2P9PA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
412
structure length
388
Chain Sequence
b'GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGKWIKQYTGINAKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 124
structure length 388
sequence length 412
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9pA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9pA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9pA03
2QWOA 5KQDA 3CJCA 3SLCA 1GLDG 3JXUA 2E2OA 2ZGZA 4JHDA 3FZFA 2P9UB 1ZXOA 5FPDA 1DGKN 1JCEA 3U9ZA 2P9SB 3LDOA 3VENA 2A40A 2CH6A 2IVNA 4MO5A 4ISGA 5AQKA 5EY4A 2GELA 3RSEB 1RGIA 3EKUA 1GLAG 2CGKA 1GLFO 4BRCA 1V4SA 5AQMA 2E2QA 3CJAA 3SMPA 2YCHA 4FWNA 4JD2B 2BUPA 2GWKA 3HM8A 2D0OA 4HWIA 3QDKA 4BG9A 4BREA 4BGAA 1NGAA 3AARA 4FWKA 3D2FB 1HKBA 5F0XA 5ELZA 4EFHA 1J6ZA 4FWMA 3C7NA 2ITMA 4RWTA 5KPZA 3QFUA 4MO4A 3SMSA 2UYTA 3VOVA 3WEEA 1MWKA 1NGGA 1QZ5A 2QWRA 3O6WA 3QBWA 4FSVA 2YJFA 3VF6A 1HKCA 2YJEA 4MLEA 3KHYA 1IJJA 2VCPA 1HUXA 4FWSA 2E2NA 1C0GA 4K25A 4QS7A 3IUCA 1GLBG 2P9PB 5AQOA 2AP1A 2PAVA 4F9OA 4A2BA 4E1JA 1G99A 3LDQA 1QQNA 3D2EA 3UKUA 4H03B 4XH4A 3VEWA 5BRFA 3R9PA 2F9TA 3CQYA 4FPAA 2FF6A 4DHYA 3VERA 4IXCA 1QHAA 4BR4A 3CHWA 4JHDB 1SQKA 3VEXA 5BN8A 3LM9A 1BUPA 2NZTA 3BUZB 3CETA 2CH5A 1X3MA 1X9JA 5JLFA 5AFUH 2E8AA 3FGUA 5E84A 4BRQA 2BTFA 4FOEA 4BR5A 1RDWX 3AY9A 3RSEA 2HMPA 2Q97A 2ZF5O 1LCUA 4BRPA 1GLCG 4M63C 1D4XA 2WUSA 2Q0RA 5JICA 4K41A 4H5TA 2QW9A 3HI0A 3C7NB 4H0PA 1TUYA 1KAXA 2GUPA 5EX5A 2NRHA 4FWPA 4CZKA 1JCFA 3UB5A 1HKGA 3WEEB 4JNEA 5KPRA 4I6MA 4EHTA 4B1UB 2W40A 2IVPA 5AQZA 5EVZA 4BRHA 4CZMA 1EQYA 3VGLA 4BRKA 5ADXA 1U2VA 3VEYA 4Y0WA 4BR9A 1OKJA 1NGHA 2J4RA 4CD1A 1XQSC 3WXLA 2H3GX 4H5WA 1XUPO 3GG4A 3VESA 2ZWHA 3D2EB 4LC9B 3UKUB 1NGDA 1NBWA 4PKGA 5AZIA 3SJHA 2A41A 3M3ZA 1K8KA 4DQ8A 5I9EB 3A0IX 3U8XA 1HPMA 1HX1A 1Z6RA 4FWRA 4O8KA 4BQZA 4A2AA 3CQXA 4PKIA 3WUHA 2FSNA 4BRIA 4CZEA 3D7EO 2E1ZA 4H0OA 2A5XA 4GNIA 3AAPA 5LJWA 3P4IA 2E2PA 4CBUA 5BREA 1NLVA 3O8MA 1BOTO 3O5BA 3H1QA 1E4FT 1MA9B 2YHWA 1ESVA 3LM2A 2KHOA 1KAZA 3ZX2A 4IO8A 3VEOA 1ZC6A 4HTLA 2FLOA 4I6MB 4WQ4A 3ATVA 5AQWA 3GE1A 4BRFA 3UE5A 4B1XB 1U2VB 3FLCO 4WYBA 5AQJA 2CGJA 2PBDA 1BA1A 2V51B 4CI6A 1YUWA 1RFQA 4BVPA 1H1VA 2P9LA 2YI1A 4NO7A 3QMLA 5JLHA 1SAZA 2FSKA 3H3NO 3HTVA 3WQTA 4PL8A 4B9QA 1Y64A 2QWMA 2P9KA 5AZIB 1CZAN 5ADXH 1ZBSA 4H0YB 1QQOA 3CJBA 4BR0A 4BRAA 3WXIA 2QM1A 5AQTA 1K8KB 3VGMA 1SZ2A 1NMDA 4CZFA 4DCHA 4B1YB 2QWPA 4H5NA 1NGCA 3CJ7A 3GBTA 4JAXA 3ID8A 5F1XA 3L6QA 3LDPA 3IFRA 3DXKA 3CERA 3CIPA 3DXMA 1HJOA 1KAYA 3VEVA 1X3NA 3S41A 4BRMA 5FPNA 3A5NC 3R8EA 3ZX3A 5KQ8A 3H46O 3ZETA 4PL7A 1GLJO 2I7PA 4FO0A 2ZGYA 1R59O 3A5LC 1YXQA 3DJCA 3M1FA 4B1ZA 2E20A 3H6EA 4H0XB 5E26A 5BR9A 3G25A 3OHRA 3ENOA 4CBWA 3W0LA 1NGFA 3MCPA 4C23A 5AQUA 3IMXA 3U4LA 4MLHA 3GDQA 3SK3A 2P9LB 1YAGA 4A61A 4WQ5A 3IDHA 3EO3A 5FPEA 2Q2RA 4M7XA 3ZEUA 2D0PA 4B1WB 3CI5A 4O5FA 2NLXA 4IWVA 2V7ZA 1DKGD 1P8ZA 2FSJA 2P9KB 2VWBA 3BF1A 3MN7A 5BRDA 3ULEA 2GWJA 3MK6A 4FOIA 2YHYA 4FWLA 4H0VB 3BF3A 3VF4A 2A6AA 4KBOA 1GLLO 1TUUA 4H5VA 3W3DA 2HF3A 4BC4A 2QWNA 4RCHA 4BVOA 5AR0A 3H45C 1KXPA 5AQFA 2W41A 2F9WA 3O1BA 1S3XA 4FWOA 3DXKB 3FZKA 3QFPA 4BG8A 1NWKA 3DXMB 3I8BA 5CE3A 4FWQA 5EOYA 4BC5A 3HBTA 4H0TB 1T44A 5AQYA 1GLEG 3HZ6A 5BPMA 4B1VA 1HLUA 1NGJA 5AFUA 4BC2A 5F2RA 3ZETB 4K43A 3O4WA 2DPNA 4CZHA 4CZJA 1S22A 2E88A 3MDQA 2IIRA 2QWLA 2A42A 2IVOA 3H1VX 2GTDA 3CJ9A 5AQPA 4M7YA 3HSCA 4AM7A 2VYPA 2E1YA 2P9IA 4GY2B 4PKHA 4J8FA 3GOIA 3WXKA 3B8AX 4JN4A 4CJ7A 1E4GT 2ASOA 4QS8A 4BGBA 2CGLA 3ENHA 1LOTB 4EIAA 1NGEA 4WQ4C 4AM6A 3ZEUB 5AZJA 2FF3B 3TU5A 3I33A 3M6GA 4CZIA 3DAWA 5B8HA 3EN9A 5BPNA 3ULEB 2V52B 3FZLA 2EWSA 2I7NA 2AA4A 3UKRA 4XH1A 4CBXA 3O08A 1WUAA 3DWLA 3QBXA 3ZX0A 1ATRA 1YVNA 5AQRA 1ATSA 3FE1A 3FZMA 4YDUA 5JMVA 3KZBA 4ISFA 5BN9A 4BRGA 3C0BA 5BPLA 2QXLA 4IZ9A 5AQNA 3WT0A 4YDUC 3F9MA 3AAQA 3TPQA 3VEZA 3VGKA 1BWFO 3U9DA 4EAHD 3JS6A 2Q1NA 4L3QA 1Z05A 4QS9A 4FPBA 4Z94A 1T6DA 1NM1A 1BU6O 2Q36A 1TYQA 4XH5A 3VF2A 4BC3A 2D4WA 2P9NA 1U6ZA 2GEMA 4NB4A 1BDGA 5AQGA 1MWMA 2QWQA 3FFKB 3ATUA 2HF4A 4FL9A 4H5RA 3BP8A 2FXUA 3L0QA 3WQUA 1MDUB 5AQQA 4BRDA 2ASMA 5AQLA 4BRNA 5AQSA 3WXJA 1T6CA 3LL3A 2P9UA 1DEJA 2D1KA 3J8AA 3BEXA 3VETA 4BRLA 1QQMA 2P9IB 3EZWA 3MN5A 1NGBA 2OANA 2P9SA 3KVGA 3QICA 1IG8A 2HOEA 3CJ1A 3O1WA 1BG3A 1C0FA 5TKYA 3MN6A 2A3ZA 5EXWA 5AZJB 3FZHA 4JD2A 3QB0A 4BQLA 2Q0UA 4BR2A 4IJAA 1V4TA 5AQXA 3R6MA 3D2FA 3UKRB 2Q31A 4WQ5C 3LDNA 3A5MC 2YHXA 4RTFD 4ISEA 5AQVA 3O80A 4A62A 4EHUA 4IJNA 1JCGA 4DB3A 3MMVA 1NGIA 5BRHA 1BO5O 5LY3A 4CZGA 3EKSA 4CZLA 3L4IA 3MN9A 1QZ6A 4BROA 2ASPA 5KPTA 1XC3A 5AQIA 4CD3A 3LDLA 2P9PA 4K42A 3FR0A 4XEIA 1ATNA 3GL1A 5LJVA 1BA0A 5AQHA 3VPZA 5FPMA 1WOQA 3A5OC 3EL2A 3A8YA 1TYQB 3H3OB 2P9NB 1Q18A 2V7YA 4BR7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RMCA 5KQDA 1VK0A 4CCHA 2E2OA 3QO9A 4LFAK 1RDBA 3CC7N 4N47A 2O8CB 2P9UB 4R5PA 5FPDA 3AV9A 4OKJA 1ILYA 5MLCQ 2GELA 2OA8A 4GKKK 1GLAG 3K59A 4B3RK 2G8UA 1GLFO 1BISA 3DRRA 1N5YA 3HM8A 2D0OA 4PY5A 1GOCA 1WSGA 3D2FB 1J53A 4FWMA 1C1CA 3C94A 3DM2A 1VQNN 5KPZA 3QFUA 4MO4A 3SMSA 2HHVA 3OYJA 2OPPA 2UYTA 1RBRA 3QBWA 3D6RA 2B4JA 2YJFA 1HKCA 1CLQA 1JLBA 2YJEA 3K2PA 2VCPA 1HUXA 4UY8O 4AHVA 3C6UA 1C0GA 4DSEA 4CF2A 4CGIA 2P9PB 3AO2A 4FJ5A 1N6QA 1NK6A 3OYIA 3SZ2A 3LDQA 4IFEA 4JI2K 3CD6N 1I94K 3IAYA 3SQ4A 4JI0K 1QHAA 4BR4A 1TL3A 2HBKA 3VEXA 5BN8A 3LM9A 1T8EA 3QEXA 3KD1E 2CH5A 5FROA 1X3MA 3AO1A 1B92A 2VG5A 3SNNA 3QIPA 1S9GA 2A1SA 4BRQA 1RDWX 4W5OA 3AY9A 2HMPA 2WBNA 4JKDA 3HVRA 2DY4A 1LCUA 3PY8A 4X62K 2Q0RA 4CFBA 4K41A 2QW9A 3PX0A 3HI0A 4LSNA 4O0IA 1VQPN 1SL0A 1TUYA 2P1JA 2YX6A 4NLCA 3V9UA 2NRHA 3ID6A 1ASWA 4DFJA 5HRNA 4CHZA 5KPRA 3V6DA 3CCSN 1NOZA 2W40A 5GAGP 4BACA 4X66K 4FM2A 1U2VA 3PUFA 3VEYA 3VQEA 2F8TA 4J2BA 1HQEA 2ZQBA 4V19S 1SL1A 1DT9A 4B3OA 3ZT0A 4C1NI 1CZBA 4X65K 5AZIA 4LY7A 3OYLA 1K8KA 4DQ8A 4DSLA 1HX1A 4FWRA 2XY8A 4O8KA 1ZBLA 4CJTA 3WNGA 4W5QA 2FSNA 3D7EO 1RDCA 5AJ3K 3OYDA 3DLBA 2A5XA 5HRPA 1KFSA 1EWRA 4FM1A 5J2MA 2BGGA 4CBUA 1NLVA 1QE1A 1D8YA 3P38A 3J7ZO 4FJJA 4DS4A 3H1QA 3S3NA 3PV8A 2KHOA 3ZX2A 1EXQA 1B9DA 4JS5A 4LFCK 1O1WA 1BL3A 3AGKA 2HVHA 3OVNA 3VQ4A 3ATVA 3SQ0A 4BRFA 1J9AA 2YNGA 1U2VB 4WYBA 4B1XB 1YJWN 2CGJA 3P39A 3RMAA 1BA1A 1BIZA 2OTJN 1ASVA 4BVPA 4LH4A 2P9LA 5C2DA 4GKJK 3L8BA 3KIOA 4O55A 2KKZA 3QMLA 1SAZA 3WQTA 3SCXA 1FW6A 2P9KA 5AZIB 1CZAN 3HK2A 1ZBSA 3HPGA 1QQOA 3WXIA 1FJGK 1K8KB 3VMFB 4CFDA 1X9WA 4FK0A 3CJ7A 1L3SA 3CMEN 1NK9A 4JI3K 4JAXA 3PSFA 4LH5A 3WXMB 4FZZA 2DFHA 2QA4N 1NK5A 1T3VA 3LDPA 1C6VA 3IFRA 4ELTA 3TAFA 3CYMA 1HJOA 3ZT3A 1C0TA 3A5NC 1BIUA 3R8EA 3ZX3A 5KQ8A 2IAJA 3G10A 3A5LC 2HHQA 3TSUA 4DFMA 3DJCA 3T69A 2UXBK 3OW2M 4FJIA 4FXDA 3MCPA 4C23A 3JSMA 5AQUA 2EHGA 4EZ6A 4KHSA 4DR1K 4ILJA 4LF8K 4C1NK 1XNRK 2P9LB 3O4NA 1RBTA 2WONA 4YY3K 5FPEA 4FJGA 1YTUA 4N76A 1HR0K 3CFRA 4DTXA 1TL1A 2NLXA 4HHTA 2P9KB 5FRNA 1W0HA 2GWJA 4I2PA 4ID5A 3ULEA 4FWLA 4KRFA 4JRQA 2A6AA 1OH6A 4IEIA 1EP4A 2D5RA 5I3UA 4DSJA 1TUUA 3HYFA 4RCHA 4JI6K 1KXPA 3O1BA 2GUIA 3KLHA 4CFCA 2B6AA 1QS4A 3ITHA 4FW1A 3I8BA 5CE3A 1GLEG 4FJXA 1HLUA 3BGRA 3E9LA 1OVQA 4CHYA 3N4QA 3OJUA 4DQRA 3O9RA 2IIRA 2QWLA 3AVGA 2G8HA 4B8AB 3NCIA 1SS6A 2ETJA 2IVOA 3VTHA 2AJQA 1LV5A 3CCMN 3CJ9A 4M7YA 3SAFA 1NK4A 1Q9YA 3GOIA 1D9DA 1W2BM 3DLGA 4DS5A 3AVIA 4WQ4C 4AM6A 5CZ1A 1E3MA 1K9MO 4CIFA 1TKXA 4FJMA 3OS1A 1WB9A 5BPNA 3ULEB 3OS2A 1WBDA 4C8OA 2I7NA 4XIUA 4KI4A 2Z1GA 1VQ7N 4CBXA 3L2RA 4CJSA 1T05A 1WUAA 3DWLA 3QBXA 4JKHA 1QTMA 4FJKA 3U3YA 3ZX0A 3SBTA 1NJZA 3VQ8A 3AA5X 1WBBA 5CY4A 3C0BA 1J5EK 3K5LA 2QXLA 5AQNA 1Y97A 3RWUA 3CCRN 3D0PA 4JI7K 3VGKA 3TPQA 4FK4A 3DI6A 3U9DA 4DV0K 3JS6A 4QS9A 3V9SA 1Z05A 4Z94A 4DV6K 1T6DA 4CF8A 1NM1A 1BU6O 3AO4A 3KLIA 3OYGA 2D4WA 4YHHK 1IH7A 4FLVA 1X9MA 4CHNA 2O4IA 5AQGA 3CPEA 3PO5A 1R0AA 1IBKK 4FL9A 2WTUA 4F4KA 3BP8A 2FXUA 3L0QA 4BRDA 1BHLA 4CJ3A 1LW2A 2VGMA 2ASMA 2DTUA 5AQLA 4Z4GA 1YJ9N 2NRRA 3L2WA 3TANA 3LL3A 1DEJA 3J8AA 3MX2A 3EZWA 4ICLA 4M3ZA 1RBSA 2P9SA 1M1KO 4FZXC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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