4BRGA 3NF8A 3C65A 5BPNA 3HT3A 4H0XB 4FJNA 1MA9B 4BRDA 5HBMA 2BGGA 4JKBA 3JSMA 1B92A 5I3UA 1HLUA 4UY8O 1WNSA 3ZLJA 4DV5K 3AO1A 3AA4A 4CHYA 4JKAA 3L0QA 2P9UA 4DKWA 3EY1A 4XJXA 2HBJA 1K6YA 2BTFA 1DLOA 1YF5L 1NGEA 3HBTA 4QAGA 4DR5K 3CMEN 3U9ZA 3JYTA 4GV9A 3WXKA 2ZD1A 2Z1HA 3THXB 2E1ZA 4YFUA 3AVMA 5AQWA 3U6FA 3ENHA 3BP8A 3WXIA 1GOBA 4J2AA 2UUCK 4GV6A 3CXCM 2D0CA 1U6ZA 3AVIA 4LF4K 2HNZA 1NLVA 3THXA 3CF5L 3NMUA 4BRMA 1VQ5N 3ZSVA 5GINA 2PBDA 2CGJA 4CBWA 3V9XA 1VQON 4Z4CA 2P9LA 4FCYA 3SAHA 4ZHRA 4E0DA 2E2PA 3RTVA 1IG9A 4FJHA 4FJGA 4BRFA 3V1OA 3CFRA 1Q81O 2ZGYA 3DWLA 2QXLA 2P9IB 3OYKA 2ATQA 3WT0A 3CCUN 4FJKA 2XY7A 3ID6A 2P9KB 4YY3K 3K5MA 1QQNA 1DGKN 4BRHA 3KLEA 4RW9A 4YOTA 1VQPN 3RR7A 4DU4A 1G99A 4E1JA 5KPZA 4LH5A 3J80O 1UA0A 3UB5A 4R5PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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