The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
54
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
TYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ultrahigh-resolution backbone structure of perdeuterated protein GB1 using residual dipolar couplings from two alignment media
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| molecule tags |
Immune system/protein binding
|
| total genus |
11
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GLS C; 2PW9 A; 3V3X A; 2I2Y A; 1IBX B; 1K52 A; 3MP9 A; 1UWX A; 2IGD A; 2JSV X; 1XCT L; 1C9F A; 4WH4 A; 4HKZ E; 1P7E A; 2JWU A; 1IGC A; 1MVK A; 2GB1 A; 2NMQ A; 1Q10 A; 1K51 A; 1FCL A; 1P7F A; 2JZP A; 2PLP A; 3FIL A; 2N9L A; 2KDM A; 5JXV A; 2LHE A; 3UI3 A; 2N7J A; 1F2R I; 2RMM A; 2IGG A; 1GB4 A; 2LGI A; 2JU6 X; 5HI1 A; 4IKG A; 1PGA A; 2ONQ A; 1KH0 A; 1MHX A; 1ZXH A; 1FD6 A; 2J52 A; 2RPV A; 1HZ6 A; 2KQ4 X; 1IBX A; 1JML A; 1D4B A; 1HZ5 A; 4MAC A; 1MPE A; 2QSD A; 1MI0 A; 1F2R C; 5BMI A; 4OZA A; 1MHH E; 2J53 A; 4IOI E; 4OZB A; 1HEZ E; 2ON8 A; 2ZW1 A; 2I38 A; 1XF5 L; 2QMT A; 4KGR A; 2PTL A; 1K53 A; 4KGS A; 4KGT A; 1EM7 A; 3GB1 A; 2KAC A; 2KWD A; 4OZC A; 2KN4 A; 5HHD G; 1YNT E; 2EEL A; 5BMG A; 2OED A; 2IGH A; 1GB1 A; 2LUM A; 2GI9 A; 1PGB A; 3FIL B; 2LHD A; 1XCQ L; 2K0P A; 2JXT A; 5HG2 A; 2N9K A; 5HFY A; 1FCC C; 1PGX A; 1IGD A; 1QKZ A; 4D2K A; 4HJG E; 1YMH E; 1K50 A; 5BMH A; 2ZW0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3T3O A; 4K3C A; 4KVG B; 1CJE A; 3H8H A; 2MX2 A; 2WDR B; 3H9D A; 2WHI A; 3Q69 A; 2KWV B; 5E6N A; 2K1F A; 5CHV C; 3Q2A C; 2QDF A; 3WAM A; 3DDC B; 3AI5 A; 2JRI B; 4XDD A; 1HA5 A; 3HIZ A; 4IG7 B; 2EMT A; 2KDM A; 2A4Z A; 4GB9 A; 2K3U A; 4LCD E; 3TSS A; 3OJ4 B; 1E8Y A; 1GB4 A; 3I57 A; 3URY A; 1V80 A; 4GDL B; 3MTN B; 1SE4 A; 2G45 B; 1YJJ A; 2LXA A; 4K3B A; 5GXG B; 1MHX A; 1YJ1 A; 4RFB A; 1E7U A; 2KQ4 X; 4USA A; 1RLF A; 1PFD A; 2WQY B; 3Q8F A; 3ZW3 A; 4HJK A; 4NY0 A; 2W3S A; 1WX8 A; 1WZ0 A; 2W55 A; 2D3B A; 2OJR A; 1E8Z A; 2J53 A; 2L0F A; 3EEC A; 3QQ8 B; 2CR5 A; 4HXD A; 4OZB A; 2V1Y A; 4II2 B; 5CX3 A; 2KZR A; 1GAQ B; 4S17 A; 4OZC A; 4MEM A; 2DAF A; 2CU3 A; 3RN9 C; 3MC8 A; 4MGI E; 2W82 A; 4M8M A; 4YTP B; 3QHT A; 3VTV A; 2AWT A; 4EZJ A; 4CQN A; 1ACC A; 1BT0 A; 2INN E; 1ZGU B; 4MSM B; 5D3D A; 4G50 A; 3BYY B; 5HG2 A; 2DNF A; 2WX0 A; 3P4P B; 1UGM A; 2WX1 A; 3AE5 B; 2X38 A; 2IZV B; 3TJP A; 1HE8 A; 2C5L C; 2MH7 A; 1HTO A; 2G9H D; 3ZNG C; 2WXQ A; 5CHW A; 2KMM A; 1H4R A; 4ANX A; 1UF0 A; 1NYR A; 4IC7 B; 4MGZ E; 3N1X C; 4XYC A; 3RNG C; 1NEN B; 1ET6 A; 2DX5 B; 2ZPN A; 3VH3 B; 2KDB A; 2O6V B; 2GB1 A; 2NMQ A; 1S3S G; 1F77 A; 1JRU A; 1P0R A; 1JQ4 A; 2PLP A; 4ARI A; 3R2I A; 4W9E A; 4E3C A; 1WJU A; 2WDT B; 2BTE A; 3DVG Y; 4DQO C; 2JU6 X; 1GC7 A; 4J3O D; 1JWA D; 4F1S A; 1UD7 A; 5C2T B; 1E9M A; 1FD6 A; 1FPY A; 1IBX A; 3AM9 A; 2FCN A; 2JYT A; 3PS6 A; 2INC C; 1GOZ A; 4C4V A; 1TZ1 A; 1QOA A; 4WJN A; 2KAN A; 2V9H A; 3ZNZ B; 5HKH A; 2K9X A; 3BWU D; 3LYY A; 2BB6 A; 1V97 A; 2QMT A; 3V61 A; 4ZYS A; 2NTS A; 2L32 A; 1FMA D; 2NPT B; 1AWD A; 2K22 A; 2WXJ A; 2R2Q A; 1N62 A; 2KD0 A; 2NBW B; 2O6V D; 1JW9 D; 3PZ8 A; 1T3Q A; 1WMH B; 3GP7 A; 4E74 A; 1GB1 A; 3Q3O C; 2KK8 A; 1L6V A; 4WJQ A; 1FXI A; 1WRI A; 4BBN C; 1TT5 B; 1UWM A; 4E71 A; 1PGX A; 5CTR C; 1WGD A; 1E7P B; 1ENF A; 2JXX A; 1FRR A; 1K52 A; 2VZK D; 2ICI A; 4K1R B; 4A55 A; 2FCM A; 2V3N A; 2O2V B; 1P7E A; 1E8W A; 1MVK A; 1TZO A; 3AXC A; 3LJ3 A; 1TIF A; 3L16 A; 3H6N A; 1QQR A; 4URK A; 1RAX A; 1ZOY B; 2L8J A; 2ZZP B; 1IP9 A; 5G5H A; 3QCA A; 4YSX B; 3UIO B; 2J0J A; 4J6I A; 4WQM A; 2LWP A; 3AN1 A; 1WXV A; 1N6Z A; 1J7A A; 2RPV A; 1HZ6 A; 1L6U A; 3W1S C; 1D4B A; 2JRH A; 3M95 A; 1PYW D; 1MPE A; 4RH6 A; 3VR9 B; 3QK0 A; 3IVF A; 2JF5 A; 1EU3 A; 4WAA A; 3SU8 X; 4BAX A; 2MBH A; 1AN8 A; 1E90 A; 1I42 A; 4ZHO A; 2N4F A; 2MW5 A; 3VQI A; 4N59 A; 3AEC B; 2WDQ B; 4GXB A; 5BMG A; 1DOI A; 2L0T A; 3DWG C; 4PT5 A; 1WXA A; 2MRP A; 2AEH A; 3RUI B; 1RFA A; 3NVV A; 1EWC A; 3AV8 A; 3QJZ A; 1TY2 A; 2KDF B; 2IY1 B; 2IY0 B; 3AED B; 3AE3 B; 1YN4 A; 4MEL A; 1NVI D; 3DPD A; 2W9N A; 4IUM B; 3B1L X; 2K8B A; 2WXF A; 4W9I A; 2Z0D B; 2N0S B; 1WXM A; 3L0W B; 2BKR B; 2KFJ A; 2KMA A; 2MP2 B; 1EUV B; 4N58 A; 3E56 A; 2IGD A; 2M8S A; 1HQR D; 5LLI A; 1WI0 A; 3MHS D; 4LK0 M; 2MQJ A; 2HD5 B; 3PRM B; 4A8X C; 4ZHP A; 3RPF C; 2TSS A; 1SJH D; 1H8C A; 4LDT D; 1P7F A; 4W9C A; 3AUL A; 4HWI B; 3W5V B; 2L3Z A; 3BII D; 2DEN B; 2KNB A; 4IM2 A; 3NY5 A; 1G6J A; 1NI2 A; 1I35 A; 1FNW A; 4PK1 A; 4B9K A; 4REZ A; 4NPN A; 1WX9 A; 1SBB B; 4X57 B; 1F2R I; 3KVF B; 4ACF A; 2K8H A; 4XX5 A; 4AJW A; 3UGB B; 1LQB A; 4IWQ A; 3WAO A; 4DXA B; 3JSV B; 3I9V 1; 3VRA B; 1FXT B; 5C23 A; 2VH1 A; 2LGS A; 2PE9 A; 3PPA A; 3IG3 A; 4MAC A; 3P63 A; 2FE8 A; 3CST A; 5BYQ A; 4EZK A; 2V4L A; 2ON8 A; 2MCN B; 2I38 A; 3WA0 A; 3L17 A; 2PTL A; 3N9Y C; 1K53 A; 3HM3 A; 3ONS A; 2IJ0 A; 2LMC A; 2C9W B; 3P1M A; 2VRR B; 4JWS C; 1KOT A; 4L2Y A; 1SIF A; 4HPM B; 3W1S A; 2KO3 A; 1E7V A; 4CHK A; 3C8Y A; 1MJD A; 2UWQ A; 2FAZ A; 2K0P A; 4AOF A; 5BYS A; 4ASW C; 2J0K A; 2LXC A; 1T5X D; 1WGR A; 3DHI C; 5LXH A; 1WM3 A; 1C77 A; 3A9K B; 3UIN B; 4BKS D; 1WJ6 A; 2NTT A; 2K25 A; 2JQR B; 2KWU B; 1EF1 A; 3I63 C; 5J18 A; 1D5M C; 2MBB B; 3AE1 B; 4MH8 A; 2QCZ A; 5EE0 A; 4W9H A; 1VD2 A; 3EGR A; 3DBH B; 2M17 A; 2DBY A; 3SFE B; 4EZL A; 4B0E A; 4A6Q A; 1YX6 B; 4EE2 A; 2LHE A; 2WXM A; 1KLG D; 3GZN I; 3U8Z A; 1E0Z A; 2BS4 B; 2N7J A; 3O65 B; 2Z59 B; 3KUZ A; 4LNO A; 2JT4 B; 2DHZ A; 2FID A; 4NNJ B; 5AZH A; 1JWB D; 3A4R A; 3QIJ A; 1NEK B; 5G2N A; 3NS8 A; 1WGK A; 3R2T A; 2J0M A; 1B9R A; 3MC0 B; 2L05 A; 5G55 A; 4OZA A; 2KJ6 A; 2MBE A; 2QIE B; 2BBC A; 3ECI A; 2L76 A; 2A5U A; 4WJO A; 4R3D A; 1IUE A; 3AB5 A; 4YL8 A; 2ACZ B; 2ZJD A; 2LRW A; 4GU2 A; 2ZNV C; 2EEL A; 4EUT A; 4QAY A; 2HDE A; 2LVO A; 2KJR A; 3L54 A; 2DLB A; 2IPK D; 3W5U B; 4ZOH C; 4PS7 A; 3RNF C; 4JPS A; 1RYJ A; 3ETR A; 4H2A A; 2N9E B; 1FIQ A; 3TEW A; 2XK5 A; 3NS1 A; 3ZYY X; 3U2S C; 4L23 A; 1WIA A; 2IO2 B; 2PMV A; 4GLS C; 1E8X A; 3VUX A; 3AU5 A; 2MJ3 A; 3I3T B; 1PUT A; 1NDD A; 3DQV A; 1WGG A; 2WLB A; 3LDZ E; 2WXG A; 1OQR A; 1FNU A; 2Z0E B; 1VRA B; 4N9F 4; 1L7Y A; 4HPP A; 3DOW A; 2N1W A; 1TKG A; 1V2Y A; 4IM3 A; 1L0X B; 2N9L A; 4W9L A; 1V5T A; 2JZ3 B; 2JY6 A; 2CHW A; 3A4S C; 2WXI A; 5EE3 A; 2KMC A; 2QC8 A; 3OJ3 A; 2ONQ A; 2ZNV B; 2M0A A; 2BPS A; 5AEK B; 1SF0 A; 3Q3J A; 2Y5P A; 2FIF A; 2BB5 A; 2ZCB A; 4I6L B; 4RM9 A; 1E5W A; 2LJI A; 1I7H A; 4TV3 A; 2LI5 A; 4AQ7 A; 4GMV A; 2PPH A; 3DVG X; 3VVW B; 1XF5 L; 4HRO A; 1WGY A; 1T0S C; 1ZE3 D; 5DPT A; 3ZXR A; 3ZXV A; 3ZUN A; 1WGH A; 2RPQ A; 5E6J A; 4KGT A; 3GB1 A; 2LRU A; 1I4P A; 4NAW A; 1YQ3 B; 3JVZ X; 4LNF A; 1VLB A; 3BVZ A; 1I4G A; 2G4D B; 1QIL A; 2BS2 B; 4HDQ A; 3NVY A; 3T9L A; 1N5W A; 5CHF A; 4K7W A; 2D10 A; 2RDH A; 1TYG B; 2LUM A; 3UQA A; 5H92 C; 4HVB A; 3RT3 B; 1GNU A; 4IW0 A; 3JW0 X; 5L83 A; 2WU5 B; 4FHK A; 4M8N A; 2KHW B; 1YMH E; 4M0W A; 2N7D A; 2BYE A; 2L52 A; 4OVV A; 3V3X A; 3I5J C; 1SSN A; 3DBH I; 1IBX B; 3A33 B; 2AQ1 B; 4JGH B; 1UWX A; 4FJZ A; 4XZ4 A; 4C4V B; 5EE1 A; 1XEE A; 2JYE A; 3RNB C; 2ZVN A; 3PV1 A; 3ZTC A; 2FNJ B; 4GGQ A; 2M1M A; 1K51 A; 1J0G A; 3MJW A; 1FCL A; 1Z2M A; 1YOV B; 1TS5 A; 1JRO A; 3AE9 B; 2WWZ A; 4DWF A; 3R8B A; 4WUR A; 3BYT B; 1CMX B; 1J8C A; 5TSS A; 4ZRK A; 1SE9 A; 2L1A A; 1RFK A; 3P4R B; 1QF6 A; 4MH0 E; 3V6C B; 4F8C B; 1ROE A; 4WWN A; 3VAW A; 1AYF A; 1V1P B; 4ANV A; 3V05 A; 1L2N A; 3VTU A; 1FM0 D; 1DYQ A; 2AL6 A; 3SD5 A; 3AE6 B; 2W54 A; 1HEZ E; 1AW7 A; 4FA6 A; 1CQV A; 2KFK B; 3Q14 C; 4PYU A; 2JZZ A; 2BS3 B; 2D5G A; 1LO5 D; 3VDZ A; 3U52 E; 3CMM B; 1OGW A; 3RI7 C; 4W9F A; 2BT6 A; 4FN2 A; 4YSY B; 2B76 B; 2GBK A; 4G11 A; 4XE0 A; 1N63 A; 3P42 A; 4KDI C; 2WXL A; 1T0Y A; 2KQ7 A; 1J7B A; 4RGM A; 1QOB A; 4LTU A; 4N6E B; 4PS3 A; 3U7Z A; 1MFW A; 2Y5C A; 1XO3 A; 2RD0 A; 2GBR A; 4TQ0 A; 3RZW C; 3O13 A; 4D2K A; 4HJG E; 3GOE A; 1I4Q A; 5IN7 A; 3NJT A; 1C3T A; 2OHF A; 3N3K B; 5JHA A; 1XLO A; 2Y5B B; 1V1P A; 1XD3 B; 1SJE D; 4I6P A; 1YQ4 B; 1OTR B; 4FJY A; 2QJL A; 3Q8B A; 1NI3 A; 5J2R A; 1LXD A; 1TS3 A; 3PRZ A; 5H8Y E; 2SAK A; 1WFY A; 2KFK A; 2L83 A; 3FIL A; 3TCA A; 3WCQ A; 1UNS A; 3Q8A A; 4IKG A; 1C76 A; 1R4M I; 1VR9 A; 2K5P A; 4KZ0 A; 4M02 A; 1M94 A; 1QLB B; 1NBF C; 2XEW A; 3A1Q A; 3HUI A; 1MHH E; 5D7G A; 2E3T A; 4XC2 A; 3PO0 A; 2E6X A; 2ZW1 A; 3PTF C; 4KDL B; 3ZNH B; 4W9J A; 1UBQ A; 4P16 A; 1MG8 A; 3KW5 B; 4ARC A; 3PHW B; 2KWD A; 2KTR A; 1JWM D; 3GS2 A; 3GZN B; 4K7U A; 4B0M A; 3DBR B; 2XN9 C; 4L1B A; 4DK5 A; 1V5O A; 3SHQ A; 4WIP A; 5IAA C; 1QOF A; 1DGJ A; 2WU2 B; 2GI9 A; 1PGB A; 4KZC A; 3PGE A; 3RNC C; 5AUK A; 4Q2J A; 2K8C A; 4ICU A; 5EE9 A; 2MA9 B; 3KQ4 A; 5DPS A; 2V0G A; 4GIV A; 3AEA B; 2KX0 A; 3CWI A; 3W2D A; 3ZKJ C; 1CK1 A; 4YTM B; 2NVU I; 1LFD A; 3QA8 A; 2C7M B; 3TIX A; 3N30 A; 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1KLV A; 4US8 A; 1A70 A; 2RGF A; 3DHG C; 3AEE B; 2M19 A; 1B1Z A; 2N1V A; 5T8I A; 4CO7 A; 4WAF A; 2MLB A; 1ZXH A; 1ESF A; 3ENE A; 4XWW A; 3K9P B; 3N20 C; 1JML A; 3PZD A; 2HTM E; 2WXK A; 4K7S A; 2W3R A; 4BKS A; 4HKQ A; 4C56 C; 3ALB A; 1VJK A; 2XK5 B; 4F7Z A; 3DBR I; 2IND C; 3R7Q A; 3A9J A; 1WXS A; 3RUL A; 1DOY A; 1PDX A; 3BK2 A; 2MJD A; 3V6E B; 1D5X C; 3UQB A; 2HTH A; 4W9G A; 4BOZ B; 2NCN A; 4AJY B; 2GRI A; 2Y3A A; 1P98 A; 3W1Y A; 3WAL A; 1FNV A; 5G5G A; 2IGH A; 4M00 A; 3Q3F A; 2K6Q A; 2KVZ A; 3PRE A; 2MBO A; 2KJH B; 2JXT A; 4P1C C; 3RD2 A; 4OVZ A; 3ZRC A; 2XBB C; 2B3A A; 1IGD A; 4DHZ B; 1WRD B; 1FRD A; 2J4X A; 3IAM 1; 2KVR A; 2PW9 A; 4XWT A; 2WDV B; 1UH6 A; 3AEB B; 3DVN U; 1T6B X; 4BVU C; 3OAW A; 5FR6 A; 2JX5 A; 4EOY A; 4OHJ A; 1TS2 A; 4LJO B; 5FKA C; 3WIM A; 4YXD B; 1JCK B; 2LGD A; 1RRB A; 4MM3 A; 3HVD A; 3DBS A; 1YN5 A; 3NOB A; 4JL9 A; 1WYW B; 4MGK E; 3NG0 A; 4TMA B; 2D11 A; 2DYB A; 3TEZ A; 1VZ7 A; 1JAL A; 2R61 A; 3AMZ A; 3MHZ A; 5JH5 C; 2RSU A; 3MC9 A; 2OOB B; 2IGG A; 2N9X A; 3ZDM C; 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