2PN8A

Crystal structure of human peroxiredoxin 4 (thioredoxin peroxidase)
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
191
structure length
191
Chain Sequence
b'YFQSMPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human peroxiredoxin 4 (thioredoxin peroxidase).
rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 62
structure length 191
sequence length 191
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pn8A00
4K7IA 1SK1A 3O3TA 2HNLA 5FT3A 3ZFBA 2HI7A 5EL8A 2CZ3A 5G1KA 1SYRA 4YQVA 4OO5A 4E8HA 2GDRA 2C8UA 2RIIA 5HFKA 2DLXA 3VPQA 4WBRD 2YWNA 4MJCA 3KTBA 1T4YA 4N0ZA 4IW9A 4ZILA 4ZL8A 3D0ZA 1TTZA 4ILFA 4FYUA 4PXOA 1TXXA 2PERA 1JHBA 1GWCA 3LYPA 1WMJA 3ERFA 3UOMA 4WF5A 4I6XA 1EZKA 1Y25A 1QXHA 2H72A 3L9VA 3LFLA 4IBPA 1DE2A 5IOXA 2TRXA 2YWIA 1IYHA 1KEBA 4MABA 3GA4A 1YEPA 3IK9A 4HUAA 3TKQA 2QSIA 2H71A 3MNGA 2PPTA 4FO5A 2H0IA 2L5LA 5D8IA 2XBQA 1GLPA 2HT9A 1TI1A 4XCSA 4IN0A 2LEGA 2OE1A 3F4TA 4BPYA 1J0FA 1GLQA 3H93A 1GSSA 1YEXA 3DVWA 1K3LA 3GH9A 10GSA 1B4QA 4YH2A 4TN8A 4WEYA 5IMVA 4IVFA 4KCAA 2FLSA 4RQRA 4KDYA 1MDKA 1B9XC 3VWUA 1WJKA 4D73A 1SJZA 4XS4B 2YZHA 3ZIJA 1JZOA 4BWSA 2C0FA 4WKWA 2K8SA 1SKRB 1ON4A 4Q5NA 5EPFA 1B8XA 4AJ6A 2LQQA 2GT6A 4TKYA 3TUEA 1T7PB 1EOGA 1Q4JA 1K0DA 4IJIA 4AGSA 2YP6A 4EC0A 3IBHA 2DJ3A 3G9BA 3C7MA 1B9YC 4TXOA 1GSDA 1T4ZA 1R5AA 1ERTA 5IO0A 4HI7A 2VM2A 1OVNA 4PGTA 2J9HA 1PD21 4V2LA 2ZUPA 3ZMKA 3ME7A 4MZWA 3QFAC 4PQHA 3GKKA 4MH3A 2CA8A 2R5GA 4KAEA 3TOTA 1UVZA 3QMXA 3ERGA 1YY7A 2X99A 2H30A 1THXA 1M7TA 4I97A 2C80A 4RUVA 1XOAA 2CZ2A 6GSSA 3IOSA 2V41A 3ZREA 2WJUA 3AY8A 4TW5A 4CW9A 4PUFC 2OBIA 2GZYA 3L0HA 1OKDA 5D96A 2VCQA 1TU7A 7GSSA 3FK8A 4KSMA 1SKSB 5ECKB 1YF1A 1EEJA 5D9TA 1TRVA 3EE2A 1TOFA 2C0DA 3QOUA 3Q18A 3CRUA 1WP0A 1AUCA 4DSQA 2N5AA 3HVXA 5CP1A 3SBCA 2CVDA 5IMFA 2DMMA 2VL3A 2LRTA 3TJJA 1O8XA 3RPPA 3E3EA 3CTFA 2X8GA 1GRXA 5IM9A 3ZFLA 1JZDA 2VD0A 5DCGA 3TKPA 3F9UA 2M46A 5B8BA 1VGLA 3ZRDA 1JZWA 4P3YB 1FHEA 5J5NA 16GSA 3QFBC 2H75A 2LQOA 5D9VA 3ERWA 4HQZA 2R4VA 4K0NA 2IJYA 4MZBA 1QUWA 4OFTA 3QPMA 2FNOA 1ILOA 4I5QA 1A23A 1FO5A 2I9HA 3N5OA 3TJBA 2VO4A 3DXBA 1XCCA 1GP1A 2FWHA 1X5CA 2O85A 2E0QA 3ZLPA 5CYYA 4V1Ap 4O92A 2O7KA 1HNAA 2BTOT 4ZB6A 1MDIA 3LXZA 4F03A 1HNBA 2LS5A 2ON7A 2L4CA 3W6GA 3DMLA 1AXDA 3TRQA 2PN8A 3M1GA 5G1LA 1XWGA 2I1UA 2VAFA 3GFKA 4GTUA 2MBTA 4K0GA 1XOBA 1X0RA 1A0FA 4DSRA 2LRCA 2AB6A 2VD1A 1V98A 3H4KA 4POKA 2EC4A 2KLXA 1ZOFA 2DJ0A 3LQ7A 5L71A 3KGKA 2AV4A 1Z9HA 3EWLA 5H5SA 1K0MA 1X9SB 4L5LA 5ECIB 1K3YA 2HE3A 3RPNA 2L4QA 6GSUA 4LL4B 1A0RP 2GSQA 5IIZA 2FWGA 3GKNA 1PX7A 2X8CA 1PL2A 2REMA 3L9UA 4OFMA 1G6YA 2WGRA 1XW9A 1GTBA 4IQAA 1BEDA 3FYGA 5FHIA 4Z7XA 4GSTA 2HRNA 1HYUA 3WYWA 1F6MC 2XHFA 5DJLA 1EV4A 3F0IA 3HZ8A 3NIVA 3M8NA 1NSWA 4EUYA 3ME8A 3KEBA 3TRXA 4YAPA 3WT1A 1UC7A 2AYTA 19GSA 3DRNA 2BMXA 2KHPA 3D4MA 3EINA 1MDJA 1A2MA 3KTLA 3SWLA 3GSTA 5ENUA 1PMTA 4K7NA 1X5DA 2OKAA 4KCEA 2H6XA 4O32A 3GURA 3VFIA 2OE0A 5HR2A 1USBA 2R3XA 4WR5A 4F82A 2JSZA 2X64A 2IMFA 2PVOC 5A4WA 1SYXA 4MH2A 1ERUA 3DEXA 4XRDA 3CRTA 4ZB9A 4DEJA 3HZ4A 2YWOA 3M9KA 4F0CA 2V1MA 2K6VA 4MPFA 4NXIA 1M0UA 2MMOA 3CSJA 1M9BA 1Q98A 4OCFA 3UIWA 5KEJA 5E4WA 2A4VA 3BCKA 1MD3A 3CTGA 5AISA 1GSYA 3UAPA 2CT6A 1EV9A 2PVQA 4K2DA 2LSTA 2CV4A 2F8AA 1XVQA 2YPMA 5AIVA 1SKWB 2DIYA 1X9MB 2O89A 2E2MA 2V6KA 1TK0B 3HJOA 3NZNA 1QQ2A 2IIYA 2MZCA 3EVIA 4GQCA 5D73A 4JZQA 4TR4A 2WULA 4MF7A 1R5PA 4ACSA 1OC9B 1T3BA 4TR3A 3I9V2 4PQ1A 4KX4A 2H1BA 5JCGA 4EXJA 1AQVA 5JWRB 1K0CA 2IFQA 3RDWA 2PGTA 3DVXA 1TP9A 1W4VA 1AAZA 1R4WA 3O76A 4KGIA 2HFDA 1K0AA 3KZQA 1QGVA 4GXZA 4L0UA 2JSYA 4NHWA 3KJYA 5G5EA 3F4RA 1KNGA 2FHEA 4LMWA 4TXVA 3W8JA 5A4UA 1AIUA 1CQHA 2MMZA 3DKSA 2HSYA 1EGOA 2JZSA 22GSA 4MP4A 4HEA2 5EVOA 1THOA 2TIRA 1I5GA 3GH6A 3TOUA 1BX9A 4GLTA 2B7KA 4DSSB 1UA5A 3HYPA 4XS6A 3EURA 3C1RA 3TB2A 3D5JA 1XZOA 4BWQA 2H73A 1X5EA 1MTCA 2OJLA 1TDIA 3CBUA 3IPZA 4ZBAA 4EDZA 3FR6A 2DJKA 2AAWA 3GKMA 3VWWA 4XTSA 2Z9SA 5DALB 4MMMA 3A2WA 3GL3A 2YV9A 2VL9A 1QMVA 2JADA 2YJHA 3TJFA 3G7YA 3GTUA 1LJRA 4HZ4A 1U88A 2HXKA 12GSA 5IMDA 3ZIVA 1Z7RA 3HVSA 2XBIA 2GSTA 1NM3A 4N0VA 1T8EB 1O73A 2FD3A 2KP1A 2WS2A 4BA7A 1X9WB 3H1NA 2AUVA 1Z5YE 3D6IA 2G0FA 3ZYWA 3KM6A 5CRDA 4F2IA 3FZ9A 1SL2B 3FEUA 4PQIA 4IKHA 2V6OA 4G10A 1GSEA 4KDXA 2R6KA 3VI7A 4YQUA 4MDCA 2VIMA 2C0EA 2VLVA 3U6VA 2F8FA 1XFLA 2I81A 2GS3A 2NPBA 2PWJA 1PKWA 3IK7A 2CVKA 4EDYA 3IRAA 4MF5A 5B6NA 5GAPD 1F3AA 1FVKA 5CRGA 3US3A 4BVXA 4JE1A 2LJKA 3VWXA 5F0GA 3G7IA 4ZL9A 3UVTA 5GSSA 5ABRA 4OFNA 1YKAA 4TVEA 1GH2A 3BBYA 5IQYA 3HJMA 4I8BA 4KW6A 2A2RA 4ECJA 5ID2A 2C4JA 1HNCA 2L6CA 5F8BA 4FYBA 4PUAA 2LKUA 3TKSC 3CYNA 5F05A 2B5YA 4I2UA 4HS1A 2HZFA 4POBA 1OC8A 3GL5A 3LWAA 4G9HA 3TDGA 2V32A 3UMAA 3EMXA 2MMAA 4WXTA 1A2JA 2JL4A 2YOIA 5ECNB 1CQGA 2AHEA 3GUSA 1J9BA 3FR9A 1XBSA 3CSIA 5HQPA 1EEMA 6GSTA 1FB6A 1TRUA 1BJXA 1O85A 2YV7A 5DQSA 3IXRA 3W8SA 4WBJA 1TU8A 5ECMB 3VLNA 18GSA 1XW5A 2N5BA 2VOCA 4GWRA 3MWHA 3C71A 1A8LA 2YANA 4ECIA 3ZMLA 6GSVA 1BYEA 3WGXA 5HR0A 3CMIA 3D22A 5D93A 4MCUA 3A5WA 3EYTA 3ZVJD 3E9JB 1FG4A 5E59A 2IMKA 1SL1B 1OC3A 4JR6A 4V1Ag 5KN3A 2I3YA 1PA3A 1GTAA 1VF2A 2WDUA 3GNJA 2H0GA 3GHAA 3ZL5A 3EU4A 5J9BA 3WT2A 2IPAA 4X0XA 4IGJA 2YJ7A 4JBBA 1WOUA 5AGYA 4E8EA 4IP6A 3GV1A 1DBYA 2P5QA 3FRCA 3S9FA 3APSA 2FGXA 4YQMA 2L57A 4LLRA 4OD7A 5ECLB 3MSZA 3A2VA 4Q5FA 4RI7A 1OE7A 1M99A 1S3CA 2F9SA 1N2AA 1PN9A 1PQNA 3GYKA 3HD5A 4HZ2A 5DAKB 3WGEA 3HXSA 1OC9A 5J9CA 2HSHA 3RAZA 3MAKA 3TKRA 1PSQA 2C3QA 1EOHA 3VWVA 3DGQA 1XXUA 2CAIA 3F4SA 3UARA 2MBSA 2YWMA 1DUGA 5DVBA 3F3RA 3R2QA 2QKEA 2MYGA 2H74A 3GRXA 1DE1A 4L8EA 5B6MA 4ID0A 2GSRA 4HOJA 3EU3A 1QFNA 2RM5A 4AF2A 3GSSA 5B8AA 1SENA 5ECPB 4OCEA 3UEMA 2H6ZA 3UL3A 2L59A 1HD2A 3F8UA 3QDNA 4MF6A 1EP7A 2VCVA 3A2XA 5JCWA 1VF4A 4ECBA 3N9JA 5JWQB 3IC4A 4ZXGA 3QD9A 1A24A 2GGTA 1TRWA 1GNWA 2RUEA 5IMCA 4KUNA 1E6BA 1B4PA 3HHVA 2DC5A 1U87A 3QAVA 1Z3EA 4DSSA 4L5OA 4LA1A 5CRWA 4QL7A 1RW1A 3WGDA 2OACA 2QC7A 3DIEA 1LBKA 2KP2A 2R37A 6GSWA 3WD6A 3TKSE 5IPHA 1H75A 2LTKA 2O87A 5CREA 5DALA 4XIHA 2P0GA 2AJQB 2GQMA 3GX8A 1PGTA 4AJ8A 1S3DA 3LEFA 3FZAA 4TR1B 3RHBA 4J2FA 4Q5RA 4EKZA 3FW2A 2PBJA 2J23A 1XPVA 4RQXA 4X1UA 2EIQA 1O8WA 4JU5A 1PRXA 1M9AA 5H5RA 4HQSA 5DQYA 4IQ1A 1W89A 4RI6A 1XWBA 5IPGA 2FA8A 1DSBA 4KB3A 3RBTA 4QL9A 4HU9A 2DSAA 4WETA 5DJMA 3TCOA 1TKDB 3HY2A 4TRXA 1MD4A 1AQWA 3LG6A 4XS4A 17GSA 1F37A 2P31A 5C00A 4ULXA 3J7Yb 2VCTA 4V2MA 3UJ1A 3U5RE 3VURA 3TRPA 5EY6A 3OR5A 3L4NA 3LSZA 4ML1A 6GSYA 1U3AA 4H86A 3EMPA 4DVCA 2YN1A 3Q19A 4NHZA 2IMDA 2OA7A 3HDCA 1WE0A 2E2GA 3APQA 2TRCP 1M2BA 1AW9A 1BAYA 3ZTLA 2K18A 3GKXA 3HCZA 2LNTA 4LL1B 1UN2A 3TGZA 1SK0A 1PX6A 3QAWA 2XPEA 3ZZXA 2HYXA 3ISOA 1YQ1A 3PR8A 1ERWA 2L6DA 3LGCA 2LNSA 1K0BA 2H0HA 3KP9A 4I2TA 5ECRB 5LD0A 1R26A 3ZVJA 5D9XA 2H1DA 1GUMA 2DJJA 3DD3A 3IE3A 2YZUA 1FAAA 1ZGNA 2VCWA 1EGRA 5AIXA 1KTEA 5ECSA 2B6MA 2L5OA 2H6YA 2VLUA 5JWOB 4GRFA 2O8VB 3KH7A 2HLSA 1V57A 4PURA 2DMLA 1BQ7A 5JCUA 1ZZYA 1F2EA 2H1GA 1F9MA 2GVPA 4EF0A 4PNFA 5CO3A 1GULA 3FY7A 3FKFA 1YZXA 1Y6EA 1ML6A 5ECQB 4EO3A 1NW2A 4ML6A 3M0FA 1AC1A 5INYA 1NHOA 1SD9A 2M80A 4XRAA 1GSQA 2B5EA 2NDOA 3PINA 3FHKA 3KXOA 2JU5A 4OWYA 1SU9A 4K8MA 2EIRA 4K9ZA 2VCXA 3PH9A 5DAKA 4MJEA 3P90A 4GQFA 1TK8B 2ZCTA 1TK5B 1JFUA 2PUKC 1FOVA 5IO2A 3VK9A 1GTUA 5LNKe 4Q5QA 5DBQA 4TR0A 4EVMA 2H70A 3I69A 1GUHA 2F51A 4GSNA 4MPGA 3LXTA 2WZ9A 2PMTA 1SL0B 2E7PA 3CXGA 1OYJA 3TJKA 5HR3A 2CAQA 3IV4A 3G7JA 4O5RA 2VUPA 5KN0A 3J7Yk 2C3NA 1YKCA 2ON5A 1TJDA 1TW9A 1N8JA 2R2JA 3IA1A 1SD8A 14GSA 4MK3A 4IJ3A 1GNEA 5A5KA 4CDOA 2JZTA 4MJAA 4XHMA 3LJRA 3Q6OA 1FW1A 3TKSA 4BVYA 1O81A 1GL8A 4KE3A 3HVVA 3IDVA 2DIZA 2MMNA 1JZRA 1LU4A 4ISDA 3D4TA 1C72A 1WIKA 3P2AA 4WF4A 2KOKA 4FYCA 4KH7A 3L9SA 4WR4A 3KD0A 3ED3A 3JCML 2OE3A 5HFIA 2RLIA 4XS1A 4ZIJA 4F0BA 4K7OA 2ALBA 1O6JA 4TR1A 1K0NA 3CSHA 1SJ6A 1VF1A 2OADA 2LV3A 5GSTA 3KP8A 4BL7A 4V2NA 2LRNA 5FWGA 3APOA 5CAXA 4NWYA 3L78A 5GZZB 2M72A 1YF0A 2HZEB 2IFQB 5KN1A 3DYRA 3M3MA 2GQLA 5KN2A 1GSUA 4ECCA 5LCZA 1O7UA 4HDEA 3F3QA 2LUSA 3MDKA 4F9ZA 2IMIA 5ELAA 3IHQA 4KDUA 1G6WA 1BG5A 5B7CA 5IMAA 2WB9A 1AQXA 4ZB8A 3FR3A 4X43A 2QGVA 2WFCA 3KCMA 1SJIA 5F07A 5HR1A 4NAXA 1YJ6A 2VLTA 4FIWA 4KSOA 5DCHA 4AJ7A 4MJBA 5C04A 2C0GA 2B1LA 2I4AA 5COHA 2PU9C 5ECOB 3PGTA 2C3TA 3IR4A 4OMVA 1FB0A 1XIYA 5G30A 2CVBA 2P5RA 2CX3A 2H66A 3GIXA 3KMOA 9GSSA 3GX0A 1IYIA 2V2GA 2IL3A 1EP8A 5J4UA 1HQOA 1U6TA 2LJAA 5G2ZA 1JLWA 4J57E 1JLVA 2DJ2A 2WRTA 2X8HA 1OKTA 2CX4A 2GQKA 3TJGA 2DBCA 2VM1A 3V1WA 1R7HA 1T00A 4CHSA 5F06A 3GTUB 1ZMAA 3BCIA 3I6AA 3HA9A 2VL2A 2C1YA 1KBNA 2ZNMA 2FWEA 2XC2A 4N11A 4IHUA 20GSA 1NHYA 3HJPA 2VL2C 1ST9A 4JEDA 5CRHA 2FCHA 1J08A 4NMUA 3QR6A 3HKRA 2YCDA 4N30A 2N5FA 1B48A 2BJXA 1QK8A 1XW6A 4EE0A 1VRSD 1M2DA 2IN3A 2KUCA 3IAM2 3LYKA 2GZZA 4ZBBA 1XWKA 2H1AA 1V2AA 4G2EA 4OO4A 4D73B 4JR4A 2CQ9A 4NV5A 1GTIA 4IP1A 2H8LA 2RM6A 1A2LA 4KNDA 3UBKA 4ZL7A 2FUG2 2B5XA 5HFGA 3A3TA 4GSSA 4TOPA 3DWVA 5ECHB 1I9DA 4HJ2A 2G2QA 3VPTA 4EL1A 4K1FA 4FH8A 2K8VA 3O6TA 1U3IA 4PX1A 2ES7A 3KH9A 4JRRA 1SK2A 1ACVA 3F6FA 4TXOB 1OAZA 2A2SA 2B3SA 5ID2B 4GF0A 1GUKA 4HJMA 1VF3A 4N10A 4IS0A 2FWFA 1URMA 1V40A 2GSSA 4MZCA 5G5FA 3K8NA 1K0OA 2OBKA 3VI5A 5IOWA 4POMA 2NBSA 3C1SA 3I43A 1S3AA 3UVHA 2RUFA 3IAS2 4PNGA 1Z6MA 1ZCPA 3BOAA 5ELGA 1V9WA 1OE8A 4GCIA 3P8WA 1G0TA 3F63A 2H01A 2YNXA 2K9FA 5G31A 1Z6NA 1Z7PA 2FA4A 2D2ZA 1ERVA 3GN3A 1G7OA 5J3RA 2GTUA 5J41A 3ZITA 1F3BA 1XWAA 3C8EA 4NV2A 2FY6A 4J56E 5A4VA 2EIOA 1ZYQB 3LORA 3Q74A 3E0UA 2LJRA 1XWCA 3EC3A 2GZPA 2GLRA 3M9JA 1PKZA 2VCZA 3KMNA 4K6XA 3P7XA 2DJ1A 1H4OA 2HRFA 1WRYA 4MLYA 2WCIA 3H8QA 4POLA 1YDKA 1FVJA 5AN1A 3F6DA 3GMFA 4YAVA 1E2YA 3D21A 4IELA 4G19A 2F3MA 5D9WA 5H5QA 2XPDA 2B7JA 1K3OA 5GAND 1TI3A 3H79A 1M2AA 1TRSA 4HU7A 6GSXA 5CNWA 5DDLA 1ZL9A 3UBLA 2NTOA 2JZRA 2GT5A 8GSSA 4QQ7A 4O7HA 4KA0A 1WWJA 3BJ5A 4NPBA 2NVLA 2IMEA 1RK4A 1EWXA 11GSA 1WPIA 2H19A 3QAGA 2JACA 3C73A 1T1VA 3FZ5A 4LMVA 4L0WA 1MEKA 1ABAA 1A8YA 13GSA 1RQMA 1GSFA 1G7EA 1V58A 2H76A 3QCPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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