2P9LA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
415
structure length
399
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 124
structure length 399
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2p9lA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9lA04
5AR0A 3QBXA 5EOYA 3VESA 2P9IB 2ZGZA 3DXMB 4B1XB 3D7EO 1KAYA 2EWSA 2V7ZA 2D0OA 3SMSA 4EHTA 4BR0A 5BPMA 2W41A 5AQZA 4ISFA 4H03B 2HF3A 3F9MA 4JNEA 1JCGA 3VENA 2ASOA 3MDQA 2F9TA 4B1WB 1YAGA 3VEYA 2E20A 1RFQA 3AARA 4FO0A 3LDNA 4BR4A 5AQIA 1RGIA 3FZLA 1GLBG 3DXKB 4BRCA 4PKIA 3H3OB 5E84A 3GBTA 1BDGA 3SMPA 5JMVA 4CBWA 5LY3A 4BRLA 3ATVA 3MN9A 3A5OC 5ELZA 2P9SB 1NGGA 3CIPA 1HKBA 3VF2A 4CZHA 3O6WA 4NB4A 4H5TA 2P9LA 3HTVA 3O1WA 2P9UB 2BUPA 5BREA 3UKUB 5AQXA 1NGJA 3CERA 2QWRA 3IDHA 3TU5A 2QWMA 4WYBA 3MN7A 4K25A 2Q2RA 4JD2B 4H5WA 2ZWHA 4BGAA 3QB0A 1NWKA 2W40A 5EVZA 3DWLA 1NGHA 3H46O 3L6QA 2Q0UA 3ID8A 4PL8A 5AQLA 5KQ8A 4CZIA 3AAQA 1MDUB 1T6DA 2GELA 4IWVA 4XH1A 4BC2A 4XEIA 3WEEB 3M3ZA 2Q1NA 4FWLA 2FSKA 3GDQA 4BR2A 3IFRA 4H0OA 2A42A 3CJAA 4EHUA 3ULEB 1TYQB 2E2OA 1HLUA 1JCFA 3C0BA 1KAXA 2ASMA 3RSEB 3DAWA 4O8KA 5FPMA 5BRDA 3DJCA 4MO5A 4QS8A 3LL3A 4XH4A 4EAHD 1NLVA 4YDUA 3WQTA 3WXIA 1MWKA 3GE1A 2AA4A 1BO5O 1XC3A 3A5NC 3BEXA 1WUAA 3CQXA 4BRPA 3HM8A 4BQLA 4H0TB 4JAXA 2IVOA 5AFUA 2ZF5O 4GNIA 4JHDA 2P9NA 4FWKA 4PL7A 2IIRA 3KZBA 2P9PB 5BPLA 3HZ6A 1ATRA 4FWQA 4FPAA 2E8AA 4BR7A 4CZLA 2J4RA 3VGMA 4I6MA 3VEOA 3CHWA 2GTDA 5AZJB 3FFKB 4FL9A 4BGBA 2FF6A 4BQZA 4O5FA 3CJ9A 1U2VB 1YVNA 1BOTO 1GLLO 4H5RA 4CBXA 4EIAA 2OANA 2VCPA 3WQUA 5EX5A 2PBDA 1WOQA 4H0PA 3SK3A 2QWQA 1BU6O 4CJ7A 4CZKA 1QQNA 5AQTA 4AM6A 3R9PA 3CJBA 1ATSA 4ISGA 2CGJA 4QS9A 4RWTA 3O1BA 2V52B 1BA0A 1Q18A 3FLCO 4ISEA 3SLCA 3L4IA 1H1VA 3ZEUB 1NGEA 4B1VA 2QM1A 1KXPA 2I7PA 1HKCA 4QS7A 5AZIB 4A2BA 3H45C 1K8KA 3KHYA 3WT0A 4FWOA 2CGLA 1RDWX 3O08A 4A62A 2QWPA 3O5BA 1MA9B 1E4FT 5BPNA 2GEMA 2YCHA 5BN8A 2PAVA 5FPNA 4FWMA 2A40A 1C0GA 3OHRA 2HMPA 4CZEA 2CH6A 5BRFA 4A61A 3O8MA 3J8AA 3GG4A 3LM2A 1Z6RA 4XH5A 3ZETA 3D2FA 3R6MA 5AQUA 2A6AA 3D2EB 5KPTA 1ZC6A 1BUPA 2FXUA 3FE1A 4BREA 3UKRB 3EL2A 4LC9B 1V4SA 5CE3A 3QFUA 4HTLA 2A41A 3BP8A 1YXQA 1GLDG 3HSCA 2P9KA 4YDUC 3G25A 4BG8A 1HX1A 5E26A 1QQOA 3U9DA 1ESVA 1BA1A 1DGKN 1J6ZA 5JLFA 1SAZA 2YHYA 1GLFO 1C0FA 3B8AX 2V51B 2E1YA 4A2AA 3LDLA 3W3DA 3ENOA 2I7NA 1P8ZA 2CGKA 3LDQA 1BWFO 3QMLA 4L3QA 3VEWA 2DPNA 3ZX3A 1GLCG 1S22A 3A8YA 5AQMA 1XUPO 5AQWA 4M63C 4NO7A 4BRMA 2E2QA 5AQSA 3VF4A 4BRHA 3IMXA 3ZX2A 3GOIA 2A3ZA 3CI5A 3FZMA 2GWKA 4BRIA 5AQOA 3H3NO 3M1FA 3EZWA 4CI6A 1IG8A 1V4TA 4H0YB 1DEJA 4MO4A 5KPZA 5AQKA 4K43A 3WUHA 3JXUA 1R59O 5AQPA 2P9LB 3IUCA 5F2RA 4WQ4A 4BC5A 1MWMA 4Y0WA 1ZBSA 2VWBA 4PKGA 3VEXA 3C7NA 4B1UB 4CZJA 4FWPA 3H6EA 4BRAA 1XQSC 5B8HA 2P9IA 1HUXA 3DXMA 5BR9A 5FPEA 4IJNA 4Z94A 1NGBA 1BG3A 3L0QA 5AQNA 1OKJA 2YJFA 3M6GA 5LJVA 3H1VX 4WQ5A 2F9WA 2D1KA 3CJ7A 3VETA 4EFHA 3WXJA 4J8FA 5AQQA 4BRNA 3VPZA 1HPMA 4FOEA 2FSNA 4RTFD 4CBUA 3DXKA 3FZHA 4BR9A 4IZ9A 3A5LC 3CJCA 1GLEG 5LJWA 5AQGA 3HBTA 2YJEA 4PKHA 2Q97A 3S41A 5AQRA 4CD3A 3MN5A 3CETA 4DCHA 5ADXH 5FPDA 2P9SA 3WXLA 2IVNA 1GLAG 1IJJA 4MLEA 1NGAA 3ENHA 4JHDB 2ZGYA 2P9NB 1SQKA 4M7XA 3QDKA 3WXKA 2NZTA 4CZMA 1X3MA 2P9UA 2A5XA 4IJAA 3UKUA 1YUWA 3BF3A 4I6MB 5AFUH 4DQ8A 2FSJA 5BRHA 4H5NA 4H0VB 4BRGA 4JD2A 1NGCA 3R8EA 2WUSA 4DB3A 4F9OA 4E1JA 2E1ZA 2GUPA 5KPRA 3UE5A 3W0LA 3U9ZA 1LCUA 4JN4A 2FLOA 1NGDA 4IXCA 1U6ZA 3MMVA 5AQVA 3WEEA 3TPQA 5AQHA 4B1YB 4CZFA 1LOTB 2CH5A 4BG9A 3ULEA 3HI0A 1TYQA 1KAZA 1T44A 3P4IA 1T6CA 1TUYA 1K8KB 3RSEA 4WQ4C 1ZXOA 4BVOA 2NRHA 3QBWA 2YHXA 3FGUA 4RCHA 3BF1A 3UB5A 4B1ZA 2NLXA 1NMDA 4H0XB 2VYPA 2QWOA 3H1QA 5AQYA 3EKSA 5JLHA 3AAPA 3VEVA 3FR0A 3LDPA 2E2NA 3ATUA 4H5VA 1NM1A 1QZ5A 2E2PA 3ZETB 4B9QA 3D2FB 4BROA 2BTFA 2H3GX 2QXLA 5EY4A 2Q31A 2QW9A 3FZKA 1Y64A 4FOIA 4K42A 1S3XA 4K41A 2P9PA 2IVPA 2HF4A 1HJOA 1DKGD 2FF3B 4WQ5C 1NGFA 3VEZA 4GY2B 5AQFA 5EXWA 1NBWA 3CJ1A 3A0IX 3LDOA 4BRDA 1JCEA 3QFPA 5AZJA 2UYTA 2E88A 4M7YA 3KVGA 2ASPA 1QZ6A 2P9KB 1U2VA 2YHWA 4MLHA 4BRFA 1ATNA 4BC3A 4CZGA 3VGLA 1SZ2A 2QWNA 3GL1A 4AM7A 3I8BA 4BRKA 3FZFA 5F0XA 5JICA 3ZX0A 3QICA 2KHOA 1E4GT 3A5MC 1NGIA 1CZAN 3O4WA 3EN9A 3JS6A 1EQYA 4CD1A 4DHYA 3VERA 2D0PA 1GLJO 3ZEUA 5ADXA 4KBOA 1Z05A 4IO8A 4FWRA 5AZIA 2QWLA 4BR5A 2Q36A 4BVPA 4FWNA 3VGKA 1G99A 1HKGA 5F1XA 3I33A 2YI1A 5BN9A 2D4WA 1X9JA 4BC4A 3VOVA 5TKYA 3U4LA 4HWIA 2V7YA 3O80A 2AP1A 5AQJA 3D2EA 2HOEA 4BRQA 3CQYA 3BUZB 3EKUA 4FSVA 3VF6A 1QQMA 5I9EB 1TUUA 2Q0RA 3U8XA 3MK6A 3UKRA 2GWJA 3EO3A 3AY9A 3LM9A 3MCPA 2ITMA 4C23A 3C7NB 3MN6A 4FWSA 5KQDA 1D4XA 3SJHA 1X3NA 4FPBA 1QHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AR0A 3VESA 2P9IB 2ZGZA 5JVGL 4CK1A 5BPMA 4GV6A 3KLFA 5AQZA 4H03B 2OPQA 2G8UA 4M3YA 5I3UA 3MDQA 2F9TA 1HYZA 1W9HA 3OYAA 1YAGA 1LWCA 1RFQA 4FO0A 4DV5K 4FLVA 4DR7K 5SZTA 2O4IA 1XMQK 2PY5A 3MX2A 3L8BA 5AQIA 4YOXA 1RGIA 3FZLA 1J5EK 2BDPA 3DXKB 4DTXA 4KHWA 4CFBA 5E84A 3GBTA 5LY3A 4BDPA 3O9QA 4CBWA 4BRLA 4DV0K 2QKKA 3N4QA 2O8CA 2YKMA 3OYJA 2O8FB 3VF2A 4CZHA 4JK7A 3F2KA 4NB4A 1D5AA 1B9DA 5C10A 4FJNA 5BREA 2HHSA 1VQ6N 2QWRA 1QSLA 3THXA 5M1OA 2ZJPL 2Q2RA 4CEZA 3SPZA 2ZWHA 1C0MA 5M1PA 1NGHA 5AQLA 3L6QA 1NNEA 4DQIA 4CZIA 3AAQA 5JS1A 3OBYA 3CCVN 4IWVA 4XH1A 4BC2A 4XEIA 4MQ3A 3PIPL 1WSFA 2YV0X 3L3VA 3CJAA 4OLAA 2HHQA 4BECA 1ZYQA 1T7PA 1TAQA 2Z1IA 1SKWA 4WF9L 3RSEB 5FPMA 3LL3A 3EZ5A 2YNFA 4WFNL 1NK4A 2QXFA 1XMOK 3MEEA 3RR7A 5DMRA 1U45A 4E0DA 3WXIA 3TI0A 3LP3A 3SV3A 3BEXA 3OS2A 4YHHK 3O9RA 4H0TB 3THVA 2IAJA 2RN2A 4IOXA 4KH5A 4GVEA 2NRXA 5J1EA 4JHDA 2P9PB 1MU2A 3PX0A 4CJVA 3CM6A 4CZLA 4JI1K 4JKGA 1VQ5N 4ELTA 3AVJA 2GTDA 5EU7A 3DOKA 1EO1A 2P5GA 1D9FA 5IWAK 3WQUA 1WOQA 3SK3A 3RWUA 1BU6O 1JJ2M 3TSUA 2X6NA 3ISNC 4FXDA 5AQTA 4O8UA 3R9PA 4W5OA 3CJBA 4A57A 4O0IA 2HSTA 4DU1A 3O1BA 3SAFA 3K5MA 4B3MK 4Z4IA 1BA0A 1Q18A 2UXDK 4GV3A 1H1VA 4FJLA 1VSLA 4AILC 3AV9A 2OZSA 1HKCA 5AZIB 2QWPA 4CF8A 4KREA 3O3GA 3IG1A 5FPNA 4FWMA 2HMPA 4I9QA 1VSFA 3AO3A 4A61A 3GG4A 5GAGP 4ICLA 3V9ZA 5AQUA 5AJ3K 2VQFK 1ZBHA 3L2WA 1NJYA 3QFUA 3LALA 4UQGA 4QCLA 3OYFA 3HSCA 4I9LA 1S72N 2XO7A 1HX1A 3QERA 2OA8A 1JLAA 1QQOA 4CEFA 3CD6N 3HVTA 4ELVA 1DGKN 1C0FA 1TL1A 2ZE2A 3B8AX 3OS1A 3TAQA 4LF5K 1WBBA 1QE1A 3ENOA 2CGKA 3PSIA 3QMLA 3OYLA 1N33K 1WSHA 4C1NK 4CJQA 4DKWA 3OYEA 3KK3A 4M63C 4E3SA 3VF4A 4BRHA 3IMXA 4IEIA 3OTOK 4FJIA 4BDYA 2A3ZA 3CI5A 3HO1A 3QEPA 3M1FA 4CI6A 1IO2A 1IG8A 3DLRA 3JXUA 4DSJA 3SUOA 1ZBFA 4GV9A 4G9ZA 4LH4A 1VQ4N 4HVJA 5HROA 1Q9YA 4WQ4A 5LL6Z 4FK0A 1TKZA 1EWRA 4PKGA 3VA3A 4ZTJA 1N36K 4CZJA 3H6EA 4ILHA 1RT7A 4BRAA 1HUXA 4JKAA 2X74A 3OYDA 4DV7K 4B9VA 1Q81O 3ZSVA 3CCMN 3HK2A 2FBXA 5GINA 3HPOA 2F9WA 3DOLA 3LP0A 3OA9A 2D1KA 4GKJK 3VETA 3HL8A 4EZ6A 3WXJA 1FXXA 4WCEL 3L2UA 3VTIA 2ITGA 4CBUA 3ITHA 4CEQA 4IZ9A 1GLEG 5LJWA 3LDSA 4L8RB 2PYJA 1ASUA 3LP1A 4ZTFA 5JENA 3S41A 4CD3A 3VQ8A 4OKEA 5ADXH 1NK5A 1L3SA 3CC2N 4MLEA 3WXKA 1A5VA 3HPGA 3L2VA 3QDKA 2NZTA 4F3TA 3PO5A 4IJAA 3UKUA 1YUWA 4AHTA 3BF3A 4CE9A 1YF5L 2FSJA 1C1CA 4FJ7A 4H5NA 3KD5E 5CR4A 4CJ3A 4H0VB 4Z4FA 4JD2A 2ZJQL 3V9SA 1WAJA 2A1SA 2E1ZA 2OPPA 1OH8A 4IG0A 3U9ZA 3AVIA 2HHHK 2FLOA 4X62K 4W5TA 1U6ZA 3WNGA 4KRFA 4B9NA 1IV0A 3MEGA 3PUFA 4GMJB 2F4VK 2QA4N 5FRNA 1C6VA 1RDDA 3HI0A 1KAZA 5HRPA 1TUYA 4FLUA 2DTUA 4OGCA 1ZXOA 1C0TA 2NRHA 1SL0A 1GOAA 2YHXA 5T7BA 1KD1O 4Z4HA 4B1ZA 4KH6A 5BR8K 4JRPA 1NMDA 1JL1A 3C95A 2VYPA 1YJWN 4CIEA 1YJNN 3EKSA 4E19A 1RTDA 5JLHA 2W00A 3AAPA 4XIUA 4BDZA 3FR0A 3A2FA 3K9JA 3D2FB 1TKXA 2XRIA 2BTFA 3TANA 4JS5A 1Y64A 4K41A 1S1XA 4CJRA 4MFBA 4IOCL 3WXMB 1DKGD 2FF3B 3VEZA 1NGFA 1X1PA 5EXWA 1NBWA 4DU3A 3A0IX 4KAZA 2IC3A 3OBWA 3O9SA 2E88A 2ASPA 2P9KB 2QI2A 3K5NA 3KWIA 1Q86O 3AGKA 3SBTA 3AO2A 4EP4A 1VQMN 2W6KA 3GL1A 3L2RA 3ZLJA 1WSEA 1QTMA 4NXMK 3C6HA 4B9MA 4JI3K 2KHOA 1JLGA 4DTJA 3P38A 4LF9K 4M3UA 3E1YA 3NVMA 4OKJA 1D9DA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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